XLOC_010185 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_010185
Unique NameXLOC_010185
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000315_pilon:122792..133633+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_010185 ID=XLOC_010185|Name=XLOC_010185|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10842bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000315_pilon:122792..133633+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAAGAAATACATTTCTGATATCAGGTACAAACTCTAAGAAGCCTC TTCATTTGAAATTATTCGAGGCTGGATCCTTTGTACTCTAAAGTCTAGAA TAAACGTAAGCCCATATAAGCCCCTTTTCCTTCTTAGGACCCCTGTTTAA TTATTTGTGAGCCTGGTTTTGATATGGAATTACCATATTATGGGGTTTTT AGTTGTACACCACCTCACGGCAATTAGCCacccccgtttattatattttg aaaaaattctgcaCCTCCTCCCCTTTTACGAAGTGTTtgatttccttttt catttgCGATTGTGTTAAAGGATTGTGTAATTTAAATGTGGAAGATAATT AGATCGaaatttttccaatattttagtttACAGAAAAATGCACCACTATT CAACCACATTTGTGCAGCATTTTCACTATGGCACAACTTGTATGAGGTAc gctcaaaaaactttcaacgtttcattttcatttaacGCTCTTGCTTATTC ATCACTCGTGATTTCTAGAGAAGTTCTCTTATGACTCCCATGATTCCCTA TTTGTTCGATAGAGTCAGTATTTTACGTGGATATAGCTCTATCAATCTTG AACTTTTAGActgtctttcgattgttttcaaggCCAGCAGGCTTGACTTT CTATGAACTATTAACGGAACATTGGAAAGAGCGAGAATTCGTACCGCGAA CCCCTTGTTTTCTTTGACGCCTGAGCCATTCAGCCATTGTTCCCTTCATG TTCTTTATTCTGATCGAAACCCGTTGATTGAAGTTAcgcattttttatta ttttaggaACTGAAGCTAAACACATTGAACACTAACTTGAAGGAATTTGC AAAGTTTCTACATTATCTTTCTGAGTAAGTACCCACTCTCATATATTAAA GCTAAATGGTGGTTTTCACGCAATTTTGTCGGAagtataaaaaaacatta tttttagaattgatttttaaaaattaatcggaagtcgttgcattgaggTG GTGTTTTGCCTGACTTTGCTTTGAAATTCCCAAAAGTTGCCCGACAAGAT TGCCTTGTATAATACGTCCAGTGTGAGTTTGCTTTTGAAATATCTTGCTC AATGATTTTATCCACCTTTTTGAGCGGTTAGCAGATAACGTCATGATGCA GTGCTAtttttttACTgggttttccagaaaaaaagtatACCCCTTGTTGA GGAGGTTCGTCCCTCTATAGCTGGCAATTTCatgtttaaacccctctgga attctgaattttagtaggatttaaaatgctacccccatggaattccagtt atttttgacagatttatgtgtctccctatggaattccgccacatatcaaa ccttaccccccccTTGGAACTGAAATAGatctcctcaacagggggtaaac agtttttttctggaaagccTATTGGATCTCTCTGTGATTATTTCAACACG GCTACCGAAAACATTCGATTATCACGTTTCGTGAAAATTAACCGTGGTTT CTGAACAAAATCACTTTACAAGCCCACAACTCAATTTGAGATTATTAAAG TAAAGAAGCTTTCAACCTAATGACGTCAAGCGACTTGTGGTTTTTggttt ttagaaacattttaatCACCGTTGTGTTTTCTTGGAAAGCCTGTGCAATA