XLOC_008589 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_008589
Unique NameXLOC_008589
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000043_pilon:673437..682044-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_008589 ID=XLOC_008589|Name=XLOC_008589|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8608bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:673437..682044- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGCTGTAGCATTGCACGACTTCAATGTCACGTCAAACGAAGATGA ATTACCATTTTTAAAGGGATCAATATTGAAGGTATATTTTATTTCTTAGT TTTTCATTTTGGTCATCCCTGACTCATGGTTTCACTAATTTCACTAGGTG CTCAAAGAAAATCCATATCAGTTTCCAGTGTAATGAACCAGGAAAGGTTT AATCTCAGGATTTTTAGGGGTTCATAATAAACAGGCTACAGTAGCTCTAA AGCTCTCAATCGAACGGAATCAACGATTGTACCTGTCGAACCAAATCGAA CGCAATTGACCGATTGAAATTCGATTGTCGAACGCAATCGAATCTCAATC GAATATTACTGCAATTTTCAGATTCGATTGATATTCGATTGCGTTCGATT GATGTCCAATTGCGTTGGCCAATTAAGAAAACCATTTTCGTTTTCTTCGA CCAATCTGAATGCCCGATACGAGTTACTTGAGGAAACCCAGGGAGAAGGC AGGCACACAAAATGGCAGGGAAAATGGCTGGGAAGTAAGGGGGCAATCTT TATGGCAGGGCTTCTTTTTGTGCTTCGGTTTTAGGTCAGTTTTTTTGGTT TTTCTTAAAGGAGGCTTGGAATTCCCATATTAGAAAAACCGAGTTAGAAA GCCGAGTTAGCAAAAAACCGAGTTATGGCGTCATCAAACGAAAATTTTTA CATCACAATGAAATATCTAACTCGATTTCTGATTTTCTAACTCAATTTTT TTTGTCAAATTAAAATTTTCAAGTTAGTTAGCTAACTAAAGTCTGTCCAA ATATAATTGGCAGTGGAAACAAGAATGCCTGTAACTTTTGATAGTCAAAT ATAATTATGGAAATTTTTTTTGCTTGTTTTAGAGAATCAAAAGCGCTATA TTTGAATGTAATTTTGGTTGAAAAATTCGCGATTTTTAGCGGTTGAATTT GCGATTGCAAAAATTGAGCTTTCTTTCTACTTATGCTATAACTTTCATTT TTACACCAGTGGTAGTTCAACCTTAGGTTAAGAAGTTTGTTAAATTTCAA AGCAAACAGAAAAGTCCTTCGGAAGATATGGGACCCGAAATACCCCTTGG TAGCACTTTTCTGTGAAATATCAAATCTCCAAATTATTACTAAAAACGGG GGTTCTGTTATCTTTTTTGAACAGTGCAATTAAAAGTTGGAAACTGTTAA GTGTTGGTGCATTGGTATTATTGGTATCATTGATTATTTCAAAACGAAGT GAAATCACAGTATAATTGTTTTTATTGAAAAGATAAGCATGAACTTATAT TGCCTTTGTTATTTTTAAGTCATTAAAGAACTTTGCTAATTCCCAAAACA CTAAACACAGTTTGGCTATGAGGTCATTAAAGAGATCGTAAAATGTGTTA TGATCGAAAAACTGTTTTATCAATCATATCACTACCCCCGTTTTTAGTAA TAAGTTGGAGATTTAATATTTCACAGAAAAGTGCTACCAAGGGGTATTTC GGGTCCCATATCTTCCGAAAGACTTTTCTGTTTGCTTTGAAATTTAACTA ACTTCTTAACCTAAGGTTGAACTACCACTGGTGTAAAAATGAAAGTTATA GCATAAGTAGAAAGAAAGCTCAATTTTTGCAATCGCAAATTTAACCGCTA AAAATCGCGAATTTTTCAACCAAAAATACATTCAAATATAGCGCTTTTGA TTCTCTAAAACAAGCAAAAACAATTTCCATAATTATATTTGACTATCAAA