|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000315_pilon:122792..133633+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_010185 ID=XLOC_010185|Name=XLOC_010185|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10842bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000315_pilon:122792..133633+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAAAGAAATACATTTCTGATATCAGGTACAAACTCTAAGAAGCCTC
TTCATTTGAAATTATTCGAGGCTGGATCCTTTGTACTCTAAAGTCTAGAA
TAAACGTAAGCCCATATAAGCCCCTTTTCCTTCTTAGGACCCCTGTTTAA
TTATTTGTGAGCCTGGTTTTGATATGGAATTACCATATTATGGGGTTTTT
AGTTGTACACCACCTCACGGCAATTAGCCacccccgtttattatattttg
aaaaaattctgcaCCTCCTCCCCTTTTACGAAGTGTTtgatttccttttt
catttgCGATTGTGTTAAAGGATTGTGTAATTTAAATGTGGAAGATAATT
AGATCGaaatttttccaatattttagtttACAGAAAAATGCACCACTATT
CAACCACATTTGTGCAGCATTTTCACTATGGCACAACTTGTATGAGGTAc
gctcaaaaaactttcaacgtttcattttcatttaacGCTCTTGCTTATTC
ATCACTCGTGATTTCTAGAGAAGTTCTCTTATGACTCCCATGATTCCCTA
TTTGTTCGATAGAGTCAGTATTTTACGTGGATATAGCTCTATCAATCTTG
AACTTTTAGActgtctttcgattgttttcaaggCCAGCAGGCTTGACTTT
CTATGAACTATTAACGGAACATTGGAAAGAGCGAGAATTCGTACCGCGAA
CCCCTTGTTTTCTTTGACGCCTGAGCCATTCAGCCATTGTTCCCTTCATG
TTCTTTATTCTGATCGAAACCCGTTGATTGAAGTTAcgcattttttatta
ttttaggaACTGAAGCTAAACACATTGAACACTAACTTGAAGGAATTTGC
AAAGTTTCTACATTATCTTTCTGAGTAAGTACCCACTCTCATATATTAAA
GCTAAATGGTGGTTTTCACGCAATTTTGTCGGAagtataaaaaaacatta
tttttagaattgatttttaaaaattaatcggaagtcgttgcattgaggTG
GTGTTTTGCCTGACTTTGCTTTGAAATTCCCAAAAGTTGCCCGACAAGAT
TGCCTTGTATAATACGTCCAGTGTGAGTTTGCTTTTGAAATATCTTGCTC
AATGATTTTATCCACCTTTTTGAGCGGTTAGCAGATAACGTCATGATGCA
GTGCTAtttttttACTgggttttccagaaaaaaagtatACCCCTTGTTGA
GGAGGTTCGTCCCTCTATAGCTGGCAATTTCatgtttaaacccctctgga
attctgaattttagtaggatttaaaatgctacccccatggaattccagtt
atttttgacagatttatgtgtctccctatggaattccgccacatatcaaa
ccttaccccccccTTGGAACTGAAATAGatctcctcaacagggggtaaac
agtttttttctggaaagccTATTGGATCTCTCTGTGATTATTTCAACACG
GCTACCGAAAACATTCGATTATCACGTTTCGTGAAAATTAACCGTGGTTT
CTGAACAAAATCACTTTACAAGCCCACAACTCAATTTGAGATTATTAAAG
TAAAGAAGCTTTCAACCTAATGACGTCAAGCGACTTGTGGTTTTTggttt
ttagaaacattttaatCACCGTTGTGTTTTCTTGGAAAGCCTGTGCAATA
ATCATCTTACTAtattaaaagaatttctttgTCTGTCACGCTTATAGCGC
AAACTGATAGCAAAGCTGTGGTTTGGAAAAGGTTAGGCAGGTTATGCACA
