|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000238_pilon:472339..492738+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_010042 ID=XLOC_010042|Name=XLOC_010042|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20400bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000238_pilon:472339..492738+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAATGGTATATTCaggtaagaaaattttatacTTCAGGATTTTTCTAT
TACCgaaatattcttttttcaattcacaTAATAACTGTTTAAACTTAATC
GCCGTAAAATGTTAAACGAAGAATGATatatcccagctgacacacaacgt
tgtttcaacgtttttctaacgttatatggacgttgtgaacgttagaaaaa
cgtcgaaacaacgttgtgtgccagctgggataatACAGTCAACTCACTTT
ATTAattgaacctctataattcgaatctctctttaattcgaacgaaaaca
TTTGTTCCACAACAGCTCGAAAGTAGTGTAAAATACcatctataattcga
atatttctataaCTCGATGGAAAGTCTTGGTCGGTTTGAGATCGAATCAT
AGAGAGGCAACTGTAAGTGCGTTATGAATCTTttataatagacgatatcg
gatttagataaatgcaatgcattctggtttctagggactctcaaaggaat
tataatagattataattcctttgagagtccctagaaacccgAATGCAATG
CATTTATCTAAaaccgatatcgtctattgttttCCAACCAAATATACTAC
TTATGACATTTTCCAACGGAGTTAAACCTGGTTAAACTCAACATAATCCT
GGGACACGACCACTCTTTCTTTTGATATGGATGCAGCCTGTATCAGTCAT
GATTTCAAAACACTTCAATCAAGGCATAGTCAAGGCTAAGTAAATACGTA
ACACAAAAACGAATTTTCAAGTTCATCCCAAAACTAGAAAACACTTCTAA
ACACACTCACACCATCACTCAATATTATCCAGCTTAATTTTTTGTTCAGG
AATTCTctcttcgttatttttttttcaaaatcctatTTTAGTATATTCTT
cctctttattttcttcttcaagaaTAGATTTTTATGTGAGAGTAGAAGAC
TATTTTTCCGTAGCTCAGCAGGTGCCAGTCTTTTGCCTTTTTACTCCCAA
TCTTTCTATCCATTATTCTTTATTCTAAATCAAAATCAGACCCAATCCTT
TTTGGTAGCCTGAAACAGTTTATTCTGAAACAAACATATCATAACTATAC
CATCGAAAAAACCCTTTTTATGTCCCAATTAAAGGCCATTACATGGGAAA
CAATGCACAGAAACATTTCATAAAATTGAAGCCTACAGCAACTATTTATT
AGGGGTATGGAACTGTTTTGTCGTTCCATAgtgtaatttgaaaatttaag
ccttcttcttcttgtttttctgCCTTGCCTGCCTGCACCTGTAAATAAAT
TTGCAAATGATGCATCTAGGCTGGACGCATCCTCTCTGATATGTGTTGAT
GTAGGTGATGCTAtattgtgtataaaattcccgtccgagagaggggatgc
gtgcaggcTGGATGCGTGCAGGCTGGATGCGTTGTTGCGTGAAAGGGTGA
TAATCCCAGAACCAAAAACACAATTATTTCAATAAAACAGATCTCGACAG
ATCGGTTAACTTTCACTTAATCGGTTAAATTTCGACTCCCTGAACAAATT
gaagaaacgaaagaagaagataaagaagaggacaagaaggagaTTGAGGA
TCTGCTCAAAGATATTGGCATCCGCGACATCAAACCAACACACCAGCATC
GTATTGGGTTCGAACATGAAAATGGGCCGTAAGGTGACTTTataaagtga
agaagaaaaagaaagaatcatgagcaacctaaaaaagttgaagtggcttg
gatatcatctaagcatcagcaatgatttcaccatcaatgaaagacgaaaa
atcaaagagatgtGCGAAAAAGTTCAGTAATGGAACTCCGAATGTGATGG
TGATTTAATTTGACGTGTGTGAAAAGAAGTCCCAGAACAGATAACCTTCG
CTTGatagaaacaaacaaaaacgaTGAGCTGCCAACAAAACATTAGCTTT
TTATTagattgtaaagtagcgttgacttatTTATTAGCCTTCTTAgctac
cttttcgtcaacatgaaataaactattacgtACATACAGttcaaaatatt
ataattttaacCATAAAACTCCTAAGATTTTCTACCAcaatttgttccaa
actctaatTTCAATGATTCTGATATTTCGAAATTCTTGTTAAACGTTtca
aaaggaaaagaagaagaaaatgtgcTCATTTATAAACTCTTATGGTCACC
AAGGACTACAACGGTTTTTCAGAGTGTGTCGTTGCCGCttaaatatttga
ttttgtACGAGTTTGCAATTTCAACAAATAAGAGTTGAAACGACATCGCT
GAGAGAGTTGATCTTCTCGTCTCGATGTCCTTCTCAGATCAACTTTGTTG
AAAGCCCTGTACGCTaaaaaaaTACCCAACAAAGCAAAAAATACAAACCC
CCTTAAGTTACTCTTAAACTCTTAAAATATTAATTACCCTTAAAATCATG
ATGACTAACCATTACGGTCAAAATACTTAGTGTTGTTACATTTGCACTTA
TAAGTATATCTAGACTTAGCTAtgacaaaaatttaagcatatgctaagcg
tTACCTGAACCCACATTTACTGATTTTggctgtgtttttttttctgggat
tttatgaatttttagaatttccataaaattaaataaaagcatctttcaag
caattttcagccttgtcaATCTCTTGATCTAGGCATTTCCGAgccacttt
ttgaatttttgtattcttataaaagcataatttaaggtatgaaaaggtAT
AGAACGGGtttttttagtttgtttgtttatgtGATTTAAACTTTCCCAAT
