XLOC_012631 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_012631
Unique NameXLOC_012631
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000179_pilon:382601..396046-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_012631 ID=XLOC_012631|Name=XLOC_012631|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13446bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:382601..396046- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAAGGTCAAAGGTGGTATTTTTGGATATAATTACGGCGTTCTCAAACCTG GTATCATCAAACTTGGAGACCCTGTTTACCAGCTTAGTTCGTAGTCAATA TTTTTTTAGGTATAGCTAGGTTATTTAATAGTTGACACATTTTGACTTTT TAGAAAGATTTTTAAACCCATGACTTTTTTGAAAAAATTTTTAACCCCAC GACTTTTTGAGAAGATTTTTTTATTGCGTTTTAGTAACTTTGAGTCTCAA ATTCATTTTTCTTATTATTTTTTTTACAAGGGGGGCGGGACACTAAAAAG CCAAATTTTCGACGAACCACAACGCTACTACTTAAGCCTTAAAAAGCTTT TCAGATTACCTTGCAGGACGAAATTTAGGCGGGAATATTTTTTTGGCAGA TGAAGGAAAGGATAAATCCACCGATAAATTTCTTCCTTTAGGGTAATTTG TCCATATAGGTCTCTCATTAGCAGCAAAATATTAAAATCAGTGTAACAGC TAAACAGACTGTTGTGTTACTACACATCGGATGGTCGAATACACCTTTTC GACCGTAGCCGCCAATTGCCGCACTGGCATTTTGTTATCCGTTTTACCAC CCTAAAACTGTCCCAGTCTTTTTTTCGCACCTATAGACAATAGAAAAAGG TGTAAAAAAGGATTGTATTGGGTTTAAGGGGATAATTAAATAATTAAGTG GCACGCGCTGACTGTGTGACTACGGTCGAAAAGGTGTATTGATGTTTGAA AAAAGTATGCTTTTCAATGGTTGAAGTGACACGGGTATTCTCATAAAAAA GCCAATTTTCACAAGCTGTATGAGTAATTCTCCAACCTTTTTGTTTTTAG ATTCAAGCAAGTAAAATATAAAATATTTAAAAAAATGGCTAAGGAGAACA TCTTCCCATTTGAAGTGTACATTGCATTTTTCCTTTCCGCTTTCATATGC TTTATATACCATAAATTTTCGACGTATAAACAGCATCTTGATGTGAAGGG AGAAATTGTTGCATACATTAAAGAGATTCGAACGCATCCAGTTAAATCAT GTAAACCTGCACAACTACAAAAAATTGAAGTCACAAATCTTGGGTTCAAA CATGACAGGTAAATTCTTTTTCCCTAATTTATGTTTTTTTAAGCAAGTTC ATCAACACATCTTGAAAACAAAACCGGGAATAAATGACAAATTTTGCCCA AACGTAATTTTTTCCTGGTTCATGACGTAATATTTTATACGGAAACACAC GAAAAACACCGGGCGTTTAAATTCAAAACTGGTGGTAAACGCCCGGTGTT TTTTCGGTGCTCACGTATAAAAGATTACGTCATGAAAATCAAGAATTTCA TAGAGGTACTGACTATCATTTTCAAATTGACTCAGTTTTACCTTTAAGGT ATTGCTAAACATCAATTCTGAATATCCTAATTCACCAAAAATCAAAGCAC AACAATGTTCAATCCCAAAAAATCGAAATTCGAATAATTTTTCTATTTTT GGTACCCTTATAGAGATCCTCCTCCAGTTTACTTTGAACGAATGATTTTG