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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000366_pilon:105278..112066+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014265 ID=XLOC_014265|Name=XLOC_014265|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6789bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:105278..112066+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATTTACGAAATAAGGACTTGGAAAAACAATTTGACCAGCAGGCATCAGA
TAAGAAAGAAATTGTTTCCTTTCTCAAAAAACAGTTGGAACAAAGATCAG
ATGAAATTGCTGATTTGCAAGAGAAAATAATTGGTGTTCAACAAGCCAAA
GATATTCAAAAGGATAAATATGAAGTTGAAATTACAACTGTTAAAACTGA
AATGCAAGAAGTTAAAGACCAGTTAACATCTGAAAACATGGTTTTACAGG
GGAAGTTAACTTCTTTGGAAGAATTTCGTGTCCAAAAAGAGACTTTATTG
AATAAATTTGCAGACATGGAACAACTTTTGAGGGATAAAGAAGAAGATCA
TAAAGAACAGATTTATCAATTGGAACGAAAAGCTGTTGTTGATAAAGATA
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TCTTTCTGCATTAAATGTGTCATAATTTTTCCATCTTTCTCAAGAATTCC
TAAAGACTCATTCAGAGGACATATTTCGTCACAATATTTTAGAGTTTATT
AATCGTTTTTCAACTAGCGCACTCGTTTACTTTGAATTACTTAttttttt
GTACTCTTCCAATAAAATGAAATTAGCCAAGCCATAGAACTTTATCGAAT
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aaagaaaattggttCCTTTCCAaggtttataaaaatatttgaattttcag
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GAAAATGTGATGATCAACTCACAACTATCCAAAATGTCTGACAAAACAGT
CGAGTTGATCACAGAGAATGATGAAATAAAACTAAAGAATAAGAATCATA
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AATGCAGCTAACCAGAAGGTATGTTTGAATGAGATATCgaaaattaatgc
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GTAGCATCTTTTGTGAGACGCACCgcatttgattggttcgaaaattagta
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ATGGTTTTCGAAAGCcgaattccaaaaaaaataccTACTATTTTAAAAGA
GGATTCCTCAAgaaattggttaaaaacattcctaatttgaagaaagacaa
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GGAACAAAGACACATTATCGTTTTTGTCTTTATGAATTTCAATTAACGTT
CtagtatagaccttttcgcctttgatGTCATTTATGTGCAAGCAGCCATT
TTTTATACGAATCATAGATTGAAAAATAGATAAACCATTTATAAACCGAA
AATGATGTCATTGATATGCAAAACTACGCAAATCTGTTCCAGTAATCTTT
GATTTGTATGAAAAATAGCTGCTTGCATATAAATGACATCAAtagcgaaa
aggtctattagtacCAGTGgtataattttgttttcttttctaagCTTAAC
GCAGTATACGCCAAGTCATTAAATACCATTCAATTTTAGCTGATACGAAT
GTTAACAGCCAAAGCTAGAGAGCAAGAAGAAACATTGATGGACTTCATGG
AGAAAGAGAGCTCCTATAAAAAGTTAGAGTCAGATCACGCTAAATTGGAA
GAAGTGTTAGAGACTTTACAAAAAGACCACGGGAGTTTCAACGAAGAACA
TTTGGCATTGACTGAACGTTACCAggaactgaaaaaagaaagagatACTG
TTTTGGATGATAAGAATTATTTGATTGGTATTTTATCTGATGCCACGCAA
GTCTTGAAACAAGCACTTCAGgtacacgtgttttttttataagaacaaac
tatataagaacataaggcttcgacgcacaagatgttaagaacaagttaag
aacattttaaggctttatggactcaaaacactcgatttcttagggaaatg
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gaaggcttcaaaaattttggatgattttataaaaaaaacgtgtttaacTT
