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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000275_pilon:124097..130184+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016036.2 ID=XLOC_016036.2|Name=XLOC_016036.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6088bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000275_pilon:124097..130184+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGCTAATGTTACATTCGATTACTCTGGAAAAGTAGTGCTGGTCAC
AGGTTTGTTGTAAAGATAATTTCTTCTATAATATCTTCTACCCCTGAATT
ATATTCCACTCTATTCTATTGATATTCATAAAATGTTTCGACCGCTTTTC
TGGGGTAAGCGACTTAAAACATTAGAGTGTCACATCCTTAGGTACAAAAA
ACATCTTGTCGTCCAACTAAGTGATTCACTATTTTATTTAGAGACTGata
acacattttttataagaacatccaaaaattttgaagccttgggatgttgt
taacttttgaaaaaaaagttttttaacatgctcttattttcgccattttt
tgagtacttTTGTCCGTTTTCCTATGAATTTCGGTTTTcaagagtccgca
aagcctaaagatgttcttcacttgttcttaacatcttGGGAATCGAAgtc
tttatgttcttatatagtttacccttataaaaaacgtctaTTACACTATT
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TGTGCTATTATATCTTCAATTCCCTTGTACACTTTAGAATTCCTTGTCTC
CCAAATAACTTCGAACCATTTTCTGGTATATCCGATACCTTTTATGACAG
ATTATAAGCTTATTGATATAAggattaatcaatttttttcaaatatcttt
atCAGGTGCTGGATCAGGCATCGGTCAAGGCACTGCTTACATGTTCGCAA
AATCTGGTGCCAAAATGGTCGTTACAGATCGTAACGAAGGCAAATTGAAA
GAAACTGCaaaaaaaTGTGAAGAATTAAGCAAGCAAAAGGTAATTCAATT
AAAAGATGAATTAACGTTTTCTTCCGTTCGAAAATTAGAATTATGATATA
TTTACCCTGTTTCAGCAGCAGGACAACCCCCTAGAAATTACTCTAGTACG
AAGGAATACCTATAAGGACTTGAATTATCCGTCAAGGTGAATAAGGGGTG
ACCAATGAGTAAAGGATGGCTATTTAGATCCCACactagactagcaagcg
tctgtctttccttggacacaggaacgcgggaatagtgcttataataaaga
gttcttataaaaaatagaaattgccgcgggagagtggattggaaagattg
tattcagtgaacatatataGAAATTGATCCATTGCAAGTTCAATCTACAg
caaaatacaacgacgtggtttactagtctaatcCCACACTGACATGGAAA
TCCCCCCTTCTCTTTACCGTGCAAAGCGAACACCGTGAAAAAATCacgtt
aatatttttgtttcacgTGAATTTAAACCATCTTGTCATTCAGAAATCCT
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cgGATAATATCCTACTGTGGCTGAGAAATTCATGACCGTGATTTTTGTTG
AGGTGTTAACGCGCGAAACATTAAAGTcctaccgtcgttttgtataagat
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TGTACtttcatatttctttattaACAGGCTCTGGCAATTGTTGGAGATAT
TACAGTTCAAAGTGACATTGAGAATATTATCAACACAACCATGGATACTT
TCAAACGTCTCGATGTCTTGGTAAGTTATTATTGTCAAGTTTGATATTGA
