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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:880964..888411+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_007495 ID=XLOC_007495|Name=XLOC_007495|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7448bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:880964..888411+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGAACATGGCTGATTCTTTATCTCAACTTTTCGAGTAAGTTTTGTTTAC
TATTGTTATAAACAactgatttttttatcaaagaaaagGTCAAATTGGAT
TGATgaaccaacattttttaaagtcCAGCTGGTATAGGAATATTGATAAT
AATAAACTATTAAATGAATCAAATAATTGGTAACAATGCCTTTCATCGAT
AATTTCAATTGACACTACCTTAGTTTAGACATTTGGCATGATCTAAACAT
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AAAATTTACTTTCGATCTGTTAGTttgaaagtcaaaataaaagaaataaa
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GACTCTTACAGAGACtcgattttctttttaatggttttttcaAAGGGGTT
AAAAAGAGACTtttgagggtgtgaaaaagggactcttatggctcgcacat
acccgacatccattttgcctaagtacccccccccccccacaggAATGGAC
GCTACCGTGCCCGGCTGAGGTTATAAATACACCACATCTGACACTTTCAA
TTCTATGATCCTGATAatgaatattttcattattttctgtAGAAAAGCTA
CATTGAAGGGCTGAGAACATGggttgaaatcgaaagtgtttcTGCAGAAC
CTGCTCGCAGACCCTATGTTTTCCAAATGATGGAGCAATGCAAAAAGGTA
ATGATAGGATTTCGAACTGTTTCagttctttttgaatttcattaccttct
ttttcatcattattttcaaattaacaATCCTTTAGCATTTGAGTTTGACT
TAATAACATATAGTGGACAATCGTCAGAGCTGCATAAATAAATTTAGATA
AACTCTGCACAAAATATAAACTTCAGAATCAATTTTGAACGTCGACTTCT
CTTTATCATCACTTTAGCAACTCGAGGATTTAGGTGCTAAAATCGAGTTA
GCTGAAAACCCTCTCAACAAAGGAAAGAAGGAAGGTGATCTCATGTTACC
ACGTATCATCTTGGGGAATCTCGGTGATGATccaaaaaagaagacactaT
TAGTCTACGGGCATCTTGATGTTCAGCCAGCAAACAGATCTGACGGTTGG
GATTATGAGCCTTTCAAATTGACAGAGACAGAGGATGGCAAACTTTACGG
ACGAGGGTCAACCGATGATAAGGGACCTGTTCTCGGTTGGATTAATGTTT
TATCAGCATACCAAGCTCTGAAGATGGAAATCCCTGTTAATCTAAAGGTT
TATTATGTCATTCTATTAGCATTTTGGTTGGTTTAGGCTTCATTCGTTAT
CAACTAAATGAAACTTTTTGCTGCTAGTTCTATTATAGTATCGAAAATTa
tcttttgttcttattttttaaacgttttatGAGTATTCTAGTGTCATTTT
ATAAGAAGTTAGATGTTGTAAAGCCCTGAAAACCTCAAAATGCCTTTAAT
TTTTGGCTCTGAAGTCATGTGTTCTcatttattttgtttgaaaaaacgTT
AACTTTTTCTTCCAATGTAGTTTTGTTTCGAAGGTATGGAAGAGTCTGGC
AGTGAAGGATTAGATCAATTGATCGATGAACGAAAGTCCACTTTCTTTTC
GGTAAGAgcctttttttactttgaacaAGAGTATTCGAAACATAGTGACT
TTGCTTTCCTTGGTCttgaaatgatgaaaaagaattaATTACACACTTGA
TTTTGGTCAAGACTTGGTTGGTGtagattttctttaaagtttgaTGTATT
TCGATTTCTGTCTTGAATTTTGTGAAATGGTTAATTTTTCTAATGATTGC
TCTACCATTTTTATACAAACAAACGAGTCTCTAAGACCATGTTGTCTctg