ATCATCTTACTAtattaaaagaatttctttgTCTGTCACGCTTATAGCGC AAACTGATAGCAAAGCTGTGGTTTGGAAAAGGTTAGGCAGGTTATGCACA TAGTTTTGATACAATCTTATACAACCTTTTCATAGACCTGTTGGTATTCC ctcctactggaaaaattggcccggtggaaaattatactcaaaTGTCCCCT GCTGaaaataccgtattacttcgaataaacgacccgaatatttattaaat ttttttgttttttaggaggggcgtttattctaGGGGAGattctttaatga tttttccTCAAAGGAGGGATGTTTTCTCGAAGGGCATTTTAAAAGAAAGA GGCGTTTATTAAAAGTAATACAGTAATCAAATTAACAAATCCTCAataca aaatattatgctattttttctaTCCACACTGATTTTTCtcacttgaaaac aatggaattaatATCCCCAGCAATAattttcagtccgttatttttactaT TGACTGAAAAATCCCTAGCGGGTCTTTGAGAAAAAGATGTGTGAACTCTT TACTCTTTATCCTTGATTTGAGTGGAAAAACAAACCTTACTTTCGGACAA AAGCCCTTCCTTATTGATGTTAAAACTCTGTTTACACTAGAAGAAAATAG CAGAAAACAGCATTTAAACGGTATTTTGACgacaaaaaaagtatttttgg gcttatactctaggggctgagttaggtcccgtatgcgcatcggcgtatag tcattttttcttttgatcatgaaagtatagtccttgaagagtcagaaaac gtgtgtggcgttatttggatcaggctcaaatttccataatggcggatttt agattttcaaccctttttagccctcttgcttgaaaaaatttttttctttg actttaaacatagccatattatataccaatcgatcacaaattttatgctg attgagaaaaaggtcagaatcatggtctgaaaatttcgttatctggagat atgaagcactttcgatttcgattttttgaaatgactacttttggttccag atttgcgtggctgtaacatttgattggcttacttaatttacttgaaattt tcggagggtcttgcccaccgttcaaataataaaattcaggaaaagttttt ttcctacatgaatttcaaaatccataatggcggattcaaaattttctttc gtcacatggactcttaggctctgctaggctaagaaaaatatttttcgtaa gtacttcgtatctcttgataacgaaattttcagaccatggttctgacctt tttcttaatcagcataatatttctgatcgattggtatataatatgcaggg ttttaagctcaaaaaatatttttcttaggctagcagagcctaagagccaa tgtgacgaaagaaagttttgaatccgccattatggatttcgaaattcatg tagaaaaataaatttttctgaattttattatttgaacggcaggcaagacc ctccgaaaatttcaagtaaatcaagtaagccaatcaaatgttacagccac gcaaatctggaaccaaaagtagtcatttcaaaaaatcaaaatcgaaagtg cttcatatctcaagataacgaaattttcagacaatgattctgaccttttt cttaatcagcataaaatttgtgatcgattggtatataatatgtctatgtt taaagtcaaagaaaattttttttttaagcaagagggctaaaaagggttga aaatctaaaatccgccattatggaaatttgtgcctgatccaaataacgcc acacacgttttctgactcttcaaggactatactttcatgatcaaaagaaa aaatgactatacgccgatgcgcatacgggacctaactcagcccctagagt attaTGGGCGTGGCTTTTTTGGAAGAAAACAGCACAATGCTAGGCGTTTT AGAATAACGGCGTAGCTCAATAGTATAGAATTCTAAAGCACATATCGTTT AAGCGGAAACTCTGCCAATTTTAATTTCTCTTCAATGGCCTAACGATACA CATTCAGTGGGTCTTAGAGAGATGACTATCCGTGCCCGTATGGTAAATTT