XLOC_007473 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_007473
Unique NameXLOC_007473
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000130_pilon:891475..899135-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_007473 ID=XLOC_007473|Name=XLOC_007473|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7661bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:891475..899135- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTCCACCGAGTCTATTCCGTAAGTCAATGATTTTTATTAAAATAAAT AAATGTATGTATATTTAAAGGACTGCTGCTGGGGGGATCCTGCATCGATC GAAAATATATTTAAATTTTTAAGACAAGAAATCTATCAAAAATGACGTAC TAAAATATTGAAATCGCTGCTCTTAACTTGAATAAGTTATAAGCATTTTC ATAACGCATGAAAATGAATACGTTTTTTAGAAGAATAAAAGAAAATTCAA CCCGTGAATTTTCGAACAATTTAATATTATATTATAAAAATTATGATAAA TTTGAGTACCCTTTAATCAGGCTATATTCTCCAATCTTTAAAAAAATCTT ACGTGGACGGAACTTTAGTATTAGGCTAAGAACCCTTTTGGATAAGTCTT TGTGGTCTTATAAAAACTCTAAAGAATTCCAGTAAAATGAGCTTGTCTTG CTGACAGTGATTCGATAATAAAGAAAGCCGATTTGAAAAGAATCTCAATG CAACTTTAATGACAGAGAAAAAGTTAACAGCCCATCTGATTTCTATTACG TCCATGATTTGATTCGAAAACAAGGATATAAAAAGATTTTGGGTATACTA AACAGCTTGAGATTGAAAACAGGATATCCGAAAGTCGATGTCTGACTATG ATTATCATCGTTTCAGGATTTGCACAGTCTACTCGGCATCCCATTGGTCA ATATGAGAATCCATAACAATCCTGAAGACAAAAAACTTCCACCAATCCTT ACAGCTCACATGGGAAATGATCCTTCTAAAACCACTTTGTTGGTTTATGG TCATTTGGATGTTCAACCAGCTCCTGATCCAGAAAACTGGGTCCACCAGG TGAGTAAGGAACTAAACTATTTATCAATTTCATCGCCTGACGACTGACTA TGTAAGCTATGCCCAGTATATACTTAATTGCAAATATAGTATAATGAACT AAAGATCGCATACATATATGCACCCTTGTCTCACAGCCCCGGTGAAACTT TTTTCCTCAGTGGAGTAGAAATTCCTATAGAAATCCCAATGGGGATAGAA ATTCCAATCGGTTCGAAGGTTAAAATATTTAGTAGGGATGTTTTTAGAGT TCAATTTTTAAGCATGGAATTTCTAGTGGGGAAGAAACCAAAATCACTTT CCTGGTGGAGCTGAAATTCCAGGGTATCTTCCAACTGGGGACAAGATTTT GGCCAAATTTTCCAGTGGGGCTGGGGTCCCAGCGGGTTTATGACACAGGG AAATATAATTGAAAAATATTTGAGGAAAACTACTAATTTTCATTTTCTAG GACGATCCATTTAAGTTGACGAAAGTTCCAGCAACTGGAGGAACATTCGA GACGATTAAATATTACGCAAGAGGTTCGACTGATGATAAAGGACCTGTTC TTGGTTGGATTAATGCTATCAAAGCTTATCAAGATCTTAATATGGAAGTC CCTGTTAATATCAAGGTATCAATCAAGCATCATTACTTATAGCACTATCA AAGCATAAAAAAAGCTGACAATACGCACGGAGCGTGGTTGGGTATCGATA ATAGTCTTTCCATTTCAAGTTTCTAAGTGCCTTTATTTCTTGGTCATCCA AAAGTTAACTTTTCGACGATTTTAACATCAGAATCAGATTTTGATTTTGT AGACACATGCTGTAGGACTTGACCACTGGGCCACCCGAATTGGAGGAGGT ACATTCACTTGCCAAGTATCGTGAACATGCAACTTTGGAAAAGCATGATT AACATCATTTCTCTTTGACTATATGCGTCTTTTAATTTTCAGTTTTTGTT TGAGTGTATGGAAGAATCTGGAGGTATTGGCTTGGAACAATTGATTGAAG