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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000281_pilon:203659..212127- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_006014 ID=XLOC_006014|Name=XLOC_006014|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8469bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000281_pilon:203659..212127- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTTAGCGTAGTTTTGGCATACTATGGAATTTCTCTTGCATCCGATAATCT
GGGTGGAAACATGTACCGCGATTTCGCTTTGACGACCATTGTCGAATTCC
CAGCCAACATTTTATTAATGTACTTCTTGAATTTGTAAGTATCTGCTTTG
TTCATTTTCAATACAGTACACTCTCATTTATTCGAACTTCTATTATTCGA
ATTTGTATATTTAGAATTAATTTTCATGAGTCCCCGTAAAGAAAAAACTT
TCGTAAAATCCTTTCTATAATTCGAATCTCTCCGTTATTCGAACAAATTA
GATTCCCCATGCAAGTTCGAATTAGCGAGTATAGTCAATTGTATTTTCAA
ACGATTCTCAAACTCGGTGCGTAACAAAGTGAAACAGATTTTTGTATAGT
AAAATCGCCCCCGTTTGAAACACCTTGAAATTTCATGGCTAGTCGAAAAC
TACACTGGACTTAACCAATTAATATTTAAAATATTGATTTCATCCTCACT
TTTGACCCCAATGTCGAGAGAAAAATCAGTTCCTCGTAGAGGACAATTTT
GGGGGAATTTATGAAAAAAGTGGGAAAACTTTGAGATCATTTTGGACATT
CAGTCTCATTCAGGGTCACTTTTTTTGCAAATTTTGGCAAATTTAAAAAA
GAGTCTCACGTCCATTTTTTAACCTCAGTGGAACACCCGCTTCGGTCAAC
AAGAGTAGTGCCCCCCCCCATTGGGTGACGTCAATAGGTCACTGAAACAG
GGGTGTAAAATTAATTTCCTTAGATCACGAGACTGAAATTCTACAAAAAC
ACAAACGAATAAACTTGTGCAGGTTGTTACTATACTTTCAGATTCAGCAC
GGTGTGCTTTTAAAAAGCGCTTAGTTTAATAGATATGAAATGCTTGTGTT
TTTTATCATTTCACAGTTTAATAGATATGAAATGCTTGTGTTTTTTATCA
TTTCACAGAATTGGCCGGCGCAACACGATTGGTGGAAGTATAATTGTGAG
TGGAATCTCATGTCTAGCTGTTGCTTTTATACCAAAACAAGGAGGTAGGA
ACATTACATTCAAAACACAGTTGTGAATACACGTTTTTTTATAAGAACAA
ACTATATAAGAACATGAGTTTTCAATGGCGAAAATGCTAAGAACAAGCTA
AGAACATTTTAAGGCTTTGCAGACCCTAAAACACCTATTTTCTTAGGAAA
ATAGACAAAAAATAGACAATAAAAACGTGCATTAAACCCTTCCATTGCAT
CCCACTGGCTGATATCTCACAGGGTTAATGAGACAGGGGTGTGCATAGCA
CTACTTCGTCACATATCCTTACTTCGTCTCCTATTGTTATTTTCTTTTCT
ACGTCATAATTTATGCTTAAAAATTAAACAGCTGAATATACATGGTTTCT
ACTAGATTATTGTTAATCATTTAAATGACGTAATACATGCTATTATGCAA
GCTAAGAAGTTGATTGACAGATATCTTTGAATGGGAAAATATGAAAAATT
GATTGACAGATATATTTTTCTAGAATACATAAAATAATTACCGTTAGGTG
TGAAAATGATGGGCGCAGAGGTAAATAAAAGACATATTTTGACATTGTAC
ATTTTCTTAACTGACCAATCAAATCACTACTATACATGTAACATTTTGAA
GAGTGAGTGCACGATGAACAATCGTGATTGAAATTCTAAAGAAATATCTC
GAAGAAACCATAATACGCATGCACGGATGCTCTACACATGGTCACATGAC
TTGAAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAAATCTATCCTTACTTGGT
CACGATGCATTGCGTAAGAGTTCTTTAAAAATTTCACAAAAATTTATATT
CTCACTACACGGTCAAGTGATTTAAAAGTTAGATTTTACAGATTAGTCAA
AAAAACTTATCCTTACTTGGTAACATGACTCGAAAGGTTGATTTTGCAGA
TCAATCAAAAAAAATTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGAT
TTCGCAGATCAGGCAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACGACAATGCAT
AAGAGTTCTTTAAAAATTTCGCAAAAATTTATATTCCCACTACACGGTCA
CATGACTTGAAAGTTAGATTTCGCAGATCAGTCAAAATAATTTATCCTTA
CTTTGTCACATGACTTGACAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAATGT
TATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTCGCAGATCAGGCA
AAAAGATTTATCCTTACTTGGTCACGATGCATTGCGTAAGAGTTCTTTAA
AAATTTAGCAAAAATTTATATTCTCACTACACGGTCACGTGATTTAAAAG
TTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAATGTTATCCTTACTTGGTCACATGA
CTTGAAAGTTAGATTTCGCAGATCAGGCAAAAAGATTTATCCTTACTTGG
TCACCATTCATTGCATAAGAGTTCTTTAAAACTTTCACAAAAATTTATAT
TCCCACTACACGGTCACGTGATTTAAAAGTTAGATTTTGAAGGTTAGTCA
AAAAAAATTTTCATTACATGGTCACATGACTTGAAAAGTTAGATTTTGCG
GATCAGTCAAAAAGATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAG
ATTTTGCAGATTAGTCAAAAAAATTTATCTTTACTTGGTCACATGACTTG
ACAGTTAGATTTTGCAGATAAGTCAAAAAAATTTATCTTTACTTGGTCAC
ATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCGGATCAGTCAAAAAAATTTATCTTTAC
TTGGTCACATGACTTGACAGTTAGATTTTGCAGATAAGTCAAAAAAAATT
ATCTTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTAGGATTTTGCAGATTAGTCAA
AAAAATTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAATTTAGATTTTGCAGA
TCAGTCAAAAAGATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGAT
TTTGCAGATCAGTCAAAAACATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTTAA
AATAAGATTTTTTAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAG
TTAGATTTTGCAGATAAGTCAAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACATG
ACTTGAAAGTAAGATTTTGCAGATTAGTCAAAAAAATTTATCTTTACTTG
GTCACATTACTTGAAAGTTAGATTATGCCGATTAGTCAAAAAAATTTATC
CTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTAAGATTTTTTAAAAAATTTATCCT
TACTTGGTCACATGACTTGAAAGTAAGATTTTTTTTAAAATTTATCTTTA
CTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGTAGATTAGTCAAAAAAATT
TATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTAAGATTTTTTTTTAAATTTA
TCCTTACTTGGTCACATGACTGGAAAGTTAGATTTCGCAGATTAGTCAAA
AAAATTTATCTTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTAAGATTTTGCAGAT
CAGACAAAAAATTTATCCTTAATTGGTCATGTTTACATCAAACACTACTT
GGTCAAGTTTTTTCATTCACTAGAAATGTTAATAACTTGGACCAAAAATA
