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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:543157..551121- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_009573 ID=XLOC_009573|Name=XLOC_009573|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7965bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:543157..551121- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTAACAAACGTCTAAACCGGGTTAGAGGACTCCCTCAAGAAAATTG
TGCTGAGCTGGCAAAGCATGATGTTCTACTTTGTAAAGTAAGTGATTTTT
ATAATGTATTTATTACATCTAGCGGAAACCAATGCAAGTTTTTGAGGCTT
TGAAAATAACAATTTTGAATGAGACAAACTAAATTTCCAACCATGTTTGT
TCAGTGATTACTTGAATACTTGTACTTTAGTTCAGATAAGTAAAATTTTG
GTTGGATAATGTCCCATGGACCATTCATTTTAAAGGCATTGGGTCAATAC
AAACTTGTGATTTTATGAAAAAAGAGAGCACTTTCAAAAGTAAAAGAAAC
ATTTTTATGGTTTTTTTTTGTAGGACGTTCTCACAAAGAACATATTGGAA
CTCATGAGTTTTGGACTTGATTACAATGAATCTAAAATTGTTTTTGATTC
AGTATCAAAATCAGTTGCACCAAACTCAAGCAAGGTAATAATAAATCACA
ATCAATGAATTTTTCTTTTGTATGCTAAAATGATAAAAAAACATATGTGA
CCATTAAAATGGTTTAAAGACCTAGAAATGCACCACAAAATAGCTCAAAA
CACTTTGTAATTTCAATTTTCTCAAGTTCTACAAGTATCAGAAAAAGAAA
TTTAGGAATTTAACATTGAATTCTGAAAAAATGTCTTTAAATGATTTTGA
CAAGAGCTATTTTTTTCAGAATCTTCCTTACAATCTAGTTTTTATATTTA
TAAAAAGTAGATTGCTGACGCGTGGAAAGGAATTTCGGCATGACTGACCC
TTTCAGCCCTGTGAATCCAGGTCGGCATTCTGCAATGCCAACCTGAAAGC
CGACGTAACTTGAGCTGAAGTCGGCTTTTATTTGCCGACGTAATTTACAC
TGTAGGTCGGCGTGCTGACAAAAGAAATGTTTTGGGTCGGCAAAGCCGAC
TTAAAGAGGAAAAATATTATTTGTTAGGTTAATCTAATTGTGTTATCATT
TGATAACACATGATAATCGAGCCTCATTCCATTCTCTTTATGAAACATAA
AACTTATTAACACAATTTTTAAGGATAGTTAAACTAACTGTAGGAAATTT
ATTGTCTTTGCCGACCTAAACAAGCTACAAGCTACGGCTTTGCCGACCTA
AAATGACCTCTAGGTCGGCAAAATTTTGCCGGCATACGGCCGGTTTTGGT
CGGCACTTATGTGCCGATATGATTTTGTTTGAATTCACAGGGCTGCCCTT
TTGTTTCGATAATAACATCAAAGCAGGAATTAATTTTCTTCTTGTTTCTT
TCTTTCCTTTTTCTTTCTTATAAGTTCACGCTTTCCCTCGCCACTCGAAG
CGTGGTTAGCTCAAGCGGTTAGATCGTCTGTCTCATATGCATGGGGCTCC
GAGTTCAATTCCGATGGGTGTCCAATTTTTCAATTCTTCAATTTTCTTTT
TTTAATTCTCTTTCTTTTATAATGAAGGTCAATCAAACAAGTAACTAGCA
TATATCTCTATATATCTCGCTCTCTGTCTAAGGTTTAGATAAGCTATGAT
AGCATCACTTAATAAGAACTTTTTTAAGTTTTGTTTTCTTCAACCTTTTT
TTTGCCACAAGCGATTATTCAAGGCTGAGATATAGAAGAACGAGTATAGG
CGTTTGCCCCTGTGTTTGCTGACTGACAGTTTCACTTTCACTTTCACTTT
CAGCCAGCAAGTGAGCGAGCGATTCTTTGTAAGAGAATCGTCAAATAACT
TCTTTCAGAATCATTGAACTTCTCGTTTTATACTTTAAAGGCAGAATAGT
AATTTATTTCCGGGTCAAAATGTTTGGCACTTGATCCAATAGTTTGCTTA
