XLOC_001346 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_001346
Unique NameXLOC_001346
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:1294225..1304376-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001346 ID=XLOC_001346|Name=XLOC_001346|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10152bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1294225..1304376- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTAAACATGAAGAAATGGTTATCCTTTTTTACCACCAACACGAGGCG ACCAGGCGGTAACCATTGGAAACGAGATTGTTTAGAAATGGCAGATCATG AAATGTCATTTGGTGTGAAATTATGTCAAGATGACGAAGAAGAAGATCAA ACAGAAGGTGAGTGTATATTCTACTGACCAGAATTATAAGGTATTGCTTG TCAGAGTATATTTTACTGACCAGAAAGTAACTAGTAAGTAGTAGTCTGCG ACTATGGTCGAGGCGACCCGAAGGCTCCTCTTTCGATAGCTATATACCCG AAGGTAGGGAAAACGCTACTCTTTCTCCTTGGATTGCTCCACTTACCCTT GATCCTTCTCTTAATTATTGAGCATCAAGCGGAAAGATATCAAGTACCAT TTTGGAAATCTTTGTTATGATTCCGGCAGGGGGTTGAACCCATAACCTTG CACACAGTAGCCAGATGCTCTACCATTGCACTACGGTTGCTATTTGACCA GAATTATACTGTATTATTTGTCAGTGTATAATTTGCTAATCAGAATTATA AAGTACTCCTTGTCAGTGTTAATTTAACTGACCAGCATTTTCAAGGGACG AGATGGAGTTTTTACAAGCTACATTTGGTTGGTCACCATTTTTAAAGAAC TTAAAATGACCAATTATTGAAGTAACTTATAAAAACTCCATCTCATCTGA TTTTCAGGGGTTAAATCAAAAGAAAAAGCACAAGGCAGGAATATTTTTCT AGATATTCGTTATTACGGAACTGCCAAGTAAAAAAAGAGTCGCCAGTGAC ACTGCAGCTAACGCTCCTCTTACGTTCACTACGTTCACTTCGCTGCCAAA CTAATCTCACGGCTCTTACTCTTAGGTGCCAAATAAACGCCCCCCCCCCG CTTGTTAATTTTTCGATTTTTTCCCAACCCCCCCCCCGGACGTTATTAGG 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TTGAAGCCTTCGGATGTTCTAAGCTTTCTTAGTTTTAATCCTAAAAATGT TCTCAATTTCACTTAATTGTTGTGTCCATGAAGCCTTAAAGTGTTTTCAA CTTATTCTTAATATTTTTGAAATCGAAGCCTTTTGTTCTATAATAGCTTT TTCTGATTAAAAAAACGTGTAGGGTAAATTTCCAAGGTCAAGGATTCGAT GCGCATTCAGGTTAAAAACACGTTTCAAGGGGATGAAAAATCGTCCAAGG GTAGATCATTGAAAAAATAATACATCCTCCAGCCCAACACATTTTTTCTG GAAGAGCCGTCCAAATAACATTATATAAACGTTCAAAAAACGTCGTGCGC CAGTTGAGTTGGCTTTTCGATTAAATTTTCAATGATTTTAGATGTGAAAA TGGAAAAAGATTTAAATTCTAAATTGACAATATTGACATTCGATTGAGAT TATTTTCATTAAAAAAAAAGACATTATATGGTTTAATATGGTTTCGATGT CGTTCACATTCTACCTTAATCATATCGAGAATAGGATAGGATTAAAAAAC AGATTGTAAAAAGCGAGGAAGAAGAAGAAATCAGAAAGTTTTAAAAAAGG