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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000098_pilon:291047..303704+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012250 ID=XLOC_012250|Name=XLOC_012250|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12658bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:291047..303704+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ggtATTGCTGTTATCTCTGCTAAAAACACTTCATACGGTTCATGGGAATA
CAAATGTGGTGGAGGATCCTGGACACCAATGGACATCCAATACAATCCAC
CGTTGAGAAAACTAAATCACACTGTCCTTCTTCTAACACCTACCGACTCG
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TACCGGATGTGTaaaaaaaCGCCCCTTTTTTACAATCTTTGacgtatttt
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TCTTCTGAAGACCTCTACAGAATGTGCTGAAAGTATTATTCCCCGTCTAT
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GTCATCTACTTCAAAGAGATGAACCCTTTCTGTAGCTATCACTTATTTTT
ATATACTTCTTTTCACTTTCCAAAATACAGCTAAAGCAAAGCTCCCTGGT
TGTGGTGGATCTAACAGTGCTCAAATGGATTTCTTATGGTCTCTAAGCAA
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GTTTGGTTATTTAGACTTTTTCTCTTAAACTATACTATTTCACCTTTTTC
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TTCCACCATCTTGACTTCAAACAACATCAAAAGGACTTACGACGTATTGG
TGGAAATAATTGAACCTTTGATCGCCAGAACTCCCACTCAGGTTGGTCCA
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TGAAATCATTCGACAACATAATCACAACTGGTGGTTACGACTCCAACCAG
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TATGTGTCTTAGCAAACTTCCTGGTGAAGATGCAGCGATCGCCAAAACAA
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TTCGTTCCCATTCTCCAACTGTACTGATCAAGCTGTCAAAACAAGCAAAA
GCTCAATTCAGCAACAAATTGCTGACAAACTGAACATCAGCAAAAATACA
ATGACCAATTTTACAGTGTCATGCGGTAGTATCGTGATCTACTACATTCA
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ACGCCATCACTCAAAATAACCTTAATATCACTGTAGCTGGACAAGTCTTA
TCTGTTAACCAATCTTCATTGATGGTAACAATCCAAACGCCCAATTATGC
TATTACAACAACCGCCCCGCCCACGGAAGATACAGATGAACTCAGTGGTG
GAGCAATAGCTGGTATTGTtattggagttttgatattcaTCATCATTGTA
GCCGTTGTGGTTTATTTCATGTGTTGTAAGAAAAACACCAGGAAAGATAA
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GTTTTGTTTACTAAACAAAGATTTCTGAGGAGGTTCAAGAAGTCACCATG
TTATTCGATAAAAGTGAGAATAGAAAAATCACCACAAATGACAGTTTCAT
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CTTCTGGCATCAAGAGTATTAAGTTTAGCAACGTTAAGTTGATGGCTGGT
AGAAACTGTACCCTTCTTGATAGATTGAAGAACTGTATGCTGCCGTTAAA
CTATAATAATCTATAACGCATAATTTTGCTCCAATGACAAATctataatt
tctttatttttttgttttctcaggAAAATCGAATCGCGCTTATCAAGGAT
CGCCGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:291047..303704+ >XLOC_012250 ID=XLOC_012250|Name=XLOC_012250|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=10080bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:291047..303704+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ggtATTGCTGTTATCTCTGCTAAAAACACTTCATACGGTTCATGGGAATA CAAATGTGGTGGAGGATCCTGGACACCAATGGACATCCAATACAATCCAC CGTTGAGAAAACTAAATCACACTGTCCTTCTTCTAACACCTACCGACTCG ATTCGATTCTTACTTCAAAATGAATCTTCGTTCTGGTCTCAGAGAGAGgc atttgagaaaaatattcagTTACAAGTGTTGGCTTGGGATCAAACCGATA