XLOC_018052 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_018052
Unique NameXLOC_018052
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:343197..353967-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_018052 ID=XLOC_018052|Name=XLOC_018052|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10771bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:343197..353967- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGATCTTGAAATTGTCAAAAGTATGTATAGTTACAATTATTTTAT TTATCTTCACAACATTTGCGATTAATTAATTTAAGATAGTTTTGCTCAAT CTTTTGTCTCGAAAGAGAGAGGGGATTGTTTTAGGCGCTTCTACCATTCT ACTTTCAGATGTTACTCTAAGTCTTTGAAGGGCTGCTGCAGCCCTATTTT TAGTTTTATAGGATACAAGTGACCCTTAGACCTTAGGCGCTCTGGCATAG TGGTCATTGACCTATGTTGGTTGCTGTTGATTCCCACTCGCAGCGGTTCA CTTGGCAAGTGAATGAACCTTCGCCTGGATCAACCCATGCCATCTGAGGG TAATTGGGTAGTCAGTTCAAGGTACTGACGGGGTGCTAATTAAAAGCGTT AATAGTTGCCAAAATGGGAAGCCTCTTGCGACTCAACCCAAACAGAAATA GAAATTAGAGGGCCTTGCCTTCTCTTCAGCCCTAGATTGTGACTTTAGCC TGTGAATCCAAGCTCAAAATGTTATGGAAAAAATTTCCTCAACCATATTG TACAGGCCCGGCAGAACAACTGTAAAAGGGGGGGGGCTGAAGGTTCAAAT TGAAATAAAATTGGCTAGGAATTGGAGGAAAAAAATCTAATTTGCTTATA AGTGGGGAGGCTGAAGTCTCCCCAGTGTCCTTGCTTCCGCTGGGCCTGAC ATGCAAAGTTCTAAAATTTTATAGAGCTTGGGGCAGGTAGATTAGTCTGA TGCAGAATGTTTGCACAGTCTGTGAGTGAACTCGTGTTGAAAGACTACAG AAACCTGAATAGACATGCATGAGGACTGGGTCACAATTAGGTTTTGTTTG CGTCATTTTCAGACCCCAAATGCAAGTCAGTCGCTCACTCAGCATATAAA TCATTGGAAAAATGTGCTCTGAATATAGGTGGTTGGGCGGTACTAAATTC 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GTAACAATGCATGATGTGATGGACGCACAATGGGTTTATGATAATACAAA AGATGGTGAGTAAAAGCTTTCTTTAGAATTATATCACTGGCTCATTTTTA ACCCTATTCATACTAGGCTTTTAAGGGCGGTTCAAAACTAGGGGGTGTTC CTGTACCACCCCTTAACTTTTGATCTAGTGGGTCTTTTTGGATGAAATTT GGCACACAAGATCCTTGTCATATAAGGTAACTTTTGACAAAAAACTTTTT TGATGAAGTCTTATCATGCCAAAAGTGAGTGGAATTGTTATCTAACAAAG CTTCCCTCTGTCTAAAATGCTTATTTTATCCTAATATTCAATAAATTACG GTTTAAACGATATATTTGACATAGAAAGAAATTTATGCTCAAGGTGTGAA AACTTTTAGGCGTCAATTTTTATTTTATTTTGAAGCTAAATTAAAGTTAG GAATTTACAGAAAATTTCATGTCAAAAGCTAACACTACTTCATTTTCTCT TGTTAGAATCTTACTTAAGGAGAGTCGTGAAACCTTTAGAAACACTTCTA ACGTCTCATAAACGATTGGTCATCAAGGACAGTGCTGTAAGTACTCTTTC