AGTTACAGGCATTCTTGTTTCCACTGCCAATTATATTTGGACAGACTTTA GGTTTTTTTGTCAAATTAAAATTTTCGAGTTAGCTATCTTATACAAAAAT GTATTGTGTATCTTTGAAAAAAAAAAAAGCACATTGTTTTTATGTTGTGG TTTATTTTGCATATAGCTGCACTTATTTACTGTAATGTCCGATCAGGGTT GCTTTAGCTTGCTCAAAGTATACTTCTCTTTAGCATTGTCCATATAGTAC GTATGCAAAGATTTTACAAATGTTTGACACCCCCTCCCCCCTTGTACGCA GAGAACAATAGAAATGACTTTGTTTAAACAATAGATGTACGCTTTTGCTG AACCCCCTCTCCCCCCTTCACTGTGTACGTACATATATGGATGGCCCCTC CAGTCTGGGTAAAAAAATTTTGTAGTTTAGTAACCGTCAAGTTACGCAAC ATGCACACAACCATCTTGAAGACTTTGCTGGTCGCAAATGATAATCGAAA GCAAAACTTAAAATTCATAACTATGCGGGGAAGCTCATTTTCCCCCCGTT TTGCTTTAAACTCGCTTTTGATTGGTCTATGAATTTGAGCGATTGATTTA CCGCCTTGGCGGAATAAACACACAACCATAATAAATAAATTCAACAGGGC AGCGGTGTAGCAATTAAGTTCAACTGGGAGTCCTCTCTTCTGTGCCAAGC ACTGGCAGTGTTTTTTAAACTTTAAAACAATGTTAAATGAAGACCAGATT GATCTGTTTGTTATGGCTGTACAAGTTGTGACGAGAGTGTGCATGTTGTG TAACTTGATGGCAGCCCGCTTTCGGCAAGTCTGATAAGAGATATCTATAA ACTGTTATCGCCATTCATTCCATTCCATCATTCAGTAAAAATGTGCGCCA AGGTTAGAAAAGGTTAGAAAAACACAATCTGCGTCCGGAACTGCGTGAAA AATAGTTTGATCAATTTCAACAAGAACTGTATATATTAATATTAATATAA ATGATCAAATTCCAAAGACCATTTGTCATAATTTTGCAAGTCCAATAATA GGAGATGTGATGCCATCATTTGTTTCCCGTCATCTGATTTACGGTCAGCA GGTAGAGCTGGAGAGTCAGAAAGCTTTTCCGCTGCTTTGCTGGATTTCCA CTGTCGACCTCTGCACGCTCTGTGTTTAAAAGTTTTCAAAATCGAAGTAG AGAGCCGCATGCTAATGGAGAGTAAACTGAAAACACCAGTTTATCCACGG TTTCTCAATTTTAAAATTCGGATCAGTCCACACGAATTCACTTTCAACAA GATGTATAGCTGCTTCTTAACAGAAAAATATTTTCGAACGACTCCCACTT TTTAAAGTAGAAATGACGGGAACCAAACAGTTTTTTGCAATTCGCCTTTA TCACAAACATGTCCAAGTCCAAAAAAGCACGATTGCATCCAGTCTTTATA TCAAATTTATACAGTAGCTGTACTTTTGTAAACTTTATCAAATCCCAATA ACATTATAACACCATCAATTCCCCTAGAGGCAAACAAGAAAAATATGTTT TTATTGCAAAAACTATTAAAAAGCAGCAATAAAAAGTATATATCAGAAAA TTCAACATAAACAAAAACTTGAGCAAACGGCTTTAAACCTTCAAAGGATG TAGAAAAAGAATCCCCTTGATGAAAATCATGTGTTTGATTTGCCGAGTTA AAAAAATAAATGACAGAAATTGAAGCTTGCAACAGATTTACACTGGAAAT ACTTTGGTACAACACTGACTTATCACATCTGACTATCGCTTGAGCCGCCA TCTTGAAACTACATTCAGGGGTCACACTCGGCATACAATCATACAATATC ATACAATTTAATCTTTTTATCAAAATTGGCATAAAATAGCATAAAATATA AGGTCTTGGCATACTGAGCATAAAATTTGACCAAAAAGCCAGGAATTTTT CCTAAGGCAAGAAACTTTGTAGATCGACATAAAACCAATTCACTGAACTT AGTTCTAGGTCCAATCTTTTATCTAGGAATATATTTTTATTGTAAAATTC ATTTGGTGATGAGCTTTATTTTTGCTCAAAATATTTATTAGTTTTTCTAA ATGGGTTTTTGCAACAGGTTTTAAGAATTTTGGCAGCAAAAAGGTTCCAG ACTGATTATTTCATAGTCATAGAATTTCAGAAAGGTTTCTTCCTGCAAAG