XLOC_005196 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_005196
Unique NameXLOC_005196
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000098_pilon:1065476..1078692-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_005196 ID=XLOC_005196|Name=XLOC_005196|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13217bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:1065476..1078692- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTACAAAAATCGTACCAGTTGGTAGTGAACCATCTAAAATGGTAGACCA AGATGCAGGTCAAGGAGCTGGTTTACAGCGTCAAATCGGACTCATTGGAA CAATAGCTATTCTCGTTGGAACAATAATTGGGAGTGGAATTTTCGCTTCA CCTGCTTCCGTATCAAGTCAAATGAATAGCCCAGGCGGCTCTTTAGTCGT ATGGGCGGGATGTGGCGTTATTGCTATGTTAGCCGCCTTATCTTGGATGG AACTTGGATGTATGTTTCCAAATAAGGGAGGCGGTGAATACGCCTACATT TACGCCGCTTTTGGGCCGTTACCCGCCTTCCTGTTTGCGTACGTTAACGT TTTGGTGACCAGGCCCGCTTCGTTGACCATCATCTCCTTAACTTGTGGCG ATTATCTTATGAGAGCCTTCAATGTTCAAAATCATGAAAATTTTCAGTAT AATAAACTGGTAGCTGCGCTGTTGTTAGGTTAGTCATAACAAGTGTATTT TTCATTTTCGAAGCTTTTTCACTACCTGGTAGGAGAAATTTAACAAACTT AACAAGGCTTAAAAAAAGTTTCTTAATTTCCAGTTTTCAAGTTTCCACGT ATCTTATCTGGCGGTGATTTGCGTCAGTTTGTTAGTTACAGATTCAGTAT CAGTCTTTTATAAAATAAAATTGTTTTCAAGGACAAACACGACTGTCTGC TAAACCATTCATAATCTCTGATTGAAGACATTTTGTTTATTCCGACCTAA TACGTAAATCTTTTGAGGATTCCTCCTGTAGGTTGTTGTCACATGTTCAA ATTGATTATGATTTTCCTTGAATGAAATTCCTTTTTGTTTATGTCTTGAG ATTGTCATCGTTTGAACGTTCATTCGACGTCCGTGTGTGTTATTGGGCCA TTTTCAAGTAATTTGTGAGCGTCATTGAGGTTTTGAGGGAAATAGTAACT 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ATTGATCTTGAGAAATTGACTGAAGTCTCTGAACTTTGGTCGAGTGTCTT TAAACAGTTTAAGCGGTCCACCTTGGTGATTTCCAGTGAAAGTTTGAAAT GATCTCTCCTTCCTGCATTCTTAAAAAAGCAACGACTGAAGTATTCTCAC AGATTCAAAACAAGCAAATCAATCATGAAATTTTAAAAATACTCATTTAA CTGTTTAAGTTCACACTGAAGGAGTTCCAGTGTTTAATTTCATTCAAGTG TATTTTTTTGCTTTTACACAAAAACATCACCATTCACTCTGTTTTGTTTC GTGTGATGTCATGGTGAATAGCTACAGTTACCAGAGGTTACAATCTTACT TTTAGGTGGGATTCTTGGACTCGTCAGACCCTCTTAATAAGAACAAACTA TATAAGAACAAGGGAGGATATTAAGAACAAGTTAAGAACATTTCAAGACT TTGTGGATTCTGAAACACCCGATTTCTTTGGAAATTACACCAAAATACTC ACAAAATGCTAAACCACGTCGTTGTATTTCGCTACAGCAAGCTTGCAATA GGCTTAATGTCTATGTGAATCTTTCCAAACCACTCTTCCGCGGAAATTTA TATTTTTTATAAGAACTTTTTATAAGCACTATTCCCGCGTTCCTGTGTCC AAGGAAAGATAGAGACGCTTGCTAGTCTAACAAAATGCTGAAAATATGAA CATTTAAAAGAACATTTTAAGGCTTAAAACTTTTTGATGTCATCAATCGA TTCTCATTTCAACTGTTATTACCATGTGGAAACTGTGTGGAAACTCGAGA