TTTCTTTCCCAAGCCTCGGTTAAATACTCAAAACTCATTCGGTTATTTTG
AGAAATCCACTGGAACAATGAGGTGCTctttcagggtatttttctttgct
ttctgatgattttgatgacgctgagtctagtgaagtagactagaagaGGG
TACTGCACAATCTTAGAAGTTTTCactgttatttaaaaaagattacacca
aatcaccaaatcaataaaatatattctaaaatcccactaaagtctataaa
actataataaaaacataaaaatacgtCCATAGGTCATAGTTTTCCATCTA
CTTTTATTCAAAAAgagactggatctagtggtatGTATTTGCTTGTAAAA
CCAAAAATTTAGCCTGCCACAATATAATTATACCAGACCAATTGTTaacg
ccatccagtctatcaaaaagcaatAAGTGGCCCAggggggggTAGGTGTG
AAGCAGCTTATAGGCAAGAAGAGATACAGGGTTCCAACAGCGCAGTGAGA
CATTTTGttgctttcgttttttttacttttTGttaattttcatttttggg
gttagaagttttgcttacatcgtcacttttttGGCCTTAAAATCTTTTGC
CAGGCCTAATTCGCGGGGCCCCTCTCAAACCTATCTCATGCGGTTGCCTC
CCACGAAAGATGTTACGGATCCATAAAGATTGGCCCCCTACTACTACTAG
TAGCTTTATATCCATTCTATGAGTGGGTTGCTATTGAAAGGGTTAGAGAA
CTGACTGAATACCTCCTCCATGGAGTTTTCGTTTGACCTGTGTGATGATA
agtattgattgattgaggagTTAATTTTTTAGTTGGAATCTGATAAGGTA
GCAGATTGTACGGACCAAAAATTTCTGTACTGTTGAAAATTTAACACTGT
TTGAAAGATTATAAGATattttcgtcaaaattgaaCAGATTACAGCTAAA
GGAAACatgattaaaataaaaacatgaaaacataACAGCTCTTTAAATGT
AAAGGAGATCATATTTACTATTTTATTCCCAACATTTTTAAACgagtttt
aaagaaaatgtaaaatgacACATTTTTATACACTCGCTGCTTCTTCAATT
TCAGAGGAAAAAATCTTCTCCAGTATTAGTTCGATGTATTTAGGTCATAT
AAACTAGGGCGTGAAGAATTAGTTTGGTGAATCACTCGCTCGAAGTCAGT
CGAAGTTGATCGATACGATTGGTCGAATCGATTATATACTTTGATCAATC
GTCAATTGAtatatattttgttaaccaagtaaatttgcgaccgcagtcga
ggttGACCCGCAAGGTTGCGCACTGTAGCTGGAAGCGACTACAAAGTGAC
TGTAGTATGAAGGTAgggcatccggctacggtgcgcaagttTGCAGGTTc
gacccccagccgggtcataccaaagattcccaaaatagtATTTAATGCCT
CTATGCTTGATGCTCGGTCAACTAAGGAGACGGACCAAGAGTAAGTGGAG
CAAtgcagggagaaagagtggcgccctcccctacctgtgggtagacagct
agagaaaatgGAGCCTTCGgatcgccctcgactgcggttgTAAACTTACT
ATTTTGTACAACACTTGCTTGataataataaaaacatttgtttGTTTGGA
TGGGTACGAGATAGAAAAAAgctcattttttaacttttatccTCTGTTTG
CGCCAACACTAAAGCGCACGAATCATTGTTTATTCCTCGGGTGTGAACAA
ATAGGATAGGGTCTCCTTTTAGGAGCGGTGACAACAAATTCTGGTGTGGA
ATTTTCCATACCAAAGGATAAGCATATGGCTTTTTTGAGTGGAGACTTTt
ttaattccaaaaaaattccaCTTCGCAAATTGTTGTTACGGGTCATAAGA
AATTGCCCCTCGCTATAAATATGGGTCGTCTCTGTGTCAAATTATTCCCA
AAAGTTTTAGTActtgtgtactaaaataccacttctcGGGAAATGGGGTG
ATGGTATGCAAGAATACCCTTTAGGTATTCatttatgtctgagattttag
tacggACCTCCTGCCCTGTCTCCAGGGCACACCCATGTCTTGTGAGGGAA
TTAGctagacagaaactcaagaaaCCTTTCGGTGACTCTGCTAGGCAATG
ATGATCTGCACAGTCACCGATAATAATACACTGTGGATGAGATGCACGCT
GGCCTTACTCGTTATTGGTTCTACGCCATGAATCTAAAAATAAGTGACAG
TATCACAAAAACCATCGCATAGACGGGGATTATATATCCTCTGTAAAAGA
GAAGCCAGTAatgtgtggtcgtgttacaaaaatacaggctgtttgtagga
aaaaaataagatctacagtagctgaaactttctccagaccttctctatag
gatgcttatacctcaggaaaaattcccctaaaatcccactggtgaaacat
cccttttttgggacatttctattttccccaggcaaaatcctaagggcgaa
attttttgaaaatttcaaacttatttccagacaatatcatgtataccatt
cgaaagctctcgaaaaactatatagaagacttttaaacgtttatagctga
tttccttacctaactcgagatatttcatgcgcaagttcaacttttcgcca
cactttggtcaaaattgaccataaatagcatcttttgcgtgaattatctt
gagttaggtaatgaaatcggctatacccgtttaaaagtcttctatatagt
ttttcgagagctttcgaatggtatacttgataatgtctgaaaatgagttt
gaaattttcaaaaaatttcaccctttgggttttgcctggggaaaaaagaa
atgtcccaaaaaagggatgttccaccaggtggattttaggggaatttttc
ctgaggcataaccatcctatagagaaggtctggagaaagtttcagctaga
tcatatTGTTTCCcataaattatgctaaacgaccccactataaGAGtttt
tctactttggccaaaaactttcattttgcacttttttgagtttttgaaca
TCGTAATTCAAGTTTACATTCAGATTTTCCTGTCGTTAGATCAAAAGTAA
TAGCACTTCCTACTAAGAGATTCAAACGGGCAATAATGTGCTTGGGATCG
ACGATTTGGACCTTTTTTCGTCGGCTATGATTAGAAAAATCTGATTTAGT
