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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000248_pilon:135319..141001- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_013112 ID=XLOC_013112|Name=XLOC_013112|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5683bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000248_pilon:135319..141001- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGCAATGCAAAGGGATATCATGAAAAGCAAATTACCACCTTTGCC
AAGTAAACCTGTTGGTCAAGCATCAAGATTTTCAAGTCTGTAAGTTTTTG
TTAAAAAATTCTTGAAACATATTTTGATGTATTCTATGTTTAATTCTAAT
TCTGTCCTTTTTAAAATAACCAAATGCTGTATAAAATGCTACCTGGAATT
ATTTATCATCATCATCATGATAAGTAAAATCATTAACTTTAAATTTTCAG
TGTTCCAAAAAGAAATGTCAAAGATTACTCCCCATCCTCATGGGAAGGAT
ATTTTGATAAACAGCATGATGTCAAAGTTGGAGAGAATGTATTTTTTCAT
TTTATTTCGACTATTTACTAACTTCTTTCGTTATCTGTCGTACCTGTAAA
ATGAGTGACCCTGGAGACTAACCTTTGATAAGTTCTTTGTTAGGAAGTAG
TGTAAACCTGTCTGAAGACTAATGCATTCACTTTTAACTTTCACTTACTC
ACACTCCTTTAACCCTTTCTCCTTGGAGTGATAAGGAGTGCTATGCACAA
CTTTTATTAGTGAAGTCTAAATTTTATTGTGTACAACTGATCACCATCCT
CAGAGATTTTTGGAGGTGTGTCTGCGCTAATCCCAACCTCAAATATGCTG
CCTGTAGATACAACAACTTCTCTGATAAAGTAGATGCTATGTGTTTAAAC
TTAGAGCTCTAAACTCTTATCTGAATTTTCTATTTAAAGACATTTAGGTT
ATATACCAGAGGTACAGATGGACCAGTAGTCTTACTTCTTCACGGTGGTG
GACATTCAGCACTATCATGGGCAGTCTTTACGGTATGTTTTGAAGCTTTA
GCATCTTTTGATATTGGTTGATAAATTATGGTGGGTGAAGTAATGATAAT
ATTAATAACAAATAAAATGTTCTTTACTACACCCATTGTCCCACAAAAAT
TATTCTTTTTCCATCCTTTTAAAAATATCTTGTTTAATAAACAGGTTCGA
TTATACATTCTCATTGAAGGTTCTTCAGATTGAAGATTCTTCAAATAGAG
TCTAACCCAAGCACATGATCTTCTAATTTTTAGAAAACCCTATGTGATAT
GTGTGATTGCCAAGTTGCTGCTATTGATTTTCGAGGTCATGGTAAGTTTT
CAACAGGGACAAACTTTCTAGATAAATTAATGAATCTGTATAAAAACATT
ATGGCAAAGCATTTTTATGACTTTTGTTAGCTCATCCTTTGTTCCAAATG
GTACATTGCTTACTTTTTGATCTTATTACCACATTCCTTAGTTTAATACT
CTTATCAATGATTCTTTGGTACCTAATAAACAGGGAGGGGTTGGAACAAT
TGGTTTTTGTGGAAAGAAATTGCAGCAGGGTTGGAATAAAAATGTCTTCG
GATTTCCATTAATTGATAAATAGGAAAAACTTGATAGGTCTGAGAGTATT
GTTAAAAAAAGTGAACAAAGCAAATTTAAAAAAAACTTGAACTTTTTAAC
AATAGAAAATTTCAGACCAGAGATTTATTTAAGGTAATGTTGATAAATAT
TGAAGCATCGTTAGAGCTTTTGATTCTTATTAATAAAATCTCTTGCTCTT
AATCATCAGTGAACTATTTTCTTGGTTAAAATACTTGATGTGAGTTCTCA
CTGTTTCTCACTTAGTTATTGTCTTTTTTGTTTTTAGGAGACTCAAGTAC
AACCAATGATACCAACATGGCAGCTGATGTAATGGCTTAGTATGTAACAC
TTGATGAATAAGGATAGTGATAATTTGTAATGTAAGGGTACAATATAATG
TTACTTTACAAATGCATTTACTTCTGTTCTTTTTAGTGATATCTGTCATG
TTATACTGAATTTCTATGACCAATCACCACCTCCAATTGTTATGATGGGC
CATAGGTATGTGTAAGAATATTTTTTAATGTAGTAATTATTTGTTTTTTT