TAGTTTTGATACAATCTTATACAACCTTTTCATAGACCTGTTGGTATTCC
ctcctactggaaaaattggcccggtggaaaattatactcaaaTGTCCCCT
GCTGaaaataccgtattacttcgaataaacgacccgaatatttattaaat
ttttttgttttttaggaggggcgtttattctaGGGGAGattctttaatga
tttttccTCAAAGGAGGGATGTTTTCTCGAAGGGCATTTTAAAAGAAAGA
GGCGTTTATTAAAAGTAATACAGTAATCAAATTAACAAATCCTCAataca
aaatattatgctattttttctaTCCACACTGATTTTTCtcacttgaaaac
aatggaattaatATCCCCAGCAATAattttcagtccgttatttttactaT
TGACTGAAAAATCCCTAGCGGGTCTTTGAGAAAAAGATGTGTGAACTCTT
TACTCTTTATCCTTGATTTGAGTGGAAAAACAAACCTTACTTTCGGACAA
AAGCCCTTCCTTATTGATGTTAAAACTCTGTTTACACTAGAAGAAAATAG
CAGAAAACAGCATTTAAACGGTATTTTGACgacaaaaaaagtatttttgg
gcttatactctaggggctgagttaggtcccgtatgcgcatcggcgtatag
tcattttttcttttgatcatgaaagtatagtccttgaagagtcagaaaac
gtgtgtggcgttatttggatcaggctcaaatttccataatggcggatttt
agattttcaaccctttttagccctcttgcttgaaaaaatttttttctttg
actttaaacatagccatattatataccaatcgatcacaaattttatgctg
attgagaaaaaggtcagaatcatggtctgaaaatttcgttatctggagat
atgaagcactttcgatttcgattttttgaaatgactacttttggttccag
atttgcgtggctgtaacatttgattggcttacttaatttacttgaaattt
tcggagggtcttgcccaccgttcaaataataaaattcaggaaaagttttt
ttcctacatgaatttcaaaatccataatggcggattcaaaattttctttc
gtcacatggactcttaggctctgctaggctaagaaaaatatttttcgtaa
gtacttcgtatctcttgataacgaaattttcagaccatggttctgacctt
tttcttaatcagcataatatttctgatcgattggtatataatatgcaggg
ttttaagctcaaaaaatatttttcttaggctagcagagcctaagagccaa
tgtgacgaaagaaagttttgaatccgccattatggatttcgaaattcatg
tagaaaaataaatttttctgaattttattatttgaacggcaggcaagacc
ctccgaaaatttcaagtaaatcaagtaagccaatcaaatgttacagccac
gcaaatctggaaccaaaagtagtcatttcaaaaaatcaaaatcgaaagtg
cttcatatctcaagataacgaaattttcagacaatgattctgaccttttt
cttaatcagcataaaatttgtgatcgattggtatataatatgtctatgtt
taaagtcaaagaaaattttttttttaagcaagagggctaaaaagggttga
aaatctaaaatccgccattatggaaatttgtgcctgatccaaataacgcc
acacacgttttctgactcttcaaggactatactttcatgatcaaaagaaa
aaatgactatacgccgatgcgcatacgggacctaactcagcccctagagt
attaTGGGCGTGGCTTTTTTGGAAGAAAACAGCACAATGCTAGGCGTTTT
AGAATAACGGCGTAGCTCAATAGTATAGAATTCTAAAGCACATATCGTTT
AAGCGGAAACTCTGCCAATTTTAATTTCTCTTCAATGGCCTAACGATACA
CATTCAGTGGGTCTTAGAGAGATGACTATCCGTGCCCGTATGGTAAATTT
CCGGGGGAAGTTTGCAGGATGATGGGTACGTGTTTCAGGATTATCAAATT
