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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000043_pilon:673437..682044- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_008589 ID=XLOC_008589|Name=XLOC_008589|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8608bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:673437..682044- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAGCTGTAGCATTGCACGACTTCAATGTCACGTCAAACGAAGATGA
ATTACCATTTTTAAAGGGATCAATATTGAAGGTATATTTTATTTCTTAGT
TTTTCATTTTGGTCATCCCTGACTCATGGTTTCACTAATTTCACTAGGTG
CTCAAAGAAAATCCATATCAGTTTCCAGTGTAATGAACCAGGAAAGGTTT
AATCTCAGGATTTTTAGGGGTTCATAATAAACAGGCTACAGTAGCTCTAA
AGCTCTCAATCGAACGGAATCAACGATTGTACCTGTCGAACCAAATCGAA
CGCAATTGACCGATTGAAATTCGATTGTCGAACGCAATCGAATCTCAATC
GAATATTACTGCAATTTTCAGATTCGATTGATATTCGATTGCGTTCGATT
GATGTCCAATTGCGTTGGCCAATTAAGAAAACCATTTTCGTTTTCTTCGA
CCAATCTGAATGCCCGATACGAGTTACTTGAGGAAACCCAGGGAGAAGGC
AGGCACACAAAATGGCAGGGAAAATGGCTGGGAAGTAAGGGGGCAATCTT
TATGGCAGGGCTTCTTTTTGTGCTTCGGTTTTAGGTCAGTTTTTTTGGTT
TTTCTTAAAGGAGGCTTGGAATTCCCATATTAGAAAAACCGAGTTAGAAA
GCCGAGTTAGCAAAAAACCGAGTTATGGCGTCATCAAACGAAAATTTTTA
CATCACAATGAAATATCTAACTCGATTTCTGATTTTCTAACTCAATTTTT
TTTGTCAAATTAAAATTTTCAAGTTAGTTAGCTAACTAAAGTCTGTCCAA
ATATAATTGGCAGTGGAAACAAGAATGCCTGTAACTTTTGATAGTCAAAT
ATAATTATGGAAATTTTTTTTGCTTGTTTTAGAGAATCAAAAGCGCTATA
TTTGAATGTAATTTTGGTTGAAAAATTCGCGATTTTTAGCGGTTGAATTT
GCGATTGCAAAAATTGAGCTTTCTTTCTACTTATGCTATAACTTTCATTT
TTACACCAGTGGTAGTTCAACCTTAGGTTAAGAAGTTTGTTAAATTTCAA
AGCAAACAGAAAAGTCCTTCGGAAGATATGGGACCCGAAATACCCCTTGG
TAGCACTTTTCTGTGAAATATCAAATCTCCAAATTATTACTAAAAACGGG
GGTTCTGTTATCTTTTTTGAACAGTGCAATTAAAAGTTGGAAACTGTTAA
GTGTTGGTGCATTGGTATTATTGGTATCATTGATTATTTCAAAACGAAGT
GAAATCACAGTATAATTGTTTTTATTGAAAAGATAAGCATGAACTTATAT
TGCCTTTGTTATTTTTAAGTCATTAAAGAACTTTGCTAATTCCCAAAACA
CTAAACACAGTTTGGCTATGAGGTCATTAAAGAGATCGTAAAATGTGTTA
TGATCGAAAAACTGTTTTATCAATCATATCACTACCCCCGTTTTTAGTAA
TAAGTTGGAGATTTAATATTTCACAGAAAAGTGCTACCAAGGGGTATTTC
GGGTCCCATATCTTCCGAAAGACTTTTCTGTTTGCTTTGAAATTTAACTA
ACTTCTTAACCTAAGGTTGAACTACCACTGGTGTAAAAATGAAAGTTATA
GCATAAGTAGAAAGAAAGCTCAATTTTTGCAATCGCAAATTTAACCGCTA
AAAATCGCGAATTTTTCAACCAAAAATACATTCAAATATAGCGCTTTTGA
TTCTCTAAAACAAGCAAAAACAATTTCCATAATTATATTTGACTATCAAA
AGTTACAGGCATTCTTGTTTCCACTGCCAATTATATTTGGACAGACTTTA
