XLOC_006272 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_006272
Unique NameXLOC_006272
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000292_pilon:235041..248598-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_006272 ID=XLOC_006272|Name=XLOC_006272|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13558bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000292_pilon:235041..248598- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCAATTTTATTATCAATTTTCTTTCTTTGTAACTTTCAAGGGTGTTTCAA AGTTAACTTTTATCGACTCGCTTTCTTCGTAACTTTTAAGAGTGTTTCTA AGTTAACTTTTATCAACTTGCTTTCTTCGTAACTTCCAAGGGTGTTTCTA AGATCACTTTTATCGAATCAATTTCTCTGTTATATACAGTAACAAACTGT TCAAAGGTAACTTTTATTTTTCCTACTCGCTTTCTCCGTAACTTTAAAAA AATATATACACTGAATGACCGACAGGATTTTGAGTTTGACCGACAGGATT TCATTTCTGTCGGACATGATGTCCGATTGACTAAAAATATTTATTTGCAG CCCTGTCAGGGACAATAGTGAGATTTCACTTTGATTGGTAAAAAGAAAAG TGGCGTTGAGACAGGAGAAAGCGTTTCATGTTGGTGGGATGGAGCATGTT GCATTGCACCAACGCGAAAAAAACTTCGCGTCCTCAAGCCTTAATTCTTG TTGAGTTTATGCAAATAAATACATGAAAATGAAAAATAGCTGAGCAGGTG GCCTGACATAGGGTTATTTCTAGTACCAGTTGTCATGGAACCCTTCACCT GAAGGGAAATGTGGGGTACATTATTTTATTGTTGTTTTCCCCAAGAAAAT GAGATTACTTCTAATGGGATGTCATCTTAATCTGTTTCAAAATTATTGCA ATTAAAAAAAGTAAAGAATAAGATTACATTTACAGTATAAGTTTAAATTT TTTTCTTACAGTTACAATGGCTGAATTATATCACTGCCCAGACCAAAAGA AAATCCAAAACTTGAAAGATGTTGCCAACAAACTTCGAATTTTGAGCATC AAATGTACAAATGCTGCAGGATCTGGGTAAGAAATTTTTAATTGCTTTAT TTCATTTTGGAACAGTTATAACCAATGAAGTATAAGCCTGAAGGGCTAGA 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TTAGTGACTTGTGGTAATTTGTGATGAAATAATACCTGAATAAAAAGGAA TCAAAACTATGTTTTTTTCATTTTCAGTAAGCGATCCAAGGGATGCATCT AGTGATCGATTTGTCTTATCTAAGGTTAGTTTTCACAATATAAACAAAAT TTGCTGGTGGATGATGTCAGCTACCAACCAGCCTTTCCGATTCAGATTTA TTTGCGCTTTGACAAACAATTCTGCGTTCTATGGTACAGTAAGCACTTTT GTGTCAGCAAAAGCCAAATTAAAGTAAGGATTTGCATTGACAATAGCCGA AAGCTGACCCAAAATTAGAATGATACGTAAACTTTCTTCACTTTATCTAT CAAGTTGCTTAGCTATGAGTAGAAGCTCAAACTGTGGTTGGTTTATTTTA CTTTCAGCTTGTATGCTACATTCAATAATACTTTGTTCTTGTATTCCATA TTTTAGGGTCATTCTGCCCCAATCCTCTATGCTGCTTGGTGTATGGCTGG TCTCTTCAGTGAAGACGAACTTATGCAATTACGAAAACTTGGAAATGATT TGGAAGGCCATCCTACACCAGTATGTTTGTTTCTTTTGTCCATACACTTT TCATGGTTTAAAAACTTTACTAAACATTCAATGATTTTAATTAAGTTCAA CAATATTATGGTTTAATTTTTAATTCAAAATTGTTTACAATATTAAGGAC CTCTACTTTTTGGACCTACCCCAGTGGGGTAGAGGCACAGATTTGCAACT TTAAGCTTTCTCCAGCAAAAAAAAGTGAAGCAAAAATTTGACTTTTTAAA TTTCGTGCCGATGGATAGGATCTAGCATTTTAATTGTTTTCGGAGCGCGA GATCAAAAAACGTAGGCGACAAACGCTATTTCACATCTCTCAAACCGGTG