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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000254_pilon:407307..414933- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_002112 ID=XLOC_002112|Name=XLOC_002112|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7627bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000254_pilon:407307..414933- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATTTGATAACTCTGGTACAAGGATGTGCAATGGTCTTCACTTTTGG
ATTCTTCTTTTCGGGAAGGTATACATATTTTAAATTTTTCTGATTTTTAT
GATTTTCATAAGACAGTTGACGCTCTCTTATTGGACGTTCTACTATTCGA
TAAGCTCCTTTATTCGAGGAAATTTAAAGTCCCCGTCAACAGAAACTCTC
CTAAACGACCTTCCCTTATTCGATAAGCTCCCTTATTTGATGAAAATTCT
TCTTGAAGATCGAATTAGAGAGCGTCAACTTTATTATGCATTACAGTAGA
AATTTCGGTGAAAAGAAAATTTTGCTGATTTGTAGTTTTTAGGTTCCTCC
GTTTTTCTTGCGACATCTGCCGAAAAATTCCGGCCAAATTTAATTTATTC
GTTTCATTTCAGGTAAAAAAATTTAAATTTAACTTTATTTTGCGTTTCAG
ATTCTTATGATTTCATGATATTTTTACACCGCTCATGGTTTTAAGAGTTA
GTTTATAGGTCATATATTCAAAAAAGAAAATACCTATGGGAGACCTTTTA
TATTTATGTACCAGAACCAACTTACAGTAGAAGGTCTGTTTTACGATTTT
CAAAATCTGCGTAGGGGAAACTTTTCCCATATAGCATATAAATATCTAGA
GGGTCTTTCGCGGAGTTTATTTTTCTCATTATAGTCAACAGCCTGGTTCC
GGACATTTGTGCCCGGACATTTGTGGCGCAGGCGATAAGCATTATAATCA
TATCACATTTTGAATTGTTTCTCGTTTATTTTCAGCGCAGCTGTATTGAA
AGTCCACCAACAAAAATCTGTTAAAAATGTCAATTTTTTGCCATATCTTG
CTGCTACTCTGAAGTGAGTTTTGGTATAATACTTTTTTTTTGTTTCTTGT
CCCATTCTGTGTTTCCCTCATAGATTTATAAAGCCCGAAGGGCTAGATGT
CATGTTTTAAGCTCTTCCATGCAAAAAAGGTGAATATCACAAAAAAAATA
TTGCTTTTGTTTTCGAAAACCCGCGAAGTATCTTATTGGTCAAGCGCTGA
AATTCTATTGTTATTATCACATGACCTAGGTAAGATTTCCTACCTAACCT
TGGCACACTTTTCAGCGAAAGCACGACATCTAACCCTTCGAGCTTTATAT
AAATCTATGGTTTCCTTTGATTTGGCCGTCATCTAGTTCTTCACGAGAAA
CCTTTGCATATTTTACTACAGTAGACACTCTGTTTTTCGAAATCACATCT
TCAGAATTCGAAAATCTCGTTTCCTACAATGGATCACGCTTAGCGAGTTT
AGGTCTGCTGTTTTTACTGTAACGGAGAAGGTTAGCTTTTGTTTTGTCTA
GGTCAGAGGACAGAGACGGCGGTAATTCAACACTTTAACCGTCCTTGATT
TTGCAAGTCAAAATTTAGGGCTGTCCCAAATCGTAACCGTCTAAATGTTA
TGTTCGCTCCGTTGTCTTAAAAAAGGGAGATACATAAGCCCGCTAATAAT
AAGCCCGCTAATAATAGGGAAAAGGAAGAAACATGTGATTCTTAGGGAAC
ATCGAATAAATTGAAATTTCAATTTTTATACAATAATTTATATACAATAT
