|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000156_pilon:448931..459238+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.16494 ID=MSTRG.16494|Name=MSTRG.16494|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10308bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000156_pilon:448931..459238+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ACTAGTGGATGGCATTTTTGTGGTTGAAGTCTAATCACTTCAAACTGGGT
AATTGCTTTACATCCTGGCCTAAAATATAGATATATCCTACAAAATTACT
ACGCTGAATGTTCTATCAAAATCCCGATTGGGATAGAAAATCGGTTGTTC
CTAGGCTGAGAAAATAATTGGGATAGATTAGGAGTGTAATTTTTTCTATT
GATTTTCAAACGGGAATGAAACAAGGTCATTTTCCCATTGGGACTGAAAT
TGAAGGGTGTTGTCTCAAcgaggacgaaatttttgccacaATTTTCAGGA
TGGCTAGAGTCTGTGACACAGGATTATTTTATCAGTTTGAATTCGTGAAG
GTTAACAGAAAAATGATATGTGCTTTATACACATTGATCGGGTGGGTTTC
TTTCTAGATTATGGTATAGTAGGggggattttgttcgattttttggaatc
gcttgactgttttgttagaagcacttgttatacatttttggaaagctaag
gggtaggggaatcgaaattactatgtttccaattttttttcggacacttt
ggtgtgattttcggacaaatatgacggtctcaggcaaaaatcatagggtt
aaaaattaatgaaaattttagctcgagaaaacggagacctgttgtatatt
tttggaaagctctcaaaaaattaagattagagatatattgcaagtatagg
tgatttctgtacctaactcgagatattaacccttgaaaaccgtgtttttc
agccagaaacatagctattttgtccagtttttgcgcttttatAGCTCAAT
ATCtggagttaggtactgaaatcacctatacttgcaatatatctctaatc
ttaattttttgagagctttccaaaaatatacaacaggtctccgttttctc
gagctaaaattttcattaatttttaaccctatgatttttgcctgagaccg
tcatatttgtccgaaaatcacaccaaagtgtccgaaaaaaaatcggaaac
atagtaatttcgattcccctaccccttagctttccgaaaaggtataacaa
gtgcttctaacaaaacagtcgagcgattttacaaaatgccctctactagt
acatcatatttagaattttacCTACATTCTCAAtattaactttatttttt
tgtcaaaacttaTGATGATCTGACAGATGATGCCTCCGAAAATATTTCAT
TCTACTAGGCGTTTCAGAAAAGTTTGAAGTTAATCTTCGAGAAAACTTAA
GATTTTTATAAATCCAAACTTTTCACAATTTGAAGGACTTGAACTTTGCG
CTATCATACTTTAAATTTGTTTCACGTATTCGAAACTGGTTataaagaaa
attcgaaaaaattatcTATCGAATTAaagtcatttttgagaaaaagtata
gataaattttatttaatgtcCATTAGGTATTGACGCTAGCTAGTAAATTT
TAGTGACATTGAATTTCTTCACAACTTTGGAGCACATGAAGTAAATTTAA
AGTATGATAgcccaaaatttaagttagcttttcttctttctgatgaTGAA
AAGTTAAGATATATAATATTCTAGGATTTCTATttaacaagaatcgcaaa
attgcgactaaatatttccttaaaaatgaaggtcattattgacatatata
aaaaagcacacataataaagtatacatatatatttgtccagaaagaactg
gcatgttgtttgctttgttttggtgtttaaaaatacctatgtacttatca
gtcctaaaaaaaatacaaatttgaatataataagggcaataagtctggtt
