XLOC_001339 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_001339
Unique NameXLOC_001339
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:1062666..1071683-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001339 ID=XLOC_001339|Name=XLOC_001339|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9018bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1062666..1071683- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGTTCTACATAATAGTTTTAATATGTTTTATGTGTACAAAATTAAC AGGTGATTAAAATTTTGTTATCCTTTTTTCATATTATTATGTCATACTTT CATTCCTTTTTATATACTAATTGAATTTTTTATTGAAATTGAAAAAGGGG TAATCTGATATAAACCTGAGCAAAACCTCATCAAAACGAGATATTCATGC ATGCTTTTTATCTTAAGCAAGAAAACAATAGAATTTTGAAAGATTGTTGG TTTTACTCAGGATAGTTTATAGCGTGCCAAAAATCTTAACCATCTGATTA TCCCTGGATAGTGAGAGCTTGTGAGTGAGAGCACACAATGCTTTTCGTGT GCACAGACTTGTTAGAAGCAAACTAATTTTTTTAAATGATCAATTAGGTA AACAAGATCACAAAAACGAGTGGTGAGAAAAATTCTGACCATTTTGCTGG TCCCTATGTGGTGTCATCTTCACTTTTGCTGGGGCTTGAGAATGAAAGTG AAAATTTGAAGCTCAAGTATGCCTAATGAAAGATATTTATCTAAGTATTC CAAAGAATATCAGAACAAATATCTGAAAATCAATCTTTGAGAAACTATAA CGGAAAATAGCTCAAAAAATAACGTCATTGATGAGGTCTCCTCAAATTAA AAAATTGTCAAAGTCAAAAAATTTCTTTCTTTCATTTTTTGTGATCTAAT GGACCTAATTGATCATTTAAGGTATGTGGACACCTTTCTAATACTTTTCC TTTAATTGGCTATATCTTCCGACTGACAAATTTTAGAACCATAAAAGTAT ATATTTTATGAAAGTAGCAATAAAGGTGGGTTTGTTTCACCAAAGACAGT GCTCTACGTAAAGGAGCAATACAATAATGATGAGTCAAAACTTTTTTTAA AATGTAGAACTTAAAGTTTCATGCTTACAATCATCAGCTACATATGATAC 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AAAAAAAATTTCCATAATTATATTTGACTATCAAAAGTTACAGGCATTCT TGTTTCCACTGCCAGTTATATCTGGACAGACTTTAGATCAAACTTGTATC ATATGTAGCTGATGATTGTAAGCATGAAACTTTAAGTTCTACATTTTAAA AAAAGTTTTGACTCATCATTATTATATTTTATGAAAGCCAATAATATTCT GTGTCTATCATCTATCAAGTTTTTTTAAATTCTTAGCGGAAGATATTTAA AATTTTGATCTAGGTGACTTTACGGAAGTTAAAGTCACCCATTGCTTTGA TCAAAAGAAAAAATACATACTACCAGATTCTGAAAGAGAAAAAAATCATT AATTTTTCTGATTTTTCTTCACTTAACCTGAAATTGTGGAACTTGAACTT GATTAGAAAAAAAAACCAAAGACACTTTTAAGTTCAATATTTTGCCAAAA ATATAAAAAAATCTTTAAATTATTAATCAAAAAAGATTTTAATTTAGTTC TTTGACCATCAGAAAGATCTTCTGATTTTCTACAATATGATATAAGAATT TTTTTTTTGAATTTTTCTCAGTCTTTGCACACGAAGGATGTTTTCAGAAC ATAGACCCTCACTAAAAAATTAAAATAAAAGCTTAATCAAACATATAATC CAGTATGTTTTGATCACAAAGTTCAACATACTACGTGCTTACAAATATGT AACTTAATTTGTTTAATATATTTAATTTTCAGAATGCCTTCAATGGGACA ATTCAGTTTCTGATTTAGCGATAAATGCTAACAGCTCAGGCTCCGCAATT