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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000246_pilon:258991..261786+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_007143 ID=XLOC_007143|Name=XLOC_007143|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2796bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000246_pilon:258991..261786+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTAACACTAATTTCACCAATAACAATGCAAATCTATCAGGCGGAGG
CTTATTTGTCACCAGTACACAAAGAGAGGATTTTGAAAACAAGGTCGAAA
TCCATCAATGCAGGTTTATCAACAATTCTGCTGAAATTGGTGGCGCAATG
TTCCAGAAGCATATTTCGTTAGACTCTATCAAAGATTTGCGAACTATTAC
AATCGCTGGTACTCAGTTCACACACAATATGGCAAATATTGGATCAGCAA
TTAATTTGGAAcgtatttttgtgatttttaacaATATGGATACTATGAAT
AACTTCGGTAGCACATTTAATGGTACAGGGGGCCAAGGTGCTATATATGC
CTTTGAGAGTAAACTCTATTGCTATGGTTCTAatttattcaaagaaaata
tgaaCAATGCTTTTGTTCTTGATTGCAGTCATCTCCATTTTCCAGGGACA
GCTTTGTTTGATCGTAACAAAGGAGAGAATGGTGGTGCGATCTCAATGTA
TGGCAATTCTTTTTTATTCCTTTACAACAGTACTGAATTGACCTTCAAAA
ATAATACAGCTTGGCGTCGTGGAGGTGCTATTTATATTGAATCATCTGGA
CCACCATTAGATCACAATTTAGTCAATGCTTTGAAATTTGATAGATGTTT
CTTTCAATATGCTGGCGAAACCGTGACGACGTTTGAAGATAACATACAAT
CATTTGAAGGCAAAGTATCGTTTACAGACAATTATGCCAAAATCAATGGT
GACAGTATATTCATCTCCTCACTAGCAGCATGCAATGTTACCAGCATTGG
CATCAATGATACTTTATTACAttggaaaaatttcaatttccgtCCTAAAA
ACCGTACACAAATCATCACCAGAGCTGTCGAAATCCATATCAATGATTTA
CAATGGCATCAACCACCAGGCACAATGTTTCATCCAAGTATCATTCTTCT
TGACCAACGTGGAAACCATGTCAGTGAGCAAATTAACGTCATCATCCATA
AAAATCACTCACATAAACAATGCAACGTATCAGTAGAAACCAATCCTCGA
TTCATCGTTACGGAGGATGATACAATCTCATTAACACTTCTCGGTAACAA
CCAACCAAAAATTGACGGTAAATACGGTAAATATTGTTACTATGACGTTA
CTATTTCGTTAGCATGGAACAAAGTTGTGTACAAAACTTTAACAGATCGT
CAATTAAAACCTTGTTATTTTGGATATACCCTTAAGAAGAATCGGTGCCA
ATGTTTAATGCAGAAAAACCAGGACAAAGGGATCGCCTTTTGTTATAGAG
GGgatatttatttttacaaaaatagatGGGCGTACAGAGATCAAAAAGCG
TTTATTAGAGATGCTGAGATAACAGTGACTTGCCCTCCTGGCTATTGTAA
TGACTGTAAAGGAGGTGTATCGATCACAGGCTATGATTGCCGATATgatc
aaaccaaaccaaaccaGTGTAGACCAAGTCGAGACCAAAATTCTAAGATC
TGTGGGCGCTGCCTTCATGGTTGGTCTGTAGCTTTAGGAAAAGAGGAATG
CGTCAAATGTAAGAACGAAGTTTTTTCACGCTATTCTAAATGGAACTGGA
TCTGGGTGATTATTGCGACTATTGTTTTCTTTGTCATGGTAGACGCTGTC
ATTATATGGCTCGATATTGATATTTACTCAAACTATTTGAATGGCTTTAT
ATACTATTGTCAAACAATCGTACTGTTACCCCCGTCCTCCTTTGAATATT
