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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000254_pilon:369258..375806- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_002110 ID=XLOC_002110|Name=XLOC_002110|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6549bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000254_pilon:369258..375806- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACCGTATGGGAAGCGGATTACCAACTAGCTGAACAAGAAGAATTACA
ATTGTTCTGGGAATATCAGGAAGTCGGTAAGTTCAGACAGTCAACTTATT
TTCACTTAATTTACCCAAAATCCATCAGGGCTCACGCCACCGGCGGGGGC
CATGTCCTCCACTTTTTTGCGAAGTATTAATTTTTTTGGTTGCGCCTCCT
TAGACTATTCATTGCCCACCCCTCCACCCACTCAATTTCATGGCGTGGAC
CCTGTCCATCTATCTTTGTATCCTATGTTACCAGTAGAAATTAATTGTGA
TGCAATCTAAAAACGACACCATTTTCGTTATCTTATTGCATGATTTTTCA
GATAAAACAGTCTAAATTTATTTTAAAAACTCTTTTAAGTTGCATTTTGC
CCTACAATAATTTTTGTTAAGAGAGACCTCTCATCTGAGACAAAATTCTT
TCAAATGCTAACAAATGTGTCAAGGGAGTGATTTATAGTCTACTTAGAGT
GATATCCGTGCCTTGTCTTACACGTTTTTTAAAAGAAAAATTTCATAAGA
AAACGAGGCTGAAATTTGGCCAAAACCTAAGAACAAATTAAGAAGAATCT
GAACCTCAGATTTCAGAAATTACTGAAAAGTACATGTTTCCATTTTAATC
AATATTGACATTTAAGGCTGAAAAACTCATATAAATTTAAGAACAGCCCA
GCCAGAATCATATGACTTACTCTTAGGGTATGCGGGATGTCAGTTAGCCA
TCCTCAAGGATGGCTTCCTCTGGGAAGCCTGGCGCCCTTGCCCTGCAAAG
CCATTATAGATCTATCGATCGTTTAAAAGTTTTGCTAGACAGACAGTTCC
ATCATTTCCACTTCTGTTGTGAGAGTCTCTTTTTCTTTTTTTACTTCATT
GTAGTTTTACTGGATTATTTAGGAAACTTATTTTGAATTGAAAATTTTCT
AGAGACGACTTTAATCACTTCAGTGTTGAAAATTGTCAAATGCAAAAAGC
TACTTGAATATGTTTTTCTCTCTAAAACTTGCATACAACCGAATTTTAAC
TGTATATAAACCGCGAATTTTAGTATATATAACCTGTATCATATTTTAAG
AATTTTATTTTTACTTTTCATTCCATCTCTTCGGAGAACTAGGTGTAGTT
GGAGCATCTTATAGCCCGGTTACGGCAATCCAAATAGGAAAAGGAAAATT
CTGATATAAAACCACCCCTGTACAGGTTGGCGTCTTGCAGGGTTCTCTTA
TGCCTCATGGGGTGATTGACCTCTTTAGACACTTGTTACTGTCATTCTCT
CTAGGGTGTATCCAGTGGCGTGGAGCATTCGAAACAAAAAGCTATCGAAA
GAAATAATCATGACTTCTCTAAACAGCACCAGGGTTCAAGCCCCTGCTTT
TCCGGTTCTACAACCTAACCTTGTTTCTTCAGAAACTGATGAACCTCCTT
CTCCAAACTCATCTGAGCGAGAAGGCGGTGATAGGATAGAGTCTGGAACC
AAAAATAATAACCGCAAACTTCTTAGATGTAAACACTCTACGATTTTTAG
CACTTTTAACGCGCGTACTCTTACTTTAACTAGTCGCAAACAGGAACTAC
TCTCCTGTTTTTCCAAATGCAATATTGATATACTTAGTCTCCAAGAACAT
AGAACATTACATCCTGAGGTTAACTTTCAACATACTAATATTGGTAAAAA
TAAACTTATAACATCCTCTGCTTGGAAAAACTCTCAGGGTTCGACCATAG
GGGGCATAGGTTTACTACTCTCTCCTAAGGCAGCGAACAACCTAATTTCA
CTTTCAAAAGTATCAAGCCGTATTATTGTCGCCGAATTTAATAGCAATCC
GAAAACAACATTCATTTCTTGCTATAGCCCCACCAACGTTTCTGATGAAT
CTGAAGTTGATGAATTCTACTCTTCTCTTTCTAGGGCTGTCCTTAACACC
CCTGCCCACAACTTCTTGGTGATATCTGGTGATTTTAATGCTCAGCTTGG