CGGCCCATTGAAATGAAGAGACTTTTATGATATTTAGTGGTGTTGGaata
aattttgtgatttttgtgaCCTTTTGCCTTTAGAGgcattttgaaggaaa
agtGCTTTACATCTTATGTTTCTCCCTCTCCCAATTaatattttcctcaa
aaaaaccTTAGCAATTTATTTCAATAGTATAAGCATTACTTTACCGGACG
TTCGCGACGGCAGGAACCGGCTAGTTCATGCTAATGCAACTTCACgtgaa
aaattgacgtcacgaaataaatttttgataaaactgacgtcaaataatat
tTTACTATCCATtcgctttttaaacttttgtcaAGTGCGGCAGAAGTGAA
TTTGTGAATTTTATCTATATTTTCGTCGAAATATTGATTAACAATGAGAA
ATTTTGCAGATTATCGTATCAATTCCTCTGAGGAATATCGTTTGATGTAT
CTACATGAAgtagatcaaaacaaaaaatttaaattggtcAATGAAGACCA
ACAAACAACCATTGAAGATTTGCGCAAACAACTTGCCGAAATGACACAGA
AGTTTGCAGAAAGTCACAACCACACAGAAGTTTTGgaggaaaaacttcaa
aaacaaGCTCAAAAAGCGAGTAACTTGGAACAGAAGCAGGAAGAAAGTAA
ACGAAAGATTGTCGAAGTGACACAAGAATGTCAAAAACAAGAAGAACGCG
TCAACAATGTGAAGGCATTGAGCGCCGAAATGTTGAACGAATTAGACAAA
GCTGATCAGAAGATTCAATTGTTGGAATCTCGTGTTGACCAACAAGCTGA
CTTCATTAAGCAAAAGTCATTCATCAACAAGGAGCTCTCACAACAGGTCC
AAAGCCTCAAGAAAACTCAAATAGCCGCTGAAATAAAATCAGCCAAAACC
ACCAAGTTGATCCAAGGATTAAAGGTGACCGTGTTCCAACAACAAAACAC
AATCAAAATGTACGACGACTTCAAATCTCGATTCCAAGAACGCGAGAGTA
AAATTCTCCTCAAGCTCGAAGCATTGGAGATGCACCAACacggaaaattt
caaactcgtGTTTTCTCCAGCTTTCATCGCCCCAGCCAAAGCCAGGAGTT
AGTGAAAAGCATCAGGGCTTTGTTCGAGAGCAACATAATCTCCGGCATTG
AAGCACACCTTGAAGCTGAATCGAACGAACGCTTGATTTGAGTTTGCGGA
AAAATTGATGTCAGGTCAGGATGAACACCATCTAGATCCCTGCTATCGGT
CAAGCTGAAACCCGGTACAACCTGTGAAGTAAAAGATGGAAACAACACCT
AGCCCGTCTTCAAGATCATTGAAGCTCTGAGAACATCAAAAGAGCGGAcg
gaaaaaaacatctatcccGTCGTCAATAGCTTTTGTAAAATCTTTTAGTT
TTCCAtccaaagaaagaaaattacaaaaataaattaaatcttTTCTTGTT
TTCTACTGTTTTTTAGTCTACAGAATAAACAGCTCCAGGTTTTTAGGCCT
AGTAGGAGTTGTaagctcgaaacgaaggaagatataaCGTAATCTACTGT
TTTCCTGAGGGGCTGAGACCCTTGAGAATATTATGGGTTTATTATGGGTT
GATTATTTTGTTTCTAGCACAGTAATTATAGTAACTTTGCTGAGAGTCAA
ACTCCAAACAGGGCTTTTTACCACAATTTCCAGTGATTTCATCAGGAGGG
GCATCATCCGATGATCGGATAAAGAAATATCtggaaattcgaattataga
gagtatttcGAATAAAAGGAGCTATAATACTAGAATGAGAGACCTATATC
TATAGTTACTTTCGTCGTTTAATATGTTTTCCAATTTTGCCTAGAAATTG
TGTTTTGAAGGTTCTCTTGCAAAATAGCGAGGAGTGCCCAAGACCCCCTG
TAGTGTGGGCCCTAGTTAAAGTGTGGGCCCTAGTTAAAACACAACCTTTG
AGAAAGTCGagcatttgaaatttcaattgaCTCGAGAGTCCCTTGCAGAA
TATCAATTCAGTATTTCTCATTGAATTTTTATCGCTATTTGAATTGCAGA
CCTGCTTGTTTATACGTATCTTGGTATTAAACGAATTATTCCCAAGAGCA