GGTACCCAATGAAGTTAATTACTGGTATAATCAACATGGATTCAACCGGG
GGTTTCATACCagctttttgttttattgacgGTTTTGATAACCTATGGAA
AGCATTGTTTAATTATCTTTTCCCGACCATTATGATTCTCATCTTAGTCG
TGATTGGATACCTAGCCAGGGATCCAAACAGCAGATTCGCAAATGTCAAC
TACATGAAGTCCTTTACCATCATAAGCGTGTTGGCTTATTCAGATTTCAC
ACGTATCACTTTCCAACTGCTAAACAGAGCGAAACTTGATCCCGATGAGC
CAAACAAACTAAACGTCTGGATACAAGGTGATGTCGAATATTTAAAAGGT
ATGACATTTTGATGCATTTAAGGTTGACTCTCTATAGCTCGAAAACCGAA
GGGGAAAGGGTAAAAATTGTTCCTGTTATGGAGAGTTTAAAAGTTTATTA
TTGTAGTCATGAACCCGATTACGGCCTTCGCAGTTTGGGAACTTATTCAA
TACCTCCAGAAGCTTACATTATGAAACTCCAAACAACAGGCATACATTCT
ATGAATTTAAATGTCAAAATCCAGAAGGCTCCGTTCATCACAGATGAGTA
GGTGAGATTGAAGTCAAGCGGTTTATAAATCAACAATAACTTTTATGACA
TATCACGTAATCAATcacacaaaattttcttttaaaggaTACCATATTGG
ATTTGCAGTCGTTGCCATCATTGTTGGCTTCTTCATTGTCCTTGGTTTTC
CTATCGTTCTTTTCTTCCATTACAAATTGGTTGCATTGCGGCCACTGTGG
GGACAGAATCCATTCCGTCGTTTGACCACATTCTTCAAGTATTTCAATTA
TTGTTATCGTGATGATCAACTTTATTTCATTTCGTTTTACTACACTTCAA
GAGTAGTTCTTCTTGGTTTAAACACCTTTGTACCAATTGATGCTGAGTCT
AGTACATGGAAATGTTTGTTATGTCTCCTTGTATGTGTCGTCTTCACTTT
CAATGAACCTTATGATAAACCGTTGATGAATTATTATGACATCTTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000246_pilon:258991..261786+ >XLOC_007143 ID=XLOC_007143|Name=XLOC_007143|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4914bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000246_pilon:258991..261786+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTAACACTAATTTCACCAATAACAATGCAAATCTATCAGGCGGAGG
CTTATTTGTCACCAGTACACAAAGAGAGGATTTTGAAAACAAGGTCGAAA
TCCATCAATGCAGGTTTATCAACAATTCTGCTGAAATTGGTGGCGCAATG
TTCCAGAAGCATATTTCGTTAGACTCTATCAAAGATTTGCGAACTATTAC
AATCGCTGGTACTCAGTTCACACACAATATGGCAAATATTGGATCAGCAA
TTAATTTGGAAcgtatttttgtgatttttaacaATATGGATACTATGAAT
AACTTCGGTAGCACATTTAATGGTACAGGGGGCCAAGGTGCTATATATGC
CTTTGAGAGTAAACTCTATTGCTATGGTTCTAatttattcaaagaaaata
tgaaCAATGCTTTTGTTCTTGATTGCAGTCATCTCCATTTTCCAGGGACA
GCTTTGTTTGATCGTAACAAAGGAGAGAATGGTGGTGCGATCTCAATGTA
TGGCAATTCTTTTTTATTCCTTTACAACAGTACTGAATTGACCTTCAAAA
ATAATACAGCTTGGCGTCGTGGAGGTGCTATTTATATTGAATCATCTGGA
CCACCATTAGATCACAATTTAGTCAATGCTTTGAAATTTGATAGATGTTT
CTTTCAATATGCTGGCGAAACCGTGACGACGTTTGAAGATAACATACAAT
CATTTGAAGGCAAAGTATCGTTTACAGACAATTATGCCAAAATCAATGGT
GACAGTATATTCATCTCCTCACTAGCAGCATGCAATGTTACCAGCATTGG
CATCAATGATACTTTATTACAttggaaaaatttcaatttccgtCCTAAAA
