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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000049_pilon:341215..342755+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_002234 ID=XLOC_002234|Name=XLOC_002234|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1541bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:341215..342755+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGCTTGAATTAGCCTACCAGTTTGGCTCCCAGAGGATCAAATTTAT
TGAAGCAATATCTCACTCACACGGTGGTAAAAAGTAGCTATATTTTGCCC
ACATAGACTAAGCCTGTGACGTCACACAGCGAATTATGTTTAGGTTTACA
GAGCCTTGTAGAATCATCAAAATGCCTTCAAACTTGGTACGTAACTTCAA
Aataatataagaaaaatttttgtcttgaaaatttttagatttcccgattt
cccgattttcaaaaacggAAAACCCTcatttttacccccgtctttggtaA
AAAATCCGACCTAGCAGAAAATTACAGGCCTTAATTCCCTAAGTCTTAAG
AtagaaaatttccttttaacCATAACTTCCTTCATGTCAGTTTTCAGCTT
TTAAGTATATCGGGAACATACAGTTTAAACTCTGCAATTCGtttttttAC
CATATATGGTCATACCTTTAATTCTAAATTTCTTGAGTTAATCAAAAGCT
GAAAttaaaagtgaccccatttttaaGCACTACTCGTCAAGATCTATCGT
TTGGAAATGTTGCTTTAAGCATAATATTAACTTTaaattttcgtttaaat
tttgatgacgtatttttcggtcacgtgatgacttttttttcaaaaatttt
tttgattttttttggaaaatagtttgaaaaatatttagggcaaaaaaaat
tattctaaggCTATAAGAATGATAAAGAACAGGATAATGGATTTAAGTAA
TTAAGTAAGTGGTAATAAAAAAGCCTATTTTGACCACCGTGTCATGTCGA
ACACTCCAGTATATTTTCACAAGTAATGACGATATTGCATTGGCCACTTG
GATGTTCCGTGGTGAGCGTGAAGCATTGTCGAAACTTCTAATCGATTTTC
TCAAGTTTTATTCAGAATACGAATTTCTATTGTCAAACTGCCCAGAAGAT
GATGTCTACggtaagaatttaattgcaaacgCCTTCAAACTCTTGGACTT
TGCTCCAGATTACTTAAAGGATCGTCGCTTTGTCACACCAGTCTTGGAAG
AGTTTCCATTGAAAGAAGTGAGCGTTGTCTCACCCCCGAATGTGCAAGAA
GTTGCATACATTTGTGATAAAGTGTCGATTGCTTCTGTTGAAAAATGCAA
AGTCAAGTTTGTTCGATTTAATTGTACCTATTTGGAACTAAGTTACTCTA
CCGTACCACATGAAGAATCAGCGCTTTTTGAAAAACCGAAGAAATTTACT
GTTGTTGACAAGAGACCGAATTATAATATTCTACCGACTCGTTTGAGCAA
TGAACCAGACTCTGTTGTCCCTGATCTTAATGTTCTGCATCCAATTCACC
AGACCTTCACACCGTCCGAAGCTAGGCCACATGAATTACGTTATGTTGAA
TTTGAATTGAGGGATTACTCGCTATCAAGACTTGTATACAACAGAAAAtt
tctgagattgttttggatgtacttttcgtttcttgatttttgttttgatg
ttttgcttgttggtctaatgttgtactttttgattgttctg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000049_pilon:341215..342755+ >XLOC_002234 ID=XLOC_002234|Name=XLOC_002234|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1632bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:341215..342755+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGCTTGAATTAGCCTACCAGTTTGGCTCCCAGAGGATCAAATTTAT
TGAAGCAATATCTCACTCACACGGTGATGTCGCTTGAATTAGCCTACCAG
TTTGGCTCCCAGAGGATCAAATTTATTGAAGCAATATCTCACTCACACGG
TGCACTCCAGTATATTTTCACAAGTAATGACGATATTGCATTGGCCACTT
GGATGTTCCGTGGTGAGCGTGAAGCATTGTCGAAACTTCTAATCGATTTT
CTCAAGTTTTATTCAGAATACGAATTTCTATTGTCAAACTGCCCAGAAGA
TGATGTCTACggtaagaatttaattgcaaacgCCTTCAAACTCTTGGACT
TTGCTCCAGATTACTTAAAGGATCGTCGCTTTGTCACACCAGTCTTGGAA
GAGTTTCCATTGAAAGAAGTGAGCGTTGTCTCACCCCCGAATGTGCAAGA
AGTTGCATACATTTGTGATAAAGTGTCGATTGCTTCTGTTGAAAAATGCA
AAGTCAAGTTTGTTCGATTTAATTGTACCTATTTGGAACTAAGTTACTCT
ACCGTACCACATGAAGAATCAGCGCTTTTTGAAAAACCGAAGAAATTTAC
TGTTGTTGACAAGAGACCGAATTATAATATTCTACCGACTCGTTTGAGCA
ATGAACCAGACTCTGTTGTCCCTGATCTTAATGTTCTGCATCCAATTCAC
CAGACCTTCACACCGTCCGAAGCTAGGCCACATGAATTACGTTATGTTGA
ATTTGAATTGAGGGATTACTCGCTATCAAGACTTGTATACAACAGAAAAt
ttctgagattgttttggatgtacttttcgtttcttgatttttgttttgat
gttttgcttgttggtctaatgttgtactttttgattgttctgCACTCCAG
TATATTTTCACAAGTAATGACGATATTGCATTGGCCACTTGGATGTTCCG
TGGTGAGCGTGAAGCATTGTCGAAACTTCTAATCGATTTTCTCAAGTTTT
ATTCAGAATACGAATTTCTATTGTCAAACTGCCCAGAAGATGATGTCTAC
ggtaagaatttaattgcaaacgCCTTCAAACTCTTGGACTTTGCTCCAGA
TTACTTAAAGGATCGTCGCTTTGTCACACCAGTCTTGGAAGAGTTTCCAT
TGAAAGAAGTGAGCGTTGTCTCACCCCCGAATGTGCAAGAAGTTGCATAC
ATTTGTGATAAAGTGTCGATTGCTTCTGTTGAAAAATGCAAAGTCAAGTT
TGTTCGATTTAATTGTACCTATTTGGAACTAAGTTACTCTACCGTACCAC
ATGAAGAATCAGCGCTTTTTGAAAAACCGAAGAAATTTACTGTTGTTGAC
AAGAGACCGAATTATAATATTCTACCGACTCGTTTGAGCAATGAACCAGA
CTCTGTTGTCCCTGATCTTAATGTTCTGCATCCAATTCACCAGACCTTCA
CACCGTCCGAAGCTAGGCCACATGAATTACGTTATGTTGAATTTGAATTG
AGGGATTACTCGCTATCAAGACTTGTATACAACAGAAAAtttctgagatt
gttttggatgtacttttcgtttcttgatttttgttttgatgttttgcttg
ttggtctaatgttgtactttttgattgttctg
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000049_pilon | genome | sc0000049_pilon:341215..342755 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 682-798:1425 |
| Aaloc | 631-681:1359 |
| Aaloc | 79-630:804 |
| Aaloc | 1-75:1 |
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