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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000023_pilon:877933..883142- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012060 ID=XLOC_012060|Name=XLOC_012060|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5210bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:877933..883142- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAACGTTCCCATCAACAACTTATCAACCGCTTCTCTCTCACACTGA
AGATGAAGAAGAAGAAGAACTCTCTGAATTACCACCAACATATGTCACAA
CACGTGGACCTGAGAAGAACGGTATAAATAATATTATTAATAACAACAGA
TATAGAAATTCTTTAGATTACTTTATTGGAACTTATTTTTGCGGGAACTA
ATTTTCGCGGTCGTAAAAAAATATCCAAAAAATTGCATTTGGTAGCTTTT
AATTTTCGCGTTTTTTTTTTCATTCTGGAATTTTCGTGGGTTTTAATTTT
CAGTTTTGCCCTTTTTTGGACAAATTTCTTTCATTTTCGTATGAATTTTT
TTAAATTTTTTGATAAAATATTTGGAAAAAATTGTATTTTGCGGGAATTA
ATTTTTCCCGGTTTTACTTCTCTAAATTTTTCACTGGCTCAAATTTTTGC
GATTTTGACAAAAAAACACAAAAAACGCTAAAATTAATTCCTGCAAAAAT
TAGTTCCAATAAGGTATACATATTTCTACCAATTTATTTTATAACATAGT
GCAGTCTAAATTTGAAAAAAAATTTCATCGTATTCTGGATTGAACATTTA
TAATTCATTTTGCTTTTTCTTATATTCTAGGTCGATGGAATCATATAGAA
AATTTGGATGACTTTTTCACAAGGATATACAAGTATCACAGGGCACAAGG
ATTTTTATGCCTTTTGCTGACCAATATTTCAGTTTTACTGTAAGTTGAAA
AAAATTAAATTACATATATTCTTGTTAAATATAGGATACATTATGTCAAT
TTTTTCAACTATTTGTTTTGTTTAAAGAAGAAATATACACATTGTAAAGT
TTAAAAGATATCACCAAAATCAAGGTTTTCATGCTTACTTTTTAGGCAAT
ATATTTTCATTGTTATCTTTGCAATATTTTTGGCAATTTGCATTGATTAT
GAAATCCTCTTCAATGATCCTCATCCAACATACACCAAAGTTGTTCAATG
GGCAAGGTTCCAACAGTAAGTGTCTTGATAGAATAATTTTTAGATAATGA
GGTTGATTTTAAGTTTAGTTTGTTTTTTAAAGCAAAAAATTTAGAAAAAA
AATAAATTTTCAAAGGCAGTTGTTATGTCCCCCTTGTATGGTATTATTTC
TTTATTTACTAACTGAAGGGAAACAATCTTTAAATCATTGTTTTTATCTA
TAAAAAATGTTTCTTGATTTTGTAAAATATTCTTAGGAAAACAATAGTGT
GAAAAGTAAACTTACATAATAATGTTTTTTTTCTATCTCAGTATTCCAAG
TGGCTTTGTCCTATGCATGGTTGTTGCTTTTTTATTTTGGATTATCCGAT
TGGTTCAGGTTATTTATGATATTTGGAAAGCATGGGAACTTCATCAGTTC
TTCAAACAAGTTTTATGTATTGGTGATGTGAGTTTCTTTTTTACATATTT
TTTATTTTTATTAGAATATTATTATTAGAAGGTTGTGATAAAAAAACTTT
ATATTCGACCCATTTTATCTGGGTCAGCATAGTCATAGCGAGATACCCTG
CAAAATTTATGGATGAGAGCGGTTTTTAAGACACTGTAATTATTGTCTTT
GTTATATCAAAAGATAATGAATATATCTTAAACGTCTGCACTCCCTCATA
AATTTTGCAGGGTATCTCGCTTCGCCTATGGTCAGCCTGTCTAACAAAGC
TAGGTCAACTTTATACCTTTTTCATATTAATCAGAGTAGACAAAAATTCA
GACATGAATATAATATCCAACCTTAATACCCATTTTTAAGATCTTATAAA
