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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000270_pilon:332936..336113- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_005503 ID=XLOC_005503|Name=XLOC_005503|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3178bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000270_pilon:332936..336113- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACTTCAAACTTTAGTTCGTTCAAGAAATTAACAAGTCGTGCTTTCTC
TTATCTTCTTGATGCACAGCAACAGCACCCTAGCATTGTAGCTTACACAC
GGTACTCACTACCACGTAAATACACTTATGCAAGACCAAATTTCCTGGAA
TTGGATGAAGAAGCAACAATAGCTTCAAGCGATCATGAGATCAGACCAGT
TATTCTACCTAAAAGACCACTCATTATGAATGCAGGATATGCTGAGGTCA
TCAATGCAGGCAAAACACCACAGACAAATGAGGATCAAGCTACTTTTTGT
TCTTTTGTCATCACAGTACCACAAAATATGCGAGAGGAAGGATGGACTAA
AGAGCAGTGTCAATTACCATGTGTTTATTTTGCAGTCTTTGATGGACATG
CTGGTAAAAATATTTATTTACTGTTTTTTTGCTTGTATCACTCTCTCTAC
TGATTTTATATACTAATTGATTCAAACTTTCCCCTATGGAAGCAAGATGA
TTCTTATTAAAGTGGGTGGATTAATATACTTGGAAAGGATCGAAGGAAAA
AAATGAACAGTAAAGACATTTTAAAAAGATTTAGTTTTTACTTTACTTGA
ATTTTGTCTTCCGAAACTGATTGTAAAGTAGATGATCCCAACGCAAAATA
GACTTAATTTTGATCATTTTTACTACTATTGCTCGAAAATCTGAGGATAT
ATCGAATTTGTTCTCCTTTATATATTACTTCACTTAGGTTACGATGCAGC
TTTGTTTGCTCAGAACAGGTTACATTTCCATGTCAAAGAGAGATTAACGC
AAATCTCCAACATGTTAGTCATGCCACAAGATGAAATAGAGCGAAAATAT
TTTACTATGGGCCTTATTATGGATATTGATGCTGATAAATTGATTATTGG
TGCTCTGGAGGAAGCTTTTCATACGTTTGATGATGAATTGAGACAAGAGA
GATTTGACTTTCATGTTCAAGGTGGTTGTACCGTGGTAGTATGCGTAATT
ATCAAAGGTAAGCACCTTAACCCTTCATACCCAAGGGATGTATATACTCG
TTCAAAATTAGTCAATATCTTAAGTCCCAGACCTAAAGCTATAACTCCTA
ACCACTTTATTTTAAAAGGCATAAACAGAATACTTTTTGACAGTGTATAA
AAATACCTTTCTAATAGTACCAAAACAGTTAACTAACTCTTAAGTTACAA
GCTTTTATGCCAGTTTGAAGTTTTCGATTTCAAAGGTAATGTTGAAATTT
TCACATTTTTCAAAAATGTTTCGCGCTGGAAAGATTGGGGCAGATTTACA
TTATTGTTTTTTGGCTTCCTTCAACTGCCAAATTAAATTTCCTCAGCAAA
AATTTTTTCGGCCATCCGCCAAACCCACCAAATTGAATTCCCACCAAGAT
TTCTTCTCTCAAGGTACACAATTTTATTAGGAAACAGGTTGCTAAGGCTC
GAGGGCCCGGATTTGCCCACTTTTTTCCCTATCCTGTAAAGTAAAAGCTT
TTTAGATAATCTAACCATGGTAAACGACAGATAACCCTTGGCCCAAAAAG
CATAAATATGGTTTACAGTAATATCAGAGGAATATTTTCGGAAGATGAGC
AAGAATGATAGGCAGCCCCATGGCTAACCTGAAGATTGGAGTTGCTTATA
AAAAGGAAATTGTATAGTTTATTAAGTAATTTTAAATTTTATTTTTTTTA
GTTCTCAAAAAAAAACTTTATGAGCATAACATTTTACAAGAAAAAGAATT
TGCTTAGTCAAAGGTTTTACAAAAAAGAATTTCTCAAGTTTAAAAAGAAA
ATTTTTGAGAATTGCTGATTCTTTTTTCTTAAGTTATTTTTATTACCGAA
TGATCTTTCAAAATTCAAAAAAAATTATAAGTATATAATTCCGTGTGACG
TCATTTTCACCCACGATTAGCCATTTTTTCTAAGAAATAGTGCAAAGAAT
ATGTACAGGATGATTTCGTGACACCTTCATAACTCAAAATCTTCAAATAG
TTCCCATTTAGACCTGCGCATAGTTTTTTGTTTCGTGGGTGAAATTTTTG