AAAAGAGGATACAGTGGTATTATCACACTTTTCAATGTTGGAAGAACATA TATCAATTCTAAGCTCAGCCATCAGAGGAAAGATACAATTGTAAACATCG AAATTACAACATCACATAACATTCCATAAAAAGAAGAGTTAAGGACTGTT ACCGACGCTGTCAGAAAATTTAAAACTATAAAACTGTCAACTACAAAAGT TTACTGTTTTGAAGTAAATGGTACAATAATCTTCGATTGTCGGTGATTTG TTAGAAGTTTGAATAGAGGGACTTAAATTATTCTGAATAAGAGCTTTCTG CAAGATGAACACAATGGTTGTATCTTCGGAGAGCTGTCCAAAATCAATGA TTTCGATCATCGTCAAACGTACAAACACAGATAAATATTGGTCCAAAGAT TTTAAGAAACAAAAGGGTAAGGAGAGTTATTTAAAGTGTTTTCAATGATG ATTTACCAAGGAAAAGGAAAAATTTTGTAAGCATGGGTTCTTCCAGAAAA TGTTCGTATATGGGGGGTGGAGGATATAGTGTAGTAAAATAATCTACAAA ATCTTTCTTGCCCGGGGGTAAACCTGCTACTGTTTGGGGGTAATTTTGCT CTGTTTGAGGGTAATTTTGAGTGTCCAGGGGGTCGATTAATGCTTGTCCA GGGGATTAGACCTGCTGTCCGGGGGTCAAAAGTCATAATGTCCGGGAGGT AAATTTCCAAAAAAATGTTATATCCTCCATCCCCCATATTCAATTTTTTC TGGAAAAGCCCCATTGAGTTCTAGTGAGAGCTTTTGGCCTTTAGAGATTT TAGGGTTTAAATGTAACTATAGGTATTCAAAATATCTTGCTCTCGTTTTC CTTTGGGAATAAATAGATAGATATAGCCGATATCGATATTTTACATAGAT AGCCCAGTACTATAGAATTTTGAAGCAGTCGATCGCTTTCACGTGGTCCA CGATCAGCCAGGGATAGAACATGGGAATGAACACTAACGCCTTGACCACT TGGTCATTGCTCCTTGGGATTTCAAATTCACATTACAATTTGACAACAGA GATGTTATAAATATCGTTAGTGGAAGGTCTTCCACTTAAGAAAAGACTTA TGGTTTTTTCTTCCAATTAAACCCTCTTCTCACAGACCCGTTGGAATTTT ATCAGCCAGTGATGGCGATTGATATTCTCATGTTTTTTATGGCTGGGGAT TTAAATTCCATTGTTTTCTAGCCAGAAAATTCAGCGACGATGGAAAAAAT AGCACAATATTTGGCAGTGGAGATTTGCTTATCTGATTATTCTCAGCGGG GACTAAGTTTAGAGTATAATTTTCCACTGGGGACGATATTTTGGCCAATT TTTACAGTGAGTCTGTGAAAAGGGGGTGTCCAATGGTTTCCTATTGGAGA TCAGTTACTTTGATATCTTCACTTACGGTTCAAGTTTAAATGTTCTGAGA CTGTTCTTATTATTGTTCTAAGAATATTCTTAGATTTTTAAAATTAATAG AAATAAGTCAATAGCACCATAAATTTTGAGGAGGCTCGATTGTTTTCAAT TTTTTCTCAGTCTCATTTTTTTGGGGACTTCTTTGAGATTTTCAACTTGA AATTGTTCTTACTCTGTTCTTATTTTCTAGGCTTATTAACCAAAATTTAC TATTTTGAGCCTTAAATTGCTTAAAATTCAGCAACAAAAGGTTCGACTTA ATTGTCATTCTTTGCCTTTTTGAGCCTCATTGTTCTTATAAAAAAGACTC TTTGTCACACATACATAGAGAGACTTGATCTTGTGGTAGGATAATTTTCA ATTTTTTAGAAAGAAAAAGATAAAAAAACAAGCTTGATTTCAATGAAATC AAATTTTCTCGAAAAGCTGCGGAAAATGGCCTAGAGAGGCTTTGAAAATG ATATGCGTTAATCGATATACCATAAGGCGAAAAATATTTCCAAGGAATTG CAAAAAAGATAGTATACATAAAAACTGATGAACCGTGGGATATTTTTTAT