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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:142668..148240+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_010663 ID=XLOC_010663|Name=XLOC_010663|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5573bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:142668..148240+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGAAAATCAGAAGACAAAGGATTGTTGAATCGTGGCGGAGGAGAGAC
GATCAATTTGAGAGAAACAAGTCCTGAAGGAAGTTTGTGTAAAGATGGCG
GCGAAAGTTCGACCTCCTCACTCAATGATAATGCTCCTTGGTAAGATGAC
GTCAATTTAACAAAGTTTTCCTCCCCTTTGTGCTAGTAACGTGAAAAGCA
CTGGGttcgaatctcaatcaaatcCTCAGCAGTGGTCCCCTTTTAAATCT
AGTTTGTTGCGTTTTTTCGTGTTGGCAGCTTTTTTATGGCCCTTTTCTGG
ATGAGCTTGTGAAAAGGGTGCTTTCAAAACGTAGACTGCTTGCATCCTTT
TGGATTCGTGTGGTATGTAGAGGGATGCGATTCAAACtaatttaaattgt
tttaaatcataaatttcAGTGCTTcttggaaaaattttcgaatGCaaaaa
aaTATCTCCACAAAACTCCTTGCGTAACTTTTTGACTATAGGTACGCTGA
CAATATTGAAATATGAACTGAAACATGTGATCAAATTTAACCCCAATTTT
AAAATCCAATCTATATTTTCAGGTATATACGATTCTGGAGACGCGAGAAG
CTGATGATTTTCATCATCATTGGTGTTTGTTTGGGATTTCTCGTTGGTAT
CTCTTGTAATAAACCCATTCAAAACCTCGATCAACCAATCCGAAAAAATG
TTCTCCTCATCTTAGGATTCCCAGGTAAGCGAGACATACAGTATTAATGG
TTTAGTGGTATAGTAATCATTGTTGAAAATTATGTCCAATTTTTGAGTGC
ATCTTCTTTCTTTATTTGAAGGCAATGcacgtttttaataagaacaaact
atataagagtaTGAGgcatggccaaaatattaagaacatcttaatgCTTC
GAGgaatctaaaacacccaatttctaaggaaaatggacaaaaatattcaa
aaaatggcgaaaataagaacatgttaagaacattttttaaggcttaggac
taaaaaagttaaaaccatTTGAGTGCTTCAAAATATTTGGatgtacaaaa
aaaacaagatcAAAAAGGAATTATTCAGTATAGAAACTAAAACAAATACA
CAAAATGGAAGAATTATTTTCTGAAAGGTGAATCACGAAGAATAAACAGA
GAAGAGAAGAGAAGTAGAGGAACACAACACACCTCTATCGAGCCCTTCAC
CTAAGCAACTGACGTCAAACATGGAGAGAGTAAAATCACTGGGGAATAAA
ATGAATGACTCATTCAATCTAGAAACTTAATATCATCATCTAAGGGAGTT
TCTAAGGTCTCTTGATGTTTCATAgagaaaaaaagaggaaaaacggaaaa
aGTGTTTTCGATTTTTGTTTCCTTATCTCGTGGTTCAATCTAAATTATTT
ATTGAATGTCTATTTCGGTACTACTATAGACCCCATTCATGGAATTTAac
attgcataaattatgctaCTATTGTAGTATTTAACATAAATTATTCATGC
AAATCATGTGATTCTTTTGAGCTACAGATAGATGAATTCATTTAAATCCG
CCAGAATTATCGGAAATAAAActccaaaaaaatattaaatcatATATAAA
ATCGTCTAGACAACAAAATTAAAATGATCATacatctttttataagaaca
