|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000018_pilon:1608002..1616681- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014554 ID=XLOC_014554|Name=XLOC_014554|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8680bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018_pilon:1608002..1616681- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GCTTTTTTATGCTTTTTTAGGTATATCAAGAAACCTTTGCTTATCAACGG
TTTCAAATTTGACATTCGAGTCTACATGTTAATTGCTTCGACTTGTCCGT
ATATTGCATTCTATCATAAAGGTTACGTCCGCTTATCTTGTGTACCGTAT
ACTGTTGATGATTTAGATATACACGCACATCTTACAAATCAGGTAAATTA
ATTTTAATCTCTCTTCTTTGTCATAAAGAAACCTCAATACGCCTTTTCGA
CCGTAGCCGCCAATTGCCGCGCGGGCATTTTTTTGTCCGTTTTACCACCC
TAAATCGATCCAATTCTTTTTTAACATTTTTTCTATTGTATTTAGGTGTG
AAAAAAAGACTGGGTCGGTTTTAGGTTGGTAAAACGGACAGAAAAATGCC
CGCAAGGCAATAGACGATATCGGCTTAACGTGAAAACTCATACTTGACCC
CCGAGAATTGCCCACAGTTCTTTGTGCGGAAAAAAGTTCACGGTGAAATT
ATTTTCGCACAAAGCATTGTGGGCAATTCTCGTGGGTTAAATCTGAGTTT
TCATGTGAAGCCGATATCGTCTATTGGCGGCTACGGTCGAAAAGGTGTAT
ACACAGGTTGAAAAATTAAAGTCTGTAGACAAATCACGTTTTTACTCAAA
AATTTTATGTGCTTGTTACATGATATTTAATTCTGATTGGTTCGAATTTA
TTGACACTAATATAAGTTATCAACTGTATATTGTAAAGCAAGTAACATGG
GAATAAAAACACGTTAACTTTTTCGAGTAATCACATTTTTTGACTGGATT
GATGTAATTTTGCAATCCGTGTATTCTGTGTGTTTAATAATTCTTAATAC
ATTTTTGTCTCGTTATCATAATTTTTGGGGAATGTGATATACTTTAAGGG
CAGAAACTTTCGCGAGACCGAAAAGTCGCGAAATTGAAGAAAATTTACGG
AAGAAACTTTCGCGGTTTTTTGTGAATGTTCAATTTTAGTAGCAATAACT
ATCGCGAGTGGCTAGGGAAAGTGAATGAAAAATTATTTCAAATCTCATTT
TTTTCTTCAATCAAAAGAGTGATATGCTAATAAATGAAAAATAAACTATT
TGCACTTCTTCCTCTCATTCCGAATCCTAGTCACTGCGATAATATCGATA
ATATCGACTCTCCTCGGCTTTTAAAACTTGGAAAAAACTTTCGCGATTTT
AGGAAAATTTCATTTTTCGCGAAATTAACTTTCGCGAATTTCTTGTTTAA
TTTCTTACATTCGCGAAAAAATGCCAAAAACGCGAAAAACGCGAAAGTTT
CTGCCCGCGAAAGTTTCTGCCCTTAAAGTATCTCCTATCTACTTATATTT
CCCTAGAATTACCGTTCTAACCCTTAATGTATCCTTATCCTTATCCTTAT
CCTTATAAATCAGCCATTGGAGACTAAGATCTTATTCTATAAATAACTTG
TAGTTTTTTAAGTATTGATGCTCATCTTAAAGGGACATAAAGTAGTAAAA
TGTAAACATTGTGCGAACCACGTTTCATTAAAGAGAACAATTAAACTCAC
GTGTCCAAAACAAACTTGTCAAACAATTGAAACAATTATTTTTTTTATTT
TGACATGTGACATTTGTTTTGATTTTGTTTCCCGCTGCATACGGTTTGTT
TACAAATTTCGTGACTACTTTTATGTCCCTTTAACTGGTGTTAAAAAAGT
CCAATAAAACGTCCCAATTTCTCATAATCTCATACCAGATAACGGTTTTT
GCGCATTAACCCTTTAAGTGCCATGAAAATCGCTAGTTCAAACTTCAAAG