TCTTTCTTGCGTGGTCGTTATTTGAATTTCAGTATTCAATGCTTATAAAA
TACGGTTGTTAAACTCGTCACATAAGGGAACAGATCATAGTTTCGAATTG
AACGCGTAATTACTAATAGCAATTAACATTACATAACGCGTCGATATCTC
TTCACTCTAATGAAAATATGATACAAAATTAAAGTGATGAGAGAATCACA
AAAAAAAAATCAAGAATTGAAAAAATTGGACATCCATTGGAATCGGACTC
GGAGCCCCAAGCATATGAGACAGACGATCTAACTGCTTGAGCTAACCACA
ATTTGAAAGTAGTGAGAGAAAGCATTAACTGATAAGAATGAAAAAGGAAA
GAAAGAATAGAGAAGAAAATTAATTCCCGCTTTGATGTTATTATCAAAAC
AAATGGATCAGTCATGCCGAAATTCCTTTCCACACGTCAGCAATCTACTT
TTTATGAATAGAAAAACTAATAGCTGTTTTCTTAGACGACTACATTTAAG
GTATTTTCTTCATGAGAATTTAAAAAGTCGATTTTTGACATTTCAAACGC
ACTTTTTGAAAGAGCATTTGCTATTTGTTTGATGGTAAGTCTTCATCCCC
AAATTAAATTTCATAAATGACTCCCCAAATTTAACCTTTCTTTCTTTCTT
TTATTGTAAAAAGATAAATTATGTAACAAGTAACAACCCGTAGAACTTGA
GAAAAGACCCCCCTTAAAATCTTTACTCGTTCAATTTGACTGAAATTTGT
TCCTGAAAGCTGATTTGTCAAATAAAAAAGACTAGTAACAGAAAAAATTT
GTTCCAATGAATATTTGATACTTTACAGATTGGTCTGTAAAATACACGTT
GACCAACTGCAGGAACTCAGGAACTACTGGAGTTTTTGACTTGAAAATTT
CCCCAGTGATAGATTTTGACTATTTAAGACGGTGTGCAAAACTAAAATTT
AGTCCCGTGAGTGGATGGTATTTTACAGACTGTCTTTTACCTAAAATGCT
CACTTTCAGATAAATGCTCGTTATTTTGTTCAGATTTTGCTGAAGTTTTG
GCTGCAAGCTTGTAATATCAATACCTACACTTTCCAAAATTTCAAGTCAA
TAGCATTTTCCAATCATAACAGTAAAAGTGTTTAGGTAAAAAAGGGCAAC
TTTGGCCTGTAAAATACACAATGCCAATAGGTTACAAAAAAAAATTGATC
CTCTGCCCAAAAAATACATATCACATGGAGTTTCCTCGCAAAATTTGAGC
AGAAAAAGTTAAAGTGAAAAAAAATCGGAGGGGGGGTCCTATCTTCAGTA
TTTTTAAAGAATGGTGACTTCAAAAGATTTGTTTTTGGGGGCCTCTTTGT
CCCCTCCCAAAATGCTTGTAGGGTTATTTTACTGCTTTAGATATTTTATG
CTTTTAATTTGTAATTATCATATTAGGTTTCTGATTTACTTGAAAAGAAG
CAGCAATGGTTTTTATCAACTCAACTTGCAAAATTAGACCAATGTCTACA
TGGAGGATTGACATCAGGGACTATCACTGAGGTATTTATAAGTAATAACT
AGGAAGGAGTAACCAAGATTCTTTTCCATTAAAATATGAAATTAATTTAA
AGACTATGTATGTATGGAGAAATCCCTCTAGAAAAACATTTTCAAATTTT
CAAATTTAAATTTTTGTTATAATGTACCTTAAGTGAATAAATTTTTGCGG
GGATTATATTTAACAAATTTTCACAAATTTTGCCTTTTTCGCAAATTTTA
ATCCCTCGCGAAAATTTTCAAACTCTCATCTCTTACTAAAATCGCGAAAT
TTAATCCTAGCGGAAATTAAGTTTTTCATGCTAAAATTTTTTTCAGCTAC
GAAACTCTCTTAAATGAGTCTCCATTACTCGAATGTCTCTATAATTCGAA
TAAATCTTCATTCCTCGTAGCCGTTCGAGTTATCGAGACTCTACTGTACA
CACAAAATCTCTTAATCAATCTAGCGAAAAATGTGAAAATCTGTAAAACT
CGCCGATTCGTGAAATTAAATCCTCGCAAAAAATTACTGTCGCAGTTAGT
TGCAAATATATAAGTCCCGCGAAAATTAAATTATTTCGCGAGGCAAGCTG
TCTCGCGAAAATTAGTCGCCGCAAAAATTATTTCCCTAAAGGTAATAATT
GAAACTACGTAATTAATTTAGGCGTAAAAACTTTCGTGAGGTAAAAAGAT