GAAACTTTTAGTTTTTTGACCTACCCCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAAT
TAACCCATGTTCGTTCGTTCGTTAGTTAGTGTGTTAGTTACCAGCTTTTC
TCGAGATTGGCTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTGGCACAAAGGTGCATGA
CCATAAACCCTCAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCTAAAAAAAAATTTTT
TAGGTAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTTAAAAACGGGTTTTTTGGACTTT
GTGAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTAGCATGAAAGTAGGG
TACAATCATAGTTAAAGGATGGCTCAAGCAGATTTTTGCAAAAAAATTTT
TTTGGCTCAAAAATCGTATTTTTTATCTATAAGACCACTTTTAATAAGAA
TACATCATGTTCTTAGCCATATTATTATTATTATTTTTATTAATTTTTTT
ACGATGAAAATGTCACGGTGAGGCTATGATTTGAGTTTTCTGTAAACACT
TATTATTTTTTGTTTGGCTGAAAAACGAATCTTATATCTATAAGAATCAC
TATTTATGAGCATATATCAATGTTATATAGCCAAATTGTTTTTTTATTAT
TATTTTTTTCTAACAGAAGAAAATGTCACGGTAGAGTTCGACGGTTTGAG
TTTTCTGGAAACCTTATTTATTAAGCTGTGCATTTTTCTGATAGTGGTTT
TTATAAAGAAAAGCGCTTAATAGCTTTTTTATTTCTTTTTCAAAAATCTT
TTTCAATAGTGTTGATAGTTTCTCTCAATAGATATGCTTTCATTTTCTTT
ATTTTTTTGTATTTTGACCAGTTATGTCTTATGTGTTTCATTGTTTCAAT
GTTCACTGATTAGTTTGATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCGCTTGT
TCTATATTATGTTTATTCTTCTAGCACTGAGGTAGCACACAGCTTACAAA
AGATCTTTCTTTTTCCTATCGGCTTTTTTTTTAGTATGGGAGGTGCAATC
GCTGTTCACATCGCTGCAAAAAAGATTCTTCCAAATTTGAGTGGCCTTGC
TGTTATAGATGTAGTGGAAGGTTGTGATTTTTCTTTGTTATTATTTGTAA
TTATTTCAGACTAATTTTGCTAAGGAAGCTTTTGAAAGTACGACTGTTAT
TTCAAAATCAGCTTTTTAAAAAAGGGGTTATTACATTGGTCATGCCGTGT
ACACTTATATCATGATTTATTGGATCGTCTGATTTATTGGATATTTGTTT
CATATAAGTTTTTTTGACATCCATCAATTACATCAAATCTTTGAAAAACT
GGACATGTAAATCTATCGAATTCTTTCCCAAAACGAGATATGTTTCCATG
TTATAATGTAACAAATCAACTTTTCATCCAATGAACTATGTTCAGTATTG
TTTTATGTTTAATATTGTTTTAACATCTAATTTTCATTCAGGGACTGCAC
TAGATGCACTGTCTTCAATGCAAAGTTTTCTTCGAAGTAGACCTCAGAAG
TTTAGTTCTCTGAAACAAGCTATTGAATGGAGGTAAATGCTTTAGTATTC
AAGGGATAGTCAGACGGTTTGAGATATTTAGCCTGCATAAACGTACGTTC
TGTGATCCTGAGTAGGATATTAAACTTTGTACTTTTAAATCTTTGTACTG
ATAATTTTGTCAAAAGAGTGCTTAGGTAAAATCGTAAATTGCATTTGAAA
ATTTACTTTAAAGCTATCTTACAATTTCCTTTCAGTATAAGGTCAGGGCA
GCTGAGGAATCTTACTTCTGCTAAGATATCAATGGCAGGGCAACTAAAAA
AGTAAGTATCGCTGTTAAAATCTTTGATAGAAAACATTTCAGATCTAGCA
ATTTTATCAAACCAAAGTCTTGTGTTGATAAGTATTTTGTTCCAGATGTT
ATATATTTTCATCTGATTTTAGGGTTGAAGGAACGAGCAGTCAATCAAGC
AATGTATCCTTAGATATTGTTGAAGAAACAGAAGAGGAGGTTGAAAATGA
ACAAACCTCATTTTCCTCAACATCAATAAGCGAGGTATATTATTCTAAGC
TTTTTCACTTTCAGAAAAATTCCCATTTTAAACTTATTTAAGTAGCAACT
TTGTTTTCATCATTTATACTTTGGTCATTTTGCTTTTTAGGAACAGTCAG
