|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000216_pilon:138282..148962+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.19186.2.p2 ID=MSTRG.19186.2.p2|Name=MSTRG.19186.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10681bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:138282..148962+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TACTGGGTTGCTTGAAATTTATTCGACTCTTGTCACGTGGTTCAAAAATG
GGCCAATCAAATCGCAAGTTACCACCAACACAATTGGAAGACCTGACCAG
GAAGACAACTTTCTCACGTGAAGAATTGAAAAGTTGGTATGAGAAGTTTA
TGAAGGATTATCCAAATGGTTTTATgagtcaaaaacaatttttgaaagtt
tatcaAGATTATTACAAGAAAGGTGACCCGTCTGGTTTCTCAGAGCATGT
GTTCAGAGTGTTTGATGCCAACAATGATGGAAAAATTGGTAAGTTTCTTT
CGTTTTACGGTTTACTTACCTAAAGGGAAAAAATTGTCATTCCCCaaaat
tgtgctatttttcGGCTATCCCCCAAATTAGATTCCCGCAAAAACTTCTT
ACTTTAAAGTTTATTCATCGAACTTTATAACTACCGTTATGACGTGAAGA
TTGCCAATGTCTCTAAATGATAGACTGggctttttagttttttgttgaTT
CTTCCTTCACAGAATTATTTGCAAAATCCACTCAAGTCCTTATTTTAGAG
TTTGGTGAGTAAATCCCGATGTTAAGGCCAATCAACCTCGTctccgtgta
tcccaggctttatttacgttactgatgggtGCCAGAGATTCTGgagctat
cagtaagcataaaaaggCAATTAATAGGCAGGAAACAAGGCAAAAGGGCG
CTGCAATCTCTTCTTTAGCTCCAGTGCTTTTTTCGtgtttggagaaaaga
ttatgtCATACAGACTAACTTTCCCCCAAACGCGAGACTTCAGTAAAGAA
ATTTTCCCCATTGGGGTTCGTTGGGGTTAACAGGGTTAAAGTGAGGTTCC
TTTCTGTCCCGGATGGTGCACTTAGGCAAATGTATGTCATGTGAGAACAC
CTGTTTTTATGATAGTCGTGACTTATTTTTCCTCGATAACTATCTTcgaa
tgacaaaattttttccTTCCTCGAtctaatattttctctttcacAATCAT
TCAAATTCAGAAAACAGAAATATTATCTGTTGCTCTGAACGAAACTTTTC
CGTAATAAAAATGCTCTGATAATCAAACCGCACCTCGCGACTCTTTCTTT
AGACTTTCTcttgttacacgttttttatctTCACCCATAATTCTTATCAC
CTATCATATATCAAAATCTGTTATCCTATGTCGCTATGTGACTATAGACA
AACAAAGAGTACCTTCAAATTTggggggggggAAACCTCTGAAACCAGAC
ATGCTAGATGAAAAACTGACCGCACCCAAAACTTAACTTACCAACATGAG
CTAAGTTTTTTAATACTTACTGGTTTTTTATCCGTTATACAATTTTTCTG
TCAGTCCAGAAATTCTGATTCAAGCAAGACCTTATTCAAATAgagcatca
aaacaaaatataccTTCCCAAACGGACCCTATCGTGACCTTTTTTGCCTT
AGCCAAAGTCgagaaaatttcatttgaagTTAATGCATGTGAATCCtttt
tttttCGGTACCTGTCTTATTAAGAATGTATTTTAAACACCCCCTTTTCC
CAGACCCGGgggaattttttcagccagtggagataaaaataacggactga
aactcgatggggattgatattcccatagtttttatggctggggatttcaa