ATCAAACATGTGGTACTTACCTTCATACTGGCTCTGATTGGCCCGCATCT ATGAGTATGAAATGGGCAACAGggtATTGCTGTTATCTCTGCTAAAAACA CTTCATACGGTTCATGGGAATACAAATGTGGTGGAGGATCCTGGACACCA ATGGACATCCAATACAATCCACCGTTGAGAAAACTAAATCACACTGTCCT TCTTCTAACACCTACCGACTCGATTCGATTCTTACTTCAAAATGAATCTT CGTTCTGGTCTCAGAGAGAGgcatttgagaaaaatattcagTTACAAGTG TTGGCTTGGGATCAAACCGATAATCAAACATGTGGTACTTACCTTCATAC TGGCTCTGATTGGCCCGCATCTATGAGTATGAAATGGGCAACAGGTATGC 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GCAATCTGTTCGTTCTACCTTGGTGAAGTTTTCTCGGCCACGCGAGGATG CTTGTGGCATTTGTGGCGGTGATAATACAACATGTGTCGATTGTGCTGGT ACACCTAATGGTAAGAAGAAGATCGATCTGTGTAAACTATGTCTATTACC TGATGACGCAAACTTCAATGCTGGTTGTTCCAAACTTGGTGATATTGTAC CGAATGTGTTTTATAAAGATCGATTGGCCAGTGCCAAAGCTACTATCTCC AGATCTGGTCCAATTATATCTGGAAATGCAATCTGTTCGTTCTACCTTGG TGAAGTTTTCTCGGCCACtcaTAATTCAACAAGTCCCATCGCTAAAAGAG AACTCACGTTATCAATTGCATCTACTTTGTCGGGTGGTAATCATAATGTC CGGTGTGATACACCtcaTAATTCAACAAGTCCCATCGCTAAAAGAGAACT CACGTTATCAATTGCATCTACTTTGTCGGGTGGTAATCATAATGTCCGGT GTGATACACCAACTGGAGGTGATACGAGGACCAACCTTAACACCACCAAT GATTTGATGATCATTGATCCATCAACCATCGCCATCAACAGTGTGTCATC ATCCATTATCGATTACGCGGCAACTGAAGAAGTGACAGTCACCGGTACAG GATTTATGGATACTAAACAATTAGCTTGTTTATTTATTCGGGACCAAGGT GGCAAATCTAAAAGAGAAGGTCCAGTGTTGAAAGCAACTTATGTCAGCTC TACTCAAGTGACATGTCAATTGAAACCATTACGTAGATCAGTATCTGGCA AATTAGTTGTCTCATTTGTTGATTCTAAACGTGAAGAATATTTAGATAAT AACATCACCTTGCATCGATCAGCTAACTTATCCAGTATTAAGAGTGCAAC CTTCTCGACTGATCTTGGTAGTATTTGGATTACATTCCATGGTTTTGTTG GTTTGAAGAACAAAACAGCATCATGTCAAGATATCTTTCCTCAGAATTAT ACAAGTTTCGGTGCAAAAGCTAGGTGTTTTAGCCGTGGTAAGATTTTGGC CATTCTCTTGATGGGTGATGCTACTATTGGTGTCGGAGCACTACACGTTG ATATGACTCAATTCGTTGTTAAACCGGCTGATTATACCGTGTATCCTGAG AGTACTGGCGTCGTTGATGTGGCCCTACCACCTGGCGCAGCTGCGCCGAA GATCAAATTGGTCGCTTCTAGACAATTAGAACTGGAGGTGATACGAGGAC CAACCTTAACACCACCAATGATTTGATGATCATTGATCCATCAACCATCG CCATCAACAGTGTGTCATCATCCATTATCGATTACGCGGCAACTGAAGAA GTGACAGTCACCGGTACAGGATTTATGGATACTAAACAATTAGCTTGTTT ATTTATTCGGGACCAAGGTGGCAAATCTAAAAGAGAAGGTCCAGTGTTGA AAGCAACTTATGTCAGCTCTACTCAAGTGACATGTCAATTGAAACCATTA CGTAGATCAGTATCTGGCAAATTAGTTGTCTCATTTGTTGATTCTAAACG TGAAGAATATTTAGATAATAACATCACCTTGCATCGATCAGCTAACTTAT CCAGTATTAAGAGTGCAACCTTCTCGACTGATCTTGGTAGTATTTGGATT ACATTCCATGGTTTTGTTGGTTTGAAGAACAAAACAGCATCATGTCAAGA TATCTTTCCTCAGAATTATACAAGTTTCGGTGCAAAAGCTAGGTGTTTTA GCCGTGGTAAGATTTTGGCCATTCTCTTGATGGGTGATGCTACTATTGGT GTCGGAGCACTACACGTTGATATGACTCAATTCGTTGTTAAACCGGCTGA TTATACCGTGTATCCTGAGAGTACTGGCGTCGTTGATGTGGCCCTACCAC CTGGCGCAGCTGCGCCGAAGATCAAATTGGTCGCTTCTAGACAATTAGGT CGTTGTGACGATATGGTGGTCAAAGCaaaaaaaCGCAAAGGCGGTGGTCG CAAACTGACCTACACTTGGTCTGTATCTTGGAGCTCATCCAACACTGCAA TTACCACAGCCCAAAACAACAGTTTGACTTCGATAAATCAAGCCCTGTCT GCTTTGCCTGGGGAATCCTCGATAATCAAGGTCGTTGTGACGATATGGTG GTCAAAGCaaaaaaaCGCAAAGGCGGTGGTCGCAAACTGACCTACACTTG GTCTGTATCTTGGAGCTCATCCAACACTGCAATTACCACAGCCCAAAACA ACAGTTTGACTTCGATAAATCAAGCCCTGTCTGCTTTGCCTGGGGAATCC TCGATAATCAAGGTGACAGCATCAGGCATTGGCAACGACTTGATGAATGT TGATCTTGACGCCACTGTGACCATCAGAAACTTCTTGGGCCTTGAAGGAA