GGTTTTTTTGTCAAATTAAAATTTTCGAGTTAGCTATCTTATACAAAAAT
GTATTGTGTATCTTTGAAAAAAAAAAAAGCACATTGTTTTTATGTTGTGG
TTTATTTTGCATATAGCTGCACTTATTTACTGTAATGTCCGATCAGGGTT
GCTTTAGCTTGCTCAAAGTATACTTCTCTTTAGCATTGTCCATATAGTAC
GTATGCAAAGATTTTACAAATGTTTGACACCCCCTCCCCCCTTGTACGCA
GAGAACAATAGAAATGACTTTGTTTAAACAATAGATGTACGCTTTTGCTG
AACCCCCTCTCCCCCCTTCACTGTGTACGTACATATATGGATGGCCCCTC
CAGTCTGGGTAAAAAAATTTTGTAGTTTAGTAACCGTCAAGTTACGCAAC
ATGCACACAACCATCTTGAAGACTTTGCTGGTCGCAAATGATAATCGAAA
GCAAAACTTAAAATTCATAACTATGCGGGGAAGCTCATTTTCCCCCCGTT
TTGCTTTAAACTCGCTTTTGATTGGTCTATGAATTTGAGCGATTGATTTA
CCGCCTTGGCGGAATAAACACACAACCATAATAAATAAATTCAACAGGGC
AGCGGTGTAGCAATTAAGTTCAACTGGGAGTCCTCTCTTCTGTGCCAAGC
ACTGGCAGTGTTTTTTAAACTTTAAAACAATGTTAAATGAAGACCAGATT
GATCTGTTTGTTATGGCTGTACAAGTTGTGACGAGAGTGTGCATGTTGTG
TAACTTGATGGCAGCCCGCTTTCGGCAAGTCTGATAAGAGATATCTATAA
ACTGTTATCGCCATTCATTCCATTCCATCATTCAGTAAAAATGTGCGCCA
AGGTTAGAAAAGGTTAGAAAAACACAATCTGCGTCCGGAACTGCGTGAAA
AATAGTTTGATCAATTTCAACAAGAACTGTATATATTAATATTAATATAA
ATGATCAAATTCCAAAGACCATTTGTCATAATTTTGCAAGTCCAATAATA
GGAGATGTGATGCCATCATTTGTTTCCCGTCATCTGATTTACGGTCAGCA
GGTAGAGCTGGAGAGTCAGAAAGCTTTTCCGCTGCTTTGCTGGATTTCCA
CTGTCGACCTCTGCACGCTCTGTGTTTAAAAGTTTTCAAAATCGAAGTAG
AGAGCCGCATGCTAATGGAGAGTAAACTGAAAACACCAGTTTATCCACGG
TTTCTCAATTTTAAAATTCGGATCAGTCCACACGAATTCACTTTCAACAA
GATGTATAGCTGCTTCTTAACAGAAAAATATTTTCGAACGACTCCCACTT
TTTAAAGTAGAAATGACGGGAACCAAACAGTTTTTTGCAATTCGCCTTTA
TCACAAACATGTCCAAGTCCAAAAAAGCACGATTGCATCCAGTCTTTATA
TCAAATTTATACAGTAGCTGTACTTTTGTAAACTTTATCAAATCCCAATA
ACATTATAACACCATCAATTCCCCTAGAGGCAAACAAGAAAAATATGTTT
TTATTGCAAAAACTATTAAAAAGCAGCAATAAAAAGTATATATCAGAAAA
TTCAACATAAACAAAAACTTGAGCAAACGGCTTTAAACCTTCAAAGGATG
TAGAAAAAGAATCCCCTTGATGAAAATCATGTGTTTGATTTGCCGAGTTA
AAAAAATAAATGACAGAAATTGAAGCTTGCAACAGATTTACACTGGAAAT
ACTTTGGTACAACACTGACTTATCACATCTGACTATCGCTTGAGCCGCCA
TCTTGAAACTACATTCAGGGGTCACACTCGGCATACAATCATACAATATC
ATACAATTTAATCTTTTTATCAAAATTGGCATAAAATAGCATAAAATATA
AGGTCTTGGCATACTGAGCATAAAATTTGACCAAAAAGCCAGGAATTTTT
CCTAAGGCAAGAAACTTTGTAGATCGACATAAAACCAATTCACTGAACTT
AGTTCTAGGTCCAATCTTTTATCTAGGAATATATTTTTATTGTAAAATTC
ATTTGGTGATGAGCTTTATTTTTGCTCAAAATATTTATTAGTTTTTCTAA
ATGGGTTTTTGCAACAGGTTTTAAGAATTTTGGCAGCAAAAAGGTTCCAG
ACTGATTATTTCATAGTCATAGAATTTCAGAAAGGTTTCTTCCTGCAAAG