ttcttttgttttcaaatcagaaaattcaatagGGGATGgaaatgaaatga
atgaaaatagcataatgttttgcagtgaggattggtttgttTGATTATGT
TCCAGTGGAGACAAatattggaggataattttcaatCGGAGACGATCTTT
TTCAAGTGGGAAGGGTtccaagtgggtctgtgagaagggagtatTTTAAT
GCTACAACCCTTTATAACACTTTAGAGATTATCATCCTTGGTTATTGTGT
ATGAGACCAGGGCTCGATTCCAAGTCAACTCCAAAGGCAGTGATCTGAGG
AGTTTATCATAGACTACTTAATGAAGTCAAGCACTAAGCTTTATATAAAA
CCTGGAGGCAGTTTTTAAtcccaaaaatctttgatcgaagttttttttaa
agtagtaccctaatggtagcactactcaatagtggtGTAAAACTTTTCCT
ACTTTTCCTTCTTGAACACTTGAGATGTAGCGCCGCTTGACGTTAAAGTC
TCAACACTACAATGGTCTCTTTGCAAGTACCAGctccaaaaaaactccga
taaaaaTGGCAGATCTAGGGTTTACGCAGGTCAGCGAAGTCAAGTGATGG
TAGGTGTGAATAATTTATATTTTCGTATGTCCTATTCTTTAATTCCATAG
ATTTTCGCGAGTTCATTTGCTCCCTATCGATGACAACTCGAGGATCAATC
GATGATAAACTCCGCTGGGCTTTTCACATTTACGATGTTAATGGAGACGG
TCGTGTGTCTATCAACGAAGTTTCATCGATTGTGAAAAGTGTTCAAGCTC
TGGCCAATGTCCATGACAGTAATTTGAGTGAGGAAAAACTTCaacaatat
tttggaaaatgcGATAAAAACTCGGATGGAACTTTAACTGTTGAAGAATT
TGTTAGAGGGTCACGTCAAAATCCGTTGTTCATGAAATTGCTTATTGATT
ATATTCAGTAGTATGTAATTATTAAATCACAATTTTTTGTAATCTAGCCG
ACCCCTAGCAGATCACCGCTAGATTCAatcatctcattttaaaactcaTT
CAAGAGAGATGTTGAAGTAGACAATCCCGAGGCATTGTAAGTAGTTTTGG
AGCTGGCTATAAcgctttggaaaatatttttcataaaattttgtttgctt
ACCTACCGAGATAGATGTTAAGTGAGGAACCTTCAAACATCTGTTTTTTC
GTGATCTGGAAAAAACCCCTACTCACAACGTGTAACGTCATTTTAATGCA
GTTGAAAAGTTCTAATAGGGAAACTGTGCCACAGCCTTACTGAGGGCAAT
ATTGATGTCCCATTgggtgaaaaactttctttccgaaatttccaaaattt
gaaaatctcatGTTCCCAGGAATTTCCAATATTCAAAGTGACCCTTTTTA
TCGATATCATCAGAGAAATCTATTGCTTATTGACTTTGTCTATTAGTTTC
TCGGCCCTTTGGTCGGCTAAATGATATATAACTCCGGCTCCTTTCATTGA
ATATCACTTACCTCGAGTGAGTTAATAAATCGCAATAACTAATTAAAGGC
CACAAAATAtctgttttttgtttcataatttTGGGTAAACtcaaacccag
tcccttagtctGCTCTTTTATGATTTCGATAGCACTAAatgtccatcagt
aaaatcaacaAGTGGTCCTGGGTACGAGATTGCTCAGTTATTGAAAAACG
AACATATGAAGATTTTTCTTCAgattcaatacaccttttcgaccgtaatc
gcgcggtcaggcgcgtgccactttatcaaatttaccaccataaactcgat
ccaatcctttttttacacttttttctattgtcttcagGCGCGAAAAAAGA
CTgtgacggttttagggtggtaaaacggacaaaaaaattcccgcgcggca
attggcggctacggttgaaaaggtgtattgagtTTGTTCtcagttttatt
tcaaaaagttattaGTGTATCAAATAATGACTCGTTATAAAAATTATTGT