ACAGACAGATTATAGATAGGTTTCAAGATGTCTTTCGATTTTTTTGTTTC
TACTAGTTGTTGTTTATGGACGATCTATGGTCATTTGAAGGGCGATTGGT
TATTGATATTGGTCAACGCAGTGGGATGTATATTGCAAGCGATTTACATT
TTCATCTTCATGCAGAATTGTGATAATAAGGTAAGGTATCTTTTGGGTCA
GTCTGGGGGTTTTTATAAGACACAAATACTCTGAATTTTACAGAACAGCA
AGAAAAGCATTTACTTACTCACCTCAAAATTTATTTAAACAAAACACTTT
GGTTTGGCAAAAATAAGGAAGAACTACACAGGAAGAAATCTTTAGCCGAC
GTTGTAAAAACTCCAGATCATCTGTATCTTTTGCTCAACGCTCAACTCTC
TTGAATAATTTGATTTTCCAGGTACCACAAATTTTACTCCCTCTAAAACC
ATAACCCCTAAAAAGAAACAAAACTGCTCAACTACGTGCGTCGCGTTACG
TCAGGGTTCGAAATAACGGTCGGACATCGGACATTGTCCGACCCAAATAG
CTTCATGTCCGACCCAAAAATCATAATTTTCAAGCTGAAGCAACCCTGAT
CGGACATTTTATCCGACCCACTTGAAATCGTTATCGTTATCGTTACGTTC
ACTAGCACGTTCAAATCACCATGATTCGTTTTGATAATGTATTGATTTCG
CAAGGTCAACATTTTCAACAGGCTTCGATTTAAATATCGTTGACCTGGCT
TCAACCTAACTTTCTCTCTGGGACCAAAAAAACCGTCCCAGTAAGGCAAA
CATTAAATTCATAGAAAATAGAATTAATTAACTACTGTAAAAGTATAAAT
CTTTGTAAAAATGGTCTTTCACCGTTTTATGGACATTTCATATGCTTCTT
ATTTTTCTCCTACCAAAAAGAGATTTGTCGTACACCTCATCAAAAAATTA
CACTCGTGGTTGTGTATGATACCACCCCTCGAGCGTTTCCTTTTGACTAT
AACAGTCGGCCAATCAAAACCATGTGCGAAAGCCCAATTAACACATACAA
TACCACCCTGTAGAAGAATTTCATACGGATCGGCACCACTACTTCTTTGT
GCACCTCCTTGTAAAAGAACTTCGTACGGACCGACGCTCAATACACGCTG
AGCCCATTCGTCATCTTTATTTTTGTCATAAACTGAATATTTTTTACTTA
AAATACCCTCGATAACTAATATTCCACCAGTCGTCAGCTCTCTAGCTTTG
TCCAATGCTTGGACTACTGTACTGCAATAAATTGGGTGGCACCCACGTGG
AAAGTTGGGCGGTGGCGTTGTCAATGCATCAGCATAGGGGAATTTTTTTT
CATTTGCGATTTTTTGGGCTTCTAAGACAATTTCTTTGCTATTTCTTAAG
TTTAGTGTGAGATTTATTGTTGTATATGCACTTATGTTTATAAACTGTTG
GCGGATGGAAGCAGCTGAGGCAATCCAAATTACTTCAATTGAAGCGGGGA
GCTCAATTTCTTCCTCGATAGGCCATTCGTCCAAGAAAAGTGCTTTGATT
CCTCTTGAAAGTACTTGTCGTACTCGCAAACTTTCTTCCTATATTGAAAA
TAAAATACCGTATTACTTCGAAAATTTTTAGATTTTTAGGAGGGGTGTTT
ATTCGAGGGAGCGTTTAAAAGAAGGAGGCGTTTATTGAATAATTTAGAAC
CGAGTATAAACTGGAAACTTATTTTGCCTTTTCATCATGATTTAGTACAA
ATATGTCAATTTTAGGGATATAGAAACAGGTCAAAACCAGATCGAGTTCT
CAAACATAGAGTTTACAAAAATCATGGCGAGAATCCAAATTCAGTATGAC
TTACTGTTGATGCTATTATTCCAATGCCGTGTTTTTGTAAGTCGTACTTC
AGTCGTCTTTCCAGTAAGCCTGCTAGTTGTGGCCCATTATTTTTATGAAC
CGCATACATAATGTTTCCCTGAAACTTCGGGTCATTGCTCAGTAACAGAG