AAATTTTCAGAAGAAATATATTTCAGGACAAAACAGTGCGATTTCCAAAA TATTCTTGTTCTAATTATATGGCTCAAACTACTTAAGATATCAGAATGAA TAAAAGAAAGATCTTTCACATCTCAGTATTAAGCCAAACCTTGCTGCCCA GAAACTTTCATTGTTTTTTTTCCATTAGTCCTAATGTGCAGGTATATTTG CAAAAAAGTGGTGACAATTTTTTGGAAAAAATATTTTTAAAAATGTCATA TAACCCTGATTTTTTTCCCTGTTATTGTAAACTGAAACCCTTAGAATCCA AAATATCAAATTTTGTGGTGTTTTAGAACAAAAGTTCCTGAAAAAAAATG TCCCATACGTTACGGGTACTTTTTTGGACCTGCTGAACCTGGAAAAGATG ATTGAAACCTAAAAATTGTTTCATTTTAAGGCAAATACCATGTACCACCA ATAGTAATATAATTGTTTGGAAAAATGGCTGTCTCAGCAACAAAAAATTC AATTTAATGCCAAAAATTGCTCAAAAATGTTAAATATGGTGACAATTATT TATAATAGAAGTAGAACAACACAACTTGATCAATTAAAATTTGGCACAAA CCAAGTACTGTATATGAGTAAAACACCAAAATCAAGGAACATAACCAAAA CCTGAGTAAAACAAATATATTTGTTTGCCTTCTCAGACCACCCCATTTAC CAAAAAATTGTCCCAACCCAGGGGGGGGGGTCAACATTTATAATACCAAC CCATAGCCCAAAAACCCGACTTTTGACCTTTTGAGCTAAGTTAACACCAC CACCCCAAAATTGGTATCGATACCAACTTGAAAATCATAATTTTCAGAAA AAGGGGGGACCCACCCCCTTAATTTGGTATCGATACCAACATGACTTTTT GAATTTGACAAAATATCATGGGACCCACCCCCTAATTTAGTACCAATACC AATCTGACAAATTTGAGTTTAAAGCTGTTTAAAGGGGACCCACCGCCTCC CACACAAACAGGGTACTAAGAGAAACTTCAAAAAAACTCTTTCTTCAACA CAACACAAAAAATTGCTAAAATAGATAATGACTGAAAACTGACAATATAA TAAAAACAAACCCAATGAAGCTAGCAAAATCAATCCGAATCAATATTATC TTAATATAATTGATGTGCAAAAACTAGGAGAAGCTATTATTAGTACATAA TTTTAGAACAGAATAGATTCACTCATTACCAAATGCTATCACAGAAAAAA TGTTTTTGCTTCAGGCTTGATCAAAAATAAAACTTGAAAATATTGAAAAA AGTCCGAAATAAACAAATTTCAAAGTCATTTATACTTATTACTCATTTAC AGTCATTATACTCAAAAGCGAAAACAAATCCAATTGAAACCTGTTAAATA AAGAGTAAATCTGATTAAAATAAAGAACATACTGTCCTGACTGGCTTTTT AACTGTAAAAAGCTTTCTGCCTCCAACTAATAAACACAGAAACACTAAAC AGAAATTCGATTTGAATACTTTTGAATGTTTTAAAATTTCGAATATTTTT TTCGAAAATTCGAATGTCTTTTGCACATTCGAAATTCGGATTTTCACAAA AAAAAAAAAAGATTTGCTTACTCTGGTTTGTTTGATACTTACACTACATC CTGCTTGATCAAGTTTGCTTTGGTGTTAGAGTTTTACTTTTATACAAAAA CGACCAAGATAACAAAGAAATACAGATTGTTTAATTTTTTCGGGGTATTT TCTAGCTATAAGGGCAAAAATTAGGAAAGTTTTGCTGTCATTTTGATATG AATACCAACTTTCTGAATCATATTATTTAAAAAAAGGGGTCCACCCCCTA TTTTGGTATCAATACCAACCGAGGATAACTCTTTTTTTTTTGAAAAAAGG GGGACCCACCCCCATCAATACCAACTTGACTTTTCAGACTTTTAAAGGAA AAAAAGACACCACCACCCGGCTATGGGTCTGGTATCTGGATGTTGACCCC