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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:320779..328670+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014841 ID=XLOC_014841|Name=XLOC_014841|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7892bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:320779..328670+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCACACAGAGCAACCCGCAAGGAATTCACGTCAAATGCCTATGCAATAAG
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TGCCACCTTTTAAAAACAACTTCAGTCCAATTCTACACGTACTTGTTTCA
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TACTGTTACACCACCGTACATATATCTATACTGTGACGATGTACTATTAA
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GCACCTCTATGTCCTCTATAGTattaatacatgtttttttttataagcaa
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AGGCATAgcatatgcttattatatgcttatgaattattatgcttttgatt
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TTGAGTCAAATGTTTATATAATAGGTACCGTGAGTGTCACAATTTCTGAA
TATTACACTGCGACGACGTATTAagcaaaaagattttgctttgcaGAGAT
TGAGAAACTGCAATTAAGGTTCATACTCAACTCCAGTGCTCGCGATACAT
TATATACCCTTTTCTCTTTTACAACTAGGTTACAAATTGGTGATAGAAGA
TGTTGCAAAGTTGCCATCTTATATTCCAAAGGTAATAGAATATTTACTTA
AATGAACCCCTTTCCACTgccaaaaacaaaaagcttTAAACAACTGAAAT
AATGACACTATATTGAGATCTGGCACACAACTTTATTTGTATGTTCAGTC
GTGCAAACTTTCGCAAGCGGAAACTTGTCgagaaatcgcgaaatttacga
catttttactttcgcgaatttgacgaaaaatgttttttgtgagcataaac
tttcgtgaGTCAACacaaaaagatgaaatttttcacacgaaaatatggct
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TCTGAGGCTTAACAGGCTATGAAGTGCCACAAATCTTGCATTTGATTTTA
AGttagaagttttacagattttccaTTTTATCAAGAGGTTTTCGCAATTG
GTCCTTTCAAGAATTTAAAAATTACTTTCGCGGAAAGGgttaaaattcgc
gaaaattgcgaaaatttCTGCTCGTGAAAGTACTaaaaaaaTATGCCTAG
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GGAAATATCGGATATTTTCAATCGTTTATGatcaagataaaaaagaaatt
ggttgcactttcattgattttaaaacTGGTGAAAATGTTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:320779..328670+ >XLOC_014841 ID=XLOC_014841|Name=XLOC_014841|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1656bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:320779..328670+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCACACAGAGCAACCCGCAAGGAATTCACGTCAAATGCCTATGCAATAAG
CCACACAGAGCAACCCGCAAGGAATTCACGTCAAATGCCTATGCAATAAG
GTTGTatgatttcaaaaatcgaactttAATGGTTGAAAGTAGTACTGGAA
cttattttattaaaatgaaAGGTACCCCTACACCCACTGGATGTTTCACT
AAACGTAAACTAGCTATCGTCGGTATAGCCGTCGCTGTGCTTGTACTAGT
CGGCTACGTATTACGCGAACGTTATTTCTACCGCGCGGACGTTTTAATTG
CTATTCAAACTAACGTTCAACATGCACGAAAAGTGGTCGGCAACAAGATT
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CGGTGAAACGGATGATAAGAAAATTAAGACAAATGTATGGGATGAATGGA
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TAAACGTAAACTAGCTATCGTCGGTATAGCCGTCGCTGTGCTTGTACTAG
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TGGAAATAAAGGGATACttggatttttgaattttggcggGAAAAACAACG
TCGGTGAAACGGATGATAAGAAAATTAAGACAAATGTATGGGATGAATGG
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AGATGGCAAAGAAGGAGTTCAAATCAAATCATATCTCAATCAAACTTACA
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GAACTTTTCATGTCCAAAAACAAAGATATGTGTGAAGAAGCTAAACTGTT
AGATACACCGTACTCGTGTCCTATCAAAGCAGAATACGAGATTACATCAT
CTTCAGTGAAAATGGAAGTCTTTTACAATGATGAACTTTTCATGTCCAAA
AACAAAGATATGTGTGAAGAAGCTAAACTGTTAGATACACCGTACTCGTG
TCCTATCAAAGCAGGTTACAAATTGGTGATAGAAGATGTTGCAAAGTTGC
CATCTTATATTCCAAAGGTTACAAATTGGTGATAGAAGATGTTGCAAAGT
TGCCATCTTATATTCCAAAGGGGAAATATCGGATATTTTCAATCGTTTAT
GatcaagataaaaaagaaattggttgcactttcattgattttaaaacTGG
TGAAAATGTTTGAGGGAAATATCGGATATTTTCAATCGTTTATGatcaag
ataaaaaagaaattggttgcactttcattgattttaaaacTGGTGAAAAT
GTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:320779..328670 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 736-828:7800 |
| Aaloc | 685-735:7031 |
| Aaloc | 553-681:6398 |
| Aaloc | 454-549:5115 |
| Aaloc | 52-450:2610 |
| Aaloc | 1-48:1 |
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