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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000234_pilon:507107..514990- Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.19881.2.p1 ID=MSTRG.19881.2.p1|Name=MSTRG.19881.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7884bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000234_pilon:507107..514990- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTTGATTAACGATCGATTGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGC
AATTACCGTCAACGTTGAAGGTTATATACGGGTAAGCTACATTACATACT
TCCACTGTACTCATTTAGAACAAGACCATTCAGCATCATTTCGATCAAAA
AAATATTTAACCTTTTCTCCTTGTGGCGAATAATAAAAGTTAGAGATGAA
CTAGGGGGTGCCTTCAAAGATCTTGGTTCGATGCCTGCCGTACCAATTGT
ACAAAGTGCGTTGTGCCTTGATTAGGTTTTGAAAATACTTTTAACTGTCA
TGAGACAAGTCTTACTTACAAGAAGTACTTTGTAATCCGTTTAAAATTGA
GCAAGCCACTCTTGTTTCTAAGATTTTGGTCAATAAAGTAAAAAACCGAA
AGGTTAAAAGCCTTTCTCAGGCAAGAAAAAGTGAAGCCTTAGAATATACG
ACATATTTTTGACGGCCGATTGAATTTAGCGGTTTCTTTATTTTCGGTTG
GTATATTTTTTGAAATCTAGCCAAAAAGTTTACTTTAAATCTGGAATCTG
TAAAAATACCATGCGGGCTGCGCAAGGCCGCACAACCTAGGTAGGATTTA
GTGGCTTCAAATCCTACGTAAAAGATTCGCTTCTAGCCCTAGAAGAAAAT
TCAGAAGGATTCACGCGAATGGATCGTTAAAAAATCAATAATCTACATTA
AACAAAAGGATTATTGTCTTTTATTTTAGACTGGGTCAGCAAACAACATC
AAGATTCTAGTGGAAAATGCAGGACGTGTTAATTATGGAAAAGATATTGG
AAATCAACGAAAAGGTACTTAACTAAAATTGTATACCTAAGGAAAAGGGA
GCCTTCGGGTCGCCCTCGACTGCGATCGCAAACTCACTCTTACTTTTACA
GTTGGCTCAATAGAACTTGCAAAGCACGTGGGCTTGTAGGGCGCTTAATT
TAATAGGCTTGGAAAAATATCACGGAAAATCCAATAAAGATATTGAGATT
CTGTTTAAAATTCTTTAACATAGTTGTCGGTTTTGTATTTTTCATTAAGA
TTTTTCGTTAAAATCTATGCTGAAAATGAGTAAAATTTTCAAAATTTGAT
GACGTCGTAAATGATGACGTCGTAAATGATGACGTCATTCATTTCAAAAT
TTTTTGTAATTTCTTTTGATTCACATTGTTAATACCTATCACCTGTCAAA
ATTTGAATATGATTGGATCAACATTTCAGAAGTTATCGCAATTTTAAAAT
TTTGAGTTTTAAGCGATTTTAGCTTGGTTTTATGTCATGTTTCACAATAA
AGTCATAAAACCTGATTTTGAAGACCTATGACCCTAAGAATTTGCACAAG
TACTCTTAATAAGATTTTATAAAAAGTCAGAAAGTTTCAGATCGTTTCTA
AAATTTTTCTCCGTGATATACACAATAGAACACCAGCGTGGTAGATTCTA
CCCCCCCCCCCGACTGAGGTTAAAAGGGTTAAGAAAAGTAAAACAAAGAA
GTTTGATTTAGACAACTATTATTTGACCGGGAAACTCTGAAGTAATATGT
GTTATAGAATATGTTAATATATTATATTTAAGAAAATAAATTCTTAAGGA
TTAAACAATGCCTTGGAGTGGATATACGTGGCATACGTCATCTTACCAGT
GCGACAAAAGTGAGACAAAAATGACATCGAGATGAAATTTTGCACAGACG
CCCAGGAACATGTTAGAAAATTATCATCCGAAAATCCTGGCGAACTTAGT
ACTTTTTCTATGACTTATTTAAGGGGTAAGACTTTTTGAAGACCTGGTCA
AGGGTGATAATGAATACACGAATTGCAAAATTAAAATATGAAGCCAAATC
AGGCTTTTAGTCGAACATAAACCTTAATAAAACATAACCTTTAATACTGA
TTGGTTGAAATTTATCGACAATGATAAAGTTATTAACTGTAAGTTTTACA
ACAGGTAACATTGGAGTAAAATCACGTGAACTTTTTCGAGTAATCACATT
TTTTGACTACACTGCTATAATTTTGCAACCCGTGTATTGTAGAAAATGGG
TAGGTACCGAGTTCAGGGTGTGTGCCCTTATTTCCTAAAAGTGAGGACAC
