XLOC_002639 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_002639
Unique NameXLOC_002639
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000342_pilon:56841..70242-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_002639 ID=XLOC_002639|Name=XLOC_002639|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13402bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000342_pilon:56841..70242- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CCAATAGATATATAATTCGAAATTTAAAATTATACATTACTTCCATTAAA TTCTAATTATTCGTTTTATAAATAGGTAGGTCCATTAAAGTATTGCTTGT TATTTCTTACTTAACTATCATTGCTGTCGTTTCCATTCTACCAGGGATAA GAGAGTATCAGAGGACACAATTCTCCTGCTGCATCGATTGTTGATGTTGG ATTCTTCAAAGAGGGCAACTGCTGATGATGCATTGATACAGCTACAAACT ACTGTCAGTTCCTGGTAAGATCTCCCAACATCACTTCCTTCTCCCTCTCC TTACCCACTCGAAAAATACGAATATATTGTCTCCAGGCTTCAGAAAGATT CCGTAAAACTTCATCCCCGTAAGAAAAAGACACTGACGTCTGATGGATTT TCATCCTGAAATAAAGTTTTGACAACAAAAATTATTTTGTAAAACAGGTG CCAAAAAGTTTGACAAAAAAAATATTTTGTAAAATAGGTGCCAGTTTAGA GAAAGAATCAACACTATTTTTTTTATTCTGTTACTGACTTTTTCATTACA AGATTGGAGTCTATTTTACGTTTCATTGAGATTTTTAAAGCTGGTTGCAA CACTGGAGGACGTTGATATTTTTTTCACGTATTAACAAATATTTGTTTGT GCAAAGTTATTTTTACATTGGTGTAAAAACCTCATTTTTACAGTTATTTT TTCTTATAAATAATTTTCTACTTTTTCTTTACTTTTGGCACGCGCCGTAA GCGCTCGCTTCGATGTACTTAATTTTCTTATTATTTGATTGGTAGTTTAT CACGTGACTTTTGTGACTTATTTTTATTGGCTTATTTTTCACTTATAACG GCCTCGTGTTTAGAAGGTCGCTCTCTTATTTCAGTATTTTATAGAAGATA AGGTGCATCATGAAATTTATTGAAGATATTGTTTGAAGTGACTATCCTGA 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TTGGTCTTTTTTCTAATACTGAGAAGAACGTCTGTGTCTTTTGTAAAAAG AGTCACAGCTCTGCTAAATGTCGAAAGGTCACAAATACACAGTCACGTCG GGATATTCTAATTAGAGAAAAGAGGTGTTTTGTTTGTTTGGCTCGTGGAC ATCGTTCCAATGCTTGTAGAGATAAGTACTCATGTAATAGGTGTAACAAG AGGCATCACATTTCTATTTGCGATGAAGGTAAACAAAGATCTGAAGCTGA TAATATTTCTAACAATCAGATCTCGATCTTGACCGATGCAAATAGTGAGC CTCAGTCTGAATCCAAAGCTCCTTGTAGTTGTAGTTGCAACTCTGTTCCT ACTCCTGTTTCTCAAAATTGTGCTCAAGTTTCTTCACGTAGCGTTTTGTT GCAGACTGCAACTAGTGAGATCTTTGGTTCCAGTTGTCACAACAGTGTGA AAACAAGATTGTTGTTCGACACTGGAAGCCAAAGAAGCTACATTACGACA GAGTTAAAAGACCGTTTAAAATTAAAGTGCGTGAGAAAAGAGAATGTAGT GATTAAGACTTTTGGAAATTTGAATAATGCGGAAATCAAACGTTTGGAAG