MSTRG.17604.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.17604.1.p1
Unique NameMSTRG.17604.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000179_pilon:382115..396133-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.17604.1.p1 ID=MSTRG.17604.1.p1|Name=MSTRG.17604.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14019bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:382115..396133- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGGTCTATTGAATTTTAACTTACCCATTTCATATCAACGAGAGTCAACC GTTTTTATTTTGTTTCTTAGGAATCGTTCAGGTCCAGCTTTTACACCTCA TGCACATAAACTTAAGGGCGGATTATTTGGATTCAATTACGGCGTTCGAA AGACTGGTTTTATCAAAATTGGTGATCCTGTTTACAAGTTGAAAGAATTA CAGACCAGATCTAAATTCATGAAAAATGACTAAAAACGATTAGACTCACG TTTATAATATTGCCATATTTTACGAAAAGGATTTGAGAAAGGATTATTCT GCCTGAATACTTTATTGGACATGAATTTTTACACAATTAGACCGTGCTAA TATAATCTATTCAAAGATTTACAGCCCTTTTCCCGAAAGTTTCGGGAATC GATGAATTTTTTTAAGAGACTATCTACGTTGCATTCAATGCTCATAATAT CCATTACATATGTTATGAACTTTTCCAATGTGTGCGTGCAACAATTTATC GACAACACACGAATGGACTTGTGATATATTTATCCCAGATGTTTTATTAC ATTTTTCATGTATCATATATTACAACGCTTTCTTAAGAGAAAAATAAATT TTTGCTGAGGCTCAGCTGTTATCATATTTTCGTTATCTGTAGTTATAACT TATGTTACTTTCCTGAAATGGCTGGAAATGCTCATAATTTGTTCTAAAGT TGTTCTGACTAAATTTGAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000179_pilon:382115..396133-

>MSTRG.17604.1.p1 ID=MSTRG.17604.1.p1|Name=MSTRG.17604.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=8256bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:382115..396133- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATGATGTACACAGATGGTAGTCCTGTTTTAATATTATCACAACCATCACT
GGTTGATTTGAATGACAAATATACAGAAGAAGATCTTAGTATGGACCGAT
TTCGTCCAAACATTGTTCTAGAAGGCTGTAAACCTTACGAAGAGGTGTTC
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GGATGTAAATTGTACTGTTTCCCTACTGATGGGCCACCGAGGCGAACGAG
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CTTGTTTGGTCTATAACAGCAGAAGGCAATTTGCTTTGCTGAACGAATAT
GGAACATTTGTGACATTAAGGAAATATCCCAAATTCGTTTTAATTGATCA
AGAGATTTTGGGCGATGAAATTCGTTTACGAGCAGAAGGGATGCCTGATC
TTCGGCTGCCGTTGAAAATGACCAAGAAAGATGGTGACCATGTTGCTGAT
GTCACATGTTCCTTGAAGTTGTGTCAACTAAATTAATAAATGAACAGCGT
TTATACATATGTCTGATTCTAATACCATTGGTATACATCATCTGGAGAAA
GATTACGTCATCACCACCAAGGAGACGTGTTGTAGGTTACGTCAAAGAGA
TTCGAACACATCCAGTGAAATCATGCAAACCATATCATGTCAAAGAAATA
GAAGTCAGTTCATTTGGTTTAGAATTTGACAGGAATCGTTCAGGTCCAGC
TTTTACACCTCATGCACATAAACTTAAGGGCGGATTATTTGGATTCAATT
ACGGCGTTCGAAAGACTGGTTTTATCAAAATTGGTGATCCTGTTTACAAG
TTGAAAGAATTACAGACCAGATCTAAATTCATGAAAAATGACTAAATGTG
TGGCTATCAACGTTGTTCCAGACAAGGGTGCGATGAGCGACAAAAGTATT
CTGAAATATCTAAATGAGACACTTGGGGACGAATACAGATCGGTGATGAC