AACAATCGGCTTTCTTTGAGGTAGGGTAGATCTGAGAGCCGTCGTCAGAT ATCATAAATAAACTTTTTTACACTTTACCATCAGAACGCAAATAAGAGGA TGATTTCAATTTTGCCACCGCATACGAGGAGTTGCTAGTTTCCACAGTAA AGAGATAATTCTTTAAATCTTTGTACCCACCTCATCACACATTACTCTAC TTTAAAATCTGTTTGTGTATGTTGCCAGGGCGTTGATGCAGTCTGCATTT CGGACAACTACTGGCTTGGATTAACAAAACCATGTGTCACATATGGATTG AGGTTCGCTTTTCATTTTTCATTTTCCCTTCAAAGTAAATATCTTCCGAG TCGCATCATAAATTATCTCTTACTCATTCAGTTTGCAAACAAATTGTGTT ATAAATATCACACAAGGATACTCCTGTATTACTCCTTGACGCCTGGATAA GACCCCCTTTCGCACTGGAAATATTGGTCCAAAATTCGTCCTCGGTATAT AGATTACTCTGAAATTTCATCCCTGTGCACAATTAGCTGATTAAGTGGTG TAAAGGACCAACAGTCCGTAGAAAACTATGTTTCTCAATTAACTTTTTCT TTTTTAGAGGTATTTCATACTACAATGTAACAATTGAATGCGCTGCCGGA GATCTTCATTCCGGTGTTTATGGTGGCACAGTGTGAGTATCGAGGGAATC TAGAGAAACAATTGTGATGGGCTCTTCCAGAAAAAAATTTTACATGGAGG ATATTTTGTCCGGGGGGGGAGGGTAGCAAAAAATCATCAAAATTTGCCTT GTCCGGGGGGGGGGGTAAATTTGCTCTGTCCGGGGGTAATTTGGGGTGTT CGGGGGTTCAGCAGATGCTTGTCCGGCGGGTAAAACCTATTGTCCGGGGA GCCAAAAGTCACCCTGTTCGGGGGGTAAATCACTAAAAATTGTTATATCC TCCACCCCCATGTACAATTTTTTTCTGGAAGAGCCCAATCGGTAGCAAAA TAATAATGGACCGTGTCAAAAAATTAACTTTAACGTTAATAACATCATAC CGTTGGCAAGATTCGGGCTCGAGGGTAGAAGCAATGGTCCATCTTTGGAA AGTGCAATAATATTTTTTGCCAACTAACAGTCGGTGATTCCACTCCAGAC TGTTTGCTGGCGCTCGTAATTTTAGTTGAATTAATTAATTCTTTACTCTC ATTCTTTGACTTTAAGATTTCACCACTTCTTTATGTATCTATCACAATAT GCATGACATTTTACAACTGCCCAAACTTTTGACAAGCATAGCGGCAAAAC GCTCATTTTTAATACCATTTTCTCATTGTAGGCGAGAGGCAATGATTGAT TTGATCAATATCTTCAGTCAATTGACGGACGGTAAAGGAGGAATTAAAAT TGATGGCGTCAATGATGATGTAAGGCTTTTACTGGATAAATGTGTAAGAG TTTCGGCTAAAAGCTTGACTGACATGCTATACGCAATTCAAAAGCGAGAC CATTATATAATTAACGTAGTTAAAAGTCTTTGGACTTCCTACGGTTAGTT GGTACTGTTTACCAAAGTTATCACGTGATTTATTATTTTATCTGATCTCT AGGTTCTTGTAATGACGGATGACGAATTAGCGTTGTATGGCCCCATTGAT TTCGATCCTGAAGAATACCGAAAAGAAATTGGAACCAAGGAATTGCTTTA TCCTGACAAAGTTGGAACTTTAACACACAGATGGAGATACCCAAGTCTTT CCATCCATGGTATAATTTTTTAACATTTAGTCGAGGTGTTCCCGATTTTC GAAATCTGCCAAATAGGGATATTCATTCACTGGTAGCTCATTTTTTCTTT TGTAAGATTGTTTCAACTTTTCTGATCCACTTTCACTTGGAGAAATAAAA ATTAGACTTTTGTTCCATTCAATCTTTTGAAAATTTTAAACAATAAATGT TCACACGATTTGCTTGCCTTACCACGGAATTCAGTTGTCGATATATGACA TTTTAATCACAATATTTTTTATTTGAAGGCTTTGTTGGGGCATCGGATGG TAACGAAGATCAGACGGTTATCCCAAGACAAGTAAAATTTATGCTCTACC CATAATTAAACTTTAACCTCATCCGGGTGAAAATATTTGAAAGTTAAACA GCCGATGACACCTTCCAAATTTAAAAAACCCAAAATTGGCAAAAACAAGA TAAAATCTAATTCAAAAATTGATTTTGCTATGTGGAGTCAATTCACAAAC AAACAAAGAAACTCTCACTTCACAACAAAAGCACCGTCAAAGTGATAGAG TTTGAGATTGTATTTATTGTGATAATTCTTTTCTTGTTTGTAGGTCAAAG