TTGTTCAATTCAAAGTGAAACATCGGAAGTCTTCTAAATACGTTTTAGTT GAAGCTCTTTGTGTTCCGGACATTTGTAGCCCGATTGCAAATCAGAAGTT GGATTGTGCAAAGAAGTTGAATGAATTCTCTGATTTGGTGTTTGCAGATG TTTCCGAGGAGTTTGACTTGAGTATAGGTGTATTGGTTGGTATCGATTCT TATTTTCGCTTCTTTACTGGTAAGAGACGTGAGAGCAAAGAAGGTGTTGT GGCTTGTGAATCTTCACTTGGTTGGATTTTGAGTGGATCTGTTGTTGGAC CTACCCCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCCGTGTTCGTTAGTTA 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AACAGCCGAAAACCGGCGTAAAACGGTTTTCCTTCATTTTTTCAACTTAT ACTCGACAGATTTTCATGATTTTTTGCACAATGATGTAAAATGGCAATGC CCAAAATGTGACAGAGCCCAATTTTCGAAAAAGAAATTTTTCCGGCCGCT AGAACCGGAAATGTCCCGAAAAAAGCGGTTTTTTGAGATTTTCTCGAGAT GAATGATTGATTAAAGTGTCGATATTATTTTTCTTTCACCGTTAAACATC GATGCGTTTCTTAATTGCTTTCTCCGTTCCAATAGATATATAAATCGAAA TTTAAAATTATACATTACTTCCATTAAATTCTAATTATTCGTTTTATAAA TAGGTAGGTCCATTAAAGTATTACTTGTTTTCAAAGGTTTGACTGAAGTA ACTTATAGTCATCAAATGAGAGTTGAGGTACAAACTGTTGATGCCAAGCT CCATAAGTTTTGGCAGATAGAGGAGGCGGAGAGTGCCGAGGATAACTCAG TGATTAACCAATTTACCAAAGACATTTACCATGATGGTACTAGGTATGTC GCGAAACTGCCTTTCAAGCCCGACCACGAGAGTGTGCCTGACAACTTTTC GACCTGTGTGAAACGTCTGGAATCCCTTAATTCGCGTCTCGATCGTCTTG GTATCAATACTGACTACGAGAAAATTTTTATTGATTATGAGAAAGACGGA ATTATCGAACGTGTGCCTGAGGCGCAGATTGCCGTTCATTACATTCCCCA TAGACCAGTTATCCGCGAAGACAAGGTCACCACTAAGATAAGGCCTGTGT TTGATGCTTCTTATTCTGTCAATGGTGTATCCTTGAATGATTGCCTTTAT CCTGGTCCAAATTTACTTGCTAAGATTTTTGACATTTTACTACGTTTTAG AATGAACAAGATTGGTATTTTAGCTGATATCAAGCAAGCTTTCTTGAATA TCAGCATCCATCCTGATCATAGAGACTTTTTGAGATTTCTCTGGAGAGAC CCTTCGTCCTCTGATAGAGAAGTCGTTGTCTATCGTTTTTTGAGAGTTGT TTTTGGTTTGACGTCTAGTCCTTTTTTACTCAATGGTACGATTCGTCAAC ACATGTCGAAGTACCTCGAGTCTGACAAAGTTTTTGTTGAACAGTTTTTA TCTGATTTGTATGTCGATGACATAACCACTGGTACTGATACCGTGGAAAG TGGTAAGATTTTCTGTGAAAAAGCACTTTCTAGTATGTCTGATGCAGGAC TTCAGTTAAGGAAATGGACTTCCAATGACGCTGAACTGCAAGAATTTTTC TCATCTAAAGAACCACCGTTACAACCCAAGTGTATTGAAGATGATAGCTC TTTTGCTCAATCCCAATTTCAATCTCAGGATGAATGCAAAAGGGTACTTG GTGTTGAGTGGGACATTTCCAAAGATGTATTTGTCTTTAGGTTTGATTCG TTTCTGGAAAAGGGTCGATTGATAACCTTAACTAAGAGAACCATTTTGAG TCTTGCTGCTTCTATTTACGACCCTTTAGGAATTTTGACTCCTATCACTG CTAGAGTGAAGACTATTTTTCAGCTTGTTTGCAAAGTTAAGTGTGGTTGG GACGATAAGGTTCCACCAGACATAGCTTGTGCTTGGTATGGTTTTTTAGA