TCAGTTAGGAACAGGCAACTTGCTTGAGGTTTGCTTGAAGATAGTCCCTA
ACTGGATTTTGTCGAATCGGTTCCATCTTCCTTGGTTTTGGGTTTCTTTT
AGGTTATTCCTATCATGCGAACCCTTTGTTGTTGCAAATTTACTGTTTAT
CTTAATGATACTTTTAATATAGGTAAACTGTACGTGGCTGGTGCTGGAGA
CAGTCGTGCTGTTCTTTATCGCGATAATAATCCAGTTGCAATGTCACGTG
ACCACACTCCCGAATCGGAACGGAAACGGATTCAAACGGTGACTTGTTAT
AATCCCGATTTGGTTCGTGGTGAATACACACCTTTACAATTTCAACACAG
ATGTCGGAAAAAGGATCTCGGAACTCGCCAATTGTACCGGAACCACTTGA
TGGATGGGTGGTCGTTCAAAGTGGTGGATAAAAATGATCTCAAGCCTCAG
GTTATTTGTGGTGAAGGAAAACGCGCCCGTTTGTTGGATACCATTGGGAC
AACGCGCGGTTTCGGTGATCATGATTTGGAGGTACCGTATATGGATGGGT
TGAAAATTAAACCGTTCATGTTGTCTTCACCAGAAGTATTTGTGTATGAT
TTAGAAAACGAGACTTTTAGTGACGAAGATGTCTTAGTGATGGCTACTGA
TGGATTATGGGAACGCTTAACAAATGAAAACGTCGGGGAACTTGTTAACA
CAACTTTGAAGAAACATTCATTAGAGGAGAATCGGAAATACCTAGTTGCC
GCCCAAGCACTTGTTGACGAATCGAGGGGCGTTTTGAGTGAACGCGGGTG
GCGAACGATCGATAACGCGCCTGCTACGTACGATGATGTTTCTGTTTTTG
TGATCCCCTTAAAAGAATGGAAACGGACTTTAGATTTGGTTGTTCGGAGT
ACACGGCCCGGTAGTTCCGTTATCCTCGCGGGTGAAGAATATTGTAATAT
CCCGCACAACCCTTTATCGGTGATCGGGGATAGACTCACGGAAGCGGAAC
TCGATGACGTCACGAAAGGTTATGATGACGTAAGTAAAACTGTTGAATTG
AGAGGTCTGGAAAATCAAAGGAAAAGAGCCAATGAGAGCCTAGATGAGGG
ACCTCAAGAAAAGGCAATGCAAAACTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000270_pilon:332936..336113- >XLOC_005503 ID=XLOC_005503|Name=XLOC_005503|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3258bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000270_pilon:332936..336113- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACTTCAAACTTTAGTTCGTTCAAGAAATTAACAAGTCGTGCTTTCTC
TTATCTTCTTGATGCACAGCAACAGCACCCTAGCATTGTAGCTTACACAC
GGTACTCACTACCACGTAAATACACTTATGCAAGACCAAATTTCCTGGAA
TTGGATGAAGAAGCAACAATAGCTTCAAGCGATCATGAGATCAGACCAGT
TATTCTACCTAAAAGACCACTCATTATGAATGCAGGATATGCTGAGGTCA
TCAATGCAGGCAAAACACCACAGACAAATGAGGATCAAGCTACTTTTTGT
TCTTTTGTCATCACAGTACCACAAAATATGCGAGAGGAAGGATGGACTAA
AGAGCAGTGTCAATTACCATGTGTTTATTTTGCAGTCTTTGATGGACATG
CTGATGACTTCAAACTTTAGTTCGTTCAAGAAATTAACAAGTCGTGCTTT
CTCTTATCTTCTTGATGCACAGCAACAGCACCCTAGCATTGTAGCTTACA
CACGGTACTCACTACCACGTAAATACACTTATGCAAGACCAAATTTCCTG
GAATTGGATGAAGAAGCAACAATAGCTTCAAGCGATCATGAGATCAGACC
AGTTATTCTACCTAAAAGACCACTCATTATGAATGCAGGATATGCTGAGG
TCATCAATGCAGGCAAAACACCACAGACAAATGAGGATCAAGCTACTTTT
TGTTCTTTTGTCATCACAGTACCACAAAATATGCGAGAGGAAGGATGGAC
TAAAGAGCAGTGTCAATTACCATGTGTTTATTTTGCAGTCTTTGATGGAC
ATGCTGGTTACGATGCAGCTTTGTTTGCTCAGAACAGGTTACATTTCCAT
GTCAAAGAGAGATTAACGCAAATCTCCAACATGTTAGTCATGCCACAAGA
TGAAATAGAGCGAAAATATTTTACTATGGGCCTTATTATGGATATTGATG
CTGATAAATTGATTATTGGTGCTCTGGAGGAAGCTTTTCATACGTTTGAT
GATGAATTGAGACAAGAGAGATTTGACTTTCATGTTCAAGGTGGTTGTAC