ATCAAGTTCAGATTTAGCTATGGAACTGAAGACCGTTCAAGTGTTAATAT TGAATGTGGAATATGGAATACAGATCAAGCCAAAATTATTCCCATGGTGA CTAAAATGGGTAACCAACCTGCACAAAGAAGAAGTGGAGTTACTGGCGAT GTTTTAGGGAATAATGCAGCTCTCTATACAGAATCTGCACAACCAACTGT TATTGGATTAAGATTGAGTAATATTGCAAAGACCTTCCCAACTCAGTACC GTTGCGATGCATCTTTTACTAAAGCTGATGGTGTGGCTGATAGTGAAGCA AGTGATCGTGTCAATCTTATTGTCTTAGGTAAATGAAACCCTTCACTTTA TTGTGTTTGAAATTTTTAATCAAACATAATCGATGACATTATCAGAATCA AGTACACTCAATTCAACCAAGCTTTCAGCAAATGCGTCTCAAGGAATACT ATTGATTGAAGTATTGTATATAGCGTTGTCCATAGCTAGATGTTGAGATA TTTGACTTTGAAAACTCGCTCATGTATTTGGATGCTTCTGGCCCTTCTCT GATTTTTTCTTAGGGATAAAGTTGACAAAATTTATTAGCCACCCCGTTAT GAAGATTTACTCCATCAGGTGGTAAAATAAGTCTAAGAACTTCAAACTTT CTAACAGTCTCTAAGCTACAAACCCTTCAAAGCTCTCCATAGAAAATTTT TGCAGGCTTGTTAGCTCAGCATTGAAGCAATTGAAGCAACATTTTTAGAT TTCATTAATCCATCTGTAATATTTTATGTTTTCAGATCGTCCAAAATTTG TAGACTGTTTGAAAAACATAGAATCCAGATCAACTACAGCTGGAAGTTCA CTTGATATAACATGCACTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTC AAGTCTCTGGCAACCCAACTCCTAACTTGAAATGTTCACTGTTGGCTTTT GATAGAGATATCCTAAATACTTTCCCTAAAAAAAGTAATGGTCGGAATCT TGATGAAGATGGTAATGATTTACTAATATTATGATAACATTATTTAAAGA AGAGATATTATTTAGTTCATCACAATTCATGGATCATTTTTATAACTTAA TGATGTGTTATAAACACATAGAAGCTTTGAAAATTTTTTTTTTTGAATCT TTCAATTTTGTTTATAATTGATTGTTAATCTTGTTTATAATGTTAAATTT TTAGAACCTGGTACTCCATTCAACATCTCATCGTCATTTTCAAATTTGCC AAAAGAGGCCCGTATTGTTCGATGCTTTGCTTCTCAAACACTTACTGGGA CCAATTCGTTAGAAAGAAAAATAACTGTCTTGCGTAAGTTATTATTTTTA TATCATACTTGAAAGCTTAAATTTCATTTCCTGAATTTTGAAAGTTCGTG TGGCGGCTGAAATCCTTTTTTCGCCTTGAAATTAAGAAATCAGAAAAAAT ACCAAGCCAATGCTCATTTTCCCAAATAAAAAAATTTCTGACTTCTTATT TGCATTTTCTTACAATGATTGCCATTTTTTTATTACGTTATCGTCTTATT ACGTTAACCTTAAGGTAGGTCCACTCAGCATGTAGCCTGTTGACATTAAA TTGGAATCATTGAAAGACAAAAACTTTGCTTAATTTACATCCATATGCAC TATAAACCTTTTTTTCCACCGCGTGTGGAATTTTTATTTGGACATTCTTT GCTCTAACAGTAACGAAAATATTGTCCTAAAGAATATATTGAATTTATCC TAATAGATAGCATTTGGAGTCTGGTGCGAAGAAAATAAAGGGAGCACAAG GTTCAAGCACCAGATTCACTGTAGATCACACTGTAACGTTTTATTGAATT TAATGCAATTTATATGCAAATCAGGGGTTCTTTTTCATTTTGAATATGAC ATGAAATTAGAATAAGAATGTATTTTTGTATTTATCACAAAATGCTTAAT CAGTTGAAGTCAAAAAGAATTTTCGATACTGAAAGTTCTGGACAGCTCAA CACAACTGTTGTCGCCACAGTCAGGCTCAACTTACTCTTTTTTTAACCTA GCACAATACGAGTAGTTCAACTGTTGTTGGCTCAACAAAGGTTAACTACC AAACCTTTGTAATGGTAAATTGATCTGCTATCCTTTAGGGACTTTATTTT CAGTGGCTGTCAATACTACTCTAATTTGTTTACTTCTTTCCTGATTAGAT