GAGCATACACCTTTTTATAAGAACAAACTGTTTAAGAAAATAAGGCTTTG ATGGCCGAGAACAAGTAAAGAACATTTTAAGACTTTGCGAACTCTAAAAA GCCCAATACTTAAAGAATATTGCATAAAATGGGAAAAATAAGAACATGTT AAGAACAATTATAGGCTTAAAACTCAGAAAGATAAGAACACCTAGTGGTT TTAAAAATTTTGGATGTTCCTGTAAAACAATATGTTGCTTTGAAATTGAT GAGAATGATGATTAGAAAATGAAAATAAAAATGAAGATGATCATGATCAT CTTGAGGAAAAGGTGTGAAATTAAAATTGAAAAATTCACCGAAACGTTTT TTTATAAGCACATCCAAAATTTATAAAGCCATTAGATGTTCTAAAGATGT TCTTAATATCACCATCTGGTTAGTATTCTTGTGCAATTTTCTAAAGAAAA TTGGATGTTATAAAAGTCCTTAAAGCTCTTAAAGTTTATAATGTTCTTAG CTTGTTCTTAAGATTTTGGCCACCGAAGCCTTATGTATGTTCCTTATAAA GTTTAATCTTATAAGAAAAGGTGTATGGCGCAATCCTTTATACAATAGCA ACCAATATTTTAGTTAGTTATTGTTTGAATTTTAAAATTACAATCCAACG CCAATCTCTTGTAAAAAGAGACGTTCACATCGTACTCATATTATATCGGA AGCATGCAATCTTGCACAAGATTTTCGGGAAGTTTTAACTTAAAAAAAGC CGAAAACGCGAACAGAAGTAAAATTTAAATGCTCTAATGAAGGCCTTTAT CTCGAATTTCATATACACTTTGATGACTAGAATTGTAAAAAACCATCGGG TATCTCAAATTTCAAATCTTTTTAAGAGAAGAAATCTTAGCTAAAAATTA GTCCATTTCGTGAGATCTACGTGAAATTCACTTCGGCAGTGAAAAAAGTG TGTTTTCAAATTTTGTCGAAATACCAGAATATTCGGCGAATTGGACAAAC ACATAAAATGAGTAAAATATTTCGTGACAATTTGAAAAGCCTATTTATCA CAAAAGAAACAACAGATCTTAATCAGATAGAACAGACTCCGAAGGAAGAT ATTCTCTACCACGACGCGTCGGAAAAAGTTTTCCAAAACAAAATTTTTTT ATCATTTTGCGGGAATCAGTCAAGATGGATTACGGAAAACATCAATCATC ACCCGAGATATAGAACATCAAGGGTAAACAAAAAAGATTATTACTCTCCC TTGTTCCCAGTCCGCAAATTAAATAAAAAGGGCGCTTCCGAGAAATTGGT GTACTCTGGTATTTAAGGAAAAAATTACCAATGCTCCGAAATTTTGTACC CTCGGAAGCCCAAACTAAAAAATGTGTCACAAAAGCACGAAATTCTATAC ACCTTTTCGACCGTAGTCGGTCAGTGCGGTCAGACGCGTGTCCCTTGATT ATTTAATTACCCCCCACCCCCTAAACTCGATCCAATCCTTTTTTGACTCA TTTTTCTATTGGTCTATAGGTGCGAAAGAAGGACTGAGACGGTTTAAGTG GGATAAAGCGGACAAAAAATGCTTGCGCGGCAATTGGCGGCTACGGTCGT AAAGGTGTATTTAGAGATTGACGTAATTTATGAAAAGGTCTATTGTATTT AGGTTCAATGAAAATTGAATTAGAGTTTGTTATTTTTGTGCACAATTTAA TCTACATTGCTTGCGGTAACCTCGCGAAATGCATGATCGTTATCCTCAAT CAAGCATGCTATATTAAATAAATTAGGTAGCCCTTAGCAACCAGATTAAC CCTTTGTGTGCGCTGTTATTTTAGAAAAAGTCGAAATTTTTCTAATTTTT TATTTGAAACTCAAAACTTTAAAGTGCCATAAAAGCTTGTAGCCTTTGAT TTAGAAGATGGTTTTGGTACTATTGGAAAGCTATTTTTATATTCAAAGAA TTTGGTTTAATCCCTTTTGAATCAAGTGGTCAGGAGCTATGGCCTCAAGT