TGCTAAATTTACTGTATTTACTTTCATGAATTTGATGAAAAAATCTTTTT
AGCAAATCACTTTTGCGAATCAAGACATAATAAAAATGAATATTCTCACA
CAATGGAATGGTTCAGGGGGACAATTACTGCTTGGATTGTGTAGAAACTT
TTGTCTTTGGACTTAAAGCTTTTTACAGGCTAGAAAGTGCCATAAACTTT
ACATTTTATTTGTTTTTTTAAGTCAGAAGTTTAACAGTGCTTCTATTATG
CCAAGAATCTTTTGCGAGCATAAACTTTTGCAAATGGCCCTTTCAAGAAT
TTTCAAAGTCATTTACTTACTTTTTGCTAAAATTTGCAAAATATTTTTGC
TCGCAAAAGTTTGTATGCCTAAAGAAGTTTGTTTCCTTGTTATTTAGTTG
ACTGGTCCTCCTGGCTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATGATGCTGGCATC
CCTAGCAATAATGAGTTTGTTATCAACAGATGATCTTGACAGTTGTGTTA
TTTACATTGATACTGAAAATGCTTTTACTGCTAAAAGGTTTTTATCAATT
CCATTTTCCTTTTGGGTTTTTAGTTTTTTGATAGATTTTGACATTAAAAA
CATGTTTTAAATTTTGTTTTCATGACAATATTACTTACATATTACCAAAA
GTGTTTTCAGCCTTTTTTTTACAATTCTTCTCATCTGAAAGTTTTTTATT
TCAAAATCATTTACATTTGGACTTTTCTTATGTTATAAGGGAGGTTGTAC
TTTTACGGTGTGACAGGACTGGCCCTTTTTCAGTATAGTGCTGCGGGATT
TGACAAAAAAAGAGACAATAATTTTAAAATCAGACCAGTATTTAGCCTTA
TTTTCTGTCATTGTGACAGTATTTTAGACTCTACAAACTGGTGTGATGGT
GTTATTATATTTTCCATTTTCAGGATTCCGGGATTCAGCAAAAATTTTGA
CTGGAAACGGTGTTTCAAACCCCTACAAACTCCCCTTATAATCTAACATT
AAGCCAATCATTGATACACCCATCTTTTCATTCAAAGCAATCAAAAAATT
TATAATTTTGTTTTATATAATTGAATTTTAGGCTGTTGGAAATTTCATCT
TGTCATATTGGGGAAAACCAAACATCTCATCTTGATGTCAAAGAAATAGC
ATCAAACGTGGTTGTCTTCTATGAATCTACATTTCAAGAAATGTTAACAA
GGTAAGGCATGAAACAGTTCAAACAATATAGAATGTTTTTAAAGGAATGT
ATTACCAATGTTGATAATGTACCTACTAATGTTCTTCTTTCAAATACTCC
TAACTATAATCCTTGCAAAATATCATTTACAAAAATGACCTTTTTTATTG
AAACTCAATAAGTAACACACCTTATTTTTCTATATCAACTGATTTTTGGG
AATTGAATTTCACTTGTTTGTTTTTTGACCTACCCCGAAGGTCCTTTAAA
TTAACTGATTTGGAAAAAAATTTTGGCCGTTAAAATCGGATATTCTTAAT
TGGGGAAATTCCCTATTGCCATATATAGGGAAAACAAGCATTTCTCGAGA
TTGGCTTTATATTTTTTTCTGATTTTTTGCATAGTAATGTAAAATGGTAA
TTCTTATAATCTGATGGAGTCCGATTTTTAAAAAATAATTTTTTTGGGCA
AATTTGGACCAAAAGTGCCTAAAAATAGGGTTTTTTGGACTTTGGGGAAA
ATCACCTTTTATCGTCAATAGGGAAATCACGCTAAAATATTTATTCACCC
CATTATCTATGACTATAAATCATACAACTTTAACTATACTTCACAGGTCG
ATATCAATTTGAGCTGTGATACTCACGGTAATCTATTCAAGCTGCTCACT
ACACTTTTTTACTCTCTTGCTATTTGTCCTATTTTTATCTGATTCTCATC
ATCATGGACCTACCATTCAGCATGTTGCTTGTTTCGATTCACTTTATGCT
CATCAAAATATTCATACCAAATTAGGTTGGAAAGTCTTGAAACAATAATT
ATTGAGCGAAATGTTAAACTTATCATTGTGGATTCAATAGCTTCATTGGC
ACGTAAAGAGTTTGGTGGACACAACTTGGTAACTGAACGAAATAACATGT
TGATGAAGGAAGCTACACTTTTGAAGTATAGTCTCTAATATTAAAGAAAC
CCTCTGTCATCCCATTTCTTCCTCTTTCATATAATACTGCAATATTTTTC