CGCTTTGGAAAGTGTAAAGATTGTTGAAATTGATAGATTTGCTTTTGTTT CCTGCAACAGTGATACTTTGAGAGTTGAGTTGCATGGATTTTGTGATAGT TCTGAGATTCTTTATTGTAGTGTTATTTATTTGAGAGTGATTTCCGAGAC TGGGATCAGTGTTTTCTTTTTGACCTCGAAAAGTAAGGTTGCTCCTTTGA AAAAGGTGACGATTCCTAGACTTGAACTTCTTAGTTGTGTGTTGTTGAGT GATTTGTTGAATAATGTTAGATCTGCTCTCTCCGGTCGTATTTCTGTTGA TGCTACTCGATGTTGGTCTGATTCGAAGGTTGCCTTGTGCTGGATAAAAG GAAATAGAAAGACTTGGAAGCCTTGGGTTGAGAACCGTGTAGTGTCTGCA AGAAAGGTTGTTCAGAAGGAGGATTGGCATCACATCCCTGGAAAGGATAA TCCTGCGGATATCCCTACCAGGATGGTTCCTCAGTTTAAAGACGCTTTTT GTGAGAAATGGTTTAAAGGACCGGAGATACTCTTTGACGAAGATAAGCTT TCTTCTTTTCTTTCTAACGAATCTTCTCTTCTCGACACTGATAAGTCTGA CGTTCTTTCTGAAGCTCGAAATCGTTTTGTTGACTTTGATGGTCGTTCTT CTTATGATCCTTTTGAGTGCAAGGATGAAGTTTTGAGTAGCGTTTCTTTT CTTTTTACGACTGACAAATCTGACAATGACATCGGCCTGAGCAAAATCAT TGATGTTGGTAGATACAGCACCTTACAAAATTGATTAAAGTTACCGCACT TGTATACCGCTTCGTCTCCAACATCAAAGCTAAACGCAACAATGGTCATG TTATCAAAGATGTCATTTCATCTGAAGAACAAGAAGCTGCTCTTACCAAC TGGATCAAGGAGGAACAACGCCTAATGAAGTCCATCTCAACATATCGAAA GCTGACGAAATCACTTGGTGTCTTCGAGAAAGACGATTTATTACGTGTCC GTGGTCGTTTTGACAATGCTGATATCACCACAGACCAAAAGCATCCAATA TTGATTCGCAACGCCACCAGCCCGTTCACGAAGCTTGTCATTTGGAATTC ACACGAACTGACAAAGCATCAGGGGATTGATTCAACACTGGCCGACGTTC GAAGAAGATATTGGATTGTGCAAGGAAGAAAAGCCGTGAAGAACACCATC AGACAATGTGTCGTATGTATTCGTTTTCAAGGTAGAACATTGCGTTCACC TCCAACACCGGACTTACCCGATTTTAGGGTTGATTTTCACGAACGTTCAT TTAATTCTGTTGGCATGGATTTTGCAGGTCCCCTTTATTTTAGAAATTTT TTAGATAATGATAAAACCAATAAGGACAGTCTGAAATGTTACATTCTTCT CCTTACGTGTGCTACTTCTCGAGCAGTCCATTTAGAGTTGGTACCGGACT TGTCAAAAGAATCGTTCATCCGTGCATTCAAACGTTTCGTCGCCCGAAGG GGTACGCCTTCGCTTGTTATTAGTGACAATGCAAAAACATTCCGTTCGTC CACCGTCAAAAGATTTATGACATCGCTCAACATTAAACAACGTTTTATTC TTCCAGCTTCTCCTTGGTGGGAGGATTTTATGAGAGACTTGTGAGATCTG TTAAATCCTCACTTAAAAAGATTTTAGGACTTTCTTTCCTTACTTATGAA GAACTTGAGACCGTGTTGATTGAAATTGAAAGTTCCATCAACACACGGCC ACTAACCTACGTTAACGAGGATGATACCGAAACCATCATCACTCCTAATC ATCTTATTTTTGGAACTGACATTCATGATAATTTTTCTTTTGTTTCTGCG AACACTTTCGTTCCAGTTAAACGTCTTCGTCACTTACATAAAATTTTAGA ACATTTCCGTAACCGTTTTTCGTCGATTTATATAAATGAACTCCGTCAAT CACATATATACAGAGAGATCAACAAACCGGATAAACGTAAGCTCGTCGTC GGAGACATAGTTTTGGTCAAAGACGACACACACCTTCCGAGATCAAGATG GCCCATCGCTAAAGTTGAAGAACTTGTCAGTGGAAAAGATGGCAACATCC