GTTTACCGGGTGGTCCAAAAAAAACTTCCATAAGTTTCAAATTTTGACGT
AGAGCGCTCTTATTGTGTATTTCTCCGGATCTAGAAGGACCTGCCTGAAC
GACGGAAAGATGCCCAATAGTAAAACTTCAAATTAATTCACTACAAGACA
GAATCAAGTAAGGCAGGGCCAAATTTGGAGGTTCTTGGATCACTCGGTCA
AAATCTCAAAAAAGTGGATTTTTGTCAAATATTTGCATTTTTTTGACTTT
TTAGCATAAAATCTTTCGACACAAATAATTGGACACAAATTCAATTTTTA
AGGTTTTTGACTTTTAAAGAAATATAGTCTGCAAAAAAGTGGGGCCAATG
GTCACGGGCTAATATCCATGAATCGGTATTTTAAAGGTTTTTTTTTCTAA
ACAAGAGTGAAATCGTTTGCTTACTCATCAATTTTAATTTACAGGCTTTT
TCACATTGCATTGACACCGAACAAGATTGGCCAGAAAGTATGGAGAAAAA
AACATTTTTTGCTTATATCAGCACAATATAACAATAGGCAGACACTTTCC
TGATATCAAATACGTGTCTGATATGAAACGGGAACACTTGTGTAAAAAAT
ATCTTTAAAATCAATCTTAAATTTTATTTTTAGTTTGTACAGAGAAAGCA
TCCTTCATATAAAGAGAAGAAAGAAGAATCTGTCATGGATTTCAACCAAT
TTAATGAGTATATCAATCATCATGTTGGTGAAGACAAATCCATATCACAT
GATTGGGTCTTTAATGAATTTACTGTAAGTAGCTACTTTAGGATTTAAAA
TGTAAGCTCCTGCTCTTTTATACTCTTTACCATAGTGTATCTCGTGTTTA
TTGCTTCGTAGTATACTCCGTGCACATTGTCTGCTTGATAAAAAAGTTCC
CGTACAGAACACTCTGTGATGAAGTATAATTATGATTTATAAATAGCAAC
ATTTCTCTTACCGTCTCCCCTTTCTCACCAACACTCCATCGCAGCGGTCG
GTTTGAAAAATTTCAAATCGGAAAAGACAATAACAACAGACCCTCTACGG
CAATGAATTTTGAAATTAGCCGTAGATACTGGGTCTGTATACAGACAAGC
TCTTTTATCGACCGTAGTGCAAAGGTAGCGTTCGGATACGATGTGCAAGC
TTGTTGGTTCAATCCCCGGCTGGGTCACACCAAAGACTACGTACTTAGTA
CAAAATGGCACTTGATGCCTCTCTGCTTTGATGCTCAGCAATTAATGGAT
CAAGGAGAAGTGGAGCAATCCAGGGAGAAGGAGTGGCGTCTACCTTTGGG
TAGATAGCTATGAAAAGAGGAGACTTCGACTGCAGACTTAATTATGAGCT
CCTTGGAGCAGGCGTTTAGACCAACCTTTTAGCTCACTCTTTAACTTACT
AAGATTTCAAAAAAAATTCTTATTTGTCAAGTTTTAATCAGGAATAAAAA
AATCGAGTAAAAGTTTTGGTTGGGTGATAAAATTACCCCCTCAAAATTTT
CGCCACTTTCCCCGATATTTCTTTCCCCGATATTTCTTTCCCCGAATAGG
TATCGAAACAATTTTGACATTACTATGGACTTGTGAAGTAGGCTCTGTTT
TAAATTCGACGTTCTGTTTGGACGTTAATGTCAAGCAAAAAAAGTCAAAA
ATTCAATAATTTAAATCATGTTTTCGTGTTTTTATCCTTACTTTAAACGA
ATCGGACATCCTTGAAAAAGATGTAAACAAAGTTTAAAATTTATTATAAA
CAATTTCAAAAATCTATTTTGATTCCGTTTGATGCTGTCAGCAAGGTAAT
GTAAACAATCAAGGAAGCTAATGGTCTCATCCAGTAGCGTAGACATGAGG
GGCGCAAAATTTGTGTAGGAGAGCTGATTTTTATGACAGTAAATTATCCT
TTTATATGACGAGTGGATAATAATAGTGTCATAAAAATCTGCTCTCCTAC
ACAAATTTTGCTCTCCTCCTGTCTACGGTACTGGATACTGCTTTATTTTG
ATTGGTTTAAATTCGAACTTCTAAAAATAAATTTTCTTTTGAAACAAATT
TGATTTAACAAAATATATAACTTTGTCAAGATCGAAAAATTTTTCGTTGG
ATTTTGATATATAAAACTAAAGACTATATTGCCATCTAGTTTTATAAGTA
GTGATTCCTCTAGGATGGTGAATATCAAAATCATAATCTACATAATATTG
