XLOC_006070 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_006070
Unique NameXLOC_006070
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000045_pilon:699926..711123-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_006070 ID=XLOC_006070|Name=XLOC_006070|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11198bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000045_pilon:699926..711123- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTTTATTTGACAAATGTTACAGTTGCTAATTAAAAGTTCTTCCGTCAAA AAACCTTGCTTTGACCACTTTACCTTTTGACAGAGACTCAAAGTTTTCTA CAAGAAACATACTTATACAGGTATTTTTATTTGACAAATGTTACAGTTGC TAATTAATAGTTCTTCCATCGAAAAACCTTGCTTTGACCAATTTACCTTT TGACGGAGACTCAAAGTTTTCTACAAGAAACATACTTATACAGGTATTTT TATTCGATAAACAGTGTTACAGTTTACTCTCGCTAATTAAAAGTTCTTCC GTCGAAAAACCTTGCTTTGTCCACTTTACCTTTTGACAGAGACTCAAAGT TTTCTACAAGAAACATACTTATACAGGTATTTTTATTTGACAAATGTTAC AGTTGCTAATTAATAGTTCTTCCATCGAAAAATCTTGCTTTGACCACTTT ACCTTTTGACAGAGACTCAAAGTTTTCTACAAGAAACATACTTATACAGG TATTTTTATTTGACAAATGTTACAGTTGCTAATTAATAGTTCTTCCATCG AAAAACCTTGCTTTGACCACTTTACCTTTTGACGGAGACTCAAGGTTTTC TACAAGAAACATACTTATACAGGTATTTTTATTTGACAAATGTTACAGTT GCTAATTAATAGTTCTTCCGTCGAAAAACCTTGCTTTGACCACTTTACCT TTTGACAGAGACTCAAAGTTTTCTACAAGAAACATACTTATACAGGTATT TTTTTCGATAAAAAATGTTACAGTTGCTAATTAATAGTTCTTCCGTCAAA AAATCTTGCTTTGTCCACTTTACCTTTTGACAGAGACTCAAGGTTTTCTA CAAGAAACATACTTATACAGGTATTTTTATTTGACAAATGTTACAGTTGC TAATTAATAGTTCTTCCGTCGAAAAACCTTGCTTTGACCACTTTACCTTT TGATGGAGACTCAAGGTTTTCTACAAGAAACATACTTATACAGGTATTTT TTTCGATAAAAAGTGTTACAGTTTACTCTCGCTAATTAAAAGTTCTTCCG TCGAAAAATCTTGCTTTGTCCACTTTACCTTTTGACAGAGACTCAAGGTT TTCTACAAGAAACATACTTATACAGGTATTTTTTTCGATAAAAAATGTTA CAGTTGCTAATTAATAGTTCTTCCGTCAAAAAATCTTGCTTTGTCCACTT TACCTTTTGACAGAGACTCAAGGTTTTCTACAAGAAACATACTTATGCAG GTATTTTTATTTGAGAAATGTTACAGTTGCTAATTAATAGTTCTTCCGTC GAAAAATCTTGCTTTGTCCACTTTACCTTTTGACAGAGACTCAAAGTTTT CTACAAGAAACATACTTATACAGGTATTTTTTTCGATAAAAAGTGTTACA GTTTACTCTCGCTAATTAAAAGTTCTTCCGTCGAAAAATCTTGCTTTGTC CACTTTACCTTTTGATGGAGACTCAAGGTTTTCTACAAGAAACATACTTA