GCAAATTTTCAATCCGTCTTGTACCAAATCAAGATCCAGCAGATATTGAT GCCAAAGTCGAAGCTTATGTTAAAAAACTTCACACTCAAAGTGGTAGTAA AAACCCGCTGACGTGAGTAATTCAAAATCTAAGAAAGATCTAACTAAGGA GCTTGTAGGCTGTGTAGGATCAGTTCATTAACTCTTTATCTAGAAAATTG TATAATTGTTTGTCATAAGTAACTGACCCAGCCTAATGATTGAACCCACG GGCTTGCGCGCTGTAGCATACGGAATACACATTTTTTATAAGAACAAAAA TCTTTAAGCCTTCGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAATCCTAACAAT GTTCTTAACATGTTCTTAATTTCACCATTTTGGTCCATTTTCCTAAGAAG GTGTTTTTAAAGTCGCAAAGCTTTGAAATGTTCTAAACTTGTTCTTAAGA TTTTTGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATTGTTTGTGTACACGTGTAC AGTACGTTTTGCACTAGCATATAAACATCCCTGTCTCACAGCCCTATTGG AACTTTTCCCCACATCTTGGATAAAAGTTTCTATCGGAATCCTAATGGGA TGGAATTCTATTGTTCCAAGCTAAAGAAATCCCGTTGGGATGTTAAGTGT CGCTCAATGGCACCAAAATACCTGAAGCTAATTTGAATGATTATAGTAAA ACTTTCTGTTTGAAAATGACACTAGAAGAACTCCTTAATCTTTATGCCTT GAAGGTGCAATTACAAATCAGCAAGTTTGTGTCTAATAGATTGAGCGCTT TCTTAAATAGTCCCTGAAAGAACTGTAACTGAGGGCATAACTTTCTACTA ATTTCAGTTTCGTGGCTACCACGTCAGCACCAGCTTGGGTGAGCGACAAC ACTGATGCTAACTACAAAGCCGGTATCAATGCACAAAAGAGAGGTAATAG ACCTTTTCATTAATTACATCACAAACATCACTTGCCTCGTATTCAATTAA ATACCATGGTGATAATGTCCCTTGAGACACTAAATGATTTCTTCATGAAT GGAAAGTAGTTTCCATAAAATCCGCTGGGAGTTAATCACCTTGGCAATAA TTTCAAAACGAGGCAAGTGATGTTCGTGACGTAATTTATGAAAAAGTCTT CAATGATATCCAACATTTATGTACAGCACCTGACCCCGAGAATGTAGTAA ACCCCGAGAATGTAGGTTTCTTATTTTCAAGCATTGTAGCCTTAACGATA GTTCAACTTCATAAAAAGTTGTTTCAGGGCATACTGTTACATATTACTTA TTATTTCTAGACATGAAATTTTAACTTGAATTAATTTTTTCCAACGGAAA TCTGAATCGAAGTTGATTGGATACTACCCGAATTGAGACATTTTTTAAAT AAATCCTCTCTAAATCGAAATCTATTGTTATTAAGTTATGATGATAGGGT ATTTTCTTATTCCTAATGAACTAAGGAAATGGGGAAAATAGTCCATTTCA ATATTTATTGTTCTAAGTTAAATATTTTGACGAAAATGTTTGACCTACCT TTTGGGGTTAGTTGACCTACAATTTGGGGGCCTTCATAACCTGACATGAA AAGTCTGTCAAATTATATAAAACTTGTTTCTTGTACTTTCATTACATGAA AGTACTACCCTGAGAGATGATTAATGTTGATATTTTGAGCTTTTACGACG TGTCCCAGACCTACTGGTACACAAGCCCAATCAGAAGATTTGCCTAAGTT TGGAACAATAGAATTTCCATCCCCATTGGGACTTTAGTAGAAATTTTTGT CCCGCTGTGGAAAAAAGTTCCACTGGGGCTGTTAGGCAGGGGTGTTGTTA CATTATTTACATATTTTAACACAAAATTTTCAACCTACAAAATAAAAACA AATTGTCTCTTCTTTTCGTCCTTTCTTTTACTTTTCCTCATTTGTAGCAC AATAAAATTAATATCTTTGTTAAACTTTTGTGAGGGTATATTTATAAATC ATAAATTTCACTTAGGGAACAATAATTTCCGATGAATACTAAAATTCCGC TCTCAACAACCAAATCTTTTCACCTACATTCTGGGGGTTGAAAAGCGAAA AAAATCAATTTTCAGAATAACAAAGTGCTCTTTAGAAAATTGTTTTGGCA CAAAATATTTCTAAAACTTGCTGTTATAATTAATCAAATTGAAAAAATAT CAACATTTTACTATTACTAGATTTAAAGCCATAAAACCAAACCTACATTC