TACATTTCGTTTCTGTGTCGCAAAAGGAAGATTTTTAAGGTTAATTTAGA CTAACAAGTAGCCTAGAGGCTTGAACGCCCAGCATAAAGTGTAATGAGAA TTTGTGCATTTATTATCAATAATTGAAAGTAGCCAGCGAGGCAATCCTTT TTAAGGGCTCTGACCATAGTGAAAAATCAATTACAGAATTTGAAGATAAA ACCTTACAGTGGATGTCCCCTAGAACGGAGGTCAAAAATGAAATCGCTCT GGTAACTTCAAAAATAGATGAATCTAAAATGGTTTTCCTCCAAAACAAAC TTCAGCCTCTCTATTTTCCTTCCCAAGAGAGTTTTTTCAAACATTTTTAA GTCAGACACATTTTTTGTTGACTCAAATAGACTCAAAGTTTAGTCACTTT TTCTCAATGGCCCCTAGAACGGAAGTTTAGAATTTTAGCAATTTCTCATG ATCTACGGTAGATATCAAAATGATATTTTTACAGTAGTTTTGAATTGTGA TTTCGAATATGGTGAGGGTAAGTTAATTCGGTAAAATTTTTACTAACATA CTAATGGTCGTTAGAATGGAGATGGAGGTTTGTGGCCCCTAGAATAGAAT GGAGGTTTTGTTGAAAGGAACCAAACCCTGAAGGAACTAAAGAGAAGTAA AAAACAGAAACTATTGACATTTTTCTCATTGGTTGATAAAATGTAATAGC TGATTGTAATGAAAGTTGTCAATTTTTCTGAAAGATTTATGATTTTGTAT GATACAAATTTAAAATTGGAAATTCCAAAATTTAATAAAACTAATTCCTT ACATAATGACGTCATTATCTATATTTAAAGAATTTTTTTCCAAATAAAAT ATGAAATTCAGCTATGGAGTATAATGTCAAAACTTTATGACGAAAGCTCA AGTCAATCATCATTTTAGTCTGCTACAACAAGATTTATGTTTCAGTTTTA ACAGTCTTATCTAGCTGTACCTAGACCTTTTGAAAAAACCTTTTTCTTTT TGTTATTATCTTTATTATTTTTGTATTATTTTTATATATTCTTTCGTTTT ATGGGTTGACTAATCCATGATATTAGGATTGTTGAAGTTTTTGAGGAAAA ATTTTTAGCATAAAATAATCATAAAATTTGAAGAAAGAGCATACAATTTG GCATAAAACCTGACTAATTTTGGCATAAAAAATCATACAATTTGGTCGTT TTTTGGCATAAAATCATACTATAATAGGGATTTTTAGAGTGTGACCCCTG TACATTATGATCTGTAAAAACAACGCACGCTAAAAGTACCCAAAAAGTTA ACCCGATCGGAAGAAAGTTTAGAAATCGTCTTATGGAAAATTTTACCTAT TTGAATGCTCAGCTTAGGCTGACCAATTAGTACAGATTAGTACCATCTGG GTAAGGCTGCGATCACAAATAACTTGTGTTCGCGTTGTTTGTAGGTCACA TCAAGTCGGTCAGTCGGTCAGCATTGATTTGATAGTGTCCAGATGGTCAG TCTCCCCGCAGTCCTTGCAATACGATAACTTAAGTTTTAGGTCTTGTGTA TGAGCAGGCTGGCGTCTTATATATTTTCAATAGTTTATTGAATGAAGCTC TTTTGTTTTGCCTGAATAGATCTGAATAGGGTATCAATAATCAAAGTATG GGCCTCTTTACCTGTTTATTTATCCAATAGACTCCCTAAAGAAGGATGTT GAAATTAGACCAACTTACGAGCATGTACTAAATATTTTCTAATCATTGTT TTGATGCTGGAGTTATGGAGTTTTTAATTACCTTAAAGGAAGAAATTTCT TTCCGCCAAATTTAATTTTGTCAGTGGTGGTCAATGGTGAATGGGCTTAT TCACCAAAATTTCTTCTCTTAAGGTACATCCAACAGGTCTATTATTTATT CAATGGAGTGAGTTGCCTTCATAAAGAAAGGGTAACATGGCCTGAAATAA TGAAGGGACATCAGATATTGGCTAACCCAATTACTGGAATGTCTGACCCA AATGTAAATAGGTTATAGTTGGACATTATGTCTTATGGAATTTCTTTTGG TGCCTTTAAACAAATTCAAGCTGATCAAAATTCACAAACTGTTTTCACCA CAACTTCTTGGAGTCAAAACGGTGTCCTGATTGAAAAAAGGTTGATACTA