ACCGTACACAAATCATCACCAGAGCTGTCGAAATCCATATCAATGATTTA
CAATGGCATCAACCACCAGGCACAATGTTTCATCCAAGTATCATTCTTCT
TGACCAACGTGGAAACCATGTCAGTGAGCAAATTAACGTCATCATCCATA
AAAATCACTCACATAAACAATGCAACGTATCAGTAGAAACCAATCCTCGA
TTCATCGTTACGGAGGATGATACAATCTCATTAACACTTCTCGGTAACAA
CCAACCAAAAATTGACGGTAAATACGGTAAATATTGTTACTATGACGTTA
CTATTTCGTTAGCATGGAACAAAGTTGTGTACAAAACTTTAACAGATCGT
CAATTAAAACCTTGTTATTTTGGATATACCCTTAAGAAGAATCGGTGCCA
ATGTTTAATGCAGAAAAACCAGGACAAAGGGATCGCCTTTTGTTATAGAG
GGgatatttatttttacaaaaatagatGGGCGTACAGAGATCAAAAAGCG
TTTATTAGAGATGCTGAGATAACAGTGACTTGCCCTCCTGGCTATTGTAA
TGACTGTAAAGGAGGTGTATCGATCACAGGCTATGATTGCCGATATgatc
aaaccaaaccaaaccaGTGTAGACCAAGTCGAGACCAAAATTCTAAGATC
TGTGGGCGCTGCCTTCATGGTTGGTCTGTAGCTTTAGGAAAAGAGGAATG
CGTCAAATGTAAGAACGAAGTTTTTTCACGCTATTCTAAATGGAACTGGA
TCTGGGTGATTATTGCGACTATTGTTTTCTTTGTCATGGTAGACGCTGTC
ATTATATGGCTCGATATTGATATTTACTCAAACTATTTGAATGGCTTTAT
ATACTATTGTCAAACAATCGTACTGTTACCCCCGTCCTCCTTTGAATATT
GGTACCCAATGAAGTTAATTACTGGTATAATCAACATGGATTCAACCGGG
GGTTTCATACCagctttttgttttattgacgGTTTTGATAACCTATGGAA
AGCATTGTTTAATTATCTTTTCCCGACCATTATGATTCTCATCTTAGTCG
TGATTGGATACCTAGCCAGGGATCCAAACAGCAGATTCGCAAATGTCAAC
TACATGAAGTCCTTTACCATCATAAGCGTGTTGGCTTATTCAGATTTCAC
ACGTATCACTTTCCAACTGCTAAACAGAGCGAAACTTGATCCCGATGAGC
CAAACAAACTAAACGTCTGGATACAAGGTGATGTCGAATATTTAAAAGAT
GGTTAACACTAATTTCACCAATAACAATGCAAATCTATCAGGCGGAGGCT
TATTTGTCACCAGTACACAAAGAGAGGATTTTGAAAACAAGGTCGAAATC
CATCAATGCAGGTTTATCAACAATTCTGCTGAAATTGGTGGCGCAATGTT
CCAGAAGCATATTTCGTTAGACTCTATCAAAGATTTGCGAACTATTACAA
TCGCTGGTACTCAGTTCACACACAATATGGCAAATATTGGATCAGCAATT
AATTTGGAAcgtatttttgtgatttttaacaATATGGATACTATGAATAA
CTTCGGTAGCACATTTAATGGTACAGGGGGCCAAGGTGCTATATATGCCT
TTGAGAGTAAACTCTATTGCTATGGTTCTAatttattcaaagaaaatatg
aaCAATGCTTTTGTTCTTGATTGCAGTCATCTCCATTTTCCAGGGACAGC
TTTGTTTGATCGTAACAAAGGAGAGAATGGTGGTGCGATCTCAATGTATG
GCAATTCTTTTTTATTCCTTTACAACAGTACTGAATTGACCTTCAAAAAT
AATACAGCTTGGCGTCGTGGAGGTGCTATTTATATTGAATCATCTGGACC
ACCATTAGATCACAATTTAGTCAATGCTTTGAAATTTGATAGATGTTTCT
TTCAATATGCTGGCGAAACCGTGACGACGTTTGAAGATAACATACAATCA
TTTGAAGGCAAAGTATCGTTTACAGACAATTATGCCAAAATCAATGGTGA
CAGTATATTCATCTCCTCACTAGCAGCATGCAATGTTACCAGCATTGGCA
TCAATGATACTTTATTACAttggaaaaatttcaatttccgtCCTAAAAAC
CGTACACAAATCATCACCAGAGCTGTCGAAATCCATATCAATGATTTACA