aattatataagaatataaggcttcgatggctaaaatataatgaacaagtt
aagaacatttttaagtctTCGCGAACTCTAAGACAGCtaatttctaagga
aaatggacaaaaatactaaaaaaatggcgaaaataagaacatgttaaaag
ctcaaaaagttttaagaacacccgaaggcttcaaaacttttggatgttct
tataaaaagacgtgtagTATACTTTGCTAACTACAACGATTTATATGTcc
taaaagaattgaaatctcaaatctactttgaaaataatgaaagttCAGCA
GTAGGGACAACTAAAACTAAATCTCAGAAATAAAGCAATAACTCAAGATT
CGAAACATCTCATGTAGGAAGAATCCTAAAAAACATCTACCACCAAAcac
ttgaaaaacaaaaatactctTTACGAAACTTACTGCACAATTTTGGACTG
ATAGTTTCCTCTGGTGAATTTCCATTGCATGTTCATGAATATTGGCTCTT
TCCAGGTCCCCTTGGTTTGTTACATACTTCAAAATCACTGAAATATACGA
AAAAGTGTTCGTTCTACTACAACCCCTACAATAATTTGAAAAGACTTTTG
AATTgtcaacaaaaaagtttttcatgttATGTTAAGTAAAGTAATTTTCG
CCATTATGGAATCAAACGCTCGATTTGCATAAGGGATCGCCTCAgcaaat
tcgaacgtttgcttccataatggcgaataatgcagaaaaaaatacatttt
agtgggaattaaatttggcggattttgggtacccaaatccgccaaatttt
ctttaggccaaatttcttcttttaatgtacacgttttttataagaacaaa
ctacataagaacataaggcttggatggccaaaatgttaagaacaagttaa
gaacattttatggctttgtggtctcaaaaacaccctttttcttaggaaaa
tggtcaaaaatactcacaaaatggtcaaaataagagcatgctaaaaacat
ttttaggcttaaaacccaaaaagtttttaagaacatccgaaggcttcaaa
aattatggatgttcttataaaaaaaactactttttttgtaatacttttAA
TCAGAAAACTTAGTATGATATTATATTGTACCTTATTGTCTTTTATTTCC
CAGGTGAACTTTTGATGCGaatgttgaaaatgttgatccTCCCTTTAATT
GTCTCCAGCTTGATTGTCGGATTGGCGGAGCTTGACCAAAGGGCGTCTGG
ACGTTTGGGAAAAAGAGCGGTTTTGTATTACATGGGAACGACAATGTGTG
CTGTCATCTTGGGTATCATTCTGGTAGTAGCTATATATCCTGGTGGAAAT
AAACAAGAGGTATGtatcttttccttttttaagaagaaatatttattttt
cagctgAAAATTGGCTAATataaaacctaagaacaaattcaGAACAATCC
TAAGCCCAAGAAGTTTTTAATTACGATAGCTCAGtgtattaagaacatcg
taagagcAGATAAGcctgagaatttaaaaaatattaagaagagccaagcc
tgagccaaaatttactggttctcataaaaaaagcgCGTAATGAACATTAT
CCCAATAACATTCTTTTCGGCTTAATAGGCTGAAGGTGAGAAAGAAGATA
AACGAGTTCGTCCGTTAGATTCGTTCCTCGATCTAATTCGCAACATGTTT
CCGGACAATCTTGTTAAAGCTTGTATAGCACAACTGGTGACAGGAGTCAA
GTTTGAGAAACATGATGAAAGGACGACTGTTTGGAGTAGTAATGAGACAT
TGGCTGACCAAATGAATTGGAATCATTGGGAAGTCAACCAAACAGCTTTA
CAAAATCAAACGAATTCAGAATGGAAATATTTGACTTACCAGAGTGTACT
GTGagtagattttcaaattcaaatccaTATGTTAAATCCTTCATTTATCC
AAATTTGAGTGACCtgaaaaatccaataaaaaataGCTTATGCAAGATCA
