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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000043_pilon:688301..692812- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_008590 ID=XLOC_008590|Name=XLOC_008590|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4512bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:688301..692812- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAATGAGTCTGTTGGACATCATTAAGAAAAAGTGAGTTATATTTTT
TCTCACCTACTTTGATCTTAACATGATGAAACTAGTCCGAATTTCTGGCA
GAGCATTTGTTTGTATTTAAAGTATCTGTTAGTATCTGTAAATTAAAATT
CAGTAAATTCTAGTTTGACAATTGGTAAATTCTCAAAAATCTTGTTTGTT
GATTGTGTCCCTGGGTGGCATGACTGTTAATTTTTCATGCCGAGACAAGA
TGTGATAATTTCTGGGCCAGAAACTGGAAAATTTTTTGAACTAAACTTGC
TCTGAATACTGAAATTTTAACAAAATACAAAATAATGCTTTTTTTATTTT
AGAAAGTCAAATGAATGTGTGAAATTACAAAAAACTGGAAAATTATATAC
TATAGATTTTCCTGAAAAAGAGGTAATTTTTTTTATTTTTTGTTTAATCA
TGACTTGTCAACACTTTTACCACCACATGAAAAAATAATTTTTCTATTGT
GGTCTCTACAGTGTAAGAGAAATTTGTGGTTCGTTTGCAGAATAGTTTGA
ACTTGTAGCTACTCTGTCAGAAACCTTTCAAACAAGAAAATCTTTGGTAA
TCAAAGAAGTTCCTCAAGAGTTGATTTTCACAAAGTTTGTTCCTTTTCTT
GTTATGTTCTTGCAAAGATTTTAAAATACCACTTTCTAGAATTTGCACTT
AGCTGGAATTAAGTACTTTCAAAAATATATGGATTCATGAAAGTTAGATC
TCCAAATATACAGCGTTCTTGAAAAAAATTCCCTCCAAGGAGGGGCTATT
TGAAATAATACCGTATGCTGAAGCTTTTGTGTCCTAATTTGCAATGGAAA
ATCAAAGCAAATTTAGCAATTTGAGAAACACTTTTACCACCACATGAAAA
ATTATTTTCTATTGTGGTCTCTACAGTGTAAGAGAAATTTGTGGTTCGTT
TGCAGAATAGTTTAATTTGTACCTACTCTGTCAGAAACCTTTCAAACAAG
AAAATCAATCTTTGGTAATCAAAGAAGTACCTATTTTAACAAAGTTTGTT
TCTTTTTCTTGTTATGTTCTTGCAAAGATTTTAAAATGCCACTTTCTAGA
ATTTGCACTTAGCTGGAATTAAGTACTTGCAAAAATATAGATTCATGAAA
GTTTGATCTCCAAATATACTTAAATTTATGAAAGTAAATACCGTAAAATT
TTAAACTTGAGCCTGGAAGCTTAAGGTATTCAAATACCGTATTACCCCGA
ATAAACTAAAAGAAGGTACTTGTTTCAAATAAACGCCCTTCCTTTAAAAA
AAATTTCCTCCAAGGAGGAGTTATTTGAAATAATACCGTATGCTGAAGCT
TTTGTGTCCTAACTTGCAATGGAAACAGATGGAAAATCAAAGCAAATTTT
GCAATTTGAGAAACACTTTTACCACCACATGAAAAATTATTTTCTATTGT
GGTTTCTACAGTGTAATAGAAATTTGTGGTTCGTTTGCAGAATAGTTTAA
TTTGTACCTACTCTGTCAGAAACCTTTCAAACAAGATCCTTCAAATGTAA
AGTCTGCTAACACAAAACTACTAACAAAAAGGGAACTTACTAAAAGAGAC
ATAACTTTCTTTCATTTTCAGACCCAACATGGTATTGACGAATGTAATGT
ATTACCACAAAGGAAATTGAAGAAATTTACAAACCCTGACAGCTTCAGGA
CCTTGGATGACCTTTGTCAAGAACTGGAAAAATTTATAAATACAGAGAGA
AAAGTTGGAGAAAAGCGAAAACTTGATGAAAAGAAAACAAATGTCAAATC
ACGGTCTTTTTATATTACTGAAACGTGTCTTTGCAAATGTCTGGAACGTT
GTATTAACGAGAAAGGGTTCTATTCTATCCAAAGTTTGAAATATTTGATA
AAAAAGAAACTGATCACATCTGCACTTCACGGGTTATTGGTGGAATGTTT
TATGAAATATGATGATATTGGACTAATACAAATCATTTCAACGTCTATTC
GGTTAAAAGAATATCTTGTTGTTAAAGTTCTGTTAAATGTTATGGGAAAA
ATGGAAAGCGGTACATGTGAACAAATAATTTTAAACCAAGACTTGAATAT
GTGTTTAGTTTCTACTGATATTCTACAGAGATTGTTGTATATAATTTCAA