TACATTTCGTTTCTGTGTCGCAAAAGGAAGATTTTTAAGGTTAATTTAGA
CTAACAAGTAGCCTAGAGGCTTGAACGCCCAGCATAAAGTGTAATGAGAA
TTTGTGCATTTATTATCAATAATTGAAAGTAGCCAGCGAGGCAATCCTTT
TTAAGGGCTCTGACCATAGTGAAAAATCAATTACAGAATTTGAAGATAAA
ACCTTACAGTGGATGTCCCCTAGAACGGAGGTCAAAAATGAAATCGCTCT
GGTAACTTCAAAAATAGATGAATCTAAAATGGTTTTCCTCCAAAACAAAC
TTCAGCCTCTCTATTTTCCTTCCCAAGAGAGTTTTTTCAAACATTTTTAA
GTCAGACACATTTTTTGTTGACTCAAATAGACTCAAAGTTTAGTCACTTT
TTCTCAATGGCCCCTAGAACGGAAGTTTAGAATTTTAGCAATTTCTCATG
ATCTACGGTAGATATCAAAATGATATTTTTACAGTAGTTTTGAATTGTGA
TTTCGAATATGGTGAGGGTAAGTTAATTCGGTAAAATTTTTACTAACATA
CTAATGGTCGTTAGAATGGAGATGGAGGTTTGTGGCCCCTAGAATAGAAT
GGAGGTTTTGTTGAAAGGAACCAAACCCTGAAGGAACTAAAGAGAAGTAA
AAAACAGAAACTATTGACATTTTTCTCATTGGTTGATAAAATGTAATAGC
TGATTGTAATGAAAGTTGTCAATTTTTCTGAAAGATTTATGATTTTGTAT
GATACAAATTTAAAATTGGAAATTCCAAAATTTAATAAAACTAATTCCTT
ACATAATGACGTCATTATCTATATTTAAAGAATTTTTTTCCAAATAAAAT
ATGAAATTCAGCTATGGAGTATAATGTCAAAACTTTATGACGAAAGCTCA
AGTCAATCATCATTTTAGTCTGCTACAACAAGATTTATGTTTCAGTTTTA
ACAGTCTTATCTAGCTGTACCTAGACCTTTTGAAAAAACCTTTTTCTTTT
TGTTATTATCTTTATTATTTTTGTATTATTTTTATATATTCTTTCGTTTT
ATGGGTTGACTAATCCATGATATTAGGATTGTTGAAGTTTTTGAGGAAAA
ATTTTTAGCATAAAATAATCATAAAATTTGAAGAAAGAGCATACAATTTG
GCATAAAACCTGACTAATTTTGGCATAAAAAATCATACAATTTGGTCGTT
TTTTGGCATAAAATCATACTATAATAGGGATTTTTAGAGTGTGACCCCTG
TACATTATGATCTGTAAAAACAACGCACGCTAAAAGTACCCAAAAAGTTA
ACCCGATCGGAAGAAAGTTTAGAAATCGTCTTATGGAAAATTTTACCTAT
TTGAATGCTCAGCTTAGGCTGACCAATTAGTACAGATTAGTACCATCTGG
GTAAGGCTGCGATCACAAATAACTTGTGTTCGCGTTGTTTGTAGGTCACA
TCAAGTCGGTCAGTCGGTCAGCATTGATTTGATAGTGTCCAGATGGTCAG
TCTCCCCGCAGTCCTTGCAATACGATAACTTAAGTTTTAGGTCTTGTGTA
TGAGCAGGCTGGCGTCTTATATATTTTCAATAGTTTATTGAATGAAGCTC
TTTTGTTTTGCCTGAATAGATCTGAATAGGGTATCAATAATCAAAGTATG
GGCCTCTTTACCTGTTTATTTATCCAATAGACTCCCTAAAGAAGGATGTT
GAAATTAGACCAACTTACGAGCATGTACTAAATATTTTCTAATCATTGTT
TTGATGCTGGAGTTATGGAGTTTTTAATTACCTTAAAGGAAGAAATTTCT
TTCCGCCAAATTTAATTTTGTCAGTGGTGGTCAATGGTGAATGGGCTTAT
TCACCAAAATTTCTTCTCTTAAGGTACATCCAACAGGTCTATTATTTATT
CAATGGAGTGAGTTGCCTTCATAAAGAAAGGGTAACATGGCCTGAAATAA
TGAAGGGACATCAGATATTGGCTAACCCAATTACTGGAATGTCTGACCCA
AATGTAAATAGGTTATAGTTGGACATTATGTCTTATGGAATTTCTTTTGG
TGCCTTTAAACAAATTCAAGCTGATCAAAATTCACAAACTGTTTTCACCA
CAACTTCTTGGAGTCAAAACGGTGTCCTGATTGAAAAAAGGTTGATACTA
TTCATTTGATCTTTTAAAGATATCCAGAAACCAAAACAAAAAAATCTTGT