GTCATAATGGAGGGTGTTTATCCAAGTGAAAGATGATGTACACAGATGGT
AGTCCTGTTTTAATATTATCACAACCATCACTGGTTGATTTGAATGACAA
ATATACAGAAGAAGATCTTAGTATGGACCGATTTCGTCCAAACATTGTTC
TAGAAGGCTGTAAACCTTACGAAGAGGTGTTCACGTGTCTCAGGAAGCCG
ACGATTGGTTCGCTCAAGTCTTAAATTTGGAAGGATGTAAATTGTACTGT
TTCCCTACTGATGGGCCACCGAGGCGAACGAGAGACAAAGGTCAATATGA
AGTCTTTGAGAATTATGATAATACCCCGAATACTTGTTTGGTCTATAACA
GCAGAAGGCAATTTGCTTTGCTGAACGAATATGGAACATTTGTGACATTA
AGGAAATATCCCAAATTCGTTTTAATTGATCAAGAGATTTTGGGCGATGA
AATTCGTTTACGAGCAGAAGGGATGCCTGATCTTCGGCTGCCGTTGAAAA
TGACCAAGAAAGATGGTGACCATGTTGCTGATGTCACATGTTCCTTGAAG
TTGTGTCAACTAAATTAATAAATGAACAGCGTTTATACATATGTCTGATT
CTAATACCATTGGTATACATCATCTGGAGAAAGATTACGTCATCACCACC
AAGGAGACGTGTTGTAGGTTACGTCAAAGAGATTCGAACACATCCAGTGA
AATCATGCAAACCATATCATGTCAAAGAAATAGAAGTCAGTTCATTTGGT
TTAGAATTTGACAGGAATCGTTCAGGTCCAGCTTTTACACCTCATGCACA
TAAACTTAAGGGCGGATTATTTGGATTCAATTACGGCGTTCGAAAGACTG
GTTTTATCAAAATTGGTGATCCTGTTTACAAGTTGAAAGAATTACAGACC
AGATCTAAATTCATGAAAAATGACTAAATGTGTGGCTATCAACGTTGTTC
CAGACAAGGGTGCGATGAGCGACAAAAGTATTCTGAAATATCTAAATGAG
ACACTTGGGGACGAATACAGATCGGTGATGACGTCATAATGGAGGGTGTT
TATCCAAGTGAAAGATGATGTACACAGATGGTAGTCCTGTTTTAATATTA
TCACAACCATCACTGGTTGATTTGAATGACAAATATACAGAAGAAGATCT
TAGTATGGACCGATTTCGTCCAAACATTGTTCTAGAAGGCTGTAAACCTT
ACGAAGAGGTGTTCACGTGTCTCAGGAAGCCGACGATTGGTTCGCTCAAG
TCTTAAATTTGGAAGGATGTAAATTGTACTGTTTCCCTACTGATGGGCCA
CCGAGGCGAACGAGAGACAAAGGTCAATATGAAGTCTTTGAGAATTATGA
TAATACCCCGAATACTTGTTTGGTCTATAACAGCAGAAGGCAATTTGCTT
TGCTGAACGAATATGGAACATTTGTGACATTAAGGAAATATCCCAAATTC
GTTTTAATTGATCAAGAGATTTTGGGCGATGAAATTCGTTTACGAGCAGA
AGGGATGCCTGATCTTCGGCTGCCGTTGAAAATGACCAAGAAAGATGGTG
ACCATGTTGCTGATGTCACATGTTCCTTGAAGTTGTGTCAACTAAATTAA
TAAATGAACAGCGTTTATACATATGTCTGATTCTAATACCATTGGTATAC
ATCATCTGGAGAAAGATTACGTCATCACCACCAAGGAGACGTGTTGTAGG
TTACGTCAAAGAGATTCGAACACATCCAGTGAAATCATGCAAACCATATC
ATGTCAAAGAAATAGAAGTCAGTTCATTTGGTTTAGAATTTGACAGGAAT
CGTTCAGGTCCAGCTTTTACACCTCATGCACATAAACTTAAGGGCGGATT
ATTTGGATTCAATTACGGCGTTCGAAAGACTGGTTTTATCAAAATTGGTG
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AATGACTAAATGTGTGGCTATCAACGTTGTTCCAGACAAGGGTGCGATGA
GCGACAAAAGTATTCTGAAATATCTAAATGAGACACTTGGGGACGAATAC
AGATCGGTGATGACGTCATAATGGAGGGTGTTTATCCAAGTGAAAGATGA
TGTACACAGATGGTAGTCCTGTTTTAATATTATCACAACCATCACTGGTT
GATTTGAATGACAAATATACAGAAGAAGATCTTAGTATGGACCGATTTCG
TCCAAACATTGTTCTAGAAGGCTGTAAACCTTACGAAGAGGTGTTCACGT
GTCTCAGGAAGCCGACGATTGGTTCGCTCAAGTCTTAAATTTGGAAGGAT
GTAAATTGTACTGTTTCCCTACTGATGGGCCACCGAGGCGAACGAGAGAC
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TTTGGTCTATAACAGCAGAAGGCAATTTGCTTTGCTGAACGAATATGGAA
CATTTGTGACATTAAGGAAATATCCCAAATTCGTTTTAATTGATCAAGAG