CAAATTTATAAATAAACTACTCATCTATCTTGGACACTGAAATTTATGAA
TTAAAAATATTCTTGTGTAACTTATGCCATGTCCTAAAATTTTAGCAATT
TTTGCTGATGTCATAAGAAAAATGGAAGAAATAGTTTGAGGATAACCAAT
ACTTGTCACAGAACAAAGATTTCGTAATCTTTTGTTGAGTATGTTTTAAA
ATATTCAAAATTTTAATTATAAGACACCATCATTTGTGTTTTAATAATAA
ATTTTTTCCTTATCATTTCAAAAAAGACACAAAATTAATTTTATCAACAG
AGATTTCTGCATATTGCATTTTTGGACATACCATAAGTGATATTATGTAT
GAAATGTATTATGAATTTGGCAAGGATTTCAGTTTTAAATTTTTATTTTT
AGGTATTTTGCAGAAAGGTTCAATATACCTGTAAGTTTTTATCATTACCT
TTCATAACGTGGGTTAAAATCTAACGCATTTTGATGTTAACGTTCTTTTG
GGTTTCTGATGGTTTAAAGGCCAATTCAGGATTCTTGGAGAACCTTTATT
GTTTACATACCTTTCTGTTAGTTTAGGGAGAAAAGAATTTTTCAAATTTT
TCATGTGCAACCCGCATTTATTGATTTAAGAATTGTGAGATTTTCATTGA
CATCGGAGAGAAAATAAAAATGATCTAAATGATAAAATATTTAATTTCCA
AGTACCATTTTCAAAGAATGGCTTGACATTTATTTTAAAGGTCTCCTCTG
ATCTAAACTAAATTTCAATTCTTCATTACACCCCTGTGTCACTGACCCAC
TGCACTGGGACCCCAGCCCCACTGGAAAATTTAGCAAAAATGTCGTCCCC
TTTGGGAAAATACCCTAGAATTTCAGCCCCACTGGGAAAATAACTTTGAT
TTCATCCCCATTCGAAATTCAATGTTAAAAAACTGTACTCCAAAACCATC
CCTATTGGATGTTTTAACCTTGGAACAATAGAATTTCTATCCCCATCGAG
AATTCAATAGGAATGTTTATCCCCACTGAGGAGAAAATTTCCAGTGGGGC
TGTGAGAAGTATGAAGACTGTGATGACATGTGAAGCTGTATGAAGTGATT
TATTCATATACCTCTTGGTTTTAGGTTTTGGTGACCAATCAAGTAACAAC
AAGCACATCTTCAGAATTATCCAAAGATTCTTGCCTGATAGCTGCACTTG
GGAATACCTGGGCGCATGCTGTTAATACACGGCTCATGATAAGACACTCA
AATGAAGATCATAGTATCAGAGAGGTATAAACATCGAATATCAATAAATA
GAAATGTTTTTTTTTGTAAGTTATTTTCTACTCCTTTTTTAGTGTATACC
CAGGGGGTTGAAGTGTCTTTTCAAGTAAAAAATACGATATCCAGGGGTAA
GCATCTTCATAAGAGAGAATATCCATGGAGTTGAGCATATTTTTAAGAGT
GGATATCCTTACTAATATCTTTACTAATAAAGTAGGATATTCAGGGGGTT
CGATACTTCGAAAAATCAATACCCTCAACAGTAGGGGTATAATATTTTTC
TGGAAAAGCCCAATACTCAAAAGGCTTTGGGTGCTGTCAAAAACTATCTT
CTTTCTCTTCTTGTTCCAGTTGTTGGTTGCCAAGTCACCTTTATGTCCAC
TGTCCAAGTTTCATTACAAGATAGATGCAAGTGGTATTGTACAAGTTGAT
GACTTAACCATTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:543157..551121- >XLOC_009573 ID=XLOC_009573|Name=XLOC_009573|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1974bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:543157..551121- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTAACAAACGTCTAAACCGGGTTAGAGGACTCCCTCAAGAAAATTG
TGCTGAGCTGGCAAAGCATGATGTTCTACTTTGTAAAATGGCTAACAAAC
GTCTAAACCGGGTTAGAGGACTCCCTCAAGAAAATTGTGCTGAGCTGGCA
AAGCATGATGTTCTACTTTGTAAAGACGTTCTCACAAAGAACATATTGGA
