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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000156_pilon:448931..459238+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.16494.1.p1 ID=MSTRG.16494.1.p1|Name=MSTRG.16494.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10308bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000156_pilon:448931..459238+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACTAGTGGATGGCATTTTTGTGGTTGAAGTCTAATCACTTCAAACTGGGT
AATTGCTTTACATCCTGGCCTAAAATATAGATATATCCTACAAAATTACT
ACGCTGAATGTTCTATCAAAATCCCGATTGGGATAGAAAATCGGTTGTTC
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TTGAACTTCGTTTTAAATCGTttcatgaaacaatttgaaacgaaaaaatt
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tgtaacatatattatatgtatagtttatcagtagacttgaatcatgatac
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cgtcagtcagggcgtacggaaggcgttttgacacgggaaattattattat
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aaatatttaataattcttGATTGCGACTTTCAattaatggagcgtatcga
atagacacccctgtctcagtaacccaTTGGGTCTTAAAAGTTCACCGGGC
TGACTTTGAAATGAGAAATATCCACCGGGGTTGAGATTTCCATTGTTCTT
CACTCGATTTTTACATCGGGTTATCGACCGGGGACAATCTGACCAGtcca
ctgatacaggggtgtgtaTAGTAAAACGTTGTATGGGTGAatgtagagag
tctatcaccatattagtaaagctcaaattgcagatgtagaacgataaact
cggtatacacAGTAGAAcgttgaattagagagcgtcaactgtaatacGAA
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TTGTACTGAAGGCCAATCACCAGACAGGATTACCGTCAAACCTTAGAGTT
CACAACAAAAACTATGATGAAACCTCTAAACAACGAATCCAAGTCAAATG
AATCATCATGCATCCAAGATACAGTAGATATAACCTGAATGCAGATATCG
CTCTTTTGGAATTGAAAACACCTGCTCAATTGAACAGTCGCGTACGTCTT
GCGTGCGTACCTCAAGTTGGCGTTTATCCACCAACCGGAAAACAATGCTA
CCTTGCAGGTTAGTAAAACGACGTTGACAGTCTTGAAAGGGATTAATCAT
TTAAGATAAGAACCTCCATGTCTCAAAAACTAAACGCATGCTTCAAAAGT
CTTTCCTGGGACTCCTTTGGCCAGAAGAAAGTCGTTCAGAATAAGAAATT
CCCCTCTCATACATGCGCAATACCTCAAGCTTTTACTCTATCAACAAGTG
TTTTCCATCGTTCGTTCGGAGAATAGGTTacatttttgtaatttctttgt
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TGGTCCGTTAGTCTGCCAAGGTAAGTGATGTTTGATGCAGGCCTGATATG
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gatatttttcccttttttcgaaAcccccccAACTTTCGAGAGGGAAAATC
CTTTGTAAAGTTTGTTTGCACAGTCTACACAATAGCCAAAATTCCACACT
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GATATAAACTTTTAAACTAATTGATTATTCGTTTCCTTTAAAACGCCACT
CACTTTTGTATGCCTTTTAAACAAGACCTTTTGCTTACGTCACAGAGGCT
GTTAAAAGCTGTAGCTGTGTTTACTGAAGTGAATTAAGGCCCCATTACAC
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TGTGAgcaattttattaaattctccTGTGTAATCAGTTGAAAGAATAGTA
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ATTATGAAGAATATTCAACAATAGCAGCCTATTGAAAGTGGGGATTAGTG
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TATTGTGCCCTCCTTTCATTCGACTTTCTTTTAGTTGGTTGTTTGTCTTT
