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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:891475..899135- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_007473 ID=XLOC_007473|Name=XLOC_007473|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7661bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:891475..899135- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTCCACCGAGTCTATTCCGTAAGTCAATGATTTTTATTAAAATAAAT
AAATGTATGTATATTTAAAGGACTGCTGCTGGGGGGATCCTGCATCGATC
GAAAATATATTTAAATTTTTAAGACAAGAAATCTATCAAAAATGACGTAC
TAAAATATTGAAATCGCTGCTCTTAACTTGAATAAGTTATAAGCATTTTC
ATAACGCATGAAAATGAATACGTTTTTTAGAAGAATAAAAGAAAATTCAA
CCCGTGAATTTTCGAACAATTTAATATTATATTATAAAAATTATGATAAA
TTTGAGTACCCTTTAATCAGGCTATATTCTCCAATCTTTAAAAAAATCTT
ACGTGGACGGAACTTTAGTATTAGGCTAAGAACCCTTTTGGATAAGTCTT
TGTGGTCTTATAAAAACTCTAAAGAATTCCAGTAAAATGAGCTTGTCTTG
CTGACAGTGATTCGATAATAAAGAAAGCCGATTTGAAAAGAATCTCAATG
CAACTTTAATGACAGAGAAAAAGTTAACAGCCCATCTGATTTCTATTACG
TCCATGATTTGATTCGAAAACAAGGATATAAAAAGATTTTGGGTATACTA
AACAGCTTGAGATTGAAAACAGGATATCCGAAAGTCGATGTCTGACTATG
ATTATCATCGTTTCAGGATTTGCACAGTCTACTCGGCATCCCATTGGTCA
ATATGAGAATCCATAACAATCCTGAAGACAAAAAACTTCCACCAATCCTT
ACAGCTCACATGGGAAATGATCCTTCTAAAACCACTTTGTTGGTTTATGG
TCATTTGGATGTTCAACCAGCTCCTGATCCAGAAAACTGGGTCCACCAGG
TGAGTAAGGAACTAAACTATTTATCAATTTCATCGCCTGACGACTGACTA
TGTAAGCTATGCCCAGTATATACTTAATTGCAAATATAGTATAATGAACT
AAAGATCGCATACATATATGCACCCTTGTCTCACAGCCCCGGTGAAACTT
TTTTCCTCAGTGGAGTAGAAATTCCTATAGAAATCCCAATGGGGATAGAA
ATTCCAATCGGTTCGAAGGTTAAAATATTTAGTAGGGATGTTTTTAGAGT
TCAATTTTTAAGCATGGAATTTCTAGTGGGGAAGAAACCAAAATCACTTT
CCTGGTGGAGCTGAAATTCCAGGGTATCTTCCAACTGGGGACAAGATTTT
GGCCAAATTTTCCAGTGGGGCTGGGGTCCCAGCGGGTTTATGACACAGGG
AAATATAATTGAAAAATATTTGAGGAAAACTACTAATTTTCATTTTCTAG
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GACGATTAAATATTACGCAAGAGGTTCGACTGATGATAAAGGACCTGTTC
TTGGTTGGATTAATGCTATCAAAGCTTATCAAGATCTTAATATGGAAGTC
CCTGTTAATATCAAGGTATCAATCAAGCATCATTACTTATAGCACTATCA
AAGCATAAAAAAAGCTGACAATACGCACGGAGCGTGGTTGGGTATCGATA
