XLOC_014795 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_014795
Unique NameXLOC_014795
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000159_pilon:69712..80214-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_014795 ID=XLOC_014795|Name=XLOC_014795|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10503bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:69712..80214- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAATTAGAAACTAGTAAACCTCAAGATTTATCCAAGCAACATATTTTGAC AATGGCAAAAATGGCATCGAAAATTGTATTGTCAGTGGTAATGGTATGTT TAACCATGGAATTTGTAGTGGCAAGAAACGAGAATTTATGTGATTACAAT CTCTTTCAAGATAATGTGAGTTTTTGTAAATACCTTCTTATTCATACATG CTTGCCGTTCCGTTGCGACCAGGATCTGTTCAACGATCAATTTAAAGTTG ACTCTGTTCTAAAGTCTGTGTCGATATAATATGCAGTGGGGACAAAAACG GCTGTGACCTTTTTTTTTTTTTCTTCTTCATTTTTCATCTTCATTTGCCA AACTTTTTTAACTGTTAAGTAATATTCCACTCTTGAATATCTTTTCATAA AACATAAAACAGCTATTTAATTCGAATTCTATCAAAAGTTACAGCCTATT TTGTATCACCGCTGCGGATTATATTGAGACCGACTTTATTATCACACCCT CATCTCATTCTCTCACAGACCCGGTAGGATTTTTTCAGTCAGTGGGGATA AGAATAACGGACTGAAAACTTGATGGGGATTGATATTGTCATATTTTTTA TGTCTGGGGATTTCAATTTTTTTGTTATCAAGTCAGAAAGTTCAGCGAGG ATGGGAAAAATAGGATAGTATTTTGCAGTGAGGATTAGTTTATTTTCGAT TATTTTCAGTGGGGACAAAAATTGGAGGATATTTTTCCACTGGGAAGATA TATCAGCCAATTTTTCCAGTAGGAAGGGGTGGGAAGGGGGTCTGTTATAA GGGGTGTACTAGTGTATCATCCAGAATTATAATACTGACTATAGGCTTGC CTACTGATTTCGGAAAGTAAATTTATTTACAAAACAACAAGGTATCAAAG CTGAAACGAAAAAGGTTTTGCAGGATGGTTTTCCAGGCTACACCGATGAA 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GATTTCGTCCAACGGTTTTGCTCGTGCAGCCAGCAGCAAATTTCATGAAA AAAAAAGAACGAAATATAACACACGTGGCCTGGCTATTTTGGCACGTGGT GCTATGGGGTATATAGGCATATAGTGCTATGGGGTATATAGGTATATAGG TATATGTACCCACGAAATCCGTGCCAACGGCAGATTTCGTCCAACGGTTT TGCTCGTGCAGCCAGCAGCAAATTTAATAGGAAAAAAAAAAGAACGAAAT ATAACACACGTGGCCTGGCTATTTTGGCACGTGGTTCTATGGGGTATATA GGTATATAGTGCTATGGGGTATACAGGTATATGTACCCCACGAAATCCGT GCCAACGGCAGATTTCGTCCAACAGTTTTGCTCGTGCAGCCAGCAGCAAA TTTCATGGAAAAAAAAATAACGAAATAAAACACACGTGTCCTGGCTATTT TGGCACGTGGTGCTATGGGGTATATAGGTATATATAGTGCTATGGGTATA TAGGTATATGTACCCACGAAATCCGTGCCAACGGCAGATTTCGTCCAACG GTTTTGCTCGTGCAGCCAGCAGCAAATTTCATGAAAAAAAAAAAAGAACG AAATATAACACACGTGGCCTGGCTATTTTGGCACGTGGTGCTATGGGGTA TATAGGCATATAGTGCTATGGGGTATATAGGTATACAGGTATATGTACCC ACGAAATCCGTGCCAACGGCAGATTTCGTCCAACGGTTTTGCTCGTGCAG CCAGCAGCAAATTTCATGGAAAAAAAAAGAACGAAATAAAACACACGTTG CCTGGCTATTTTGGCACGTGGTGCTATGGGGTATATAGGTATATATAGTG CTATGGGGTATATAGGTATATGTACCCACGAAATCCGTGCCAACGGCAGA TTTCGTCCAACGGTTTTGCTCGTGCAGCCAGCAGCAAATTTCATGAAAAA 