CCTAGACAACGTTAAGTTCTCTTTCCACCCATTAACTAATCGGAACGGTA
ACAAACTCTTTGACTTCATGCAACAGTTTCAATTACTAGCAACAAATACA
ATGTTTATGAAAAAGGCTTCCAAACTCTGGTCATTCCAACACCCTTCAGG
AAGCCTCTCTCAGTTAGATTATGTGATTGTAAGAAACAAATGGAGGAACA
GTGTTCGCAATGCTCAGTCCTATTCTTCTTTTTCTTCTGTTGGTTCTGAC
CACAGAATTGTTTCCTGTCGCATTTCTCTTAGCCTTAGATCATCTAAAAA
GTCTAAACCTGACCCAATGAAATCCATCGATTGGCAACAGGTTTATTGTA
ACCACGACCTCCGAACTACTTACACTATTGAAGTGAAAAATAAATTTGAT
ACATTGGCTCAAGCAGACGACGACATTGAGAAAAGTTACCAAAATCTGAT
TAAAGCTAATAAAGAAGTTAGTCTTGCTCTTCTACCAAAGAAACAAAAAG
TCAAAAAGAAATATCTCTTTGAAAACAACCTTGTTTCTGATGCACGGAAT
GCACTTGTAGAGGCCAAACTAAAACATCAGCGACGCCCTACAAGAAGAAC
ATCAAAAATCCTCTCTGATGCTCAAAAAGATCTGGATGATGCCTACCTTA
ACGCCGAATCGATGTTTATTCAGGGTAAGATAAACTCAATTTCCAATCTT
CATGTTAGCCATCAGCACTCGGCCGCTTGGAAAACGATCAATGATCTAAC
AGGTCGAAAAGACCACCCTTCTATTCAGCTCAAAGGTGGCTCACCAGATA
AAAGAAGAGAAAACTGGCTCAACCACTTTAAAACTTTACTTGGAAACCAA
CCTATTTTAAATATTAATGCTCTCCCTTTAACTCAAATTTTTGATGAGCT
TGACATATCAACTTCTCCGTTTACAATTGATGAACTTTCAAATTGCGTTA
AACTTTTTTCAAATAATAAATCTTCAGGCCTTGATGATATTCCAACTCTG
CTTTGGAAAGATCCCGTCTTTATGGAAATGCTTCTCGATTTTTGTAATCA
CACATTTGAGTTTTCTAACTCCCCCTTCTGCTTGGTTAACTGGCGGTATC
ATTCCTGTTCCAAAAAAGGGTGATTTGACCTTAGCATCCAACTACAGAGG
CATCACTCTTATGCCTATCGCCGCCAAAATCTTCAACAAACTTCTTTTAC
AACATATCGTTCCAGTTCTTGATCCTCTTCTAAGAAAAAACCAAAATGGT
TTTCGGAAGGGAAGAAGTACTCTTACACAGATTTTAGCCATCAGGCGTAT
TTTGGAAGAAATGCGAAAACTTAACAAAGATGCTTTTATTTGCTTTGTTG
ACTTTAAAAAAGCCTTTGATTCCATATCTCGTGTAAAAATGTTTGAAATT
CTTAAATTGTACGGCATTCCAGAGAAACTCATTTCAGTCATCAGGGCACT
CTACGTGTCCACCAAAGCAAAGGTCATTACAGCTGACGGAGACACTGATA
TTTTTGACATTCATGCTGGAGTTCTACAAGGTGACACCTTAGCTCCCTTT
CTTTTTATCATTGTTTTAGATTATGTTTTAAGAATTTCTGTTGACTTATC
TAATGACAAGGGAATCAAAATTAAGGTTCCCCTGCGCAAGCGTAACCGCG
GCCTTTTTCTGACCGATCTTGACTTTGCTGACGATCTAGCCTTAGTTTCT
GAGAGTATTCAAAATCTTGAAAGTCTTCTTCACTCACTTGAAACTTCGGC
CAGTCAAGTCGGTCTTTATTGCAATGCTGGAAAAACTGAATTTATCAGCT
CCTCTGGGATTGTTCTCCCTTTAACTTCCAAGAATGGTGTCAATATCAAA
CTTGTGAAGGATTTTAAATATCTTGGCTCTCATATTAACAGCTCTGAAAA
CGATTTTAAAATTAGGAAAGGTCTAGCTTGGAAAGCTTGTAATAAGTTAA
ACAAGATATGGCACTCTAATTTGTCTAACGCTCTTAAACTTCAAACTTTT
AGAAGTCTTGTCGAGCCCATTCTTCTATATGGCTCGGAGACTTGGACCAT
GACAAAAACCATGCTGAAGAGCCTTGATGGCTGCTATACAAATCTTTTGA
AAAGAGTCCAGAATCTTGATTGGCGCAACCACCCAACCCTTCAAGGGATA
TATCATGGACTCCCAAGAATTTCCTCTGTCCTGACTAGCAGGATGCTCTC
TTTCTCAGGTCACTGTTTCCGTGCGAAAAACGAAATGGTATCTGAGATCT
TACTTTGGTGTCCTGCGGGCACTAGGCGCTCGAGAAAGCGCACTTTTCTT
GATACTTTGAAACGAGAAACAGGGCTAGAGATTGAGGAACTGGGCACTGC
AATGGCTGATCGAGAGCTGTGGAGGGAGGGTTATTGTTTGTTTCCGACCT
