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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000049_pilon:1581483..1589884- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_013855 ID=XLOC_013855|Name=XLOC_013855|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8402bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:1581483..1589884- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACAAAGTTGGTGAAGAAACGTTAAGTCATGCCACATTTGGCTTGAT
TGCCTTACTTCGTAAGTGCGGGCCTTCCACGCCTTCTAAAATTTCTGACT
AATAGACTCAGATCAAGGGATCTTACCTGGAGAGAGTGGAAGATAAAGTG
AAATGTGCACTGTAGTACACTGTCTTAGCCCAAAAAAGATACAATTTTCC
ATAAAAAGTAGTCAAAATTTCAAGAGTTTTTATTTTTTAAATCTCCTATC
GCGAGGGCCGTGTAAATGAGTCGATTTATTGTATTGTTGTTGGCATTTTT
TCCAAACTTTCTTTTTATGCGATCTCTTCTCATGACACTTTCTTACAACA
GTCTTTTAATAAAAGGTTGTTTGTTATCTCAACTTTCACATGATTATCTA
GAGGAAAAGCCATACGTTTGTGACATCAAATTCAAACAGAATGAAGCCGT
GTCAAAAAACATGCTCACTGTTTGGGAAGAGGTTTGAACATTATTCCTAA
TTATTTGTTCTTTCATTTTACGACTAAACTTCTTCAAGTTTATGATGACC
TACAGGTGTTTTTATAAGAAATTATATAAGAACATAAGGCCTCGATGTCA
AAAATATTAACAACAACTTGAGAACATTTTATGACTCTAAAACACCACAT
TTCTTCAGAAAATGGACTAAAATACTCAGAAATGGCGAGAACATTTTTTG
GCCTAATTAACCTTTAAAAAGTTTTTAAGAACATCCGAAGGCTTTAAAAA
ATTTGGATTTTCTTATAAAAAAACGTGTAACAAGAATGATAATTAAAGAG
TCCCCCCCCCCAGCGGACCTTCATTTGACGCAATCACGCAATTTTTTTCC
CAAATTCATGCAATTTTTGTTCACGCAAGGCCTTCCAATTCACGCATTCA
CGCAATTCTTTTTAAATTTTAACGCATTCACGCAAACGGTTGGGGGAGCC
CTATTAAAGGTACATTGCATGCTCTTTTAATAAAGCCTTAAAATGTTCCT
AAAATGTTTTTATTTTTACTATTTTGTGAATATTGATGTTTAGTTTACCA
TATGAATGAACTTAAACGGTTTAATGCTTCTTAATTTCTGTACCGAGAAT
GAGTTTACTGTTATGGGATCAATGTTTCAACTTCCAAACGCCCTGAAATG
CACCTGGCAACATTTACGTTCCAAACACTGGCACCAAATCGATCACGTTA
TCGCCAACACATCGGCAAAGCATAGCATCAATGTCACTAAAGTCGATATC
CGTGCTGACTGTTTCACCGACCATAGACTTTTAATTTGTAGATGTGTTCC
TTCTCCCTTAAAAAGAGAAGAAAAGGTAAAAAACCGCCTCGAAAACCTTT
CTTGAACATGAACGCAGATAAAATAAAGCAACTACAAGATTACCTCAATG
ACAACCTCGTGAGTAGACCATGTGACTGGAACTCCTTAAAATCTACTTTA
CAATCCGCCACCGAACTGATCTCTGAAAAAGCAAAGAAAGTATCTCACGA
TTGGTTTGATGATAATGATGTGCAGATTCTTGCTCTTCTAAGAAACAAAC
ATCTTAATAGAAACGAGCTTCAGAAACGTATTCGTCAAATGAAAAATGAT
TGGTTTGTTGAAAAAGCTAATCAGATGGAGAGGTTTTATCTCGAGAACAA
TATTAGAGACTTTTATGCGACTTTACGTGAAATATACGGTCCTAAATCCA
AGTCTACTAATCAGATACGCTCCAAGGACGGCACGCTTTTGGTTATCGCA
ACTCAAATCAAAAGAAGATGGGTCGAGCACTTCTCTGAATTACTTAACCT
CAGATCGGACACTGACGAATCCGTTCTGAATGAAGTTCGACAGCTTCCTA
TCGACAATTCACTTGCTGTACCAATTGCTCGAGATGAAATTGATAAGGCA