AGATCGTCTCTCTTTAGAGGGTAAATTTACAAATTTTCCATGGACGGATT TGGTTTCTGTAACCTTTAGAGAGATTTGTTCTATTTCATAGGCAATTCGT CTTATTAAACCAATACGGAACATTTTTGACGTCAAGAAAGTATCCCAAAT TCGTTTTAATTGAACAAGAGATTTTGGGCAATGAAATTAGTTTACGAGCA GAAGGAATGCCTGATCTTCGGCTGCCGTTGAAAATGACAAAGAAAGATGG TGACCATGTTGCTGATTTTGCGTAAGCCATCTTTTTTTAAGGACAAAATT TGTTTATTACTGTTTTCAAGTCAACTTTTTGGACCTACCCCGGTGGGCTG TAGGTCCTATAAATTAACCTCTGTTCGTTCGTTCGTCCGTTCGTCCGTTC GTCCGTTCGTTACTAGCTTTTCTCGGGACTGGCTCATTAGTTTTTCCTAA TTTTTGGCACAAAGATGCAAAATGGTAATGCCCAAAATGTGACGGAGCCC GATTTTCGAAAAAAATTCATTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCCGG AAAAACCGGTTTTTTGGCATTTTCTCGAGATTTCATCATTAGTTTTTTCT GATTTTTTGCACAAAGATGCGTAATAGCAATGCCTAAAACATGGATTAGT CCGATTTTTGAGAAAAATTCTATTCCGGCTGAAAATGCCGGAAATATCCC GGAAATCGCTGTTTTTGCAGATTTTCATCGGACTTTTTCCTTATATTTCG TTGTTTTTTCACACAAAAACATTATTGATAGCAATGCCCACCATCAAGCA TGGTTTAATTGTCAATAAAAGTGATTTTTGAAGCCGGACGGACGGACTTC TAAAAATCGCCGGCGGACAGCCTATTTTCGCCGGAAAAAGAAAAAAAAAC GGTATTTCTTGAATTTCTCGAGCTGTACTTTATATTTTTTCATGAAATTT TGCACACTGATGCAAAATGACAATACTAAAATGTGACGGAGCCCGATTTT CGAAAAATATTTTTTCCCGGCCGAGAATGCCAGAAATATGCCGGAAAACC GTTTTTTTTACATTTTCTTGAATTTTCATCTTTAGCTTTTTCTGATTTTT TGCAGAAAGATGCGTATTTGCAATGCTCAAAACATGGCCGAGTTCGATTT TTGAGAAAAAATTTTTCCGTTTGAATATGCCGGAAATCACCGTCTTTGCA GATTTTCATTACATGTTTTCCTTGTATTTCTATGTTCTTCACACAAAAAC ATTATTGATAACAATGCTCACCATCAAGCATGATTCAATTGTCAATAAAA CTGATTTTTGCGACCAGAACTTTCTATTAATTTTTCCCTACAACCCTTCC CTCTCCCCCCATCAACAATCAATGATGAATTTATTGCGTTATGCATTTTC GCTAAACGATATATTTTCTGATTGATTTTTTTCTCCTCGCATTGCTATCT AACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATCTAGCTTGTTTTTTGTGT TTTCAATTTTGTTCATTTATTTATTTTTTTCAGAAAAGGTTATTTAAATC AATACAAAGCAACCTTGAGTACCGCGCTTTGATAACGACTTTCTATTGGT CTAACGCACTGATTTGGAAAGCCCAAAGGGCTAAATGTCGTGCTTTTGCT GAAAAGTGTGCCGTTGTTACAAAAGAATTTCAGCACTTGACCAATCAGAA GCTTAGTGGTATTTCGAAAACAATAGAAACTATATTTCTTGCGATATCCA CTTATTTTACCTGCAATGGCTTAAAGCACGACATCTAGCCATTCGGGCTT TATAAATCTATAGTCTAATGGTCTTTAAATTGGGATGCGGTCAGTCCGGA TTACCAATGATTCATTCTTGAAATGGCCGATTTCACGCTAGTACAATAGT CAGTATTTTTACCTTTTTCGATAGAATCTGGACCATCAAAGGACAAGGTG TTCACGTGTCTCAGGAAGCCGACGATTGGTTCGCTCAAGTCTTAAATTTG