GAAAATAAACTTCCCTACAAGAGACTTCTTTCTCGATAGGCTATTTTGTT
TCCTGTATAAAGGACTGATGCAGTACTTGTGTTGTTGCTTGTACTTTTAG
GCCCGGCGAACGGCGAATAACGCGAAAAATTACAGTTCGCTGGTATAGAA
ATTCGGTTCGCCGCCTCAAGCACATATtcacgctaatcaatacactatAG
GCCTACGAAGAATTCGCCGTTCTAATATCTAAATTCACCGGGGTTAATTC
TCCGTTTGCCAACCTatcaaaaataaagcaaaacccCTGAATAACCTaaa
aaaaCAgcgaatttattattttttgctgtTGTTTTTTGGCAAAGGTTTAG
ATGGTTAGGAAGTCTGTAGACTAACAAATTGAATTAATTTGTTTTTGGGA
CTTTTGTAATTTCATTTGCTTGGTGTTGTCTGAGAGGGAGTCTGCAtgtg
caaaattttaatttagaaggagcatatttattttttttgagaaacaatga
ttttttttcattagacGTTGTTAAAGTTGGGTCAAAGTTTTTCgagaaat
gaaattgtttgtGTTTTccccagatgagatggagttttatAAGTTAATTT
AATatttggtcatttgaagtaataaaaatgacgcgttctttagaaaaagt
agtaaaattCTTTCagtactggttaacgaccaaccaaatcaaataagagc
ttgtaaaaactccatctcgtcccgttTTCTCATTTTCTCCCAAAGGATTA
ATTTAAAAGAGTAACTTTCTCATCTAAGGCGAGTAAGATATAATATGTTG
GTCTACGGGTAAGATCGTCATGAAAATCTCGGTCATTGTGATTGaaaaaa
gtgtgtttttaaattttcactaTATCATTTCGGCCTTTCAAGGGGaaaga
attcttaaaaatattttttgcgacagGAAACTCCATCATAATAGCATGTA
AGGGTCATTCGGGCATGTTGTTCAACAATTGCTTAGTTTTCTTTGAAGAA
AGGGGTTAATAAAATCTTACAGTTCTTGTCTTGTCTTCCATGACAGAATT
ATTGGAGAAAAAATATCATCTTCGAAATGAAGTGTATCTTGCATCAAACT
CATTCACTCAGTACCATCATTCAACAGCAAAGACAACAAGATGACCAAGA
AGGAATTGATTGGAGAACGCTCTACATCCGCCTCATCGTTTGCGCTTTTA
TTCTCTTATTCTCAACTCTTGAGAACATCGCTTTGATTGTTGGattaaga
aaaacaaacaagaaattGACAATCTCTCAAAaactttacatttttctttc
cgTAACTGATGCTGTAACGGGATTTTTTACACCTTATTTTGTTATCCTTG
ACTTAACATCAGCCAGGAACTGTACGACAGCGAGTTTCGGTATGGCTTTC
ATAATATATACATTTGGTTTAGGTCTTGGAAcctttgttcttatttcttt
CCTACGGAATCTCGCCATACGAAAACCATTCTATTCGGTATCTAACAAAA
CTATCTGTATGATCTTGGTTGCATGGAATTTACTCATGATTCTGATAACT
TTATTCGCtttttttACCTATGTACCAACCTTCACTTCTCGGACACTATA
CATAATTAATTGGCTTTTTACCGGATTCTTAATGATATTGGTGGTGACCT
TAGTAACGCTTCTCAATGTTTGGTCTAGAAGAATCTAAATCGATCAATCC
AGAAATTTTACAATTGAAAATGAGATCGAAATCCGGAGATGTAAACGTAA
CAAAAAAGCCGTCTCTATCGTGAATGCTATTACTTTGATATACTCAGTGT
GTATATTACCCTTGGCCTTTTACTATGTTGTACTTGGAGTTTCGCTAAGC
GTGAATTCTGACTCGCTCTCTAGCTCTTCGTTTAGTATAACTATTGTTAT
GCATATGCTAGTCTTTCCTTGTTCTGGTACAAATGCTTTGGTCTACATGC
TAATGGACAAAAAGATCAGGACATTTTATAAACGTTTTCTTTGTTGTGGT
TGTTTATGTGGCAAAACGAAATCAAGAAACGTGTGATGAGTACAGTTGAC
TTTCTGTTACGATGTTCAAGGGAAATTGGATTTTAATCGAATAAAAGAAC
