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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000098_pilon:755632..764730+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_009324 ID=XLOC_009324|Name=XLOC_009324|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9099bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:755632..764730+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGCATTTTGGAGGTTTGTATCTTAGGTTttccactttcactttcaacaaa
attcaaaatggcggccgtTGGAGCCTTTACTTCTATGGATCAAGCTGAAG
GTAAATCCATTTCAAGCTATTTTTCCTCCCTAGAGATGCATATCTTAGTG
TGTAAAAGAAAGTCCGAATGCTATAATCGACTATTTCTTTGTTTATTAGG
AATCATGGCAAGGTAAATGTCACAGGCCAATCCTTTCTTTATTTccatta
tttattttcaaatgtcaaaacaaagggccattccagaatttgtctgtaac
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aaattcgaaatttccgaggcgagagaagaaaatatatggatttccaaggc
aattgaattaaaaaggcaaaaagagtggaatttccgatgcattttgcaaa
agtacatggatttttatcggaatttccgaccaccactggaaaagaaaaat
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CGGCGCattgcttgcgagtcaagtaaacgatataccGCTTTTGCGCCTCT
CTGATCTTTGATAAGCATATTTCGGCGGGACCCTTGTGCGACTAACTGCC
ATACAGTCATCAATCTAACTtgtcaaatcaatcaaaaaacttaaaaacta
atcagtgcgtcacaaaccgccatataaacaaaattcaacattctcacaaa
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ttcaaaaatcaaaaattcatttatcattcGCGaaaacaaataataataat
gaattaatattacatactaagtaagacgcccccgttttttactctcgttt
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ctgacaattatcaaaattgatgatgatgatttttttcggtcaggcgaatg
tctcgtattgggggttctagtcttgactcctaagcctacgcgagattgaa
gcatttgggtaaacgagacaaaactccaaaaaagctggtgttttgaagcg
cttccatgcgatcgaaatatcgctgtttgtgacgcactgctAATCAAACT
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AGTTTGATAATTTCAAAAACCCAATTTTGTTAAACAAGTACATACATGTC
ACTCCTTGGAATATCAGCTTCTGTTTTCAAAGCTAAATTCTATTACAATT
TTTACCCCGTATTTTAGAAAGGAAGGGCAGCATCTGTTGACAACAAAATA
GGGGCCTAGCTAGGATCTTGAACCGACAACCCTTCCCATTTGTACGTACA
CtcattttatatttgatttctgAGTATGGGAAAATTAATGCTAACAGCTG
TTATAGGGAGAACTTCAAtttagggggtacttaggccaaaataccgtaag
ttggtctaatatcgacatccctcgtctaatttcgacacccttctttagag
acaggaacaATATtgctgattgaaaaaggattattcctctctgaccacta
agcaaagaaaaacagtttcaacctttctatcaatttcagctgatttaaaa
agggtgtcagaattagaggagggatgtcgacattagactaaGTTACGGTA
GGTGCTGTGTATATTTGTCATTCATATGACTAAaagttcaatttcaaaat
aactGTAAACTGCATTACtaatctgacaaaacatgggacggcaatttggc
caccatttcagccaccatttcactgaacctccaaagtcatttgatttgag
ttaatgaatgaACAGCGTATataaaaatacatgatttctctttcgtaCCG
TAGTAGGCTttcaaatcgaaatatgaaaaaatccgtagtggaacatgATG
GAGCGTATGTATGACATCACTCACGCATTAAGTTACatcatagtttctag
aggggtcaagacctcccccttaggtaagaggacctcccccttaagtgcta
accccccttcgaaaattcatttaaaatttcaccccccccccccttagaaa
atcagtataaatgagatgaaaagaatttttttttgtttaaattaaGGAAG