ATTTGAAATCAACGATTTTTGGTAGAGTAGAAAAAGTTTTCATGTTTTca
ctaattatttttatttctaaacttttataAAATCATCTTAGACTTCAATC
CAAcctaaattatcttttcaacgaagtCTTGGTTTTGATGATATCTTTTT
CCTATAAAGATAATGTTTAAATGTCCAGATGCCAATTACTGTCATTTATT
GCAAAAATGTGGCTAAATTTCCCAAGGAAGAAACCCGTTGGGGGACGGAT
TTTGTATTCAAATGACTGTAACTGGGACTGGTGGGAGGTAAAAAAGGTAT
ATGAATCGGCCCCGTCTTTTACAATCTTGCCCCAAAGGAGAAAGTGTGTT
ATTTTGAGTTTGAAGGAAcgaaaaatctcttttgaaatgaaaatcctcta
atagaccttatcggagtttttgatttttctaaaaaatcgatgcattgtgg
gattgtttcgagtgtattacaatagaaatctcttaggaattcctcaaggg
aattctattgtaatacactcgaaacaatcccacaatgcatcgccttttta
gaaaaatcaaaaattccgaTAGGGTCTATTCACGTACGAAATCATCCttt
ttttATTCTCTGAAGTTATGGCTTTCTtatcatttttcaagaaaacgaaa
aaaaaggaaaattaactAGATTTTAAAAAGTGATAACTTTATGTTATTTT
AGAAACAATTTCTTAAAACTGTACATTAGAAATACAGTctacaaaaaaat
gaataatttcCTTGTAACTAGGGGGGTAACTAAGCTTTCAgtcttcaaat
ttcaaaaaaacgttttaaacaaaaagatgaaaattcttttaaaggTTACG
AATTTCTTTCCCGTTTGTGGCAAGATTATGTAAAagacctttttaaaaaa
aattcgtaaaaaagtACGAGACGTGAAACTTTGTGGTTGATCTGTTGGCT
TTTTCATCCTCTTTTCCGAATCAAATAGGACAAAGTCTGGCTGTCATTTG
AATGTAGTATGAATGTTACTTCTGGTTGAAGAGGCTTTCTTGTTTCAACT
TATTTCACAACCGGGAGATGTCAACTTTTTGACCATAGTCTTTCTGGAGG
TCTTCTCTTGGAAACTtttattttctgaaacaatgtTCGAGCAGGTAACG
ATTCCGTTTTGCTCCCAATCttaatgaagacattctattggttgaaagtg
acgtaaaaattgAACTTAACCAATACAATGGCTTTATTTCtattcggagc
gaaacggaaccgtagcgtATGAGCGCGGTCTGAAAACTTTATAACCCAAC
CTGACACAAACATTCTTTTAGCGCAattctaacgttatatagacgttgcT
TTATGGACGTTGTTGTGACGTTTTGTGTCCCAACTGACATGTTTAGTACA
TTTATTGTATCTGGAAGTCAGGTTGTTTTGGATTTTGTGACTGGTATTTT
TTACCCATCCATCGatgatttaatcacatgatcaaattCTAAATCAAAGA
GTTGTCACTAAGATTTGGGAAGTCGTTGAAATGCGACGTTACGCAGCTAA
GCAACTGATCAATATCGATCACGTGTCCAAAATAAAATGAGACCTTTTTG
CTTGCGTTTTCTGACCAGCAGGGTGACGTATTTGATTGATATTCAAACCT
TGAGCTACAATCAACATTAAAGGTGACTTGGTTCGAGTTTACCAGGGTTG
AATGACGTCAAATGTCCGAAATCACAAATACACTCACAGATACatatatt
tgacgtcattcgACCAAACTGAATTCGAATATTCGAACCCAGCCTCCATG
AAATGTTGTAACTCGTTAACTCATGTGCTAGTAATTGTAATAAGATCATA
AGTTTTACTGAGCCCTAGGAAAGGCAGCAGGgcgtttcaaaattcaaaaa
tatgttGGGTGTTCTCATATCAAAGATTCAATCAGGAATATCATTTATTA
AGATCATGTTAACAAAatatatttgatatttatttcatGTCagttatctt
ttctttttatgtaTTACTTTGATGCCCATACCTTATCGCGGTATCGCGTT
ATATACACCCTCGAAGctataaaatgacaaaatgcTAACCTCTGATAATA
TGCGTAAATACAGCGTATTCTTCACAAGTGTTACGTGTATATAATAAAAG
TGAATAAAAGTTGATCTAACAGGAGGTATAACACGGGGTATAACCACTGA
ACTTTATATACCCTAGAAGCAGTTCCTCAATcctggccaagcaaaatctt
tgatcagagtttttttgtTTCCATAGCTACAATACGATTCAAACGGTGGT
TTGAATTTGTTGGTCACTTGATTATTTCACTGAAAATTGCCATCCTGTAT
GGCATGAAACTTTGTGTAAGAAATTAACTTAACTCATTTCTTAACTCGAA
CTAGGTTGCTTGATAGACGGTGTTTGACGTTGCAGTGCTTGTTGCCTTTT
CATGTGTGGTAtcatataaattttgaaaatattttactttcgtAAGGATG
CATTGACAAGAGTGTGTCCATGATAAAATCTAAGGTAATACAATTTCATA
CTCCCAGAGCTGACTAATTTGTGATTTAATTTGTACTTTTTGAATGAACT
CTTTTTATAGATACTTCGATACCTTTTTAGGAATATTTCCACAGATTGAG
TAAGGATATGTTTCGGTGTAAATAGTGACTGTTACGTACTGTTAAGTAAT
ATGCAAGATATTTGTGAGTTTGCCCACTTTGCCTTAGGCTGCCAGCATCC
CTCTGACTAGTTATCAGTAACTAGATAGAAGGAATGCGGAAAATGCAATA
ATTTGCTAAGTAGAAGCGATTCCCATCCCTTCTAACAAAATCGATTTTTA
CGAATGCGCGCAGCGATCTTAACCTTTTGCCTCAAAAGTTATTGGTTGGT
TTTTTCAcgcagttgactctctctaattcgatgacCAAGGGACCAGGAtt
cttcttcgaattagagaataaTATAAATAACAAAGAGTACGAATAatgtt
cgaataacagaaagattcgaaaaatagaGAATGTGATTCTGTATCACATT
TTTTGTGGACGGAGTCTCACTCTTGTATATTTGAATACAGTTAaggctct
ctaattcgacgttctactattcgatacactgcattattcgatgatattga