agatgttactttattcacaggatttaaggattactgaaaaaatactactg
cagatgaactaaactcaaaaactaaaactttacaataaatttacattacg
acaaagtaaaaatctatctttaatagcaacaaagaaaaaaatgttgctca
aagttttaaagcatttaaatagctttaaacaaaagaccttttttaaaaga
ggcagccatattgaataattatgtactccagcataaaaacaatgatacag
ccatgcataatttagGTCTACTtagttcagtaggtatagagaaatcaaga
tttgaaaacagacactgcaatggtttacaagactagagaaagatgtcaac
catccacacggttcatgaaaaaaataaagtatttgtcaaaaaaaggttct
cttttttttggtaatcaatgtACACTTTTTAACAGTGTCGGctgcgcacg
cgtatgaacaattttctattgttttgattttggcaaccacgagaaacttc
actctcccacGTAAAAAATCATAGGTAAACagccagttctcataagaaaa
cccagcagagaaatggtaggtaaagaactccttttcaccataacttcttt
tcctcttggtgaatttttgtgaaattttcaggagagatacataaaattgt
cattaatatcatgttcaaacatctaaaacattctctttaaaggaaggaaa
aaaatggcaatgtttacatttctctaaccttccacagtactaaagtgagc
atttttacctcccgcctctacggtggagatggcgagactgttaaacggtg
tcttccaacaaacaacaatcaatataccctaacaggatcccacagtgtaa
acattatcaaccaacaaaacccacaccaccaaaattgtaaaaataagtca
atataatttctatcaacaattctcgtaaaatgatttttttcaaacattct
gactgtctgataccaatcatggctggagtcatcatgtgtagagtgactgt
gtataacaacaaaagtttattgaaaatcatcccacggtaatggtgaagct
aaagatttatcaaccaaacaaaactgacgcgccaagtcaaatctgtcgat
taaaaatttcctttaaaattacaatcgaaacttatctcataaaatgcttt
tttcaacattctggagaaGTTCAAAGtcagaggtatcatatgtagagcca
agcaatacatgaaaagtcatttgctatcccatttgccatgagatatacga
gtcaagaaatcaaacaaaaaacaacaaatcatgtctcttcacttccactt
tcatgtcacatcgtgttttatatggggtaaccagaaagtcaatccacaag
aacagccatcttcctttattatggagtgttccaaaactattggtaggttg
tttggaagtaaagaaacccacacagtttgatttattttaaagatttaact
tgaaaacaaactgtttcaacctgctacataagggagcgtctccaaatatt
gtttcatttttaaacgaaaatgaaacgaaAGCttcgtttatgtgcttcgt
ttatgtttcgtttagctttcgtttcgacctcgtttcgacttcgtttcgAA
TATATTCAGATAATGATGTCTGATTAACTTTAATTACTTAAGAAAAGAAG
ATAattgaactgaaaaaaagataatatattgaaacgaatggtgaaacgaa
ataaattttttctctggatttcatgtcatccaaaactttttagaattttt
tagcAATAGTCTCATTTTGTTACTACAACAATAGATAGTTCTTACTTCCT
CAAatgtgtaatatttttttcgatgtttaaagggattcagtttctgaagt
ttcttgctttcaaGCTTGACAAGTTTTCTAATATCTTTTACCCTCGAttt
aagaattcttttaaacctgtttctgataaaaaataaaaattatggtatAA
GGCTGCGAAGGTACTTTCCGACATAACAACCCGAAACACTTTGCAAATTA
CTTCAATATAATTCATATGGGAATACCGTAATTAATTACAACTGAGTTGG
TAATTAATTACAAATTGAGTCGGTAACACCTTTAAGACCTGTTAAAATTG
TTGCACTAATTATATCCCTGTTAGCTGATAGCCCCAAACagtaagaaaaa
