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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000345_pilon:109945..115131- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_013546 ID=XLOC_013546|Name=XLOC_013546|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5187bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000345_pilon:109945..115131- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTGGTTTATCATCTGCGACTCGAAGCCTGAGGCTAGCTTCGCAAGC
AGCTTTAAGCCAACGATATCTATTTCTGTTAACACGAGGCTTTGCTACTA
AATTTTCTGAAGGTATGTTATAGTTTATATTTATTTTTTGGGAGGTTGTG
GTGTGTGGGTTCGACTACTAATTACTAATGTTAATCACTTATAATAAAAC
TTTCAAGTTAGACCGAATCAGAGACATTGTTTCAATTGTCAACTGGTTAA
CAGCTGTAGAATCCAGCTGGTACTAGCTTAGTTGCTGGTTCCCATACCAG
ATGATCAATTGGTCTACCAGTTCAACCTTTTAAGCTAAAATTCACTGTAT
TCTTACAAAATATATTGTTTAAAAATAAAATTTGGAATTCTAATATGTTC
ATTCAGGAGTTGAAGTCGTTGGGGATATCAAGGATGGTTGGGATCGTATC
TTGTCTCCCGATGCCGTCCAATTCTTAGCAGACATTCATCGTAACTTCGA
AGCTAAACGACAAAGCGTCTTGCAAACACGTATTGATCGACAAAAACTCG
TCGACCAAGGAGAAGACTTAAAGGTTCGTAAAATGATTTAACCTTTTATA
TTTAAGATGAGGGTTGATCTTCTTGAAAAACCAACCAATTTTAAAACCTT
AACATCTAGCCAACTACTACTTAATGAGAATGGTCTCTTGTTGTTGGCTA
TTAACTGATAAGATAAGCGTCCGTATTTGTATATCTGAATCTCTTTTTAT
GTCACACTTGTAGCTCTTGCTTCGAATGAGAGAGGACTCGAGTTAGGCTT
ATTGACTTCAGATGTCTAGATACATTGCTTTCTTGACCCACTTACACATA
TTCCTCCCTAGTGAAGTTGGACCCAAACCCCCTAAGGTGTTACAGTTTGT
AGCATAAAGGTTTTTGATGATGTCATTTTTACGTATACGTGAGTTTTTTA
GCCTTGCGAACCTACCAAAATTGCTTGACTGAAATTTGATGCAATCACGA
TTGAAAAATGATATTACCTATTATGAGAGAGTGTATTTTGAAATAGACAT
TGGACTATGGGTTCAATTGTCTTTTCCATTAACTTGTTAAGATGTGTCAC
ATTATACATATTCTTAAAACATAACAAGATATCGTCTTAAGAACTCAAGA
AGTTATAATGTTTCCCCTTTGTTAGCCCGATGATGTGCCGATGATGTCAG
TCAACTATAATTGACTTGAAGTCTTACGGTTAGAAACCTTCCTGTCAACT
TATTCAGCCAGGTCCCCACAGCTAAGATGTATCTGTTTTAACTAGTCCAT
TTTACCTACCACTTGGCGCTATAAATGGCTAAATAACTTGCTATCTCTAA
CCATTTTCACCTTTTGGGTATGCAAAAGTAGCAAACCCAAAAGTCTAAGC
AATATTTTTTAAGTTTCCTAAGACTCTTACATGTAACAGAAATCTTACCT
TTCAATAAATTAAAGACCAGCTATTTTGTAAGTTAAGGTTTCCTAATTTC
ACTTGCTAAACAATTGCCTTATAAATACAGTTTCCAGCTAGACGCGAGGA