CCCCCCTGAACAGAATTATCCGATACCATAATTACTGAAAACCATCCAAA AATCAACAAAAATGTCCCATACGTGACAGCCTGTAGCCAAAACAGCAAAT GCTATGGGATTCATATTTTGCACCCAGTTAGGCAGCCTTACAAGGAATAT TTTAAAGCTTATTTGATTTAATTTGACAAATTTGAACAGTCTCCAGGGTC AAAACCATGGTTTGTCACCCCTTTTTTGCAAATATACCTGCATTCAATTC AATATTGTGTTGATTTTAGGTCAATGCTATTTGTTATGGTGCCAAACTCA TGTTGCCAGGTATCTTGCGATATGAATCCGGAATTGAGGTCAACGAGGAT GTTGTCATGATGACGACTAAAGGAGAGGCTATCGCAGTTGGTAAGTACTT CGTCTGGTCCGTATGATTTGTTTATAGAATATCCGAGTGAGTGAGCTTTG AGTGTTTGAATTGTCTGAATGCCTCAGTTTAATATTTTGTCTCTGAAAAA GTTGTGGAAAATGGTTCCTTCTGCCAAGAATTTAGCTAGGTTTAATTATT CAAACAAAGCCATTTCTAATATGGTATTTGTCACTATCTTATTGTAACAA TAGTGTTGCAAAGCACTTACAAATATTCTTTCTATTCTCTCTACTACGCA TACATATAGGCATTGCCCTGATGAGTACTGCTACCATAGCAACATGCGAT CATGGGGTTGTTGCCAAGATAAAACGTGTCATTATGGAACGAGATACATA CCCAAGAAAGTGGGGTCTCGGACCTAAGGTACTATAAAACAATCTTCAAA CCTTATTTAAAAAATTGCTGCTCTTACCTAATCTTGTGATAAGATAATTT CGATTTGGTAAATTTGTATTTAATGTGAGTAAGTTGTACGCCTCAGAAAG TATAATGTAGACCAATAAAAAAAATTCTTCTTAGATCTCGTTTCACATTG ATCAAAAGATTAATGTGTTTGGTTTTTTCTTTAGAATGTTTATCTAGCAT TAAATTTGCACCCTTTTTCCTTTAGGCTTTGGAAAAGAAGAAGCTCATTG CCGCAGGGTTACTTGATAAATTTGGAAAAACAAATGATAAAACTCCGAAA GACTGGAAGGATTACAAAAACTACAGGTACTTTAGGCGTACAAACTTTCG CGAGCAAAAACTTTCGCGATTTTCGCGAGTTTTGGCCCTTTTCGCGAAAG TAAATGTCTTTAAAAATTCTAGGAAGGGCCATTCGCGAAAGTTTATGCTC GCGAAAAATTCTTTACAGAAAATCTGTAAAACTTCAAATTTTGAATAAAA TGTAACTTTAATGGCACTTTTTAGCCTGCTAAAAGACTAATAAGTCAACG GACAAATGTTTCAAGCCAATGCCAGAAGTATTCGTCCCTCTAAGCCATTT TTTCATGTGAAAATACTCAATTTTACGTCTTGATTCGCGAAAGTTAATGC TCGCGAAAAATATTTTTCTGTTAAATTCGCGAAAGTAAATGTCGTGAATT TCGCGATTCTTCGTCCTCGCGAAAGTTTCTGCTCGCAAAAGTTTGTGCGC CTAAAGTAGGTCCTTGATACAACGCTCAAATCATCCTCCTTCAAAATTGG CAATATTGAGCATTCATATAAAAGTTTAAACGAGAATGTGAATAAAAGTT TTATTTCTTAAATTCCCTTCTTGTAGCCAAATAAAATCTGAGGATCTTGT GTCTGCTGCAATCAAAAGAGAAGAAGATGCTGCAGAATCCAAATCTGAAT CCAAAAAGGTTTGTTATGCTTTTGAATTCTCTTCTTACAAATCCGTCAAA TCTTTTTAAAGCTTCTCTAAATGAATCGATTGAAAATCGATAATCGTAAT CCTTAGAGAAATTATTTATCTTTTCAGCGAAAGCACGAATCAAGCGGCAG TGAAGATGAAACGGTAAAAGTGAAGAAAGACAAAAAGAAGAAGAAGAAAA AGAAGGCTGAGAGTGACGAAGAAGCTGAAGAAGATGTCAAAGTGAAGGAA GAACCTGATTCTGATGACGAGGTGCGTTCTTTTGGTTTATTTTGTGAAAT