GCGGTGCAAAGTTATCTACCGTCACCAAGAATGGAAAACGAGGATCCATT CACCGCCCACTGGCCAAAATCATTCCTTTTGAAATCGTCGATAACCATCA ACAGACGCCTGAGACACCTGTTTCACCCACCGCTACCGAACCAGCTGAAA TGGTTGAAAACTGTGAGAAAGTAGTACATAATCGGGGGAGAACCAGTACG AGAAAGGCTGCAATCGAGGGACAGAACCTGCGAAGATTACGAAATCAATA TCTTTGAACCTTTTTCATGAATATTTCTTTCTTTGGTCGCTGAGGATGTA AAAACCTCATTTTTACAGTTATTTTTTCTTATAAATAATTTTCTACTTTT TCTTTACTTTTGGCACGCGCCGTAAGCGCTCGCTTCGATGTACTTAATTT TCTTATTATTTGATTGGTAGTTTATCACGTGACTTTTGTGACTTATTTTT ATTGGCTTATTTTTCACTTATAACGGCCTCGTGTTTAGAAGGTCGCTCTC TTATTTCAGTATTTTATAGAAGATAAGGTGCATCATGAAATTTATTGAAG ATATTGTTTGAAGTGACTATCCTGATTTTCCTGAAAGGAATTAACATAAA TTTCCGTTTTTACAATTGGATTCTAAGTACTTCATTATTCTATCTCAAAA TTTAAGTTAGCCTTCCCTTAACATTTTTAGTTTGCTCACAATCTGAATTC GATCTTGTACACTTTTTTTTCAAACACCTGGTATCTCTCTTCAGGTATTG CTCAACCGTTCTACACGATGTTCAGATTGTGCCTGATATCGATCACCAAC AAGATAAAGAAAACGCCACCAACTCAAATACTACTTCAAACGGTAACCCA TCCTCACGGAAAAGCTCTACAGAATCCATGGATAGCGTCATCTTGGTACA AACTCCAAAACATCTCAAACAACCTCACAGACATTCAACTCGATATAGTC ACCATAGACATCAACAAGAACTTCTGAGGCGAATTCAAAGTATGACTTCA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000342_pilon:56841..70242-

>XLOC_002639 ID=XLOC_002639|Name=XLOC_002639|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2910bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000342_pilon:56841..70242- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCAAGATATGAAAAAATGTCTGCTGCAAGAAATTTAAAACGTAAAATCTC
AGTGGCTACAAATGGCGAGTTCAACGATGAATCAACAAAAATTAAAAAAG
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TGTATCAAGAATCGACTGTCCCTTAAGTGTGCTGGTCCATACGTATTGGG
GCCATCTCTTGGTCGTTCACCAGTTAAAAGTATTGTTCAATGTTTAGCAA
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GGGGCTTCATGAGGCAAGATATGAAAAAATGTCTGCTGCAAGAAATTTAA
AACGTAAAATCTCAGTGGCTACAAATGGCGAGTTCAACGATGAATCAACA
AAAATTAAAAAAGCTAAAAAGAGCTCTACACCATCGTCAAAAAATGAAGA
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CATACGTATTGGGGCCATCTCTTGGTCGTTCACCAGTTAAAAGTATTGTT
CAATGTTTAGCAAGAAAGATGAGTACTGACAATTTCTTCACCATAAAATT
ACTAACTCTAACCAATTCTAAGGAATCAATGAATGATGTTAAGCAGGGTA
AAATGTTGATACACACTGAGTATTCGTTGTTATCTTTACTTCATAAGCAA
GAAGGTGTTATACACACTCATGGACTGTTTCAAGATGAGGTTATACCAGA