TAACACATGGCAGGTGGCACCGATCCCCTCGGACCTGCAATGTCGTCACA
TCGAGATCACGGGTCCAGTTCAACGTAAAATGATGATCAATGCTTTAAAC
AGTACAGCTGATGTGTTTATGGCTGACTTTGAAGATTCAAACAGTCCAAC
GTGGCACAATGTGATTGATGGGCAAGTCAACTGTTTGGATGCCAACACGA
GGACTATCGAATTCAAAAACCCTGACGGTCAGTTGTAACAAATTGATGTT
AAAGTCCAGAAAAGAAGCTTCTTAACTTTTTTTCCTATGTTTGAAAATTT
GAAATCTTCTACTTCAGCATTATCACTAAAGGAATAAATCTACCGGCTAC
TTATCATCAATCTCAAACTAATTTACAGTACTTCTAATTTGGCATTTGTG
ATCAAACTAGTCAGAAACATCAATTTGAAGTACAATACATTCAAAAAGAC
GTTTGTGCTTTACGAGAATCCAAACTTATGTGTTCTTAGGTGCTTCCTGA
ATTATACATATATTTTTAAGAATGGCATTGAAGCATACCTATGCTTAGAA
TCGGATCTGAAAACGATGGTTTCTTGTTTAAGATCCAGCTAAGTCTAGCC
ACAGAAAATAAATATCTTCTATTTTTTTCACTACAGGATCAATTCGTAAA
CTGAAAGAAAACCCCGCTCAACTCTTCATTCGAACACGTGGATGGCATTT
AGATGAGAAACATTTGGTCATTGATGGAAAACCCATTTCTGGTGCTTTCA
TGGACTTTGGACTCTACTTTTTCCATAACACAAAACCACGTATGGACCGT
GGTTCGGCGCCGTATTTTTATCTTCCCAAAATGGAACACCGGACAGAGGC
AGCTTTGTGGAATGAGGTTTTCGAATTCGCTGAAGATTACATAAAGATCC
CTCAAGGTACAATAATCGAGTACTAACCTTTCCCTTTATTGCGATAAACC
ACGTATAGCCTCTACGAATTAGGCAAATTTTAATTTAAAAGATAATGGTG
CCTTTCTACATCTAAAAGTATAAGGGGGATCGTAAAAATTTCAAAATTCA
TTCCCTTCAGGGTTCTTTTTTGCAAACGTTGAAAAAAAAATCAAAATTGA
GTACCCAGTAAACAAGGGCAGTACTCGCTTGTGGAAAGACGTCTTTCACT
TATCATTCAATCCAAAACTTAGTTATTTTTCTCTTAAGGAACCATCCGTG
CCACTGTTATGATCGAAACACTCCCTGGTTGTTTCGAAATGGAAGAAATG
TTATACGAATTACGTAACTACGCATGCGGCATGAACGCAGGTCGTTGGGA
TTACATTTTCAGTTTGATCAAAGTGCTGAAGACGAGAGGCGATTGTATTA
TGCCCGATCGAAAACAGGTAAATTTTGGTATTGTGGAAAATATATTAAAA
ATGTTAGATCAGTACCGCTTAACGAGCCCCCTGAAGGTTTTTGTGGTGGC
GTGATTTATGATTTTCAGAAGCATGATGCGTAATGAGAAAAGAGATTAGC
ATGATGGCGTGAGAAGAGAAATTTTTTACCGTGATGGCTTGATCAGGGCC
CTGCTAGGGTTGGGGTGGGGCTGGTTATGTCAATGATTGACGATTCACTT
CACCGATCAACCCGACAACCAACACAAAATGATCCTGAAAAAAAAGTTTT
AAGGCTAAAAACGTCCACTCTATAGTCTAAATCATCTTTTCTCCTTAGGT
CACGATGAAAGTTCCCTTCATGTCTGGCTACGCACAACGTCTTGTACAAA
TCTGTCATCGTCATGGAGCACATGCAATGGGAGGCATGTCTGCTTTCATC
CCCTCACGACGCGATGAAGAAGTCAACAAAGTCGCCATGGAGCAAGTCTC
TCTTGATAAAGAAATTGAGGTAAGTGTTCATAATTCTTCTTGCGATACAT