TGGAGATTGATTTTACAATATTAAAAGAACAATTTAAGTTAGTGGTTGCA
AAAGAAGCAATGACCTTATTGAAAATACTGCAATACATTTTAAACCAAGT
TTCAAATGCACTGGAAAAAGATCCTGATTTTGCGTTGAATGTTCAAAACA
TCACTGAGAAGAAGGTAAAATTATTTTTATTAAATTTCTATTTGGCAAGT
GATGATAACAAAGGACTTAGTCATGAACAATGACGATAGATAATTCCTCG
TTTCTAATGCAAAGAATACTAAAGGAGTAGGCAGTTTATCAAAAATACAT
TAAGCTCTGCAAAGTTTCTGAAATATTTCCAGATGTACGTAATTGCAAGT
GATGATAACAAAGGACCTAGTCATGAACGATGACGATAGATAATTCCTCG
TTACTGAAGCAATAATCTTTTTCTTTGGGTATTGATATTTCTCCAAGAAG
TGCAAGTGATGTAAACACATCCTTATCTTTCGAAATGAAGACAGTTAATT
CCTCGTTGCTGATGCTCTTCTCGCCCTGCAAGGTTAAGGCACTCAAATAA
GGAGATTCGGGATGAATTTGGAACATATTTTTCTGTGACTCATCCCCAGA
ATATAACGTCAGAATAAACCAAGAATTGATTCTATTTTGCCCCAGGTACT
CGGATGGCTTGATTCGCTGGTCAGTGCACACACCATGACATTTGCAACCT
CTCCTCTTATGAAGTCTTCAATACAAAACCTCGATACCTCCACTAAAAAA
CAGGTAAACAATCAAATTTTCAAGTCTTGCAGTTTCCCTTTAACCCCTTA
TGAAAACTTTTGCAATTTCTGAGCTTTTACCTTCTCTTCGTCAAGAAGAT
GTCTGATTATTTCTCGTGGCCACTCAGTGAAACTAGAAGGTCGATAGTAT
CTTTGTGATGAGACAAGTGATGATTTTTATGTCAAAATTTGAATGTTGAT
AGATAATTCCTCGTTTCTGATGTCTCACAACAAAGCACGTCACACAATCG
AATTTTCAAGTCTGGCAGTTTCCCTTTAACCCCTTATGAAAACTTTTGCA
ATTTCTGAGCTTTTGCCTTCTCTTCGTTAAGAAGATGTCTGATTATTTCT
TGTGGCCACTCAGTGAAACTAGAAGGTCGATAGTATCTTTGAGATGAGAC
AAGTGATGATTTTTATGTCAAAATTTGAATGTTGATAGATAATTCCTCGT
TTCTGATGTCTCACAACAGCACGTCACACAATCGAATTTTCAAGTCTGGC
AGTTTCCCTTTAACCCCTTATGAAAACTTTTGCAATTTCTGAGCTTTTGC
CTTCTCTTCGTTAAGAAGATGTCTGATTACCTTAAAGGAAGAAATTTTGG
CGGGAATTTAATTTGGCGGATGGTCAAAAAAGTTTTTTCAGAGGGAATTT
AATTTGGCGGATGCACGAAAAAACTAAATTTGGCGGGAATTTAATTTGGC
GGTCGCTTAAAAATTTAACCTTAAGATGGCGTCAAAACAGCGAAAAAATA
GCAAAAACACCTTAAAAGAGATCACATTTTCAAAATGTTTAATTTGGCGG
GAATTTAATTTGGCGGATGGCGGAAAAAAGAAATTTTGGCGGGAACTTAA
TTTGGCGGATTTCAGTCAAATCCGCCAAATTTTCTTTCCGCCAAAATTTC
TTCCTTTAAGGTATTTCTCGTGATCACTCAGTGAAACTAGAAGGTCGATA
GTATCTTTGTGATGAGACAAGTGATGATTTTTATATCAAAATTTGTATGT
TGATAGATAATTCCTCGTTTCTGATGTCTCTCAACAAAGCACTTCACACA
ATCGAATTTTCAAGTCTAGCAGTTTCCCTTTAACCCCTTATGAAAACTTT
TGCAATTTCTGAGCTTTTACCTTCTCTTCATCAAGAAGATGTCTGATTAT
TTCTCGTGATCACTCAGTGAAACTAGAAGGTCGACAGTATCTTTGTGATG
AGACAAGTGATGATTTTCATGTCAAAATTTGAATGTTGATAGATAATTCC
TCGTTTCTGATGTCTCACAGCAAAGCTCATTTGTTATATTATTATATATT
ACATTACATTATTAGTGCATTCATTAATCGCTTGAAATTTCTATCCATTT
ATTTGCATAAACCTAAACAAGTTAACATCGCATCGTTAACTGTTCTTGAT
GAGTTGAGATGGATCGGGTTATAGCCAGTCCTATCTATCACTATTGCATT
GACATTTTTCTCGAGGCTTTAAATTTTCCCTTGTTTGTTTTTCAGATTGG
ATATTACCGGACGATAGGCGAACTATTTCCCTATTTGGATGTACTTCAAA
AATCTTACGAACTCCCATCTCGAAGGCTTGAATTGTACTCCATCGAAGTT
ATTACTTTATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000043_pilon:688301..692812- >XLOC_008590 ID=XLOC_008590|Name=XLOC_008590|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2046bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:688301..692812- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAATGAGTCTGTTGGACATCATTAAGAAAAAATGGCAATGAGTCTG
TTGGACATCATTAAGAAAAAAAAGTCAAATGAATGTGTGAAATTACAAAA
AACTGGAAAATTATATACTATAGATTTTCCTGAAAAAGAGAAAGTCAAAT
GAATGTGTGAAATTACAAAAAACTGGAAAATTATATACTATAGATTTTCC
TGAAAAAGAGACCCAACATGGTATTGACGAATGTAATGTATTACCACAAA
GGAAATTGAAGAAATTTACAAACCCTGACAGCTTCAGGACCTTGGATGAC
CTTTGTCAAGAACTGGAAAAATTTATAAATACAGAGAGAAAAGTTGGAGA
AAAGCGAAAACTTGATGAAAAGAAAACAAATGTCAAATCACGGTCTTTTT
ATATTACTGAAACGTGTCTTTGCAAATGTCTGGAACGTTGTATTAACGAG
AAAGGGTTCTATTCTATCCAAAGTTTGAAATATTTGATAAAAAAGAAACT
GATCACATCTGCACTTCACGGGTTATTGGTGGAATGTTTTATGAAATATG
ATGATATTGGACTAATACAAATCATTTCAACGTCTATTCGGTTAAAAGAA
TATCTTGTTGTTAAAGTTCTGTTAAATGTTATGGGAAAAATGGAAAGCGG
TACATGTGAACAAATAATTTTAAACCAAGACTTGAATATGTGTTTAGTTT
CTACTGATATTCTACAGAGATTGTTGTATATAATTTCAATGGAGATTGAT
TTTACAATATTAAAAGAACAATTTAAGTTAGTGGTTGCAAAAGAAGCAAT
GACCTTATTGAAAATACTGCAATACATTTTAAACCAAGTTTCAAATGCAC
TGGAAAAAGATCCTGATTTTGCGTTGAATGTTCAAAACATCACTGAGAAG
AAGACCCAACATGGTATTGACGAATGTAATGTATTACCACAAAGGAAATT
GAAGAAATTTACAAACCCTGACAGCTTCAGGACCTTGGATGACCTTTGTC
AAGAACTGGAAAAATTTATAAATACAGAGAGAAAAGTTGGAGAAAAGCGA
AAACTTGATGAAAAGAAAACAAATGTCAAATCACGGTCTTTTTATATTAC
TGAAACGTGTCTTTGCAAATGTCTGGAACGTTGTATTAACGAGAAAGGGT
TCTATTCTATCCAAAGTTTGAAATATTTGATAAAAAAGAAACTGATCACA
TCTGCACTTCACGGGTTATTGGTGGAATGTTTTATGAAATATGATGATAT
TGGACTAATACAAATCATTTCAACGTCTATTCGGTTAAAAGAATATCTTG
TTGTTAAAGTTCTGTTAAATGTTATGGGAAAAATGGAAAGCGGTACATGT
GAACAAATAATTTTAAACCAAGACTTGAATATGTGTTTAGTTTCTACTGA
TATTCTACAGAGATTGTTGTATATAATTTCAATGGAGATTGATTTTACAA
TATTAAAAGAACAATTTAAGTTAGTGGTTGCAAAAGAAGCAATGACCTTA
TTGAAAATACTGCAATACATTTTAAACCAAGTTTCAAATGCACTGGAAAA
AGATCCTGATTTTGCGTTGAATGTTCAAAACATCACTGAGAAGAAGGTAC
TCGGATGGCTTGATTCGCTGGTCAGTGCACACACCATGACATTTGCAACC
TCTCCTCTTATGAAGTCTTCAATACAAAACCTCGATACCTCCACTAAAAA
ACAGGTACTCGGATGGCTTGATTCGCTGGTCAGTGCACACACCATGACAT
TTGCAACCTCTCCTCTTATGAAGTCTTCAATACAAAACCTCGATACCTCC
ACTAAAAAACAGATTGGATATTACCGGACGATAGGCGAACTATTTCCCTA
TTTGGATGTACTTCAAAAATCTTACGAACTCCCATCTCGAAGGCTTGAAT
TGTACTCCATCGAAGTTATTACTTTATGAATTGGATATTACCGGACGATA
GGCGAACTATTTCCCTATTTGGATGTACTTCAAAAATCTTACGAACTCCC
ATCTCGAAGGCTTGAATTGTACTCCATCGAAGTTATTACTTTATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000043_pilon | genome | sc0000043_pilon:688301..692812 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 907-1023:118 |
| Aaloc | 799-906:1718 |
| Aaloc | 106-798:2892 |
| Aaloc | 37-105:4160 |
| Aaloc | 1-33:4513 |
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