AGAATCTCATTCATAATTTGTACTTTCGTTGACCTTCCAAAGTCACAATG TGACAAACATTTAGAACTCAAATATATGGCCTTCATGTTTTTGAATATCA AATGACAAAATAGACAAAACTCAATCAATGTTGTCCCATCATGACAAAGT 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ATAGATTTTTTTCAGCTTTTCACCGTAAATGTTATGGTAAATCCTCATTA AACCGCCATAGGAAATACTAACTAACAAAAGAGAAATAGATTTTCTATGC CACTAATTGTTCTGCAAGTAATACAACTTTTAGTTTTGCCCACTCTGTAC AGTGGAATCTCGAACCTCTATGACTGGAATATCTCCCATATCTCGAACAA GTTTTATGATCCCTGCTGGTAGCAATGCCTTATAAACCTATAAAAGGGGC CCCCTTTAAATGCCAAGTTTACATTTGCCCCTATAAATAAAAAACAAACA GAAAATCCTGGCCATAGTTCAGCTCGATAGTTCTATGAATTTTGATGATA TTTTTAAATATACTTGATTGTTTTGTTGTTTCATATAATTTTTGAAAACG AAATGTAAAATTTTCAAGATGGCAGAAATCTCTAATCTTCTTCACTAGAT TCAGCGCCAAAGAAAACTATAAAGTTCAGCTAGAAGAAAACTCTTATATA TAGTATCATAGGATATGACACTACGTTGAAAATGGTTCTTAAAATCATCT CAGGAATTAGATCTCATTGTGTCTGGGGTTGTCTTAAACAACGAAACCGC AGAAAGTTCATATCACTTGTTGTTTATGATGTCATTTTTCATCATATACA TTTCAAAAATGTTCTGCTTTCAAAGTTTTTACTTTTCGTGTGATCTGGCT TAACGTGTCGTTTTAAGATGGTAGTTTTAGCTGAAGTAAACTCCCATAAA AACTCTGTATACTTGAAATTTTGATACGTTCCATTTTTTGGAAAACCTTT TTACAAAAGATGGAGATTTCGTACAAGAGAGAAAGTTTTTCGTCTCAATC ATCCGGTAGCAGTCAGGAAGAATTCGTTCAAATAAGACCGAGTCATCGAG ACAACGAAAACGCCGGATTTCTTATCCAACCGAATCGGAAAAATGGATTG 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ATTCTGATCGTGAATTGTTTGAGTGTGAAATGGGCCACCCTGATGCAAGT CTTCTTTACGGCAGCCAAAATGATCGCTATCGTCATGCTTATCATTACAG GATTCGTTCGTCTCGGTCAAGGTAGGTTTTCATTTGACTTGAAGCTTATT TACGCTCTTTACGATAGAATGCTTTCCTACTATGCTATCTGAAATCTAAT CATAAAAGTTTATAAAAGACTAACTCTTTGTCGATATTGACGTTGAAAGC CTTGGCGGAAGAAAATGAATGATCTCCATAGTTGGGAATGTGGACAGAAG CCTTTCAATGTTTGTTTTTTTTCACCACTATTTTCACTAGAATTTCAACC TTTTATGATATATGGGCGATGTTTTGGTCCATTTAGATATTGAAAGCCTG CGTGGATGGCTGGGGTAGGTATTGATAAAAAACGACCCTTGTAAAAAGAC ACTACACCTTTAAAGCTGATTCACCGTCCCTGGCTAGTCATATCACATAA TTTATTGAGGGCGAAAATAATAATTTAGTATCACTTTTCTCCACCTTGTT GTCTTTTGAACAATATATTTGACCGATTCTGTCTCTGTCTTTTTTCAGGT CATGACGAGCATTTTAAAAACGCCTTCAACGGGACAAATACCGGTATATC AGACATCGGTTACGCGTTTTACGGTGGTCTATGGGCTTACGATGGTTGGA ATAATTTGAATTACGTCACCGAAGAATTGAAAAATCCTATCCGTGATTTA CCGTTAGCCATTATGATTGGTATTCCCTTGGTAACGGGTTGCTATGTGAT GGTGAATGTAGCATATTTGACGGTGATGTCCGCTTCACAGATTGCAACTG AAAAAGCAGTAGCTGTG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:1065476..1078692-