CTGAGACTTAGTATTTTGGCTTGTTTTGGACACATATACGCGTCCCTCGT GGTCTAAGGGTTAACGACATTGTCCAACTTTTTAGAATCGAAAAAGGCAC CTCCATTTCTTGTAGTCGTAATCATTGTATGACTACTTATAGCCTTTTTT CCCTGAATATGTAATTCGGCCAATGACGAAATTGTTAAAAGTCACCGGAC TCGTCAAACGTCATTCCAGTCAAAATTGATCCACATGATAAAAATGTAGA GTAGATTTCTAAGGCTGACGGGCCAATAATTTTGACAGCCTTTAAGTTTT ATACTTTCAAAGTGTTTTCATGATCAGCGACGCAAATTCTTTTTCTGTAA GCAATCAAAGACCTCCAAAACTTTTTTAGCGCAAAATCTAGTAGCCCGGT ACCTGATTGAGCTATTTTGTCTTGGATACTTAAATCAGGTCTTGGATAGC TAGATTTTGCGCTTTTGAGCTTTATTTAATATTCCGATATTCAGATATCA GATAGTAAGGGCTGGGGTTCAGGCCTCCCAATACAAAATATTTGACACGG TCTGCCAAACCTTCCAGATGTTAAAAATCTCCCAACCTTCAGAACTTTAG CATGTCGGAAAAAATTTCTACATCGAGTGCCAGTAATCTACACGTTTTTT TTTTTAAGAAACTTGTTTTACCAAGCAGGCTCAATGTTTCTTAAGAAATC GGCCTTTTGAGCCTTAAATGTTTCTTACATGTTTCTAAACTTTGTCAAGC TTAAAGGACGTATGTCGATAATACAATAGTCTAATAGACTAATCTACGGT ACTTTCCCATCTTCTATATTGATTTTCTGACTTTCTCAAGTGTTTCTAAC TGTTATATAAGTATTTTTCTGGAACTTTGCCTTGATTGGAAGGTTCTTTA AAAAAAAAGAATTAAAAAATGTTATTTCTCATTCTCAGCCTCAGCATGTT TCTTAGACGTTTCTTAGTTTTTAGGCATTCTGAGCCTCGTGTTTCTTAAA AGTGTGTTTCTTAAAAAAAAACGTGTATCAGCTGAACGGAAAATTAAAAA GGGCGAAGGGTTTGAACCTATAGATTTATAAAGCCCAAATGGCTAGATGT CGTGCTTTAAGCCATCGCAGGCAAAGAAAAGTTAATATCGGAAAAAATAT TGTTGCTATTGGTTTCAAAAACTCGTGAAACTTCTGATTGGTCGAGCGTT GCAATTCTATTGTAATATCACGTGACTTACCACGGCACACTTTTCAGCAA AGTACGCTATCTAGCCTTTCGGGCTTTATAAATCTATGTTTGAACCGGGA ACCCTGGCAGCTGACACCATAAGCCACTCAAACGACGCTCCTGAGTAAAT GAATTTTCGTCAACCTGACATTTTCTTCTTTTGTTTTTGTTTACAGAATA TTTCAACGATAGTGCATCAGAAGAGAATTCAGTCGGTAAATCAAAACTCG ATGTCATGGTTGAGACGAAAAAAGACGAATATGTTAGCTCATTCACTGTC CACGGCCTCACGCGAATCTTCAAAGGTTCAAAGTCAGAATCTATGTTCTG GATGATGATGCTTTTAGTAGGTGTGACCCTTTCTACGTATGTGATCCATG GCCTAATCAAGAAATACTTTGAATACAACATATATACCGAGGTTCGATCC ACCGTATCGATAAAGAATATATTCCCAGGAATCACTGTTTGTGAATTTAA CGGGATGTTATCAAATTACTTCGCATATTGTGGTCAACAAAGAGGACACG CTACCATTTACGAAGCTGACAATGTTTGTAGTGTGGATGCCAGAGCTGGA AAAGAGGAGATTAAAGATCGTTTAGATCATCCATTTCAATGGAGTAATAG TGTCTTCAATGTGACACAATGTCATACCTGGGGTGGCAAATATTGTGCTA AGGACACTTATATCAAATCACTGGCCGACCATAACCACAGATGTTTCACG TTCAATTATAATGGAGATTTCTATGACACATACTCGCACGCGTATATGGA