ATCTGTTGTATAGTTTGTAATATAAAGTTTTGtgtaatttcaaattattc
aaaaataatctaTATTAATGGTTGGGTTTGTACAGACCTTTTGTTGTTAC
GTATCATCTAATATGTTATTTAGTTACATTCTCATTACCATACAGTAGAC
ATTTTGAAAGGTACTTTTACACACACCAACTATACTGGACCATGAAAAAT
CCAAGCCAAATCTAGCTAAAAATCCTGCAAAAACAGTTATTtacactggc
ggatttaagacaatagagcaagtatgtCGGTAACatacgaaggagtgcaa
cgctcgttaaaagacaataaaattacaattacaaatctcttcttcTGATA
AGTTCAATGTGGTGTAAAACCGCCTATGATTTAGTGACAAATCACTATCT
GAGAAATAACCAGTcctcgaaactctcccgccgattttttctcCCGAATA
CCGCCATACTTCCCCGCCTTTAccatcactgtaacggacgataacatcgt
ctactgAAAGTTTAAGTCGCTGGCCCAGTGTTGTTCTCCTTTATTCTCTT
ACTCGTAATTTGGTGCACTGGGAAAGATTGTTTTCCAATTACTTCTTAAA
GTCCGTAGCCTTTTTGAGGGTGTGTTACAAAATTCAGGTACATCTCGGAT
GGGCAAATTGACTTTTCAAACAGCGATTTTCCTTCGTGTATATGGTCGGA
ATCATGTACATGGTCAGGGCAAGAGCAGCCAACGGCTAGAAGTTAtctgt
ttttttcaaaacaaatctgtTCTGATTTGTAATTTTCTCTGGGAAATCCG
TTCTGTTCTTGCCATACTCTTGGATAAACTTATTACTTACTGTatctgtt
tttgaaaaaaaattaggttccTGAAAATTTAAATCTGTTCCGAGTTAGAA
TTATGTTACTGGAAAAATTCATCTATTCTGTGTTGTTATGTTCTTTAATT
GAGTGCCCTGGATTCTTGAGACAAGGGACATCTGAGAGGTCTGCTGGAAA
AGTAaatgttattttattaaaatttactGCTCatggattttcattttttt
tgtagtgCTTAAAAGATAAGCTGACTCCTTGATTTTACTCCAAAATTCCT
TCTCCTGGGAAAAAGGAAGgcatattttgagaaattccgcGGCTGGATGC
TGCTGCCGGGGGACTTTTTAACTTAAATCTTAATTTTACAGTCAAAAAGA
CTTAATAACTCATTCCGGTGAAAAGTAAGTTGTATTTCGTCAGCCCAATT
TTCTGGATGgggcttacacgtttttttataagaacatccaaagtttttga
agccctttggatgttcttatttttttcagttctaggcctaaaaatgtttt
taaaattttccttgtgttactattttgtgagtatttttgttcaattaCCA
TTGGGTGTGTCCAAAaggccttaaaatattcttaacttattcttagtACG
GAATGTATTTCCATCTCACTTTGCTAAGATGATTGTTACCCCGATCTTCA
AGAAAGTTGACAAGGAAAATCCAACAAACTACCGAGCTATTGCCCTTCTG
TCAATCCCAGGAAAAGTTTTAAACCGTATCTTACTGCAACATATTCAAGC
AAAAACGGAGGAAATTACAAGCGATAGGCAGTATGATTTTAGACCTAACA
GAGGGACAACAGATGCGATATCCGTTGTCCGGCAATTTATGCAAAAATCC
AAAGAGAAAAACATCAATCTTCATTACCACTTCATTGATTTCAAAAGTGC
ATTCGATACCATGGAGAGAGGCTCTGTGGAAAATGATGAAGCGAATCGGC
GTCAACGAAACTGTAATTGAGGTGATCAAAAACATGTACGAGAAGACCCA
ATGTGCTGTCAACGTAGATGGTAAATTAACCAATTGGTTTGAAGTGACAG
TAGGTGTGAGACAGGGATGCTTGCTATCACCAACTTGCTGTTCAACTTAT
TCCTGGAGTTCGTGATGGATGAGCTCCAAGAACTACAAGAAGCGACAATC