TTATCATGAAAATTCTAAGACAACCTAGGAAAGTCTCAAACTATTCTCAT TACAGTATTTTTAGTTTGCATTAAAAAGGAAAAGCTTCACGATTTTCTCC AAGATTTACCATTTTTCGTTACTTTTAAAAAATGATTGCGGAATCAAAAA TGAGCCACAACAGGAAAGCTGATATTTTTTCACACCTATGCGATTTCAAA CGTTTTCACGTTGCCATTGCAGTGGGCGTTGTGACTGCGGAAACTCTCTA TTACATATGTGTTCGTTTTTTTCTTTTCTTCAGACACACCTTTTCCACCA AAGAATTTTAGCCAAGAAAACAGTCCTGATCGAACATCAATCACAGTCTC TTGGTTACCACTTACTAACGATGAATGGGGAGGTGCCAAAGATGGCTATA GGGTAGCTTACTACATGGTTGGTCAGGATCCGCGATTGAATTTAACGACA AAGGAATTGGGACATCAACCTTCAGAATTTGGCCAGGATGCAAACGTTTA TGTCTCTAGAAAAGTGGGAGAAAAAGATGTGGAATTTTATTTCTATACTA TCAAAGGTTTAAATCCACAGAGACCTTATCAAGTATATCTTTATGCACAG AACCGTTATGGAAAAGGAGATGATTCAATAAGGTTTTCCATGACACCTGG TGATAATCGTAAGTAAATGCTCTCATGATATTTTAATAACAGAGAAAAAA AATTATTTCTTCAAAACTTTTTAAAGCGAGTCTTAGTAAGTAACTCTGCG ACCACATTCAGAGGCGACCCGAAGGCTCCTCTTTTGATACCTATCTACCC GAAGGTAGGGGAGGGCGCCACTCTTTCTCCCTGGATTGCTCCACTTACCC TTGATCCTTCTCTTAATTGCTGAGCATCAAGCAGAGAGTCACCAAGTACC ATTTTGGAAATCTTTGATATGAGCTGGGGTTGATCCACAACCTTGCGAGT AGCTGGGTGTACCAGCACTACGGTCGTACGGGTCATCAGTGGCGTTGTGG CGGGGGGCTGGGGGGCCATGGCCCCCCAGCGGAGCTTTTTTGAAGGGGCG TCGAAGAGCAAGGGGCGCCAAAAGAGATTTTTTTAAACGCCCCAATCTTA AAAATCATACTTTATGCGCCTTAAATTGCGCCCAGGACCAATTTTACTGA GATAATTTTAAAATACTTGCAATTTTTTTCGCCCAGGACCAATTTTACTG AGATAATTTTAAAATACTTGCAATTGCGAAATCTGTATGTCTCTCCTTAC GATTTTAGGTGAAGAAAAAAAGGCGTCGGAAGTAGCTTCTAGTCAGTTAT TTGTCTTTTCTCTCACGCGTGCTGAATATTTAATTAGTGTTTACATTATT TGATTGACAGTTTTATTATAAGTAATAACCGACTAGTTTACTAGTCTACA CTAAATATTTCCTTCCTCATTATGCCTAGGCAAATGAATTTGGTAAAAGT TTAGAAAATGATGGGTGGGGACACCACTTTGAAAAATTGGAGGGGGCGCC ATTTAAAAAAAATTGACTTTGGCCCCTCCAGAAAAATGTTCCCACAACGC CACTGATCGGTAATGAGTCTTAAGTAGCCAACTCAATTTACATACAATAA AACTTTTCCTTGATATTTGAAAAAATACAAATTAGAAAGTATTTACATTT TGAATTTATTTTAGCAAATGCAATGGAATCAAGGAATCCTGAATCTGATA GTAAATTGGCAGAGATAATTGGTGGTGTCATTGGTGGTACTATTGTTTTG GTGTTGATTGTCATCCTGGTTGTATGGCTTTGTAGACGTCCATCTGCACC CAAAAGTAAGGATTTGCCTGTTATAAAAAGAATTGGATAATGAATATTCA TTCAATTTTCCTGTTCCTTTTTGTTACTGTTCTAGTTCTGTTCATAGTGG TCCTTCGTGGAAACAATTCGTGAGCTGTCTAAAAGCTGCAGAATTTTTCG GAGCCTTTGAACATTCGTTATTGTTATTATTATCATTATCAATAATTAAA ATTTGATTGAATTTTGCGATAGTATAAATTCATTAAAAAAATTTATTACC TAATTGCCTAATAACCCCTTCATCTGAAAACAAAAAACTGACTGTTCGCA ATTTTTTCTTTCTTTGCCTAAATAGGACCCACCATAAAAATAGAATTTTT AATTTAACGTAACCTTTTTTCTTTGTTTACAGAAAGCAAGTATCCCACAA GGTAGGCTCAATAACTAACTTTCATCTATTTGACTTTGAATAAGGCTACG