tttcaaaacttttttgtaaGCTATTTGTTGTTTCCAGGGTGTAGACTATT
GCTGTATTTCTGACAATTATTGGTTGGGAAAGAGTACTCCTTGTGTGACT
TATGGATTGAGGtaaaataccttaagtggataaattttcgcgtggacttt
ttttcgcgaatcgaaaatcgaaaattttcgcgtcgactaaatttcgcgaa
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aaatcataattttaaatttttcgcgtggacaaaatttcgcgaaaatggcc
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aaggtagtatCATCAAGAAAAAGAGTAATTGAActctttcattttgtttg
atACTGGGCTTTATATGTTCTTCTGattagtttttttgatttttttttgt
aaaagatatGTCATTTTTTCCTTCAGTTTAATGATTAACATAAAATCAGT
AAAGGAACTTCTAATGAAACAAGAACTCAAATCTGCgggggggggtattt
agtttaatgggtgctgggtatacGCGAACGATAAGGGTTGGTTTTTCCAC
attccaaagtctctctaagaaaGACAAAAAGTTGTCTTTTTCAGAGTCgc
aaaacttttaacttttacgaacattttttagttttcactAAATTTGGTCT
CTCTGACACtgagggtcggttttcggaagTCTGGTCCGCACATCACAGAC
AATCTCCAACCCTAGTACTCCTGCCACTCCGCTCTAGGACCTAAATAgaa
caaaacttttcttttaacTTTAGAGGTATTTGTTATTATCATGTCAAGAT
GAGATGCGCTGGCGCTGATCTTCACTCTGGTGTTTTCGGTGGCACTGTGT
AAGTTTTTCTCTAAATAAATGTTTAATCCTTGACTTTCATTTGAAACCAT
CTAGCATCTTCTTATTAGCTGTCTTTTTAGGGAATTttactctttctttt
ttattaagaAACCATCTAGCATCTTCTTATTAGCTGCCCttttagggaat
tttaaaagttctttcttttttattaaaggttttatttttacataagtgtt
ccgtttcatatcagacacatatttcatataagcgaaaaaaatgtttttat
tttcctctttctgaccaatcttgctccacatacgtgtcaatccaatgtga
aaagcttgtgaattaaaattgatgagtaagcaaatgatatcactgttatt
taaaaacaaaacctttaagcccaaaataaaaagtttgaaaaaagcacaaa
agacaaaataagtgaaaCACCCCTGCTAGCCTCTAGTACCTTTTGCCATT
TGACCTTGTTCCTGGGAAAGGCGGGATGTCGAATTTTATAGCTGTAGTAG
TTTCTTAAGTTTTTGTTTCCTGCACTACATGATGTGATTTATTCTTTTAG
AGTAGACTCTGCTTTatgattaatatttttttaggcACGAGGCAATGATC
GATTTAGTACATCTGCTCAGCAAGATTGTAAACCAACGAGGTCGTATTTT
GATTCCTGGTGTCAACGAACTTGTGGATAAACTTACCCCGGAGGAAGATG
CACTGTATGCACCCATTGATTTCGACCCTGAAGAATACCGACAAGACATT
GGAGCTGATAAATTATTACATCACGGTGGCGATTGTAAAAAGAAGACTCT
CCAACATCGATGGAGATACCCATCTCTCTCTATTCACGGTAAAAATGAAT
GTTAAAGGAATACCTTTTCAGTTAAATTAGATATCTAGGGGGtcaattga
ttttctttcgTATTTGTTTAAGATGAGCTAAGCTTTAAGTGAATGTTTCG
AGTTTAGATAATAAGCAATTCGAGGCGATTTTCTTTCCACATTGATACTA
TCTCTCTATTTTAGGTTTCCAGAATGCTTTTGATGGTGAAGGATGCAAGA
CTGTCATTCCCAAGGAGGTGAACATTTTCTCCTCTTTAATTCTCCATGTA
TCTCGAACAACAACTTGAACCACTTTACCCAAAGTTACCGAAAGTCGAAt
gcattgggctattccaggaatagtctgtaccccctatgttgaggagatgT
GACGTCCAGGCTGTCAGTAAAATTGGgattgaaaatccagggtggccctg
aaaaatttgacaaaatcaacctttaaaaaaaaaagatctcctcagcatag
ggggtacaaattttttctggattAGCACATTAAGTAATAAGAGCGCTAGG