CCAAACACTATACTTGGTCACGCCTTTTCACTCATAAGAAATGTTCATTA
TTTGGATCATAAACCACGCCTTTTTACTCATAATTAGAAATCTTTATATT
TCGGACCAAAAACATCAAACACTACTTCGTCATGCCTTTTTACTCATAAG
AAATGTTAATAATTTTGATCAAACAAACCAAACACTACTCCGTCGCGCGT
TTTTCCTCATCAGAAATGTTCATAGTTTGGATCAAAAAGACCAAACACTA
TACTTGGTCGCGACTCTTTACTCCTTAATCATTCAGATATTTTTCACACA
AAACCCCACCAAATGTTACTTAATTATATCTTTCATTGAAAGCTCTCGTC
ACTTCCATTATTCGTCCAAAAATGTCTTCGATATTTAAAGAATTTTACGA
TACATTGAAAGTTCAGGTGAAGAGGAGTTGCTAACTTGCACTTTTAGTAC
ATTTGTGGCCGAAACGCCCGACGAGACAGAATGGGATACATATACCTTTT
TCTATTGAGATTTGTTAAGAATATATTCAACTTTTTGTAAGCTTTAGGGT
GTTCTTTCTTTTGAATCTTAACCCTAAAAATATTATTGAAATTTTTACGG
CGATCGGTAACCGGTATGACCGATTTTAAGGGAACCCAACCGTGATCAGG
ATAGGATAGAGTGATCTGTCGGAAACGAAAGTGTCCCAGAAATTGTGACC
TGGTTGATGTATGTATAAAAAAACTTCTTTCTTCTACATTTTGACTCGTT
ATAAGGAGACTTTATCATTACTTTTAGAGATACTAAAGGTACTAGCTGAA
AAAAAATCGATTTTTAAAACTTCCACAGATAATGATCTGTGAAAACTAAT
TTATTAAAATTATTTAAAAAATAATATCAAATTCGATTCTATTATCTTAT
TAGTTTTATTGTATGCCGCCGCTTCTTTTAGAAGCCGTATGCAGTATGTT
CTTTATAAAGTTTTTGATAAAAAAAGGGTTCAGACATTGAACCTTTAATT
TTTGCTAGACGGAACGAGAAAGCGATCATTCATTCACTTTATTAAGTTTG
TTTGTTAACACCTTTAAAAAAAAGAGAGATCAACCATAGACTATTTCTTG
TTTCATTTGTTTATTAACACCTTCACATGAAAGAACAATTTTTTTGTTTA
ATTTTAACAGTTATAAAGGTGTTACAGAACAATACAATAAAAAAAAGCAA
GTAGAAACCACCTCTAATCTCAAGATCAATCAGAAATAATTTATGCAATT
ATTCATGCATATATTATGACGTAAAAGAGAAAATAACAATAGGAGACGAA
GTAAGGATATGTGACGAAGTAGTGCTATGCACACAGGGGTGGCAAACGTT
TTTGTATAAGACTCCATACAAAGAGCTTCGTGGACTATCATAATCTGTTG
TGGTATAGGGTTGTTTTCTGAGAATTGGAAACCATTTAGATATAATTACC
AATATTGGAAAATCGCAACAACAGATAAAGAAATTGAATTGGAAAACTTT
TAAAACCTATAACACTAAAACTTTTGAAACAAATTTAACAAAAACATTTC
AAAATTAAAAAAAGACCTAGTTAAAACATTCGCATGTTCAATTGGCTTGA
AGTTGAACGATAATTCGAATCTATTAATTGAAGCTAAAATTTTCCTAAAG
AACATTAACACCCTCACAGACCCACTGGGAAAATTGGCCAAAATATTGTT
CCCGGTGGAAAATTACCCTCCAATATTTGACCCCACTGAAAATAATCAAA
CAAACCGATCCTCACTGCGAAATACTATGCTATTTTTCCCACCCCGCCCC
CTGAGTTTTCTGACTTGAAAACGAAAGAAATGAAATCCCCAGCCACAAAA
AATATGGGAGTGCCAATCGCCATTGAGTTTCAGTCCGTTATTTTTATCCC
CACTGGCTGAAAAATTCCACCGGGTCTGTGAGAAGGGGGTGTCATATACA
ACTATAGACGCTGCGGAAAATGCTAGAAATTAATTTCAAATTTGTTTCAC
TTTTAGTTTACAATTGGATCCGTGTAGCGATGGGAATGTTTGGCAAATTC
TGGATCACTTTCGCTTTCAGTGGTGTGTACATTTGGTCCGCAGAACTCTA
TCCAACGGTCATCAGGTATGTTACTTGTGAGTGTCTAGTACAAAACGTCG
AAACAACCATTCAACGTCCATAACGTCCATATAACGTTATACGAACGTTG
AAACAACGTTGTGTGCCAGCTGGGGAGTCTTGAAAGCAACTTTCTTTAAT