CTGAAAAGCACAAAATTAAGAAAAAGCCCTGGTCCAGATGGGATCCTTCC
GGAAATCATTGTTTTTGGAGGTGAAGCACTTCGAGAATACCTATTGGAGA
TCTTCAATATCCTTTGGGAGAATGACAACATTCCAGCAGAATTGATCAAC
CCTAACATATGTATCCTCTTCTAAAAAGGCGATAGGAGTGAGTGTGGTAA
CTACCGTGGAATATCACTATTGAGTACAGTGGGAAAAGTCATCGCAGACA
TTGTTTTACAAAGAATTCAAAACCTGCTTCCTAATGTATACCCTGAATCG
CAATACGGCTACAGAAGCGGTAGAGGAACAGTCGATGGTATATTCACCCT
ACGTCAACTGATGGAAAAAACCCGCGAACAGCAATGCCACCTCTACATCG
CTTTCATCGATTTCACCAAAGCCTTCGATACCGTTGATCGTCCCCTACTC
TTCGCTATCCTTGAAAAAATTGGTTGTCCTCAGAAACTTGTCAGCTTGAT
CAGAATGCTTTATACGAATGTTGAAGCCCGCCTCATAATCGATGGTTAAA
TGTCAAACCTTTTCAATTACAACAGTGGTGTCAAACAAGGTTAAGTAAGC
TGGCTCCCACTTTATACGGTATCTACGCTGCTATTCTACTTTGGGTTGCC
TACAAAGACATCAAACACGAACACTCAGTACTGATCAGATTCCGAACTGA
TGGCAAATTTTTCGACTTGAGAAGACTTAAAGCAAAATCAAAGGTCTTCC
TTGAGTATCTTCGTGAAGCTCAATACGCCGACGATATTGCCATCGCTAGC
AATACAGGTCCTGGATTACAAACGCTTCTTACATCCTACAATCTCACCTC
TATTCGTTTCGGACTTATGATAAATGTTAAGAAGACAGAAACCATGTGCA
TCGGTCCTGAAATCACATTTTTTGTCAACGAATCACCGTTAAAGAATGTC
AACCGCTTCAAATACCTTGGAAGTTTCGTTTCATCTGATTGCACGCTGAG
GGAGGAAATTACAGCACGCATTCAGGCAACATCCTGTGCATATGGACGTT
TGAAACAGCGTGTGTTCAATAACCATGACCTTACCACATCCACCAAATTG
AGTGTATACAAGCAATGTCTCATGCCTATTCTATTGTATGGGAGTGAGAC
CTGGACACTATACGCTCACGAAATCCGTCAACTTCGTACATTTCAACAAC
GGCATCTACGAACCATCTTGAAAATCAAATGGGATGATTTTGTCAGCAAC
GAAGACGTACTGAAAAGATCAAACGTAGAAGATGTTGAGATTTCGCTTGC
CAAAAGCAAGTTAAGATGGCTTGGGCATGTTGTCAGGATGGATGATAGTC
GACACGTGAAAATGTTGTTATATGGAGAAAGAACTGATGGCTCCAGACCA
ATCGGCAGACCTAAACTCCGATATAAAGATAATATTAAATCTCTCTTGAA
AATTGGAGATTTGTTAGAAACGTGGCAAGAACTTGCTTTGAACAGAACTA
GATGGCGCTCTGGTACAAAGAAAGTATGTACAAAGTTAAATGAAAAACGT
ATTCAGAGCTATGAACGAAGAAAACAAAAAAGAAGATAGTTTTCATAGTA
TTTACCCTTTTGTAGTAGACATATGTATATAAACTTGTTAGTATTTTACT
CGACACCGAGGCTAGGCATATTATTATTATTATTTACCATAAAATTTGGT
GTTAAGAGTTTGCAAAGCCTGAAAGTGTTCTTAACTTGCACTTGCATTTA
ATATTTAGTCCATCGAAGCCTTATGTTCTTATAATTTTCTTTAGTAAGAA
AAGGTTCAGCTAACATATTAATCTTGTCTTTACCTCATGCTTTTTTCAGG
GCAACCAATGTCAATTACCATCTGACTTGAGACAATTTTATGAAACAATG
AATGGTCTACTGATTCAGTGGAAAATCAAATTCAATGGTACGTGGTGCTA
CCCTTCCCCTAGTGTTTCACTTGGTTTTGACTTCTCAAACTGTCATAATG
CTTTGAACAAAGCAGAAGAATAACTCACCCCAAATTAGTTCGAGTTAATG
AAATCTCGAGTTAAGGATTAGGCATTATTGACTGAAAGGACGAGAAAGCT
TGTTTGAGTTAAGGAAAAAATTCTGGTTGTAGATGTTCGAGATAAAGAGA
CTCTACTGTATATTATCTTGAATTAAAATTTAAATCATAAACAAGAATGA
AATCCCTGGAATAGTTTTTGTTTTTGTTGTAAGGGATGCGAATCAGACTG
GAAGAACACGCTAATCATGTTTTAAATGTGGTGTGTGATCCCTTTTATTC
