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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000043_pilon:478696..484591- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_008583 ID=XLOC_008583|Name=XLOC_008583|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5896bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:478696..484591- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTTCCTTAGTTGGTAAATGTATTATGCAGCAGTGTCTATCAGCCAA
ACTGATGGTCAAGCCAGCTGAAGGTGATGACAGCCCTGCTCAATATGTCC
AAGTATATAAAATGTTTGTGATCTGAATATTGTATTAATTTGTTCATGGT
TATATACTTTAATTCATGAAACTCATTTGAAACGCAAACATAAATTTCAG
GTACTTTTTCATCTTGAATTTAACTGATTGTTTCGTGGACAAAAATTATT
ATAATGATGAGGTATTGCAGGGGAAAGAGTTAGATAATTTGTGTATAAAA
TTACATTCCCCCTATTTGTCATTTTATTCAGATCAACCAAGGTGTTGTTG
TGTTCATTTGTTTTCTAAAAGATGCAGCAATCGATCATTTACCCAAAATT
GGTGAGTTTCAAAGAAGTCTCTTGATTTTCAAAAAATGCCTTTTACTTGT
ATTACCACAAATGTTCCAGGGCGTCTCAGGAAATTAGACCGGAAATTCAG
GTATTTGAATTTTCGGTAAAAATTCTGGTTGTTAGGAGATGCTGGTTAAT
CTTTCAAAAGCTTCCATTGAGGTCATGAGCTCATATTAAAATGTTAAACT
AAAAGGTTTTCCTCGATTAACCAAATCATGCCTTACTCATTTTGTATAAT
CTAGCTTTTATCTTGAGTAATGAGAGTAAGCCCACCCCCCCAAGATATTT
TCTCAAAACATTAAAGATATGTATTATTTATTTATTATAGTGAAATCAAT
ACTTGAAGTTCGGCTGTCCTTTTCTGAGGAAAATCAAAAACGAGTTTCTA
TAATGGACTTGCCTGGTGACGTCCTGATCGTCCCTCAAGTATTCATTTTT
TTTATGATTCTTTCCATTTGGAATTTGGGCTATCTTTGTGCTTTAGAGCA
AAGCAGAGAACAAAGAGCTGGATTATACAATCTTTATGGCCCAAATAAAG
GATTTTGCACAATGTTTTTTTATTCTCATATCTTGAGGGTATCTAAATTT
TTCAAATATTCTAAAACCACTGACATTTGGGGAACAAACTATGACACATA
CTTTAAAAGTTTTAAGCCTGAGGTCTGGTTTTGACAGTTAACTTTTCACG
CTGCCTATTTTAATTGTATAGACTATAGCCTATTGTAATTGTGAGAAGGG
CAGAAGGTTTGCTGTCTAAAGTCAATGTATAGCATTCTTTCAACGTCAAT
GTAATAATCTCTTTCAATCTTTTCCAGGGGAAGATTTTAACTGCCAACTT
TCTGGCTACTTTAACAATAGAAGAAACAGTAGAAATTCAGCCGTCTTAAA
ACCAGAGCTAAACCTCCCTTGCTCAAACTAAAAGCTACCATTCAGTAATT
ATCGATTTCTATAATTTCAGGCCACTCTCGGTGGAAGAATGAAAGGCAAA
GCCATCCAGTAAGAACAATACATTGTATACCATCATTCTGTGAAAATTTT
TCAACAAGACCCACTGTCCTTTATAAACTATGGGTTAAACTATATCCACC
ATAGATTTGAGTTTTTGTCTAACGTTTGCGTTCGACCGCGCTATTATCCC
AAATCAAAATAATAAAGGATAAGTAGATCGAGCGATTATCATACATTATA