TTTAACAATGGCTTGTGTATTGATGTTCGCTACGCAGATGATACCACCTT
GATAGCAGCTTTCTTTGAGAAACTTCAACTCTCCACGAATCAACTACAGG
ATGCCTGTTTGAAGTGCGGCATGAAAATCAATGCTACAAAATGCAAAGCC
ATGACAGCCAGCCCTCAGCCAGTTGTAATCGACAATAAAAATGTTGACAC
TGTTCAagacttcattttccttggatCAAATGTTCCTAGTACCTCCACGG
ACTTTCACTTGCAAATATTGCCTTTGGAAAACTAAAACAGAAGATCTGGT
TAAGGAGAGATGTCTCAAATGCTCTTAAAATTCGACTGTACAAAGCTCTC
ATTCTCCCAATCGCAATATACGGCGCGGAAACCTGGTCTCTAACACAGCT
TGATGAAAACAAGCTCTCAGTATTCGAAAACAATTGTATTCGCTCCATAC
TGGGGATTAGACTCCAAGACCGGATATCACTCAAACGGCTACGTAAAAGA
GCAAAGCTCAAAATGCAGATTGTCTATATGATAAAAAAGAGACGCTTGTC
TTGGTTTGGGAATGTAGCAAGACTGCCCGAGGAAATTCTAGccaaaatat
gtttgaaaaatgaattccAAGGCACACGAAGAAGAGGTAGACCTGCAAAA
AGATGGCAAGATAAAAATCAGAGGTGTGCTGATAAGTAAGTCAAGTATTC
TTAGTATTTgtgctatcgaagccttatatagtttgttcttatgaaaaaat
gtttattcTCAGTCAAAATTTACAAGTCACCTGGCACTGCACTGGCGGAC
TTAAGACAATAGAGTAAACACGttggaaacatgcgaaggagtgcaacgct
cgttaaaagacagaATTTATAATTACAAATCttttcctctgataagtttg
acatggtctaaaaccgcctatgggTACTGAACTTCTGgtctttcaaaatc
ttgaatttttttaaacttatacATCCACagacagtggagtctccataact
cgagccCACACAGGAACATAGTTTTATTCGAGTTATGGGATCAGACCCTT
TAAACATCTGTATATTAGCATAGCAATTccaaattaaaaagaatttagtA
TATTGTGTGCGATCAAGGTTTAATTTGGTTACTGTTGCAATTAACGGTGT
ATTATTTAAAGCAGtgttaatgacaattttatatTTGCTTGATGAGCAGA
TTAAAGGGTTAAGTTATCATGTTCAGCGCGTGCCACATTACACCGCACTG
AAGCTTTAATTAATAAATGCtttttttAAGAGAACAAGTAAAAATGTCGG
TCCCAATGTTCATCATTTTTTCGAGATTTGCTATTCTTATATTCACAATA
CTCTAAGTTTATTCCCCTTCAAAGCCATTAGTATATTATGTTATAACTTT
TCTGAGGTTAATtcttaatttcttttcaaaggtttgttttaaaattttgg
tctcttgttctcataaaattgttcttataataaatgAGCATTTTCGTACT
TCTGTATCTTGTAGCAAGCACAAAACATCAAAATGGCATCCATTTAACGT
CCTTGGTTAACATCCTtctaacgttaaatgaatgATTTAAACGACGTAGT
CATAggtcatacacgtttttttttcataagaacatccaaaaattttgaag
ccttgggatgtttttaacttttcgagttttcagcctaaaattgttcttac
atgttcttattttcgccattttttgagtaatcTTGCCTATGAAATTCGCT
Gttctagagtccgcaaagctttaaaatgttcttaacttgttcttaacatt
ttgaccatcgaaaccttatgttcttatatagtttgttcttataaaaaacg
tgtagttagtCTTTGCGTTCAAAGGTCATAGaaaattaaattcattttgT
TAGGTTGTCACagagcccgggggggggcactgggtttgcggactgacggt
atgtgcgggccaaaaattggcttttaaaattgcacccttacagtgcagca