ACTCATGAGTTTTGGACTTGATTACAATGAATCTAAAATTGTTTTTGATT
CAGTATCAAAATCAGTTGCACCAAACTCAAGCAAGGACGTTCTCACAAAG
AACATATTGGAACTCATGAGTTTTGGACTTGATTACAATGAATCTAAAAT
TGTTTTTGATTCAGTATCAAAATCAGTTGCACCAAACTCAAGCAAGGTTT
CTGATTTACTTGAAAAGAAGCAGCAATGGTTTTTATCAACTCAACTTGCA
AAATTAGACCAATGTCTACATGGAGGATTGACATCAGGGACTATCACTGA
GGTTTCTGATTTACTTGAAAAGAAGCAGCAATGGTTTTTATCAACTCAAC
TTGCAAAATTAGACCAATGTCTACATGGAGGATTGACATCAGGGACTATC
ACTGAGTTGACTGGTCCTCCTGGCTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATGAT
GCTGGCATCCCTAGCAATAATGAGTTTGTTATCAACAGATGATCTTGACA
GTTGTGTTATTTACATTGATACTGAAAATGCTTTTACTGCTAAAAGTTGA
CTGGTCCTCCTGGCTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATGATGCTGGCATCC
CTAGCAATAATGAGTTTGTTATCAACAGATGATCTTGACAGTTGTGTTAT
TTACATTGATACTGAAAATGCTTTTACTGCTAAAAGGCTGTTGGAAATTT
CATCTTGTCATATTGGGGAAAACCAAACATCTCATCTTGATGTCAAAGAA
ATAGCATCAAACGTGGTTGTCTTCTATGAATCTACATTTCAAGAAATGTT
AACAAGGCTGTTGGAAATTTCATCTTGTCATATTGGGGAAAACCAAACAT
CTCATCTTGATGTCAAAGAAATAGCATCAAACGTGGTTGTCTTCTATGAA
TCTACATTTCAAGAAATGTTAACAAGGTTGGAAAGTCTTGAAACAATAAT
TATTGAGCGAAATGTTAAACTTATCATTGTGGATTCAATAGCTTCATTGG
CACGTAAAGAGTTTGGTGGACACAACTTGGTAACTGAACGAAATAACATG
TTGATGAAGGAAGCTACACTTTTGAAGTTGGAAAGTCTTGAAACAATAAT
TATTGAGCGAAATGTTAAACTTATCATTGTGGATTCAATAGCTTCATTGG
CACGTAAAGAGTTTGGTGGACACAACTTGGTAACTGAACGAAATAACATG
TTGATGAAGGAAGCTACACTTTTGAAGTATTTTGCAGAAAGGTTCAATAT
ACCTGTATTTTGCAGAAAGGTTCAATATACCTGTTTTGGTGACCAATCAA
GTAACAACAAGCACATCTTCAGAATTATCCAAAGATTCTTGCCTGATAGC
TGCACTTGGGAATACCTGGGCGCATGCTGTTAATACACGGCTCATGATAA
GACACTCAAATGAAGATCATAGTATCAGAGAGGTTTTGGTGACCAATCAA
GTAACAACAAGCACATCTTCAGAATTATCCAAAGATTCTTGCCTGATAGC
TGCACTTGGGAATACCTGGGCGCATGCTGTTAATACACGGCTCATGATAA
GACACTCAAATGAAGATCATAGTATCAGAGAGTTGTTGGTTGCCAAGTCA
CCTTTATGTCCACTGTCCAAGTTTCATTACAAGATAGATGCAAGTGGTAT
TGTACAAGTTGATGACTTAACCATTTAATTGTTGGTTGCCAAGTCACCTT
TATGTCCACTGTCCAAGTTTCATTACAAGATAGATGCAAGTGGTATTGTA
CAAGTTGATGACTTAACCATTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:543157..551121 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 892-987:97 |
| Aaloc | 742-891:592 |
| Aaloc | 715-741:1313 |
| Aaloc | 565-711:1940 |
| Aaloc | 445-561:2834 |
| Aaloc | 304-441:3519 |
| Aaloc | 199-303:4690 |
| Aaloc | 88-198:7593 |
| Aaloc | 1-87:7966 |
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