GGATACATCAGATAAAGCCATCACCAGTGAAGAACAAGAAACTCGTTTTA
AAAAATGCAGACGGTTATGTCTTGTTTTAGATTGCCTTGAGCCTCACAAT
TATTGTCAATCTACACAAGATTTCGAGAATTTGCAATCGTATGTTATTAA
AGAGAAGAAATTGTGTGAGAGGAAAGCTTTGGTTGTTTTCTTGGATATTA
TCAAAGTTGTTAAGGGGCTTCATGAGAAAAATATTGTTCACAGAGATCTC
AAGCTAGGAAATATTGTTTTAAACAAACGAAAAATATTGTTCACAGAGAT
CTCAAGCTAGGAAATATTGTTTTAAACAAACGAACAAGACGGATTACTAT
TACTAATTTTTGTTTGGGCAAACATTTAGTCAGAGGTGATGATTTGTTGA
ATGACCAGAGAGGGAGCCCTGCATATATAAGTCCTGACGTCCTTAGTGAA
CAAGACGGATTACTATTACTAATTTTTGTTTGGGCAAACATTTAGTCAGA
GGTGATGATTTGTTGAATGACCAGAGAGGGAGCCCTGCATATATAAGTCC
TGACGTCCTTAGTGGTCGTCCATACTCAGGCAAAGCATCAGACATGTGGG
CGCTGGGCGTTGTTCTATACACCATGCTGTACGGACAATTCCCATTCTAC
GATAGTGTACCACAGGAGTTATTTCGTAAGATCAAGACTGCTGAATACGT
TATTCCAAAGTCGTCCATACTCAGGCAAAGCATCAGACATGTGGGCGCTG
GGCGTTGTTCTATACACCATGCTGTACGGACAATTCCCATTCTACGATAG
TGTACCACAGGAGTTATTTCGTAAGATCAAGACTGCTGAATACGTTATTC
CAAAGGATAAGAGAGTATCAGAGGACACAATTCTCCTGCTGCATCGATTG
TTGATGTTGGATTCTTCAAAGAGGGCAACTGCTGATGATGCATTGATACA
GCTACAAACTACTGTCAGTTCCTGGGATAAGAGAGTATCAGAGGACACAA
TTCTCCTGCTGCATCGATTGTTGATGTTGGATTCTTCAAAGAGGGCAACT
GCTGATGATGCATTGATACAGCTACAAACTACTGTCAGTTCCTGGTATTG
CTCAACCGTTCTACACGATGTTCAGATTGTGCCTGATATCGATCACCAAC
AAGATAAAGAAAACGCCACCAACTCAAATACTACTTCAAACGGTAACCCA
TCCTCACGGAAAAGCTCTACAGAATCCATGGATAGCGTCATCTTGGTACA
AACTCCAAAACATCTCAAACAACCTCACAGACATTCAACTCGATATAGTC
ACCATAGACATCAACAAGAACTTCTGAGGCGAATTCAAAGTATGACTTCA
CCTCCACCCACATTGAGACGTGTTAGTCGTAGCACTCCTTCACTTACGGA
AAGTGATTTAGAAGCATACGCTAGAGGGATTCGATCAATTGTTCCACTAT
AAGTATTGCTCAACCGTTCTACACGATGTTCAGATTGTGCCTGATATCGA
TCACCAACAAGATAAAGAAAACGCCACCAACTCAAATACTACTTCAAACG
GTAACCCATCCTCACGGAAAAGCTCTACAGAATCCATGGATAGCGTCATC
TTGGTACAAACTCCAAAACATCTCAAACAACCTCACAGACATTCAACTCG
ATATAGTCACCATAGACATCAACAAGAACTTCTGAGGCGAATTCAAAGTA
TGACTTCACCTCCACCCACATTGAGACGTGTTAGTCGTAGCACTCCTTCA
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TCCACTATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_002639XLOC_002639-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000342_pilongenomesc0000342_pilon:56841..70242 -
Properties
Property NameValue
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