TGCAGGTATTTTTATTTGACAAATGTTACAGTTGCTAATTAATAGTTCTT CCGTCGAAAAACCTTGCTTTGACCACTTTACCTTTTGATGGAGACTCAAA GTTTTCTACAAGAAACATACTTATACAGGTATTTTTATTTGACAAATGTT ACAGTTTACTCTCGCTAATTAAAAGTTCTTCCGTCGAAAAATCTTGCTTT GTCCACTTTACCTTTTGATGGAGACTCAAGGTTTTCTACAAGAAACATAC TTATACAGGTATTTTTTTCGATAAAAAGTGTTACAGTTTACTCTCGCTAA TTAATAGTTCTTCCGTCGAAAAACCTTGCTTTGACCACTTTACCTTTTGA CAGAGACTCAAGGTTTTCTACAAGAAACATACTTATACAGGTATTTTTTT CGATAAAAAGTGTTACAGTTTATTCTCGCTAATTAAAAGTTCTTCCGTCG AAAAATCTTGCTTTGTCCACTTTACCTTTTGACAGAGACTCAAGGTTTTC TACAAGAAACATACTTATACAGGTATTTTTATTTGACAAATGTTACAGTT GCTAATTAATAGTTCTTCCGTCGAAAAACCTTGCTTTGACCACTTTACCT TTTGACAGAGACTCAAAGTTTTCTACAAGAAACATACTTATACAGGTATT TTTATTTGACAAATGTTACAGTTGCTAATTAATAGTTCTTCCGTCGAAAA ACCTTGCTTTGTCCACTTTACCTTTTGACAGAGACTCAAGGTTTTCTACA AGAAACATACTTATACAGGTATTTTTTTTCGATAAAAAATGTTACAGTTT ACTCTCGCTAATTAAAAGTTCTTCCGTCTCATCAAAGTATATAAAGAGGA TTTCCCGTCTCAAAATTGTGCATAAATTCACCAAAATCTCTAGACGAGAC CGAGATAAATTTGAAAACCGTGTTTAGCCCGGGGTGGAGTATGAGTAAGC AGTGCCTGACGCTCTGACTCTGTGCATATAAATTTTCCCGCGTTTACTGG CCCTCTAACGGACGATAGCATCATCTATAAAATCTCAAATATATCAAATA TATTACCTGCCAAGCATATCTACCTGCACTTCCTTTGTCTTCCAGTATAT TTAGAGTACGGTCCGAAGTATAAGTTAAATGTTAATTCTTTCGTTTTTCA TCTCTTTCAGGTGAAACTACATATTACCTGACTGTCACAGCCATCGATAA ACTTCAAAATGAAATCAAATCAGATACCGTCAAAATCATCGTATCAACCT GTTCTGTACCTGAGTTATTTTTCTCTTATGGCACGCCAAGCGAACCGCTC CAATACACACGTGGTCAGTCAATCCCAATGGTGGGTTATTGGGTTAAGTT ACCAGATTGCGTCGATACTGTTCAAAGAGAATACAAATATATGAATGCTA CATTTAAATCTAATGACGGCTCAACCAATGATAAAATTGAATTTTCATTC GATCTCTCATTACGAAAACTTTCGTATACTGTCCAACCGAGAAGCTACGA ACCCGGTTCATACACTGTCAATTTGATCATGTCTTTTAAAGGAGAATTAT ACCAGTATAGTGGTTATTTCCGTATTGTCCAATCACCGCTTCAAGCTGTT ATCAGTAATAATGATTTTCAGACGCTCCCAACTCGCCATAAAGATGGCTC CTTTTATAATTCTGTTATAGACGCTAAACAGAGTCGGGATCCAGATGATC CGCGATTGGGATATTCCGGACTAAATTTCACATGGTTTTGCCGGTTGAAA ACTGAAAATGATACGAAAGTTCAAATTGAGATTCAAAAAAGAAATGATAC AAATGTTGAGTATAAATGTTTGAATAAAGTTTGGAATGAAACCCAGCCGT TTGGCAAAGGTAAGAGAAAATGAAAGTCTCTTCATGTTTTGTTGAGTTAT GTAACTTCTGCACTGACCTTTGTATATCCCTGGACCAAGCTTTATTCGCC