CCTCTATTGAGTAAGTGCTACCATTAGGGTACCATGTTCAAAGATTTTGC
TTGGTCGGGATTGAGAAACTACCTCTAGGATTTATATAAAGCTCAGTGAG
TTGTTAACTTTGACGACCAGACCCAAAGAACTAATGCCAAATCTACTTTT
CATATTTTGACCATTTTCACCCGTTTGGAAAGTATTTATTATTTATTTAT
CATGTTGGAAAAAAAACTTTTATACAAACGATTTATATACTCTCCATAGT
TCTAAAACCACAATTTTTCATTTCTTCTTCTTTTTTATATCCTACCTTTT
TGTTTAGATATCATAATAATGTTTCTAAGGAGCTTGGTCAACAGTTGTAT
TCTGATTTCGTTGCACAGATGAAGGTTAGTGTTTTAGTGAGAATTGCAAT
TATTTATCTTGCTCAAAAAATGGTGTTTCATGACTTGATTGCAATATATT
GGTGAGTGCCGCATCAGTATATTGTAAAGTACTTACAATATTGCAAAGGT
GTCTACAATATATATATAATATAAACTTGAACTTTGATGGGTCAAAAGTT
ATACTGAATAATTATTTGAAGGGGTATACCCTAGCTATGAAACATCCGTA
GATGACCCATCAAAATTTAAGTTGATTCTTTCAAAAAACTTGAAGAAATT
CATTTCAAACAGGGTAAATTATTTCTGGCACGCCCGATGGATAAAATGAT
GTCGAATTTCTTGAAAAGCTCACGGAATCAGACCAAAGCTCCTAAAGTTA
TAGGTGTAAATACGATAACTCTTATGAATTTTTTTATCATTTCTTATCAC
CATTGCAAGTCTTGAAATAAAGATCTGACATTTTCTTTGACCGACTTGAA
ATCGAGCCATGCCACTGCCAGTCAATATCGCATTAATTGTCTGAAATGGA
AGCATAATAAAATATGTATATTATATATCTTTCTATAATTTTTAACCTTC
AAGATTATATAGGGCTAAGAGATGCTGGCTAAATCGACCCAGCCAGCCAA
TGTGCAGTACACAGTGCTGGCGACTCCCAATTTAAGGACGAAAAGCATAC
ATCTTATCTGCAACCCAAATCTCATGATTGAATATTGTTGTGCAAAAAAT
CCTATGTCTTAACATTATTTATATTTTTCTTTTTACCAGGAATCTTTTGA
AAAAAACAGAACATCCAAACCGAATGATTGTGTTGTGCATAGCGGTAACT
GCTTGTCTTTCTTTAAAGGGATTATCAGATGATTTGAGATAATTAGGCTA
TTGTCCTTAATAAAACCTATAACTATTTTTTCCTAACTTTTTTTCCGAAG
TCTGCATATCACAGTTTAAATTTTCTAAAAATGGGTTCATATAACTGAAA
ATAGAAAATGGTTAGGCCTACTTCTTTTTCGAAATTCTTTGGATTTTTCT
ACTACCATACAAAAAAATCCAAGATAGCTCACACACCTAAAATCTCTGAG
GGGTGTGATCAATCACACGCCATAAATCCAAATTTCACTACTAAAGTTGT
ACACAGCACTCCTTATCACACGCCTAAATTCCAAAAAATAAAGTTTTGGG
AGTGTGATTGACCATACGCCTGCATTTTTCAAATGACAAAGCCTGGCTAA
CTCGAAAACTTGTGAACGAAAAATAAATTCCGAGTTAGCTAACTCGAAAA
AAGGTTTTGTGAAAAAGAAATTCGAGTTAGCTAACTCGAAAAGGTTTTTA
CGAAAAATAAAATTCGAGTTATTTTAACTCGAAAAATATTTTTTGAAAAT
AAAAAATCGAGTTAGAGTCGAGTGACGTCAGAATTTGCACTTTCATGACG
TCATAATTTAGCTAGCTCGAAAATTCCTAACTCGAAAATCGCTAACTCCA
AGTTTTCTAACTCGAAGATTCCGGGACTCAAAAATTTTCAGCTTTTGCTC
AGAAATCCCACATGTCTAATATCTCAAACCATAGTCCGTATAAAAAACTC
TGGTCTGGAAGCCTTTTGTTTTTTTTCCATTGTTTCTTACTTGGACTTGT