TAGCAAAATTAAGATGACTTTGGACCCATTTACCATTGGTTATATGGAGG
TTCTTCAAATTGAATAAATCTTTCGTCGTTATGGAAACAAATGTGTGATT
TAGCAAACCTCTACAAAACCTCTATTGGTCATATCGCCTCGGTAAAATGA
TTCAATTGGCCGTGGATCATCCTACTTTCACCCATCATTCGGAATCTGAT
AGGAAATAACCAGAATTGGTTAATTTTTGGTTCATTTTTCTCCTGGTGGT
TTGATCTCACGATTTTTGTGAGGAGTGATGAACAGATATTGCACGGTCTT
CTCGatgtgggatacgggatatacagggtcagtaaaaaaCGCCACTGTAT
CTCATTGCAAATAGGTAAAAAGTAATCATAACAATTGTTTTCATCAGGTC
ATTGGTAAATTCTCCATCCGCTTGGTGCCATCACAAACTCCAGAAATGAT
TGATAAATTAGTTGAAGATTATTTGAAGAAAGTGCACGCTGAAAGTGGAT
CTGCCAACAGGCTAACGTAAGTTTTTTAACAAAGCCTCAAACAAATTAAA
TACGAAAGTTAGTTGGATAAGCATAGATTTAAATGCCACGGGTTTTTCGT
TACAAGCCTGAAATTGGGGAAAGAGTCTATTACTCTACTTCACCTTAACC
AAAACTTGCCACTCaattacttttcatttttatcgaaaACAGCTGTGTCA
TTTCGATATGTGATTTTTAATTCAGATTTGCGCCATGAATTCAAAAGTTT
GAATAACTGTTCGGGGTTCGGGAATAACTGTTTCGGGGTTCCTTCCTCCT
AGCGATGTAATCTAGAGGTACTTTGCGGGAGGGGAGGGATCATATAGTGG
TATTATATGTTTGTGTCATTTActtgttaaaaaaagaaaagtttgaatta
aTATTTGTTTTCTTATGAAGAATTTGAACAAGAAAATGATGTTGTACTGC
TGCTTTAccaattactcttaggttccaaatataCGGTGGGGGATCGAATA
AACAAAGGGTTTGGAAAATtatcgagattttaataaggggggggggggta
attacttgggggttggaaattgtacttctgaaaacccaaaaataaggtaa
ttataggCTAAATCAGGCtatttggagcaaaataagggaccttctctttg
acagctgaaaatattcttaaaaattaataagcgggggtcctaataagggg
ggtggttgggggtggtggttgaaaaattaacaagcggggggggcgtttat
ttggaacctaatagtactttttttatctttttcatctAGTGTCATCAGTG
AACACGGTGGCAAACCCTGGTTAAGTGATTACACTGACGATAACTTCAAA
TCTGGACGGAATGCCATGAAAAGAGGTATGTAATACTCtgcaaaaacttt
caatttctgtttttttttttttttcaaatttatagtTATAAGAGACATGA
ATAAGTATTCGAGGCATTCGTCGAACTCAAAGTCGAAGTTTTGTTATTCT
AGTAAGTTTAGCACTACTAtgcaaatttcataaaattcttattttcagtT
ATACGTTGACTTAGAGGAGTGTTGACTGAGAGTTTTAAGGCATCACAAAT
CAGGAGTTCTCAAGTCCCTGCCTTTTTCAACACTCCATTCTGCTCATACG
ggaagaatttaatttcgtaATTCGTATCTCAAAATTTGgaagtttcgcgg
aatttaaatTCGCGGTTGAGATATCTATTTGTTTAcaatatggcctattt
tgccctaaaataaCCGAAATAACCAATTTTAGAGGTGACTTTTTAATTCc
tgagaatattcgtgttttgcggaatttaatttcgtggatttGTCGAAAAA
CCGTGAACCGTGAATATTTGTTTcacgaaaatttctttccttaaagTAGA
TAGCCGATCTAGCTGGTCGTGGAGTCCCCGAAAGCATTCGAAAGACTGTC
TTGTCCTAGATCATTCTGTTATATATGCAAAACATCGACTCTGATaatac
gCGGGGAAAGATTGCGACTTTACGACTTCACACAAATCACCTTTGCGCTG
TTTTCTCCATAGTCTTTGGAAAAGAACCTGACTTGACACGTGAAGGTGGA
AGCATCCCAGTAACACTTTCTTTACAAAATGCAACGGAGAAGAGTGTGAT
GCTGTTACCTATAGGTGCTTCTGACGATGGTGCTCATTCACAAAACGAAA
AAATCAACGTCTCTAATTACATCAATGGAGTAAGTGACTTTGAATGCCAC
TGACCTTGATacatccctggaccaagctatatccgccatctttgatcgaa