TTGACTAGTAAATGAAATGATGTTTTCATTTTAAGCATCTTCTTTTAAAA
TATGATTGGTTGATGTAATGTATTCTGGTATTAAGGATTTAGCTATCATT
TCTAATACATCCATAAGAAAAAGGAGCTCAAATGTTCTAAATTAGTAAAT
ATTTGACGGTTAAAACGAGATTGAAGTTATGCTCCCTCTATTTCATAGTT
TGGCTCTACCAAATTCGAATTCAAATCATCTTTTCTATTAAGTACTGTTG
ATGGACATTCGTTTTCTCCTAATGATAGACtttttttGGTCATCTACAAA
TCAAGAGCCATGATTTTAATTAtcatacagtgtgtcccaaataAAGCAGA
CTAATTTTATATAGTATGTATACTTAATATTTTAATCTCgaaaacctatt
caatcatcttaggaattgaatatctattgattgaacagagatatttcaat
tattctaagcTATTTATTAATTTAAATAACGAGTTtcgaggattttactt
tatataaaaatttgtccacttttttCGAGACACATTGTACTCAAAGCTgt
agctgaaaaaattctagACCAAAAAATCTCATATTTAGAGCTGACGAACC
ACTCTCAGTTTTAAAGGTTTATCCTGATATCTTTTCGGTGTCTCAATTAG
CGATCCGTTATCGCAGTTACTAAAGGGTTTTTGTTGCAAATCAGACTCTA
GTGTCTTGATTCAAATAAAGCCTTtattctcgggtacctaatagccgtcc
ccccgctaattaatttttcgaaaattttccacccaggacattcttattcc
aacccccccccccccccgctaattaatttttgggaaaatgtttttgaaag
ttcccttttttgtcttaattctgctgtattagcctccttttcaaacattt
tccacccaggacatttttattccaaccccccccccgcttattaaattttg
agatttttttcaacccccctgcttattccaaccccccccggctattaggt
acccgagagtaaatgGTGCCAATCAAGACCATGTTTGTGTTCGGAAAAAG
ACTCTTAAGGGCCTGGGTTTATTACACCCATGGGTTTTGTTTGAAACAAG
ACCTCCGTTATCACAGCACCTAAAGGTctcctttgtttttttaagaccaG
TTAAGGTCTGCTTCTATTCCAGACCCAATAGTCTTGTTTGAAATAGGACC
CTTCAAAAGGTCTTAAAGATAACCTTCAACTTTGTGCTCCTTTATTTTCA
GCACGAGGATCCGACGGAAGATGCAGGACGAGTGGAGATGAAGAATACAA
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GTCGGCATACAATTGGATGATTTCCTGGCCAAACGCACTTTGATCGCGAA
GAAGAAATTGCATTGTGGTCTACCATCACAAATGACCATGCAAtcgtatg
tttttattttatttttctatcaGAACTACTTGAAAATATAGTAAATCACT
TTCCTTGTGTATATCATACCCGGCTAGTGGCCTGGTATTTTTAAGTTCGG
AGCTggaatattcatgacgtaatgttttatacgggaGCACCCAAAAAGAC
TTGGTTGCCTATTTGCCAcatattttgaaatctagcggcAAACGCACGGG
CTATTTTAGATGCTACCGTAAAAACATTAAgtcataaatatcatgaatta
cagAGGCCAGTTAGTCAGGTACTTGATGATTCTGCagtaaacaaattgaa
aaaatatatagtaTAGTAAGCTCCATCATATTCCATCTCTAAATAGGAAA
ACTTCGTCCGGTGTACATAAGTTTTTCGGGAAAGGCCTTTTTTGAGTTTG
GATACTCTTTTAGTTTATTATTATAGTTTTGTCACTGAGTGAGCTGTCTT
CTTTTATCCCTTTTGTTTGATTGGTCAAACCAAGTTTTTGTCTTAAACGT
AatacaaattgaaaataaatgaggAGATAACATTTTATTGGTCTTAATCT
TTCAACAAATTCCATAAAAAGTAACCTTTTAACATTATATTAGAAAATGG
TAATTTTACACTTGATTTGGTTTCTATACATCACCTTTCTAAAATAGATT
TCCTTTCGTGAAGCTGAAAATAATTCGTGaaacttgatcaaaaataaTGG
CACCAAATTTTTCATAAGGCCGAAAATTACTTTAGTATGGGTTGATGGCA
CAATCattattcttttgaaattcaacttttttaaatgccGAGTAAGATAA
GACTTACCTTGTTCGCGATATTCCAGTCTTTTTTCAAGCTGGCATTAAAA
TCGTATCAAAGAaagaatttcttcattttcgaaataattttccaaaaaat
ttcccaaagaTCTCACCCATTAGTTCATTAAAAATAagcatttgaatttt
tttgccaaCTTTTTGAACCTGGACAAGGAGCCCTGCGCAGAGCAGTTTTT