AACTTTTGTCACCAGATCTGATTAAATATCAAACTTATGAACTCGTGTAG
TACCATAATATCCTTCCTATGCTAAAATTTTAGTGACATCAACGATTCCC
ACCTCAAAAGAGTTGATGTGATTTTGGGGCCGATATGCATCCCTTAAATC
TAAGCAAATCAGAGGGATACTGGCAGCCTATGTGGAGAGTTTGTTCTAAC
AAGCCCAAGTCAACTTCTGTATTCTTATTTCGCCAAACTTCCTGAATTTT
CAATAAGTTATAGTTTTATTTTGCCAGACGATGAAATTGAAATTGGCTTG
ATCGAGATTAATCCCATCGAATGTTTGAATGGTTTGGCTATGCGAATGAA
CCGTAACGATTTGACTCTACAAGATTTTCAGCTGCCCGAAGATTTCACAA
TGGACATAAAGGGTTTGATACTAAATTATTTCCCCACCTCAAATTTCTCA
TTTGAATTTTATTAGCTTAAGGGAACTTATTTTGGCGAGAACTACTTTTG
GCGAATTCGGCGAATTTAGACAAAATTCGCCAAAATTAGTCTCCGCCAAA
ATTGAATATTATACTCACTTGCCAAAATAAGTTCTCGCCAAAATTAAATT
TTTTGGTATTTTGCCTAAATAGCTTCTTGAGCTCACAAAAAAAGCTTCAA
ATAAGGCAAAATAGTACAGATTTTATGCTGTCAATCGGCAAAATAAGTTC
TCGCTAAAATTAAAAATTTTCAGAATTTATTACTTAAAAAGCACAAACTT
ATATTATTATTAATTTCTAAATACAGTAGTAATCGTTAGAATTTCTTGAT
ATATCCTTTGAACGTTTGAAGGAATGAAGTAAGGAAGGTCACTTTGTGTT
TGATTGCATTAACCAGTTTTAACCAGTATGGCCGAGTTTTTGGACCTACC
CCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAATTCACCTCTGTCCGTCCGTCCGTTCG
TTACCAGCTTTTCTCGAGATTGAATCATAGGAATCATTTGATTTTTGGTA
CAAAGGTGCAAAACGGTGGTGGCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGA
AAACAAATTTTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGG
TTTTTTGGACTCTGTGAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTG
AATGAAAGTAGGGTACCATCATAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATCTTT
GCAAAAAAATTTATTTGGCTTAAAAAACGCATGTTTATCTATAAGAATCA
CTATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGTCAAATTACTCAATTTCTTT
ATGAATAGATGTTTTTTTTGCTCATGAGGGCTTACTTTTAAAGAATATGT
GTGTTTAGACATGAAATTTTGGTTGCTTGGCGTGTTTTTATAGAAAAAAC
TGGCCAAATTCGATATTTTTTTATAAGCACATTATCGATTACTTAGGTAT
TAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTTTCATTCTTTATGATTTTTTGCACAAA
GATGCATAACAATAAACCCTCGAATGTGACTGAGCCCGATTTTCGAAAAA
AAATGTTTTTAGGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTTAAAAAAGGGTTTT
TTGGACATTGTTGAATATTCGATCGTTGTTTTTTTCTGATTTTTTGCATG
AAAGTAGGTAAAAGATGGGTCAAGCAGATTTTTGTAAAAAAACTATTCAG
CTCAAAAAACGCATCTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATACAT
CAATGTTCTTAGCCAAATTACTCAATTTTTTGATGAAATAGATGTCTTTT
TATGCTCACGAAGTCTTGAATATGAAAGAATATTTCAAGAGCATGAAATT
TTGGTTTCTAAACGTTTTTTTTATAAGAAACAAACGACTAATTTTAATAA
ATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAACGTTCATGCTCACGTA
GATATGAATTATAAATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAATG
TATCACTTGTATTGTTTTTAAATCATCTTTTGTTATGTCACCGATTGTGC
TAAGTAACTAGGACCTTTTGTCATTGTTAATCTCAATCAAATATCTAATT
ACCTGTTTATGGCACCGATTGTGCTAGAAATAGCGTCTGCTATTGTGAGC
TACTTGTAATTTTGGACCTTTTATCTAATTTCTTCTTATATTGGTTTAGT
GAATCAAAGACCAATTCCAAACTTCAATCAGAAGATCATGGAAATTAGCT
CAGACGGGCAACATGGAAAAGTTTGCCTGCTTTTCAAAGGTATAAGTAGA
TTCTTGAATGATTATAGCTTTATGGTCAACATGAAAAATATGAGCAATCT
GATCGGCTAAAAACGCGTACATAAATGCTGTTTTTGTGTTTGTTGTTGTT
TGTTAATGATGTGTTGCTTAAAGGATAAACTTCTGGGCATGGGGCGTTTT
TACTACAGGGAAGTGCCACATTTTCAACTTCGTGATATATTTTGTGATAT
AGAAAGGATGCGCGTCTTTTATGCTGAAAAAGAAGAATTAAGAAAATAAT
TATCATACTTTGTGCTTGTGCGGCGCAGTTTTGTGTAAAAGTTGTTTTTG
CCTTTGCTAAAAAAATTATGTACGATTGCTTACTCGAGCCGCACTGACGA
GTCCTTTGGAAAGACGAAACAAACGTCTACTGCGGATAGATATCAACAAT
ATTGAGCTGTCTGTTAGCATATAAAAACTAAGAATACTTCACGCTTCAGA
TGGTGATAAAAGTATGAAATTTGGCACAGATGATCCTTAGAGGGTCTAAA
ACTTAATTTTATTGCTTTTAATTCATTGCTTTTTCTGATTCTGATGTTCA
AATTTAATTAAAAGCTTTAAATCCCACAGAATACTAAAACTTAGATTTTG
AGATTTACAAGGCAAATCAAGGCAGCGTTCTCCCTTCAGGAACACAGTAA
ACAACCGACTAATTTTTTGGATGTTTTAAGCCTTCCTATGTCGTTTAGAC
CCAAGCATCAGAAGGAACTTCGAATTTTGACATGGATTCATGTATAAAAC
ACCAAATTTGGTCAACTAGTTCCGTTATTACGGGATTTTTAGGTTTTGCC
TGGAAAGGCTTATGATAACGTCAAACTTTCAACCTTCAAAACTTTTGATA
GGAAGATTTTCAAGGCATGCTTTATACCTCGATTTTCATCAAGCTGGAAC
CATCAGAATTTGAATATTTAGAAAAATATATTTAAAAGAATAAATCTTTT
TTCAGCCACCTGATGACGTCATCTGGTAGGTGGCCAGGTTGAAAAATTTG
GTGTTACTGTTTAAAATTAAGTTTTAGACCCTCTAAGGATCATCTGTGCC
AAATTTCATGCTTTTATCACCATCTGAAGTATTTTTGTGCTAACCTCACT
ACAACAACATTTTTTCAATAGAACTTTTCTAGATATCAGCTTCCATAGAA
CTTAGTGTAACAATAATACACATAATATTTTAGTGTCTCTTTATTTTTTC
AGAAAATGGCAATATTGAGGTTTGGCTGATTGATTTATCATTGCAATGGC
ATTACCTTGCACCGTCATTCAGTCATTACTACCGAATGATGGTCACACAC
TTGGGAATACGTGGATGGCAATTCCTTTACACCGAATATGGACTCACTCC
TGAGGCGAAGGTTTGCAAAGAACATGTGTCCGATTGATTTCTGCTTGTTA
CTTTTACGGAAACACAAAAAAGACTAGCCACTAGTTTTTAATCAAACAAT
AAAACTTGTGGCAAACGCCTAAATTGTCTTTGGTGCTTCGGTTTAAAACA
TTACGTCATGAATATCATGAAATTAGGTATTGAGAATTTTTCTCGGGATG
AAACGAATTATACAGCGGAATACGGAAGATATTTTTGCATTTGTCATAGT
GTCAACTGTTACTATAAGCTGTTTTTTCGTCTTAGCAATGGTTCAGTTTC
TGCCTTCCACATCGACTAAAAGAAGACATATTCCAAAAAGAAAACGACCA
CAAACCATCAAAAACAACAAATAAAGTTGACTTTGCATCACTGTTCAAAC
AGAAAAAGAAGACCAAGGACCCCAGTACTGGCACTGCGTCCTCAAACGAG
CAGAATTTAAACAAGCGGAAAAAACAGCCTGGAAACCTGAAGCCAAGGAC
AACAGCTAAACCTCCGGCTAAATTAAACAAAGCTTCTTTTAAAAACCCAT