TATTTCATTCACAAGTTGACACAATTGGCTTTGACCAACCTTAATTAAGG GAAGAAATTTCATTTGGTGGATTGCCAAAAAAATTTTCTCGGGAATTTTA TTTGGTGGATGGCTCGAAAAGTCGAATTCAGTGGGAATTTAATTTAGCAG GTGAAGGGTTTTTTTGACCGAAAAACCCGTTTTAAGCACACATTTGGAGA ATGATCAGACACATATTTGATATCGAGTAGTCCAATGTATCAGCGCTATA AACTACTATGTCCTAGTTCCAATCCCGAGAGACCTTGCCTGCTCCCGATT TTGAATTCTTAAATGACTAACGTGTCCACAGTTAGCAAATTATTCCTCCT TACATTTTCAGTCCAAGAAAGAGAAAAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAAG GAGAAAGAGTCCGAAGAATAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:343197..353967-

>XLOC_018052 ID=XLOC_018052|Name=XLOC_018052|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3042bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:343197..353967- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGATCTTGAAATTGTCAAAAATGGCTGATCTTGAAATTGTCAAAA
AAAAAAAGAAAATGAAGAAATCCAAAGAAACAAAAAAAAAGAAAATGAAG
AAATCCAAAGAAACAAATGGAGATGTTGATTCAGACAGTGAATATGTTAT
CAAGCCTACAAATATTGTGCCAAAGTTGGACACATCCAAATGGCCATTGT
TGTTGAAAATGGAGATGTTGATTCAGACAGTGAATATGTTATCAAGCCTA
CAAATATTGTGCCAAAGTTGGACACATCCAAATGGCCATTGTTGTTGAAA
AATTATGACAGATTGAATGTGCGAACAGGTCACTATACACCAATCCCATG
TGGAAGTGCACCATTGAAACGAACTTTGAAAGATTATCTTGCTGCTGGAT
TCATTAACCTTGATAAACCTGCAAATCCATCTTCTCATGAGAATTATGAC
AGATTGAATGTGCGAACAGGTCACTATACACCAATCCCATGTGGAAGTGC
ACCATTGAAACGAACTTTGAAAGATTATCTTGCTGCTGGATTCATTAACC
TTGATAAACCTGCAAATCCATCTTCTCATGAGGTTGTTGCTTGGATTAAG
AAGATATTGAGGGTACAAAAGACTGGACACAGTGGTACTTTAGATCCTAA
AGTAACTGGGTGTCTAATTGTTTGTATTGAGCGTGCCACTCGTTTGGTAA
AATCCCAACAAGGTGCAGGAAAAGAATATGTTGGTATTCTTAGACTTCAC
AATGCTATCGAAGGCCAAGATAAGCTAGCACAGGTTGTTGCTTGGATTAA
GAAGATATTGAGGGTACAAAAGACTGGACACAGTGGTACTTTAGATCCTA
AAGTAACTGGGTGTCTAATTGTTTGTATTGAGCGTGCCACTCGTTTGGTA
AAATCCCAACAAGGTGCAGGAAAAGAATATGTTGGTATTCTTAGACTTCA
CAATGCTATCGAAGGCCAAGATAAGCTAGCACAGGCTATTGAAATGTTGA
CAGGTGCTTTATTTCAAAGACCACCTCTCATCTCAGCTGTCAAACGTCAG
TTGCGTGTTCGTACAATTTATGAAAGTAAACTCCTGGAGTTTGATGATGA
AAAACATCTTGGCTATTGAAATGTTGACAGGTGCTTTATTTCAAAGACCA
CCTCTCATCTCAGCTGTCAAACGTCAGTTGCGTGTTCGTACAATTTATGA
AAGTAAACTCCTGGAGTTTGATGATGAAAAACATCTTGCTGTTTTCTGGA