ATTCACCATAAATGACAAGTATGCAAGAGGTGCTCCATTTATTATTGCCA TAGTTCATGATCCAAGAATCGCCGAACTGGATATGACAAACAGAGTGGTT TTGGAAGCATCTAAGATATACGAGTTGAAGATTGAGAAAACAGTCATCAA ACGCTTACCATCGCCATTCCCTTCAAATTGCACTATTGGTAAAATGAATG ACTTTTTTTCCCTGGTAAATATACCAGGAGGAATTGTCTTGAATCCATTA CATATTCTCGTATGTTTAAAGAGTGTGGTGATGTCTTAGATTATCATCAA AAATACATTCCCAAAGAGTTGAAAGACAAGTATAAGACCAACAAAACAAT ACGAGAGGTCGTCCAATGTATTGAAAAATTCAGTCAAGAAGAAGTCACAG ATATTAAAGAATGTCCGTTCCCGTGTGAAGAAATCGAATATACGACAATG CCGACATTCCATAGTCGTGTGCCTAAAGACCCCATTCCAACCTATAGGCT ACATATACAATACCATAGAGTAGACTCTTACAAATCAATTGAAGAAAAAC AGTTGGTGACTTGGGATCAAGTGGCTGGCGAAGTTGGTGGATTGGTTGGA TTGGTGATAGGAGCATCGTTCATATCCATAATCGAGATTGTGTTTTATGT CTTTCTGTGCTCCTTTCATAAAGTGAAAAGGGCATGTTACACGTCTGGAT GA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:1294225..1304376-

>XLOC_001346 ID=XLOC_001346|Name=XLOC_001346|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2926bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1294225..1304376- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTAAACATGAAGAAATGGTTATCCTTTTTTACCACCAACACGAGGCG
ACCAGGCGGTAACCATTGGAAACGAGATTGTTTAGAAATGGCAGATCATG
AAATGTCATTTGGTGTGAAATTATGTCAAGATGACGAAGAAGAAGATCAA
ACAGAAGATGGTAAACATGAAGAAATGGTTATCCTTTTTTACCACCAACA
CGAGGCGACCAGGCGGTAACCATTGGAAACGAGATTGTTTAGAAATGGCA
GATCATGAAATGTCATTTGGTGTGAAATTATGTCAAGATGACGAAGAAGA
AGATCAAACAGAAGAATATTTCAACGATAGTGCATCAGAAGAGAATTCAG
TCGGTAAATCAAAACTCGATGTCATGGTTGAGACGAAAAAAGACGAATAT
GTTAGCTCATTCACTGTCCACGGCCTCACGCGAATCTTCAAAGGTTCAAA
GTCAGAATCTATGTTCTGGATGATGATGCTTTTAGTAGGTGTGACCCTTT
CTACGTATGTGATCCATGGCCTAATCAAGAAATACTTTGAATACAACATA
TATACCGAGGTTCGATCCACCGTATCGATAAAGAATATATTCCCAGGAAT
CACTGTTTGTGAATTTAACGGGATGTTATCAAATTACTTCGCATATTGTG
GTCAACAAAGAGGACACGCTACCATTTACGAAGCTGACAATGTTTGTAGT
GTGGATGCCAGAGCTGGAAAAGAGGAGATTAAAGATCGTTTAGATCATCC
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GTGGCAAATATTGTGCTAAGGACACTTATATCAAATCACTGGCCGACCAT
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CTCGCACGCGTATATGGAATTCACCATAAATGACAAGTATGCAAGAGGTG
CTCCATTTATTATTGCCATAGTTCATGATCCAAGAATCGCCGAACTGGAT
ATGACAAACAGAGTGGTTTTGGAAGCATCTAAGATATACGAGTTGAAGAT