ATTTTGGGCGATGAAATTCGTTTACGAGCAGAAGGGATGCCTGATCTTCG
GCTGCCGTTGAAAATGACCAAGAAAGATGGTGACCATGTTGCTGATGTCA
CATGTTCCTTGAAGTTGTGTCAACTAAATTAATAAATGAACAGCGTTTAT
ACATATGTCTGATTCTAATACCATTGGTATACATCATCTGGAGAAAGATT
ACGTCATCACCACCAAGGAGACGTGTTGTAGGTTACGTCAAAGAGATTCG
AACACATCCAGTGAAATCATGCAAACCATATCATGTCAAAGAAATAGAAG
TCAGTTCATTTGGTTTAGAATTTGACAGGAATCGTTCAGGTCCAGCTTTT
ACACCTCATGCACATAAACTTAAGGGCGGATTATTTGGATTCAATTACGG
CGTTCGAAAGACTGGTTTTATCAAAATTGGTGATCCTGTTTACAAGTTGA
AAGAATTACAGACCAGATCTAAATTCATGAAAAATGACTAAATGTGTGGC
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AATATCTAAATGAGACACTTGGGGACGAATACAGATCGGTGATGACGTCA
TAATGGAGGGTGTTTATCCAAGTGAAAGATGATGTACACAGATGGTAGTC
CTGTTTTAATATTATCACAACCATCACTGGTTGATTTGAATGACAAATAT
ACAGAAGAAGATCTTAGTATGGACCGATTTCGTCCAAACATTGTTCTAGA
AGGCTGTAAACCTTACGAAGAGGTGTTCACGTGTCTCAGGAAGCCGACGA
TTGGTTCGCTCAAGTCTTAAATTTGGAAGGATGTAAATTGTACTGTTTCC
CTACTGATGGGCCACCGAGGCGAACGAGAGACAAAGGTCAATATGAAGTC
TTTGAGAATTATGATAATACCCCGAATACTTGTTTGGTCTATAACAGCAG
AAGGCAATTTGCTTTGCTGAACGAATATGGAACATTTGTGACATTAAGGA
AATATCCCAAATTCGTTTTAATTGATCAAGAGATTTTGGGCGATGAAATT
CGTTTACGAGCAGAAGGGATGCCTGATCTTCGGCTGCCGTTGAAAATGAC
CAAGAAAGATGGTGACCATGTTGCTGATGTCACATGTTCCTTGAAGTTGT
GTCAACTAAATTAATAAATGAACAGCGTTTATACATATGTCTGATTCTAA
TACCATTGGTATACATCATCTGGAGAAAGATTACGTCATCACCACCAAGG
AGACGTGTTGTAGGTTACGTCAAAGAGATTCGAACACATCCAGTGAAATC
ATGCAAACCATATCATGTCAAAGAAATAGAAGTCAGTTCATTTGGTTTAG
AATTTGACAGGAATCGTTCAGGTCCAGCTTTTACACCTCATGCACATAAA
CTTAAGGGCGGATTATTTGGATTCAATTACGGCGTTCGAAAGACTGGTTT
TATCAAAATTGGTGATCCTGTTTACAAGTTGAAAGAATTACAGACCAGAT
CTAAATTCATGAAAAATGACTAAATGTGTGGCTATCAACGTTGTTCCAGA
CAAGGGTGCGATGAGCGACAAAAGTATTCTGAAATATCTAAATGAGACAC
TTGGGGACGAATACAGATCGGTGATGACGTCATAATGGAGGGTGTTTATC
CAAGTGAAAGATGATGTACACAGATGGTAGTCCTGTTTTAATATTATCAC
AACCATCACTGGTTGATTTGAATGACAAATATACAGAAGAAGATCTTAGT
ATGGACCGATTTCGTCCAAACATTGTTCTAGAAGGCTGTAAACCTTACGA
AGAGGTGTTCACGTGTCTCAGGAAGCCGACGATTGGTTCGCTCAAGTCTT
AAATTTGGAAGGATGTAAATTGTACTGTTTCCCTACTGATGGGCCACCGA
GGCGAACGAGAGACAAAGGTCAATATGAAGTCTTTGAGAATTATGATAAT
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GAACGAATATGGAACATTTGTGACATTAAGGAAATATCCCAAATTCGTTT
TAATTGATCAAGAGATTTTGGGCGATGAAATTCGTTTACGAGCAGAAGGG
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TGTTGCTGATGTCACATGTTCCTTGAAGTTGTGTCAACTAAATTAATAAA
TGAACAGCGTTTATACATATGTCTGATTCTAATACCATTGGTATACATCA
TCTGGAGAAAGATTACGTCATCACCACCAAGGAGACGTGTTGTAGGTTAC
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CAAAGAAATAGAAGTCAGTTCATTTGGTTTAGAATTTGACAGGAATCGTT
CAGGTCCAGCTTTTACACCTCATGCACATAAACTTAAGGGCGGATTATTT