TGGGGGTTATAATGAAAATGGGAGTCAACTTCAAGGACCAAAACAATTAG CCTATCTATCACAAGTAATGAAACTAACCCCTGGGAAAGGATTTTGGTAG TTCAGAATTTCGTTGAAAACATTCAATGTTTTCTGAAATGCAAATCTACA TCTTTCAGGTCTGATTCAAAATTCACCTACATTCTCGGGGTCAGGTGCTG TAGTGATGAATTTCAAATGAAAATTGATGCAAAAAAAAAAAACTTTAAAA AATAGATACACCCTAAAACTTCCGGGCCGTACGGCGTTTTCAGGCGGTCA AAGTGGCCATGATACATCTCTACCGAATGGAGAACAAGCCTGCAAAATAT GCCCTAGCCTGGGAATCCAAGCGTTAAACTTTGTTCACAGTCTAGTTTAT GATATCTTCACTGCTTGTTTAATCTTAAAACTTTGTGAGGTGAGGTATTT TTTGTTTTTCTAAGATTATGAGCTTGGATTCCCAGGATAAATAAGCCCTA AAATTAAGAATTGCACAATAACAAATCTTATCTTTGAGCGTCAAAAAAAA AGACAAACATATCTTCAACAGCACCATGCTGAATACTTTTTTTCTCCGCT TTAGTATATGGTATTGAACCAGACCTTACAAGAGAAGGAGGAAGTATTCC GGTAACACTTACTCTTCAAAACGCGACCAATTCAAGTGTCATGTTATTAC CTATTGGACAATCTGATGATGGTGCTCATTCACAAAACGAAAAAATGTCG GAGAGGAATTACATTAATGGGGTATGGGAAAATTATAGGAAAATATAGCT AGAATTTTGTCCCGATGGGAAAAATATCCTACTATTAATTTCAGCCCTAC TGGCAATTCAACTTTCTTTTTATCCCATTCGAAGTTATTTAATGAAAAAA AATTGCACTCGAAAACCATCCCCACTGGATTTTTTGACCAGGGAACAATA GAATTCCTATTCACATTGGAATTTCGATATAAATTTTCGTCCCCACTGTA GGAAGTAGTTTCACCGGAGCTGCGAGGAAGGGGCGTGATTTAACTAGTTC TGTAGATACAAATCATTAACTGATTGAATGAAAACTCTTCAAATAAATTA ATAACATGAAGATTTTCGTTCTTTTTTCAGGCAAAGGTTCTTGGTACATA CCTCAACGAACTTGGAAAAGCTCAGAAAACATTGAAAAGCAAGAAAACTG GCAAAAAATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:891475..899135-

>XLOC_007473 ID=XLOC_007473|Name=XLOC_007473|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2694bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:891475..899135- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTCCACCGAGTCTATTCCATGGTCCACCGAGTCTATTCCGATTTGCA
CAGTCTACTCGGCATCCCATTGGTCAATATGAGAATCCATAACAATCCTG
AAGACAAAAAACTTCCACCAATCCTTACAGCTCACATGGGAAATGATCCT
TCTAAAACCACTTTGTTGGTTTATGGTCATTTGGATGTTCAACCAGCTCC
TGATCCAGAAAACTGGGTCCACCAGGATTTGCACAGTCTACTCGGCATCC
CATTGGTCAATATGAGAATCCATAACAATCCTGAAGACAAAAAACTTCCA
CCAATCCTTACAGCTCACATGGGAAATGATCCTTCTAAAACCACTTTGTT
GGTTTATGGTCATTTGGATGTTCAACCAGCTCCTGATCCAGAAAACTGGG
TCCACCAGGACGATCCATTTAAGTTGACGAAAGTTCCAGCAACTGGAGGA
ACATTCGAGACGATTAAATATTACGCAAGAGGTTCGACTGATGATAAAGG
ACCTGTTCTTGGTTGGATTAATGCTATCAAAGCTTATCAAGATCTTAATA
TGGAAGTCCCTGTTAATATCAAGGACGATCCATTTAAGTTGACGAAAGTT
CCAGCAACTGGAGGAACATTCGAGACGATTAAATATTACGCAAGAGGTTC
GACTGATGATAAAGGACCTGTTCTTGGTTGGATTAATGCTATCAAAGCTT
ATCAAGATCTTAATATGGAAGTCCCTGTTAATATCAAGTTTTTGTTTGAG
TGTATGGAAGAATCTGGAGGTATTGGCTTGGAACAATTGATTGAAGAACA