CTCATTGTGCCTCTGAACCAAATTTCATCTCAACAACATTTTTGTTTCGC
AATGTGCAATTCTACTTGATTCCAAAACATTTCATTATTTTCCCATGAAA
ATGATTTGGCAGTCAGTTTTTAATTCAAATGAATGTTTATAACGCTTCTT
CGATACACTGATAAACAGGAATCATAACAGTAAAGGGAAAGCACCAATCC
TTGTTTAAGCATAATTCTTTTTGTTGGTTTTCGTAACGTATGACTTTGCA
ATTTCTGATGCTGGTCAACATAGTATTACGATTGGTAGCAATAGCATTTA
CTTTTACAATAGTATTTTCAACTTCGTCCGCCATTGGGATTGCAGTTGTT
GATAGCTTTGTTTCTTCATGCCTTGCTCTCTCTGTTTTCAACGTTAAACC
ACTTTTGATCACAGGGCTCGACATTACCATTGTTACAATGAGTACGAAAA
ACACAAGTAGAAATCTCATTTGAGATCTGAAGACGAAATTGTATTTCATT
TTTTTTGCTAGAACAATGAAGACATTCTATAAAATTTCTGTCAATACATT
CCTTAACCAGGTTTCTTTGTGATGAATTACAAACCCTTTGTTTTAATTGT
TATTTATAAGGAATTGACGTTATCAAGTCAAATATCTGAAGAATTTTATA
GGCAATGAATAAAACATTGAAAAACTAATGACAACCTAATTTATGTGGAA
TGCATTACCCTTTTTTATAGGGAACACGTTTATAAGAAACTTGAGGCTGA
AAATGTTCTGAAAAATAGGGAATTACTAAGGAACTGTTCGGGCTGAGAAT
AAGAAACAAGTTAAGAAACATTAAGTTTCAAACTTGAACTCGCACACATT
TACAAAAACCTAAAAAAAAAGTTTTAAAAATATTCATGAAACAACGTTCA
ATAAACGTTATTTTCAGTATTTTAGTCAGTTGTTTAACAAAGCATCAAAT
CAGTCCAAGCCTAGCAGCTAAGTGAATAAGGAACTCGATTAGGAACTTTG
AAGTTGAAATTATCTGGAAAAATAAGGAGCTCCAGGCTCGGAGCCAAGTT
CAGGTTCCTTTAAAAAAAAAAGACGTGTATGTATCTGACATGAGAAAAGT
GTTTAGTGGGAGCGCTTATGACAAGGCTTCTAGCGCAACTAACCAATGGG
AAATACCGTCAACTGCTCTAACTTGGGACAAAACATGGGACGGCAATTCG
GCCACCATTTCACCGAACTTCCAAAGTCATTTGATTTCACTTAATAAACG
GCGTGTTAAAAAATACACGATTTCTCTTTCGCATCGAGTAGAAAATAGAA
AAAAAATATAAAAAAATCCTTAGTGGAACAATCGCGAATGTCTGGAACGA
AGAAGACCAAATTAGTGGCAAAACGATGGAGCGTTTGACGTCACTCGGGC
GGCAAGTTACACACTCATTATTTGTTAATCCCATTCGGCGATAGGCGGTT
AGGCGGCGGGTGTTCTCTAATTCTCCAGTCTGGAAATTAAATAGGCCTGA
AATAGGCCTTTTCATTAATTATTTTGCTTGCACGACTGCCTTGTTTTGAA
ATCATTACCAAGATGATCAAATCTCTTGTTTATTCAAGTGTTACTTTTTA
AATAGAGTGAACTTATTTTGAATCGCCGTGAACTTCTCTGGGAATCAATT
AACAACGAGGTAACCGTTTTCCATGACGTAATTTATGAAAAGGTCTATTT
AGAGGGAAGATGAAAATATCGTCCATTACTTTCGAGATATTATTTTCGCA
ACATTTTGCTTTAACACTATCTCCCCCGATGTAACAAGGAAAAAAGTATT
GCAAAAATTATCATAATGAGCTTACCCACTGCACTGTAGGCATCCCCTCT
GATATGTTTTGATATAGATGATGCGTATCGTGTATACAATTCCTGTCTGA
CAGTTACTGCTTCATTTTTCTTAAAAAGGCTCAGAAATCCAATGATTGTA
TTAACCCCTAGTCATTCAAATTTTCAATTCAAATTTAATGAAATTTAAAG
ATTTCTCATATAATAAAACTTACTAATCAAGCTAATCAAGTTTCTAAAAG
TCAAAAATATAAAGATGGGGTAACTCTCAGACGGGAATTTTTTACACGAT
ACGCATTCCCTATATCAAAACATTTCAGAGGAGATACGCGCAGCCTAGTC
ATACTTCTCACTTCATCGGAATCTAAAAGTGAAATAAGATATGTGTCCCA
CAAAAACAAATACACGACCTCATTTTGATATTAGCAAATCTGAATATTTA
GCACAGCAATTTCCACCTGATGTTTTGGAACATTGAATTTCCCTGTGAAA
CCAATTTTTAACTGATTAACGTGAGAGAAGGTTTGTTGCCAATTAACCCT
TGCCAATTCGAATTCGAACGAAGTCCAATTTCTTCTAATTACAAAGAGAT
TCAGAGCAATGGGCTTTTCCAGAAAAAAAACCGTGCACCCCCTGTTGAGG
AGTCCATTTCCATTCCAAGGGGGTATGGTTTGAAATGCAGTGGAATTCCA
TAGTAGTAGACAAAAATCCGTCAAAAATAAGTGGAATTCCATGGAGGTAA