aagtcaccgtcaacaagaaactctcataaacgacattCTACCatttgata
cgctcccttattcgatgaaatccaATTCCCTAcagaaatcgaattagaga
gtgtcaactgttaTGTAGTagacattgaaaatgtttattttttatcgCGT
GAGTGCTTCTTAATACGACGAGATGATCATTCAGTCTCGTTTTTCAAGAG
ATCCTTGACAGGATTTGCAATACCTTTCAGTGATGATTGACAAATACCTC
TATTCcttaaaagttaaaatattgCGGTGATAAAAAGACTTAACTTCACA
GTTGGTATTTAGTGCGAGGAAGTATGGCGATTATATCTGGATATGATGGT
TTTAAGACGTTCTTAACACTGTTATCGTGAAAGGTTTGTAGGACTGGTTC
TATTGGCTCTAGGCTCCAGGCAACCGCAGATGAATTTATTTGTTGATATA
TTTTTACTTGTTGtaatgttcattcaaaagggCTCTTGGATGTTATTTGG
ATGTTATTTGGATGTTGTGTTTTGTGAAATTAGGTTCGAAATTTCTGCAG
TCGAATAGCTTtgtctttacattttttttcagaaaatctctTTTAacgta
aaattgacgttttttcaAACCTCTACAAAAATGTGTATGTTTCAAGTTTG
ACAAGTCACTTAAATGCAATATTTTCACAGATGATGAAataagggtttaa
aaaagaagcaaggATGTTTCTTTAAAGTTTACATTTAGACCGCCAACTGG
TCCACCTACTCTACCGTACAAGAGGTGGTGTGCCTGTTTTgtatatcata
aaaaaaaacgaaaacgatGCTTGATTTGATTCGGGTGAAAGTTtcttaca
gataaaaaaatctgtcaaaaataactggaattccataggggtagcctttt
aaatcctactaaaattcagaattccagagggttttaaacctgaaattgcc
tggaattccagggggttgcagcatttccagccacaaaatgatagacctcc
tcaacagggggtatacggtttttttctggaaaagcccaatgtttgagaca
aaggggatttccacCAAAAGTGTGTGTGTAGGATTTCCCTACGAAATTTT
GAACACCGcaatgatgatttttttgagCGCGTTAAAGTACGGTTGTAAAG
TAGAGctgttttaacatgagacttaacacTTACGACCTTAGAAtatcagg
atttaaaagctaaatattgttccaataaggctggaAATATAGCTAATTAA
Accccaaaatcgaaatattcaatgaaataaagttgaagtacacgtttttt
tttttataagaacaaactatataagagcataaggcttcgaggcccaaaaa
tttaagaacattctaagaacattctaaggctttggagacttaaaaacatg
cattttcttaagaaattacatcaaaatgctcaaaaaacgctgaaaataag
aacatttttaggcttcaaatccaaaaaactaagaacatccgaaggtttcg
aaaatttttgacgttcttataaaaaaaaaacgtgtactaagATCAcacaa
ttctcgcccgaactcaaaattctgaaaaactaaaaaactaaatatctcaa
tatatttcgaccaagATTGTAGGAGATGGTTCTCTGTGTTGAAAATGGAT
CTAGAAAAggaatttaatacctcttttcgCTTTAGGTAtttgctacacgt
tttttataagaacaaactatataaggacataagacttcgatggtcaaaat
atcaagaacaagttaagaacattttaaggctttatggaccctaaaacacc
tattttcttaggaaaatggacaagaatactcgcaaaatagtgaaaataag
aacatgctaagaacatttttaggctttaaaactcaaaatgtttaGAACAC
TCAAAGGCTTGAaaaagtttggatgttcttacaaaaaaacgtgtaaattt
tCCAACCTTTAACCCTTTGATTACCATAAAATCAGTCATTGTAGGCTGTA
GAGATTGTAAACTAAAACAGAGAACTTTTAAAGATTCGGATCATGCATGT
TTGTGTTAGTTAGTTTGTTTCTCAAACAAAAACAGGAGACATTCACGCtc
cttttattgatttttggattATCTAACTTGGTTacattttgaagtttctc
tAATGTCATTCGTCCTTTGAAAGAAGGCCAATTTTTTCTTTACGCTGGAG
TGgagtcttttttttaatgtgagATTTATATTCAAGTTTGGGAAGTTTGT
GAACTGCGCCAATTACATTCAAGACATCGTGAGTATCACATATATGGTTT
TCTTGGAAATATAAACCAGGGGATCatcccccccaggaagatggggagAA
TCAACTTTCAACTAATCAATCAAATTTGTCTTAGCGGAAAGAATTTCGGT
TATCCGCTTGCGAAAGTTCCGCCAAGAAAAAATCTTGTTCCAAACACCCT
ATATCatcaataaaaattaaattcgtATAAAGATTATCGTTtatatatat
ataCAGAAATCTTTACAAAAATTGTTTAGAAAGGCTCTTTTCTCacattt
ttttaggaaaatttaatGCTGTTGACTAAACCAGTATCCTAAATGAAACT
TCAGGAAATTTTTCCTTCCCAATTTTCACTATTTTCTGGTAAATCTTCAT
AATATTTGTGTATACAATCTTAAAACATCGGACTAACTTATATCCGCCAT
CTACTGGGAATAAATTTTCTGTCACATTCAGGTAGCAACAATATTAAGTA
ATTCTGCTATTAAAGTCTACTACCTGTGATAAACTCTgatataaaatttt
gattggcCGGAATTGAGTTATAGTCCTCGCGGGCTTCATATAAAGGTATA
AATTCCAGTGGTAGTAGCCCCCTCCCGGCGAAAACAAACATCAAACACGC
TTTAACAGAACTTATACCAATGATCGTGTGTAAATAACCAATAATAACGA
CAAAAATACCTTCCACTCAAAAGCCAAATTGTCTCATTGATTGGTGGGCG
GTCTGAAGATTCTAGAGTCCATATAAGTAGTACTTCTAAATCGTTTGTTT
TGATGGGTCTGTCTTCTAAGATTGTTGGGATAGAATGATTTTGctaatca
aatttcttttacaTTGGCTGTATTCCttcttggaaaatattttcattctt