AAATTGCATATTTTAGTCACGTGACTCTGGTAGGAAATCCTTCCAAAGAT 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TCAAGCATGATTCAATTGTCAATAAAACTTTTGCAATTTTGCAACCGGAA CTTTCTATTTCTTTTTTCCCTAAACCCCCCTCCCCATCAACAATCAATGA TGACATTTAATGCATTTTCGCTAAGCGCTATATTTTCTTAATGATTGTTT TTCTCCTTATTGCTATCTAAGTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCAT GTTGCTTGTTTTTACCTTTTCTGATAGTGCCAGATAATGCTTGTATTATA TAATATATAAATAATCAGTTTAAAGGCCTGAAGATATCTAAGGATTTTAC TCCCAATAAGCAAAGGATCTCCACTTAAAGGTCGTGATACATAAACATAT TGCTTTTGACAATCTAATATTCCCTACACATTTTCCTAAATTTACTAAAA ATAGGAAATGTTTAACAATGTGAGCCTCTAACATGGCTTCACATTTACAA AGATTTAAATTCCAAATTAGATTCCAAACAGATTCTAACACATATTCCCC AAAGAGGAGCCAGCCAATCTCTATTGTTAAAAGGTTAATCCCCTTAGCAA ACAAATTTTTACAATAGAAAAGGAGGAGATAGGGGCAGTTATTGTGCATA CATGCACATTTGAAAACAAGAAGGATTTGTGATAGAGGAAATGTCATGGT GTAACATCTGTCAACATTTTTCTTTGCTTCGCTATTTTTAGTAATTTTGT GAAAAAGTGTAGGGAAATGTATCGCGACCTTAACAATGAATGATTTTGTT TTTCACAGAGATTGAACTTTGTTGATGTGGCCACTGGATCTTTGGGTCAA GGTCTAAGTTGTTCTGCTGGTATGGCATACACTGGAAAATACTTGGACAA AGGAAGGTAAGAAAACTTCTGTTCTTTATTGATTCAATGAGCTGTTCTTC CTACTGTAGTGCATGTAGGGGTAGAGCATCCAGCTACGGTGCACAACACA AGTTTGTGGGTTCAACTCCTAGCCCGGTCAAACCAAAGATTCTCAAAATG GTACTTGATGCCTTTCTGCTTGATGCTCAGCAATTAAGAGAAGGGTTGAG GGTAAGTGGAGCCTTCCCCTAGTTCTCGAAAGAGGAGCCTTTGGGTCATC TATGACTGTGGTCCCAGACTTACTTACTTCTAAAGTTCAAATGTTTAAAA CATTTATAGCGTTATAAGTTCTTCTTCTTTGGATTGTTGAACTTTCCCTG TCTGCAGAGTTTCAGTCTTGAAAAAGACAGGAAAGAACTGGAAAGAAGGA ATTTGTCAATATTTGGTCACAGCTCATGGTAAATTTACCATTTTGCATTG CGTTATCATTGTACACCAAATTTTATTATTTTTACAGCTACCGCGTTTTC TGTTTGATGGGTGATGGTGAAAGTGCTGAAGGTTCTGTCATGGAGGCTGC TAACTTTGCTGGGTACTACAAATTGGACAACTTGGTTGGTATCATTGACA TTAATCGTTTGGGACAAAGTGATCCAACCTCATTACAACACGAAATGGAT GTTTACCAAAAAAGATGGGAAAGCTACGGGTAGGTAGAATTTCATTATTA TCATTTTTGAAATACCAGTTTTTTCTCTCTTTCTAGGTAGAATTTCATTA TTATCATTTTTGAAATACCAGTTTTTTCCCTTCCGTTTAACCTGAACTTA TGAGCACCTATGAGAGCTCCATCAAGAACCAAAAATGATTGTCTTTAAAT GATTGTTTTACTTCATTTCTAATTTCAGGTGGAATGCTATTGTTGTTGAT GGACATGATATCGAAGCAATTTGCCGTGCTTACTTTGATGCTGAACAAGC AAAGGGACGACCAACCATGATCTTGGCAAAGACGTACAAAGGAAAAGGTA TAATTATTTAAAAATTATTACATTCTACTCAACCCAAAAAAAAAAAACAT AAAAAATGCAATACACTTCTTAAAGTAAACGTCTCTTCACATTTATTTTA AAGGAACTTTTTGAGTGATTTTAAAGTGATAAGAAGCCCTTTTCATCTTC TTCAGTCCTAAAAACATTCTTGTTCTTTGAATATCAGGTATTCCTGGCGT TGAGAACGAGATGAACTGGCATGGAAAAGCTCTCGGTGCCAAAGCTGATG ATGCCATTGCTGCTATTGAAGCTCAAATGGTCGACAAGAATGTATCTGGT GAGTTTTGCTTTCTAAATTTCGAAGATTCATGCCCTCACAGTCAGTTTGC TTTCAAATAATCGACGCCTTGTTCGTATGCGGTCCAAGCCCTAAGTTGTG