CATATTTAACCTTTAGGACAAGGACAGCGGTAGTGAAACCAAGTGGTTTT
GACGGTGACGTCATTAAAACTTGGACTTTGCATCTTTTTAAGTGTTAATG
AGgtttagtttaaaaaaagatatcaaataTGTTATCTGTTAAttgatttc
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tatgcgcgttttggataggaaataagtggcttcaatttttcttgcctgag
ctgagaagaattaaagtttcgtctctagcccttcgggcttgaaactcaat
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ATTGCGTTTGAATTTAAAACCTACTTGTTTAGAGTTGGGAAGAGACGGAA
ACAATAAAGTATCAAACTTAAAgcattgtttagaaaaaatgatttccgat
tattatttttttcgaaaactgtATTTTACTCCCAAAAATACTTTGTTtag
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CCAAAAATAACCACATACTTATGTTTAATATACCCTAAACTTTCAACCTC
AGCAGCCATTAGGAAGTTCAATATCGTCCCAAAATAAAATGTAGAAACGG
TTTCCTGTCTGAACCATTttactttttgatttgaaaacgaataaaccatc
cccattgaaaTCTTGTTAGAAACTTTCACCctgggtactagggttggcgg
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ccgaccctgaGAGACTTTGAAGAgtgaaaaaccgacccttaccgtctgca
catacccagcacccatttttgcctaagtacctcccCCCAGAACTTTGATT
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AAGGTACCAGATAAATCATACCTTTGCGATTCTTATTATTTGTAGGCCAC
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gaagcctcgggatgctcttaactttttgagttttaggcttaaaaatgttc
ttaacatattcttattttcgccatttttcgaGTATTTTAGTAAGATTCTC
CTAAGAAACCTGGCGTTTTAAAGTCTGCAAAGCCTCAacatattcttaac
ttgttcttactattatggccatcgaagccttatgttcttatacagttttt
tcttataaaaaaatgtgaagGGTGTTATGAGATTAAAATAATCCTTTCGC
GATTTTTTATAACCATATGGTTTTTGTGCGGCTCGTTTTGCTCAGCAAAA
TACTTGTTTGAcccacaaaattaaaaatttaaactaTAATACTGATTTAA
TTGGGGTGAATTGCACATTGTGCATGTTTTTCTTGTTATCTTTGAtttgt
caatattttgaaatttatcatcGATATGCTTAAATATTTCCAAGAATTCT
GCCTAGACATGCGTATAAGTGTTATGCTTATAGatagtaaaattttaaaa
tttcttttacgTTTCCTTGTTTCAGGCTGTTTATTGTTCAGATGAACAAC
TGGCTAAAGGAACACCTCGTCATTCAGCTTACGACTTCGTGCAAAGTAGG
ACGGTTAAATTACCCAAAATCCCCTCCCCTGTCCAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000366_pilon:105278..112066+ >XLOC_014265 ID=XLOC_014265|Name=XLOC_014265|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2706bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:105278..112066+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATTTACGAAATAAGGACTTGGAAAAACAATTTGACCAGCAGGCATCAGA
TAAGAAAGAAATTGTTTCCTTTCTCAAAAAACAGTTGGAACAAAGATCAG
ATGAAATTGCTGATTTGCAAGAGAAAATAATTGGTGTTCAACAAGCCAAA
GATATTCAAAAGGATAAATATGAAGTTGAAATTACAACTGTTAAAACTGA
AATGCAAGAAGTTAAAGACCAGTTAACATCTGAAAACATGGTTTTACAGG
GGAAGTTAACTTCTTTGGAAGAATTTCGTGTCCAAAAAGAGACTTTATTG
AATAAATTTGCAGACATGGAACAACTTTTGAGGGATAAAGAAGAAGATCA
TAAAGAACAGATTTATCAATTGGAACGAAAAGCTGTTGTTGATAAAGATA
GGATTTACGAAATAAGGACTTGGAAAAACAATTTGACCAGCAGGCATCAG
ATAAGAAAGAAATTGTTTCCTTTCTCAAAAAACAGTTGGAACAAAGATCA
GATGAAATTGCTGATTTGCAAGAGAAAATAATTGGTGTTCAACAAGCCAA