CCGGGGGAAGTTTGCAGGATGATGGGTACGTGTTTCAGGATTATCAAATT CGGCCCATTGAAATGAAGAGACTTTTATGATATTTAGTGGTGTTGGaata aattttgtgatttttgtgaCCTTTTGCCTTTAGAGgcattttgaaggaaa agtGCTTTACATCTTATGTTTCTCCCTCTCCCAATTaatattttcctcaa aaaaaccTTAGCAATTTATTTCAATAGTATAAGCATTACTTTACCGGACG TTCGCGACGGCAGGAACCGGCTAGTTCATGCTAATGCAACTTCACgtgaa aaattgacgtcacgaaataaatttttgataaaactgacgtcaaataatat tTTACTATCCATtcgctttttaaacttttgtcaAGTGCGGCAGAAGTGAA TTTGTGAATTTTATCTATATTTTCGTCGAAATATTGATTAACAATGAGAA ATTTTGCAGATTATCGTATCAATTCCTCTGAGGAATATCGTTTGATGTAT CTACATGAAgtagatcaaaacaaaaaatttaaattggtcAATGAAGACCA ACAAACAACCATTGAAGATTTGCGCAAACAACTTGCCGAAATGACACAGA AGTTTGCAGAAAGTCACAACCACACAGAAGTTTTGgaggaaaaacttcaa aaacaaGCTCAAAAAGCGAGTAACTTGGAACAGAAGCAGGAAGAAAGTAA ACGAAAGATTGTCGAAGTGACACAAGAATGTCAAAAACAAGAAGAACGCG TCAACAATGTGAAGGCATTGAGCGCCGAAATGTTGAACGAATTAGACAAA GCTGATCAGAAGATTCAATTGTTGGAATCTCGTGTTGACCAACAAGCTGA CTTCATTAAGCAAAAGTCATTCATCAACAAGGAGCTCTCACAACAGGTCC AAAGCCTCAAGAAAACTCAAATAGCCGCTGAAATAAAATCAGCCAAAACC ACCAAGTTGATCCAAGGATTAAAGGTGACCGTGTTCCAACAACAAAACAC AATCAAAATGTACGACGACTTCAAATCTCGATTCCAAGAACGCGAGAGTA AAATTCTCCTCAAGCTCGAAGCATTGGAGATGCACCAACacggaaaattt caaactcgtGTTTTCTCCAGCTTTCATCGCCCCAGCCAAAGCCAGGAGTT AGTGAAAAGCATCAGGGCTTTGTTCGAGAGCAACATAATCTCCGGCATTG AAGCACACCTTGAAGCTGAATCGAACGAACGCTTGATTTGAGTTTGCGGA AAAATTGATGTCAGGTCAGGATGAACACCATCTAGATCCCTGCTATCGGT CAAGCTGAAACCCGGTACAACCTGTGAAGTAAAAGATGGAAACAACACCT AGCCCGTCTTCAAGATCATTGAAGCTCTGAGAACATCAAAAGAGCGGAcg gaaaaaaacatctatcccGTCGTCAATAGCTTTTGTAAAATCTTTTAGTT TTCCAtccaaagaaagaaaattacaaaaataaattaaatcttTTCTTGTT TTCTACTGTTTTTTAGTCTACAGAATAAACAGCTCCAGGTTTTTAGGCCT AGTAGGAGTTGTaagctcgaaacgaaggaagatataaCGTAATCTACTGT TTTCCTGAGGGGCTGAGACCCTTGAGAATATTATGGGTTTATTATGGGTT GATTATTTTGTTTCTAGCACAGTAATTATAGTAACTTTGCTGAGAGTCAA ACTCCAAACAGGGCTTTTTACCACAATTTCCAGTGATTTCATCAGGAGGG GCATCATCCGATGATCGGATAAAGAAATATCtggaaattcgaattataga gagtatttcGAATAAAAGGAGCTATAATACTAGAATGAGAGACCTATATC TATAGTTACTTTCGTCGTTTAATATGTTTTCCAATTTTGCCTAGAAATTG TGTTTTGAAGGTTCTCTTGCAAAATAGCGAGGAGTGCCCAAGACCCCCTG TAGTGTGGGCCCTAGTTAAAGTGTGGGCCCTAGTTAAAACACAACCTTTG AGAAAGTCGagcatttgaaatttcaattgaCTCGAGAGTCCCTTGCAGAA TATCAATTCAGTATTTCTCATTGAATTTTTATCGCTATTTGAATTGCAGA