>XLOC_005196 ID=XLOC_005196|Name=XLOC_005196|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2148bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:1065476..1078692- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGACGAATTACCGAACGGAACTTCAACTCCACCTCCTCAATCTTACAAAG
AAATCAAAAGTCCGGAACATTTAATCAACCGGAAAATCCGATCACCGGAA
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TTATCGCTTGTTATCGGTGTTATGATTGGGAGTGGAATTTTCGCGTCGCC
GTACGTCGTTTTCAGTAAAGCAGAAAGTTCGGGGATGAGTCTCATAGTTT
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AGCATTTGGTCCCTTGGTCGGCTTCTTATACAGTTGGACGGCCATTTTGA
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GTTGAAATGCATTTCCGCTGGTGGAATCGAAAATGGAAAACGATCGATTA
AACTCAAGTTCTAGTATTGATGATCTACCGGACGAATTACCGAACGGAAC
TTCAACTCCACCTCCTCAATCTTACAAAGAAATCAAAAGTCCGGAACATT
TAATCAACCGGAAAATCCGATCACCGGAATTGTATCCACGGCGTTTATCA
CATGATCCGTTCGGTGATAATTATTCCGACAGCGAAAAAGGTGACGATCA
TGACGACGAAGGTTCCGTCGTTTCCGACGTCGAACGAGCAAATATCGGTC
TTCGGCGAGAAGTCGGTTTCGCTGGATGTTTATCGCTTGTTATCGGTGTT
ATGATTGGGAGTGGAATTTTCGCGTCGCCGTACGTCGTTTTCAGTAAAGC
AGAAAGTTCGGGGATGAGTCTCATAGTTTGGGCAGGCTCCGGTGTTTTGT
GTATTTTTGCGGCTCTTTGTTACGCTGAACTTGGTACTGCTATCAAATCA
TCTGGAGGCGAGAAAACTTATTTATCAAGAGCATTTGGTCCCTTGGTCGG
CTTCTTATACAGTTGGACGGCCATTTTGATTGTCAAGCCAGCCTCGCTTG
CAGGCGTATCCATGGCATTCAGTGCATACGTTTGTGAACCGTTTTATAGA
GGGACGACAGATGGAGCACCGTCATATTTGTTGAAATGCATTTCCGCTGG
TGGAATCGCGGTGATTCTGATCGTGAATTGTTTGAGTGTGAAATGGGCCA
CCCTGATGCAAGTCTTCTTTACGGCAGCCAAAATGATCGCTATCGTCATG
CTTATCATTACAGGATTCGTTCGTCTCGGTCAAGCGGTGATTCTGATCGT
GAATTGTTTGAGTGTGAAATGGGCCACCCTGATGCAAGTCTTCTTTACGG
CAGCCAAAATGATCGCTATCGTCATGCTTATCATTACAGGATTCGTTCGT
CTCGGTCAAGGTCATGACGAGCATTTTAAAAACGCCTTCAACGGGACAAA
TACCGGTATATCAGACATCGGTTACGCGTTTTACGGTGGTCTATGGGCTT
ACGATGGTTGGAATAATTTGAATTACGTCACCGAAGAATTGAAAAATCCT
ATCCGTGATTTACCGTTAGCCATTATGATTGGTATTCCCTTGGTAACGGG
TTGCTATGTGATGGTGAATGTAGCATATTTGACGGTGATGTCCGCTTCAC
AGATTGCAACTGAAAAAGCAGTAGCTGTGGTCATGACGAGCATTTTAAAA
ACGCCTTCAACGGGACAAATACCGGTATATCAGACATCGGTTACGCGTTT
TACGGTGGTCTATGGGCTTACGATGGTTGGAATAATTTGAATTACGTCAC
CGAAGAATTGAAAAATCCTATCCGTGATTTACCGTTAGCCATTATGATTG
GTATTCCCTTGGTAACGGGTTGCTATGTGATGGTGAATGTAGCATATTTG
ACGGTGATGTCCGCTTCACAGATTGCAACTGAAAAAGCAGTAGCTGTG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005196XLOC_005196-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000098_pilongenomesc0000098_pilon:1065476..1078692 -
Properties
Property NameValue
Aaloc871-1137:268
Aaloc745-867:871
Aaloc64-741:13218