GGATTCAATTACGGCGTTCGAAAGACTGGTTTTATCAAAATTGGTGATCC
TGTTTACAAGTTGAAAGAATTACAGACCAGATCTAAATTCATGAAAAATG
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CGGTGATGACGTCATAATGGAGGGTGTTTATCCAAGTGAAAGATGATGTA
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TGAATGACAAATATACAGAAGAAGATCTTAGTATGGACCGATTTCGTCCA
AACATTGTTCTAGAAGGCTGTAAACCTTACGAAGAGGTGTTCACGTGTCT
CAGGAAGCCGACGATTGGTTCGCTCAAGTCTTAAATTTGGAAGGATGTAA
ATTGTACTGTTTCCCTACTGATGGGCCACCGAGGCGAACGAGAGACAAAG
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GTCTATAACAGCAGAAGGCAATTTGCTTTGCTGAACGAATATGGAACATT
TGTGACATTAAGGAAATATCCCAAATTCGTTTTAATTGATCAAGAGATTT
TGGGCGATGAAATTCGTTTACGAGCAGAAGGGATGCCTGATCTTCGGCTG
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ATTACAGACCAGATCTAAATTCATGAAAAATGACTAAATGTGTGGCTATC
AACGTTGTTCCAGACAAGGGTGCGATGAGCGACAAAAGTATTCTGAAATA
TCTAAATGAGACACTTGGGGACGAATACAGATCGGTGATGACGTCATAAT
GGAGGGTGTTTATCCAAGTGAAAGATGATGTACACAGATGGTAGTCCTGT
TTTAATATTATCACAACCATCACTGGTTGATTTGAATGACAAATATACAG
AAGAAGATCTTAGTATGGACCGATTTCGTCCAAACATTGTTCTAGAAGGC
TGTAAACCTTACGAAGAGGTGTTCACGTGTCTCAGGAAGCCGACGATTGG
TTCGCTCAAGTCTTAAATTTGGAAGGATGTAAATTGTACTGTTTCCCTAC
TGATGGGCCACCGAGGCGAACGAGAGACAAAGGTCAATATGAAGTCTTTG
AGAATTATGATAATACCCCGAATACTTGTTTGGTCTATAACAGCAGAAGG
CAATTTGCTTTGCTGAACGAATATGGAACATTTGTGACATTAAGGAAATA
TCCCAAATTCGTTTTAATTGATCAAGAGATTTTGGGCGATGAAATTCGTT
TACGAGCAGAAGGGATGCCTGATCTTCGGCTGCCGTTGAAAATGACCAAG
AAAGATGGTGACCATGTTGCTGATGTCACATGTTCCTTGAAGTTGTGTCA
ACTAAATTAATAAATGAACAGCGTTTATACATATGTCTGATTCTAATACC
ATTGGTATACATCATCTGGAGAAAGATTACGTCATCACCACCAAGGAGAC
GTGTTGTAGGTTACGTCAAAGAGATTCGAACACATCCAGTGAAATCATGC
AAACCATATCATGTCAAAGAAATAGAAGTCAGTTCATTTGGTTTAGAATT
TGACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17604MSTRG.17604Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17604.1.p1MSTRG.17604.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17604.1.p1.exon8MSTRG.17604.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17604.1.p1.exon7MSTRG.17604.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17604.1.p1.exon6MSTRG.17604.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17604.1.p1.exon5MSTRG.17604.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17604.1.p1.exon4MSTRG.17604.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17604.1.p1.exon3MSTRG.17604.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17604.1.p1.exon2MSTRG.17604.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17604.1.p1.exon1MSTRG.17604.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000179_pilongenomesc0000179_pilon:382115..396133 -