CTCATTTAATATGCATGACACTACATACTGATTTTGAATTTTAATCCAGA
TTCATTCTATACATACAATCAAAAATTTCCCTCCTTACATTCGTGTATCA
TGTTATCTTATTCCCCTCACGTGGCATGGGTTGACTCAGGCTAGAATCTT
CACTTACAACAGCACCAAAGCTGATAAACCAGATAACCTGTTGTTCAACA
AATAGGCTTCCTCACAAAACATATGCAAAAAAACAAAACAAACGCAACTA
AGCTAGGAATTTCCCTAGCTTATCATATCTTTTTCAAGTGAAATGAAGCG
TTAAGAAGACTTTAAAGTAAATGTACACTCGTGTTTGAGCTTCACAACAG
GCAATCACCATAGTGTTTATCCCCCCTATTATAACTATTCTCAATCTCAA
GGTCTGGCGTCCTTGCCCTGCATAGCCTGAGGTTTCTTTACTTCTGGATT
TCGTGGCACTCTATGCATCATTTCAAAAAAAAGCTCTGTTTCTAAAAAGT
GGGTCAGGTGCCGCACTAACCTTTTGTTAACTATTTCAAAGATATAACAT
ATTATCTAGTACAGTATACTTTGCTATCATACTTCTTTGAAAAAACAAGC
TATTTAATGTTACCTTAATTATTTTTCAATTTTTCTACCTGAAGTGCTGG
GACTTAGGATCATTGATTTTAGGTGGGAGTTATAAGTAGTGGTGGGACCT
CATTTTTTGGTGGGACGCGGAACCTCCATCCACATTATGCTCACTGCACA
TGAAAGTAATAAGTATGAATTGCTTCTATAAATAATAATGCTCTATAAAA
TGTCTCCTTTGTATTCTAACGCAGGTCCTAAATATGACCGATGATCGCAA
TTGGTATAAAGCAGAACAAAATGGCAAAGAGGGATTTGTACCAAAGAATT
ATATACAAATGAAGCCCCATGTGTAAGAAGCCAATATTATTGAACTCTTT
TAGAAACACCCAATGTGTTGTTCTTACACTATCCAAGCTATTCAGTTCCT
TCAAAGATATCGACAAATATGTAGTAATAATAATGTTTGAATTATAATCT
TTAGGTGGTATTATGGGAAGATCAAAAGAGCGGAGGCTGAACAACTCTTA
CTTCAGGAGCCTCATGATGGTGCTTTCCTTCTTCGAGACAGTGAAAGTAC
TGCAGGTAACAACCCACAGATATCTTATAAAACACTAGATAGAGCTAGTC
CCTAGCTGAAGCAAAATAATCCACCATCTTTGATGAGTAGACCATATTTC
GGTGCCGGCAATTTGATTGACCAGGTTCATTTTCTCGCCTCCTCACTTCA
CGCCACTCAGGGTTTTTTGTTTGGTTGAACAAATTGCCGGTATCGAATTG
TGATCTACTTTCAGGAAAGATTTTTCGCTCTTTAAAAATTTTTATCCATA
GCCCTAACCTGCTTTTGCAGCTCATGAAGTTGACGGACGATATTGATGAT
ATTTTAGAAGAGTTTTGAATGAGTTTTGTGTATCATTTTTCTCTCTTTAT
CGTTTTAGGTGATTTCTCATTATCAGTAAAGTAAGTCCTCTTTATATATA
TTTTTAAATTAAAACTCATTTTTGGATTTTTAAAATTATTTCAGAAACAG
CAATTTCTCAAACCTTCCTTTTGTGTAAGAGATAATGTGATAAAGGAGAT
TTGAGATTCATTTCGTTTTCGGTATTTTCAGATTCAACGACCAATGTCAA
CATTTCAAAGTGTTGCGAGACGGTGCAGGAAAATATTTCCTATGGGTGGT
CAAGTTCAATTCGCTAAACCAACTGGTGGAATATCACAGAGCAGCGTCAG
TCAGTCGATCGCAAACTATTTACCTCAAAGACATGGTCAATGCCCACGAG
GTTTGTTTGAAGGCCTGCTCGTTTTATTTCCTCATAAAATAACTACTTGG
TTTTGGATAAGTCAGATTTTTATTTTGATATTTCTTGCTATTTTAGAGCC
CTTCTCATCCCTTTTCAGGTGATAAGTGCACAGTCACGTTTCTTTATAAG
AACAAACTAAATAAGAACATAAAATGGCTTCGATAGCCAAAATATCAAGA
ACAAGTTGAGAGCATTTTAAGTCGATATGGACATATACTAGACTCATTTT
CTTAGGAAATTGAGCAAAATACTCACAAAATGGCGAAACTAAGACTATTT
GGGGAAGGCTTAAAAAAACTCAAAAAATTGAAAACGTCTAAAAGCTTCAA