TGTATTTGCACTTTATGGTCACAAAATTCTATCTGAACAAGTTTCGTAGG
CTTCTGCTATAAAAAACTTTATGTAGGAAGTATATACCCTGAGTATCAGA
GGTTGAGAATATTTCAACCTCTGACGACCAATAATAGAAACTTTATCGCG
CATGTGTCAATCTAATCACTGTAGAAAAAAATCAAAGATGAAGAGCAAAT
ATTACTATATTAATGTTTAGCAGACTGTATCAGTATGCAGTTTACTATTT
ACGAATTCCCCAGAAACCTCCAAGTGTAATTGAAATGAGTTTCTTCAAAA
GAAATCTTTTACATGATCCCCAAATGTATAACAGTAATTACTAAACTTTT
AATTATTGAAATGTCACTTTAATTGAATCGAAATAATAGACAAACTTTAT
GTTATGATTCTCTACACTGACTCTTTTTAAAAAGTATTGATAACATTTAT
GAGTTGTGTTTTCAACGACGGGAATAAAAATATCAACTTTGAACTTCATC
CAAGATCTTGGATGGTCGTCATGGTTACTTTTCTCTGCGCTGATTGCGCG
CTGAATAGAATCTGGATTGGTCGGCACAGCGTCGATATATGATTTCGACC
TGTGCTTTTCACGGTAGGGATTGTATCTATAGAGGTCTGCGATTCAGACT
ATAAGTTTTGCGAGTTCAAACCGGGGATAAACATGAAAAAACGAGCTTCA
CTGAAATACGTAAACTGCTTGTTAAAATAGATAGATCTTTCTCTTGTACT
TGTACTTGTTGGTTTAGCTAAACCATCTGTTTGACAACTGTTGTCGGTTC
GTCCAGTAGCGTAGACAAGAGGGGCGCCTGCTGTTGTCGGTTCGTCCAGT
AGCGTAGACAAGAGGGGCGCCTGCTGTTGTCGGTTCGTCCAGTAGCGTAG
ACAAGAGGGGCGCCTGCTGTTGTCGGTTCGTCCAGTAGCGTAGACAAGAG
GGGCGCAAAATTTGTGTACGAGAGCAGCTTTTTATTACACGGTAATTATC
TTTTTATATTATGAATAGATAATTACTGTGTCATAAAAATCTGCTCTCAC
TACACAAATTTTGCGCCCCTCCTGTCTATGCTACTGGTCGTCTGAGATGA
ACCATGTCCCTTGCGTTTCAGTGCCTCTTTGTAGAAATTGTTTTTCGTCA
ACGCAGTAAATTTCGTCACTTTGTCTTCTAGTGTCTAATCTGATCTTATT
TTTCCACTTTCCTAAGTTTTGTAATTTTTGATCAATTGTACACACCAATC
CGCATACACTTGAGATGGTTTAAGAGGAATAAAAAATTTAAAGAAAATCG
AACAAAACTTCCAAACATCATATCTCAGTATTCTGATTCCGAGCGTTATA
TTTAGTACTCCTTATTCCTTCCGATGAGTCCTTCTTCCTATATCTGTTCG
AGTTGTTAGGTATTTATATATATCTTCACACAGCACATTATAAAACACTT
TTCTTGTAAGGAGAACCAATATTTTTAGAGATCAAGGAAATAATGCTAAA
AAACAGAAAAGTTGTTATAATATTGTGCGCTAATGGCAATGTAGTGATTC
AAAGACGGAAATTATTTTCATCCATAGAGCACAAGGACTTGGACTAATGA
TGGTTGCCAGCCGCATCGGTGGTTCAGCAGCGCCCTGGGTGGCGCAATAT
TTGAGCAAATATGGAGACTTTGTACCGTTTTTAGTAATGGGAACACTTTC
ATTGGTCAGTGCTTTGTTATGCTTCAAATTGAAAGAAACAAATGGAAAAC
CATTGGCTGATACTTTGGAAGAATTTTACGCAGTTAGTGAGTACGGCAAT
CTATCTTTTTATGTATCTTCTCAATCATTTTGTTTTCCGACTGAGCTACT
ATTACACGTTGTTTTATAAGAACAAACTAAATAAGAACATAAGGCTTCGA
TCGTCAAAATCTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTTGAGGACT
CTAAAATACCTAATTTCTTAAGAAAATGGACAAAAAATGGAGAAATTAAG
AACATGTTAAGAACATTTTTAGGCTTAAAACCAAAAAGTTAAGAACATCC
GAAGGCTTCAAAAATTTTGGATGTTCTTATAAAAAAAAGTGTACTTTTCA
CATGAATAATTATTTTCAGGGGGTACTAAATTATACTTGCTGATAGACGG
GGGTTGTACCACCTAGGTTCAAATTTGGACCCTTTTCTGGAATTTAATTT