GA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000049_pilon:1581483..1589884- >XLOC_013855 ID=XLOC_013855|Name=XLOC_013855|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1758bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:1581483..1589884- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACAAAGTTGGTGAAGAAACGTTAAGTCATGCCACATTTGGCTTGAT
TGCCTTACTTCATGGACAAAGTTGGTGAAGAAACGTTAAGTCATGCCACA
TTTGGCTTGATTGCCTTACTTCAGGAAAAGCCATACGTTTGTGACATCAA
ATTCAAACAGAATGAAGCCGTGTCAAAAAACATGCTCACTGTTTGGGAAG
AGAGGAAAAGCCATACGTTTGTGACATCAAATTCAAACAGAATGAAGCCG
TGTCAAAAAACATGCTCACTGTTTGGGAAGAGGGCAACCAATGTCAATTA
CCATCTGACTTGAGACAATTTTATGAAACAATGAATGGTCTACTGATTCA
GTGGAAAATCAAATTCAATGGGCAACCAATGTCAATTACCATCTGACTTG
AGACAATTTTATGAAACAATGAATGGTCTACTGATTCAGTGGAAAATCAA
ATTCAATGACGATGAAATTGAAATTGGCTTGATCGAGATTAATCCCATCG
AATGTTTGAATGGTTTGGCTATGCGAATGAACCGTAACGATTTGACTCTA
CAAGATTTTCAGCTGCCCGAAGATTTCACAATGGACATAAAGGACGATGA
AATTGAAATTGGCTTGATCGAGATTAATCCCATCGAATGTTTGAATGGTT
TGGCTATGCGAATGAACCGTAACGATTTGACTCTACAAGATTTTCAGCTG
CCCGAAGATTTCACAATGGACATAAAGGTGAATCAAAGACCAATTCCAAA
CTTCAATCAGAAGATCATGGAAATTAGCTCAGACGGGCAACATGGAAAAG
TTTGCCTGCTTTTCAAAGTGAATCAAAGACCAATTCCAAACTTCAATCAG
AAGATCATGGAAATTAGCTCAGACGGGCAACATGGAAAAGTTTGCCTGCT
TTTCAAAGAAAATGGCAATATTGAGGTTTGGCTGATTGATTTATCATTGC
AATGGCATTACCTTGCACCGTCATTCAGTCATTACTACCGAATGATGGTC
ACACACTTGGGAATACGTGGATGGCAATTCCTTTACACCGAATATGGACT
CACTCCTGAGGCGAAGAAAATGGCAATATTGAGGTTTGGCTGATTGATTT
ATCATTGCAATGGCATTACCTTGCACCGTCATTCAGTCATTACTACCGAA
TGATGGTCACACACTTGGGAATACGTGGATGGCAATTCCTTTACACCGAA
TATGGACTCACTCCTGAGGCGAAGCAATGGTTCAGTTTCTGCCTTCCACA
TCGACTAAAAGAAGACATATTCCAAAAAGAAAACGACCACAAACCATCAA
AAACAACAAATAAAGTTGACTTTGCATCACTGTTCAAACAGAAAAAGAAG
ACCAAGGACCCCAGTACTGGCACTGCGTCCTCAAACGAGCAGAATTTAAA
CAAGCGGAAAAAACAGCCTGGAAACCTGAAGCCAAGGACAACAGCTAAAC
CTCCGGCTAAATTAAACAAAGCTTCTTTTAAAAACCCATGACAATGGTTC
AGTTTCTGCCTTCCACATCGACTAAAAGAAGACATATTCCAAAAAGAAAA
CGACCACAAACCATCAAAAACAACAAATAAAGTTGACTTTGCATCACTGT
TCAAACAGAAAAAGAAGACCAAGGACCCCAGTACTGGCACTGCGTCCTCA
AACGAGCAGAATTTAAACAAGCGGAAAAAACAGCCTGGAAACCTGAAGCC
AAGGACAACAGCTAAACCTCCGGCTAAATTAAACAAAGCTTCTTTTAAAA
ACCCATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000049_pilon | genome | sc0000049_pilon:1581483..1589884 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 613-879:268 |
| Aaloc | 457-612:699 |
| Aaloc | 367-453:2002 |
| Aaloc | 232-363:3924 |
| Aaloc | 142-228:4654 |
| Aaloc | 64-141:8000 |
| Aaloc | 1-60:8403 |
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