AGGTCCATTCGGACCTAGGTCGAAGGATGATGATGATGACTTACTGGTTT
TTCCTATAAAAAGCGTATATATCTGAAGATACTGCTCTTCATATGTTATT
TTACTAATGTACACGTTTAGCAACATAACTGTTCGAATACTTTGAGTAGA
GTAATATTTTTAACCTATGAAGAGCGCTTAATAACTATTTGTGGTATAAA
AAGGGAATTTCCCAGAAAAGGGAATTTCCTTAGATTCATTTAACTCTCCA
GGGATAAGAAAAAGACAAACTGACATTTCAAAATGAGTAATCAGATCAAA
ATAACTCCGGAAAAGTCTTTTTGATGACGATAAAACAATAGAGAGACTAC
TTATGAATTACTGTATTCAATCGTCTGTTAAGTATACTTTCTTCTTTTTC
TAACGGGACTTTCCATTCGTCAGTTTTACAGTACGGATTTGTGACGATGT
TCGTGGCTGCATTCCCATTGGCGCCACTCATTGCTCTCATCACAAACTTG
ATCGAAATCCGCATCGATGCAACCAATATGATCAAAGCATACCGACGGCC
GATCGCATACAAATCGGAAGGGATCGGTGTGTGGTATGATATACTGGTCA
CTTTAACGACGGTAAGTACACGTTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGA
ACATAAGGCTTTGATGGCCAAAATTTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTA
AGGCTTTGAGGACTCTAAACACCTGATTTCTTAGAAATACCCACAAAATG
GCGAAAGTAAGAACATGTTAAGAACATTTTTAGGCTTAAATCTGAAAAAG
TAAAGAACATCCGAAGGCTTCAAGAATTTTGGATGTTCTTATAAAAAAGA
CGTGTATATGAGACGTACTGTACCGGGTGTGCCAAAAAAAAATTACCCTT
TTTGATTTGATATTGTAGTCAGTAGAAAAGAGAGTTCTCAAAAATTGTTT
CGGAAAGCCCAATTTTGGTGTTTTACTTTTTGATTTTAATTCATTGATTC
AAAAGTTATGTCCAAAAAAACTAAAACATCAATTTTAAAGAAATGTCAAA
AAAGGCAGCGACTTCAATTTTGTTTGGGTTCAATTTTTCTCTTCAATATG
ACGCTAGTACAAAATTAGTAGAGTATTTTTATGTCTCTGCACGCTTTTGC
TTGAGATGTAAATTTAGAACACCACGTAACGTAATTTCACATTCGTTTTA
GATTGCCGTTTTGGTAAATGGTTTCGTCCTTTCGTTAACATCCGAGTTCA
TTCCACGTTTGGTTTACAAGTACCGGTATAGTCCGGATATGACGTTAACC
GGATATGTGGAATGGAGTTTATCTAAATTCAATATTTCCGATTTTTCGCC
AGATGAGAGTCCGTTGAATATGCCGGAAATTGAAATTCTGCAGACGCATG
TTTTTAAGAGGGTGAACAAGACAGTGTGCAGGTAACTATTTGATTGATTG
ATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGAT
TGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTG
ATTGATTGATTGATTGATTGTAGAGATTTTTTATTTTCACAAATGTACAA
TGATCTAAATTTTTCAGTTTTAAAGATTTTCATATTTTCAATATCAGATA
TCCTGGTTTCCACGTGAACAACGAATCGCACGAGTTTAGCATGGTTCATT
GGTATTTAATGACAATCAGGCTAATGTTTGCCTTCCTCTTCCAATGGATT
GTATCAGCCGCTGGTCGTATTTTAGCCTGGATCATCCCTGACCGTCCACG
CTCACTAGACTTAAAAATTAAACGTCAAGAATTTCTGGCTAAAGAAGCAT
TACGTAATTATAAAATTAAGACGGGTAAAAGAATGCCGGAAGCCGAAAAT
GTCTCAGAGGAGGAAGAGGAAAGTGATACATCGGAAAGTAAACGGAACTC
GGACCAAGCAAACGGAACAACCCCGGAAACTGGAAATCCTTCTAATAGAG
ACAATACGGACAACGCCGTTGATCAAGATATCCGGATTAAAATTCCAGAT
CGAAGCGCTTCTACAATGGAAACGACTTTTTTAATTGATCCAGAGAAGAA
ACCAACTTCTCCGAATTACTCTTTCGAATATTTGACACAAATGCTTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000254_pilon:369258..375806- >XLOC_002110 ID=XLOC_002110|Name=XLOC_002110|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1992bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000254_pilon:369258..375806- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACCGTATGGGAAGCGGATTACCAACTAGCTGAACAAGAAGAATTACA