AGCGTGGATCTTGTTTTAAAAATAAATACCTTAAAGGAAGAAATTTAATT
TGGCGGATGGCTGGAAAAATTTAATTTGAAGGGGATTTAATATGGCGTTT
GCAGGATATTTTTAGCCAAAATCGTTATCAAATAAGCAAAAAAACATGTT
TTACGGCCTGAAATAGCACCAATTTGGGGAATGAGTAAATGAAATAAATT
TGGCGGGAATTTAATTTAGCGGATGGAGGAAAAAATAAATTTTGGCGGAA
ACTAAATTTGCGGATTTTGGCTAAATCTGCCAAATCCGCCAAAATTTCTT
CCTTTAAAAAAAGGTAGTGACTGCAATACTTCCAGTGTTATCAGAATTAA
GATAATTAAGGTTTGTACGTTTGCTCGCAAATTGATATTTCGAAAGTAAT
TATTCCGTTTGTAAACGAGGTCAAAAATGATTTTGTACATCTAAATACAA
ATAAATGAGAAATTGTCGTTTTAAGGCACCTATAAGTGAGATGAGATCCC
GTGAAAATTCCCAAATCATAACAATCCAATGCTTTTAGATTTTATAAAAA
TTTGGTTGTGACAAGTTATGTTTTGCTTTTTAGGTCGCTGCGGGTTATGA
TGGTACCTGGGTTGCTCATCCCGATTTATGCAAACTTGCTAAAGACATAT
TTGTTCGTGGTCTCGATGGAAAAGTCAACCAAATCGACAGGTAAGAAGAG
AGAATTCAGTAAAACTGGCTATTAAACTAGGTAGATTTCCCGTGTTTCTC
TAGGCCCTGGCTTATTAATCAACTCAGTTGAATGCTAAATAAAGAGATTT
GGGAGATCTGGACCACAAATGTACCATCCAAAGTGCAATATAACGGTCGA
TAGGAAAGACAGTGTATTTTGAGGGTGCATAAAAGTGCGAAAAGCAAAGC
TTTTTGGTAAAATCCTGCTGTTTTTGCACTATAATGGACAAACGAAATCA
CAATCCTGTTTAAATTGATCTCCTTAGGAAATTCGAAGACTTGAACATTA
CGGAGAAGCAATTAGTCACTTTCGATGTCGAAGGAGGAAAGATCACTGAG
AGAGGTGTTCGAACTAATGTTTCCATCGGTCTACAATACTTAAATCAATG
GTTCAAGGTAACATTGTTATTTTATTCAAACATCCTTAAAATATTTTATC
GATAAAATAATTGTCTAAAAAAAAATACCTTTAAGTATTACAGCTCTTCG
ATTTATATAGCATACCTTATATTACACGAAAACGAGTAGACAAGTATACG
ACCTTGCATGCAAAAAGTTAACACGATTTTTTGTTTCATATTTCAAGGAC
CACTGCGGTTGGTTTTTTTTCGTGTAGTAAGCTTAGAAAATGTTGAAAAA
GAAAAGTGTCAACATTGTTTCAGAAGATGTCGAGAGTAAAACTCTAATAT
TTTGGTGATACCAAATGTTCACCTTTCTCTTGTTTCTCAGGGTAACGGAG
CAGCAGCTTTGTACAACTTGATGGAAGATGCTGCCACGGCCGAAATCTCC
AGAGCTCAATTATGGCAATGGTTGCACCACTCCGCCAAATTGGATGATGG
GCGCACTTTCACTTTAGAACTTTTTAAAACTATCCTTAAAGAGGAGGTTG
AGAAATTAGGAGGAATTGACAATGAGGCTTACAAACAAGCATATGATATT
GTCGATAAAATGGTCGAAAATGAAACCTTCGAAGATTTCTTAACGTTGCC
TGGTTACGAATGCTTGGTTGGTACAATCGGGAAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000345_pilon:109945..115131- >XLOC_013546 ID=XLOC_013546|Name=XLOC_013546|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3360bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000345_pilon:109945..115131- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTGGTTTATCATCTGCGACTCGAAGCCTGAGGCTAGCTTCGCAAGC
