XLOC_005198 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_005198
Unique NameXLOC_005198
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000098_pilon:1092067..1127091-

Legend: polypeptideCDS
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:1092067..1127091-

>XLOC_005198 ID=XLOC_005198|Name=XLOC_005198|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6144bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:1092067..1127091- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTCATTCATATAACCCTCGATATTGGATGTAAACAATCTGGTCAACT
CTGGACTAGAAAAGTTACTCCAGAAGTTGAGGATGGATGGTCATTCATAT
AACCCTCGATATTGGATGTAAACAATCTGGTCAACTCTGGACTAGAAAAG
TTACTCCAGAAGTTGAGGATGGGCTGGTACTCAATATCAAGAATGTGTCA
AGCAATGGTTTCACTACACGTCATATTCGTTTCCAGCATCTAGCTTACGA
CAGCTCTGGTGATCGAATAGCAACCAGTGATCATCATGGAAATATACATG
TTTTGGATTTACAGAAGAACAGGCTGGTACTCAATATCAAGAATGTGTCA
AGCAATGGTTTCACTACACGTCATATTCGTTTCCAGCATCTAGCTTACGA
CAGCTCTGGTGATCGAATAGCAACCAGTGATCATCATGGAAATATACATG
TTTTGGATTTACAGAAGAACAGATACAACTTGGTATATTCATGTGGCATC
GCTTTGACATCGATTATATGGAATAATTACAGAATAAATGAAATTGTCAT
TGCACTTTCAAATAACGAAGTTCGCTGCTATGATATAGATACAACTTGGT
ATATTCATGTGGCATCGCTTTGACATCGATTATATGGAATAATTACAGAA
TAAATGAAATTGTCATTGCACTTTCAAATAACGAAGTTCGCTGCTATGAT
ATAGGGAAAAGAAGTTTACTTTCCATTTTGAAAGGACACACTTCTCCTGT
AGATTCACTCTCTATTCATGGTTCTGGTAGATACCTTTTAACGTCTTCAT
TTGATACCACCATTTTGTGGGATTTGAATACATTCACTAAAAAGAGAACT
CTAAACGGTGCTCAAGAAGTTGGTATACAAAAGGGAAAAGAAGTTTACTT
TCCATTTTGAAAGGACACACTTCTCCTGTAGATTCACTCTCTATTCATGG
TTCTGGTAGATACCTTTTAACGTCTTCATTTGATACCACCATTTTGTGGG
ATTTGAATACATTCACTAAAAAGAGAACTCTAAACGGTGCTCAAGAAGTT
GGTATACAAAAGGTCTTCTTTTTACCGAACAGCAATCACATAGTGAGTTG
TTTCCAAGACGACAGCATATTTGTGTGGGACTGTGAGAGTATGAAGTGTG
TTTATCAGCTGACGGTACCACCTGAAAGAAAACCTGCTTTCAAATGTTTA
ACTGCTACTAATGATTGTCGTGTCCTTGTCGGTGGTGGAAGGTCTTCTTT
TTACCGAACAGCAATCACATAGTGAGTTGTTTCCAAGACGACAGCATATT
TGTGTGGGACTGTGAGAGTATGAAGTGTGTTTATCAGCTGACGGTACCAC
CTGAAAGAAAACCTGCTTTCAAATGTTTAACTGCTACTAATGATTGTCGT
GTCCTTGTCGGTGGTGGAAGGAGTCGTTTCTTATACCTATGGAACATGGA
CAATCGTCAGCTGATACAAGTGATTGAACTACCAGATAAAGTGAAAAGTG
TGAAAGACATTCAGTTTGTAACCAATGTCATGGCGTTGAATCAACACCAG
GAGTCGTTTCTTATACCTATGGAACATGGACAATCGTCAGCTGATACAAG
TGATTGAACTACCAGATAAAGTGAAAAGTGTGAAAGACATTCAGTTTGTA
ACCAATGTCATGGCGTTGAATCAACACCAGTTACTGGGTGTTTTGGCACA
AGACGGTGTTATTCGATTTATCGACACAAATAATTGTAGCCTGAAAGCTG
AGCTTGGTAGCACTTCAAAGTTACTGGGTGTTTTGGCACAAGACGGTGTT