gtttttttgaattggtaccactgacctttatataaccctggaccaaacaa
tatctgccatctttgattggagtttttttagaattggtacccaaggagaa
gccattgcaatgttaaaaattaacgtctaacgccgctacatcatcaaaag
aatttgaggaaaagtagacctagcgctctcgatgcaaatacaccgctatc
gagtagtgccgacattagggtaccaattttcaaaaaactccgatcaaaga
ttttgcttggctgggattgagaagctttgtccagggtatataaaggtcag
tgattggTACCTGTAAAGaggccattgcaatgttaaaaattaacgtctaa
cggtgCTACATCATCAAATGTTTTCCCAGAGAAAGTAGATCTAGCCCTCT
CGacgcatttacaccgctattgagtagtgccgccattaaggtaccattta
aaaaaaactccgatcaaagattttgcttggccaggtttgagaaacttggt
ctagggtatataaaggtcagtggataaTACACGAAATACACGCTTTGATA
TAAGAAAGAATCGATTTCTGACTGAGGTTCTGCTGTTTTTAAGTTTAAAG
ACCTAAAGTGTTTTGACCGTGTACTTTACTGAAGGGCTTTAATAATTTCG
GAAATGTAACGGTTCAGGTTTTCCTTAATTTCATCTTTGCTTTCGCTAAA
TTCTAGACATCTTTTTGTATTCgatgtaaaatgtgtgtggatcaaaaatg
caaaatctaTGTCTTGAAAAAATCCTTCTTATGCCATTTGATGTAATGTC
TCGATATCCGTTATTAAGATGTTTTGATTGTTCTTATCTTTCCCCCTTAG
ATCAAAGTTCTCGGAGCATACATTGACGAATTAGGAAAACTGAACTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:880964..888411+ >XLOC_007495 ID=XLOC_007495|Name=XLOC_007495|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2892bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:880964..888411+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGAACATGGCTGATTCTTTATCTCAACTTTTCGAaTGAACATGGCTGAT
TCTTTATCTCAACTTTTCGAATTTGTCGACAACAACAAGATTTGTCGACA
ACAACAAGAAAAGCTACATTGAAGGGCTGAGAACATGggttgaaatcgaa
agtgtttcTGCAGAACCTGCTCGCAGACCCTATGTTTTCCAAATGATGGA
GCAATGCAAAAAGAAAAGCTACATTGAAGGGCTGAGAACATGggttgaaa
tcgaaagtgtttcTGCAGAACCTGCTCGCAGACCCTATGTTTTCCAAATG
ATGGAGCAATGCAAAAAGCAACTCGAGGATTTAGGTGCTAAAATCGAGTT
AGCTGAAAACCCTCTCAACAAAGGAAAGAAGGAAGGTGATCTCATGTTAC
CACGTATCATCTTGGGGAATCTCGGTGATGATccaaaaaagaagacacta
TTAGTCTACGGGCATCTTGATGTTCAGCCAGCAAACAGATCTGACGGTTG
GGATTATGAGCCTTTCAAATTGACAGAGACAGAGGATGGCAAACTTTACG
GACGAGGGTCAACCGATGATAAGGGACCTGTTCTCGGTTGGATTAATGTT
TTATCAGCATACCAAGCTCTGAAGATGGAAATCCCTGTTAATCTAAAGCA
ACTCGAGGATTTAGGTGCTAAAATCGAGTTAGCTGAAAACCCTCTCAACA
AAGGAAAGAAGGAAGGTGATCTCATGTTACCACGTATCATCTTGGGGAAT
CTCGGTGATGATccaaaaaagaagacactaTTAGTCTACGGGCATCTTGA
TGTTCAGCCAGCAAACAGATCTGACGGTTGGGATTATGAGCCTTTCAAAT
TGACAGAGACAGAGGATGGCAAACTTTACGGACGAGGGTCAACCGATGAT
AAGGGACCTGTTCTCGGTTGGATTAATGTTTTATCAGCATACCAAGCTCT
GAAGATGGAAATCCCTGTTAATCTAAAGTTTTGTTTCGAAGGTATGGAAG
AGTCTGGCAGTGAAGGATTAGATCAATTGATCGATGAACGAAAGTCCACT
TTCTTTTCGTTTTGTTTCGAAGGTATGGAAGAGTCTGGCAGTGAAGGATT