GCTTGAGAAATTAGTTTGTTTTGCTCACTTTTTGATCATGTGATTAAATC
CTAAACCAATCACATGAGGAATACTTGGCAACGTGATCAAAAACTGAGCA
AATCGATTTTTATCTTTTTATATTAACAAAGGAAAAGCTTACAAAAAGTT
AAAACAATAAGCTTCCAGACTGTGTTTTTTATAAGGACTATGCTCAAACC
ATCTGATTATCCCTTTAACTCAAAATGGAGTAATCTATTAGAATATTTGA
TTTAAACCTTGCTTGTCATTCTCTATGACTTTTGTTTCAAAGTTTTTTTC
TCACAACATTCTGTCTTGATACGATCTAGTCCTTTTACATCAGCTATCAT
CAATTTTATATGATCGACGACAACTTAGTCACAAAAACGTGGTATGCCAC
TTTTTAGGTTCGTTCATTATACATATATCAACCTTTAAAACGCGAGGAGA
GTGGGTTCAAGTTTACCAGGATGGAATGTCGTCGAAATGCCTGAAGTCAC
ATAGTGACCTCATAGTCCTCCCCCTTTTAAAAGCCTGCTAGGACACTACT
ATGAGTCGTTGTATTGAGATCCTTACTACAGATAAAGAACTTTGACATGA
TTTAATGTAAATTCATTACCAACCCCATTACCGGGTTGATCATAGCATTG
AGTTTAAAGCCGAAAATACTAGAAAAGGATCTTAAACCTTTCTTAAGCAA
GAATAAGTGAAATGTTATGATTTACGCGGACGTTTATGTGAAAACCACTC
GGGTTACTTGTTTTGGATTGAAAATAAGTGGCTTCATTTCCTATCCAGAA
TTTTCTGGCTTTAAACTTATGGTTGTATAGTTGTATTCATGCAGTTATAC
AATTTCTTTTTGAAAATGACCAGTTCTACATACATGAAGAAAGGAATAAA
AGACACCCCTGTGTCACAGACCCACTGGAACCGCAGCCCACTGGAAAATA
TGGCAAAAATTTCGTCCCCGGTAGGAAAGTACCCTGGAATTTTAGCCCAA
CTGGGAAATTGATTCATATTTCATCCCCACTCAAAAATAAATGTTTAAAA
ATTGCACTCTAAAACCATCCCCAATGGAACCCGGTGGAGGTTCTATAAAT
TAACCCATGTCCGTCCGTTCGTTCGTCCGTACGTCCGTCCGTCCGTCCGT
CCGTCTGTTACCAGCTTTTCTCAGGATTGGCTCATTAGTTTTTTCTGATT
TTTTGCACAATGATGCAAAATGGCAATGTCCAGAACGTGACGGAGCCCAA
TTTTTAAGAAAAAATTTGTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAACTACCTAAA
AATAGGGTTTTTTGGACTTTTTTTTGATTTTTTGTACAAAGATGGAAGGC
AAGATTCTCTAAAGAATGGCTGAAGTGGTTTTTCCCGGAAAATTCTTATT
CGCCTTAAAAAACGGATTTTCGTATTTTGGGGGAAATTCCCTTTAACCAA
ATAAGAAAATATAGCTTTTCTCAATGTTGACTCGTTATTTTTTTCTGATA
TTTTGCACAATGATGCAAAATGGCAATGCCTAAAATGTGTCGGAGCCCGA
TTTTCGAAAAAAAATATATTTAGGCAAATTTGGGCCAAAAACTGCCTAAA
AATAGGGTTTTTTGGGACTTGTGCAAAATTCTGTAATTACTTTTTTCTGA
TTTTTTGTACAAAGATGGAGGGCAAGATTCTCTAAAGAATGGCTGAAGTG
GTTTTTCCCGGAAAATTTTTATTCGCCTTAAAAACGGATTTTCGTATTTT
GGGGAAATAGGGAAAGAATGGCTGAAATGTTTTTTTTCATAATTTTTTCT
GATTTTTTGCACAATGATGCCCAAAATGTGACGGAGCCAGATTTTTAAGG
AAATTTTTTTGGGGCAAATTTGGGCCAAAAACAGCTTAAAAGGTTTTTTG
GGTCTGAATGGTTTAAGTGATCTTCGTATTTGGGGACATTCCTTTTTACC
