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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:214603..221438+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_005783 ID=XLOC_005783|Name=XLOC_005783|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6836bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:214603..221438+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATAatacgagatggagtttttacaagaagTTTATACGTTTTAGTATT
AACAATAGTGTTTTTGATATCAACCTGTAGTTGTGGTGGTTCAAAGAAAT
TTCCTCTTATGAAGAGGAGGAACCAAGCGACTAAGGATGTTGTTACAACA
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GAACTTCTACTGTTTTACCATCTTCACATTTTACATACAAagacaatttc
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AATCAAAAGCTCTGAAAACTTCTTTATCAATGGATCGAATTGGGAAGGCA
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TTAGGTATTTGGTGAGACAGACGAAGACCTTTACAAAGGAGATTTATTTT
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CGAAAGCCAATTCTATTATAGTAATTGCCTTATTGATCATTATTAAATAA
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ATATGGTAAGTTTTAAATGATAATATATATTGTATTATACATACTGTCAG
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GTAGGGAGATACCTTACACAACATCTTTTGTTTGCCATGTTgtttaacct
ttcaaagccgcttacttttttgaaaaatgccaaaaagttcataatttttt
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caggtatcaactttggtatcgttggaaagctctttctctcagctacaaaa
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TTGCTTTTATTGCGgctataaattttttgaaatttccggaGATATCGGGT
CTGTTTTCAGACTATCGTTGACTTGTGCAgatttagaccatgttcgcagc
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CGAAATGGAACGGTAGTGTGTGAACGTGATGTTAGGTTTcaaattcttct
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AACATTGCTATAAGTTTGCCATCACCAAAGCAGAAAGAGGGACAGTGATT
GGAGCGGTCATTATGGAAGGTTTTTATGTTGTATTTGATCGTGAAAATGT
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AAGAACTATTTGAAGTTTGATTCTACTCTACTTTTGTTTTCGCAAGCAAA
TCTTAAAACTAGAGAATCTAGGAAAACTTTATAAATATTGATCGCTAATT
TAGAAATCttggattttccaaaaaatttcattttcaaaaaatttaaaagt
ttaaatcttttgcaaatgagTTGCACGACATCCTGATTAAATTTCTTTAA
TCAATTTGtgatcttttttttccttttcagctGAAGGCAGGTTGAATCCA
AGGTCTAGTGTTTCTGGTCCATTTAATAGAGGTAAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:214603..221438+ >XLOC_005783 ID=XLOC_005783|Name=XLOC_005783|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2550bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:214603..221438+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATAatacgagatggagtttttacaagaagTTTATACGTTTTAGTATT
AACAATAGTGTTTTTGATATCAACCTGTAGTTGTGGTGGTTCAAAGAAAT
TTCCTCTTATGAAGAGGAGGAACCAAGCGACTAAGGATGTTGTTACAACA
GAGAATTTGAAAGGAAGACCTGGTCAAGGGTATTACATTGCCATTTTATT
TGGTACACCACCTCAAAGGATGATAatacgagatggagtttttacaagaa