ATTCGATTTATCGACACAAATAATTGTAGCCTGAAAGCTGAGCTTGGTAG
CACTTCAAAGCGTATCCATTCGTTTCTGTTGAGCATGAATAGCCAATACA
TTGGATTGATTATGGATAACGGTGAAATAGCACTTCATCATCTACCAACC
GTCATCAAAGACAAGCAGCGTATCCATTCGTTTCTGTTGAGCATGAATAG
CCAATACATTGGATTGATTATGGATAACGGTGAAATAGCACTTCATCATC
TACCAACCGTCATCAAAGACAAGCAGACCCATAAGTTCACTGTAAAGAAG
ATCGCATCACAAACCTCATCATCCAATACAATTCCTTCAATGAATAACAA
TAAACACACTAAAGAGAAAGAAACAGAATCCGTTACCAAGGAAAATCAAC
CACCACGTTCAACAATATCTTACCGTAAAACTCAAGATGCAAGTCCACAA
TCTAGGACCCATAAGTTCACTGTAAAGAAGATCGCATCACAAACCTCATC
ATCCAATACAATTCCTTCAATGAATAACAATAAACACACTAAAGAGAAAG
AAACAGAATCCGTTACCAAGGAAAATCAACCACCACGTTCAACAATATCT
TACCGTAAAACTCAAGATGCAAGTCCACAATCTAGGCTAAATGTCGGTGG
TATAAGTATCAAGAGATTGAAAACCATCTTACAAGGCTTTGGCGAATATC
CTTCCAAATATCGCTAAATGTCGGTGGTATAAGTATCAAGAGATTGAAAA
CCATCTTACAAGGCTTTGGCGAATATCCTTCCAAATATCGCCAATTGATC
TGGAAGAATCTATTGGCCATACCTGAGAACCACACGTCGTTCAGTGCACT
TGTAGACAAAGGAATACACAACGCATACATTGCAATACATGAAAGATATC
CCATTAAAAGTCAAAAGTTATTGCGCGTACTCCAGAGCCAATTGATCTGG
AAGAATCTATTGGCCATACCTGAGAACCACACGTCGTTCAGTGCACTTGT
AGACAAAGGAATACACAACGCATACATTGCAATACATGAAAGATATCCCA
TTAAAAGTCAAAAGTTATTGCGCGTACTCCAGAGGGTTTTATCAGCTCTG
GCACATTGGTCACCGATCTTTGGAGAAACAGAATATTTACCGATGTTGGT
CTTCCCTTTTGTCAAAATGTTTCCGAACAATCAATTGGTGTGCTTCGAAT
TTGTCGTCACTATTCTCAGGTTTTATCAGCTCTGGCACATTGGTCACCGA
TCTTTGGAGAAACAGAATATTTACCGATGTTGGTCTTCCCTTTTGTCAAA
ATGTTTCCGAACAATCAATTGGTGTGCTTCGAATTTGTCGTCACTATTCT
CATGAATTGGTGTCAAAGATGGTTCGAATATTTCCCTAATCCTCCGCTCA
GCATCTTAGCAATGGTTGAAACGTTGTTATCGCACCATGATCCAGTTCTC
CTCAAGCATTTCATTGACCTCGATATCTCAACACAGTGAATTGGTGTCAA
AGATGGTTCGAATATTTCCCTAATCCTCCGCTCAGCATCTTAGCAATGGT
TGAAACGTTGTTATCGCACCATGATCCAGTTCTCCTCAAGCATTTCATTG
ACCTCGATATCTCAACACAGTTATACGCATGGCCGATGTTACAAACGTTG
TATTCGGAAGTGTTGACGCGTGATGATTGGCTGATAGTGTGGGACAATGT
CTTCTCCAGTCATCCATCGTTCATGCTTTATTTTTTGGTCGCCTATCTCA
TTCACTCTCGGAAAGCATTACTTTGCACTCAGACGAAAGAAAATATTAAG
TTATACGCATGGCCGATGTTACAAACGTTGTATTCGGAAGTGTTGACGCG
TGATGATTGGCTGATAGTGTGGGACAATGTCTTCTCCAGTCATCCATCGT
TCATGCTTTATTTTTTGGTCGCCTATCTCATTCACTCTCGGAAAGCATTA
CTTTGCACTCAGACGAAAGAAAATATTAAGGTCTTTTTTCATCACCAAAA
CCCAGTGGATATTGCCATGGTGATAAAAGAAACATATAGATTATCTTCCT
CAACACCGCCAGACCTTGACCCCAAAAAGTCGCTGGACGACAGAGTGCCG
CTACCGGAGGGCCAATATCCGATCTTCGATTTTTATCCCAAATTTGTTGT
AAATTATTTGGTCTTTTTTCATCACCAAAACCCAGTGGATATTGCCATGG
TGATAAAAGAAACATATAGATTATCTTCCTCAACACCGCCAGACCTTGAC
CCCAAAAAGTCGCTGGACGACAGAGTGCCGCTACCGGAGGGCCAATATCC