AAAAGTTGGAGTTCCTGTCTGCCCAACAATGTAACTTCAGTTACCCCACT CAGGAAATCGGTAACCTTATGAGGCTAACCCTAAAAAGTGTTTCTGTTTC TGACCAGGGAAAATTAATTTTTAGTCTTTTTTATGACGATGTTACACCAC TACAAAGTCTACCATTTTTTATGCTTTTGAATTCTGATTTAAATGTGAAG GAAAATTTGAAATTGGGATTGAAGCAGTCTGTAACGCAACGCCAAATAAA GAACTTTTTTGTCAGTAAATAGCTTGAAATTGATGTGTCTCAGTCAATTT CAAATATATTGATTTTCAAATTCTGATCTTTTTTGACAAAACTTAGTTAT GTTGAAGATGCGGTTGATTATCCACCGCAACAGCCACAACAAAACCTATA TGCAGGTGTCAATAATTCCAAACAAAGAAATGGATCTTCCAATCACTCAG ACATCATGAGCAATGTATGTATTAATTTCTTTCTTTTTATTCATTTATTT TTAAAGAAGAGTTTTAACTTTCACGGGAAAAGTGTATTACAGTCAACTAC AAAAATAAATTCAGTTAAACTTGAATAAATTTGGGTTTTGGAAGTTTTTA CTGTGGCATATATTGTCTGAATCATGAAATGGAACGTCGTCTTTAGTAAT AGCACAACCTGTTAAATCTCAACTCTGAACTTTTCTACTACTTGAGTTAT TCAAAAAGAATGCAATTGGCGAGAAAGGACCTTCATACTTTGAGATACTC CTTCTTGCACTACTTCTGAACACTGATTTTAATATGTTTTGTTTTATCTT TTCAGGGTGATGGCTATCCAATGAGAGGTATGAATTCATATGAAACGTCA GAAAAGGCATATGTGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:1062666..1071683-

>XLOC_001339 ID=XLOC_001339|Name=XLOC_001339|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2970bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1062666..1071683- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGTTCTACATAATAGTTTTAATATGTTTTATGTGTACAAAATTAAC
AGATGAAGTTCTACATAATAGTTTTAATATGTTTTATGTGTACAAAATTA
ACAGAATGCCTTCAATGGGACAATTCAGTTTCTGATTTAGCGATAAATGC
TAACAGCTCAGGCTCCGCAATTATCAAGTTCAGATTTAGCTATGGAACTG
AAGACCGTTCAAGTGTTAATATTGAATGTGGAATATGGAATACAGATCAA
GCCAAAATTATTCCCATGGTGACTAAAATGGGTAACCAACCTGCACAAAG
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CAGAATCTGCACAACCAACTGTTATTGGATTAAGATTGAGTAATATTGCA
AAGACCTTCCCAACTCAGTACCGTTGCGATGCATCTTTTACTAAAGCTGA
TGGTGTGGCTGATAGTGAAGCAAGTGATCGTGTCAATCTTATTGTCTTAG
AATGCCTTCAATGGGACAATTCAGTTTCTGATTTAGCGATAAATGCTAAC
AGCTCAGGCTCCGCAATTATCAAGTTCAGATTTAGCTATGGAACTGAAGA
CCGTTCAAGTGTTAATATTGAATGTGGAATATGGAATACAGATCAAGCCA
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AGTGGAGTTACTGGCGATGTTTTAGGGAATAATGCAGCTCTCTATACAGA
ATCTGCACAACCAACTGTTATTGGATTAAGATTGAGTAATATTGCAAAGA
CCTTCCCAACTCAGTACCGTTGCGATGCATCTTTTACTAAAGCTGATGGT
GTGGCTGATAGTGAAGCAAGTGATCGTGTCAATCTTATTGTCTTAGATCG
TCCAAAATTTGTAGACTGTTTGAAAAACATAGAATCCAGATCAACTACAG
CTGGAAGTTCACTTGATATAACATGCACTATCGTCCAAAATTTGTAGACT
GTTTGAAAAACATAGAATCCAGATCAACTACAGCTGGAAGTTCACTTGAT
ATAACATGCACTGTCTCTGGCAACCCAACTCCTAACTTGAAATGTTCACT