AGCTTTAAGCCAACGATATCTATTTCTGTTAACACGAGGCTTTGCTACTA
AATTTTCTGAAGATGATTGGTTTATCATCTGCGACTCGAAGCCTGAGGCT
AGCTTCGCAAGCAGCTTTAAGCCAACGATATCTATTTCTGTTAACACGAG
GCTTTGCTACTAAATTTTCTGAAGGAGTTGAAGTCGTTGGGGATATCAAG
GATGGTTGGGATCGTATCTTGTCTCCCGATGCCGTCCAATTCTTAGCAGA
CATTCATCGTAACTTCGAAGCTAAACGACAAAGCGTCTTGCAAACACGTA
TTGATCGACAAAAACTCGTCGACCAAGGAGAAGACTTAAAGGAGTTGAAG
TCGTTGGGGATATCAAGGATGGTTGGGATCGTATCTTGTCTCCCGATGCC
GTCCAATTCTTAGCAGACATTCATCGTAACTTCGAAGCTAAACGACAAAG
CGTCTTGCAAACACGTATTGATCGACAAAAACTCGTCGACCAAGGAGAAG
ACTTAAAGTTTCCAGCTAGACGCGAGGATAACACATGGCAGGTGGCACCG
ATCCCCTCGGACCTGCAATGTCGTCACATCGAGATCACGGGTCCAGTTCA
ACGTAAAATGATGATCAATGCTTTAAACAGTACAGCTGATGTGTTTATGG
CTGACTTTGAAGATTCAAACAGTCCAACGTGGCACAATGTGATTGATGGG
CAAGTCAACTGTTTGGATGCCAACACGAGGACTATCGAATTCAAAAACCC
TGACGTTTCCAGCTAGACGCGAGGATAACACATGGCAGGTGGCACCGATC
CCCTCGGACCTGCAATGTCGTCACATCGAGATCACGGGTCCAGTTCAACG
TAAAATGATGATCAATGCTTTAAACAGTACAGCTGATGTGTTTATGGCTG
ACTTTGAAGATTCAAACAGTCCAACGTGGCACAATGTGATTGATGGGCAA
GTCAACTGTTTGGATGCCAACACGAGGACTATCGAATTCAAAAACCCTGA
CGGATCAATTCGTAAACTGAAAGAAAACCCCGCTCAACTCTTCATTCGAA
CACGTGGATGGCATTTAGATGAGAAACATTTGGTCATTGATGGAAAACCC
ATTTCTGGTGCTTTCATGGACTTTGGACTCTACTTTTTCCATAACACAAA
ACCACGTATGGACCGTGGTTCGGCGCCGTATTTTTATCTTCCCAAAATGG
AACACCGGACAGAGGCAGCTTTGTGGAATGAGGTTTTCGAATTCGCTGAA
GATTACATAAAGATCCCTCAAGGATCAATTCGTAAACTGAAAGAAAACCC
CGCTCAACTCTTCATTCGAACACGTGGATGGCATTTAGATGAGAAACATT
TGGTCATTGATGGAAAACCCATTTCTGGTGCTTTCATGGACTTTGGACTC
TACTTTTTCCATAACACAAAACCACGTATGGACCGTGGTTCGGCGCCGTA
TTTTTATCTTCCCAAAATGGAACACCGGACAGAGGCAGCTTTGTGGAATG
AGGTTTTCGAATTCGCTGAAGATTACATAAAGATCCCTCAAGGAACCATC
CGTGCCACTGTTATGATCGAAACACTCCCTGGTTGTTTCGAAATGGAAGA
AATGTTATACGAATTACGTAACTACGCATGCGGCATGAACGCAGGTCGTT
GGGATTACATTTTCAGTTTGATCAAAGTGCTGAAGACGAGAGGCGATTGT
ATTATGCCCGATCGAAAACAGGAACCATCCGTGCCACTGTTATGATCGAA
ACACTCCCTGGTTGTTTCGAAATGGAAGAAATGTTATACGAATTACGTAA