ATCCCCCTTATCTAATAAGACCCCaccttaggtaagaagaccccctCTTA
GAAAAGTCATACTTTTGACACCCCACCTAAATGTTGtaggggggtagaaa
ctatgtacacactcgttattcatggctccgactgggtttctaggtccccc
cgccaaatttaggccccccccctgagaacaaggtccccccagcctgataa
aattttaggtcccagtgcagtataggggaaaaattttatggcattcacaa
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tttagcccccagacttacataaactaatgcaggtccccccaagatagagc
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attttaggtgtagctcccccCGCTCAGACGGAGGGGGGTGCGAGCTAtgt
tatttgttaatctcatCAGGCAATAGGCGGTTAGGTGGCGgcggcgttct
ctaattctccaatcagcgtccggacattttgaataaaaacaaaaaagtta
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tatgattgataaacttggtggagttatcaaaacaaatttgttgtcataga
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ttgaccaatcgtcccaagttagagcagttgacggtagtacctttacaaaa
tttaaagttttactgtGGTTCATCTTTGAGATTGACCTTTTTTCATGGAG
AGGAATAGTCAATGTTTAcatatgacaaaaaggccaatctcaaaggcaga
acagaattgcaagatttccaatttttcaacacacttattttgagattgaa
cctttagtcatgtggacGGTGTATGTGCATGTCTTGAGGGTCAGTTTTCt
caccttccaaagtctctctaaaggtcggaaaaatcataaagttttaaatt
agtctctctaagggtcggaaaattcaagatttttaggagattttttttga
ttttttacgaTATAGGAATAAATGAtggacaaatttattttctaaatttg
atttattatttcaaTATGAGCTgattagggagtggtcagaaagtatctac
tagggtggggtggaggatattttcaaaaattccaaaacaaaTATGCACCA
CCCCCCTTTGATATCCCAAAAGAATTTCAAGCCTCCCCCCTAATAAGCTC
ACAAAAGTGCAGAAAGCTTGAAATTTCATGGCACataaagttttctttgt
aattttggtGTCAAAGGGATAACTTTGGTCTTAGAAAagtcaaacagctt
aaaggaGGTCTTAAAAAGGTCAAAAGCAGACAAGGAACATTTGAAATCTA
TattaatgagaaaaaaattggaacccctTCCCCCTAgttagtagatactt
tctgaccactcccttacaTAACTTGCATTTGAGGATAAAGTTGATTTCAA
CGGCTAAGATGGCTATTTAAGTATATATCTAAGAAATGCTGTCTTCAATA
aagattcaataaaaaaatttaaatttttcttttttcagatttaaaagCAT
TTGAAAGACGGTTGGTAGAACATATTAACAACCTTGGACCAAAAGCCAGC
TTTTGGAAAGGtttgctttaaaaaatatatatttttgtttaaaattatgG
ATTAGTTTTGTTGATACATATAAAGCTGCTTCCTGATCTTGCAAAAGCGA
TGCAAATAATTTACTTGGACCATCAAAACTGTAGACCATccgtttttaaa
atcttttttcaacattttcaacgtcTAAGCATTCTATGGCCTGCCTTATA
TGATTTTAGAAAGAAAAGATTGTCAAGTAGAACAATCAACTGACATGTTG
TGCGCTGATTTGTTTAGATGATTCGTTTAAACAATAGCAATGTTTTCGAA
AGTTCAGCAGATATTTCATAGCGAATCCGACCTCCTTTTAAATACCATTA
TCATTAACTTAGTTTTTACTAATGTAACCTTTTACTCtgaatttcttatt
tttcagtgGTTGTGCTCATCACATTTCTTGTGACTGCATTTACTGCTTCA
CAATGGGCTCTTGACCAACAAACTGTAGAAGTAAGTTTAACCTTCAGTTC
GAAAATTGCATAGCATCGCTCAGCGCTGTGAAATTTCCCAATTTCAGCAT
GGTCAAATTCTGCAACCTAGCTGAGTTTTCTTATCAGCTTAGAAAATTGC
AGAAACACAGTGTTGCAAAACTCTGAAATGTTTGTGTTGTCAAATACTAC
AACGTTTAAATGTTGAGAAAATAAGGTCTCGAAATTCATGTGCTTTTTGT
AGAGCAACCCAAAAGTAAACTCTTTATCCTAGGATTTTAAAGGGTTTAAG
CAATTGGTCCgtgtttataataatttttaacACAAGCTTCAATTGGAAAT
CGTTGTGTATAATTGCACACTGCTGTGGAAGCATcgcaaaaaattacaaa