AATCTTTTTCTGATGTTCATATGAAAAATACGTGCATATGTAACAGTGAG
CATTCTCTTAGAAGTGCATTTCCTAATTTTTCAGGTTGGCAGAGCGTTGT
TCGATTTTATCGCACAAGAAGACGGAGAACTCGGATTCAATCGCGGTGAT
TTAATCAAAGTAACGGACACAAGTGACCAACATTGGTGGAGCGGCATTTT
TAACGATAGATCGGGCATGTTTCCGGCGAACTATATTCAACTTATTGTAA
CATGTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000043_pilon:673437..682044- >XLOC_008589 ID=XLOC_008589|Name=XLOC_008589|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1290bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:673437..682044- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAGCTGTAGCATTGCACGACTTCAATGTCACGTCAAACGAAGATGA ATTACCATTTTTAAAGGGATCAATATTGAAGATGGAAGCTGTAGCATTGC ACGACTTCAATGTCACGTCAAACGAAGATGAATTACCATTTTTAAAGGGA TCAATATTGAAGGTCCTAAATATGACCGATGATCGCAATTGGTATAAAGC AGAACAAAATGGCAAAGAGGGATTTGTACCAAAGAATTATATACAAATGA AGCCCCATGTGTCCTAAATATGACCGATGATCGCAATTGGTATAAAGCAG AACAAAATGGCAAAGAGGGATTTGTACCAAAGAATTATATACAAATGAAG CCCCATGTGTGGTATTATGGGAAGATCAAAAGAGCGGAGGCTGAACAACT CTTACTTCAGGAGCCTCATGATGGTGCTTTCCTTCTTCGAGACAGTGAAA GTACTGCAGGTGGTATTATGGGAAGATCAAAAGAGCGGAGGCTGAACAAC TCTTACTTCAGGAGCCTCATGATGGTGCTTTCCTTCTTCGAGACAGTGAA AGTACTGCAGGTGATTTCTCATTATCAGTAAAGTGATTTCTCATTATCAG TAAAATTCAACGACCAATGTCAACATTTCAAAGTGTTGCGAGACGGTGCA GGAAAATATTTCCTATGGGTGGTCAAGTTCAATTCGCTAAACCAACTGGT GGAATATCACAGAGCAGCGTCAGTCAGTCGATCGCAAACTATTTACCTCA AAGACATGGTCAATGCCCACGAGATTCAACGACCAATGTCAACATTTCAA AGTGTTGCGAGACGGTGCAGGAAAATATTTCCTATGGGTGGTCAAGTTCA ATTCGCTAAACCAACTGGTGGAATATCACAGAGCAGCGTCAGTCAGTCGA TCGCAAACTATTTACCTCAAAGACATGGTCAATGCCCACGAGGTTGGCAG AGCGTTGTTCGATTTTATCGCACAAGAAGACGGAGAACTCGGATTCAATC GCGGTGATTTAATCAAAGTAACGGACACAAGTGACCAACATTGGTGGAGC GGCATTTTTAACGATAGATCGGGCATGTTTCCGGCGAACTATATTCAACT TATTGTAACATGTTGAGTTGGCAGAGCGTTGTTCGATTTTATCGCACAAG AAGACGGAGAACTCGGATTCAATCGCGGTGATTTAATCAAAGTAACGGAC ACAAGTGACCAACATTGGTGGAGCGGCATTTTTAACGATAGATCGGGCAT GTTTCCGGCGAACTATATTCAACTTATTGTAACATGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000043_pilon | genome | sc0000043_pilon:673437..682044 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 472-645:175 |
| Aaloc | 304-471:777 |
| Aaloc | 283-300:949 |
| Aaloc | 181-279:1404 |
| Aaloc | 82-177:1635 |
| Aaloc | 1-81:8609 |
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