GTATCGAaaagtagagcgtcgtttatgagaggtTTTCCGTTCACGGTAAC
tatcaatattatcgaataatggaatgCGTATCGAATAGAGTAAAGCGTTG
AATCATAGCTTGACAGCTGTATACCTTTTTGATTGCGCCAATTGTCCGCT
GAGTATCTATTTTTCGTATTCCGGTACCAAGGGTTGTTATGATTTCATCT
CTCACAGACGaagtttttgcaaaaaaaacaattgagTGACACTATTTGTA
AGAGATGGCAGTGtttttttGGTATACACCGAAATCGATTGTGTTTTATT
GAAACAGTTGAAATAATAGTTGATTGGCTGACTACAGATTTTCATCATTG
GGATGTTGCTCTTTTCATCCATAATTCAACCTTGTTGACTTTATTAAATC
GTTttgtttgaatttaaatttcatCTTAAAATTTACGGATAACAAACATT
CAAGAATATTTCTGGCAGTTAAAAATTCTAACTAAAACAAATACTATCAC
TTTTAAATGcaatttaccgtcgtcctcggtCAATCAGAATGTACACAAAT
TAGACGCCTACCGTATCCGTCGTTGAAAAAACgcagatacataaactcgc
tattatgcAGACACAGCTATCAAGcccttttaatttttcatttataaccC
TTATAATACAGTGATATGgctgttatatgataatacgataattgttgcGC
GATAATAGCAGTTTGTATAAAATACAGTTTACAATTTTTCCTTTCCATTA
TTTTTGTCGTATCAAGTTAGTCGTTTagcataggcggttttagaccctgT
CGATGAAGAGATGAAGATACTTGGTgtcccaaaaaaaACtttacatgTCT
TTAAATGCTAATATTTTTGGCGTATTTTTTTTAAAACACTTCGAAATTTT
AAGGGTTTCTCAAGAATTCATATTTGTAATTGTTACTTCATTGTTTTTTA
ACCCTTTCAGTGCTGCTGTCGATCTCGACCTATTTGCCAGGGGTTTTATT
GAGTTTATTGAAAGTTTGATTTTGAACTAGATTTCAATAAATAGCGCAGT
TGAATAATTAAAATATATATTTCATAGATGTTTTTCATAATTATACATAT
TTCAACTGAAAAGTAAACACATATCActtatatttctgatatttttcaga
aaataaagctaaatgTGATGGTCAGCTCTGTGGTCGCTattgtcggcata
tgccgacatttggcaaataggtcgaaccttctttttttccgtggcaaata
ggtcgacccttaaaaaatacgaatggcagttaagggctctgaccatagtc
agaaaattgattttagtatctatgaacataaaagttatgttttagattct
ttaacacttttaacaaagaataattgcctttataaattgctttttaatca
aaccccttaagagtaattaagaacttaattgcaaaaatgacgttatgaac
gttaaaaagacgttaataatatgttgcatcaccttcttttataaaaagtg
ctaagtttgaatgggtaattaacctttttgtttcgaacttttttcaaact
ggcCGCAAAGAAtcgaactattttaaattttgcggaaaatttttctaaaa
agatgtatcaaaagttatggatgtttttttaagcaaaatccagatgaaaa
attgatgaaaaaccactattttgaagatttcgagacaaagaagcatttac
aaaaattttccgcaaaaatttttattgttcggtaaaagatacaccatcta
ctgcgaaaaatttttcaaaatgttttttcttcgccgaaactaagctcttc
aaagttgaaatactctctCTTccttgcaaaagtcttcattttcttcttca
tcaaattttttcaatgcaatttttgaattttcagattcaggaatagtttg
tctaacagaaaatgtataacatgccatagttttgctggttacatcagtca
gaaaacacattttaaacacggtaattatgaaaaattcactatggtcagag
cccttaaagggTTAACGAGAGTTGCACTATGCACACTGCACTTTGCATGT