ATCTTTGATTGAAGTTTTTTTGGAATTGGTACCCGTAAAGAAGCCATTCC AGTGTTAAAAATCTAACGGCGCTATATCATCAAAAGTTTTCGAGGGAAAG TAGATCTAGCGTTTTCGATGCATTTACACCGCTATTGAGTAGTGCCTCTA TTAGGGTACCACTTTTCAAAAAAACTCCGATTAAAGATTTTGCTTGGCTG GAATTGGTCCAGGTTATATAAAGGTCAGTGACCCTATTCGAAGCAAAATA ATGCGTCATCTTGAATGGAGTGACGTCACAATTTGAATGTATGATTCGAA CTTTTGCTTCCGTAACGGCGGAAACTACGTAGCTTAATAAAACATGAAAA ACTTATATACGTTGTAACAAACATTGAATCCTTAATTCGGACACATGTGC TTCTCAGGTGTTTCCACTAGATCGGCAAATGACAAATCCAAGTGTATTTA AAATCATTTGTCTGATCGGGTTGTCTAGCATGCTAGGTAAGTCTGCGACC GCAGTCGGAGGCGACCCGAAGGCTTCTCTTTTGATAGCCGTCTACCCGAT AGAGGAGGGCGCCACTCTTTCTCTCTGGATTGCTCCACTTACCCTTGATC CTTCTTTTAATTTCTGAGCATCAAGCAGAGAGGCGTCCAGTACCATTTTG GGAATCTTTGGTATGAACCGCCTTGGGGTTGAACCCATAACCTTGCGCAC TGTAGCCGGATGCTCTACCACTGCACTACGGTCGCTAGCATGCTAGACGA CTAATCTAGACACAGAATGAAATATGGCAAAAAAATAATGTAATCAAATG GACAATCTTAGTCGGAGGTTTCCAGTCGTTTAGAAAAGCTGATATTATCC TGTTACAATTATTGTATCAAGATAATTGTATTCCATAGGTTATAGACGAC TTCAGTCTACTGATCTGATAGAGGAAATATTTAACAAGTCTTATACATAG GTTTTGCTTTTACATAAGTGTTCCCGTTTCATATCAGACACATATTTCAT ATCGGGACAGTGGCTTCATATTGTTATATTATGCTGATATAAGCAAAAAA ATGTTGTTTTTTCCTCTTTGTGACCAATCTTGCTCCACATCCGTGTCAAT CCAATGCGAAAAAGCTTGCAAATTAAAATTGATGAGTAAGCAAACAACAT CATTCTTATTTAAAAACAAAACCTTTAAACCTTTTCGTGTCTTTGGTCAG TGGGCCTCCTTCAATAATAAAAAAATTAATTTGAATTTCCACAGGTGTCG AGGCGAAATCGAACGCGTATCATTTCTTACAAAACATCGAATATGAGTTT CGTGTCATCGTTCAGAAAGGCTCAAGAAGTAGCCAAGACGACCAGACTGT ATTTTTCGCTGAGGGAGACCCACCTGGTATAGTGTTGTTGTGCCAAGACA ATTGTGGAAGCAAGATTAATACACAAGGAGAGTTGGCTTACAGGCTTGAT TGTGATCGGTATCCAGTCTGGCAACAGTAAGTGAATCAATATTTTGTACA AAACTTTTTAATTTAGAATAGAACAGGTTTTTTGGAACTCTACAAAAACT GAAGAAGGGAGGTCAAAAATTTCCCTAGAAAGGAGAATAGCAAGAAAGGA GTACCTTTCTGATCTAGATTGTGTAATTTCATACTCTTTATTCAAAACAA AAATTTGCCCAAATTCAAATATATTTATTCTCTAGTTCTAAGGCAGCTTC AATGTGCTGTTTTTCTGGCTGGCAATTTAAGTTTTTTCTAGAGTTAAACA ATAAGACTGAAAAGAGTGAAGAAACCGTAACTTTTCAAGTTTCAGAATCA AAAAAGAAGTAGGGGTTTTCAGACCAACTTCCACATTAAGTCCGACCGGT GCTCACAGGTCAGGGGGGATCCGAGGGTACACGCCTGCACCGTTGTGGGT CCTTCAAAGTTCCTCAAAGTGTCGTCAATGAAATGTCAAAGACATTGATA