CGTGGTAGTATGCGTAATTATCAAAGGTTACGATGCAGCTTTGTTTGCTC
AGAACAGGTTACATTTCCATGTCAAAGAGAGATTAACGCAAATCTCCAAC
ATGTTAGTCATGCCACAAGATGAAATAGAGCGAAAATATTTTACTATGGG
CCTTATTATGGATATTGATGCTGATAAATTGATTATTGGTGCTCTGGAGG
AAGCTTTTCATACGTTTGATGATGAATTGAGACAAGAGAGATTTGACTTT
CATGTTCAAGGTGGTTGTACCGTGGTAGTATGCGTAATTATCAAAGGTAA
ACTGTACGTGGCTGGTGCTGGAGACAGTCGTGCTGTTCTTTATCGCGATA
ATAATCCAGTTGCAATGTCACGTGACCACACTCCCGAATCGGAACGGAAA
CGGATTCAAACGGTGACTTGTTATAATCCCGATTTGGTTCGTGGTGAATA
CACACCTTTACAATTTCAACACAGATGTCGGAAAAAGGATCTCGGAACTC
GCCAATTGTACCGGAACCACTTGATGGATGGGTGGTCGTTCAAAGTGGTG
GATAAAAATGATCTCAAGCCTCAGGTTATTTGTGGTGAAGGAAAACGCGC
CCGTTTGTTGGATACCATTGGGACAACGCGCGGTTTCGGTGATCATGATT
TGGAGGTACCGTATATGGATGGGTTGAAAATTAAACCGTTCATGTTGTCT
TCACCAGAAGTATTTGTGTATGATTTAGAAAACGAGACTTTTAGTGACGA
AGATGTCTTAGTGATGGCTACTGATGGATTATGGGAACGCTTAACAAATG
AAAACGTCGGGGAACTTGTTAACACAACTTTGAAGAAACATTCATTAGAG
GAGAATCGGAAATACCTAGTTGCCGCCCAAGCACTTGTTGACGAATCGAG
GGGCGTTTTGAGTGAACGCGGGTGGCGAACGATCGATAACGCGCCTGCTA
CGTACGATGATGTTTCTGTTTTTGTGATCCCCTTAAAAGAATGGAAACGG
ACTTTAGATTTGGTTGTTCGGAGTACACGGCCCGGTAGTTCCGTTATCCT
CGCGGGTGAAGAATATTGTAATATCCCGCACAACCCTTTATCGGTGATCG
GGGATAGACTCACGGAAGCGGAACTCGATGACGTCACGAAAGGTTATGAT
GACGTAAGTAAAACTGTTGAATTGAGAGGTCTGGAAAATCAAAGGAAAAG
AGCCAATGAGAGCCTAGATGAGGGACCTCAAGAAAAGGCAATGCAAAACT
AAGTAAACTGTACGTGGCTGGTGCTGGAGACAGTCGTGCTGTTCTTTATC
GCGATAATAATCCAGTTGCAATGTCACGTGACCACACTCCCGAATCGGAA
CGGAAACGGATTCAAACGGTGACTTGTTATAATCCCGATTTGGTTCGTGG
TGAATACACACCTTTACAATTTCAACACAGATGTCGGAAAAAGGATCTCG
GAACTCGCCAATTGTACCGGAACCACTTGATGGATGGGTGGTCGTTCAAA
GTGGTGGATAAAAATGATCTCAAGCCTCAGGTTATTTGTGGTGAAGGAAA
ACGCGCCCGTTTGTTGGATACCATTGGGACAACGCGCGGTTTCGGTGATC
ATGATTTGGAGGTACCGTATATGGATGGGTTGAAAATTAAACCGTTCATG
TTGTCTTCACCAGAAGTATTTGTGTATGATTTAGAAAACGAGACTTTTAG
TGACGAAGATGTCTTAGTGATGGCTACTGATGGATTATGGGAACGCTTAA
CAAATGAAAACGTCGGGGAACTTGTTAACACAACTTTGAAGAAACATTCA
TTAGAGGAGAATCGGAAATACCTAGTTGCCGCCCAAGCACTTGTTGACGA
ATCGAGGGGCGTTTTGAGTGAACGCGGGTGGCGAACGATCGATAACGCGC
CTGCTACGTACGATGATGTTTCTGTTTTTGTGATCCCCTTAAAAGAATGG
AAACGGACTTTAGATTTGGTTGTTCGGAGTACACGGCCCGGTAGTTCCGT
TATCCTCGCGGGTGAAGAATATTGTAATATCCCGCACAACCCTTTATCGG
TGATCGGGGATAGACTCACGGAAGCGGAACTCGATGACGTCACGAAAGGT
TATGATGACGTAAGTAAAACTGTTGAATTGAGAGGTCTGGAAAATCAAAG
GAAAAGAGCCAATGAGAGCCTAGATGAGGGACCTCAAGAAAAGGCAATGC
AAAACTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000270_pilon | genome | sc0000270_pilon:332936..336113 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 676-1629:955 |
| Aaloc | 406-672:2440 |
| Aaloc | 1-402:3179 |
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