AGTATACTTGGAGGGTCGATTTAGCAGAAACTGAAAAATATTGGAAAGGT
ATGGAAATTCCTTTGCTGTTGTACATGTTTTTACTTATCGATTTTGATGA
TTTCAAATGATGTGCTGATTTTTTCTTCTCTCGTTGTAGGATGGTTTGAG
AATATGTCATCACTTTTTGTTTCTTGCCCAGTTCCAAAGCTACTTTTACT
AGCAGGTAAAGATTATCTGTGGCCGGAAAGCTCAGTCGGTAGAGCATTTA
CCTTACAATGGTTGTTGGTACCTTCCGGTTCCCCGGTCACCCCCAACTCA
GCCAGCAAATGAGTAGCTTAGATTGGGTAATCTGATCTATGCAGTAACTT
ACTGGAAGCTGTAGGTGTGGCCCTCCATCTCAGCATTTGAACTCCCAGGT
CTAGTGTAAATAGAAAAGACTAGACTAGATAGACTCCCTTGCTCTCGGCT
CTGCCAACAGCCACCTGATGAATATACTTTTACTTTTGTTTTACTTACCT
AAAGTTTATGCAAAAGAAAACATTAAGTCAAGAATTAAAAGTAATGTTTT
ATTTGCCAGTGCAACTTTAAATGTCAGTTAACATTAATATATGGTCTTCT
TTCTTATTGATTCAAACATGCTTTTACATTTCTAGGAATAGATAGACTTG
ATAAAGATCTGACAATAGGTCAAATGCAAGGTATTTTTAGTATTTAAAAT
TTTTGGTATTTTATTTATTGAAAATGTATAACGGGAAAATGAGGAATAGG
GTATAACCTTTAAGACATTGGGCAAAGGAAGAACTCTTTATTTAATGTTT
TTAAAAATCTATGTCTTATGTTTTATCCATTTTTGTGTTTTCGCATCAAG
TAATTTATGATATTGTGATATATCAGACAGTGAACTCGTTGGTAAAGCAG
AATTAACTGGTCCAATGAAAACTTGTGAATCTTCGTATTTTAGGGAAATT
TCAGATGCAAGTTCTACCTAATTGTGGACATATGGTTCATGAGGATGTAC
CAGATAAGGTAAGCATTTGATCTCGTAAACTCAGTGGCAAAGTTCTGTCT
TAAATTCAAGCCTGAAGCTGTCTTTACAAATATGATACTTCACTTACGAC
GGAAACGCATGATTGTAAGAAGATAGGGTTAGAGGCCCAGTGCAGTGTGC
CTAACTGTAAATAAAACTCTATAATAGAATTGACAAACAAATGGAATGAT
AAGATCTATAAATTGTAAAGATGTAAGATTGTTTCCTAGAGGTCAATAGA
CCTGAGAAATACACTTCTATAAATAAATAAATATTGTGTGAATAGTTTAA
ATGTTCTAGGGTTGGTTGGTAAATTTCTTGAAGTCGGTAGAATCATGTTC
TATTTCTAATGGTACTTTAACTTTGAATTAAATTTCTTCTGTAACGATTT
TCTTAGGTTGCAGAAATCCTTACTGCCTTTCTATTGAGACAAAAATTGAC
TGTGGCCAAAAGCAATTTTGAAAGGTAAGCTTACTTTAAGTTAATAATTA
GGAACATTACATGGTCCACCTCCAGTGATTGCTGGAAATTTTAACCTTTT
TTTTTTTTTTTCAGACACACACCATCTTGCTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000248_pilon:135319..141001- >XLOC_013112 ID=XLOC_013112|Name=XLOC_013112|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2250bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000248_pilon:135319..141001- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGCAATGCAAAGGGATATCATGAAAAGCAAATTACCACCTTTGCC
AAGTAAACCTGTTGGTCAAGCATCAAGATTTTCAAGTCTATGTCTGCAAT
GCAAAGGGATATCATGAAAAGCAAATTACCACCTTTGCCAAGTAAACCTG
TTGGTCAAGCATCAAGATTTTCAAGTCTTGTTCCAAAAAGAAATGTCAAA
GATTACTCCCCATCCTCATGGGAAGGATATTTTGATAAACAGCATGATGT
CAAAGTTGGAGAGAATTGTTCCAAAAAGAAATGTCAAAGATTACTCCCCA
TCCTCATGGGAAGGATATTTTGATAAACAGCATGATGTCAAAGTTGGAGA
GAATACATTTAGGTTATATACCAGAGGTACAGATGGACCAGTAGTCTTAC
TTCTTCACGGTGGTGGACATTCAGCACTATCATGGGCAGTCTTTACGACA
TTTAGGTTATATACCAGAGGTACAGATGGACCAGTAGTCTTACTTCTTCA