TTGAATTTGCGATCTCTTTTTAGAATGAGCTACAAAATATGACGTGGCAA
GATGTTCAACATAAATTAGTTGAAGTTCAAGCTTCACATCAAATGTGTAT
TCATAAAAAGGAATTGACTGAACTAGGTATTATAAGCTTTCTATAAAAGA
TTTTGATTTTTTGATGGATTCACTTTTTTTATATAAGAATTGTGTTTTTC
GTTTCATATTTATCATGGACATTCTTAACTACTTGGGGCTAATCATCCTT
AAAAAAAAAATCGTAGGCTAGGATCCAAATTCAACTTATTCAGTTATTTA
GCAAGAAACAGCATCTGGGGAAGGGGTATTGAAAGATAAAAAATGTTTAA
GAATATCTTTTCTCGGGTTGAGTCGTCAAATTTTATGACGGTGATATTCT
TAGCATGTTCATATTTGTTTGACCAATTTCATCATGAATAGTGTTAAATT
ATTCTTCAATGATGAATTATTTTACAACTAATATTCAAGACCAAATTTTC
AGATTTTTGTCCTCGTGGTTATAGCTTTTGTAATGAGAAGTTGAACCTAT
TAGTTTAAAAAATAACAAGTCTGTTACTTTCCTGTGATGGTTGACTCTGT
TGAGTGGTTTATCTTTATCCTTCCTTTTTAGATATCCATCATAGAATCTT
GCGACAAAAGAATTATTTGATTGCGCTTCAGAACAAAGGAGTCATTGATT
ATCTATTCCACTTCCCATTCCTTGGTGAAAGGTAAACAGAATTTTGGTGC
CACAAATAGAAATTACTGAAAAATGGGTTCTTACACGGTCCTTTCTCTTG
TGCTGAAATAAAGAAAACTTGTAACTTGAAGAAACACTTTTATTTATTTT
CAATTTTAATTTTAAACTATTTAGTAATAGCAATGAGGCTCAAAATGCTG
AAAAAAGAACAATTTGAAGCTCAAAGTACCAAATGATAAGAAAAACTGAG
CCCTCGAATATTTACTGGCTGTTTATGAAAAGAGTTTTTAGATTAGAGGA
CTTAAATAAACTGTTTCCTTTTGTTTGTAGGACGTTCTTGACAGAGGGAA
TGAAATTCAATTTATATTTAATCTTATTCAATGGACCTGGTGCACCTTTC
GAAAAAAGTTGGAAACTCAAAACTCAATATAAAGATATCAGTAACAGGTA
ATTCTGTTTTAACTACTTTTCTATACCACTGTAGTTAAAAGGTGTTTTAT
GATATGAATTTTCTTTATTCTTCTGATTACTGATCTTCAAATTTATGATG
ACTATGGCCTTCTACTAAGAATCTTTGAAATGAGAAGTTTTTTTGTGAAA
TTATAGATCCCTAATTCACAAATTATTATTATTATTTTTTTTTAGGTCTC
TATTAGCTGCACAGTAAGTTTAGCTTTAATTGACTCTCTTGAAAAAGAAA
AAATTACTCCCACTCTACACAACCTATGTCTGTTAAGTCTGGTTGTACAC
AACCTATGTCTGTTAAGTCTGGTTGATACAGTTGTGGATTTCAGAATAAA
TATGAATGAGAGTTCATTTCCTTACATACAGTATATGGATTATGAAACAC
TCTTTATCATAAATTTTGAACCCCTCCTTATCCCTTAATAAGCTATCTTT
GTCAATTTGCATTATATTATTATACGTCAGAATTTTATAAGGACTAAATA
AAGTAAGCAGCATTTGTATTAAAATTATTTGATTATTTTTCTGTTTAGAC
TATCGAGGCGTATCTTCATGCTTGGTGTAATGAATTTCGTTTTTTGTCCA
TTCATTTTGCTGTACCAATTCCTCTATTCATTCTTCATGTATGCTGAGGT
AAATGATATACCATAATTTACGCCTTATCTTGTGAGCTGAATAAATTAAA
AATATTCAGCCGGAAATACAAATGTAGGGATATGAGAATTTGGGTTTTGT
GGAACAAAACAAAAGGATACACTATTCTGGATCCGCTTATTTCGTCGAAT
GACTTAGTGGGCTAAGAAGACAATTTTCTGATTTTCTGACTCGAACCCTC
GCTCCTTCTATGTTCAATTTAGTTCAATGGTTGGACTGGTTGGCCTAGAG
GTTTCTCGCTAACTATGTTCAATAGATCTTGACCCTATTTAGCCAATAGC
TTCTCACAAAACCAGCGGGTTTTATGCGAATAAATGCAACGCAATGCAAG
TGAAAGTGAGAATTTTGTGTGCGTTTAGGGTGCAGGATCTACTTTGATTA