ttcGATATTTTGACATGCTGCGATGGAAAAGTAACCATTGATTATTGAAA
AGGCGGGTTAAAAGGTTTCCCGGGGGGGGATCACATAGGCAAAATTGAGT
ACGATGACATttcgctggtcagggtcccttttttagattttgaagatATC
TGATatagggtcccaaaattactAAGTTTCAAGATCTGTATCTGATAGGG
TgggaataataaaaaaattttgtcaactcatttttgccacttttcagcaT
GAAAATgtgaatttcttttgaaaatttgtatcaGACTGGGTCcgcttttc
aaactccagcggaaTGTCCCCGTCATCAGTGTTTTGCCCTTAACCACACC
CTCCCCtccgggaaaattttttatgttgaaaaaggAAAGGGGTCTCGAAA
TTAATCATTATGGACATTTTCTATACGGAgaatctgttttttttaatctt
gcACAAACCAATAAGTTACATGAAATTTACTTGTACAATGCTGTGGTCAG
ATCTTatcttcaatttttctgatataAAGAATTTTAATCAAATATATTAA
CTCTTCTAAAAAATGAAtggttcaaaaaaaaatctcatggCATTAAGTGA
ACTGTGTAAATCGATGCTTGTGCAAATAGAAAAAACAACTTTGTTCACTT
TCgaaagaaaatattatatatcATTTGGGTTTTTAACGGTGCTTAAttct
tatcaaaacaaattgttTGTATTGTAATATTTACTTTAGAGTGCATTGAC
CCCTAATTAATTACTTAATTTTGAATGATCTATGTCGTAGTTTGAAGTTT
GAATGGGAACACTATAGCATTGCTAGCTTCGGTATCAATTgaattttgtt
gtattttttgaagcaaagagttttgaaaatattatatgagAAACGTAATT
ATCTGTAGGCGTTCCTatgtgtatttttaaaggaaaaaatgacTGTCTta
tgtgtttttaaaaataatatgtgcatttttattttaagaaatactACTGT
GTATTTTCTGTGTATCTCTTAGCAAAaatgttttgtattttcaagGGGAA
AGATTTCTGTgtattttaaatctttaaaagacaaaacaaaccatttttgc
AAGAAAACTTTAATTTAATGTAGCTCCAATAAAATCTCCACAGGATGAGG
TTTTAAAGACTAATGTCTTAAATAAATTATCAGCTCACAGAGGGATATTA
GGATTACTAAGCAAAATCTTGacttctcaaaaaaaaaatccaaaagcgAA
AATCGATGTTGTTTAACAATGAATTATagatttttaaactttaaattaaa
ttttaatcgGACCTCAACCTTTCTATGTTTATTAAAAGATTGTTCAAGTT
GTTTTCTCTCAAAGGGTTATTGACATAGAAGTCTTTGCTCAtttttttAT
GTAGAAGTCTTCGAAATGATAAACTCCAATAAATTTATTTCATGCATGAC
CTTAATTAACTTCTGTCCTTTTTTGCCTCTCACCTTTCTAATTACGGAAC
TCGCAGCTCGATCGTGTGACCTGATCACCaactacaattttttataagaa
aaactttaCACGAACATCCACCGGGTCACAAAAACCTCACACTATTCCTG
TGAATAGTCAAAGGTGTAGAAATAAAGTTGATAGCCTTAAATACctcaaa
ttttatcttaaatataactttactggttcttatttgaaaaattgtagGTT
TTAGATAGTGTTAGATTTTTGGGGGTGTCCTCCTCCGGGGGGTAGGTTTA
CTTActaaaatttgcaatttttcatagaCTTGCTGAAATtttcaccctta
cagtgcatttctgatattttgaaaaacgtaCCCTTAACTGACGCACacac
ccgtcggtcaatttgtaTGACTACCTCTGGTACTTAATTACAGTTTACCA
TTTAAGTACACGTTAAATATGAGTTGCGATGATTATTTTCCGACTTGGAA
TAATGACAATAATGACCTGTTCGCGGATCAAAGTTAGCTGCGGAAATTGA
TATAGGGGGCGTTTTCGTCAATGAAAGAACACTAGTGCGTGACTAGGCTG
TACCCATACCTCCATAccatatgttttgatatagtgGATGCTcttcgtgt
ataaaattcccgtccgagagttctAATGAAACTCAAAATCACAAAGATGG
Gtttttcccagctggcacacaacgttgtttcgacgtttttctaacgttca
caacgtccatataacgttagatgaacgttgaaacaacgttgtgtgccagc
tgggttgagtttttgaaatttgattgacttgattagtaagttttttttga
gaaatatttaaatttcattaatttgtatttgaaatttgaatggaTAGAGG
TTAAAACAATCATTTgattttaaacctttttaagaaaattgaaacaaatt
acctcaaatttggggtaactttcggacgggaattttatacacgattagCA
TCCCTTATATCAAATTTTAGGTCAGAGGGGATATGTGCAGCCTAGTCGTG
ACATATTCAAGAATTGACCTTTAAAATAAATGACTTTTCAAAATGAATAG
TCAAAACAACCGAGATTAATAAAAATAGCTTATCTTTctaaagaaaacag
aaaaataagGGCATAGAAACTggctttaattttctttttagggATTTATC
CTACTGTAGACCCTAAAACCAACTTAAACAGAAtaattttgatggaaaat
agaaaaaggaaaaaaaagtcacgaaaatgACGTTttatttcatcttcttt
ttacaaaaaaacaaaatcttgttttgaaattcttttctcCTACGCGCGCT
TACTTTATCTagttttcaattttcctttgtcaaaagaaaaattattgacT
TTTTTCTTAGTTATAAGAATTCTGAGTCAAATGTTTTATTAATTCCAAAA
TTTGACTTATAAACTTCTGTAATAAAGAAAGTCCTGATGTTCTTACAAAG
TTATATCTCATTATATTAGCTtgttgagaaattctttttcatgttCCTTT
TTTCCTCCATTGTTTTAATCTTATTCTGACAGAGACCTTTTAAATTTAGT
TGACGCATGCGCGGAAAGACAAACTATAGATGACAAATGAAAAGATTGAC
ccattggaaaaaaaaactgaCAGCGAGCTAACCGATAGGACACTGTGCAG
TAACACAATttgcttttggaaatcaaatTGAAGAACTTTGATATCGGAGA