ATCGGCTTTCTTTGAGTTTTTGTTTGAGTGTATGGAAGAATCTGGAGGTA
TTGGCTTGGAACAATTGATTGAAGAACAATCGGCTTTCTTTGAGGGCGTT
GATGCAGTCTGCATTTCGGACAACTACTGGCTTGGATTAACAAAACCATG
TGTCACATATGGATTGAGGGCGTTGATGCAGTCTGCATTTCGGACAACTA
CTGGCTTGGATTAACAAAACCATGTGTCACATATGGATTGAGAGGTATTT
CATACTACAATGTAACAATTGAATGCGCTGCCGGAGATCTTCATTCCGGT
GTTTATGGTGGCACAGTAGGTATTTCATACTACAATGTAACAATTGAATG
CGCTGCCGGAGATCTTCATTCCGGTGTTTATGGTGGCACAGTGCGAGAGG
CAATGATTGATTTGATCAATATCTTCAGTCAATTGACGGACGGTAAAGGA
GGAATTAAAATTGATGGCGTCAATGATGATGCGAGAGGCAATGATTGATT
TGATCAATATCTTCAGTCAATTGACGGACGGTAAAGGAGGAATTAAAATT
GATGGCGTCAATGATGATGTTCTTGTAATGACGGATGACGAATTAGCGTT
GTATGGCCCCATTGATTTCGATCCTGAAGAATACCGAAAAGAAATTGGAA
CCAAGGAATTGCTTTATCCTGACAAAGTTGGAACTTTAACACACAGATGG
AGATACCCAAGTCTTTCCATCCATGGTTCTTGTAATGACGGATGACGAAT
TAGCGTTGTATGGCCCCATTGATTTCGATCCTGAAGAATACCGAAAAGAA
ATTGGAACCAAGGAATTGCTTTATCCTGACAAAGTTGGAACTTTAACACA
CAGATGGAGATACCCAAGTCTTTCCATCCATGGCTTTGTTGGGGCATCGG
ATGGTAACGAAGATCAGACGGTTATCCCAAGACAAGCTTTGTTGGGGCAT
CGGATGGTAACGAAGATCAGACGGTTATCCCAAGACAAGTCAAAGGCAAA
TTTTCAATCCGTCTTGTACCAAATCAAGATCCAGCAGATATTGATGCCAA
AGTCGAAGCTTATGTTAAAAAACTTCACACTCAAAGTGGTAGTAAAAACC
CGCTGACGTCAAAGGCAAATTTTCAATCCGTCTTGTACCAAATCAAGATC
CAGCAGATATTGATGCCAAAGTCGAAGCTTATGTTAAAAAACTTCACACT
CAAAGTGGTAGTAAAAACCCGCTGACTTTCGTGGCTACCACGTCAGCACC
AGCTTGGGTGAGCGACAACACTGATGCTAACTACAAAGCCGGTATCAATG
CACAAAAGAGAGTTTCGTGGCTACCACGTCAGCACCAGCTTGGGTGAGCG
ACAACACTGATGCTAACTACAAAGCCGGTATCAATGCACAAAAGAGAGTA
TATGGTATTGAACCAGACCTTACAAGAGAAGGAGGAAGTATTCCGGTAAC
ACTTACTCTTCAAAACGCGACCAATTCAAGTGTCATGTTATTACCTATTG
GACAATCTGATGATGGTGCTCATTCACAAAACGAAAAAATGTCGGAGAGG
AATTACATTAATGGGTATATGGTATTGAACCAGACCTTACAAGAGAAGGA
GGAAGTATTCCGGTAACACTTACTCTTCAAAACGCGACCAATTCAAGTGT
CATGTTATTACCTATTGGACAATCTGATGATGGTGCTCATTCACAAAACG
AAAAAATGTCGGAGAGGAATTACATTAATGGGGCAAAGGTTCTTGGTACA
TACCTCAACGAACTTGGAAAAGCTCAGAAAACATTGAAAAGCAAGAAAAC
TGGCAAAAAATGAGCAAAGGTTCTTGGTACATACCTCAACGAACTTGGAA
AAGCTCAGAAAACATTGAAAAGCAAGAAAACTGGCAAAAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_007473XLOC_007473-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000130_pilongenomesc0000130_pilon:891475..899135 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1267-1347:82
Aaloc1102-1266:606
Aaloc1015-1098:2604
Aaloc895-1011:3469
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Aaloc370-447:5870
Aaloc205-369:6362
Aaloc22-204:6996
Aaloc1-21:7662