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TAGAATTGCTTCtagaattgcacccttacagtgcagaaaaaaattggtga
aattcgtacccttacagtgcattttttcaaattttaaactcttttagagt
caatttgcctgactgcccccccccctcccggggCCAGAATGTCATGGAAA
TTTTAACATACCAGGACTTTAACTCAATAAGGTTCCAtctggcacacaat
gttgtttcaaagtttatctaacgtccatataacgttaaatgaacgttgaa
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CTGAGACgcattgagtaatttaacttcTTTTATTACACAGGTAAACAATG
CTGGAGGTTTAGTCATGGGGACATGTCTTCAAACATCAACGGAAGATTTT
GATCAAATGATGAACATCAATGTCAGGTAAACGActtccagctggcacac
aacgttgtttcaacgtttaactaacgttcacaacgtccatataacgttag
atgaacgattaaacaacgttatgtgccagctggctTGTGTTCTTTCATTT
TGTCCCTTCTGCACTGGCATGTAAATTAATGAGTTCATGTATGTCTGTTT
TTCTGCTACGGAGATGGatagttattttttcatttttctgtccTGACTGA
CTAGggatgacggtaaatcagcatttttaccCTCCTCGATTTTGCGGATC
AAAACTGTGAGCtgttccaaatcgtttcagtcactttaccgtcctcaggG
TACATAAATTTGCAATTTCACTGCAGCAAGGGTGTCGTGTACTAAGAGAC
GAATGAACACAGCTCCAAATAAGGACGATTAACGCCCTATTTACGATTTA
TATTCATCAAGCTTGTGTTTGATTTTTTGGCACAAGATATTGTCTCCCTT
TGTCAGCTAAACAGGTCGCTTCTTGCAACAAGATGAAGAGGTACTTAAAG
TGTACCTACTTCAAACACTTGATTGTCTGTATTTGTTAATATTACGCTAA
TTCAAATGTCACGTTTTGATGGGCTAATGTTTACATAATGGGTCTATTTT
TAGATGCTACACGTGAAGAACTATTTCTAATGCGAATCATGTACTTAAAG
AGAAAttactaccttattacacgaatattactagtcattttattaacacg
aattgaattaattgtgttttaataaaaaaccccttaattaaaaccagctg
CTGTTTCCTTGAGAAAGCATtttcgtgttaatttcagattgtgcaaattt
caaggccgctaaatacttgcctagtaataatCGTGTAATGAGGTATATAC
ACAAGCTCTCTGATTGGTCGGACCCTAATTATGTTATAGGTTTTATGTAA
ATTCTTGTTTCCAGATCTGTTTTTCTTATCACCAAGATGGCTATCCCACA
TTTGAAGAAAACTCAAGGTTAAAGTCAGCTCATTCATTTTTACTCTCCCT
ACTACAAGAAAGCCTTCGCCATTCCAATATCTTTATCTCTAGCTAAAATG
GTTTTCCCTACAAATAAACTAAAACTTGATGGTACTCTGAAGATAATATA
TTGTAAAAGTAGTATATTGTAAAagtgaaattatttttgggggAATAAAA
ACCTTTGTGGACAGTACTGTTTGTGGAAAAAAGATTATTGTGGTGAACAA
AAGCAGTAATTTGAGAAActaatttgggaaaaaaatggccaaaaattctt
ttcatatcgAAACAAGGCGATCTGGATTTATCGGATTAAAAAATGCCTAT
TTTTGGtcgtaaagaaaaaatgacgaTATTTAACACAACGAATATCCAGT
GAAAACTTGAGATCTTTAGCCCTTCCCGATCGGGAATTAATTCGATTCCg
attttgagggatctaaaTTTAAACTTACACTcaaaaatttcccgattttg
aatagtttttatcaaaaaatttgttaaatCGGGCTGTTTTAAAAACAGTA
ATGCActaattacaaaaatatacttttgGTTTCCCCGACTTTTAAACATT
ACTCTAAAGATCGCCGTGGAAAAATACCAGTATGTTATGATCTTGACATT
CGAGATTGGAATTTTGAGCAATAAACACTAAATTTCTACACATTAAGACG