ATAGTCTTTCCATTTCAAGTTTCTAAGTGCCTTTATTTCTTGGTCATCCA
AAAGTTAACTTTTCGACGATTTTAACATCAGAATCAGATTTTGATTTTGT
AGACACATGCTGTAGGACTTGACCACTGGGCCACCCGAATTGGAGGAGGT
ACATTCACTTGCCAAGTATCGTGAACATGCAACTTTGGAAAAGCATGATT
AACATCATTTCTCTTTGACTATATGCGTCTTTTAATTTTCAGTTTTTGTT
TGAGTGTATGGAAGAATCTGGAGGTATTGGCTTGGAACAATTGATTGAAG
AACAATCGGCTTTCTTTGAGGTAGGGTAGATCTGAGAGCCGTCGTCAGAT
ATCATAAATAAACTTTTTTACACTTTACCATCAGAACGCAAATAAGAGGA
TGATTTCAATTTTGCCACCGCATACGAGGAGTTGCTAGTTTCCACAGTAA
AGAGATAATTCTTTAAATCTTTGTACCCACCTCATCACACATTACTCTAC
TTTAAAATCTGTTTGTGTATGTTGCCAGGGCGTTGATGCAGTCTGCATTT
CGGACAACTACTGGCTTGGATTAACAAAACCATGTGTCACATATGGATTG
AGGTTCGCTTTTCATTTTTCATTTTCCCTTCAAAGTAAATATCTTCCGAG
TCGCATCATAAATTATCTCTTACTCATTCAGTTTGCAAACAAATTGTGTT
ATAAATATCACACAAGGATACTCCTGTATTACTCCTTGACGCCTGGATAA
GACCCCCTTTCGCACTGGAAATATTGGTCCAAAATTCGTCCTCGGTATAT
AGATTACTCTGAAATTTCATCCCTGTGCACAATTAGCTGATTAAGTGGTG
TAAAGGACCAACAGTCCGTAGAAAACTATGTTTCTCAATTAACTTTTTCT
TTTTTAGAGGTATTTCATACTACAATGTAACAATTGAATGCGCTGCCGGA
GATCTTCATTCCGGTGTTTATGGTGGCACAGTGTGAGTATCGAGGGAATC
TAGAGAAACAATTGTGATGGGCTCTTCCAGAAAAAAATTTTACATGGAGG
ATATTTTGTCCGGGGGGGGAGGGTAGCAAAAAATCATCAAAATTTGCCTT
GTCCGGGGGGGGGGGTAAATTTGCTCTGTCCGGGGGTAATTTGGGGTGTT
CGGGGGTTCAGCAGATGCTTGTCCGGCGGGTAAAACCTATTGTCCGGGGA
GCCAAAAGTCACCCTGTTCGGGGGGTAAATCACTAAAAATTGTTATATCC
TCCACCCCCATGTACAATTTTTTTCTGGAAGAGCCCAATCGGTAGCAAAA
TAATAATGGACCGTGTCAAAAAATTAACTTTAACGTTAATAACATCATAC
CGTTGGCAAGATTCGGGCTCGAGGGTAGAAGCAATGGTCCATCTTTGGAA
AGTGCAATAATATTTTTTGCCAACTAACAGTCGGTGATTCCACTCCAGAC
TGTTTGCTGGCGCTCGTAATTTTAGTTGAATTAATTAATTCTTTACTCTC
ATTCTTTGACTTTAAGATTTCACCACTTCTTTATGTATCTATCACAATAT
GCATGACATTTTACAACTGCCCAAACTTTTGACAAGCATAGCGGCAAAAC
GCTCATTTTTAATACCATTTTCTCATTGTAGGCGAGAGGCAATGATTGAT
TTGATCAATATCTTCAGTCAATTGACGGACGGTAAAGGAGGAATTAAAAT
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TTTCGGCTAAAAGCTTGACTGACATGCTATACGCAATTCAAAAGCGAGAC
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GGTACTGTTTACCAAAGTTATCACGTGATTTATTATTTTATCTGATCTCT