ATGGCATCAACCACCAGGCACAATGTTTCATCCAAGTATCATTCTTCTTG
ACCAACGTGGAAACCATGTCAGTGAGCAAATTAACGTCATCATCCATAAA
AATCACTCACATAAACAATGCAACGTATCAGTAGAAACCAATCCTCGATT
CATCGTTACGGAGGATGATACAATCTCATTAACACTTCTCGGTAACAACC
AACCAAAAATTGACGGTAAATACGGTAAATATTGTTACTATGACGTTACT
ATTTCGTTAGCATGGAACAAAGTTGTGTACAAAACTTTAACAGATCGTCA
ATTAAAACCTTGTTATTTTGGATATACCCTTAAGAAGAATCGGTGCCAAT
GTTTAATGCAGAAAAACCAGGACAAAGGGATCGCCTTTTGTTATAGAGGG
gatatttatttttacaaaaatagatGGGCGTACAGAGATCAAAAAGCGTT
TATTAGAGATGCTGAGATAACAGTGACTTGCCCTCCTGGCTATTGTAATG
ACTGTAAAGGAGGTGTATCGATCACAGGCTATGATTGCCGATATgatcaa
accaaaccaaaccaGTGTAGACCAAGTCGAGACCAAAATTCTAAGATCTG
TGGGCGCTGCCTTCATGGTTGGTCTGTAGCTTTAGGAAAAGAGGAATGCG
TCAAATGTAAGAACGAAGTTTTTTCACGCTATTCTAAATGGAACTGGATC
TGGGTGATTATTGCGACTATTGTTTTCTTTGTCATGGTAGACGCTGTCAT
TATATGGCTCGATATTGATATTTACTCAAACTATTTGAATGGCTTTATAT
ACTATTGTCAAACAATCGTACTGTTACCCCCGTCCTCCTTTGAATATTGG
TACCCAATGAAGTTAATTACTGGTATAATCAACATGGATTCAACCGGGGG
TTTCATACCagctttttgttttattgacgGTTTTGATAACCTATGGAAAG
CATTGTTTAATTATCTTTTCCCGACCATTATGATTCTCATCTTAGTCGTG
ATTGGATACCTAGCCAGGGATCCAAACAGCAGATTCGCAAATGTCAACTA
CATGAAGTCCTTTACCATCATAAGCGTGTTGGCTTATTCAGATTTCACAC
GTATCACTTTCCAACTGCTAAACAGAGCGAAACTTGATCCCGATGAGCCA
AACAAACTAAACGTCTGGATACAAGGTGATGTCGAATATTTAAAAGgaTA
CCATATTGGATTTGCAGTCGTTGCCATCATTGTTGGCTTCTTCATTGTCC
TTGGTTTTCCTATCGTTCTTTTCTTCCATTACAAATTGGTTGCATTGCGG
CCACTGTGGGGACAGAATCCATTCCGTCGTTTGACCACATTCTTCAAGTA
TTTCAATTATTGTTATCGTGATGATCAACTTTATTTCATTTCGTTTTACT
ACACTTCAAGAGTAGTTCTTCTTGGTTTAAACACCTTTGTACCAATTGAT
GCTGAGTCTAGTACATGGAAATGTTTGTTATGTCTCCTTGTATGTGTCGT
CTTCACTTTCAATGAACCTTATGATAAACCGTTGATGAATTATTATGACA
TCTTCgaTACCATATTGGATTTGCAGTCGTTGCCATCATTGTTGGCTTCT
TCATTGTCCTTGGTTTTCCTATCGTTCTTTTCTTCCATTACAAATTGGTT
GCATTGCGGCCACTGTGGGGACAGAATCCATTCCGTCGTTTGACCACATT
CTTCAAGTATTTCAATTATTGTTATCGTGATGATCAACTTTATTTCATTT
CGTTTTACTACACTTCAAGAGTAGTTCTTCTTGGTTTAAACACCTTTGTA
CCAATTGATGCTGAGTCTAGTACATGGAAATGTTTGTTATGTCTCCTTGT
ATGTGTCGTCTTCACTTTCAATGAACCTTATGATAAACCGTTGATGAATT
ATTATGACATCTTC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000246_pilon | genome | sc0000246_pilon:258991..261786 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 2101-2457:2440 |
| Aaloc | 1-2097:1 |
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