TGTATTTTCTATCCCTATGGCCATTAAGCTCGTTCAAAATATTCTATTGT
ACTGGCTAAATGGGTCAATGTAACAATGGTCTGTACCGGGATAATTTAGA
ATGCGCCAAAAGATGTTGCGTTTATTAAAACCGTGTATTGTTTAATCTTT
TAGGCAACATTGTCAATGTTTCGACCCTTGGTAGCTCGAGACCagtaagt
ttttctttttcgagCTCTTCAGAACTTTCAGTTGCCTCGTTCCTTTTCAC
GAGACCAtattcgcacgtgacggttgaagccattctattggttagaagtg
acgtaacacttgaatgtaaccaattgAATCGCTTCATTTCGTTTTGGAGC
CGTCACGTGAGAATTTGGTCTGAATTTTGGGTATCTAACATACTGTGTTT
AAACTTTGATAATTAGTAGTGGTACCAACTCTCGACTCATTTCATAGcct
acacacacacacacacctATTCATACTATACACATTTCTTCTTTAAAAGC
AACCAGTTTGTTAAGCCTCGAGCCCTAAAATAAGCCAATTCTTCTCCCCT
ATAAAAGGTTAAACGGcagcccttgacccaataagcataaataagGTATG
ATATGAGGGGTGGCTGaagcaagttttttttaaattgagcTAAAATGCTA
AGCAACTTCAACCCTAAgccgaaaattttcttttgttgcaGCAAATTGGA
GTAAATGCATATTGTACCAGCAAAGCAGCTTTGGATCAATTTACGCGAGC
TACTGCAATTGAGTTAGGAGCTGACCAAGTTCGTGTCAACTGTGTCAACC
CAAGCATCATTGCTACCGAAAATACCTCAAGTAGCAACCATCCCACAATC
TCAGTATGTagtagttttttttcatttctaaaGTATTTCTATAACTTGAA
AATCATTGTACAGAAGGCCCTTTCATCTAGTGCCTGTTTAATCCATTTAA
GATACAGGAAAAATTTAGCTATAATAACCGCCCTTTGAATTCCACTGGCG
GATTTAaaacaatagagcaagtacgctAGAAACATGctaaggagtgcaac
gctcgttaattgaaaatgaaattacaattacaaatctcttaaCCCAGGGC
ACCTTGAGAAGTGTACACTTTACAGTGTGTCTCGAAAAAGATACTGTAAC
AGACAACTTATATAAAGTAGAAATTGTACTCTTTTCAATTATTTATACGA
GATGATCTTTAATGTGTTGTTTGCCAAAAGACATGTCTTAATTTTAGttg
gccttaattattagtcggccctaattttagtcacctcgtcaaaattaaGT
CActtaagggccgactaataattaaattttggcaatttctaaatttttag
tcggccctaattttagtcacctcgtcaaaatttattcACTAAGGGCCAAC
TGATAATtaaattttggccatttctaaacTTTTAGTGGACCCAAATTTTA
Gtgggcccaaatttttagtcagccttaattttagtcacaaaaccaaaatt
taatcacttagggccgactaagttttggtcgATAAGGTAGATTACAGAAC
AGATCAACGAATATCATGTATTTTTCACCACAATGTACCAACTGTACTAG
TACTGTACAAACAAAATCGATGGTAATTTCCCTGCTTTATTTAGAAATGA
TAGGTAAACTTTTTCATATACGATAAATATTTTCTACTCACAGTTCTTTT
CTCGCtgtatcccagctggcacacagcgttgtttcaacgttcatctaacg
ttatatggacgttgtgaacgttagacaaacgttaaaacaacgttgtgtgc
ctgctggGATGTGTCATATGTTATGGTAAACTATAATAAACCATTGCTTG
AAATCATTGCGATTAATTTCTCATAGAGTGCAATGGAAAGAAGCAAAGAC
GTGCACGCCCTGGGTCGTGCTGGTACAGTTGACGAGGTAGCCTCAGTTAT
CTGTTTCCTAGCGTCAGGAGCTGCTTCATATATGACTGGAGCATGCATCC
