XLOC_005169 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_005169
Unique NameXLOC_005169
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000098_pilon:1038243..1047836+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_005169 ID=XLOC_005169|Name=XLOC_005169|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9594bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:1038243..1047836+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:1038243..1047836+

>XLOC_005169 ID=XLOC_005169|Name=XLOC_005169|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1272bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:1038243..1047836+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGACGATTTAAAGTTGTTTTGATAGGTGACAGTGATGTTGGTAAGTC
ATCTACTTTCATTCGATTCAGGGATGGTAAATTTGATGATTATATTCAGT
CAACAATTGGTTTGGATTTTGCAACACGAGAAGTCAGTTTTCAAGTAAAC
GAGGATGATCCTGAGACAGAAACAAAAACTGAGATGAGACGATTTAAAGT
TGTTTTGATAGGTGACAGTGATGTTGGTAAGTCATCTACTTTCATTCGAT
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CTTATGTATGACGTCACAGATACAACAACAATGAACAACTTAGAAATGTG
GTATGACAATGCAAAAAACGATTCCAATAATACAAACACTATCTATTTTC
TTGTTGGGAATAAAATTGACGAGACACCTGGTGAGATTCAGGTTTCAGAA
GGTGATGCATGTAGATTTGCTaaagaaagtttgaagattGACTCCGATAA
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ATCTGTTTCAGAAAATTACACACATCTTGTCGGGATGCTCTAAACAACCG
GCTGAGAAGTTGGACAACACAATCACAGATTTAACAGATGCAGGTAGAGA
GAAAGACAAGTGCGGTTGCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005169XLOC_005169-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000098_pilongenomesc0000098_pilon:1038243..1047836 +
Properties
Property NameValue
Aaloc184-636:9142
Aaloc1-183:1