TAATGGTTAGAACAATTAAAATTAATCTGTATGATTGTTTCTTTAAACAA TTAATCAAGATTTAATGATTACATTTTTTTTTCAGATTCTCTTCTAAATG GATTATCTCGTACGACGGTCAACCATCATCAGAACATCGCGTACAAGAAC GTGATGGTAACTGCAATAACCATAACTTAATCATTTATACTGACACCCCA TTGGTTGAAGCCAAGAATTATACATTCGAATTCCAATTCCGATATTATGG AGATGTTGGGAAATCGGTTTATCGGATTACAAGACAGACAAGTCAGATAC CACATTCAGGATCGTGCGCAGTTACGGGGTAAGAATCTTTCAATAATCTT GCAAAAAACGCTGCCGTGTGCCAAACTTTGCAATATCATTTCAGCAAAGA GTTTCCCAGCTGGCACACAACGTTGTTTCAACGTCTATCATATGTTCATA TCGTCCATATAACGTTAGATGAACATTGAAACAACGTTGTGTGCCAGCTG GGTTGGTAGAAGCTCAAACAATTCATAATATGCACCATTGCAATGTTTTC CGTTCCACCCAATAGCTGATTGGTTGAAAGTGACGTATTGACTGCTTTTA CGTCACTTCCAACCAATGAGCTATTGGTTCCGTGACGTAATGTCAGAAGA AATTGCAGTGGTGCATATCATGAATAAACCACAAGAATTCAAACTGGCCT TAGTTAACTGAGCCCGTATTCACAAGGCTAGATCACACGGCTTTTGGCAA TATAGCTTTTTGGCGCTTTGTAGATTTTTTATATATACGGATTTTAAATT TATATAAGTAAGTTCACAACTTACCATCAGATTTATCCTAGTCACTGAAT CAAAATAGCTTAGATTTCTAGGCTTCAAACTGCGTAAAGAAGTTTTTCAT GATTTGTTAAGTAACGTAACATTGAAAAAAATCTGCCATTATGGTAGAGA GCACCTCACTAAAAACCGGGATTTTCATCTCGTTTCTAAGTGAGTTCCAC TTTGACGATTTTTAAAAAAGTCTTTCAAGTATTTTGACGTTTTGACGCAA ATTCGATTATTTTGCTTCTGCAGGAGCTTCGAAAATTAAAAGTGACGTCA AAAAATCTAATGTTTAGAGCCCGAAAACCCGGACTCAAAACATTCGAAAA ATTCGTAAAGTGGACGTTAATTGCTTAAAAAACGCGGGTGACGTCTAGTA TAGGCTACCATTATGGAGGCAAACGTTCTAACTTGTATATTAGCCGGTTC TACGCAAATCGAACGTGTTTGCTTCCATAATGGTAGTGAAAGTTGCGTAA CTTAGTTAACTTGAAAACCCCCTGGAGTCTGAATCGCAGATCTCAAAACT GCATTACCATATAGGGTAATTTAAAAGGAGCACGAATCCGTTAGTGGAAG CAAAACAAAAAAACGGTGTTTGACTAATTGTTTAACCAACTAAAATACTA ATTTTTACTCCTTTACTTAGGTAAATAAGTAGTTTCATCTAGTTGCTGTC GGAGGAAACGGGATTGTGGGAGTTTATCCCCTTTTCTATCATTTGCGCTA GATGTGGGAGATCGAGTGCTGAGGTGAAGCACCATACCTACTCTCAGCTC CCAGTGACTTACTACTTAGATCAGATTACCCAATCCAAGCTACTCATTAG CTGAGATGTCAGTGACCGGGGATCGAACCCACATCCCTTAGATTGCAAGG CGAATGCTTTACCGACTGAGCTAACTGGATATTTTTAATTTCTTCGTATA AGAAACAAACCAAATCGTTTCATATTTTATCACACAGGAACAACAATATT ACAGTAGACGAATTTTCAGATATACAATGTCAAAATTGGATCTCTGAAGA ATTACCTCTGAGTTACGAGCTACGTTATAAACTAGAAAATGGACAAGATT GGATTTTACCAGGAAGTTCAATTTTCTCCAGACAGCTTTTCACTATTGGA AAAAGGGAAGACAATTATAAGCTAAACCTCCGAATCAATATTTATTCA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000045_pilon:699926..711123-