ATTGTTCTGGGAATATCAGGAAGTCGATGACCGTATGGGAAGCGGATTAC
CAACTAGCTGAACAAGAAGAATTACAATTGTTCTGGGAATATCAGGAAGT
CGTTTTACAGTACGGATTTGTGACGATGTTCGTGGCTGCATTCCCATTGG
CGCCACTCATTGCTCTCATCACAAACTTGATCGAAATCCGCATCGATGCA
ACCAATATGATCAAAGCATACCGACGGCCGATCGCATACAAATCGGAAGG
GATCGGTGTGTGGTATGATATACTGGTCACTTTAACGACGTTTTACAGTA
CGGATTTGTGACGATGTTCGTGGCTGCATTCCCATTGGCGCCACTCATTG
CTCTCATCACAAACTTGATCGAAATCCGCATCGATGCAACCAATATGATC
AAAGCATACCGACGGCCGATCGCATACAAATCGGAAGGGATCGGTGTGTG
GTATGATATACTGGTCACTTTAACGACGATTGCCGTTTTGGTAAATGGTT
TCGTCCTTTCGTTAACATCCGAGTTCATTCCACGTTTGGTTTACAAGTAC
CGGTATAGTCCGGATATGACGTTAACCGGATATGTGGAATGGAGTTTATC
TAAATTCAATATTTCCGATTTTTCGCCAGATGAGAGTCCGTTGAATATGC
CGGAAATTGAAATTCTGCAGACGCATGTTTTTAAGAGGGTGAACAAGACA
GTGTGCAGATTGCCGTTTTGGTAAATGGTTTCGTCCTTTCGTTAACATCC
GAGTTCATTCCACGTTTGGTTTACAAGTACCGGTATAGTCCGGATATGAC
GTTAACCGGATATGTGGAATGGAGTTTATCTAAATTCAATATTTCCGATT
TTTCGCCAGATGAGAGTCCGTTGAATATGCCGGAAATTGAAATTCTGCAG
ACGCATGTTTTTAAGAGGGTGAACAAGACAGTGTGCAGATATCCTGGTTT
CCACGTGAACAACGAATCGCACGAGTTTAGCATGGTTCATTGGTATTTAA
TGACAATCAGGCTAATGTTTGCCTTCCTCTTCCAATGGATTGTATCAGCC
GCTGGTCGTATTTTAGCCTGGATCATCCCTGACCGTCCACGCTCACTAGA
CTTAAAAATTAAACGTCAAGAATTTCTGGCTAAAGAAGCATTACGTAATT
ATAAAATTAAGACGGGTAAAAGAATGCCGGAAGCCGAAAATGTCTCAGAG
GAGGAAGAGGAAAGTGATACATCGGAAAGTAAACGGAACTCGGACCAAGC
AAACGGAACAACCCCGGAAACTGGAAATCCTTCTAATAGAGACAATACGG
ACAACGCCGTTGATCAAGATATCCGGATTAAAATTCCAGATCGAAGCGCT
TCTACAATGGAAACGACTTTTTTAATTGATCCAGAGAAGAAACCAACTTC
TCCGAATTACTCTTTCGAATATTTGACACAAATGCTTTGAATATCCTGGT
TTCCACGTGAACAACGAATCGCACGAGTTTAGCATGGTTCATTGGTATTT
AATGACAATCAGGCTAATGTTTGCCTTCCTCTTCCAATGGATTGTATCAG
CCGCTGGTCGTATTTTAGCCTGGATCATCCCTGACCGTCCACGCTCACTA
GACTTAAAAATTAAACGTCAAGAATTTCTGGCTAAAGAAGCATTACGTAA
TTATAAAATTAAGACGGGTAAAAGAATGCCGGAAGCCGAAAATGTCTCAG
AGGAGGAAGAGGAAAGTGATACATCGGAAAGTAAACGGAACTCGGACCAA
GCAAACGGAACAACCCCGGAAACTGGAAATCCTTCTAATAGAGACAATAC
GGACAACGCCGTTGATCAAGATATCCGGATTAAAATTCCAGATCGAAGCG
CTTCTACAATGGAAACGACTTTTTTAATTGATCCAGAGAAGAAACCAACT
TCTCCGAATTACTCTTTCGAATATTTGACACAAATGCTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000254_pilon | genome | sc0000254_pilon:369258..375806 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 496-996:502 |
| Aaloc | 265-492:949 |
| Aaloc | 79-264:1725 |
| Aaloc | 1-75:6550 |
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