TGAATGAAAATCTGTAAAAATTCGGAATTCTAGAGGGGTGTGATCCTAAA
ATTGCCTGGAATTCCAAAAGGGTAGTTTACAAAAGATTGGAGCTCCTCAA
CAGGGGGTGTACGGTTTTTTCTGGAAAAGCCCAATATATATCACTTTTTG
ATTTTCTTGATATCTTGGATGCTATCAGAATCATTAAAAAGTGTACTTAG
GCACTTGGTAACAAGCTTGAGTAAATGGAGGACAAGAATCTAAGGATATC
TTCTCGCTTTCTTTCTGATTATAAAAAAAGATTTCCCTTTGATGGGGACT
GGGAATTAGTTCAAGTTATAGAAAGGCTCCAATAAAAGAACTTTATATCG
GATAAAACCAGTCCGAATTAGTGATAGTCTACTGTAATAGCTCACCCGGA
TCCTTTGTTAAGATTCAGTTTAAGGTAACGCTTGAGTTATGGGGCAAGCT
TCTTTCGTTCAAAAAAAAAGTAATGTCGAAAGTCTTTTAATCAACAACTG
TTTGGACTAGTCGCTTTTGATTTACTCGGAAGCTGAGATATAGTACTATG
TAATCACTTAGATATTTAAAGTGATTTAAATGGCGTTAATTTCGGAATAT
TGCTTTTCTTCTTTACACGAAAATAAAGCTGGACTTTCCCAAGATGATAA
TCATCATCATAATCATATTTTCAAATCACAAAAAAATATGTTAAATGCTG
CAACCTACGCCGCGCCCACACACTTAAAAAATTATACAAAACTCAAAAGA
GTCCTCTCTCCTATATCTGTTGCTTCAACCAAAAGGTGTTATCTGATAAC
CAATCCTGTTTGGTGAAAAAAATTAATAATCTTTTTTATAATATTTTCTT
TTTTCGACCTACCTGGAGGTCCTATAAATTAAACGTTGTTCGTTCGTTCG
TTCGTTCATTTTTGCACAATGATTCAAAATGGCAATTACCCAAAATGTGA
CGGAAAAAGATTTTCGAAAAATAACTTCCCTACTTGAGCTCTAACTTTAA
TCATCAGGTAGGTCCAATCAGCATTCCGACTTGTTTACTTCATTCTCTTA
ATATTTTTTTGCTTCGTAGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAATAG
TGACGCGACTGGATGGACCATATACCCTTTACAATTTGACGAAGATCTTG
TTTCAAAGTGAGAATTTTTTCGAGTTGCTTACGTAGAAATCTTATTAAAG
TTTGTGGAAAAATAAAGAGACATAACGTGTACAAATTCTCAGTACGGGGG
ATCAAATTTCTTTTTACATGGGACCAAAATTCGGGGGGGGTCAACCCCTG
AAGAAGATTTAAAGATGTTACATCCTCCACCTCTATGTAATATCTTTATG
GAAGAGTTAGCTATTTGTTTTTTAACAAACCAACATTTCTTTTTTTTAGG
CTTGAGAATAATCCAACACTATGGGAGCCATCGGATGGTGAAAAGGAGAA
CTCACAACCTACACTTTATAAAGGTTTCCTAAACATTGATGGTCCTCCGA
AAGATACATACTTTAAAACGAGGGTAAGTTGTTTACCAATGAATCTCCAC
AAATGAACCCGAGTTTAGTGTCAAATGCTTGATGATTTATCATATTAAGT
AACAAAAAGTTATCAAATGGTACAAAGAATGTCAGCTCAATTTCATTTGA
AAATTTATTTCAATTTTGTCAAACAGCTCTCTAAATCATTTATCATGTAT
AAGAGAGAATTTAAGTTGACATTTTCTCTCTTTTTTACCAGGGTTGGTTC
AAGGGTGTTATTTTCGTTAACGGTAAAAATCTTGGTCGTTATTGGAAACG
TGGTCCTCAATTTACACTTTACGTTCCAAAACAGTGGTTGAAGAGTGGGA
TTAATACTGTTCTGGTCTTTGATTTGCACGGTGAGCAGTCCCATCACTGT
GACGGATTTCCTTGCATCGAATCTGTTGATACTCCTGATGTTGGAGCCAA
AAAAGAATTCCACATTTGAAAAAATTGACACAAAATATGATTGGAAGGGA
TTTATTGAAATGAAATGAAAACTTTAAGACGGTATGCGTTACTTTTAATC
GAGCTTGACAAGGTCTTGAGAGTAAACCTTACAGCAAGTTTTCTGTACAC
AGACAATTATCTACGGCTAATTTCAAAATTCATTGCCGTAAAGGGTCTGT
TGTCATTGTCTTTTCTGATTTAAGATTTTTCGAACCAACCGCTGCAAGCG
CGCGCGAGAGAAGAGAGACGAAGAGAGATCTATAAATTGCTATCTATAAA
TCATAGTCATTATAAAGAAAAACCGGTCTGGCAATGTAATTTTTAGCTTT
TTGTTCAATTTTTTTTTTGTTACAAACAAAAGACAAGTTGCGATTTGCAT
ACTTTTTGATCTTGGGATTGGTCTATTTTCTAATCACATGATCAAAAAGT
TTGCAAAATAAATCGATTTTGGTACATAAGCTCTATTATTTAACAATAAA
AAGAGACAAAAGCCTTCCAGACCAGTGTTTTTATAATGACTATGTATAAA
TCATACTTCATCACATCGAGGCTTCCGTACGGGAATTTTTTTGTCAAACA
