XLOC_007909 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_007909
Unique NameXLOC_007909
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000057_pilon:1757401..1770204-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_007909 ID=XLOC_007909|Name=XLOC_007909|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12804bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000057_pilon:1757401..1770204- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTTCTGATTTCCCTTCCGAAAACAAAGGTTCGAGCCACGGCACAAGATCA TCCGAAACGAAAAGAATTTCTCACTTCGAGATTATGTGAGGATTTTTCTC AGCTCGCTTTGAACATTATTTACAGTTTTGATGATCCCGATGCTCAAGTC GATAAACGCTTTAACACGCTAATTACTAACTGCTTATCCAGACACGCTCC AGAGAAACGGGTTAAGCTTACACGTCCCCCTGCTCCGTGGATGCAAGATC CTGATATTGTCCGATCTAGAAACCATTTAGAAGACCTTCGAAAAAAGAAA AGTCGCCGAATCAGATGATTGAGAGATGAATACCGAAAGGTCAAAAACAG TCACAAAATAATGTTCTTATCGCTCAGCCGGTCAGCGACTACATCACATC GCCCCTCGTTCACATCATCAACAACTCAATTAAAACCGGTATCTTCCCGG ACAAGTGTCTGCCCTATCCTGAAGGTGAGAAATCCTGCGGTTGCAAAGGA CTTTCGACCTGTTTCTATTCTACATTTACTACCAAAGGATTTCAAAAAAA TCATTCTCATGCAGATCCTTGATCACATCGAGTCAGGAAGTCATCGAAAC CCCGTCAAATTCAAATATCGGAGAATGTTATATCCTTTGAAAGGGATCTC ACGGAACTATCGAGATGGTACACCAATAATAGTCTAATATTCAAGGACGA CGAACTTCAAATGATAGTATTTCACAAACCAAGACCCCTCCCTACTTACC GATCCTACCTTGTTCGATCAAAAAATTGTCACTCTATTAAACAGGAGTTA ACGGTAAGTCTTTTGGGGGACATGATCGACCAAAACCTTACATGGATAGA TCAAATCAATCACGTAACAAAATTTGCTCAGTCTTATCTTCAAGTGTTGA AGCAATTTCAACGATTTACACCTTTCAACGTCAGGAAAACGCTGGCAGAG 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TTTTGTTTTATAAATTAAGTTTTTTTTAGATGTTATTTATTTATTTATAT TTTTAAGTATTTTAATAGGGATAAGAACCGTAGTATAATATGGAACTCGA AGTATGTTTAAAAACAAAAAAACAAGCAAAATCAAAACGCCTAGATTATT TTTTTTTCTGCAAAGGCTACCTATCTTTTTTGATAATATTCCACTCCGGA TTATCTTTTTTAACGAGCACAAAATCGCTACTTAATTCAAATTCTATCAA AAGTTATTGAGGTTTGAAAAAACACTGCCCGCTAATTTGAAATAGACTTT AGTGTACTATGAATTAACGAATAAGATAAAACTTCTGCAAAAGGGTTACT CAAATCAATACACTTGACCTGTCCCAACTGCCATAATCCCTGAACATAAC TCTGTGTGTATCTTTAAAATATCATTTCATTCTAGGATCACAATGCAGTA TGTCAATTCGGTCCAACAGAATGTGTCTTTTGTTCCAAGAAATTTCCTCC CAGCGAAATGGAACAACATCAGAAACAATGTGTTCTGGCAATGAGCAACA TGGCATGTCCTTATGCACACGCTGGATGTCAATTTCAGGTAAATTAACAA GGCTTGATTTTCAAGATCATCAAAATTCAGTGGTTTATGGTTGATCAGAA ACGGTGTTTGTTTGTGGCTGCCATATTGAAATCAAGTTTTACTTTCCAGC TATGTGGTATGCTAACCAGGCTGTCCAAATAGAATACACGCTTTTTTTAT AAGAATAACTTCAGGGTGAGTACAACCAAACTAGCCAAAATACATTATTG TTATAAACTAGTACATAGCTTACACTAACATGCCACCGCAGCAATATAAT ATTTAAAAAATTCTATAATAAATTGTATAATCATAACAATGTCAATTGCA AGATTATAAGAAATGCATGGGGACAAAAAAATAGTAAGTAACTACACGTT TGGTTAAACGAAGAAATAAAAGATTTTCTTTTTTCCTGAAAATAATAACA ATAACACTCCATCTAAATAAATAAAAACGATGGCCTAGTCATAATTAAGG TTTCGACGAAGACATGAAAAAATCTAATTAAAAAGAAATGACTCTTATGT TTTGCAAGCTAAAGTTTATTCCACTTAAATTGGCATTCATTTTTGCTATC