ATTTTACATTATTCAACACACAAGCTTTATTTTTCCATTCTGAATTTTTG
TACAATTATTGTCACTTTTTTCTTATTTTCATCTGATGTTAATCATTAGG
TAGGTCCATTCAGCATGTTGCTTGTTTAACCTTTGAACAATATAATTTTT
ATCCCCATTGGGATTTCAGTAGGAATTTTTATCGCCACTGAGGAAAAAGG
TTCCAGTGGTGCTGTGAGACAGGTGTGTTAAAAGCAAAGTGCCACCCTTT
TTAAATAAATAACGTTTAATTTTAGGTACGTATGGTAACCTGCAGGTCTT
AAACATGGAAACGAACGGCCCGTACACAACCATTCTCGAATTTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000043_pilon:478696..484591- >XLOC_008583 ID=XLOC_008583|Name=XLOC_008583|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1002bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:478696..484591- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTTCCTTAGTTGGTAAATGTATTATGCAGCAGTGTCTATCAGCCAA
ACTGATGGTCAAGCCAGCTGAAGGTGATGACAGCCCTGCTCAATATGTCC
AAATGAGTTCCTTAGTTGGTAAATGTATTATGCAGCAGTGTCTATCAGCC
AAACTGATGGTCAAGCCAGCTGAAGGTGATGACAGCCCTGCTCAATATGT
CCAAATCAACCAAGGTGTTGTTGTGTTCATTTGTTTTCTAAAAGATGCAG
CAATCGATCATTTACCCAAAATTGATCAACCAAGGTGTTGTTGTGTTCAT
TTGTTTTCTAAAAGATGCAGCAATCGATCATTTACCCAAAATTGTGAAAT
CAATACTTGAAGTTCGGCTGTCCTTTTCTGAGGAAAATCAAAAACGAGTT
TCTATAATGGACTTGCCTGGTGACGTCCTGATCGTCCCTCAATGAAATCA
ATACTTGAAGTTCGGCTGTCCTTTTCTGAGGAAAATCAAAAACGAGTTTC
TATAATGGACTTGCCTGGTGACGTCCTGATCGTCCCTCAAGCCACTCTCG
GTGGAAGAATGAAAGGCAAAGCCATCCAGCCACTCTCGGTGGAAGAATGA
AAGGCAAAGCCATCCAATATCATAATAATGTTTCTAAGGAGCTTGGTCAA
CAGTTGTATTCTGATTTCGTTGCACAGATGAAGATATCATAATAATGTTT
CTAAGGAGCTTGGTCAACAGTTGTATTCTGATTTCGTTGCACAGATGAAG
GAATCTTTTGAAAAAAACAGAACATCCAAACCGAATGATTGTGTTGTGCA
TAGCGGAATCTTTTGAAAAAAACAGAACATCCAAACCGAATGATTGTGTT
GTGCATAGCGGTACGTATGGTAACCTGCAGGTCTTAAACATGGAAACGAA
CGGCCCGTACACAACCATTCTCGAATTTTAGGTACGTATGGTAACCTGCA
GGTCTTAAACATGGAAACGAACGGCCCGTACACAACCATTCTCGAATTTT
AG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000043_pilon | genome | sc0000043_pilon:478696..484591 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 433-501:70 |
| Aaloc | 376-429:3158 |
| Aaloc | 310-375:3989 |
| Aaloc | 271-306:4527 |
| Aaloc | 175-270:5155 |
| Aaloc | 103-171:5566 |
| Aaloc | 1-102:5897 |
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