CTTGTTGTTGTTTTAGGAGAATGGGTCAAATACCTTGGAAAATGGTTTTT
CTGAAGTTATTTGTTTGCTTCTCAATATCCGGTAAGGAATTTCCCATCTG
ATTTATCCATTACTAGCTCATGTACTAgccacccagctggcacacaacgt
tgttttaacgttcatctaacgatatatggacgttgtgaacgttagataaa
cgttgtagcaacgtcgtgtgccagctgaCCAGTTTATTTACAGTGGAGCC
TCAATATCTCGACCCTTTATAACTTGAGCGGGATTTCTGGCCCTTTCAGT
TAACAGAGCCTTACATACCAGTCTCCTGTAACTATAATACTCACGggaaa
taaatttatttgatattttactATTAATTTAACTTCGTTTAAAAGAACGG
CTGACATTTTATTCTATCGTTGATCCGTGAATACTGTACCATCTTTGAGT
GTTTTTGGTAGGTCCTATCGGATTTTCAGAGTTCTTTAATGATGGACCCA
TGGAAGCATACTCTAAAATTATAggctttttcatgaaaattatcTTAAGT
GCAGTGACTGCCTTGTCTTGGATCCATTACTAAGAAAATTGAATTCATTG
AGCCTTCAAATGTTACCTTGTAAATAGAGAAAACTTCTTACAATATGAAC
TCCGGGAATTGATAACATAACAGCGTTgcttgtgacgtaatttatgaaaa
tctcTGATCCATAGCGCGCTGTTAATATGGTGGCGGGCTGGCCCGGCTAG
GTAAAGTGGGATGGATTTTCGAACGTTGCGTCGCAGCTTCTGACGAATCA
AATGGCTACAATTAGATCACAtgacgttcgaaaatctatccCACCTCACG
TAGCCGGCCCAGTCTCCATATGAAGGGTCCCTAAGTCCTAAGACCATAAT
TCTTATTTTCCTAAGTTGGAATATCAAGAGCGAGTTCAATAAGGCTTACA
AACGGCTTAAACTATATCCCATCGGGAAACACCGCAATATTATCATGGAT
ACACGATCAACCTTTCGATATGGTCGAATTCAACTACAGATTGAACCAAT
CGGAAccacttttgaataaaatcGAATATCGTCGTAATCAAAGTTCGGGA
CAATTCGATACGTCTTCAACGAGACCGAACATCACAGAACGACTTTTTAC
AAGTTCAACAGCTGATAATTCAACGTTTGAAATCTCTCTTCGTGATGTTC
AACCAGGCGAATATCTGGATGCCAAGATCTCAATCGGAGGAAGTATATTT
GGTATAGACTATCGCCTGATTGGTTACTGTAAGTGTTATCGATTTTATTT
ACTCTACACTTATTTCTTGTTTGAATAAATTCCGGCGattgtttttttgg
aatttaaagTAGGCTAGATTTTGGCCTTAACCTAATGATTTAAGACGATT
TTCTAAGAATAAAGCATAAAAGATTTTATGTCATTTGGAAAACATCTTAA
ACCTTGATTCTGTTCTTAAATTTCGCCaaaaaaaTGGTAGTTCATAAAAA
AGGGTATATTGCTTGATTCCAGTGCCTCCTGCGCTACTCTCATACCAATT
CACGGACGACAACAAATTCATTGCTGAAATTCAAACGGATCTGCAACCGA
ATGTTCAAATCACTCAAATTAGCCCTACCGAACaaaaacagtttgtttac
acTAGTAACCTTGACGACCGACACGTGTACACAACAGATTATACGGCACC
TTATCCTTGTggaaggaaaataaaaattaatgcTACAATTCATCGATCCG
AAATGGTCAAAATCATTGACTTTCCAAGTAAGTTATTTATCTCTTACTCT
TGTATtatcaatcgaacggaatcaacaATAGAATCAATTGAAACCAAATT
GAAACTATATTAAAGTACGATTGGTTCGGCGGGGGTTTTACCTATGCATA
AGTACTTGCTAGGTTTGAGTCCggactgaaaaaaaagaagtaagtctctc
taagggttgtggATAATTTCGAAAGTGGTTTcgctttttcgcaaattttt
agTCACTCTAAGGATCGGTCTTTCGGAGATCTGGTTCGTACATACCCGAC
ATTCTCCAACTCTAGTACCTCAGGTTTTGCTTCAGTCTCGTTCAAAATAT
acgttttaatttttctctttaggcttgaatacaatattttttatctctat
tttagatgattttGAAATATACAATCTCAATTTAACAACAAACATcacat
gtttttctttgaaatgggAACATTCCGTCTCCAACTGTACTTACCAATCC
TTACAAATCATATCACCACTCAATGGATCCGCCATTTTAAATTTACCGAC
GGACCAATCATATTTCGAGCAATGCTCAGATAAACCAATAGGATGGGTTT
GGAATTATGACCGAGTAGTGGAAGGCAAAATTCGTGGTGTTTTTGATGAC
GGTCTTTATAGCAAATGGTACAAGTTTATCAAATACAGTAAGTGTTTTCT
acaactctctctctaattcgaacctctattattcgaatctttctacaaTG
CAAACATATTGTGATCTACTCAGCTGAAAGTGGTCTAAATCAttctctgt
aatttgaatctttctctaatttgaagaaaacttttGGTCCCTTTAAAGAT
CAAAAAAGACCGTGTGTTTGCCACTCATTTTCAATTTAAACAATAAACTA
GCAACAAACGCCGCGGGCTATTTTTAGTGCTTCCGTGTTAAACACTACGC
CATGAATATAATGAAtctttaaaggccggtctccacttgcgcgcgctgca
atcgcacATTTTGGCTTCAATcgtttttgcttggaaaagagaTTATCAGG
AGaaagttttgggaaaaaaaaCTTACCACTTTTACAATCTTTCACACTTT
TACAACTTTCCTAACCAAAACTTTGTAAATGTTTGTAAAAATGGGGGATT
TTCCATGGTTGCAACACGAAAGcacgaaatagaaaatatttgcataattt
ttttcaagtagaAGTGACCTTGGAAAATCGTAATAATCGCTATAATTTAT
TCTTTTATGAAATCGAAAGTTAAAGTTCTTTATTGAATTGCTTTTGGAGG
ATGATACGCATAGTTTTCAGCCGAGTCTGGAatgattatgacatcataga
tccaattttcccaccaaaataccaaaactttGCAAATTCAAATGATTGCT