AGGTTCTTGTAATGACGGATGACGAATTAGCGTTGTATGGCCCCATTGAT
TTCGATCCTGAAGAATACCGAAAAGAAATTGGAACCAAGGAATTGCTTTA
TCCTGACAAAGTTGGAACTTTAACACACAGATGGAGATACCCAAGTCTTT
CCATCCATGGTATAATTTTTTAACATTTAGTCGAGGTGTTCCCGATTTTC
GAAATCTGCCAAATAGGGATATTCATTCACTGGTAGCTCATTTTTTCTTT
TGTAAGATTGTTTCAACTTTTCTGATCCACTTTCACTTGGAGAAATAAAA
ATTAGACTTTTGTTCCATTCAATCTTTTGAAAATTTTAAACAATAAATGT
TCACACGATTTGCTTGCCTTACCACGGAATTCAGTTGTCGATATATGACA
TTTTAATCACAATATTTTTTATTTGAAGGCTTTGTTGGGGCATCGGATGG
TAACGAAGATCAGACGGTTATCCCAAGACAAGTAAAATTTATGCTCTACC
CATAATTAAACTTTAACCTCATCCGGGTGAAAATATTTGAAAGTTAAACA
GCCGATGACACCTTCCAAATTTAAAAAACCCAAAATTGGCAAAAACAAGA
TAAAATCTAATTCAAAAATTGATTTTGCTATGTGGAGTCAATTCACAAAC
AAACAAAGAAACTCTCACTTCACAACAAAAGCACCGTCAAAGTGATAGAG
TTTGAGATTGTATTTATTGTGATAATTCTTTTCTTGTTTGTAGGTCAAAG
GCAAATTTTCAATCCGTCTTGTACCAAATCAAGATCCAGCAGATATTGAT
GCCAAAGTCGAAGCTTATGTTAAAAAACTTCACACTCAAAGTGGTAGTAA
AAACCCGCTGACGTGAGTAATTCAAAATCTAAGAAAGATCTAACTAAGGA
GCTTGTAGGCTGTGTAGGATCAGTTCATTAACTCTTTATCTAGAAAATTG
TATAATTGTTTGTCATAAGTAACTGACCCAGCCTAATGATTGAACCCACG
GGCTTGCGCGCTGTAGCATACGGAATACACATTTTTTATAAGAACAAAAA
TCTTTAAGCCTTCGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAATCCTAACAAT
GTTCTTAACATGTTCTTAATTTCACCATTTTGGTCCATTTTCCTAAGAAG
GTGTTTTTAAAGTCGCAAAGCTTTGAAATGTTCTAAACTTGTTCTTAAGA
TTTTTGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATTGTTTGTGTACACGTGTAC
AGTACGTTTTGCACTAGCATATAAACATCCCTGTCTCACAGCCCTATTGG
AACTTTTCCCCACATCTTGGATAAAAGTTTCTATCGGAATCCTAATGGGA
TGGAATTCTATTGTTCCAAGCTAAAGAAATCCCGTTGGGATGTTAAGTGT
CGCTCAATGGCACCAAAATACCTGAAGCTAATTTGAATGATTATAGTAAA
ACTTTCTGTTTGAAAATGACACTAGAAGAACTCCTTAATCTTTATGCCTT
GAAGGTGCAATTACAAATCAGCAAGTTTGTGTCTAATAGATTGAGCGCTT
TCTTAAATAGTCCCTGAAAGAACTGTAACTGAGGGCATAACTTTCTACTA
ATTTCAGTTTCGTGGCTACCACGTCAGCACCAGCTTGGGTGAGCGACAAC
ACTGATGCTAACTACAAAGCCGGTATCAATGCACAAAAGAGAGGTAATAG
ACCTTTTCATTAATTACATCACAAACATCACTTGCCTCGTATTCAATTAA
ATACCATGGTGATAATGTCCCTTGAGACACTAAATGATTTCTTCATGAAT
GGAAAGTAGTTTCCATAAAATCCGCTGGGAGTTAATCACCTTGGCAATAA
TTTCAAAACGAGGCAAGTGATGTTCGTGACGTAATTTATGAAAAAGTCTT