>XLOC_006070 ID=XLOC_006070|Name=XLOC_006070|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4392bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000045_pilon:699926..711123- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGTGTTGGTACGTTAAGGATCGATAACGCTAATCCGCCACCCCACGTCGA
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AGTGGAACTCAAAGTTGATATGAGGAACGGCACATTCCCAGAATATTTGA
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GTTCCTGAAGTTTTCTACGAGAAACATACTTATACAGTTACTCAGAGTGT
GGTCAAAAAGCAATCACAGTCAAAGTCAAGAATCCATTAAGCGCTGGCAA
CACCTGGGAAAACTTGCCATCACCAAGCGTTAGCAAACGAAACATTGTCA
TCATCTGCCCGTTAGGTGATCTCCAGATTGAAACAGATCCGGTTTTCTCA
GCTTCCCGAGTTTTAGAGATATCCGGTGGTGTTGAAGTGGAACTCAAAGT
TGATATGAGGAACGGCACATTCCCAGAATATTTGATCGAATGGGGAGATG
GTGTATCAGACAATGTGGATCAAACTAACAAAATTGTTCCTGAAGTTTTC
TACGAGAAACATACTTATACAGGTGAAACTACATATTACCTGACTGTCAC
AGCCATCGATAAACTTCAAAATGAAATCAAATCAGATACCGTCAAAATCA
TCGTATCAACCTGTTCTGTACCTGAGTTATTTTTCTCTTATGGCACGCCA
AGCGAACCGCTCCAATACACACGTGGTCAGTCAATCCCAATGGTGGGTTA
TTGGGTTAAGTTACCAGATTGCGTCGATACTGTTCAAAGAGAATACAAAT
ATATGAATGCTACATTTAAATCTAATGACGGCTCAACCAATGATAAAATT
GAATTTTCATTCGATCTCTCATTACGAAAACTTTCGTATACTGTCCAACC
GAGAAGCTACGAACCCGGTTCATACACTGTCAATTTGATCATGTCTTTTA
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TAAAGATGGCTCCTTTTATAATTCTGTTATAGACGCTAAACAGAGTCGGG
ATCCAGATGATCCGCGATTGGGATATTCCGGACTAAATTTCACATGGTTT
TGCCGGTTGAAAACTGAAAATGATACGAAAGTTCAAATTGAGATTCAAAA
AAGAAATGATACAAATGTTGAGTATAAATGTTTGAATAAAGTTTGGAATG
AAACCCAGCCGTTTGGCAAAGGTGAAACTACATATTACCTGACTGTCACA
GCCATCGATAAACTTCAAAATGAAATCAAATCAGATACCGTCAAAATCAT
CGTATCAACCTGTTCTGTACCTGAGTTATTTTTCTCTTATGGCACGCCAA
GCGAACCGCTCCAATACACACGTGGTCAGTCAATCCCAATGGTGGGTTAT
TGGGTTAAGTTACCAGATTGCGTCGATACTGTTCAAAGAGAATACAAATA
TATGAATGCTACATTTAAATCTAATGACGGCTCAACCAATGATAAAATTG
AATTTTCATTCGATCTCTCATTACGAAAACTTTCGTATACTGTCCAACCG
AGAAGCTACGAACCCGGTTCATACACTGTCAATTTGATCATGTCTTTTAA