GTTGGCTTTTGATAGAGATATCCTAAATACTTTCCCTAAAAAAAGTAATG
GTCGGAATCTTGATGAAGATGGTCTCTGGCAACCCAACTCCTAACTTGAA
ATGTTCACTGTTGGCTTTTGATAGAGATATCCTAAATACTTTCCCTAAAA
AAAGTAATGGTCGGAATCTTGATGAAGATGAACCTGGTACTCCATTCAAC
ATCTCATCGTCATTTTCAAATTTGCCAAAAGAGGCCCGTATTGTTCGATG
CTTTGCTTCTCAAACACTTACTGGGACCAATTCGTTAGAAAGAAAAATAA
CTGTCTTGCAACCTGGTACTCCATTCAACATCTCATCGTCATTTTCAAAT
TTGCCAAAAGAGGCCCGTATTGTTCGATGCTTTGCTTCTCAAACACTTAC
TGGGACCAATTCGTTAGAAAGAAAAATAACTGTCTTGCACACACCTTTTC
CACCAAAGAATTTTAGCCAAGAAAACAGTCCTGATCGAACATCAATCACA
GTCTCTTGGTTACCACTTACTAACGATGAATGGGGAGGTGCCAAAGATGG
CTATAGGGTAGCTTACTACATGGTTGGTCAGGATCCGCGATTGAATTTAA
CGACAAAGGAATTGGGACATCAACCTTCAGAATTTGGCCAGGATGCAAAC
GTTTATGTCTCTAGAAAAGTGGGAGAAAAAGATGTGGAATTTTATTTCTA
TACTATCAAAGGTTTAAATCCACAGAGACCTTATCAAGTATATCTTTATG
CACAGAACCGTTATGGAAAAGGAGATGATTCAATAAGGTTTTCCATGACA
CCTGGTGATAATCACACACCTTTTCCACCAAAGAATTTTAGCCAAGAAAA
CAGTCCTGATCGAACATCAATCACAGTCTCTTGGTTACCACTTACTAACG
ATGAATGGGGAGGTGCCAAAGATGGCTATAGGGTAGCTTACTACATGGTT
GGTCAGGATCCGCGATTGAATTTAACGACAAAGGAATTGGGACATCAACC
TTCAGAATTTGGCCAGGATGCAAACGTTTATGTCTCTAGAAAAGTGGGAG
AAAAAGATGTGGAATTTTATTTCTATACTATCAAAGGTTTAAATCCACAG
AGACCTTATCAAGTATATCTTTATGCACAGAACCGTTATGGAAAAGGAGA
TGATTCAATAAGGTTTTCCATGACACCTGGTGATAATCCAAATGCAATGG
AATCAAGGAATCCTGAATCTGATAGTAAATTGGCAGAGATAATTGGTGGT
GTCATTGGTGGTACTATTGTTTTGGTGTTGATTGTCATCCTGGTTGTATG
GCTTTGTAGACGTCCATCTGCACCCAAAAGTAAGGATTTGCCTCAAATGC
AATGGAATCAAGGAATCCTGAATCTGATAGTAAATTGGCAGAGATAATTG
GTGGTGTCATTGGTGGTACTATTGTTTTGGTGTTGATTGTCATCCTGGTT
GTATGGCTTTGTAGACGTCCATCTGCACCCAAAAGTAAGGATTTGCCTCT
TAGTTATGTTGAAGATGCGGTTGATTATCCACCGCAACAGCCACAACAAA
ACCTATATGCAGGTGTCAATAATTCCAAACAAAGAAATGGATCTTCCAAT
CACTCAGACATCATGAGCAATCTTAGTTATGTTGAAGATGCGGTTGATTA
TCCACCGCAACAGCCACAACAAAACCTATATGCAGGTGTCAATAATTCCA
AACAAAGAAATGGATCTTCCAATCACTCAGACATCATGAGCAATGGTGAT
GGCTATCCAATGAGAGGTATGAATTCATATGAAACGTCAGAAAAGGCATA
TGTGTAAGGTGATGGCTATCCAATGAGAGGTATGAATTCATATGAAACGT
CAGAAAAGGCATATGTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_001339XLOC_001339-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:1062666..1071683 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1423-1485:64
Aaloc1300-1422:528
Aaloc1147-1299:1453
Aaloc772-1143:2834
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Aaloc55-447:5435
Aaloc1-51:9019