ttaaacTATGCTATAAACTCCTTTAATAAATCACATGCATTTAAATAAAC
TTTCCAGATCTTTCCGACAATGTTTCAACGTGTAACAtatagatttttaa
atatttttggttgaatGGTCTACTGTAGAAtctaataacatttttaaaac
ttttttgttttaccCAAATAGCAATGTAAAATTATATCATAAAATTGTTA
ATCTATGTTACTGTTGGCTGTTTGATGCAATGAagtactctttttttttt
tgaaagttccctcttttaccctaattctgctgtattagcctccttttcga
aaattttccacccaggacattatttattatttattccaaccacccccccc
ccccccgcttattattaagttttcagattttttccaaaccccccgcttat
tccaaaccccccggctattaggtacccgagagtatctaTCTTTATTCCAA
CTGatctatttattttattttttcagttatcgTTTTGGCAATCGTTATGG
AACCATCCCAGTTTCTTTTGCAGCATTGTTGCTATATTCATATTATTTCT
TCTTGGTGTTCACAAACGTATTGTCATCAAAACAATGTATCCTTTCACAA
CAAATCGAACCGTGTCTTCTTATGATAAGCTCCTtattactttcgttttc
aaccacaCTGTTAGTGTAATTAGACAAATTcccttttgagaattttttct
aTTCATGGTTAGACCAACCTCTAGACgatatgaaaagaaaattttcatca
aaaattctGCATAAATCCTTACAAAATGCTTGTTTTGGGCACTCCTTATA
AGGATTAAtgctaaatttcaaaagttcttcTCATACGCGCCAAATATAGC
GGCGCCGCCTCAGTCACTCCAGCATGACCCTGCTACTTATAAAGTGGAAC
TGAAGCCCCTTTCATTCTAGCTTTTTCcttgactttcattttcattgaaa
ttgcaGAATGTTGACACGATGTCGGAATGTTTTAGAAGATTTCAATATGT
CTTGTGATGAGGTAAGGAGGCGGTCATTGAAATTTAGTTTTTCAATCATA
TTTGTGCTCAGTCACTGACAAAGCCGGAGGTAAAGGGATAGGGATTAGTT
TGGTTattttcatcatcatctttcATCATTTTTCGACCGCCAATTGGTGA
CGCGGTGTCTCATCTATTCTGAGTTCAGTGCTCCTACTCACTGTTTGTGC
AAAAATGAGTTTCCTTGGACATTGTTCTGGTATGATCTCAGAAGAGGGTA
ACATGAAGAATCAGTTATTACTTTTCGCTGATTGATTTCAAGAGTCGTGG
TCGCTCAAGGCATTTTCCAGATAATATCTTCTGAGTTCAGTGTTCCTAGA
AAAATGTGTCGACTGTGCTGTTATGATCTCGGAAGAGGCACGATGCATTA
TTAGGGTGATTATTCACCTTATTTCGACTACTGTAGCATTCGATcacaaa
tgtttttcattttgaccttttttactttgctttttcttttttgttgcaaa
aagttacgtgactttttttgaaattcaacaccGCTTCTATTTCCGCACTA
ATGATAAAAACCAACtaaaaaaatacatgttttGAATACATGTTCTTTCA
AGACACTTCTTTCATAACATCACTTTCCTTTCACTTTTCGGTTTGCTTTT
ACAATTTGTACTTAGAAAATCTGCTCTTGACTGTATAAGGACTTAAAAAA
GCCTTCATATTATATAATGTCACAACCAAGTGTCGAAATATCGTTCTGCA
TCCCTTCTGGAGCTTCCACCAGTTCGTCGAGCAGCTCACCTCTCAGTTGT
GATATTATACttggaattttccaaaaaaagttgtttGCTTTGGAATTTAG
TTTGCCTAGATCGTCTGTTTTTGTTTGTTGTCCAATTATTTTATTTGGAT
CAATTGTTGAGTAATTGCGATTGGTTGGATATTGTTTGCTTTGAACAACC
AAGAAAGATAAAGCATTGTTTAACTTTGAACAATAAGACTGTTGGCAGAT
AGAAGACATGTACATTATTATAGCAGTACTTGGAATCATCTTGACATGTG
TCTGTCTTGTTTTACATTTCATTGCGATTCGAAGTCTATGGAAGGAGAAA
CAAGAGAGAACGAAGCAACGATGCATTTTATTAAACATCAACGCGTGTGA
AACGATTTTATTATTGACTTTCATACCGTATTGGATATCAATATTTCTTG
GTATTGAGCACTATCGATTTGTAACGGCATCAATGGCTTTAAATCACGCC
AGTTCTGTCAGTGTAACCCTCATGTTGATCATTCTTACGGCCGACCGATT
TATTGCTTGTTATACTCCATTAAAGTACCGCACATATATCACTCAATTTC
GTGTCCGTATAGCTCTATTTACATCATGGGTTATCGGTGGCTCGTCTTTT
TTGGTTTCCGGATTTATCCGGTTGTACGGTGGCCCGAAGATAATTTCGCA
TAAGACTTATGAGAATATGATACTCCTTGGATTCTATGTTAGCTCATTCT
TGTGCTGTTTTGTGACTTACGCATACATGTACGTAGCCTTGTTTTCTATT