CAATGATATCCAACATTTATGTACAGCACCTGACCCCGAGAATGTAGTAA
ACCCCGAGAATGTAGGTTTCTTATTTTCAAGCATTGTAGCCTTAACGATA
GTTCAACTTCATAAAAAGTTGTTTCAGGGCATACTGTTACATATTACTTA
TTATTTCTAGACATGAAATTTTAACTTGAATTAATTTTTTCCAACGGAAA
TCTGAATCGAAGTTGATTGGATACTACCCGAATTGAGACATTTTTTAAAT
AAATCCTCTCTAAATCGAAATCTATTGTTATTAAGTTATGATGATAGGGT
ATTTTCTTATTCCTAATGAACTAAGGAAATGGGGAAAATAGTCCATTTCA
ATATTTATTGTTCTAAGTTAAATATTTTGACGAAAATGTTTGACCTACCT
TTTGGGGTTAGTTGACCTACAATTTGGGGGCCTTCATAACCTGACATGAA
AAGTCTGTCAAATTATATAAAACTTGTTTCTTGTACTTTCATTACATGAA
AGTACTACCCTGAGAGATGATTAATGTTGATATTTTGAGCTTTTACGACG
TGTCCCAGACCTACTGGTACACAAGCCCAATCAGAAGATTTGCCTAAGTT
TGGAACAATAGAATTTCCATCCCCATTGGGACTTTAGTAGAAATTTTTGT
CCCGCTGTGGAAAAAAGTTCCACTGGGGCTGTTAGGCAGGGGTGTTGTTA
CATTATTTACATATTTTAACACAAAATTTTCAACCTACAAAATAAAAACA
AATTGTCTCTTCTTTTCGTCCTTTCTTTTACTTTTCCTCATTTGTAGCAC
AATAAAATTAATATCTTTGTTAAACTTTTGTGAGGGTATATTTATAAATC
ATAAATTTCACTTAGGGAACAATAATTTCCGATGAATACTAAAATTCCGC
TCTCAACAACCAAATCTTTTCACCTACATTCTGGGGGTTGAAAAGCGAAA
AAAATCAATTTTCAGAATAACAAAGTGCTCTTTAGAAAATTGTTTTGGCA
CAAAATATTTCTAAAACTTGCTGTTATAATTAATCAAATTGAAAAAATAT
CAACATTTTACTATTACTAGATTTAAAGCCATAAAACCAAACCTACATTC
TGGGGGTTATAATGAAAATGGGAGTCAACTTCAAGGACCAAAACAATTAG
CCTATCTATCACAAGTAATGAAACTAACCCCTGGGAAAGGATTTTGGTAG
TTCAGAATTTCGTTGAAAACATTCAATGTTTTCTGAAATGCAAATCTACA
TCTTTCAGGTCTGATTCAAAATTCACCTACATTCTCGGGGTCAGGTGCTG
TAGTGATGAATTTCAAATGAAAATTGATGCAAAAAAAAAAAACTTTAAAA
AATAGATACACCCTAAAACTTCCGGGCCGTACGGCGTTTTCAGGCGGTCA
AAGTGGCCATGATACATCTCTACCGAATGGAGAACAAGCCTGCAAAATAT
GCCCTAGCCTGGGAATCCAAGCGTTAAACTTTGTTCACAGTCTAGTTTAT
GATATCTTCACTGCTTGTTTAATCTTAAAACTTTGTGAGGTGAGGTATTT
TTTGTTTTTCTAAGATTATGAGCTTGGATTCCCAGGATAAATAAGCCCTA
AAATTAAGAATTGCACAATAACAAATCTTATCTTTGAGCGTCAAAAAAAA
AGACAAACATATCTTCAACAGCACCATGCTGAATACTTTTTTTCTCCGCT
TTAGTATATGGTATTGAACCAGACCTTACAAGAGAAGGAGGAAGTATTCC
GGTAACACTTACTCTTCAAAACGCGACCAATTCAAGTGTCATGTTATTAC
CTATTGGACAATCTGATGATGGTGCTCATTCACAAAACGAAAAAATGTCG
GAGAGGAATTACATTAATGGGGTATGGGAAAATTATAGGAAAATATAGCT