CGGTGGTGGACATTCAGCACTATCATGGGCAGTCTTTACGAAAACCCTAT
GTGATATGTGTGATTGCCAAGTTGCTGCTATTGATTTTCGAGGTCATGAA
AACCCTATGTGATATGTGTGATTGCCAAGTTGCTGCTATTGATTTTCGAG
GTCATGGAGACTCAAGTACAACCAATGATACCAACATGGCAGCTGATGTA
ATGGCTTAGAGACTCAAGTACAACCAATGATACCAACATGGCAGCTGATG
TAATGGCTTATGATATCTGTCATGTTATACTGAATTTCTATGACCAATCA
CCACCTCCAATTGTTATGATGGGCCATAGTGATATCTGTCATGTTATACT
GAATTTCTATGACCAATCACCACCTCCAATTGTTATGATGGGCCATAGTA
TGGGAGGTGCAATCGCTGTTCACATCGCTGCAAAAAAGATTCTTCCAAAT
TTGAGTGGCCTTGCTGTTATAGATGTAGTGGAAGTATGGGAGGTGCAATC
GCTGTTCACATCGCTGCAAAAAAGATTCTTCCAAATTTGAGTGGCCTTGC
TGTTATAGATGTAGTGGAAGGGACTGCACTAGATGCACTGTCTTCAATGC
AAAGTTTTCTTCGAAGTAGACCTCAGAAGTTTAGTTCTCTGAAACAAGCT
ATTGAATGGAGGGACTGCACTAGATGCACTGTCTTCAATGCAAAGTTTTC
TTCGAAGTAGACCTCAGAAGTTTAGTTCTCTGAAACAAGCTATTGAATGG
AGTATAAGGTCAGGGCAGCTGAGGAATCTTACTTCTGCTAAGATATCAAT
GGCAGGGCAACTAAAAAATATAAGGTCAGGGCAGCTGAGGAATCTTACTT
CTGCTAAGATATCAATGGCAGGGCAACTAAAAAAGGTTGAAGGAACGAGC
AGTCAATCAAGCAATGTATCCTTAGATATTGTTGAAGAAACAGAAGAGGA
GGTTGAAAATGAACAAACCTCATTTTCCTCAACATCAATAAGCGAGGGTT
GAAGGAACGAGCAGTCAATCAAGCAATGTATCCTTAGATATTGTTGAAGA
AACAGAAGAGGAGGTTGAAAATGAACAAACCTCATTTTCCTCAACATCAA
TAAGCGAGGAACAGTCAGAGTATACTTGGAGGGTCGATTTAGCAGAAACT
GAAAAATATTGGAAAGGAACAGTCAGAGTATACTTGGAGGGTCGATTTAG
CAGAAACTGAAAAATATTGGAAAGGATGGTTTGAGAATATGTCATCACTT
TTTGTTTCTTGCCCAGTTCCAAAGCTACTTTTACTAGCAGGATGGTTTGA
GAATATGTCATCACTTTTTGTTTCTTGCCCAGTTCCAAAGCTACTTTTAC
TAGCAGGAATAGATAGACTTGATAAAGATCTGACAATAGGTCAAATGCAA
GGAATAGATAGACTTGATAAAGATCTGACAATAGGTCAAATGCAAGGGAA
ATTTCAGATGCAAGTTCTACCTAATTGTGGACATATGGTTCATGAGGATG
TACCAGATAAGGGAAATTTCAGATGCAAGTTCTACCTAATTGTGGACATA
TGGTTCATGAGGATGTACCAGATAAGGTTGCAGAAATCCTTACTGCCTTT
CTATTGAGACAAAAATTGACTGTGGCCAAAAGCAATTTTGAAAGGTTGCA
GAAATCCTTACTGCCTTTCTATTGAGACAAAAATTGACTGTGGCCAAAAG
CAATTTTGAAAGACACACACCATCTTGCTGAACACACACCATCTTGCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000248_pilon | genome | sc0000248_pilon:135319..141001 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1108-1125:19 |
| Aaloc | 1039-1104:178 |
| Aaloc | 976-1038:639 |
| Aaloc | 931-972:947 |
| Aaloc | 865-927:1443 |
| Aaloc | 805-861:1594 |
| Aaloc | 694-804:1811 |
| Aaloc | 628-690:1998 |
| Aaloc | 538-624:2291 |
| Aaloc | 451-534:2749 |
| Aaloc | 382-447:3847 |
| Aaloc | 331-378:3995 |
| Aaloc | 271-327:4601 |
| Aaloc | 178-270:4945 |
| Aaloc | 91-177:5433 |
| Aaloc | 1-87:5684 |
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