AGGAGAATTATACCAGTATAGTGGTTATTTCCGTATTGTCCAATCACCGC
TTCAAGCTGTTATCAGTAATAATGATTTTCAGACGCTCCCAACTCGCCAT
AAAGATGGCTCCTTTTATAATTCTGTTATAGACGCTAAACAGAGTCGGGA
TCCAGATGATCCGCGATTGGGATATTCCGGACTAAATTTCACATGGTTTT
GCCGGTTGAAAACTGAAAATGATACGAAAGTTCAAATTGAGATTCAAAAA
AGAAATGATACAAATGTTGAGTATAAATGTTTGAATAAAGTTTGGAATGA
AACCCAGCCGTTTGGCAAAGGTGTCGAGGCGAAATCGAACGCGTATCATT
TCTTACAAAACATCGAATATGAGTTTCGTGTCATCGTTCAGAAAGGCTCA
AGAAGTAGCCAAGACGACCAGACTGTATTTTTCGCTGAGGGAGACCCACC
TGGTATAGTGTTGTTGTGCCAAGACAATTGTGGAAGCAAGATTAATACAC
AAGGAGAGTTGGCTTACAGGCTTGATTGTGATCGGTATCCAGTCTGGCAA
CAGTGTCGAGGCGAAATCGAACGCGTATCATTTCTTACAAAACATCGAAT
ATGAGTTTCGTGTCATCGTTCAGAAAGGCTCAAGAAGTAGCCAAGACGAC
CAGACTGTATTTTTCGCTGAGGGAGACCCACCTGGTATAGTGTTGTTGTG
CCAAGACAATTGTGGAAGCAAGATTAATACACAAGGAGAGTTGGCTTACA
GGCTTGATTGTGATCGGTATCCAGTCTGGCAACAATTCTCTTCTAAATGG
ATTATCTCGTACGACGGTCAACCATCATCAGAACATCGCGTACAAGAACG
TGATGGTAACTGCAATAACCATAACTTAATCATTTATACTGACACCCCAT
TGGTTGAAGCCAAGAATTATACATTCGAATTCCAATTCCGATATTATGGA
GATGTTGGGAAATCGGTTTATCGGATTACAAGACAGACAAGTCAGATACC
ACATTCAGGATCGTGCGCAGTTACGGGATTCTCTTCTAAATGGATTATCT
CGTACGACGGTCAACCATCATCAGAACATCGCGTACAAGAACGTGATGGT
AACTGCAATAACCATAACTTAATCATTTATACTGACACCCCATTGGTTGA
AGCCAAGAATTATACATTCGAATTCCAATTCCGATATTATGGAGATGTTG
GGAAATCGGTTTATCGGATTACAAGACAGACAAGTCAGATACCACATTCA
GGATCGTGCGCAGTTACGGGGAACAACAATATTACAGTAGACGAATTTTC
AGATATACAATGTCAAAATTGGATCTCTGAAGAATTACCTCTGAGTTACG
AGCTACGTTATAAACTAGAAAATGGACAAGATTGGATTTTACCAGGAAGT
TCAATTTTCTCCAGACAGCTTTTCACTATTGGAAAAAGGGAAGACAATTA
TAAGCTAAACCTCCGAATCAATATTTATTCAGAACAACAATATTACAGTA
GACGAATTTTCAGATATACAATGTCAAAATTGGATCTCTGAAGAATTACC
TCTGAGTTACGAGCTACGTTATAAACTAGAAAATGGACAAGATTGGATTT
TACCAGGAAGTTCAATTTTCTCCAGACAGCTTTTCACTATTGGAAAAAGG
GAAGACAATTATAAGCTAAACCTCCGAATCAATATTTATTCA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006070XLOC_006070-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000045_pilongenomesc0000045_pilon:699926..711123 -
Properties
Property NameValue
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