CTTTTTGTTGGAGAAGAAAACTTTTGCCTGTACCGTAACCACCCTTTATT
ATGACTTTTCGGTATCGAGGCTCGTCGCTAATAAGCGCTGGTAGTTGTTC
CTTGGAATGGAACAGAATGGTATGACTGGTACATACTGAATCGATAGCTT
CACTGATGTATTCTACCCAATTTGTGGTTGTGATTGGTGCTATTTGACCC
TTCTTTGACACGTGTATAGCGAACACAATCAATCTTAAGACGTTTTTGAG
TTGATATATTGGAGGTAATAATGGTGTAATTTCGAAATGGTAAATAGGAA
AGTGCCTAAAGATGGACTCTAACCATGATTGCAAATCAGTTTTAGTGCTG
ATATAGTGTAAGCTTTCAAACATAAGTTCCTCCACGCCGACACATATTAC
AGGGAAAAACGTCCAACCTTCACCGAACTGATCACCCAGTCTTTCTTCGA
ATAAACTGTGGTATTTTTCTAGTTGGTCAAATGCCTTATCAGTGAGTTGT
CGTTTCATTTCAATCCCGATGACGAGTTTCCTGGACCAAGAGAAAATGAC
AAGATCAAACTCTTGGTGCATCTTCTTTTTGACGTTGGTTAGAAAACAGA
CTGATTGAAGAATCACTGTATCGTTCAGGATGCTTTCTCTATTCATGGAT
TCAAGTCGGTCGAAAATTTTATGCTCGATCTCTTCGCCTCGTTCGGGAAG
CTTTAATTCAAAAAACCATCTCATGTTTGAATCTTCAGGTGGGTTTTGTT
GAATCAGCTCTTCAACTTCTCGATTTAGATACGATCTACCATTTTTGTTT
TTGTTTTGTAATTTCTGAAGACAAGTCTGAAGCTTAGTTTCGAGCTCAGA
TCCTGGTGATTCTTTTGCCAACTCAGAAATACAGTTCTGAATGAAAACAT
CCGTCTTTGAAATTGTCGAAAAATTTATTTTCTTTAATCTCAATTTTTTG
GCATGTATAGACATAATTTTTGCATTCAGTACCCATTGGTTGAAAGCTTT
GGCGTTTATATCTTTAATATTATCCTTTGAAAGTTTTTCCAACTGAAGAA
ATTGCTGCAACTCTGCCGTGAACCAATTTTCTTTCGACTCCTTAAGCATA
TTATCCAGTGTTTCGAGAATCAGCTTTTCAATGTCATAATCTAGAAGTGG
CAGAGATGATTTTTTGGTGTATTGATTGGATCGGAAAACTGGTGGTATAA
ACACTGGCTCGTGCCGTGATTGGTTGAAAATTGACGATTTTCCATACTCT
CGTTCAAGCAAGTAGTCGGCAGCTTGAATTGGATCGGTGAATGTTTGGCC
ATTACCAAGGTTGAATTGTTTAGCTTGCTGCTTCAAAGTTTTTGATGAAT
CCCTCGAAACCTGTTGATGCAATGATTTTTGTACTGTACATTTTGTATAA
TCAATATCTCTTGGTTTTAATGTTAACAATTTCTGTCTAAGATCGCAAGT
CATCCTTTTTGCAACAAGATTTCTTCTCAACTTGAATCTTGATAGTGTTT
TTTTTCAATTCGGATAGTTTTCATATCATTAAAACTATGGTAATATAATG
TTTTATTCATCATTTTTTAGGTTTTCATTACATTGTTTCAGTTCGTGGTT
TGTTTTCATATGTCTATACCCTTTGATGAATTTTTTATATACAATCAATA
TACACTTATTTTTTATAAGCATGTCCAGGCATAAATCTCGAAAAAATTTA
AGTGGGCCTCAGTTTGCGAAATTTCAAAATTTGAATTTAAGATTTGCTAA
AATACTCTATGAAAATCGAAGTTAGAGCCCCAAAAATATTTCTTTATTTT
CCATGGACCAAGCTCTATCCACCTTCTTTGATTGGAGCTTTTAGAAAAAG
GTGGTACCCTAATGGTAGCACGACTGGATGATGGTCAATTTGTAATTCAA
TCAAATTTTCCGCTTAAAATTTTTTAAACATCGTTGAGGAGCGCTACCAT
TAGGGTTACCACTTTCAAAATCTCTGGTTGAAGACTTTGCTTGGTCGGGA