TTCCGACTTAGTtatgctctattgtcttaaatccaccATTGGTCTATATG
GACTatgggtcacccggtagttaCATTACCTTGCCTAAAGGTAGTCCACC
CAACCAActgttcttttttcatttcttttcttttgcgcagggttttttcC
TTATCATCACACGTGAAGATTTACGAAACAGATTTCCCTTGCATCAAGTC
CAAAGCTGATACAGTTTACAATTTAAAAGAAGGTAAACTTTGtagttttt
tctataagaacaaactataaaagaacataaggcttcaatgatcaaaatga
taaaaacaagttaagagaCTTTATTAAAGGCTTTGCTTACTTTAAATCAC
CTATTGTCTtaggaaattggacaaaaatactcaaaagattctggaaataa
caaacaaacattctaaaaataacaaagaacatttttagtttagaacatcc
gaaggcttcgaaaatctcttattaaaaaaaacgtgtcgGCTTGAATTGTC
CTCACAGTGAGAAATGTACTGGATTGTCATCTCGTTTTTGAACAAAAACT
GACTCGTCCATTCCTTTGGGAATAATTAAAATGTCGTTGCTGAATTTTTC
ATCATCCCCTTATCTTATTTTTTAAAATGGTTAAAGTAGATGAAATGGCA
GAATTTTACTCTCGTTTTCTTTTCTCGTGTTTTAGAATTCAGTAGTATAT
CAGAGAAGTGTCAGCAGATTAAAGGTTTCAGTCTTATCAACCACGCCTTG
GATATTTTCAATAATAATAACATGGACGAACCACCACCCAAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000315_pilon:122792..133633+ >XLOC_010185 ID=XLOC_010185|Name=XLOC_010185|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=732bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000315_pilon:122792..133633+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAAAGAAATACATTTCTGATATCAGATGGAAAAGAAATACATTTCT GATATCAGtttACAGAAAAATGCACCACTATTCAACCACATTTGTGCAGC ATTTTCACTATGGCACAACTTGTATGAGtttACAGAAAAATGCACCACTA TTCAACCACATTTGTGCAGCATTTTCACTATGGCACAACTTGTATGAGga ACTGAAGCTAAACACATTGAACACTAACTTGAAGGAATTTGCAAAGTTTC TACATTATCTTTCTGAgaACTGAAGCTAAACACATTGAACACTAACTTGA AGGAATTTGCAAAGTTTCTACATTATCTTTCTGAggttttttcCTTATCA TCACACGTGAAGATTTACGAAACAGATTTCCCTTGCATCAAGTCCAAAGC TGATACAGTTTACAATTTAAAAGAAGggttttttcCTTATCATCACACGT GAAGATTTACGAAACAGATTTCCCTTGCATCAAGTCCAAAGCTGATACAG TTTACAATTTAAAAGAAGAATTCAGTAGTATATCAGAGAAGTGTCAGCAG ATTAAAGGTTTCAGTCTTATCAACCACGCCTTGGATATTTTCAATAATAA TAACATGGACGAACCACCACCCAAGAATTCAGTAGTATATCAGAGAAGTG TCAGCAGATTAAAGGTTTCAGTCTTATCAACCACGCCTTGGATATTTTCA ATAATAATAACATGGACGAACCACCACCCAAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000315_pilon | genome | sc0000315_pilon:122792..133633 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 262-366:10738 |
| Aaloc | 169-258:10192 |
| Aaloc | 100-165:807 |
| Aaloc | 31-99:378 |
| Aaloc | 1-27:1 |
|