GTTGTTGGCAGGGAAAGTTTGGAAAAGTCCTATTTTTCACATCTTCACAA
CTTTCAAGGAACCTCTTTTGAGGTGGGAAAAATAGTAAGATAttttacaa
cttttatggtttttacaacttttttagaCCAAAGACTTTGACTTTGTGAT
GGGAAAAGTGGGAGGATTAGCAAAACTACATACATACCAAAAGTTTCTCC
TGtatgtcataaaaatgtagcgcgagctcgaaaaaacaaatttgaatata
tttcaacttttttcaaccgttacgtcagatagcgtggaagcttttatcga
aaaagtgcaatcgcagcgcgcgcaagtggagaccggccttaaactAAGCC
TCTCAAAAATCACTTTCACTTGTTACACAGGTCGAGAACCATGCGGACAA
GATGATCCACCAAGCGCCCCTGACGCATGGTATAGCGTTCTAGCGGGCGT
TGGCAGTGTAGTGACGGTCGTTCTCATCTTCTGCATCATATCACACTGTA
TCCTTGTCACGAAAAGTAAGTTCATTCGTGTGGGTTTTGATCATGCTGTT
TTCAATGTTCAAATTTTCTAGCCATTGTTGAGATTGCGTAATTGCAATGA
GTGAAACTAAAATACGTTTCATTACAATCACTATATACCAGGTTCCTATC
CTATCGCGAATTATCATTATTTCCTCATGCCTTCTTGTCTTATTATCACT
AGGGATTCGTGTTAAAAATCTATACGTTAGCAAAAAATAATATTGTTCGA
GGCGAAAAAAGGGAATCAGGCTTTTGACTGTTATCTTGAACCCAGCCCTT
CTTCGAAAAATAATTGATCTaaaaaaaTACaggcttttgaattttgaata
atctacatatttttacactttttctttCATCTTCTAGAGTCAGAAGCTAT
CAAGTATGCTGCAGTGAAATCAAATGGCCGCGCGACAACTGAAAATACCG
AAACAATAAACCTTATTGTGGCTGAGGAAGGAGTCGATAGCGCAGACAAT
AAACCTAGCTCTAAAGGTGATACATTATTTATCAATCTTGAAAGTGACGA
GAACACTAATCTACCGTCGAAGGAAAAGAAAGCTAAAACGCCGGAAGAAC
AAATACCTCAGATCAATTTTGAAGATGAGAATGGATGTTTGATGTCCATC
CGTGAGGTTCCTGAGCCAGAGGAAGAACCTAATCACTCACAAAAGAATGA
TCATGATCCCTCCCAAGAAATCATAAAAGATCGAGCTAAAAGCGAAGACA
TACAAAATGAGAAATCGAAAATAGATGAGGACAATGACATTATAGCGGAG
ACTCctaattcaaatgaaaaagatttattaatTGACGAGCCTTTACAGGA
AAAACAAGATTCTAAGTCAGACAAACAAAACATCGACAAGCCGTTAAATA
ACTATGAAAATGCCTCTGTAACAAAACCAAAACCGGAGGAGAACGTTTCC
TTAAAACCTTTGGAAActgtacaaaatcaaaaacctgaaagtcagggggt
aaaaaataacaaaccttCGGAAACCAATGAGCCCTCTGCTCAACCAGTGC
ATAAAAACACGGATCCTGATTCCTCGAAAACACCGGAAGCCGAAGCTAAA
ACCGATAATGGGGAAAATCTTAACGACATTTCTGGAAAGAAAGAGACAAT
TGAAAAGACTGATCAAAACGAACGACAAAACATTGAAAGTCCTAAAGATG
ATACTAAAATCGAAGTTCTACAAAACGTGCAATCGGATACTACTGTATAG
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000238_pilon:472339..492738+ >XLOC_010042 ID=XLOC_010042|Name=XLOC_010042|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3960bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000238_pilon:472339..492738+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAATGGTATATTCagATGAATGGTATATTCagGAGAATGGGTCAAATA CCTTGGAAAATGGTTTTTCTGAAGTTATTTGTTTGCTTCTCAATATCCGG AGAATGGGTCAAATACCTTGGAAAATGGTTTTTCTGAAGTTATTTGTTTG CTTCTCAATATCCGTTGGAATATCAAGAGCGAGTTCAATAAGGCTTACAA ACGGCTTAAACTATATCCCATCGGGAAACACCGCAATATTATCATGGATA CACGATCAACCTTTCGATATGGTCGAATTCAACTACAGATTGAACCAATC GGAAccacttttgaataaaatcGAATATCGTCGTAATCAAAGTTCGGGAC AATTCGATACGTCTTCAACGAGACCGAACATCACAGAACGACTTTTTACA AGTTCAACAGCTGATAATTCAACGTTTGAAATCTCTCTTCGTGATGTTCA ACCAGGCGAATATCTGGATGCCAAGATCTCAATCGGAGGAAGTATATTTG GTATAGACTATCGCCTGATTGGTTACTTTGGAATATCAAGAGCGAGTTCA ATAAGGCTTACAAACGGCTTAAACTATATCCCATCGGGAAACACCGCAAT ATTATCATGGATACACGATCAACCTTTCGATATGGTCGAATTCAACTACA GATTGAACCAATCGGAAccacttttgaataaaatcGAATATCGTCGTAAT CAAAGTTCGGGACAATTCGATACGTCTTCAACGAGACCGAACATCACAGA ACGACTTTTTACAAGTTCAACAGCTGATAATTCAACGTTTGAAATCTCTC TTCGTGATGTTCAACCAGGCGAATATCTGGATGCCAAGATCTCAATCGGA GGAAGTATATTTGGTATAGACTATCGCCTGATTGGTTACTTGCCTCCTGC GCTACTCTCATACCAATTCACGGACGACAACAAATTCATTGCTGAAATTC AAACGGATCTGCAACCGAATGTTCAAATCACTCAAATTAGCCCTACCGAA CaaaaacagtttgtttacacTAGTAACCTTGACGACCGACACGTGTACAC AACAGATTATACGGCACCTTATCCTTGTggaaggaaaataaaaattaatg