AGATCAATTGATCGATGAACGAAAGTCCACTTTCTTTTCGGGTGTAGACT
ATTGCTGTATTTCTGACAATTATTGGTTGGGAAAGAGTACTCCTTGTGTG
ACTTATGGATTGAGGGTGTAGACTATTGCTGTATTTCTGACAATTATTGG
TTGGGAAAGAGTACTCCTTGTGTGACTTATGGATTGAGAGGTATTTGTTA
TTATCATGTCAAGATGAGATGCGCTGGCGCTGATCTTCACTCTGGTGTTT
TCGGTGGCACTGTAGGTATTTGTTATTATCATGTCAAGATGAGATGCGCT
GGCGCTGATCTTCACTCTGGTGTTTTCGGTGGCACTGTgcACGAGGCAAT
GATCGATTTAGTACATCTGCTCAGCAAGATTGTAAACCAACGAGGTCGTA
TTTTGATTCCTGGTGTCAACGAACTTGTGGATAAACTTACCCCGGAGGAA
GATGCACTGTATGCACCCATTGATTTCGACCCTGAAGAATACCGACAAGA
CATTGGAGCTGATAAATTATTACATCACGGTGGCGATTGTAAAAAGAAGA
CTCTCCAACATCGATGGAGATACCCATCTCTCTCTATTCACGgcACGAGG
CAATGATCGATTTAGTACATCTGCTCAGCAAGATTGTAAACCAACGAGGT
CGTATTTTGATTCCTGGTGTCAACGAACTTGTGGATAAACTTACCCCGGA
GGAAGATGCACTGTATGCACCCATTGATTTCGACCCTGAAGAATACCGAC
AAGACATTGGAGCTGATAAATTATTACATCACGGTGGCGATTGTAAAAAG
AAGACTCTCCAACATCGATGGAGATACCCATCTCTCTCTATTCACGGTTT
CCAGAATGCTTTTGATGGTGAAGGATGCAAGACTGTCATTCCCAAGGAGG
TTTCCAGAATGCTTTTGATGGTGAAGGATGCAAGACTGTCATTCCCAAGG
AGGTCATTGGTAAATTCTCCATCCGCTTGGTGCCATCACAAACTCCAGAA
ATGATTGATAAATTAGTTGAAGATTATTTGAAGAAAGTGCACGCTGAAAG
TGGATCTGCCAACAGGCTAACGTCATTGGTAAATTCTCCATCCGCTTGGT
GCCATCACAAACTCCAGAAATGATTGATAAATTAGTTGAAGATTATTTGA
AGAAAGTGCACGCTGAAAGTGGATCTGCCAACAGGCTAACTGTCATCAGT
GAACACGGTGGCAAACCCTGGTTAAGTGATTACACTGACGATAACTTCAA
ATCTGGACGGAATGCCATGAAAAGAGTGTCATCAGTGAACACGGTGGCAA
ACCCTGGTTAAGTGATTACACTGACGATAACTTCAAATCTGGACGGAATG
CCATGAAAAGAGTCTTTGGAAAAGAACCTGACTTGACACGTGAAGGTGGA
AGCATCCCAGTAACACTTTCTTTACAAAATGCAACGGAGAAGAGTGTGAT
GCTGTTACCTATAGGTGCTTCTGACGATGGTGCTCATTCACAAAACGAAA
AAATCAACGTCTCTAATTACATCAATGGATCTTTGGAAAAGAACCTGACT
TGACACGTGAAGGTGGAAGCATCCCAGTAACACTTTCTTTACAAAATGCA
ACGGAGAAGAGTGTGATGCTGTTACCTATAGGTGCTTCTGACGATGGTGC
TCATTCACAAAACGAAAAAATCAACGTCTCTAATTACATCAATGGAATCA
AAGTTCTCGGAGCATACATTGACGAATTAGGAAAACTGAACTAAATCAAA
GTTCTCGGAGCATACATTGACGAATTAGGAAAACTGAACTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:880964..888411 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1399-1446:7401 |
| Aaloc | 1234-1398:6315 |
| Aaloc | 1147-1230:5541 |
| Aaloc | 1027-1143:4648 |
| Aaloc | 976-1026:3917 |
| Aaloc | 721-972:3486 |
| Aaloc | 646-717:2825 |
| Aaloc | 571-642:2038 |
| Aaloc | 490-570:1671 |
| Aaloc | 160-489:1068 |
| Aaloc | 55-159:743 |
| Aaloc | 37-54:323 |
| Aaloc | 1-33:1 |
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