AGAATTTTGTCCCGATGGGAAAAATATCCTACTATTAATTTCAGCCCTAC
TGGCAATTCAACTTTCTTTTTATCCCATTCGAAGTTATTTAATGAAAAAA
AATTGCACTCGAAAACCATCCCCACTGGATTTTTTGACCAGGGAACAATA
GAATTCCTATTCACATTGGAATTTCGATATAAATTTTCGTCCCCACTGTA
GGAAGTAGTTTCACCGGAGCTGCGAGGAAGGGGCGTGATTTAACTAGTTC
TGTAGATACAAATCATTAACTGATTGAATGAAAACTCTTCAAATAAATTA
ATAACATGAAGATTTTCGTTCTTTTTTCAGGCAAAGGTTCTTGGTACATA
CCTCAACGAACTTGGAAAAGCTCAGAAAACATTGAAAAGCAAGAAAACTG
GCAAAAAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:891475..899135- >XLOC_007473 ID=XLOC_007473|Name=XLOC_007473|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2694bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:891475..899135- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTCCACCGAGTCTATTCCATGGTCCACCGAGTCTATTCCGATTTGCA CAGTCTACTCGGCATCCCATTGGTCAATATGAGAATCCATAACAATCCTG AAGACAAAAAACTTCCACCAATCCTTACAGCTCACATGGGAAATGATCCT TCTAAAACCACTTTGTTGGTTTATGGTCATTTGGATGTTCAACCAGCTCC TGATCCAGAAAACTGGGTCCACCAGGATTTGCACAGTCTACTCGGCATCC CATTGGTCAATATGAGAATCCATAACAATCCTGAAGACAAAAAACTTCCA CCAATCCTTACAGCTCACATGGGAAATGATCCTTCTAAAACCACTTTGTT GGTTTATGGTCATTTGGATGTTCAACCAGCTCCTGATCCAGAAAACTGGG TCCACCAGGACGATCCATTTAAGTTGACGAAAGTTCCAGCAACTGGAGGA ACATTCGAGACGATTAAATATTACGCAAGAGGTTCGACTGATGATAAAGG ACCTGTTCTTGGTTGGATTAATGCTATCAAAGCTTATCAAGATCTTAATA TGGAAGTCCCTGTTAATATCAAGGACGATCCATTTAAGTTGACGAAAGTT CCAGCAACTGGAGGAACATTCGAGACGATTAAATATTACGCAAGAGGTTC GACTGATGATAAAGGACCTGTTCTTGGTTGGATTAATGCTATCAAAGCTT ATCAAGATCTTAATATGGAAGTCCCTGTTAATATCAAGTTTTTGTTTGAG TGTATGGAAGAATCTGGAGGTATTGGCTTGGAACAATTGATTGAAGAACA ATCGGCTTTCTTTGAGTTTTTGTTTGAGTGTATGGAAGAATCTGGAGGTA TTGGCTTGGAACAATTGATTGAAGAACAATCGGCTTTCTTTGAGGGCGTT GATGCAGTCTGCATTTCGGACAACTACTGGCTTGGATTAACAAAACCATG TGTCACATATGGATTGAGGGCGTTGATGCAGTCTGCATTTCGGACAACTA CTGGCTTGGATTAACAAAACCATGTGTCACATATGGATTGAGAGGTATTT CATACTACAATGTAACAATTGAATGCGCTGCCGGAGATCTTCATTCCGGT GTTTATGGTGGCACAGTAGGTATTTCATACTACAATGTAACAATTGAATG CGCTGCCGGAGATCTTCATTCCGGTGTTTATGGTGGCACAGTGCGAGAGG CAATGATTGATTTGATCAATATCTTCAGTCAATTGACGGACGGTAAAGGA