CCTGCTTGTTTATACGTATCTTGGTATTAAACGAATTATTCCCAAGAGCA GAAAATAAACTTCCCTACAAGAGACTTCTTTCTCGATAGGCTATTTTGTT TCCTGTATAAAGGACTGATGCAGTACTTGTGTTGTTGCTTGTACTTTTAG GCCCGGCGAACGGCGAATAACGCGAAAAATTACAGTTCGCTGGTATAGAA ATTCGGTTCGCCGCCTCAAGCACATATtcacgctaatcaatacactatAG GCCTACGAAGAATTCGCCGTTCTAATATCTAAATTCACCGGGGTTAATTC TCCGTTTGCCAACCTatcaaaaataaagcaaaacccCTGAATAACCTaaa aaaaCAgcgaatttattattttttgctgtTGTTTTTTGGCAAAGGTTTAG ATGGTTAGGAAGTCTGTAGACTAACAAATTGAATTAATTTGTTTTTGGGA CTTTTGTAATTTCATTTGCTTGGTGTTGTCTGAGAGGGAGTCTGCAtgtg caaaattttaatttagaaggagcatatttattttttttgagaaacaatga ttttttttcattagacGTTGTTAAAGTTGGGTCAAAGTTTTTCgagaaat gaaattgtttgtGTTTTccccagatgagatggagttttatAAGTTAATTT AATatttggtcatttgaagtaataaaaatgacgcgttctttagaaaaagt agtaaaattCTTTCagtactggttaacgaccaaccaaatcaaataagagc ttgtaaaaactccatctcgtcccgttTTCTCATTTTCTCCCAAAGGATTA ATTTAAAAGAGTAACTTTCTCATCTAAGGCGAGTAAGATATAATATGTTG GTCTACGGGTAAGATCGTCATGAAAATCTCGGTCATTGTGATTGaaaaaa gtgtgtttttaaattttcactaTATCATTTCGGCCTTTCAAGGGGaaaga attcttaaaaatattttttgcgacagGAAACTCCATCATAATAGCATGTA AGGGTCATTCGGGCATGTTGTTCAACAATTGCTTAGTTTTCTTTGAAGAA AGGGGTTAATAAAATCTTACAGTTCTTGTCTTGTCTTCCATGACAGAATT ATTGGAGAAAAAATATCATCTTCGAAATGAAGTGTATCTTGCATCAAACT CATTCACTCAGTACCATCATTCAACAGCAAAGACAACAAGATGACCAAGA AGGAATTGATTGGAGAACGCTCTACATCCGCCTCATCGTTTGCGCTTTTA TTCTCTTATTCTCAACTCTTGAGAACATCGCTTTGATTGTTGGattaaga aaaacaaacaagaaattGACAATCTCTCAAAaactttacatttttctttc cgTAACTGATGCTGTAACGGGATTTTTTACACCTTATTTTGTTATCCTTG ACTTAACATCAGCCAGGAACTGTACGACAGCGAGTTTCGGTATGGCTTTC ATAATATATACATTTGGTTTAGGTCTTGGAAcctttgttcttatttcttt CCTACGGAATCTCGCCATACGAAAACCATTCTATTCGGTATCTAACAAAA CTATCTGTATGATCTTGGTTGCATGGAATTTACTCATGATTCTGATAACT TTATTCGCtttttttACCTATGTACCAACCTTCACTTCTCGGACACTATA CATAATTAATTGGCTTTTTACCGGATTCTTAATGATATTGGTGGTGACCT TAGTAACGCTTCTCAATGTTTGGTCTAGAAGAATCTAAATCGATCAATCC AGAAATTTTACAATTGAAAATGAGATCGAAATCCGGAGATGTAAACGTAA CAAAAAAGCCGTCTCTATCGTGAATGCTATTACTTTGATATACTCAGTGT GTATATTACCCTTGGCCTTTTACTATGTTGTACTTGGAGTTTCGCTAAGC GTGAATTCTGACTCGCTCTCTAGCTCTTCGTTTAGTATAACTATTGTTAT GCATATGCTAGTCTTTCCTTGTTCTGGTACAAATGCTTTGGTCTACATGC TAATGGACAAAAAGATCAGGACATTTTATAAACGTTTTCTTTGTTGTGGT TGTTTATGTGGCAAAACGAAATCAAGAAACGTGTGATGAGTACAGTTGAC