CAATCGATGGAGGACGATCAAACATGATTCCAGTCTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000275_pilon:124097..130184+ >XLOC_016036.2 ID=XLOC_016036.2|Name=XLOC_016036.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000275_pilon:124097..130184+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGCTAATGTTACATTCGATTACTCTGGAAAAGTAGTGCTGGTCAC
AGATGGCAGCTAATGTTACATTCGATTACTCTGGAAAAGTAGTGCTGGTC
ACAGGTGCTGGATCAGGCATCGGTCAAGGCACTGCTTACATGTTCGCAAA
ATCTGGTGCCAAAATGGTCGTTACAGATCGTAACGAAGGCAAATTGAAAG
AAACTGCaaaaaaaTGTGAAGAATTAAGCAAGCAAAAGGTGCTGGATCAG
GCATCGGTCAAGGCACTGCTTACATGTTCGCAAAATCTGGTGCCAAAATG
GTCGTTACAGATCGTAACGAAGGCAAATTGAAAGAAACTGCaaaaaaaTG
TGAAGAATTAAGCAAGCAAAAGGCTCTGGCAATTGTTGGAGATATTACAG
TTCAAAGTGACATTGAGAATATTATCAACACAACCATGGATACTTTCAAA
CGTCTCGATGTCTTGGCTCTGGCAATTGTTGGAGATATTACAGTTCAAAG
TGACATTGAGAATATTATCAACACAACCATGGATACTTTCAAACGTCTCG
ATGTCTTGGTAAACAATGCTGGAGGTTTAGTCATGGGGACATGTCTTCAA
ACATCAACGGAAGATTTTGATCAAATGATGAACATCAATGTCAGGTAAAC
AATGCTGGAGGTTTAGTCATGGGGACATGTCTTCAAACATCAACGGAAGA
TTTTGATCAAATGATGAACATCAATGTCAGATCTGTTTTTCTTATCACCA
AGATGGCTATCCCACATTTGAAGAAAACTCAAGATCTGTTTTTCTTATCA
CCAAGATGGCTATCCCACATTTGAAGAAAACTCAAGGCAACATTGTCAAT
GTTTCGACCCTTGGTAGCTCGAGACCaGCAACATTGTCAATGTTTCGACC
CTTGGTAGCTCGAGACCaCAAATTGGAGTAAATGCATATTGTACCAGCAA
AGCAGCTTTGGATCAATTTACGCGAGCTACTGCAATTGAGTTAGGAGCTG
ACCAAGTTCGTGTCAACTGTGTCAACCCAAGCATCATTGCTACCGAAAAT
ACCTCAAGTAGCAACCATCCCACAATCTCACAAATTGGAGTAAATGCATA
TTGTACCAGCAAAGCAGCTTTGGATCAATTTACGCGAGCTACTGCAATTG
AGTTAGGAGCTGACCAAGTTCGTGTCAACTGTGTCAACCCAAGCATCATT
GCTACCGAAAATACCTCAAGTAGCAACCATCCCACAATCTCAAGTGCAAT
GGAAAGAAGCAAAGACGTGCACGCCCTGGGTCGTGCTGGTACAGTTGACG
AGGTAGCCTCAGTTATCTGTTTCCTAGCGTCAGGAGCTGCTTCATATATG
ACTGGAGCATGCATCCCAATCGATGGAGGACGATCAAACATGATTCCAGT
CTAGAGTGCAATGGAAAGAAGCAAAGACGTGCACGCCCTGGGTCGTGCTG
GTACAGTTGACGAGGTAGCCTCAGTTATCTGTTTCCTAGCGTCAGGAGCT
GCTTCATATATGACTGGAGCATGCATCCCAATCGATGGAGGACGATCAAA
CATGATTCCAGTCTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000275_pilon | genome | sc0000275_pilon:124097..130184 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 622-783:5927 |
| Aaloc | 460-621:4742 |
| Aaloc | 421-459:4206 |
| Aaloc | 367-417:3316 |
| Aaloc | 280-363:2291 |
| Aaloc | 187-279:1728 |
| Aaloc | 55-186:708 |
| Aaloc | 1-51:1 |
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