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TGTGGTGGTTCAAAGAAATTTCCTCTTATGAAGAGGAGGAACCAAGCGAC
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GTCGACACAGGGAGCAGCAACTTTGCCATCGCCTCAAGACCACACCCATA
TCTACCACTATATTTCCACGCCGACCAATCAATGTATTGGTCGACACAGG
GAGCAGCAACTTTGCCATCGCCTCAAGACCACACCCATATCTACCACTAT
ATTTCCACGCCGACCAATCAAAAACATTTGTTCCACTCAACCGTCCAGTT
GCAGTACCTTACACACAAGGAAATTGGCAAGGTGAACTCGGCACTGATTT
CATCCAATTCATTGACGCTTTGAATGTCACTGTCAATGTAAATGTAGCTT
TAATCAAAAGCTCTGAAAACTTCTTTATCAATGGATCGAATTGGGAAGGC
ATTTTAGGCCTGGGTTACACTCATCTTTCAAAgATCAAAAACATTTGTTC
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GAACTCGGCACTGATTTCATCCAATTCATTGACGCTTTGAATGTCACTGT
CAATGTAAATGTAGCTTTAATCAAAAGCTCTGAAAACTTCTTTATCAATG
GATCGAATTGGGAAGGCATTTTAGGCCTGGGTTACACTCATCTTTCAAAg
CCTGATAGCAGTGTTATTCCAGTGTTCGATCAATTTGTGATTGACAATGT
GGTCGATGATACCTTCTCAATGCAATTGTGCAGTAGCAGTGAACTTGATC
CTTCTGCTGAACCTACGGTAGCCGGTACTTTGCCTGATAGCAGTGTTATT
CCAGTGTTCGATCAATTTGTGATTGACAATGTGGTCGATGATACCTTCTC
AATGCAATTGTGCAGTAGCAGTGAACTTGATCCTTCTGCTGAACCTACGG
TAGCCGGTACTTTGGTATTTGGTGAGACAGACGAAGACCTTTACAAAGGA
GATTTATTTTACACACCTATTGTCAAGAAGTGGTATTATGAAGTCATCAT
CACTGATTTCGCTGTCAATGGAGTGAGCTTAGGTATTTGGTGAGACAGAC
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GTATTATGAAGTCATCATCACTGATTTCGCTGTCAATGGAGTGAGCTTAG
GGTTGAATTGTAAGAAGTACAATTATGACAAAACGATTGTTGACAGTGGT
ACAACCAACCTTCGTGTTCCTGAAGACGTTTTCAATGCTATTCTCGTGCA
TCTCAAAAAATATGACAGGGGTTGAATTGTAAGAAGTACAATTATGACAA
AACGATTGTTGACAGTGGTACAACCAACCTTCGTGTTCCTGAAGACGTTT
TCAATGCTATTCTCGTGCATCTCAAAAAATATGACAGGCTTGGTGTACCA
GACGAATTTTGGATTGGGCGTCAAATGATGTGTTGGAATTATGATAAAAC
ACCTTGGGAAGAATTCCCTGACATGtcaatttcacttttatcttCTGTTA
GCAGTTCAAAAGAATTCATACTCAAAATCACACCACAGCTTGGTGTACCA
GACGAATTTTGGATTGGGCGTCAAATGATGTGTTGGAATTATGATAAAAC
ACCTTGGGAAGAATTCCCTGACATGtcaatttcacttttatcttCTGTTA
GCAGTTCAAAAGAATTCATACTCAAAATCACACCACAGcTTTATCTTCGT
GAGACGATCGAGCGTGGACCATTACCCGGTCAACATTGCTATAAGTTTGC
CATCACCAAAGCAGAAAGAGGGACAGTGATTGGAGCGGTCATTATGGAAG
GTTTTTATGTTGTATTTGATCGTGAAAATGTTCAAGTAGGATTCGCTGCT
ACCACGTGTGGAGcTTTATCTTCGTGAGACGATCGAGCGTGGACCATTAC
CCGGTCAACATTGCTATAAGTTTGCCATCACCAAAGCAGAAAGAGGGACA
GTGATTGGAGCGGTCATTATGGAAGGTTTTTATGTTGTATTTGATCGTGA
AAATGTTCAAGTAGGATTCGCTGCTACCACGTGTGGAGctGAAGGCAGGT
TGAATCCAAGGTCTAGTGTTTCTGGTCCATTTAATAGAGGTAATctGAAG
GCAGGTTGAATCCAAGGTCTAGTGTTTCTGGTCCATTTAATAGAGGTAAT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:214603..221438 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1222-1275:6783 |
| Aaloc | 1045-1218:6358 |
| Aaloc | 895-1044:4601 |
| Aaloc | 778-894:4039 |
| Aaloc | 658-774:3605 |
| Aaloc | 526-657:2103 |
| Aaloc | 310-525:1517 |
| Aaloc | 220-306:619 |
| Aaloc | 1-219:1 |
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