TTTCTGTTACGATGTTCAAGGGAAATTGGATTTTAATCGAATAAAAGAAC GTATCGAaaagtagagcgtcgtttatgagaggtTTTCCGTTCACGGTAAC tatcaatattatcgaataatggaatgCGTATCGAATAGAGTAAAGCGTTG AATCATAGCTTGACAGCTGTATACCTTTTTGATTGCGCCAATTGTCCGCT GAGTATCTATTTTTCGTATTCCGGTACCAAGGGTTGTTATGATTTCATCT CTCACAGACGaagtttttgcaaaaaaaacaattgagTGACACTATTTGTA AGAGATGGCAGTGtttttttGGTATACACCGAAATCGATTGTGTTTTATT GAAACAGTTGAAATAATAGTTGATTGGCTGACTACAGATTTTCATCATTG GGATGTTGCTCTTTTCATCCATAATTCAACCTTGTTGACTTTATTAAATC GTTttgtttgaatttaaatttcatCTTAAAATTTACGGATAACAAACATT CAAGAATATTTCTGGCAGTTAAAAATTCTAACTAAAACAAATACTATCAC TTTTAAATGcaatttaccgtcgtcctcggtCAATCAGAATGTACACAAAT TAGACGCCTACCGTATCCGTCGTTGAAAAAACgcagatacataaactcgc tattatgcAGACACAGCTATCAAGcccttttaatttttcatttataaccC TTATAATACAGTGATATGgctgttatatgataatacgataattgttgcGC GATAATAGCAGTTTGTATAAAATACAGTTTACAATTTTTCCTTTCCATTA TTTTTGTCGTATCAAGTTAGTCGTTTagcataggcggttttagaccctgT CGATGAAGAGATGAAGATACTTGGTgtcccaaaaaaaACtttacatgTCT TTAAATGCTAATATTTTTGGCGTATTTTTTTTAAAACACTTCGAAATTTT AAGGGTTTCTCAAGAATTCATATTTGTAATTGTTACTTCATTGTTTTTTA ACCCTTTCAGTGCTGCTGTCGATCTCGACCTATTTGCCAGGGGTTTTATT GAGTTTATTGAAAGTTTGATTTTGAACTAGATTTCAATAAATAGCGCAGT TGAATAATTAAAATATATATTTCATAGATGTTTTTCATAATTATACATAT TTCAACTGAAAAGTAAACACATATCActtatatttctgatatttttcaga aaataaagctaaatgTGATGGTCAGCTCTGTGGTCGCTattgtcggcata tgccgacatttggcaaataggtcgaaccttctttttttccgtggcaaata ggtcgacccttaaaaaatacgaatggcagttaagggctctgaccatagtc agaaaattgattttagtatctatgaacataaaagttatgttttagattct ttaacacttttaacaaagaataattgcctttataaattgctttttaatca aaccccttaagagtaattaagaacttaattgcaaaaatgacgttatgaac gttaaaaagacgttaataatatgttgcatcaccttcttttataaaaagtg ctaagtttgaatgggtaattaacctttttgtttcgaacttttttcaaact ggcCGCAAAGAAtcgaactattttaaattttgcggaaaatttttctaaaa agatgtatcaaaagttatggatgtttttttaagcaaaatccagatgaaaa attgatgaaaaaccactattttgaagatttcgagacaaagaagcatttac aaaaattttccgcaaaaatttttattgttcggtaaaagatacaccatcta ctgcgaaaaatttttcaaaatgttttttcttcgccgaaactaagctcttc aaagttgaaatactctctCTTccttgcaaaagtcttcattttcttcttca tcaaattttttcaatgcaatttttgaattttcagattcaggaatagtttg tctaacagaaaatgtataacatgccatagttttgctggttacatcagtca gaaaacacattttaaacacggtaattatgaaaaattcactatggtcagag cccttaaagggTTAACGAGAGTTGCACTATGCACACTGCACTTTGCATGT