GAAGGATGTAAATTGTACTGTTTCCCTACTGATGGGCCACCGAGGCGAAC GAGAGACAAAGGTCAATATGAAGTCTTTGAGAATTATGATAATACCCCGA ATACTGTAAGTTTGATGAGTTTATTCTAAACTATTCTTGTTGATTTTTTA ACCCTACGCGCTTGACAATTTATCGTGCGAAATACATGAAATTAAAGTAA AAACTTATTTGAAACCCGTGTATTAACAAAAGAACTTCTCAAAATTTTTG CTCGCGTGGCGTCGATGGCGGTGTTTAAATATGCTGTGAAAGCAAACGAT AGTCCCTAGAACTGAAGTGACAAAAGAAAAAAGAAAAAGAATTTCTGGTA ACGAAAACAACCTGAACCCCTATGAATCGAATGTTCCATGGATCGAAATT TCCATAGCAAAAAATCGAATAAATCTGTTTTACCTTTTATTTTATTTAAC CAATTGCACGTTTATTTCAGATGATGTACACAGATGGTAGTCCTGTTTTA ATATTATCACAACCATCACTGGTTGATTTGAATGACAAATATACAGAAGA AGATCTTAGTATGGACCGATTTCGTCCAAACATTGTTCTAGAAGGCTGTA AACCTTACGAAGAGGTAGTTCATTCAATGACTTTTTTTTGCCACCAAATG AACCACTTCTTTCAATCTTTTTTCAGGCCAAAATACTTGGAAAAGCTTCC TGCAAGCGTCCGAAAGTGCAATATCCTATTTTCTAGGTCTTCCGTTGAAA AAATAGGCGTAGTGGTATAGTGGTTATCGTGCTTCACTTCTGCCCAGGAG ACACGAGCTCAATACTCACCGTGGCCCTGCAATTCACTTGACAAGTGAAT ACTTTTTCGCCCGGGTCAACCCATGCCATTCGAGGAGAATTGGGTAGCAT AATAACTCTGATACAAGACTATGGGTAGATATTCCAGACATTGTTGTGTC GTGGGACACTTAGGAGGTTCTACACCTGTGCGGACATCCGTTCTCCCGTG TAGTTCGAGTGTCATGATATACGCCATGGCTGGGCAGCTCGCATCTGCAG GGTTATAATATCTGATTGCGCTGTAATCCCTACTCCATCGTGGGTAGGAC CCATTCCGATACATCGGAGGGCATATCTATCTATATCTATCGTTGAAAAA ATAATATTTTCTTAATTTCATTTCAATACTTGGGTACAACGCCCGTTAAA GGCAAATCTTTTCAAGTTAATTTAAACCTGTATTTTTAAGGACACTTGGG GACGAATACAGATCGGTGATGACGTCATAATGGAGGGTGTTTATCCAAGT GAAAGGTATATACAGTGTGTGTGTTTTTTTTTCGGCTTAGAACATAAGTC ATTAGACGTCCTTCTTATTATTCAAATTCCCAAGTAACATAGTGAAAAAG ATCTATACTGGGACCCCATCTCAACTTTTGCGAAAATTTGGTACCAGGTG GGAAAATACCCTGGAATTTCAGCCCCACTGGGAAATTGACTTTGATTTCA ACCCCACTCGTAAATCAATGTCTGAAAATTGCACTCCAAGACCATCCCCA TTGGATTTTTGGACCTACCCCGGTGGGCTGTAGGTCCTATAAATTAACCT CTGTTCGTTCGTTCGTCCGTTCGTCCGTTCGTTACTAGCTTTTCTCGGGA TTGGCTCATTAGTTTTTCCTAATTTTTGGCACAAAGATGCAAAATGGTAA TGCCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAATTCATTTCCGGCC GAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAAACCGGTTTTTTGGCATTTTCTCGA GATTTCATCATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAATATGCGTATTAGC AATGCCTAAAACATGGATTAGTCCGATTTTTGAGAAAAATTCTATTCCGG CTGAAAATGCCGGAAATATCCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTCAT CGGACTTTTTCCTTATATTTCGTTTGTTTTTTCACACAAAAATATTATTG ATAGCAATGCCCACCATCAAGCATGGTTTAATTGTCAATAAAAGTGATTT TTGAAGCCGGAACTTTCTAAAAATTCGCCGGAAGCCTATTTTCGCCGAAA AAAAAACGGTATTCTCGAATTTCTCGAGCTGTACTTTATTTTTTTTCATG 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TAATTTCTCATCATTGTTATAGTCTGTACACAGACCCGATATCTACGGCT AATTTCAAAATTCATTGCCGTAGAGGGTTTGCTAGTCATTGTCTTTGCTG ATTTTAAATTTTTCAAACCTACTGCTGCGATGGAGTGCGGGTGAGACGAC GAGAGAAGTGTTGCTATTTAAAAATTATACTTTATCGCAGAGGTTTCCGG ACGGGAATTTTTTTTATCAAACAGACAATGCGGACAGAGTGTTCTACGAA ACGATGAACTTGAGATACACTCTGGTACAGAGTACCTTTGTCATTGCGTC GTCAAAACTGTTCAAGCTGATAATCAGCTTGTTTGAAAATTAAAACCTCT CAATCGTCTTCTGTCATTGAAAAAGCCTTTTTAGTTTAGTTTACTATATT GAGCTTTTCCTCTTCGAATGAAAAATTGTCTGATCAAAAAGGCTCGAAGA TAAAGCAGGCAAAAATTGAAGAAGTTGAAAATTGAACCTTCAGTCACTAA AGTGAACATAAATGTCCGGGTTAATCTGTATCGGACTCATTACTCATAAT TATTGACAGCCAATAAATCGATAATGAACACAAAAATCAGAAAGTGACTT TAACTTATTCGACACTTATTTGTCAAAGTGCTATCCTGATTGAATGCGTT CTATATTGAATTAAATAGACCTTCTCATAAATTACGTCACGAACATCACT TGCCTCGTATTCAAAAAATTACCATGGTGATTGTGTTTCTTGAGACATTA AATGATTCTTTTATGAACGGGAAGTAGTTTTGATAAAATCTGCTGCGGGG AGTTAATCACCATGGCAATAATTTCAAAACAAGGCAAACGATGTTCGTGA CGTAATTTATGAAAAGGTCTATTGAATTTTAACTTACCCATTTCATATCA ACGAGAGTCAACCGTTTTTATTTTGTTTCTTAGGAATCGTTCAGGTCCAG CTTTTACACCTCATGCACATAAACTTAAGGGCGGATTATTTGGATTCAAT TACGGCGTTCGAAAGACTGGTTTTATCAAAATTGGTGATCCTGTTTACAA GTTGAAAGAATTACAGACCAGATCTAAATTCATGAAAAATGACTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000179_pilon:382601..396046-

>XLOC_012631 ID=XLOC_012631|Name=XLOC_012631|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2064bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:382601..396046- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTCCTTGAAGTTGTGTCAACTAAATTAATAAATGAACAGCGTTTATA
CATATGTCTGATTCTAATACCATTGGTATACATCATCTGGAGAAAGATTA
CGTCATCACCACCAAGGAGACGTGTTGTAGGTTACGTCAAAGAGATTCGA
ACACATCCAGTGAAATCATGCAAACCATATCATGTCAAAGAAATAGAAGT
CAGTTCATTTGGTTTAGAATTTGACAGATGTTCCTTGAAGTTGTGTCAAC
TAAATTAATAAATGAACAGCGTTTATACATATGTCTGATTCTAATACCAT