AGATATTCAAAAGGATAAATATGAAGTTGAAATTACAACTGTTAAAACTG
AAATGCAAGAAGTTAAAGACCAGTTAACATCTGAAAACATGGTTTTACAG
GGGAAGTTAACTTCTTTGGAAGAATTTCGTGTCCAAAAAGAGACTTTATT
GAATAAATTTGCAGACATGGAACAACTTTTGAGGGATAAAGAAGAAGATC
ATAAAGAACAGATTTATCAATTGGAACGAAAAGCTGTTGTTGATAAAGAT
AGattgaaGAAAGAGATGATTCTACGAGTAAACACAGTGGCTGCAGAATT
CCGTAAAGTATCTAATAAACAGATGGCTGACACAACCAAACGTACCATCC
GTGAAAATGTGATGATCAACTCACAACTATCCAAAATGTCTGACAAAACA
GTCGAGTTGATCACAGAGAATGATGAAATAAAACTAAAGAATAAGAATCA
TAAACAGCATCTGGATGTCTTGGAAGGAACTGAAAAAGAATTGATACGTA
AAAATGCAGCTAACCAGAAGattgaaGAAAGAGATGATTCTACGAGTAAA
CACAGTGGCTGCAGAATTCCGTAAAGTATCTAATAAACAGATGGCTGACA
CAACCAAACGTACCATCCGTGAAAATGTGATGATCAACTCACAACTATCC
AAAATGTCTGACAAAACAGTCGAGTTGATCACAGAGAATGATGAAATAAA
ACTAAAGAATAAGAATCATAAACAGCATCTGGATGTCTTGGAAGGAACTG
AAAAAGAATTGATACGTAAAAATGCAGCTAACCAGAAGCTGATACGAATG
TTAACAGCCAAAGCTAGAGAGCAAGAAGAAACATTGATGGACTTCATGGA
GAAAGAGAGCTCCTATAAAAAGTTAGAGTCAGATCACGCTAAATTGGAAG
AAGTGTTAGAGACTTTACAAAAAGACCACGGGAGTTTCAACGAAGAACAT
TTGGCATTGACTGAACGTTACCAggaactgaaaaaagaaagagatACTGT
TTTGGATGATAAGAATTATTTGATTGGTATTTTATCTGATGCCACGCAAG
TCTTGAAACAAGCACTTCAGCTGATACGAATGTTAACAGCCAAAGCTAGA
GAGCAAGAAGAAACATTGATGGACTTCATGGAGAAAGAGAGCTCCTATAA
AAAGTTAGAGTCAGATCACGCTAAATTGGAAGAAGTGTTAGAGACTTTAC
AAAAAGACCACGGGAGTTTCAACGAAGAACATTTGGCATTGACTGAACGT
TACCAggaactgaaaaaagaaagagatACTGTTTTGGATGATAAGAATTA
TTTGATTGGTATTTTATCTGATGCCACGCAAGTCTTGAAACAAGCACTTC
AGCACGAGGATCCGACGGAAGATGCAGGACGAGTGGAGATGAAGAATACA
AACCTCCTCTACAAAGTCATCGAAATCCTTAAAGTTGCCGTTGAAATGGG
TGTCGGCATACAATTGGATGATTTCCTGGCCAAACGCACTTTGATCGCGA
AGAAGAAATTGCATTGTGGTCTACCATCACAAATGACCATGCAAtcCACG
AGGATCCGACGGAAGATGCAGGACGAGTGGAGATGAAGAATACAAACCTC
CTCTACAAAGTCATCGAAATCCTTAAAGTTGCCGTTGAAATGGGTGTCGG
CATACAATTGGATGATTTCCTGGCCAAACGCACTTTGATCGCGAAGAAGA
AATTGCATTGTGGTCTACCATCACAAATGACCATGCAAtcGCCACCACAT
GCAGCTCATTACAAGCTCGGTGATTTGGGAATTGTTCCTCcaagaaaaaa
gagtcccaccaaaaagaaaacagacaaaacaaagGCCACCACATGCAGCT
CATTACAAGCTCGGTGATTTGGGAATTGTTCCTCcaagaaaaaagagtcc
caccaaaaagaaaacagacaaaacaaagGCTGTTTATTGTTCAGATGAAC
AACTGGCTAAAGGAACACCTCGTCATTCAGCTTACGACTTCGTGCAAAGT
AGGACGGTTAAATTACCCAAAATCCCCTCCCCTGTCCAATAAGCTGTTTA
TTGTTCAGATGAACAACTGGCTAAAGGAACACCTCGTCATTCAGCTTACG
ACTTCGTGCAAAGTAGGACGGTTAAATTACCCAAAATCCCCTCCCCTGTC
CAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000366_pilon | genome | sc0000366_pilon:105278..112066 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1243-1356:6676 |
| Aaloc | 1150-1242:5997 |
| Aaloc | 955-1146:3552 |
| Aaloc | 673-954:1790 |
| Aaloc | 406-672:752 |
| Aaloc | 4-402:1 |
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