aaaatcagtgaaaatcatacccttagagtgcattttccccaacattttct
atccttttcgtgcaaaaaatggtcaaaattctagcatttttggtcaaaat
atctagatttttcaaaaattttctgaaatttctacccttacagtgcatct
ctagtttttccgacccttacagcgcATTTTAAACATgctggaaaaggtac
ccttaggacccgcacatacccgtcggtctttttgcccagctgcccccccg
gGTCACAGAGATATATCCCGCACCCCTAGGTGTTTTGAAATTTCggtgtt
tttttttgcctgaaactCTTTGCCGTTTTGGACGAAATGAGCCCTATGGA
TTGATATGTAGCTTGGTGCGATTTGGAAACCAAGCAGAGGCCTAAAGTTC
TTAGAATCACTTCTTTTACTTCTATATCATGGGTGCTTAGCTTGCTGGAT
AACTAATAACACCGAGATGAGATTTTAAGATTTGATTTCACTCTATACCA
CGCTAtatcacattttgaaaaattgaccctttaaaatcgaattttgaaaa
ctttgttaTCTTGCCTTACTTTCAGcaaaaactttttaacttttatccaa
aattttacgaaaattgACGACCCTGCGTGGGAGTCGATTGTTGATCTTTC
gcaattttgggaccctttcagaaaaacaattGGCGATTTATGGTTTTTCT
ACCCCTTCAAGATACTTTTGAGGGTGTAAGAAAGGGACCCTGATGGCTTG
CGTATAACCGACACCCATTTAGCCTCCCCTGGGACAGAAACTGAAAAAAT
GTTGaactttgaattatttttgataatTtttaataataatatacttttct
aaaataataatagtatcttaatCTCTTCTgtcacaaaaaatatattttgc
ttttattttacaaaaaaaatcctttttaatcCAGACTTTACTTAATTACG
GgtctaatgcacaaaaaaatttattgttttacaAGCAAAATAAGGCGTCA
CTTAAAACGTAAAAATCCTAGAGTTAAGTACTGAATGATTATGGTAGGCT
GAGATATATTTCACAAAATGATCCacgaatatatttttttataggaGCAG
TTTCATAAAACGGTTGATAGGAACGATCTCTTGCTAGGCTTGTCTTTGAT
ACCTAAAGGCTTTTGATTACTTTTACGTACATTTCCGAGTAagttttttg
attaaaaatatccgaaaaataaTCTTCTAGCTAACAGGTGGTATCCAATC
ACAGGGCTATTTGAATGGTGGCGAAATCTTGAGTAATTTGCTCTTTCCCT
TTTCAGGAATCCAAAATTCGCTGGTGTAAATTTTGTGAGACTCCTCAAAA
TCCGCTACAGTAAGTAATCAagcataaataaataaacttcACTTTAaaat
ctgtttttcttttcaaaaaaaaataaaagtcataataaaatataaatact
gGCAGGAACTTGGcgacttttttctttctttataaatatattacaaaaaa
aacaacactcAGAAAGAGGTATTTCACTTTTCGTTTtctagtcatttaaa
aaatacacattggttatctttgaagaaaaattcatacGCCTTTGATTGTG
ATCAATTTTCAGCAATCCAAGGTAATACAGTTTCTATGAGAATGTCATTA
TTATGTCGCAGGATTTTTCCAAAGGCAACCAATGTTTTAGATACTAGAAT
TTTTAGGgggaaaatgcattaaaaagatataaaaCTATTACCATTAGAAA
AGCTATAGAGAGATTTTTCCATAACACCTTGTCCTTATTAAAGTTAAGTA
CCAATCTTTAAACATTTTGTTCCTCTCAGCTTCTGACAAAAGTGTCCTCA
ATTCTAGCTTCCTCCTTTTCGTTAACAATTTCTCCTTTAGCCAGTCCTCA
GTGCATTTTTTAAAACGATGGCTATTGTTTTCGATTTTGGTACTGCCTAA
AAtctttcttgtatttttgagaatttgacTATAATCTTTAGCATCCAAGC