GTACCCAGCTTCAGTATGTGTATACtagtacaatcaaggtcataatattt
gagaaaaaagggaaattccccaggaagttttgaaaccacaatcgatttgt
aagtgctctaaagtaggttcgaagggtagattTATAACGCTAAACATGGA
ATCTGaggatttaaaagttcaaaaatagtccaataaggctcagaatatag
actggaagtctgccaaaccatcccaaattgaaatattcgattaaatagaT
TTGATAGctcaaaatcgattttttcgccggaactttaaatcttgaaaaac
gttaaaataaccggaattctcaatatatttcgaccatgattgtagattgg
CTTTGAGTTAATGAAATGAACAGAAAAGTCTTACCCTTTTCCCTCTTTGA
TTCTAACATAGAAATGGAACAAACGTAACAATGGTTAAAGAATGGCGTGA
AGTCAAGATGCCTGATAAACCATCAGACAAAGGAAGCACCAATGTTCTCG
GTCTCGTAGTTTTCTCCATCGTCGTTGGTCTAATGTTAGGGAAGATGGGA
AAGAAAGGACGCGTCTTCGTTGATTGGATGATTGTGTTAAATGATATTGT
TATGGAGTTGGTTGGTTGGGTCATGTGGTATTCACCTATTGGTATATGGA
GTTTGATTTCAGCTAAATTTGCATCCATGAATGATATTGAAGGAACATTT
GAGAAACTGGCTCTCTATATGGTGACTGTCATTGTTGGTTTGATTATCCA
TTCATTCTTGGTGTTGCCTGCTATATTCGCTGTTGTCACCAGAAAGAATC
CGTTCAGATTCGCTACTGGTCTGATCAAAGCATTACTAACGGCCTTCGGT
ACAAGCTCCAGTTCGGCAACTCTGCCAGTCACGTTTTCCTGCCTCGAAGA
TAATCTCCGCGTGGATAAGCGTGTCACACGGTTCGTGCTCCCTATCGGTG
CCACTATCAACATGGATGGAACCGCCTTGTATGAAGCGGTCGGAGCAATC
TTCATTGCTCAAAACTCAGGTCTTGATTTAGATTTTGGTCAATATGTTGC
CGTTAGTTTAACAGCAACTCTAGCCTCAATTGGAGCTGCCGGAATACCAC
AGGCTGGCTTGGTGACCATGTTGATTGTATTGCAGACGATTGGTCTCCCA
GAAGATGCAGTGACCCTCATCTTGGCAGTGGATTGGTTCTTGGATCGAGT
ACGAACGACTGTTAATGTTTTAGGTAaggaaagtttattttattgtttgg
cTATGATGATAAAAGAACTAAATTACTTTTTGGCCTGCTATATGCTGCTA
TTTTAGCTATAATACCAACCTAAATGTGACAAAAAATACAAGAGTAAATC
AATGACAATTTTCCAGGGAAGTGTTCCTTAACAAATGTTGCAAACAACTT
TTTCCTGTAAACTATAGAATTTAGTAAACTTAAAGTGTAAAAACAGCAAA
TAGATAAAACAGAAATGAAATTTCATGTGATGTTGAAATTCTCGTCATCT
TTTACGTGACTGCGTTAGTATAGGGCAACAAAAATGTTATGACTTTTATA
AAGGAAGCTAAAAATTTAACAATTTCCTAATTATGCTATTAATTATCAAA
TAAAACTAAAGGtttttttCATGTTatgttaagttacgtaactttcGCCA
TTCtgaaagcaaacgttcgatttgcgtaagggattGCTTCTACAGAAGTT
AACAAATCATGAATAAACCTTACCATATATTTATTCACCAGGTGATGCTT
ATGGAGCTGGTATCGTTCACCACTTGTCACAACGAGAACTCCAACAAATG
GATGAAGATCAAAAAGCTTTGGATGAAGTGCACCGTGTTGAAGaaggatt
tgaaaattttactggaAAACATGATGAAAATCCACCTAATATGAATATGT
ATAATGGCCTTACTGCTCTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:142668..148240+ >XLOC_010663 ID=XLOC_010663|Name=XLOC_010663|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3528bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:142668..148240+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGAAAATCAGAAGACAAAGGATTGTTGAATCGTGGCGGAGGAGAGAC
GATCAATTTGAGAGAAACAAGTCCTGAAGGAAGTTTGTGTAAAGATGGCG
GCGAAAGTTCGACCTCCTCACTCAATGATAATGCTCCTTGATGGGAAAAT
CAGAAGACAAAGGATTGTTGAATCGTGGCGGAGGAGAGACGATCAATTTG
AGAGAAACAAGTCCTGAAGGAAGTTTGTGTAAAGATGGCGGCGAAAGTTC
GACCTCCTCACTCAATGATAATGCTCCTTGGTATATACGATTCTGGAGAC
GCGAGAAGCTGATGATTTTCATCATCATTGGTGTTTGTTTGGGATTTCTC
GTTGGTATCTCTTGTAATAAACCCATTCAAAACCTCGATCAACCAATCCG
AAAAAATGTTCTCCTCATCTTAGGATTCCCAGGTATATACGATTCTGGAG
ACGCGAGAAGCTGATGATTTTCATCATCATTGGTGTTTGTTTGGGATTTC
TCGTTGGTATCTCTTGTAATAAACCCATTCAAAACCTCGATCAACCAATC
CGAAAAAATGTTCTCCTCATCTTAGGATTCCCAGGTGAACTTTTGATGCG
aatgttgaaaatgttgatccTCCCTTTAATTGTCTCCAGCTTGATTGTCG
GATTGGCGGAGCTTGACCAAAGGGCGTCTGGACGTTTGGGAAAAAGAGCG
GTTTTGTATTACATGGGAACGACAATGTGTGCTGTCATCTTGGGTATCAT
TCTGGTAGTAGCTATATATCCTGGTGGAAATAAACAAGAGGTGAACTTTT
GATGCGaatgttgaaaatgttgatccTCCCTTTAATTGTCTCCAGCTTGA
TTGTCGGATTGGCGGAGCTTGACCAAAGGGCGTCTGGACGTTTGGGAAAA
AGAGCGGTTTTGTATTACATGGGAACGACAATGTGTGCTGTCATCTTGGG
TATCATTCTGGTAGTAGCTATATATCCTGGTGGAAATAAACAAGAGGCTG
AAGGTGAGAAAGAAGATAAACGAGTTCGTCCGTTAGATTCGTTCCTCGAT
CTAATTCGCAACATGTTTCCGGACAATCTTGTTAAAGCTTGTATAGCACA
ACTGGTGACAGGAGTCAAGTTTGAGAAACATGATGAAAGGACGACTGTTT
GGAGTAGTAATGAGACATTGGCTGACCAAATGAATTGGAATCATTGGGAA
GTCAACCAAACAGCTTTACAAAATCAAACGAATTCAGAATGGAAATATTT
GACTTACCAGAGTGTACTGCTGAAGGTGAGAAAGAAGATAAACGAGTTCG
TCCGTTAGATTCGTTCCTCGATCTAATTCGCAACATGTTTCCGGACAATC
TTGTTAAAGCTTGTATAGCACAACTGGTGACAGGAGTCAAGTTTGAGAAA
CATGATGAAAGGACGACTGTTTGGAGTAGTAATGAGACATTGGCTGACCA
AATGAATTGGAATCATTGGGAAGTCAACCAAACAGCTTTACAAAATCAAA
CGAATTCAGAATGGAAATATTTGACTTACCAGAGTGTACTAAATGGAACA
AACGTAACAATGGTTAAAGAATGGCGTGAAGTCAAGATGCCTGATAAACC
ATCAGACAAAGGAAGCACCAATGTTCTCGGTCTCGTAGTTTTCTCCATCG
TCGTTGGTCTAATGTTAGGGAAGATGGGAAAGAAAGGACGCGTCTTCGTT
GATTGGATGATTGTGTTAAATGATATTGTTATGGAGTTGGTTGGTTGGGT
CATGTGGTATTCACCTATTGGTATATGGAGTTTGATTTCAGCTAAATTTG
