XLOC_017508 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_017508
Unique NameXLOC_017508
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000024_pilon:578741..593074-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_017508 ID=XLOC_017508|Name=XLOC_017508|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14334bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000024_pilon:578741..593074- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGAGAAGAGAGATTGCTCGGAAAGAGTTCCAAGAGAAAATAACTGAAATG TCACAGGTAAAAACACAAGAATCTCTTTACTTGACCTGTAACTTATAGTT TTCCCCCCGAATGTTATTCAAAAAGAATACTCCTAAAGGTATACATATAT TTTGTTAATGTAAACAATTCATGCTTTGACCTTGTTTGAGGGAAGACAGT ATCTGAGTATTATATGAAATCTTTTATAATAATCACAACATCATTATGTG AAAATTTTTCTCAGAAACTTCAAACTGTTGAAGAGTCCCACCTGAAGCAG ATGTTAGAGTTATTGTCGAAATATGGAGAATCTATCAAAGTTGAAAGATT TCTTCTGGAACAAGTAAGTTGATGCCATTGGGATTTATTTGACTTCTCAC TTGAACAGAGGAAGATCAAAACTCGATACTAATTCACTCAATACTATTGG ACTTTCTTCGACTCAACTGCTAGTTGAAAAAACCTCAGAATCGTAGTCAG CTACTTAAAAGTTGGTTCCAAACGGTAAAGATTGGGCACAAAAATTCATA GATATTGGTTTTTGATTAAAAAACAACAAAAAAGTTTAAATGAGAACCAC AAATAGATTATTAGGTCTAAAGTTGCTGCTACTTTTGGTTGGCTACTTTA CCTAAAAAAAAAGGCCCGAACCTTAAGGAACCTAAGAATAGTCACATTTT ATTACATTTTAAAACCATAGATCATTGATGAATTTGGACGGAACATGGTA GCACTCACAGTTGACAAACTATTACAACAGTTCATCAATTTAAAACAAAC TGGAAAAGATGTACCAGGTATGCCAGTGTTCTTATACCGTAGATGAAAGA TGATTTTTCTACAACAAACGAGGCTGAAGACTCTTCTTTATAGGCGGATT TATTTACAAGACAATGGAGTTTTTTTGTCTCAATACTTGATGATTAAAAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000024_pilon:578741..593074-

>XLOC_017508 ID=XLOC_017508|Name=XLOC_017508|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2190bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000024_pilon:578741..593074- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCAAAGAAACATTCAGCATACCAGTTAGAAAATAATAGGTCACATTCTGA
AGATATAAAAGATGGTGAAATAAACGAAGAAAATGAAAGTGAAAGTAATG
ATAATGATGTTTTTTCAACAAAGACCCAAACAGACGGAGGAGGCTTTTCG
AAAAAGCCAAAGAAACATTCAGCATACCAGTTAGAAAATAATAGGTCACA
TTCTGAAGATATAAAAGATGGTGAAATAAACGAAGAAAATGAAAGTGAAA
GTAATGATAATGATGTTTTTTCAACAAAGACCCAAACAGACGGAGGAGGC
TTTTCGAAAAAGGGTGACAAACACAATGGGTTTGACGTGCTTCAACAGAA
CTTCAAATTGGGTCTCAATGCGAGCAAAGAATTTGCAGACTTTTTGAAAG
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AACATAGAAGAAAGTTATTCAAAAAGTTTGTTAAAACTAGCTCACAAGTG
TGCAGCAGCAAATAACAATGTTGGGAGTAACATAGAAGAAAGTTATTCAA
AAAGTTTGTTAAAACTAGCTCACAAGTGTGCAGCAGCAAATAACAATGTT
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GGCCAATGTTCACAGTCAAGTTATACTACACTTAAACGATGTCAGCAAAG
CTGTTAGAGAATATGGGGAACAACAAAAAGAAAAACAAAAACATAATATT
TGAACCCTGTTGGAAGTTTCTTCAAAGCTCAACTGAAAAGCTGGCCAATG
TTCACAGTCAAGTTATACTACACTTAAACGATGTCAGCAAAGCTGTTAGA
GAATATGGGGAACAACAAAAAGAAAAACAAAAACATATGAAAGATGATTT
TTCTTCAACAAACGAGGCTGTCCAAAATCTACAACAACTAAGTGTTGCAC
TATTAAAGATGAAAGATGATTTTTCTTCAACAAACGAGGCTGTCCAAAAT
CTACAACAACTAAGTGTTGCACTATTAAAGACAAAAGAAGCCTATCACCA
GCGTTCACAAGAGGTTGAAAAGTATCGGAAAGAAATGACCAATCTAAAAG
ATATCAAAACCACAAAAGAAGCCTATCACCAGCGTTCACAAGAGGTTGAA
AAGTATCGGAAAGAAATGACCAATCTAAAAGATATCAAAACCGCGGAAAC
TAAATACAAAAAGTCAAGCGGAAACTAAATACAAAAAGTCAACTGAGGAA
TATAAACAAATGGTGGAGAGAAGAGAGATTGCTCGGAAAGAGTTCCAAGA
GAAAATAACTGAAATGTCACAGCTGAGGAATATAAACAAATGGTGGAGAG
AAGAGAGATTGCTCGGAAAGAGTTCCAAGAGAAAATAACTGAAATGTCAC
AGAAACTTCAAACTGTTGAAGAGTCCCACCTGAAGCAGATGTTAGAGTTA
TTGTCGAAATATGGAGAATCTATCAAAGTTGAAAGATTTCTTCTGGAACA
AAAACTTCAAACTGTTGAAGAGTCCCACCTGAAGCAGATGTTAGAGTTAT
TGTCGAAATATGGAGAATCTATCAAAGTTGAAAGATTTCTTCTGGAACAA
ATCATTGATGAATTTGGACGGAACATGGTAGCACTCACAGTTGACAAACT
ATTACAACAGTTCATCAATTTAAAACAAACTGGAAAAGATGTACCAGATC
ATTGATGAATTTGGACGGAACATGGTAGCACTCACAGTTGACAAACTATT
ACAACAGTTCATCAATTTAAAACAAACTGGAAAAGATGTACCAGCACAAA
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GTAGCCCAAGCACCACAAATCGACTTTGAGGAGATCACCTTGGAAACGCA
ACCTGTTGACTTGGAAGCTGTAGCCCAAGCACTCAAAGAAGAAAAACAAA
AACGCAAGAAAGAGAAACAAAACAAACGAGCTGAACGCAAAACCAAGAAA
AAGGAGAAAACAACGGTCACTAACGGTTCAGTGTAATCAAAGAAGAAAAA
CAAAAACGCAAGAAAGAGAAACAAAACAAACGAGCTGAACGCAAAACCAA
GAAAAAGGAGAAAACAACGGTCACTAACGGTTCAGTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_017508XLOC_017508-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000024_pilongenomesc0000024_pilon:578741..593074 -
Properties
Property NameValue
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