GGAATTAAAATTGATGGCGTCAATGATGATGCGAGAGGCAATGATTGATT TGATCAATATCTTCAGTCAATTGACGGACGGTAAAGGAGGAATTAAAATT GATGGCGTCAATGATGATGTTCTTGTAATGACGGATGACGAATTAGCGTT GTATGGCCCCATTGATTTCGATCCTGAAGAATACCGAAAAGAAATTGGAA CCAAGGAATTGCTTTATCCTGACAAAGTTGGAACTTTAACACACAGATGG AGATACCCAAGTCTTTCCATCCATGGTTCTTGTAATGACGGATGACGAAT TAGCGTTGTATGGCCCCATTGATTTCGATCCTGAAGAATACCGAAAAGAA ATTGGAACCAAGGAATTGCTTTATCCTGACAAAGTTGGAACTTTAACACA CAGATGGAGATACCCAAGTCTTTCCATCCATGGCTTTGTTGGGGCATCGG ATGGTAACGAAGATCAGACGGTTATCCCAAGACAAGCTTTGTTGGGGCAT CGGATGGTAACGAAGATCAGACGGTTATCCCAAGACAAGTCAAAGGCAAA TTTTCAATCCGTCTTGTACCAAATCAAGATCCAGCAGATATTGATGCCAA AGTCGAAGCTTATGTTAAAAAACTTCACACTCAAAGTGGTAGTAAAAACC CGCTGACGTCAAAGGCAAATTTTCAATCCGTCTTGTACCAAATCAAGATC CAGCAGATATTGATGCCAAAGTCGAAGCTTATGTTAAAAAACTTCACACT CAAAGTGGTAGTAAAAACCCGCTGACTTTCGTGGCTACCACGTCAGCACC AGCTTGGGTGAGCGACAACACTGATGCTAACTACAAAGCCGGTATCAATG CACAAAAGAGAGTTTCGTGGCTACCACGTCAGCACCAGCTTGGGTGAGCG ACAACACTGATGCTAACTACAAAGCCGGTATCAATGCACAAAAGAGAGTA TATGGTATTGAACCAGACCTTACAAGAGAAGGAGGAAGTATTCCGGTAAC ACTTACTCTTCAAAACGCGACCAATTCAAGTGTCATGTTATTACCTATTG GACAATCTGATGATGGTGCTCATTCACAAAACGAAAAAATGTCGGAGAGG AATTACATTAATGGGTATATGGTATTGAACCAGACCTTACAAGAGAAGGA GGAAGTATTCCGGTAACACTTACTCTTCAAAACGCGACCAATTCAAGTGT CATGTTATTACCTATTGGACAATCTGATGATGGTGCTCATTCACAAAACG AAAAAATGTCGGAGAGGAATTACATTAATGGGGCAAAGGTTCTTGGTACA TACCTCAACGAACTTGGAAAAGCTCAGAAAACATTGAAAAGCAAGAAAAC TGGCAAAAAATGAGCAAAGGTTCTTGGTACATACCTCAACGAACTTGGAA AAGCTCAGAAAACATTGAAAAGCAAGAAAACTGGCAAAAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:891475..899135 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1267-1347:82 |
| Aaloc | 1102-1266:606 |
| Aaloc | 1015-1098:2604 |
| Aaloc | 895-1011:3469 |
| Aaloc | 844-894:3782 |
| Aaloc | 685-840:4210 |
| Aaloc | 598-684:4480 |
| Aaloc | 523-594:5204 |
| Aaloc | 448-519:5584 |
| Aaloc | 370-447:5870 |
| Aaloc | 205-369:6362 |
| Aaloc | 22-204:6996 |
| Aaloc | 1-21:7662 |
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