ATCAAACTATCAAAATTCGAAGAGAAAACAAAGATCTGCCAAAATTAGTA TTGAACAGACAATCCGTAGAGATTAGAGCATCACAAAAACTCATATTGAA AGGTGACAGCATCAGGCATTGGCAACGACTTGATGAATGTTGATCTTGAC GCCACTGTGACCATCAGAAACTTCTTGGGCCTTGAAGGAAATCAAACTAT CAAAATTCGAAGAGAAAACAAAGATCTGCCAAAATTAGTATTGAACAGAC AATCCGTAGAGATTAGAGCATCACAAAAACTCATATTGAAAGCTAAAGCA AAGCTCCCTGGTTGTGGTGGATCTAACAGTGCTCAAATGGATTTCTTATG GTCTCTAAGCAACGCAGATGGTTCACAGTCTAGTGTAGTTTTAGCTAAAT TGGACGGCCCGAGGCTCATCATCCCTGCACAATCACTAGCCGGTGGAAGC 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TTACGACATGTGGTTCCACCATCTTGACTTCAAACAACATCAAAAGGACT TACGACGTATTGGTGGAAATAATTGAACCTTTGATCGCCAGAACTCCCAC TCAGATTGAAGCGGGTTTGAAATCATTCGACAACATAATCACAACTGGTG GTTACGACTCCAACCAGCAAGCTGCCAAACAATCCTATCTCTCATCTGCA ACTCGGCAAACACAGCGTATGTGTCTTAGCAAACTTCCTGGTGAAGATGC AGCGATCGCCAAAACAACTTTAGCCACTTTACAATCAATTCAATTGAGCT TATCAGCTTCGGAAAGTAATTGGACTAAACTTGGCTGTGATGATTGCACC ACTAAACCTTCTTATGTGGACTTGAGAGAATTGAAAACACAATTCAGTAA TGATTATACGTGTGGTGATGAACAATGTTCTGGTGCTTGTGTTGCTTCAT TCCAAATTGAAGCGGGTTTGAAATCATTCGACAACATAATCACAACTGGT GGTTACGACTCCAACCAGCAAGCTGCCAAACAATCCTATCTCTCATCTGC AACTCGGCAAACACAGCGTATGTGTCTTAGCAAACTTCCTGGTGAAGATG CAGCGATCGCCAAAACAACTTTAGCCACTTTACAATCAATTCAATTGAGC TTATCAGCTTCGGAAAGTAATTGGACTAAACTTGGCTGTGATGATTGCAC CACTAAACCTTCTTATGTGGACTTGAGAGAATTGAAAACACAATTCAGTA ATGATTATACGTGTGGTGATGAACAATGTTCTGGTGCTTGTGTTGCTTCA TTCCAATATCCAAACGATCTGTATGCATCAAGTTTCAACGATACCATGTT ATCTCACGTTTTGGACGTCCAGTTATTTGACTCCAGCACCACCAGCGCTG GCTCGTTAAATGTCACCACTGTCTCTGGTGGAATTGATCTCCATATTCAC 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CCAATTATGCTATTACAACAACCGCCCCGCCCACGGAAGATACAGATGAA CTCAGTGGTGGAGCAATAGCTGGTATTGTtattggagttttgatattcaT CATCATTGTAGCCGTTGTGGTTTATTTCATGTGTTGTAAGAAAAACACCA GGAAAGATAATCAGATTGAACCCAATGAAAATGACGTCGAATTAAGAGCA AGCATCAGTACCATGGCTTTCTCCTCCAGTATTTCACCATCAGCAAGCCT CAATAACTCCATGATGTCAACTGCAGTCGTCCCAACACTCTCGCCACAAA ACTACCCACGTGCTGTACAATTTTCGTTCCCATTCTCCAACTGTACTGAT CAAGCTGTCAAAACAAGCAAAAGCTCAATTCAGCAACAAATTGCTGACAA ACTGAACATCAGCAAAAATACAATGACCAATTTTACAGTGTCATGCGGTA GTATCGTGATCTACTACATTCAAACACACGACAGCAGTATAACCGCCCAG CAAGCAGTCACCCTCCTGCAAAACGCCATCACTCAAAATAACCTTAATAT CACTGTAGCTGGACAAGTCTTATCTGTTAACCAATCTTCATTGATGGTAA CAATCCAAACGCCCAATTATGCTATTACAACAACCGCCCCGCCCACGGAA GATACAGATGAACTCAGTGGTGGAGCAATAGCTGGTATTGTtattggagt tttgatattcaTCATCATTGTAGCCGTTGTGGTTTATTTCATGTGTTGTA AGAAAAACACCAGGAAAGATAATCAGATTGAACCCAATGAAAATGACGTC GAATTAAGAGgAAAATCGAATCGCGCTTATCAAGGATCGCCGTAAgAAAA TCGAATCGCGCTTATCAAGGATCGCCGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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Properties
| Property Name | Value |
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| Aaloc | 2998-3192:7749 |
| Aaloc | 2581-2994:6846 |
| Aaloc | 2440-2577:6304 |
| Aaloc | 2149-2436:5433 |
| Aaloc | 1957-2145:4825 |
| Aaloc | 1777-1956:4062 |
| Aaloc | 1057-1773:2999 |
| Aaloc | 961-1053:2412 |
| Aaloc | 685-957:1809 |
| Aaloc | 457-681:1347 |
| Aaloc | 325-453:701 |
| Aaloc | 1-321:1 |
|