GACAAAGCGCACATAGTGTACTACGAAGCGATAAACGTGAGATACACACT
GGTACAGAGTATACAATAAGGTGTGTCAGTGATAATGTAACCTTGAGCTT
TTTTGATGAGGCTTGGGTTTTTACCGGGATGATTGATCATATAAGGATGG
AGGAAGAAACATTTCTCATTTTATTTTTCCTAAGTTTCTTGCAGGGAAGA
TTAGACAAAGTCTCCTAGGTGAGATTTTGCGACAATTTAATGAAGAGGCG
AGTGTTACCTCGGGTTTTGATTACGCTTTTGTCTTGGGATGAAGATGGGG
TTGTTTGGGATAATCAGATCACTTCTATGAAGTGTAAATATATTTAACCG
ATTTACGGTCATGGGTTTAAAAAATGAATTTAAATAAATGAATGAAAATA
AATTTAGCATTTTAAATACCTTTCATACACATTCATTTTATTTATACGGT
AGATGAAATTAGAATGATGCATTTTTATAAATTTTAAAAATTTTACACAC
ACAAAAATAGAGAATATTACTCATATTATAATAAAGAGAAATGTAAGTGA
TAAAGTTATTGTATTCCATCACCACACCCGCTTTACGTTTAACACATAAG
GGAGGGAGAGGGGGCAGGTTAGAAAGTATGTGCCTGTAAACGTAGTACAC
TGGACATCACATAACAGTTTTACATCAAATCTTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000234_pilon:507107..514990- >MSTRG.19881.2.p1 ID=MSTRG.19881.2.p1|Name=MSTRG.19881.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3030bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000234_pilon:507107..514990- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTTGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGTTAACGGTAAAAATCTTGGTCGTTA
TTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACACTTTACGTTCCAAAACAGTGGTTGA
AGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTCTTTGATTTGCACGGTGAGCAGTCC
CATCACTGTGACGGATTTCCTTGCATCGAATCTGTTGATACTCCTGATGT
TGGAGCCAAAAAAGAATTCCACATTTGAGCTTGAGAATAATCCAACACTA
TGGGAGCCATCGGATGGTGAAAAGGAGAACTCACAACCTACACTTTATAA
AGGTTTCCTAAACATTGATGGTCCTCCGAAAGATACATACTTTAAAACGA
GGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAATAGTGACGCGACTGGATGGA
CCATATACCCTTTACAATTTGACGAAGATCTTGTTTCAAAACTGGGTCAG
CAAACAACATCAAGATTCTAGTGGAAAATGCAGGACGTGTTAATTATGGA
AAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGGTTTTGATTAACGATCGATTGGTCG
AAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCAATTACCGTCAACGTTGAAGGTTAT
ATACGGGGTTGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGTTAACGGTAAAAATCTTGG
TCGTTATTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACACTTTACGTTCCAAAACAGT
GGTTGAAGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTCTTTGATTTGCACGGTGAG
CAGTCCCATCACTGTGACGGATTTCCTTGCATCGAATCTGTTGATACTCC
TGATGTTGGAGCCAAAAAAGAATTCCACATTTGAGCTTGAGAATAATCCA
ACACTATGGGAGCCATCGGATGGTGAAAAGGAGAACTCACAACCTACACT
TTATAAAGGTTTCCTAAACATTGATGGTCCTCCGAAAGATACATACTTTA
AAACGAGGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAATAGTGACGCGACTG
GATGGACCATATACCCTTTACAATTTGACGAAGATCTTGTTTCAAAACTG
GGTCAGCAAACAACATCAAGATTCTAGTGGAAAATGCAGGACGTGTTAAT
TATGGAAAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGGTTTTGATTAACGATCGAT
TGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCAATTACCGTCAACGTTGAA
GGTTATATACGGGGTTGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGTTAACGGTAAAAA
TCTTGGTCGTTATTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACACTTTACGTTCCAA
AACAGTGGTTGAAGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTCTTTGATTTGCAC
GGTGAGCAGTCCCATCACTGTGACGGATTTCCTTGCATCGAATCTGTTGA
TACTCCTGATGTTGGAGCCAAAAAAGAATTCCACATTTGAGCTTGAGAAT
AATCCAACACTATGGGAGCCATCGGATGGTGAAAAGGAGAACTCACAACC
TACACTTTATAAAGGTTTCCTAAACATTGATGGTCCTCCGAAAGATACAT
ACTTTAAAACGAGGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAATAGTGACG
CGACTGGATGGACCATATACCCTTTACAATTTGACGAAGATCTTGTTTCA
AAACTGGGTCAGCAAACAACATCAAGATTCTAGTGGAAAATGCAGGACGT
GTTAATTATGGAAAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGGTTTTGATTAACG
ATCGATTGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCAATTACCGTCAAC
GTTGAAGGTTATATACGGGGTTGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGTTAACGG
TAAAAATCTTGGTCGTTATTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACACTTTACG
TTCCAAAACAGTGGTTGAAGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTCTTTGAT
TTGCACGGTGAGCAGTCCCATCACTGTGACGGATTTCCTTGCATCGAATC
TGTTGATACTCCTGATGTTGGAGCCAAAAAAGAATTCCACATTTGAGCTT
GAGAATAATCCAACACTATGGGAGCCATCGGATGGTGAAAAGGAGAACTC
ACAACCTACACTTTATAAAGGTTTCCTAAACATTGATGGTCCTCCGAAAG
ATACATACTTTAAAACGAGGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAATA
GTGACGCGACTGGATGGACCATATACCCTTTACAATTTGACGAAGATCTT
GTTTCAAAACTGGGTCAGCAAACAACATCAAGATTCTAGTGGAAAATGCA
GGACGTGTTAATTATGGAAAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGGTTTTGA
TTAACGATCGATTGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCAATTACC
GTCAACGTTGAAGGTTATATACGGGGTTGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGT
TAACGGTAAAAATCTTGGTCGTTATTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACAC
TTTACGTTCCAAAACAGTGGTTGAAGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTC
TTTGATTTGCACGGTGAGCAGTCCCATCACTGTGACGGATTTCCTTGCAT
CGAATCTGTTGATACTCCTGATGTTGGAGCCAAAAAAGAATTCCACATTT
GAGCTTGAGAATAATCCAACACTATGGGAGCCATCGGATGGTGAAAAGGA
GAACTCACAACCTACACTTTATAAAGGTTTCCTAAACATTGATGGTCCTC
CGAAAGATACATACTTTAAAACGAGGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAG
ATAATAGTGACGCGACTGGATGGACCATATACCCTTTACAATTTGACGAA
GATCTTGTTTCAAAACTGGGTCAGCAAACAACATCAAGATTCTAGTGGAA
AATGCAGGACGTGTTAATTATGGAAAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGG
TTTTGATTAACGATCGATTGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCA
ATTACCGTCAACGTTGAAGGTTATATACGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000234_pilon | genome | sc0000234_pilon:507107..514990 - |
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