TCATCATACAGTAAAAATGATTGTTATTACAAAACCTTTTTTCTTGCAGG CGAGAAATTGAACACTCAAGTGGTTGTGGATGACGTCAAGCCCGTTGACC CGTCGGCCATCGTGCTGTCAGAGAAACCATCATACGCAGCTGATGCCAAA GAGGCTACCCGAAAAGCTTATGGTCTCGCATTGGCTAAATTGGGTCGATC TTCAGACCGTGTAGTTGCCCTTGATGGTGATACCAAGAACTCGACTTTCG CCATCACCTTCCAAAAAGAATTCCCAGGTTCGTATCATTAGCTCCATATT TTTATGTAGATTGGTAACCTTATCAAGCTGAGAATTCACTGAAGTTAAAA GCTGTCATCTGGCTGTTATTTACTTTTAAAGATCGAGTGAAACAAATTTA ATTCCAAATACTTAACACTCGATTTTTCTTTACCTTTTATCAGACCGTTT CGTCGAATGCTTCATCGCTGAACAGAACATGTTGGGTGTCGGTATGGGAT GCGCCACAAGAGACCGCACGGTGGCGTTCGCAAGCGCCTTTGCCTGTTTC TTGTCCCGTGGATATGATCAAATCCGTATGGGTGCTATCTCTCAAACTAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000292_pilon:235041..248598-

>XLOC_006272 ID=XLOC_006272|Name=XLOC_006272|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4068bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000292_pilon:235041..248598- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTCAAGATGTCGAAAGTGTAGATAAAAGGCGGCTTTTTCATCAAGGATC
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AATGGCTGAATTATATCACTGCCCAGACCAAAAGAAAATCCAAAACTTGA
AAGATGTTGCCAACAAACTTCGAATTTTGAGCATCAAATGTACAAATGCT
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GGCTGAGCTCACATCTGTTCTTTTCTTCCACACCATGAAGTACAAAGCCA
TCCCACATCATGCTGCTCGATGGCTGAGCTCACATCTGTTCTTTTCTTCC
ACACCATGAAGTACAAAGTAAGCGATCCAAGGGATGCATCTAGTGATCGA
TTTGTCTTATCTAAGTAAGCGATCCAAGGGATGCATCTAGTGATCGATTT
GTCTTATCTAAGGGTCATTCTGCCCCAATCCTCTATGCTGCTTGGTGTAT
GGCTGGTCTCTTCAGTGAAGACGAACTTATGCAATTACGAAAACTTGGAA
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GCTGCTTGGTGTATGGCTGGTCTCTTCAGTGAAGACGAACTTATGCAATT
ACGAAAACTTGGAAATGATTTGGAAGGCCATCCTACACCAAGATTGAACT
TTGTTGATGTGGCCACTGGATCTTTGGGTCAAGGTCTAAGTTGTTCTGCT
GGTATGGCATACACTGGAAAATACTTGGACAAAGGAAGAGATTGAACTTT
GTTGATGTGGCCACTGGATCTTTGGGTCAAGGTCTAAGTTGTTCTGCTGG
TATGGCATACACTGGAAAATACTTGGACAAAGGAAGCTACCGCGTTTTCT
GTTTGATGGGTGATGGTGAAAGTGCTGAAGGTTCTGTCATGGAGGCTGCT
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TTTACCAAAAAAGATGGGAAAGCTACGGCTACCGCGTTTTCTGTTTGATG
GGTGATGGTGAAAGTGCTGAAGGTTCTGTCATGGAGGCTGCTAACTTTGC
TGGGTACTACAAATTGGACAACTTGGTTGGTATCATTGACATTAATCGTT
TGGGACAAAGTGATCCAACCTCATTACAACACGAAATGGATGTTTACCAA
AAAAGATGGGAAAGCTACGGGTGGAATGCTATTGTTGTTGATGGACATGA
TATCGAAGCAATTTGCCGTGCTTACTTTGATGCTGAACAAGCAAAGGGAC
GACCAACCATGATCTTGGCAAAGACGTACAAAGGAAAAGGTGGAATGCTA
TTGTTGTTGATGGACATGATATCGAAGCAATTTGCCGTGCTTACTTTGAT
GCTGAACAAGCAAAGGGACGACCAACCATGATCTTGGCAAAGACGTACAA