TCGAGAAACTGTGACAGGCTATATAAAGGTCAGTTAGGGGAACTGGTGTT
TTAATCTCATATTCTCGCATTAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTATTTTTTG
GAAAATTGAGTTATGACCATACTGATGCTTTACGCCTCATTTTTATCGAT
TTTTTGACTTTTAAAAATCCATCAAAAACCAACCTAAAGTGGTCTAATTT
TAAGCTAAAAAAAAGCCTAAAAAGTCTAACGTGGAAGTAATTTTGGACTT
TTCAGCCATACTATCTCAAGAAGGTGTTTGTTTTACTGACAACATGTTTG
GGTGCATTATCATTCGCTTACCTGGGTACAGATCTCTTCGATGTCGTGCG
GTCGCTTGGTTTGTTCGCTAGCACTGTTACCGTTCTTATGTTCGGCTCAC
CATTATCTGTTCTAGTAAGTATCTGCAATACCTTATCGGCCAAAACTTAG
TCGGCCCAAGTGACCAAATTTTGGCTTGGTGACTAAAATTAGGGCAGACT
AAAAATTTGGCCCGAATAAAATTTGGGCCGACTAAAAATTTGGAAATGGC
CAAACCTTAGTTATTAGTCGGCCCTTTGTGACTAAATTTTGACGAGGTGA
CTAAAATTAGGGCCGACTAAAAATTTGGAAATGGCCAAAACTTAGTTATT
AGTCGGCCTTTAGTGACTAAATTTTGACGAGGTGACTAAAATTAGGGCCG
ACTAAGTTTTGGCCGATAGGTTACATAACAATGGGACTGGGTTCGAGTTA
AAATATTATCTTGTTCTTGGATCTATGAGCACGCTATGATGGTATTATTC
CAGACTTTAGATGCCCTTTCATCTTCTGATAAACTTATATAAGAGGATAA
CTCTTTGGCGAAGAAATTGAGAAAAATCTTTTGATTAAAATTGTCCTATA
TATGTTAAATGTGGTCCAATAAAATTAGTAATAGGAGCATTTAGAATTTC
CACCAATATGGAAGCAAACGTTCGATTTGCGTAAGGGATTGTCTTACAGA
TACGAACATTCGCTTCCATAATGGCGGAAATTACGTTACTTAAACGAAAG
AGAGAGAGAGTTCTCTGCACCTGAATTTAAATCGTCACTTTATCACTTTC
GTTTTCAGCGTGTTGTCATAGCAACGAAGAGTTCCGAACAAATTTCTTTT
CCTTTATCTCTAATGACCGTTTGTAATTGTTTTTCCTGGCTTGTGTATGG
TTATCTTATCAAAGACAGCTATGTACAGGTTTGTGTGGTGTTCTTTTTAT
GAAAATCTTCGTGTTTGGACCAGCGAATAATTCTCAATTTGAATAGTGAC
TGGTTCCCTTAAATGGGCACGTTCTAAGCCCATTTCTAAAGTAACGGTAT
TTTACCCTTGATTAAGTTTCCCTTAATTTCGACGTGATGTCATGTGTTTT
AAGGTCTGTTTCCATCGATCGCGCGACCGTGCACGCCAGGGCAAAATTTC
CTAAAATAACCTATCGACGTCACAAATTCAATTTTCTTGTACTCAAAAAG
TGTACGCTCTTGTACGCTTTTGTGCTCTTTTCTACGCTGAAAATTTTCAA
ATTTTTTGAGCGTACAGGAGCGCACATCTCAATTGATAATTTTTCAACCA
ATCAAGAAAGAGAAAAACTGCTGAGTAAACAAAAAAATGTAAACATACAG
ATTATGTATGTTTTTGATGGAAATCAAACATTGATCGCGCGGAGTGTGCG
GCCAAATCTATTTTAAGAATTTTGGCCTAGCGTGCACGCTCGCGTGATCG
ATGGAAACAGGCCTTTAATAGATAATTAATTACGCTTTTATATCGTTTGG
GATGTTCGGAGGTTTCACATTATGTACGTAATGTTATGCACCCCCTTTTC
TGGGATTGTTGTAACTTCTTTTAACAAATCTATCTTCTCATTTTGCTTAC
TTTTTTATTTTCCCTTCTTTTCTAGGTACCCAATTTCTTTGGGCTTGTTC