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CTCAATTAACAACAGAAATCTTTTTTTTCACGACAATTACCATAAAAGGC ATGAAAAGATTCGAGATTTCTCTTTCGTTTTCGGCTTTTTGTCGTATGTT GTTTGATTGATATTTGTTTTAACACTTTTATTTTCGTTAGTTGTAATTTT TGATTGACGGCTTCATATTATGGAGATAAAAGGAAGAGAGATGTTTACGA ACTGTGCAGCTGGCTGCCAGAGGATAAATGTCATAGTACTGGACATGAAT GTCAGGTAACCCGAATTATGTTTTATCTATCCCTAAACGTCAAACTATTT ATGCCTATAGCTAAAGGCGGCTTTAGACCACGTCGAACTTATCAAAGAAA GAGATTTGTAATTGTAATTTCATCGTCTTTTATTGAGTGTTGCACTCATT TGCATGTTTCCGACTTGCTTTCTCTTTTGTCTTAAATCCACCAGTGGCTA AATATTTATTCCAAGGCAAGATTTAGCTTGGATATCAATACGGTAAACTA TTTCTTTTACTCTGTTGTTTCTAGTTTCAAAGTTTTAAAGTTTTGTAAGG CCGATAGTTAATTTGATATTCTATGTTTTCCCGTGGCTCAGTTTTTTTGA GACCGATGATCACATTGATGACTTCGCATTAATTTCTAACTGCCTAATAA TTACACTTATGGCTTTTAATAGATTTTAATGAATTTTCTATATTTTTCCT TCGCTCAGATTTTTTATTAAGACCGCGATGATTAATTTTCAATGTTTTGC TATTAATCTCAAACTATCTAATAATTATTTTATGGCTTTCCGACGGCTTT TAATGATTTTTTTTGTTTTTCTCATGGCTCAATGTTTTCATACGACACCC GTTTATTTTTCAGGTTCATTTCGGTCGTGTGGAGAAGTCAGTCATTTTGG TCAAAGGAATAGATGTTGTACATTTGCAAAGAACTTTTGTAACCAGCAAC CAGCCTGCGGAGATTATTGTGCATGTTGGAGAGAAAAATGTCGTGGAAAA TAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000159_pilon:69712..80214-

>XLOC_014795 ID=XLOC_014795|Name=XLOC_014795|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=750bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:69712..80214- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAATTAGAAACTAGTAAACCTCAAGATTTATCCAAGCAACATATTTTGAC
AATGGCAAAAATGGCATCGAAAATTGTATTGTCAGTGGTAATGGTATGTT
TAACCATGGAATTTGTAGTGGCAAGAAACGAGAATTTATGTGATTACAAT
CTCTTTCAAGATAATGAATTAGAAACTAGTAAACCTCAAGATTTATCCAA
GCAACATATTTTGACAATGGCAAAAATGGCATCGAAAATTGTATTGTCAG
TGGTAATGGTATGTTTAACCATGGAATTTGTAGTGGCAAGAAACGAGAAT
TTATGTGATTACAATCTCTTTCAAGATAATCAAGCAGTAACAGCCGAGAT
CAATGGGGAATATGATGGAGAAACAACGATGCTACTAAATTATTGCTCAG
CAAGCAGTAACAGCCGAGATCAATGGGGAATATGATGGAGAAACAACGAT
GCTACTAAATTATTGCTCAGGTTCATTTCGGTCGTGTGGAGAAGTCAGTC
ATTTTGGTCAAAGGAATAGATGTTGTACATTTGCAAAGAACTTTTGTAAC
CAGCAACCAGCCTGCGGAGATTATTGTGCATGTTGGAGAGAAAAATGTCG
TGGAAAATAAGTTCATTTCGGTCGTGTGGAGAAGTCAGTCATTTTGGTCA
AAGGAATAGATGTTGTACATTTGCAAAGAACTTTTGTAACCAGCAACCAG
CCTGCGGAGATTATTGTGCATGTTGGAGAGAAAAATGTCGTGGAAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_014795XLOC_014795-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000159_pilongenomesc0000159_pilon:69712..80214 -
Properties
Property NameValue
Aaloc238-375:139
Aaloc166-234:9474
Aaloc1-165:10504