TGAGAAAACAGTCATCAAACGCTTACCATCGCCATTCCCTTCAAATTGCA
CTATTGGTAAAATGAATGACTTTTTTTCCCTGGTAAATATACCAGGAGGA
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GTCAAGAAGAAGTCACAGATATTAAAGAATGTCCGTTCCCGTGTGAAGAA
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CATTCCAACCTATAGGCTACATATACAATACCATAGAGTAGACTCTTACA
AATCAATTGAAGAAAAACAGTTGGTGACTTGGGATCAAGTGGCTGGCGAA
GTTGGTGGATTGGTTGGATTGGTGATAGGAGCATCGTTCATATCCATAAT
CGAGATTGTGTTTTATGTCTTTCTGTGCTCCTTTCATAAAGTGAAAAGGG
CATGTTACACGTCTGGATGAAATATTTCAACGATAGTGCATCAGAAGAGA
ATTCAGTCGGTAAATCAAAACTCGATGTCATGGTTGAGACGAAAAAAGAC
GAATATGTTAGCTCATTCACTGTCCACGGCCTCACGCGAATCTTCAAAGG
TTCAAAGTCAGAATCTATGTTCTGGATGATGATGCTTTTAGTAGGTGTGA
CCCTTTCTACGTATGTGATCCATGGCCTAATCAAGAAATACTTTGAATAC
AACATATATACCGAGGTTCGATCCACCGTATCGATAAAGAATATATTCCC
AGGAATCACTGTTTGTGAATTTAACGGGATGTTATCAAATTACTTCGCAT
ATTGTGGTCAACAAAGAGGACACGCTACCATTTACGAAGCTGACAATGTT
TGTAGTGTGGATGCCAGAGCTGGAAAAGAGGAGATTAAAGATCGTTTAGA
TCATCCATTTCAATGGAGTAATAGTGTCTTCAATGTGACACAATGTCATA
CCTGGGGTGGCAAATATTGTGCTAAGGACACTTATATCAAATCACTGGCC
GACCATAACCACAGATGTTTCACGTTCAATTATAATGGAGATTTCTATGA
CACATACTCGCACGCGTATATGGAATTCACCATAAATGACAAGTATGCAA
GAGGTGCTCCATTTATTATTGCCATAGTTCATGATCCAAGAATCGCCGAA
CTGGATATGACAAACAGAGTGGTTTTGGAAGCATCTAAGATATACGAGTT
GAAGATTGAGAAAACAGTCATCAAACGCTTACCATCGCCATTCCCTTCAA
ATTGCACTATTGGTAAAATGAATGACTTTTTTTCCCTGGTAAATATACCA
GGAGGAATTGTCTTGAATCCATTACATATTCTCGTATGTTTAAAGAGTGT
GGTGATGTCTTAGATTATCATCAAAAATACATTCCCAAAGAGTTGAAAGA
CAAGTATAAGACCAACAAAACAATACGAGAGGTCGTCCAATGTATTGAAA
AATTCAGTCAAGAAGAAGTCACAGATATTAAAGAATGTCCGTTCCCGTGT
GAAGAAATCGAATATACGACAATGCCGACATTCCATAGTCGTGTGCCTAA
AGACCCCATTCCAACCTATAGGCTACATATACAATACCATAGAGTAGACT
CTTACAAATCAATTGAAGAAAAACAGTTGGTGACTTGGGATCAAGTGGCT
GGCGAAGTTGGTGGATTGGTTGGATTGGTGATAGGAGCATCGTTCATATC
CATAATCGAGATTGTGTTTTATGTCTTTCTGTGCTCCTTTCATAAAGTGA
AAAGGGCATGTTACACGTCTGGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_001346XLOC_001346-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:1294225..1304376 -
Properties
Property NameValue
Aaloc964-1461:499
Aaloc160-963:1305
Aaloc1-156:10153