ATGTGGAAACCATATCAGAGTAATTAGACTACTCGAGTACCTAATAAACG TACAGTAGCGAATAAACGTACAGGGTCGAAAATAGAGGCATGCAAACCTA ATTGAAGGATCTTTTTAATGAGGTTAGGGGGTAAATATTGGGTAATTTGC TTTCTTTTGACGAGTAGAACAAACCTCAAAAGTCAAAGATGGATATTTAT ATCATTAGAAACAAAAGTAGGCACTTGAAATTGAGGAAAATTTTTGTTAA AATTAATAAACGTACATGTACGTTTATTAGATACCCGAGAGTATCTTCCT TGAGAGTGGTTTGTACATGGTAGCAAAACAAACTTCCAATTTACATGGAA TAGATTTTAAATGTAAGACGGGTTCAAGAAACGAGCTTGTCGGAACAGGT TGACGAGATAAAGCTTTTAATGCTTTAAAGATTGAAACATAAAAAATAAT CAGGAATAATTAATTGATTTGATGATTGATTGATTTAATTACTGATTGAT TGATTGATTGATTCTCTATTGCTACTTTGCCTAATAAACAATAGTCAAGA GGATACTGCGGATAAAATTTATCAAAAAGTTCTGCGCCATCTTAAATAGG GCGAAATAGAAACCAATCCTAGCTAAGGCCCGGACTCCACTCGCCTACAC TTTGATTGTACTTCTCAAGCAAAATCTTTCATGTTGTTGGTCAAAAGAAA AATAAAGATATGCCATTGTGGTCCATTCAGACGTACAGTCGAGAAAAGTT 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TAGTTATTAATAAAATAACAGACAATATAAATTACAGTTTGATAAGTTTG AACAAAAATATCAACAAAATGTACATTTGAAAACTTGAGCAAATTTCTTT AAAGATTCCCGAAAAAGAATTGAAATCATTGCTGAAATGAACTTCTGACT AAATTACAGTATTTATTCAGTTTTAAAGACAAGAAACAAAATTAGACATA CAAAACACTTTTTCCATTCAATGAATCGAATCAGCTCATCATCATAACCA GTCTGCCATTTTGTTTGTTTTGATTTGCAAAAGTAATATTGTAATCCTTG TTATGGTGATGTTATATACTTTTTCTATAATTTGCATTTATAACACTCGC TTCAGCTTTTCAATCCTAAATCAAAACTAATGAAATGCAATATATAATAA TGGTAATAGCATATAACGTAATATGAAAATGTGTATAACATTTACCGCTG TATAATTTACCGCCATATTTTTGCGGAACACTTAATTGGCCGGAACAGAA ATACGAACAAACGCGCGCGCGCAAAGATTCGAGATTCCTGTCCAATATCC TTGCGTGAAGCTATGAAGGCCTCCTCACTCGCTACGCTCGTTGCGGGGGC AAAAAGTGTGTATTAGTCTTCAATTTGATAAACACTTCGACTTCGTCATT AAAACTATCAATTAACATTGTTGGAAAGGTTTATGGATTATCAGAAACAT TGGTATGATACAGTATTGTATGGACTATAATGGAAACCCTTTTTAATTAC ATGCCTCTGAAGAGACTGCTAATTTAAAAGTAAACGGTTGTCTTTCTTCA AGTTGTGGCACCGTCGACAAGAAACAACTAATGTCGTTTTGCTTGCATAT TCGATGTCGATTCAAGGTAAAAGGGTCAATTAGTCGGGCGCTCTTATTAC AATTTCTCCCGGGGGAGGGGGTACTACCCTTGTCGACCGACGGGGGTTTC 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ATTCGACGGACATATGATTTGGAAGATCGACAATTTTGAAACGCGATACC AACAAGCGGTAATTGGAAAAACAACAGCTTTACACAGTGCACCTTCATTC ACCTCTCGATATGGGTACAAATTCTGCGCACGACTCTACCTGAACGGTGA CGGAATGGGTAAAGGCACCCATGTGTCGCTTTTCTTTGTCCTAATGAAAT CTGAGTTCGATACTCTGTTAGAATGGCCTTTTAACAAGAAAGTTACTTTC ACTTTAATCAACCAGGAAAACCAAGAAAGGAATGTGGTGGAAACGTTTAA TGCTGATGTTAACTCCTCAAGTTTCAAGAAACCGACCAAACACATGAATA TCGCATCAGGGTGCCCTTATTTTGTTTCGCAGGAAAAACTGAAGAAACCA AACTCGGGTTTTATCAAGGATGGATGCTTTTTTTTAGAGATAAAGGTCAA GTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000057_pilon:1757401..1770204-

>XLOC_007909 ID=XLOC_007909|Name=XLOC_007909|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2448bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000057_pilon:1757401..1770204- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTTGTCTTTTAGGGACTCAAACATATGTCCAATCGACCATGAAGTTAT