TAGGTATTATCCAAGTCCTAACGATATACCAATATCCAAACAAAACAAGC
CGTGTGGGTTTAACGTCTCAAGTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000254_pilon:407307..414933- >XLOC_002112 ID=XLOC_002112|Name=XLOC_002112|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1302bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000254_pilon:407307..414933- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATTTGATAACTCTGGTACAAGGATGTGCAATGGTCTTCACTTTTGG
ATTCTTCTTTTCGGGAAGATGGATTTGATAACTCTGGTACAAGGATGTGC
AATGGTCTTCACTTTTGGATTCTTCTTTTCGGGAAGCGCAGCTGTATTGA
AAGTCCACCAACAAAAATCTGTTAAAAATGTCAATTTTTTGCCATATCTT
GCTGCTACTCTGAACGCAGCTGTATTGAAAGTCCACCAACAAAAATCTGT
TAAAAATGTCAATTTTTTGCCATATCTTGCTGCTACTCTGAATTGTTGTT
TATGGACGATCTATGGTCATTTGAAGGGCGATTGGTTATTGATATTGGTC
AACGCAGTGGGATGTATATTGCAAGCGATTTACATTTTCATCTTCATGCA
GAATTGTGATAATAAGTTGTTGTTTATGGACGATCTATGGTCATTTGAAG
GGCGATTGGTTATTGATATTGGTCAACGCAGTGGGATGTATATTGCAAGC
GATTTACATTTTCATCTTCATGCAGAATTGTGATAATAAGCCATACTATC
TCAAGAAGGTGTTTGTTTTACTGACAACATGTTTGGGTGCATTATCATTC
GCTTACCTGGGTACAGATCTCTTCGATGTCGTGCGGTCGCTTGGTTTGTT
CGCTAGCACTGTTACCGTTCTTATGTTCGGCTCACCATTATCTGTTCTAC
CATACTATCTCAAGAAGGTGTTTGTTTTACTGACAACATGTTTGGGTGCA
TTATCATTCGCTTACCTGGGTACAGATCTCTTCGATGTCGTGCGGTCGCT
TGGTTTGTTCGCTAGCACTGTTACCGTTCTTATGTTCGGCTCACCATTAT
CTGTTCTACGTGTTGTCATAGCAACGAAGAGTTCCGAACAAATTTCTTTT
CCTTTATCTCTAATGACCGTTTGTAATTGTTTTTCCTGGCTTGTGTATGG
TTATCTTATCAAAGACAGCTATGTACAGCGTGTTGTCATAGCAACGAAGA
GTTCCGAACAAATTTCTTTTCCTTTATCTCTAATGACCGTTTGTAATTGT
TTTTCCTGGCTTGTGTATGGTTATCTTATCAAAGACAGCTATGTACAGGT
ACCCAATTTCTTTGGGCTTGTTCTAGGTATTATCCAAGTCCTAACGATAT
ACCAATATCCAAACAAAACAAGCCGTGTGGGTTTAACGTCTCAAGTGTAA
GTACCCAATTTCTTTGGGCTTGTTCTAGGTATTATCCAAGTCCTAACGAT
ATACCAATATCCAAACAAAACAAGCCGTGTGGGTTTAACGTCTCAAGTGT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000254_pilon | genome | sc0000254_pilon:407307..414933 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 550-651:103 |
| Aaloc | 430-549:920 |
| Aaloc | 271-429:1773 |
| Aaloc | 148-270:5971 |
| Aaloc | 70-144:6842 |
| Aaloc | 1-66:7628 |
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