CATTAGATTACCCGTATACTGAATATTGAATTTGACTACACGTGTGTCAG
GTAGTTTGTGTGTTGATTAAAAAACCATACTGGAATTCCTGCACTTTTAC
ACGGTGTGATAATGTATTTCTTTGCCTTTCAGTTGGTGAAAAGATCTCCA
GATCTCTTTGGTGCAAGGAAATGGTATGTGCCAAAACAAACACAAGTTTT
TAATGGTTACGACAAATGCATGTGTTAATCTTAAAACAATATATTGTTTT
TAACTTTTTTACTTTGGAATAGATGGAATAGTATCAGTATAATACAAGGT
ACGAGGGCTTTTCTAAACAGGTTTCCATTCAACTTTGAACAATCAGCAGT
ACATTTTTTATTTATTTCACAGGTCACTATATGGTCGTGTATATCTTCGC
CATTTCAACGAGCTCGATCATGAATTTCAACAACGATTAAGTCGAGCATA
CGATCCATCTAAGAAATACATCAATTCGTTTATGTCACCTGTTCTTACAA
TCATTGCTAAGTATGTTCATTGAGGTTAAAGTTCAACATTCAAAAAAAAA
GTTTTGAATTTATCATTTTATTGCTCCTTCACGTAGAGCACAGTCTTTGG
TGATACAAATCCCCTCCATCAATACTAATTGAGGTTATTACAATCTTTGA
ATTCACATGGTAGGACCTACGACTCCTACGGCTAAAATCGAATCTTCTAT
TGTAGGATTTGAAGCCACTTATTTCCTTTACATAGTTGCACTACACAAGT
GATTTTTATAGAAACGCTGGACTGGAAATAACATTTACCTCCATAAATCG
AAAAAAAATGTGATTGCGCAGAAAGTTCAATTCGTCATCCGAAATGCGAC
GTAAAATTCTAAGACATAACTTTGACTTGTCTGGGAAGTTGAAACAATAG
CTTTTAGCCTTAAAAAACAATTAATGAGATACTTTATAATAGGTTTTTAT
GTGGGTTGCTCGTATGGAAAGAAATGTAGTCGGATTTTTTACCTCATAGA
ACTATCAAACTATAGGCTAAATACTCAGATTTGCCTACAACCCAAACAAA
ACAATATAATAAACAAAATAATTATAATGATATTTTCTCTTTTTTTAGAA
ACATTGCTTTTTTTGCTGGCTCAATTTTGGCAGTTATGTTAGTATTGTCA
TTTTATGATCAAGACGTTTTAACAGCCGAACATGTTATTTCATTCATGGC
TATACTAGGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:877933..883142- >XLOC_012060 ID=XLOC_012060|Name=XLOC_012060|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:877933..883142- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAACGTTCCCATCAACAACTTATCAACCGCTTCTCTCTCACACTGA
AGATGAAGAAGAAGAAGAACTCTCTGAATTACCACCAACATATGTCACAA
CACGTGGACCTGAGAAGAACGATGTCAACGTTCCCATCAACAACTTATCA
ACCGCTTCTCTCTCACACTGAAGATGAAGAAGAAGAAGAACTCTCTGAAT
TACCACCAACATATGTCACAACACGTGGACCTGAGAAGAACGGTCGATGG
AATCATATAGAAAATTTGGATGACTTTTTCACAAGGATATACAAGTATCA
CAGGGCACAAGGATTTTTATGCCTTTTGCTGACCAATATTTCAGTTTTAC
TGTCGATGGAATCATATAGAAAATTTGGATGACTTTTTCACAAGGATATA
CAAGTATCACAGGGCACAAGGATTTTTATGCCTTTTGCTGACCAATATTT
CAGTTTTACTGCAATATATTTTCATTGTTATCTTTGCAATATTTTTGGCA
ATTTGCATTGATTATGAAATCCTCTTCAATGATCCTCATCCAACATACAC
CAAAGTTGTTCAATGGGCAAGGTTCCAACAGCAATATATTTTCATTGTTA
TCTTTGCAATATTTTTGGCAATTTGCATTGATTATGAAATCCTCTTCAAT
GATCCTCATCCAACATACACCAAAGTTGTTCAATGGGCAAGGTTCCAACA
TATTCCAAGTGGCTTTGTCCTATGCATGGTTGTTGCTTTTTTATTTTGGA