AAATTTCAAACATTTGTTTCCGGGCAAAGAGTTTTTGAATTAGTTTCCAC
TGGTAAAACAATCAATGCTACGCCTTACAATACAATTCAAGAAACACCCT
ACCCAAGATGCATCAGTATTTGTTCTTTAACCCCAGAATGCCGTTCGTTT
GATTATACTCTCTCGCTGCAAAGAAGTGGAATTTATGGAGAATGTCATTT
TTATGATATTGATTTCGAATTCTATCAAGATCAACAAGTTAGAGAATTGA
AAGCAAGCAGCACAACAAAATATTATTCGATTTTGATGCTCAAAGATTGC
GCCGCTTGGTTCAATTATGGTGCACGGGAAGACGGCATTTACGATGTTTT
TCTATTGGGGAAATACCGACGCCGTGTTTTTTGTTTGATGCAACACGCTG
GTGGCGGATGGATGGCCTTTCAGCGCCGTTTTGATGGATCTGTCAGATTC
ATGAATCGTAACTGGAGAGAATTCAAAGAGGGGTTTGGGAACGAGGAAGG
AGAATATTACCTTGGAAACGAGCTTCTCAATTTGTTGACAACGGATGAAG
GACATGATTGGTTGGTGAGAGGAACCAATTGGGATGGAATTACTCAAATG
AAAATGATTCATAATGTCATAGTCGAAAGTGAAACTGATTGGTATCGACT
AAACTACGATGCATCTGATATTGACTCGACCTTTTCTACCGTGTGGTATG
GTGAAGTCATGAGAGGGATGAAATTTTCTACATTTGACGAGGATCACGAT
ATAGCATCTACAAAGAATTGTGCCGCTAAACATGGTGGATGGTGGCATAA
GGAATGTCATGGGGTAGCAATGAACGGTCCATACTGGGCCAACGAACATT
ACCGCCCTTCTAACGATGCAAATGGTATTATATGGTGGAAATTCGATAAT
AACGGAAATAAGGAATACGCAAATTTACAAAGCAGTTTGATCATGATTCG
ACCCTCCTCTTTCTAACCATAAAGACTTTTTTCAGTGCACTAGCAGGAGT
TGTATTGCCTGACGATTAGCGCTGTTACTTCCAAAATGAACTGGAATTGA
CAAAGCGCGTGTATTTAAAGAAACCGGACATACAGCAGCATGGGTAGTAT
TATGCTTAAAGAAAGGCTGGGCCAATGAATCACCTTTAATTTTAAAACAA
AGGCTGTCATTTAAATAACAGCCTAATCGAAAAATTGAGAACAATTCGAA
ACGATCTCGTTGAAAATTTTGACATTGACATTTTTTCTGATGTGTTTTTT
ATTTTGAAAGTTGGACCATTTGCAAGCTCATGCTATCAAACACATTTAAC
CATTGAGATTTGGATTTTTGCATCGTGAATGATTCAAAAAGTTTGCAATC
TTCGTTAAATTGATTGAATGTATAATTATTTAGTAGATTAAAAATTTGTC
CCTCATTTTCGTAAATATTGTATATTATCAAATATTTATTAACTATTATA
TCTTATAACGACAAATCAGAAATTGGAAAATATAATGTGTCATGAAATGA
AACAATCTAATCATGTGTCAATAGAAATTCTTGAAACAATATAAACAATT
CAGTTAGATTTTGCAGTACGGGGCCGTCCACATAGTACGTACGCACTAAA
ATGTCGAAAATCGAGTACCCCCTACCCCCCTGTACGCAAGCGTACGCAAA
TGACTATACCTCGCTCTGGTAAGTACGTACTTTTTCATTCACCCCCCCCC
CTCGGTTGAAGAAAATTTCGAATTCAAGCCGTTTGGTTCGGACCTTTATT
TCATACATGAAACTCAATGTTTATCAAGAAACTTTTTCTTTTCCTTGATG
CGTATAACAAGCGTAAAAGTTGACAAAAAAACAAAATGGCTATGAAAAAA
TTTTCTCCGCGTACGTCCATTTTCCTTTGACACATCCTTAGTGCGTACGT
ATTATGTGGACGGCCCCTACGCTGCATACAGTTTGTTTTCTAAGGGCCCG
TTTACATGGTTTTTTGGTACGGTCTACGGTCTGAAGTCTCATATCGTTTA
CATGCCGGATTGGTCTGAGATTTCAGTACGCCCTAACTTTCGGTTCGGTC
AAAACCACCGAACCGAAATTTCAGTATGGTCCAGAAAATCTATGTAAATA
CAAAGAAATTTCAGTTCGGGGTGTTCGTAGTTCTTTTTACAGGCTGATTA
TTGACAGAACTCAAAATATATTTACTGGAACGGCATTTTCAAAAGTTTTT