AATTCTTTTGAATCTTGGCTGTACACTACCTGAGACTGGTTTTACAATTT
TGTGTTTTCAACCATACCTTGGGCAACCTCGTTCCCTGCGTATTATCAGC
TTTTGATGCTTACTGATAGCGCTAGATAATACGTCTCTGGCGTCAAATCA
GTAGCGTAAATAAAACCTGGGATACACGGGGACGAGGCTGACCTTGGGAA
GCTAAGAAAGTGACGCTTTATCCAGCGGAGCACCCGATTCCACTCTTGCT
CTTTCTCAATTTTAATATTTTTTTACCAGATATCAAAGATTGTAAAGGAA
AGTCAGCCATCGAGAAGGTTTCAACAAAAAGACTCAACAAAAACGCCGAA
TCTGCTATCTGATGTGAAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000281_pilon:203659..212127- >XLOC_006014 ID=XLOC_006014|Name=XLOC_006014|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1248bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000281_pilon:203659..212127- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTTAGCGTAGTTTTGGCATACTATGGAATTTCTCTTGCATCCGATAATCT GGGTGGAAACATGTACCGCGATTTCGCTTTGACGACCATTGTCGAATTCC CAGCCAACATTTTATTAATGTACTTCTTGAATTTTTTAGCGTAGTTTTGG CATACTATGGAATTTCTCTTGCATCCGATAATCTGGGTGGAAACATGTAC CGCGATTTCGCTTTGACGACCATTGTCGAATTCCCAGCCAACATTTTATT AATGTACTTCTTGAATTTAATTGGCCGGCGCAACACGATTGGTGGAAGTA TAATTGTGAGTGGAATCTCATGTCTAGCTGTTGCTTTTATACCAAAACAA GGAGAATTGGCCGGCGCAACACGATTGGTGGAAGTATAATTGTGAGTGGA ATCTCATGTCTAGCTGTTGCTTTTATACCAAAACAAGGAGTTTACAATTG GATCCGTGTAGCGATGGGAATGTTTGGCAAATTCTGGATCACTTTCGCTT TCAGTGGTGTGTACATTTGGTCCGCAGAACTCTATCCAACGGTCATCAGT TTACAATTGGATCCGTGTAGCGATGGGAATGTTTGGCAAATTCTGGATCA CTTTCGCTTTCAGTGGTGTGTACATTTGGTCCGCAGAACTCTATCCAACG GTCATCAGAGCACAAGGACTTGGACTAATGATGGTTGCCAGCCGCATCGG TGGTTCAGCAGCGCCCTGGGTGGCGCAATATTTGAGCAAATATGGAGACT TTGTACCGTTTTTAGTAATGGGAACACTTTCATTGGTCAGTGCTTTGTTA TGCTTCAAATTGAAAGAAACAAATGGAAAACCATTGGCTGATACTTTGGA AGAATTTTACGCAAGCACAAGGACTTGGACTAATGATGGTTGCCAGCCGC ATCGGTGGTTCAGCAGCGCCCTGGGTGGCGCAATATTTGAGCAAATATGG AGACTTTGTACCGTTTTTAGTAATGGGAACACTTTCATTGGTCAGTGCTT TGTTATGCTTCAAATTGAAAGAAACAAATGGAAAACCATTGGCTGATACT TTGGAAGAATTTTACGCAATATCAAAGATTGTAAAGGAAAGTCAGCCATC GAGAAGGTTTCAACAAAAAGACTCAACAAAAACGCCGAATCTGCTATCTG ATGTGAAAATATCAAAGATTGTAAAGGAAAGTCAGCCATCGAGAAGGTTT CAACAAAAAGACTCAACAAAAACGCCGAATCTGCTATCTGATGTGAAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000281_pilon | genome | sc0000281_pilon:203659..212127 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 571-612:43 |
| Aaloc | 535-570:91 |
| Aaloc | 331-534:992 |
| Aaloc | 223-327:2812 |
| Aaloc | 136-219:7511 |
| Aaloc | 1-132:8470 |
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