TTATCCGATTGGTTCAGGTTATTTATGATATTTGGAAAGCATGGGAACTT
CATCAGTTCTTCAAACAAGTTTTATGTATTGGTGATTATTCCAAGTGGCT
TTGTCCTATGCATGGTTGTTGCTTTTTTATTTTGGATTATCCGATTGGTT
CAGGTTATTTATGATATTTGGAAAGCATGGGAACTTCATCAGTTCTTCAA
ACAAGTTTTATGTATTGGTGATAATGAGCTACAAAATATGACGTGGCAAG
ATGTTCAACATAAATTAGTTGAAGTTCAAGCTTCACATCAAATGTGTATT
CATAAAAAGGAATTGACTGAACTAGAATGAGCTACAAAATATGACGTGGC
AAGATGTTCAACATAAATTAGTTGAAGTTCAAGCTTCACATCAAATGTGT
ATTCATAAAAAGGAATTGACTGAACTAGATATCCATCATAGAATCTTGCG
ACAAAAGAATTATTTGATTGCGCTTCAGAACAAAGGAGTCATTGATTATC
TATTCCACTTCCCATTCCTTGGTGAAAGATATCCATCATAGAATCTTGCG
ACAAAAGAATTATTTGATTGCGCTTCAGAACAAAGGAGTCATTGATTATC
TATTCCACTTCCCATTCCTTGGTGAAAGGACGTTCTTGACAGAGGGAATG
AAATTCAATTTATATTTAATCTTATTCAATGGACCTGGTGCACCTTTCGA
AAAAAGTTGGAAACTCAAAACTCAATATAAAGATATCAGTAACAGGACGT
TCTTGACAGAGGGAATGAAATTCAATTTATATTTAATCTTATTCAATGGA
CCTGGTGCACCTTTCGAAAAAAGTTGGAAACTCAAAACTCAATATAAAGA
TATCAGTAACAGGTCTCTATTAGCTGCACAGTCTCTATTAGCTGCACAAC
TATCGAGGCGTATCTTCATGCTTGGTGTAATGAATTTCGTTTTTTGTCCA
TTCATTTTGCTGTACCAATTCCTCTATTCATTCTTCATGTATGCTGAGAC
TATCGAGGCGTATCTTCATGCTTGGTGTAATGAATTTCGTTTTTTGTCCA
TTCATTTTGCTGTACCAATTCCTCTATTCATTCTTCATGTATGCTGAGTT
GGTGAAAAGATCTCCAGATCTCTTTGGTGCAAGGAAATGTTGGTGAAAAG
ATCTCCAGATCTCTTTGGTGCAAGGAAATGGTCACTATATGGTCGTGTAT
ATCTTCGCCATTTCAACGAGCTCGATCATGAATTTCAACAACGATTAAGT
CGAGCATACGATCCATCTAAGAAATACATCAATTCGTTTATGTCACCTGT
TCTTACAATCATTGCTAAGTCACTATATGGTCGTGTATATCTTCGCCATT
TCAACGAGCTCGATCATGAATTTCAACAACGATTAAGTCGAGCATACGAT
CCATCTAAGAAATACATCAATTCGTTTATGTCACCTGTTCTTACAATCAT
TGCTAAAAACATTGCTTTTTTTGCTGGCTCAATTTTGGCAGTTATGTTAG
TATTGTCATTTTATGATCAAGACGTTTTAACAGCCGAACATGTTATTTCA
TTCATGGCTATACTAGGTAAACATTGCTTTTTTTGCTGGCTCAATTTTGG
CAGTTATGTTAGTATTGTCATTTTATGATCAAGACGTTTTAACAGCCGAA
CATGTTATTTCATTCATGGCTATACTAGGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000023_pilon | genome | sc0000023_pilon:877933..883142 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1105-1215:112 |
| Aaloc | 967-1101:838 |
| Aaloc | 925-963:1079 |
| Aaloc | 826-924:1712 |
| Aaloc | 808-822:2065 |
| Aaloc | 691-804:2380 |
| Aaloc | 592-687:2778 |
| Aaloc | 487-588:3388 |
| Aaloc | 352-486:3919 |
| Aaloc | 232-348:4315 |
| Aaloc | 124-228:4579 |
| Aaloc | 1-120:5211 |
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