TGTCTTGTGAAGCAGGAACCTATGTTAGGACGTTGTGTGTACATCTGGGA
TTGATCCTTGGAGTTGGTGGACACATGCAAGAGCTTCGTAGAGTTAGATC
TGGAATCCAGTCAGAAAATCTGTTTTCTGGATGTCTTGTGAAGCAGGAAC
CTATGTTAGGACGTTGTGTGTACATCTGGGATTGATCCTTGGAGTTGGTG
GACACATGCAAGAGCTTCGTAGAGTTAGATCTGGAATCCAGTCAGAAAAT
GATGGTTTAGTAACAATGCATGATGTGATGGACGCACAATGGGTTTATGA
TAATACAAAAGATGGATGGTTTAGTAACAATGCATGATGTGATGGACGCA
CAATGGGTTTATGATAATACAAAAGATGAATCTTACTTAAGGAGAGTCGT
GAAACCTTTAGAAACACTTCTAACGTCTCATAAACGATTGGTCATCAAGG
ACAGTGCTAATCTTACTTAAGGAGAGTCGTGAAACCTTTAGAAACACTTC
TAACGTCTCATAAACGATTGGTCATCAAGGACAGTGCTGTCAATGCTATT
TGTTATGGTGCCAAACTCATGTTGCCAGGTATCTTGCGATATGAATCCGG
AATTGAGGTCAACGAGGATGTTGTCATGATGACGACTAAAGGAGAGGCTA
TCGCAGTTGGTCAATGCTATTTGTTATGGTGCCAAACTCATGTTGCCAGG
TATCTTGCGATATGAATCCGGAATTGAGGTCAACGAGGATGTTGTCATGA
TGACGACTAAAGGAGAGGCTATCGCAGTTGGCATTGCCCTGATGAGTACT
GCTACCATAGCAACATGCGATCATGGGGTTGTTGCCAAGATAAAACGTGT
CATTATGGAACGAGATACATACCCAAGAAAGTGGGGTCTCGGACCTAAGG
CATTGCCCTGATGAGTACTGCTACCATAGCAACATGCGATCATGGGGTTG
TTGCCAAGATAAAACGTGTCATTATGGAACGAGATACATACCCAAGAAAG
TGGGGTCTCGGACCTAAGGCTTTGGAAAAGAAGAAGCTCATTGCCGCAGG
GTTACTTGATAAATTTGGAAAAACAAATGATAAAACTCCGAAAGACTGGA
AGGATTACAAAAACTACAGGCTTTGGAAAAGAAGAAGCTCATTGCCGCAG
GGTTACTTGATAAATTTGGAAAAACAAATGATAAAACTCCGAAAGACTGG
AAGGATTACAAAAACTACAGCCAAATAAAATCTGAGGATCTTGTGTCTGC
TGCAATCAAAAGAGAAGAAGATGCTGCAGAATCCAAATCTGAATCCAAAA
AGCCAAATAAAATCTGAGGATCTTGTGTCTGCTGCAATCAAAAGAGAAGA
AGATGCTGCAGAATCCAAATCTGAATCCAAAAAGCGAAAGCACGAATCAA
GCGGCAGTGAAGATGAAACGGTAAAAGTGAAGAAAGACAAAAAGAAGAAG
AAGAAAAAGAAGGCTGAGAGTGACGAAGAAGCTGAAGAAGATGTCAAAGT
GAAGGAAGAACCTGATTCTGATGACGAGCGAAAGCACGAATCAAGCGGCA
GTGAAGATGAAACGGTAAAAGTGAAGAAAGACAAAAAGAAGAAGAAGAAA
AAGAAGGCTGAGAGTGACGAAGAAGCTGAAGAAGATGTCAAAGTGAAGGA
AGAACCTGATTCTGATGACGAGTCCAAGAAAGAGAAAAAGAAGAAGAAGA
AAAAGAAGAAGGAGAAAGAGTCCGAAGAATAATCCAAGAAAGAGAAAAAG
AAGAAGAAGAAAAAGAAGAAGGAGAAAGAGTCCGAAGAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_018052XLOC_018052-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:343197..353967 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1462-1521:61
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