TGAGCTAGACGGCACTTATCCAGATAGAGCAAAACAACGAGAGATTCTTA
TGCTGGCATGCTTTTGCCCAAATGCAAAGTTTGGATGTGGCTGGCAAGGA
TCCGTCAAACTGTTAGAGATTTTGTCTTTTAGGGACTCAAACATATGTCC
AATCGACCATGAAGTTATTGAGCTAGACGGCACTTATCCAGATAGAGCAA
AACAACGAGAGATTCTTATGCTGGCATGCTTTTGCCCAAATGCAAAGTTT
GGATGTGGCTGGCAAGGATCCGTCAAACTGTTAGAGGATCACAATGCAGT
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ATGGCATGTCCTTATGCACACGCTGGATGTCAATTTCAGGATCACAATGC
AGTATGTCAATTCGGTCCAACAGAATGTGTCTTTTGTTCCAAGAAATTTC
CTCCCAGCGAAATGGAACAACATCAGAAACAATGTGTTCTGGCAATGAGC
AACATGGCATGTCCTTATGCACACGCTGGATGTCAATTTCAGGTTTCCGA
ATTCGAGTCAGTGGATGAGCACATCACAAGAAATGCTTTACTTCATGCCA
AAATGTTTTCCGAACATTACAAAGCAAACGAAACTAAGCATCAGCAAGAA
AAAACTGAAATGGTTAACCAGATCAAAGGATTACAACTCGAGTTGCATTC
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GTGGAGGCTATTAAAGCCCGAGGCGTTTCCGAATTCGAGTCAGTGGATGA
GCACATCACAAGAAATGCTTTACTTCATGCCAAAATGTTTTCCGAACATT
ACAAAGCAAACGAAACTAAGCATCAGCAAGAAAAAACTGAAATGGTTAAC
CAGATCAAAGGATTACAACTCGAGTTGCATTCAACTAAAGAAAAATTTAC
ACAAACTACTCGACAAATGCAGCAAGAGTTTGAAAACAAAATTGACGAGT
TTCAAAAAGTTTTGCAGGTCAAATTATCAGAGGTGGAGGCTATTAAAGCC
CGAGGCCCAAGCGGTGGCGATGGCACAGTCATGAGTGCGGAGATGTCGTC
TGGCATTCACAAAGAGATAAAGAAGACACGTGATGACGTCACACAAATGA
ACAAGACTGTCAGCAACATCAGCCAGAATCTCTCCGACGTCGACTTACGT
CATCAGCTCCACGAAAACACGACATTCGACGGACATATGATTTGGAAGAT
CGACAATTTTGAAACGCGATACCAACAAGCGGTAATTGGAAAAACAACAG
CTTTACACAGTGCACCTTCATTCACCTCTCGATATGGGTACAAATTCTGC
GCACGACTCTACCTGAACGGTGACGGAATGGGTAAAGGCACCCATGTGTC
GCTTTTCTTTGTCCTAATGAAATCTGAGTTCGATACTCTGTTAGAATGGC
CTTTTAACAAGAAAGTTACTTTCACTTTAATCAACCAGGAAAACCAAGAA
AGGAATGTGGTGGAAACGTTTAATGCTGATGTTAACTCCTCAAGTTTCAA
GAAACCGACCAAACACATGAATATCGCATCAGGGTGCCCTTATTTTGTTT
CGCAGGAAAAACTGAAGAAACCAAACTCGGGTTTTATCAAGGATGGATGC
TTTTTTTTAGAGATAAAGGTCAAGTAACCAAGCGGTGGCGATGGCACAGT
CATGAGTGCGGAGATGTCGTCTGGCATTCACAAAGAGATAAAGAAGACAC
GTGATGACGTCACACAAATGAACAAGACTGTCAGCAACATCAGCCAGAAT
CTCTCCGACGTCGACTTACGTCATCAGCTCCACGAAAACACGACATTCGA
CGGACATATGATTTGGAAGATCGACAATTTTGAAACGCGATACCAACAAG
CGGTAATTGGAAAAACAACAGCTTTACACAGTGCACCTTCATTCACCTCT
CGATATGGGTACAAATTCTGCGCACGACTCTACCTGAACGGTGACGGAAT
GGGTAAAGGCACCCATGTGTCGCTTTTCTTTGTCCTAATGAAATCTGAGT
TCGATACTCTGTTAGAATGGCCTTTTAACAAGAAAGTTACTTTCACTTTA
ATCAACCAGGAAAACCAAGAAAGGAATGTGGTGGAAACGTTTAATGCTGA
TGTTAACTCCTCAAGTTTCAAGAAACCGACCAAACACATGAATATCGCAT
CAGGGTGCCCTTATTTTGTTTCGCAGGAAAAACTGAAGAAACCAAACTCG
GGTTTTATCAAGGATGGATGCTTTTTTTTAGAGATAAAGGTCAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_007909XLOC_007909-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000057_pilongenomesc0000057_pilon:1757401..1770204 -
Properties
Property NameValue
Aaloc604-1224:622
Aaloc322-603:1180
Aaloc169-321:4770
Aaloc1-168:12805