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GTTCACTGCTCCAAGGCATggtgacacccccttctcacacgATGGGATTT
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AATGTACACTTTTgcgtttctcttttttctcaattttctctGAACAGCCT
CCGTGACGTCACATAcacaaaattgctttttaaaaaggggctttctgtaa
acaaaagaatttaactCCATTAAATAAAAATCATTCTTCTAGTCAAATCA
AGTATCCCTGATTCattaaaaccaataaaattaaaaaatgaggAGTCAAA
tttttaccgaaccattcctttaacgtctttttaaggttctttttcttttt
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ATGTGTACACTTATTGTAAATATTACACAGCGTATACACCCTTCAACAAA
TATTTACCGTGGGTTAGACAATACGTCAGTGGTGTTTAGAAGAACGATAT
GGAAATCATTAAAAGAACTTATAATGTAAAGATACGTGCAAATCGGAATA
AAATTTACTTATCAATCCAGTATAGATTCTTAGTGGGGAAAACATCCTCC
ACCTTGCTCGATAGCCATGGTGGATAAACAATCTCTCGAAAACGTAACCG
AACtttaaatctcgtgatccaaacTCCCAATGTTTACTAAAAAACCTTTg
acaaaaac Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000156_pilon:448931..459238+ >MSTRG.16494.1.p1 ID=MSTRG.16494.1.p1|Name=MSTRG.16494.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1422bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000156_pilon:448931..459238+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCATCCAAGATACAGTAGATATAACCTGAATGCAGATATCGCTCTTTT
GGAATTGAAAACACCTGCTCAATTGAACAGTCGCGTACGTCTTGCGTGCG
TACCTCAAGTTGGCGTTTATCCACCAACCGGAAAACAATGCTACCTTGCA
GgTTGGGGAACGACAACCCACCCAGGGATTTCACCAGCCATTCTCCAACA
AACGCGACTACCAGTTGTTCCAAGCCAAAAATGTCTAAACAGTCAAGAAC
ATGTCTGTGTTGGAAACGGATTCGATCCACGTCCGGATGGTTCCCAACAA
CCAAATGCTTGCCGTGGAGATTCTGGTGGTCCGTTAGTCTGCCAAGGTTC
TGATGGTCGATGGGTGTTGGATGGAGTTGCAAGTTATGTGTACACTTATT
GTAAATATTACACAGCGTATACACCCTTCAACAAATATTTACCGTGGGTT
AGACAATACGTCAGTGGTGTTTAGATGCATCCAAGATACAGTAGATATAA
CCTGAATGCAGATATCGCTCTTTTGGAATTGAAAACACCTGCTCAATTGA
ACAGTCGCGTACGTCTTGCGTGCGTACCTCAAGTTGGCGTTTATCCACCA
ACCGGAAAACAATGCTACCTTGCAGgTTGGGGAACGACAACCCACCCAGG
GATTTCACCAGCCATTCTCCAACAAACGCGACTACCAGTTGTTCCAAGCC
AAAAATGTCTAAACAGTCAAGAACATGTCTGTGTTGGAAACGGATTCGAT
CCACGTCCGGATGGTTCCCAACAACCAAATGCTTGCCGTGGAGATTCTGG
TGGTCCGTTAGTCTGCCAAGGTTCTGATGGTCGATGGGTGTTGGATGGAG
TTGCAAGTTATGTGTACACTTATTGTAAATATTACACAGCGTATACACCC
TTCAACAAATATTTACCGTGGGTTAGACAATACGTCAGTGGTGTTTAGAT
GCATCCAAGATACAGTAGATATAACCTGAATGCAGATATCGCTCTTTTGG
AATTGAAAACACCTGCTCAATTGAACAGTCGCGTACGTCTTGCGTGCGTA
CCTCAAGTTGGCGTTTATCCACCAACCGGAAAACAATGCTACCTTGCAGg
TTGGGGAACGACAACCCACCCAGGGATTTCACCAGCCATTCTCCAACAAA
CGCGACTACCAGTTGTTCCAAGCCAAAAATGTCTAAACAGTCAAGAACAT
GTCTGTGTTGGAAACGGATTCGATCCACGTCCGGATGGTTCCCAACAACC
AAATGCTTGCCGTGGAGATTCTGGTGGTCCGTTAGTCTGCCAAGGTTCTG
ATGGTCGATGGGTGTTGGATGGAGTTGCAAGTTATGTGTACACTTATTGT
AAATATTACACAGCGTATACACCCTTCAACAAATATTTACCGTGGGTTAG
ACAATACGTCAGTGGTGTTTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000156_pilon | genome | sc0000156_pilon:448931..459238 + |
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