CAATTTGTCCTGTACTATTATTACTACTTTGATTATTAGCTGCTTCACTT
GATTTCAAGTTCTTTGTTTTTTGTTCTTCattaaataaagaaaagaatga
GGTGTAAAATTCCATTGCGTCTTTCTTGGATTTGATTTGAGTATTAGCAC
CACTACTGGCACCCGTTTCGCCATCAATAGTTTCTAAGTTTCTTCCTCCA
CTTTTACTGCCACCAATACCAAAACGTTTTCCTAAAGAACCGAATGCATT
TTTTGATCTCTTAGTAGGTATACCGCCTCCGGCGCCCGGTATTCCGCCTC
CAGCGCCCGTATTAgtcctttttgttttcatactTGTCTGACGCCTCCAT
CCAAACGTTGGCCCACTACCAAATGGCAAAGTCCTCGCAAGATGTACCAA
ATAAAGTAGGTAGATTAATGTGCCGTGTATTCTCATCCTATATTTTCTat
attaaaaaagtttctaaaatttcaatCGATATTCATAAGAATTCAACCAT
CCAAAATGAAACCAAACAATAAATCTACTTTGAAGAGcagaaaaaaacca
aaaacaaaaacaattctctTTCTCTCCTTATCGTTGTCCAATTTACTTTC
CGATTGCAGCTCGTTTGATTCTTGTTGCACGTGGGGTTGTAATAATGCAC
AAATTTGAAGACCAGATTtcaacaaaatgtaaacaaattggATTAAAGAC
ACCCTCTGTTCGATGTCAATGCAATTAAGGTATGCGTTTAATTCGTTACT
TTTTCTGTGTCGtttttttgtgcaatctgcttttcttctacctcttttgt
tgtgctttgtgttgtatttttgtATCGAATTAAGCAAATCTTATATTCGT
TTTGTGTGTAATGCAACTTGACGGAGAATGTAATGTCGTTCAATGaagtg
taatttttttatgtgacactaaaatggaaaaaaaaataattggaaAAATA
TTAATAAGTAGATCAATTTTGTGGTCAGATTCCACTACAATAGATTGAAA
GACCCTACTTTTACTTAATGGGTCATAATTG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000216_pilon:138282..148962+ >MSTRG.19186.2.p2 ID=MSTRG.19186.2.p2|Name=MSTRG.19186.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=528bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:138282..148962+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGCCAATCAAATCGCAAGTTACCACCAACACAATTGGAAGACCTGAC CAGGAAGACAACTTTCTCACGTGAAGAATTGAAAAGTTGGTATGAGAAGT TTATGAAGGATTATCCAAATGGTTTTATgagtcaaaaacaatttttgaaa gtttatcaAGATTATTACAAGAAAGGTGACCCGTCTGGTTTCTCAGAGCA TGTGTTCAGAGTGTTTGATGCCAACAATGATGGAAAAATTGGAATCCAAA ATTCGCTGGTGTAAATGGGCCAATCAAATCGCAAGTTACCACCAACACAA TTGGAAGACCTGACCAGGAAGACAACTTTCTCACGTGAAGAATTGAAAAG TTGGTATGAGAAGTTTATGAAGGATTATCCAAATGGTTTTATgagtcaaa aacaatttttgaaagtttatcaAGATTATTACAAGAAAGGTGACCCGTCT GGTTTCTCAGAGCATGTGTTCAGAGTGTTTGATGCCAACAATGATGGAAA AATTGGAATCCAAAATTCGCTGGTGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000216_pilon | genome | sc0000216_pilon:138282..148962 + |
|