CTACGCATGCGGCATGAACGCAGGTCGTTGGGATTACATTTTCAGTTTGA
TCAAAGTGCTGAAGACGAGAGGCGATTGTATTATGCCCGATCGAAAACAG
GTCACGATGAAAGTTCCCTTCATGTCTGGCTACGCACAACGTCTTGTACA
AATCTGTCATCGTCATGGAGCACATGCAATGGGAGGCATGTCTGCTTTCA
TCCCCTCACGACGCGATGAAGAAGTCAACAAAGTCGCCATGGAGCAAGTC
TCTCTTGATAAAGAAATTGAGGTCACGATGAAAGTTCCCTTCATGTCTGG
CTACGCACAACGTCTTGTACAAATCTGTCATCGTCATGGAGCACATGCAA
TGGGAGGCATGTCTGCTTTCATCCCCTCACGACGCGATGAAGAAGTCAAC
AAAGTCGCCATGGAGCAAGTCTCTCTTGATAAAGAAATTGAGGTCGCTGC
GGGTTATGATGGTACCTGGGTTGCTCATCCCGATTTATGCAAACTTGCTA
AAGACATATTTGTTCGTGGTCTCGATGGAAAAGTCAACCAAATCGACAGG
TCGCTGCGGGTTATGATGGTACCTGGGTTGCTCATCCCGATTTATGCAAA
CTTGCTAAAGACATATTTGTTCGTGGTCTCGATGGAAAAGTCAACCAAAT
CGACAGGAAATTCGAAGACTTGAACATTACGGAGAAGCAATTAGTCACTT
TCGATGTCGAAGGAGGAAAGATCACTGAGAGAGGTGTTCGAACTAATGTT
TCCATCGGTCTACAATACTTAAATCAATGGTTCAAGGAAATTCGAAGACT
TGAACATTACGGAGAAGCAATTAGTCACTTTCGATGTCGAAGGAGGAAAG
ATCACTGAGAGAGGTGTTCGAACTAATGTTTCCATCGGTCTACAATACTT
AAATCAATGGTTCAAGGGTAACGGAGCAGCAGCTTTGTACAACTTGATGG
AAGATGCTGCCACGGCCGAAATCTCCAGAGCTCAATTATGGCAATGGTTG
CACCACTCCGCCAAATTGGATGATGGGCGCACTTTCACTTTAGAACTTTT
TAAAACTATCCTTAAAGAGGAGGTTGAGAAATTAGGAGGAATTGACAATG
AGGCTTACAAACAAGCATATGATATTGTCGATAAAATGGTCGAAAATGAA
ACCTTCGAAGATTTCTTAACGTTGCCTGGTTACGAATGCTTGGTTGGTAC
AATCGGGAAATAAGGTAACGGAGCAGCAGCTTTGTACAACTTGATGGAAG
ATGCTGCCACGGCCGAAATCTCCAGAGCTCAATTATGGCAATGGTTGCAC
CACTCCGCCAAATTGGATGATGGGCGCACTTTCACTTTAGAACTTTTTAA
AACTATCCTTAAAGAGGAGGTTGAGAAATTAGGAGGAATTGACAATGAGG
CTTACAAACAAGCATATGATATTGTCGATAAAATGGTCGAAAATGAAACC
TTCGAAGATTTCTTAACGTTGCCTGGTTACGAATGCTTGGTTGGTACAAT
CGGGAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000345_pilon | genome | sc0000345_pilon:109945..115131 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1384-1680:298 |
| Aaloc | 1255-1383:760 |
| Aaloc | 1147-1251:1155 |
| Aaloc | 976-1146:1940 |
| Aaloc | 799-975:2448 |
| Aaloc | 529-795:3000 |
| Aaloc | 280-525:3658 |
| Aaloc | 115-279:4780 |
| Aaloc | 1-111:5188 |
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