TTCATTTGATCTTTTAAAGATATCCAGAAACCAAAACAAAAAAATCTTGT CTCATTTAATATGCATGACACTACATACTGATTTTGAATTTTAATCCAGA TTCATTCTATACATACAATCAAAAATTTCCCTCCTTACATTCGTGTATCA TGTTATCTTATTCCCCTCACGTGGCATGGGTTGACTCAGGCTAGAATCTT CACTTACAACAGCACCAAAGCTGATAAACCAGATAACCTGTTGTTCAACA AATAGGCTTCCTCACAAAACATATGCAAAAAAACAAAACAAACGCAACTA AGCTAGGAATTTCCCTAGCTTATCATATCTTTTTCAAGTGAAATGAAGCG TTAAGAAGACTTTAAAGTAAATGTACACTCGTGTTTGAGCTTCACAACAG GCAATCACCATAGTGTTTATCCCCCCTATTATAACTATTCTCAATCTCAA GGTCTGGCGTCCTTGCCCTGCATAGCCTGAGGTTTCTTTACTTCTGGATT TCGTGGCACTCTATGCATCATTTCAAAAAAAAGCTCTGTTTCTAAAAAGT GGGTCAGGTGCCGCACTAACCTTTTGTTAACTATTTCAAAGATATAACAT ATTATCTAGTACAGTATACTTTGCTATCATACTTCTTTGAAAAAACAAGC TATTTAATGTTACCTTAATTATTTTTCAATTTTTCTACCTGAAGTGCTGG GACTTAGGATCATTGATTTTAGGTGGGAGTTATAAGTAGTGGTGGGACCT CATTTTTTGGTGGGACGCGGAACCTCCATCCACATTATGCTCACTGCACA TGAAAGTAATAAGTATGAATTGCTTCTATAAATAATAATGCTCTATAAAA TGTCTCCTTTGTATTCTAACGCAGGTCCTAAATATGACCGATGATCGCAA TTGGTATAAAGCAGAACAAAATGGCAAAGAGGGATTTGTACCAAAGAATT ATATACAAATGAAGCCCCATGTGTAAGAAGCCAATATTATTGAACTCTTT TAGAAACACCCAATGTGTTGTTCTTACACTATCCAAGCTATTCAGTTCCT TCAAAGATATCGACAAATATGTAGTAATAATAATGTTTGAATTATAATCT TTAGGTGGTATTATGGGAAGATCAAAAGAGCGGAGGCTGAACAACTCTTA CTTCAGGAGCCTCATGATGGTGCTTTCCTTCTTCGAGACAGTGAAAGTAC TGCAGGTAACAACCCACAGATATCTTATAAAACACTAGATAGAGCTAGTC CCTAGCTGAAGCAAAATAATCCACCATCTTTGATGAGTAGACCATATTTC GGTGCCGGCAATTTGATTGACCAGGTTCATTTTCTCGCCTCCTCACTTCA CGCCACTCAGGGTTTTTTGTTTGGTTGAACAAATTGCCGGTATCGAATTG TGATCTACTTTCAGGAAAGATTTTTCGCTCTTTAAAAATTTTTATCCATA GCCCTAACCTGCTTTTGCAGCTCATGAAGTTGACGGACGATATTGATGAT ATTTTAGAAGAGTTTTGAATGAGTTTTGTGTATCATTTTTCTCTCTTTAT CGTTTTAGGTGATTTCTCATTATCAGTAAAGTAAGTCCTCTTTATATATA TTTTTAAATTAAAACTCATTTTTGGATTTTTAAAATTATTTCAGAAACAG CAATTTCTCAAACCTTCCTTTTGTGTAAGAGATAATGTGATAAAGGAGAT TTGAGATTCATTTCGTTTTCGGTATTTTCAGATTCAACGACCAATGTCAA CATTTCAAAGTGTTGCGAGACGGTGCAGGAAAATATTTCCTATGGGTGGT CAAGTTCAATTCGCTAAACCAACTGGTGGAATATCACAGAGCAGCGTCAG TCAGTCGATCGCAAACTATTTACCTCAAAGACATGGTCAATGCCCACGAG GTTTGTTTGAAGGCCTGCTCGTTTTATTTCCTCATAAAATAACTACTTGG TTTTGGATAAGTCAGATTTTTATTTTGATATTTCTTGCTATTTTAGAGCC CTTCTCATCCCTTTTCAGGTGATAAGTGCACAGTCACGTTTCTTTATAAG AACAAACTAAATAAGAACATAAAATGGCTTCGATAGCCAAAATATCAAGA ACAAGTTGAGAGCATTTTAAGTCGATATGGACATATACTAGACTCATTTT CTTAGGAAATTGAGCAAAATACTCACAAAATGGCGAAACTAAGACTATTT