TGGTATACATCATCTGGAGAAAGATTACGTCATCACCACCAAGGAGACGT
GTTGTAGGTTACGTCAAAGAGATTCGAACACATCCAGTGAAATCATGCAA
ACCATATCATGTCAAAGAAATAGAAGTCAGTTCATTTGGTTTAGAATTTG
ACAGGCAATTTGCTTTGCTGAACGAATATGGAACATTTGTGACATTAAGG
AAATATCCCAAATTCGTTTTAATTGATCAAGAGATTTTGGGCGATGAAAT
TCGTTTACGAGCAGAAGGGATGCCTGATCTTCGGCTGCCGTTGAAAATGA
CCAAGAAAGATGGTGACCATGTTGCTGATGTCACGCAATTTGCTTTGCTG
AACGAATATGGAACATTTGTGACATTAAGGAAATATCCCAAATTCGTTTT
AATTGATCAAGAGATTTTGGGCGATGAAATTCGTTTACGAGCAGAAGGGA
TGCCTGATCTTCGGCTGCCGTTGAAAATGACCAAGAAAGATGGTGACCAT
GTTGCTGATGTCACAATCTGGACCATCAAAGGACAAGGTGTTCACGTGTC
TCAGGAAGCCGACGATTGGTTCGCTCAAGTCTTAAATTTGGAAGGATGTA
AATTGTACTGTTTCCCTACTGATGGGCCACCGAGGCGAACGAGAGACAAA
GGTCAATATGAAGTCTTTGAGAATTATGATAATACCCCGAATACTAATCT
GGACCATCAAAGGACAAGGTGTTCACGTGTCTCAGGAAGCCGACGATTGG
TTCGCTCAAGTCTTAAATTTGGAAGGATGTAAATTGTACTGTTTCCCTAC
TGATGGGCCACCGAGGCGAACGAGAGACAAAGGTCAATATGAAGTCTTTG
AGAATTATGATAATACCCCGAATACTATGATGTACACAGATGGTAGTCCT
GTTTTAATATTATCACAACCATCACTGGTTGATTTGAATGACAAATATAC
AGAAGAAGATCTTAGTATGGACCGATTTCGTCCAAACATTGTTCTAGAAG
GCTGTAAACCTTACGAAGAGATGATGTACACAGATGGTAGTCCTGTTTTA
ATATTATCACAACCATCACTGGTTGATTTGAATGACAAATATACAGAAGA
AGATCTTAGTATGGACCGATTTCGTCCAAACATTGTTCTAGAAGGCTGTA
AACCTTACGAAGAGGACACTTGGGGACGAATACAGATCGGTGATGACGTC
ATAATGGAGGGTGTTTATCCAAGTGAAAGGACACTTGGGGACGAATACAG
ATCGGTGATGACGTCATAATGGAGGGTGTTTATCCAAGTGAAAGATGTGT
GGCTATCAACGTTGTTCCAGACAAGGGTGCGATGAGCGACAAAAGTATTC
TGAAATATCTAAATGAATGTGTGGCTATCAACGTTGTTCCAGACAAGGGT
GCGATGAGCGACAAAAGTATTCTGAAATATCTAAATGAGAATCGTTCAGG
TCCAGCTTTTACACCTCATGCACATAAACTTAAGGGCGGATTATTTGGAT
TCAATTACGGCGTTCGAAAGACTGGTTTTATCAAAATTGGTGATCCTGTT
TACAAGTTGAAAGAATTACAGACCAGATCTAAATTCATGAAAAATGACTA
AGAATCGTTCAGGTCCAGCTTTTACACCTCATGCACATAAACTTAAGGGC
GGATTATTTGGATTCAATTACGGCGTTCGAAAGACTGGTTTTATCAAAAT
TGGTGATCCTGTTTACAAGTTGAAAGAATTACAGACCAGATCTAAATTCA
TGAAAAATGACTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_012631XLOC_012631-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000179_pilongenomesc0000179_pilon:382601..396046 -
Properties
Property NameValue
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