GATCTTCGATTTTTATCCCAAATTTGTTGTAAATTATTTGGTGGAAGAAC
GTGAAAGAATACGCGAAGAAGAGCTTGAATACCTCAGACAAAAGTGGAAG
AACGTGAAAGAATACGCGAAGAAGAGCTTGAATACCTCAGACAAAAGCAA
TTAGCACTGGATATGAAACGCCAGAAGGAGTTAACACAAAAAGAAGAATT
AGCTTACTACAGAGAACAAGAACAAGTGGTCAACGCGGAAAATGAACGGA
GACAAATTATCGCCAATGAAGAAAAACGTCTAGCTAGCCAACGGAAAAAG
CAATTAGCACTGGATATGAAACGCCAGAAGGAGTTAACACAAAAAGAAGA
ATTAGCTTACTACAGAGAACAAGAACAAGTGGTCAACGCGGAAAATGAAC
GGAGACAAATTATCGCCAATGAAGAAAAACGTCTAGCTAGCCAACGGAAA
AAATTACAATCACTGCGACGTGACATAGCAATGCAAGAGCTTGAGATGCA
CGACGAGGTGCGAAGGAAATTCTTCCACCATCAACGACAACAAAAACAAA
TGCAATTACAACGCCTGGATGATGAAATGAAAAGAAAAATTACAATCACT
GCGACGTGACATAGCAATGCAAGAGCTTGAGATGCACGACGAGGTGCGAA
GGAAATTCTTCCACCATCAACGACAACAAAAACAAATGCAATTACAACGC
CTGGATGATGAAATGAAAAGAAAATTTGAACAGCGAGAAGTAGAAATGAA
AGACGCTTTGACCGATGCTGAGATAAAAGCCATGCAAATCAAAGCACAGA
AACTCCAACTGGAAGAGTTTGAACAGCGAGAAGTAGAAATGAAAGACGCT
TTGACCGATGCTGAGATAAAAGCCATGCAAATCAAAGCACAGAAACTCCA
ACTGGAAGAGGACTTGATGCGAGAAGATGTGGAATCTTCATTTCGTTTGC
AATCAGAACGAGAAATCTTAAGACAACATGAAGAACAAAGTAGCCGCAAA
ATGAAACGTGTCATTGATAAAGCTTATGCTGTAGACGCTGAAAAGTTAAA
GGACTTGATGCGAGAAGATGTGGAATCTTCATTTCGTTTGCAATCAGAAC
GAGAAATCTTAAGACAACATGAAGAACAAAGTAGCCGCAAAATGAAACGT
GTCATTGATAAAGCTTATGCTGTAGACGCTGAAAAGTTAAAGGAATATCA
AACAGAGCTTGGGAAGGTCGGCCAACGACGTCAAAACATTCAAGTACAGG
CTGATTTGGCTGCTCAAAACAAGAAATGGGATATGGAGCGAGAAATACAG
GCTTTACAGGAATATCAAACAGAGCTTGGGAAGGTCGGCCAACGACGTCA
AAACATTCAAGTACAGGCTGATTTGGCTGCTCAAAACAAGAAATGGGATA
TGGAGCGAGAAATACAGGCTTTACAGATTGCACGAATGAATGAAGAAAAC
GAACAAATAGAAAACGAGCTTCATCAAACAATACGTCAGTCCATTCTCCA
TCAGATTGCACGAATGAATGAAGAAAACGAACAAATAGAAAACGAGCTTC
ATCAAACAATACGTCAGTCCATTCTCCATCAGCGAGAGATGATGGACGAT
GAACAAACGGTAAGGTCAGAGAAAAACTTTAATGACCAACTTCCTACCAC
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CAAACGGTAAGGTCAGAGAAAAACTTTAATGACCAACTTCCTACCACGTC
TGATCGAGTTATGCGAGGACATCGAGTGTTAGCGAGGGACGAGGACGACT
TGAGTGATCGAGGCTCTTTCACTGGTCGACAGATGGACTTGATGACCCAA
GTTCGTGATTTACGTACGCAAATGGCAAGGAAACAAAAACAGCTAAGTGT
TGTTGATTGATGTTAGCGAGGGACGAGGACGACTTGAGTGATCGAGGCTC
TTTCACTGGTCGACAGATGGACTTGATGACCCAAGTTCGTGATTTACGTA
CGCAAATGGCAAGGAAACAAAAACAGCTAAGTGTTGTTGATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005198XLOC_005198-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000098_pilongenomesc0000098_pilon:1092067..1127091 -
Properties
Property NameValue
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