cTACAATTCATCGATCCGAAATGGTCAAAATCATTGACTTTCCAATGCCT CCTGCGCTACTCTCATACCAATTCACGGACGACAACAAATTCATTGCTGA AATTCAAACGGATCTGCAACCGAATGTTCAAATCACTCAAATTAGCCCTA CCGAACaaaaacagtttgtttacacTAGTAACCTTGACGACCGACACGTG TACACAACAGATTATACGGCACCTTATCCTTGTggaaggaaaataaaaat taatgcTACAATTCATCGATCCGAAATGGTCAAAATCATTGACTTTCCAA atgattttGAAATATACAATCTCAATTTAACAACAAACATcacatgtttt tctttgaaatgggAACATTCCGTCTCCAACTGTACTTACCAATCCTTACA AATCATATCACCACTCAATGGATCCGCCATTTTAAATTTACCGACGGACC AATCATATTTCGAGCAATGCTCAGATAAACCAATAGGATGGGTTTGGAAT TATGACCGAGTAGTGGAAGGCAAAATTCGTGGTGTTTTTGATGACGGTCT TTATAGCAAATGGTACAAGTTTATCAAATACAatgattttGAAATATACA ATCTCAATTTAACAACAAACATcacatgtttttctttgaaatgggAACAT TCCGTCTCCAACTGTACTTACCAATCCTTACAAATCATATCACCACTCAA TGGATCCGCCATTTTAAATTTACCGACGGACCAATCATATTTCGAGCAAT GCTCAGATAAACCAATAGGATGGGTTTGGAATTATGACCGAGTAGTGGAA GGCAAAATTCGTGGTGTTTTTGATGACGGTCTTTATAGCAAATGGTACAA GTTTATCAAATACAGTCGAGAACCATGCGGACAAGATGATCCACCAAGCG CCCCTGACGCATGGTATAGCGTTCTAGCGGGCGTTGGCAGTGTAGTGACG GTCGTTCTCATCTTCTGCATCATATCACACTGTATCCTTGTCACGAAAAG TCGAGAACCATGCGGACAAGATGATCCACCAAGCGCCCCTGACGCATGGT ATAGCGTTCTAGCGGGCGTTGGCAGTGTAGTGACGGTCGTTCTCATCTTC TGCATCATATCACACTGTATCCTTGTCACGAAAAAGTCAGAAGCTATCAA GTATGCTGCAGTGAAATCAAATGGCCGCGCGACAACTGAAAATACCGAAA CAATAAACCTTATTGTGGCTGAGGAAGGAGTCGATAGCGCAGACAATAAA CCTAGCTCTAAAGGTGATACATTATTTATCAATCTTGAAAGTGACGAGAA CACTAATCTACCGTCGAAGGAAAAGAAAGCTAAAACGCCGGAAGAACAAA TACCTCAGATCAATTTTGAAGATGAGAATGGATGTTTGATGTCCATCCGT GAGGTTCCTGAGCCAGAGGAAGAACCTAATCACTCACAAAAGAATGATCA TGATCCCTCCCAAGAAATCATAAAAGATCGAGCTAAAAGCGAAGACATAC AAAATGAGAAATCGAAAATAGATGAGGACAATGACATTATAGCGGAGACT CctaattcaaatgaaaaagatttattaatTGACGAGCCTTTACAGGAAAA ACAAGATTCTAAGTCAGACAAACAAAACATCGACAAGCCGTTAAATAACT ATGAAAATGCCTCTGTAACAAAACCAAAACCGGAGGAGAACGTTTCCTTA AAACCTTTGGAAActgtacaaaatcaaaaacctgaaagtcagggggtaaa aaataacaaaccttCGGAAACCAATGAGCCCTCTGCTCAACCAGTGCATA AAAACACGGATCCTGATTCCTCGAAAACACCGGAAGCCGAAGCTAAAACC GATAATGGGGAAAATCTTAACGACATTTCTGGAAAGAAAGAGACAATTGA AAAGACTGATCAAAACGAACGACAAAACATTGAAAGTCCTAAAGATGATA CTAAAATCGAAGTTCTACAAAACGTGCAATCGGATACTACTGTATAGAGT CAGAAGCTATCAAGTATGCTGCAGTGAAATCAAATGGCCGCGCGACAACT GAAAATACCGAAACAATAAACCTTATTGTGGCTGAGGAAGGAGTCGATAG CGCAGACAATAAACCTAGCTCTAAAGGTGATACATTATTTATCAATCTTG AAAGTGACGAGAACACTAATCTACCGTCGAAGGAAAAGAAAGCTAAAACG CCGGAAGAACAAATACCTCAGATCAATTTTGAAGATGAGAATGGATGTTT GATGTCCATCCGTGAGGTTCCTGAGCCAGAGGAAGAACCTAATCACTCAC AAAAGAATGATCATGATCCCTCCCAAGAAATCATAAAAGATCGAGCTAAA AGCGAAGACATACAAAATGAGAAATCGAAAATAGATGAGGACAATGACAT TATAGCGGAGACTCctaattcaaatgaaaaagatttattaatTGACGAGC CTTTACAGGAAAAACAAGATTCTAAGTCAGACAAACAAAACATCGACAAG CCGTTAAATAACTATGAAAATGCCTCTGTAACAAAACCAAAACCGGAGGA GAACGTTTCCTTAAAACCTTTGGAAActgtacaaaatcaaaaacctgaaa gtcagggggtaaaaaataacaaaccttCGGAAACCAATGAGCCCTCTGCT CAACCAGTGCATAAAAACACGGATCCTGATTCCTCGAAAACACCGGAAGC CGAAGCTAAAACCGATAATGGGGAAAATCTTAACGACATTTCTGGAAAGA AAGAGACAATTGAAAAGACTGATCAAAACGAACGACAAAACATTGAAAGT CCTAAAGATGATACTAAAATCGAAGTTCTACAAAACGTGCAATCGGATAC TACTGTATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000238_pilon | genome | sc0000238_pilon:472339..492738 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1120-1980:19540 |
| Aaloc | 985-1116:19033 |
| Aaloc | 703-981:17658 |
| Aaloc | 448-699:17025 |
| Aaloc | 85-444:16418 |
| Aaloc | 19-81:15518 |
| Aaloc | 1-15:1 |
|