CGACCACGACTGAGATTTTTAAGTATGTGGTAAACATTCCATAGGCGGTT
TTAGACCATGTCAAACTTATGAGAGGAAGATATTTGTAATTGTATTTTCA
TTGTCTTTTAACGAGCGTTGCACTCCTTTGCATGTTTCCGACGTACAATC
AAGGTCATAATATTTGAAAATAAAGGGAAATTCACCGGGAAGTTTTGCAA
CCACAATCGATTTGTAAGTGGTCTAAAGTAGGTTCGAAGAGTAGAGTTTT
AACTCTGAGTTTTAACGCTAAACTTTAAATCTTGAAAACCGGAATTCTCG
ATATATTTCAACCATGATTGTACTTGCTCTATTGTCTTAAACCCGCCAGT
GGACTCGGCCCACTAAAGTACGACGACCACCCCGAACCGAAACCGAAAAT
TCAGTCCGTACACCGAAGCACCTAAACATGTAAACTCAGGTCGGTCTGGA
TCTCAGACCGTACCGAAAATCCATGTTAATGGACCCTAATACAGTAACTA
CCTTTTTTGTAGATCTTGTTTTTGATGGTATACGACTGGGACGGTTTTAG
GGTGGTAAAACGGACAAAAAAGGGCCGCGCGGCAATTGGTGGCTACGGTC
GAAAAGGTGTATATCTTTTGAGTCTCCCGGTACTTAATAGTAAATTTGTT
TTCACAAACTTCTCTTCTTCTCTTAGATACAAAATAACCTCCCTGTCAAT
CAGAATAATTCAATCTTTTCAAAAACTCCCGGCTTGTATAGAAAGATTGA
GAAATTGAGAAATTAATTTTTGATTTTTATTCATTATTTTTAGGACAAAA
TGAAATCCATCATGTTGACATGTTTGAAAGGTTGTATGGGGAAGTTAGAT
GAAAAACCTTCAACTTTTGAATTACTTGGATTTGATTTCATGATTGATGA
AAATATGAAGGTGAGATATACAGAAAATGGCGACCGTAGCATGGGTCATG
CCAAAGATTCCCAAAATGGTACTTGATGCCTCTCTGCTTGATGCTCAGCA
AATAAAGAGACGAAGAAATACAGGGAAAAGAGTGGCGCCCTCCCCTACCT
TCGGGTAGACAGCTATACGAAAAGGGAGCCTTCGGGTTGTCCTCGACTGC
GGTCTCAAACTTACTTACTATACGGAAAGTATTGTATATAATTTACAGAC
CAGAGCAGAGCTAGAAAGATGTCTTAAGACATTTCAGACAATCGCAAATC
TATGACATCTGTTACACTTGACACTCCTAGGTGACGAAAAGTATCATCCT
TTTCCCTCCCTGCAAGTTTATTAGGTGACCAAATCATATTTCTAGCCTCG
TCACATTTTTAGCGAAGTACACTATTTCTCTTCTTTCGCTAGAAAATTTT
AACTTATGCAAGTCCTCATTCCCTCTCTCCACTTTTGGAATTGTGTATTC
ATCCATGTGTAAATCCAGCCTTTTAGGTGTATCAGCCTCTACTTACTTAT
TTGCGGAATTAAAAAATCAAGTGTTTTTAAGGTATATTTTTTGAGAAAAG
TGGTGTGCACTAAAACCTTTGGGGTAGGTTGTAGACTTCAAAAAATTGAT
CATGCGATTGCGCCCTACTAAAAATGCTACGAATCCTAAGAGTTTGCCCC
CTACAATGGTAGATTATGCTTTCAAATAGAAACGTGTATATATTCTATAA
ATTCACTTTGACCTTACTTTAAAGGTGTGGCTAATTGAAGTAAACATCAA
TCCAGCGCTTCATACAAATTGTCACGTGCTAAAAGAAACTATTCCACCAG
TTGTTCATCAGACTCTCGGTAAGTTCCATACTCCTTTTCTGGGTATTTAT
AATCTCCAACTGGCTTATAGCATCTTATTTAACGATAAAATGGACAAGAA
TAACAAGCCGGGGGGGGGGGGGTACTTAGGAAAAAATGGGCGCTGGGTAT
GTGGGGAAAGCAAGGTAATGGTCGGTTTTCTCACCTTTCAAAGTCTCTCT
AAGGGTCGGAAAAATCACGATTTATTGAAAATTCTTTTTTATTTAGAGTG
AAAAAATTGTAAAAAAGTCTCTCTAAGGGTAGAGAATCTTTCCAAAATCG
AAGAAAATGTTTCAAAAAGGTCTCTCTAAGGGTGACCTTTTCTTTTAAAT
CAGTCTCTTTAAGGGTCGGTTTTCGGAGATCGCATCCGCACATACCCCTC