TTCCGACTTAGTtatgctctattgtcttaaatccaccATTGGTCTATATG GACTatgggtcacccggtagttaCATTACCTTGCCTAAAGGTAGTCCACC CAACCAActgttcttttttcatttcttttcttttgcgcagggttttttcC TTATCATCACACGTGAAGATTTACGAAACAGATTTCCCTTGCATCAAGTC CAAAGCTGATACAGTTTACAATTTAAAAGAAGGTAAACTTTGtagttttt tctataagaacaaactataaaagaacataaggcttcaatgatcaaaatga taaaaacaagttaagagaCTTTATTAAAGGCTTTGCTTACTTTAAATCAC CTATTGTCTtaggaaattggacaaaaatactcaaaagattctggaaataa caaacaaacattctaaaaataacaaagaacatttttagtttagaacatcc gaaggcttcgaaaatctcttattaaaaaaaacgtgtcgGCTTGAATTGTC CTCACAGTGAGAAATGTACTGGATTGTCATCTCGTTTTTGAACAAAAACT GACTCGTCCATTCCTTTGGGAATAATTAAAATGTCGTTGCTGAATTTTTC ATCATCCCCTTATCTTATTTTTTAAAATGGTTAAAGTAGATGAAATGGCA GAATTTTACTCTCGTTTTCTTTTCTCGTGTTTTAGAATTCAGTAGTATAT CAGAGAAGTGTCAGCAGATTAAAGGTTTCAGTCTTATCAACCACGCCTTG GATATTTTCAATAATAATAACATGGACGAACCACCACCCAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000315_pilon:122792..133633+

>XLOC_010185 ID=XLOC_010185|Name=XLOC_010185|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=732bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000315_pilon:122792..133633+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAAGAAATACATTTCTGATATCAGATGGAAAAGAAATACATTTCT
GATATCAGtttACAGAAAAATGCACCACTATTCAACCACATTTGTGCAGC
ATTTTCACTATGGCACAACTTGTATGAGtttACAGAAAAATGCACCACTA
TTCAACCACATTTGTGCAGCATTTTCACTATGGCACAACTTGTATGAGga
ACTGAAGCTAAACACATTGAACACTAACTTGAAGGAATTTGCAAAGTTTC
TACATTATCTTTCTGAgaACTGAAGCTAAACACATTGAACACTAACTTGA
AGGAATTTGCAAAGTTTCTACATTATCTTTCTGAggttttttcCTTATCA
TCACACGTGAAGATTTACGAAACAGATTTCCCTTGCATCAAGTCCAAAGC
TGATACAGTTTACAATTTAAAAGAAGggttttttcCTTATCATCACACGT
GAAGATTTACGAAACAGATTTCCCTTGCATCAAGTCCAAAGCTGATACAG
TTTACAATTTAAAAGAAGAATTCAGTAGTATATCAGAGAAGTGTCAGCAG
ATTAAAGGTTTCAGTCTTATCAACCACGCCTTGGATATTTTCAATAATAA
TAACATGGACGAACCACCACCCAAGAATTCAGTAGTATATCAGAGAAGTG
TCAGCAGATTAAAGGTTTCAGTCTTATCAACCACGCCTTGGATATTTTCA
ATAATAATAACATGGACGAACCACCACCCAAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_010185XLOC_010185-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000315_pilongenomesc0000315_pilon:122792..133633 +
Properties
Property NameValue
Aaloc262-366:10738
Aaloc169-258:10192
Aaloc100-165:807
Aaloc31-99:378
Aaloc1-27:1