XLOC_008574 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_008574
Unique NameXLOC_008574
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000043_pilon:547397..554994+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_008574 ID=XLOC_008574|Name=XLOC_008574|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7598bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:547397..554994+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000043_pilon:547397..554994+

>XLOC_008574 ID=XLOC_008574|Name=XLOC_008574|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1590bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:547397..554994+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACGATTAGCAAGGAATACAGAATTTGTATGCCATTGTCTGTGGAAGA
GATGACGATTAGCAAGGAATACAGAATTTGTATGCCATTGTCTGTGGAAG
AGTATCGCATCGGTCAACTCTTCATGATCAATAAGCACAGTCATGAACAA
AGTCAAAAAGGAGAAGGCGTGGAAGTTGTGAAGAATGAAGAATGTGAAGA
TCCAGTTCACGGGAAAGGAAGATTCACCGAGAAAAGAGTCTACCTCAATA
GTATCGCATCGGTCAACTCTTCATGATCAATAAGCACAGTCATGAACAAA
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ATGATTGGTATGGTGATAAAAGATATATTATTGGCAGGACATCGGCAAGC
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AATGAAAACATTGCCGCTGCTCCTACTTCTTGAACATGACGTTCGAGGAT
GTGAGGGCGTTCGAAAAACAATTACAAGAAGAGACCAACAAGAAAGTCAT
GGGAAGTAATGAAAACATTGCCGCTGCTCCTACTTCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_008574XLOC_008574-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000043_pilongenomesc0000043_pilon:547397..554994 +
Properties
Property NameValue
Aaloc691-795:7494
Aaloc625-687:6981
Aaloc529-624:6281
Aaloc469-528:5969
Aaloc370-468:5407
Aaloc298-369:3236
Aaloc202-297:2712
Aaloc52-198:1728
Aaloc1-51:1