AACTGTCAACCGTAGTACCCCTCCCCGGGAATAACAACCAATTTCACAAT
TTCAATATCTTAAATTTCTAAAGTACTCTTTAGTTTTACCCAAAGATTAA
AAAATTCATCAGCAAATTTAACGAAAAAATAACTTAGTGACGAATTTTTT
TACAGGTGAATCTTTTTACCGATTATATCAGTACGGTATTAGACATATTT
TGATCAATCATTTTCTATATTGTTAGATATCGAATTGGAGATATTCAACA
AACGTAAGAAACGAACGAAACTTGGTCAACTAGACTGTGTAACTACAATG
GAACCTCTTTACAACGGTTTCACTGGGGCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000018_pilon:1608002..1616681- >XLOC_014554 ID=XLOC_014554|Name=XLOC_014554|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1296bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018_pilon:1608002..1616681- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GCTTTTTTATGCTTTTTTAGGTATATCAAGAAACCTTTGCTTATCAACGG TTTCAAATTTGACATTCGAGTCTACATGTTAATTGCTTCGACTTGTCCGT ATATTGCATTCTATCATAAAGGTTACGTCCGCTTATCTTGTGTACCGTAT ACTGTTGATGATTTAGATATACACGCACATCTTACAAATCAGGCTTTTTT ATGCTTTTTTAGGTATATCAAGAAACCTTTGCTTATCAACGGTTTCAAAT TTGACATTCGAGTCTACATGTTAATTGCTTCGACTTGTCCGTATATTGCA TTCTATCATAAAGGTTACGTCCGCTTATCTTGTGTACCGTATACTGTTGA TGATTTAGATATACACGCACATCTTACAAATCAGTTTGTACAGAGAAAGC ATCCTTCATATAAAGAGAAGAAAGAAGAATCTGTCATGGATTTCAACCAA TTTAATGAGTATATCAATCATCATGTTGGTGAAGACAAATCCATATCACA TGATTGGGTCTTTAATGAATTTACTTTTGTACAGAGAAAGCATCCTTCAT ATAAAGAGAAGAAAGAAGAATCTGTCATGGATTTCAACCAATTTAATGAG TATATCAATCATCATGTTGGTGAAGACAAATCCATATCACATGATTGGGT CTTTAATGAATTTACTGACAAAATGAAATCCATCATGTTGACATGTTTGA AAGGTTGTATGGGGAAGTTAGATGAAAAACCTTCAACTTTTGAATTACTT GGATTTGATTTCATGATTGATGAAAATATGAAGGACAAAATGAAATCCAT CATGTTGACATGTTTGAAAGGTTGTATGGGGAAGTTAGATGAAAAACCTT CAACTTTTGAATTACTTGGATTTGATTTCATGATTGATGAAAATATGAAG GTGTGGCTAATTGAAGTAAACATCAATCCAGCGCTTCATACAAATTGTCA CGTGCTAAAAGAAACTATTCCACCAGTTGTTCATCAGACTCTCGGTGTGG CTAATTGAAGTAAACATCAATCCAGCGCTTCATACAAATTGTCACGTGCT AAAAGAAACTATTCCACCAGTTGTTCATCAGACTCTCGATATCGAATTGG AGATATTCAACAAACGTAAGAAACGAACGAAACTTGGTCAACTAGACTGT GTAACTACAATGGAACCTCTTTACAACGGTTTCACTGGGGCTATATCGAA TTGGAGATATTCAACAAACGTAAGAAACGAACGAAACTTGGTCAACTAGA CTGTGTAACTACAATGGAACCTCTTTACAACGGTTTCACTGGGGCT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000018_pilon | genome | sc0000018_pilon:1608002..1616681 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 550-651:103 |
| Aaloc | 454-546:807 |
| Aaloc | 337-453:1688 |
| Aaloc | 196-336:6248 |
| Aaloc | 4-195:8681 |
|