AAGAAACGTCAGAAGAGCAGGAGAGACCGTTGTATGTCTTACGCTATTCA
ATACCATTGCTCATCCGGTTCAGTACATATTCGATTGAAACGTAAATTTG
TGATTTTAACATGTAACAATACCCTTAACGGCATCCAAAGATTAGCTCAT
CTCGGTGTGTTTGTAACCTTAACTTTTGTTGTCTTTTCATTGGTTCCCGC
GATAACGGCGGGCTTTATCAACTACCATGACGCATTTCGGAAAGACGTGA
GCTTTCAACGACAACTCTTGAACTGTACTTGGGAGATTAGTTTCTTCACG
ACTCCCTTGGTGTATGTCTTTGGCGCTAGATGGCCGAAAGCCGTACTAAG
ATTGTGCCATTGTGGATGTTAGAAAATCGATTAATACTAAAACGGAGGTT
TCGACATTTTGGATTGTTGGCCTTTTctcttaaaaagatttttgaaaatc
tcaattCATGAAGATgtgaaattttgattgaatgGGACAAAAGTGTTTCA
ATGTATGTAGTAGCGGTACAATTATTCTAAATAACGGCGGTTCTTAATAT
ACAAGGGGGATTTACAAACTTTCTGTTGAAATTGTAACGTACtttttttG
TAACGAAAAGAACTTTTTGTTGATTACTGAATAAAAGAACTTATTGAGAA
ATATACCGCCTAACGCTCtctttccttctttaaactgcAATTCCCCCGaa
aaaaaaGGACGTTCGGTTACAAGCTTCTAATACTGTATTgcaaaataata
tcaaaatgtATTCATTTTTTAGGATAAGGAATATAAAGTTTTACACAGCG
TTTAACCAAAGAAGCAAATtaaaaactctcaaaaattgTCATTGTGAAAT
TTTATTATAATCTTTCCATAGATTGGTCGACTGATATTGAAACCGAGACC
AAAAGAAATGGACATCTATCAACGTTTATATAACCCTGGGCATGGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:755632..764730+ >XLOC_009324 ID=XLOC_009324|Name=XLOC_009324|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=978bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:755632..764730+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGCATTTTGGAGGTTTGTATCTTAGGTTttccactttcactttcaacaaa
attcaaaatggcggccgtTGGAGCCTTTACTTCTATGGATCAAGCTGAAG
CGCATTTTGGAGGTTTGTATCTTAGGTTttccactttcactttcaacaaa
attcaaaatggcggccgtTGGAGCCTTTACTTCTATGGATCAAGCTGAAG
atttaaaagCATTTGAAAGACGGTTGGTAGAACATATTAACAACCTTGGA
CCAAAAGCCAGCTTTTGGAAAGatttaaaagCATTTGAAAGACGGTTGGT
AGAACATATTAACAACCTTGGACCAAAAGCCAGCTTTTGGAAAGtgGTTG
TGCTCATCACATTTCTTGTGACTGCATTTACTGCTTCACAATGGGCTCTT
GACCAACAAACTGTAGAAtgGTTGTGCTCATCACATTTCTTGTGACTGCA
TTTACTGCTTCACAATGGGCTCTTGACCAACAAACTGTAGAAttatcgTT
TTGGCAATCGTTATGGAACCATCCCAGTTTCTTTTGCAGCATTGTTGCTA
TATTCATATTATTTCTTCTTGGTGTTCACAAACGTATTGTCATCAAAACA
ATttatcgTTTTGGCAATCGTTATGGAACCATCCCAGTTTCTTTTGCAGC
ATTGTTGCTATATTCATATTATTTCTTCTTGGTGTTCACAAACGTATTGT
CATCAAAACAATAATGTTGACACGATGTCGGAATGTTTTAGAAGATTTCA
ATATGTCTTGTGATGAGAATGTTGACACGATGTCGGAATGTTTTAGAAGA
TTTCAATATGTCTTGTGATGAGATTGGTCGACTGATATTGAAACCGAGAC
CAAAAGAAATGGACATCTATCAACGTTTATATAACCCTGGGCATGGTTAA
ATTGGTCGACTGATATTGAAACCGAGACCAAAAGAAATGGACATCTATCA
ACGTTTATATAACCCTGGGCATGGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000098_pilon | genome | sc0000098_pilon:755632..764730 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 412-489:9022 |
| Aaloc | 358-411:6558 |
| Aaloc | 247-354:6077 |
| Aaloc | 175-246:5159 |
| Aaloc | 103-171:4691 |
| Aaloc | 1-99:1 |
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