CATCCATGAATGATATTGAAGGAACATTTGAGAAACTGGCTCTCTATATG
GTGACTGTCATTGTTGGTTTGATTATCCATTCATTCTTGGTGTTGCCTGC
TATATTCGCTGTTGTCACCAGAAAGAATCCGTTCAGATTCGCTACTGGTC
TGATCAAAGCATTACTAACGGCCTTCGGTACAAGCTCCAGTTCGGCAACT
CTGCCAGTCACGTTTTCCTGCCTCGAAGATAATCTCCGCGTGGATAAGCG
TGTCACACGGTTCGTGCTCCCTATCGGTGCCACTATCAACATGGATGGAA
CCGCCTTGTATGAAGCGGTCGGAGCAATCTTCATTGCTCAAAACTCAGGT
CTTGATTTAGATTTTGGTCAATATGTTGCCGTTAGTTTAACAGCAACTCT
AGCCTCAATTGGAGCTGCCGGAATACCACAGGCTGGCTTGGTGACCATGT
TGATTGTATTGCAGACGATTGGTCTCCCAGAAGATGCAGTGACCCTCATC
TTGGCAGTGGATTGGTTCTTGGATCGAGTACGAACGACTGTTAATGTTTT
AGAAATGGAACAAACGTAACAATGGTTAAAGAATGGCGTGAAGTCAAGAT
GCCTGATAAACCATCAGACAAAGGAAGCACCAATGTTCTCGGTCTCGTAG
TTTTCTCCATCGTCGTTGGTCTAATGTTAGGGAAGATGGGAAAGAAAGGA
CGCGTCTTCGTTGATTGGATGATTGTGTTAAATGATATTGTTATGGAGTT
GGTTGGTTGGGTCATGTGGTATTCACCTATTGGTATATGGAGTTTGATTT
CAGCTAAATTTGCATCCATGAATGATATTGAAGGAACATTTGAGAAACTG
GCTCTCTATATGGTGACTGTCATTGTTGGTTTGATTATCCATTCATTCTT
GGTGTTGCCTGCTATATTCGCTGTTGTCACCAGAAAGAATCCGTTCAGAT
TCGCTACTGGTCTGATCAAAGCATTACTAACGGCCTTCGGTACAAGCTCC
AGTTCGGCAACTCTGCCAGTCACGTTTTCCTGCCTCGAAGATAATCTCCG
CGTGGATAAGCGTGTCACACGGTTCGTGCTCCCTATCGGTGCCACTATCA
ACATGGATGGAACCGCCTTGTATGAAGCGGTCGGAGCAATCTTCATTGCT
CAAAACTCAGGTCTTGATTTAGATTTTGGTCAATATGTTGCCGTTAGTTT
AACAGCAACTCTAGCCTCAATTGGAGCTGCCGGAATACCACAGGCTGGCT
TGGTGACCATGTTGATTGTATTGCAGACGATTGGTCTCCCAGAAGATGCA
GTGACCCTCATCTTGGCAGTGGATTGGTTCTTGGATCGAGTACGAACGAC
TGTTAATGTTTTAGGTGATGCTTATGGAGCTGGTATCGTTCACCACTTGT
CACAACGAGAACTCCAACAAATGGATGAAGATCAAAAAGCTTTGGATGAA
GTGCACCGTGTTGAAGaaggatttgaaaattttactggaAAACATGATGA
AAATCCACCTAATATGAATATGTATAATGGCCTTACTGCTCTGTAAGTGA
TGCTTATGGAGCTGGTATCGTTCACCACTTGTCACAACGAGAACTCCAAC
AAATGGATGAAGATCAAAAAGCTTTGGATGAAGTGCACCGTGTTGAAGaa
ggatttgaaaattttactggaAAACATGATGAAAATCCACCTAATATGAA
TATGTATAATGGCCTTACTGCTCTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:142668..148240 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1585-1764:5394 |
| Aaloc | 772-1581:4063 |
| Aaloc | 499-768:3279 |
| Aaloc | 295-498:2806 |
| Aaloc | 142-291:574 |
| Aaloc | 1-138:1 |
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