GGGGAAGGCTTAAAAAAACTCAAAAAATTGAAAACGTCTAAAAGCTTCAA AATCTTTTTCTGATGTTCATATGAAAAATACGTGCATATGTAACAGTGAG CATTCTCTTAGAAGTGCATTTCCTAATTTTTCAGGTTGGCAGAGCGTTGT TCGATTTTATCGCACAAGAAGACGGAGAACTCGGATTCAATCGCGGTGAT TTAATCAAAGTAACGGACACAAGTGACCAACATTGGTGGAGCGGCATTTT TAACGATAGATCGGGCATGTTTCCGGCGAACTATATTCAACTTATTGTAA CATGTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000043_pilon:673437..682044-

>XLOC_008589 ID=XLOC_008589|Name=XLOC_008589|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1290bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:673437..682044- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGCTGTAGCATTGCACGACTTCAATGTCACGTCAAACGAAGATGA
ATTACCATTTTTAAAGGGATCAATATTGAAGATGGAAGCTGTAGCATTGC
ACGACTTCAATGTCACGTCAAACGAAGATGAATTACCATTTTTAAAGGGA
TCAATATTGAAGGTCCTAAATATGACCGATGATCGCAATTGGTATAAAGC
AGAACAAAATGGCAAAGAGGGATTTGTACCAAAGAATTATATACAAATGA
AGCCCCATGTGTCCTAAATATGACCGATGATCGCAATTGGTATAAAGCAG
AACAAAATGGCAAAGAGGGATTTGTACCAAAGAATTATATACAAATGAAG
CCCCATGTGTGGTATTATGGGAAGATCAAAAGAGCGGAGGCTGAACAACT
CTTACTTCAGGAGCCTCATGATGGTGCTTTCCTTCTTCGAGACAGTGAAA
GTACTGCAGGTGGTATTATGGGAAGATCAAAAGAGCGGAGGCTGAACAAC
TCTTACTTCAGGAGCCTCATGATGGTGCTTTCCTTCTTCGAGACAGTGAA
AGTACTGCAGGTGATTTCTCATTATCAGTAAAGTGATTTCTCATTATCAG
TAAAATTCAACGACCAATGTCAACATTTCAAAGTGTTGCGAGACGGTGCA
GGAAAATATTTCCTATGGGTGGTCAAGTTCAATTCGCTAAACCAACTGGT
GGAATATCACAGAGCAGCGTCAGTCAGTCGATCGCAAACTATTTACCTCA
AAGACATGGTCAATGCCCACGAGATTCAACGACCAATGTCAACATTTCAA
AGTGTTGCGAGACGGTGCAGGAAAATATTTCCTATGGGTGGTCAAGTTCA
ATTCGCTAAACCAACTGGTGGAATATCACAGAGCAGCGTCAGTCAGTCGA
TCGCAAACTATTTACCTCAAAGACATGGTCAATGCCCACGAGGTTGGCAG
AGCGTTGTTCGATTTTATCGCACAAGAAGACGGAGAACTCGGATTCAATC
GCGGTGATTTAATCAAAGTAACGGACACAAGTGACCAACATTGGTGGAGC
GGCATTTTTAACGATAGATCGGGCATGTTTCCGGCGAACTATATTCAACT
TATTGTAACATGTTGAGTTGGCAGAGCGTTGTTCGATTTTATCGCACAAG
AAGACGGAGAACTCGGATTCAATCGCGGTGATTTAATCAAAGTAACGGAC
ACAAGTGACCAACATTGGTGGAGCGGCATTTTTAACGATAGATCGGGCAT
GTTTCCGGCGAACTATATTCAACTTATTGTAACATGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_008589XLOC_008589-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000043_pilongenomesc0000043_pilon:673437..682044 -
Properties
Property NameValue
Aaloc472-645:175
Aaloc304-471:777
Aaloc283-300:949
Aaloc181-279:1404
Aaloc82-177:1635
Aaloc1-81:8609