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GTCGACAAGAATGTATCTGGTATTCCTGGCGTTGAGAACGAGATGAACTG
GCATGGAAAAGCTCTCGGTGCCAAAGCTGATGATGCCATTGCTGCTATTG
AAGCTCAAATGGTCGACAAGAATGTATCTGGCGAGAAATTGAACACTCAA
GTGGTTGTGGATGACGTCAAGCCCGTTGACCCGTCGGCCATCGTGCTGTC
AGAGAAACCATCATACGCAGCTGATGCCAAAGAGGCTACCCGAAAAGCTT
ATGGTCTCGCATTGGCTAAATTGGGTCGATCTTCAGACCGTGTAGTTGCC
CTTGATGGTGATACCAAGAACTCGACTTTCGCCATCACCTTCCAAAAAGA
ATTCCCAGGCGAGAAATTGAACACTCAAGTGGTTGTGGATGACGTCAAGC
CCGTTGACCCGTCGGCCATCGTGCTGTCAGAGAAACCATCATACGCAGCT
GATGCCAAAGAGGCTACCCGAAAAGCTTATGGTCTCGCATTGGCTAAATT
GGGTCGATCTTCAGACCGTGTAGTTGCCCTTGATGGTGATACCAAGAACT
CGACTTTCGCCATCACCTTCCAAAAAGAATTCCCAGACCGTTTCGTCGAA
TGCTTCATCGCTGAACAGAACATGTTGGGTGTCGGTATGGGATGCGCCAC
AAGAGACCGCACGGTGGCGTTCGCAAGCGCCTTTGCCTGTTTCTTGTCCC
GTGGATATGATCAAATCCGTATGGGTGCTATCTCTCAAACTAAATTGAAA
ATGGCTGGCTCTCACGTTGGTGTCTCCATCGACCGTTTCGTCGAATGCTT
CATCGCTGAACAGAACATGTTGGGTGTCGGTATGGGATGCGCCACAAGAG
ACCGCACGGTGGCGTTCGCAAGCGCCTTTGCCTGTTTCTTGTCCCGTGGA
TATGATCAAATCCGTATGGGTGCTATCTCTCAAACTAAATTGAAAATGGC
TGGCTCTCACGTTGGTGTCTCCATCGGTGAAGACGGTCCATCTCAAATGG
CTTTGGAAGATCTTGCTATGTTCCGTGCCATCAACAACTGCACTGTCTTC
TATCCCTCCGATGCCGTGTCGTGCGAACGCGCGGTCGAATTGTGCGCCAA
CACACCCAATATGTGTTACATCAGAACTAGCCGACCAGCTACTTCTATCT
TGTACGGTGCCGATGAGGTCTTCGAAGCCGGCAAAGGAAAGGTGAAGACG
GTCCATCTCAAATGGCTTTGGAAGATCTTGCTATGTTCCGTGCCATCAAC
AACTGCACTGTCTTCTATCCCTCCGATGCCGTGTCGTGCGAACGCGCGGT
CGAATTGTGCGCCAACACACCCAATATGTGTTACATCAGAACTAGCCGAC
CAGCTACTTCTATCTTGTACGGTGCCGATGAGGTCTTCGAAGCCGGCAAA
GGAAAGGTCGTTAAACAAACAGCTTCAGATTTCTGTCTCTTGATTGGTGC
TGGTGTAACACTTCACGAATGTTTGAAAGCACACGAAACTTTGAAAGCTG
AAGGTATCAATACTCGTGTCTTCGATCCTTTCTGTATCAAACCATTGGAC
GTCCAAGGAATCATCGCAAATGCTAAAGCTTGCAATGGAAATATTGTCAC
CATTGAAGACCATTATCCAGAAGGTCGTTAAACAAACAGCTTCAGATTTC
TGTCTCTTGATTGGTGCTGGTGTAACACTTCACGAATGTTTGAAAGCACA
CGAAACTTTGAAAGCTGAAGGTATCAATACTCGTGTCTTCGATCCTTTCT
GTATCAAACCATTGGACGTCCAAGGAATCATCGCAAATGCTAAAGCTTGC
AATGGAAATATTGTCACCATTGAAGACCATTATCCAGAAGGTGGTCTTGG
TGAAGCTGTTCTGTCCGCTGTCGCCATGGAAACTGGAATTCGCGTCCAAC
GATTGGCTGTCACTGGTTTGCCACGCTCAGGTCCATCCGCTGCTTTGATG
GAAATGTTCGGAGTTTCTGCCAAACAAGTCGTCGAAGCTGTCAAGAAATT
CTAAGTGGTCTTGGTGAAGCTGTTCTGTCCGCTGTCGCCATGGAAACTGG
AATTCGCGTCCAACGATTGGCTGTCACTGGTTTGCCACGCTCAGGTCCAT
CCGCTGCTTTGATGGAAATGTTCGGAGTTTCTGCCAAACAAGTCGTCGAA
GCTGTCAAGAAATTCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006272XLOC_006272-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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