catatttctgAAAAAGTCTACATCATAAAATACGAAAGCAGACTTCAATC
TGGATTGATCTTCAACCAAAACATTCTGTCGAAAATAAAGTTCAGTCATT
AAGATATATTCCTAAAAAAGCGTGCATATGTGAAATTAAACATGAACTCC
CTCCCTATCCTATCCGTTTCACAAATTTTTAAGTGAGAAGTTTGTCTAAA
CGAAATGAAAGGAATAGAAAAAACTCAGAGATAATTTTAGATAATTATCT
CTAAATTAGAACTAATTATGCATTTCGTTTGAGCTTCGTTTGAACTTCGT
TTGAACTTCGTTTTAAATCGTttcatgaaacaatttgaaacgaaaaaatt
gaaacaacatttggagacgctccctaacaattgccagtcgggtctgctac
taacatgtaatagttttattataaccgggcttgagaatccgtaaggaatt
tgtaacatatattatatgtatagtttatcagtagacttgaatcatgatac
attactgatacttcactggatgcatttttccCTGTGAAATttaaaacggg
cgtcagtcagggcgtacggaaggcgttttgacacgggaaattattattat
tacggAGGAGAAAGCCTGTTTTAACAAGTacttcccttttggaaaacggg
aaatatttaataattcttGATTGCGACTTTCAattaatggagcgtatcga
atagacacccctgtctcagtaacccaTTGGGTCTTAAAAGTTCACCGGGC
TGACTTTGAAATGAGAAATATCCACCGGGGTTGAGATTTCCATTGTTCTT
CACTCGATTTTTACATCGGGTTATCGACCGGGGACAATCTGACCAGtcca
ctgatacaggggtgtgtaTAGTAAAACGTTGTATGGGTGAatgtagagag
tctatcaccatattagtaaagctcaaattgcagatgtagaacgataaact
cggtatacacAGTAGAAcgttgaattagagagcgtcaactgtaatacGAA
TCAAGGTTGATATTTGATTGATGATTATTTTAGGTATTAACAGCCAGTCA
TTGTACTGAAGGCCAATCACCAGACAGGATTACCGTCAAACCTTAGAGTT
CACAACAAAAACTATGATGAAACCTCTAAACAACGAATCCAAGTCAAATG
AATCATCATGCATCCAAGATACAGTAGATATAACCTGAATGCAGATATCG
CTCTTTTGGAATTGAAAACACCTGCTCAATTGAACAGTCGCGTACGTCTT
GCGTGCGTACCTCAAGTTGGCGTTTATCCACCAACCGGAAAACAATGCTA
CCTTGCAGGTTAGTAAAACGACGTTGACAGTCTTGAAAGGGATTAATCAT
TTAAGATAAGAACCTCCATGTCTCAAAAACTAAACGCATGCTTCAAAAGT
CTTTCCTGGGACTCCTTTGGCCAGAAGAAAGTCGTTCAGAATAAGAAATT
CCCCTCTCATACATGCGCAATACCTCAAGCTTTTACTCTATCAACAAGTG
TTTTCCATCGTTCGTTCGGAGAATAGGTTacatttttgtaatttctttgt
tgTGCAAGTTCTTTTATGACGGAACAGGAGcggaaatttgagaaataaga
aatttaccattgaataattttaaaggTTGGGGAACGACAACCCACCCAGG
GATTTCACCAGCCATTCTCCAACAAACGCGACTACCAGTTGTTCCAAGCC
AAAAATGTCTAAACAGTCAAGAACATGTCTGTGTTGGAAACGGATTCGAT
CCACGTCCGGATGGTTCCCAACAACCAAATGCTTGCCGTGGAGATTCTGG
TGGTCCGTTAGTCTGCCAAGGTAAGTGATGTTTGATGCAGGCCTGATATG
GTACTGACTTCTTTTTACGGGTgagttttttttcgtttttgagaaatatt
ggagaaattttgtCTTGATCCGTTGGGGTTCGGATCAGTTAGGCTCAAAG
TTAGAGTTACACCTTTACTAAGGGCTAATCTGAAATtaagaaaatgaaga
tattcCCAAAGAATAGtttttcaactttgaggaccttatttacggcgaag
aaaaaaaatttggaaaaagcttttactttagaTAGTGTATATAGTGTaga
tcttttatcgaactacatttgacgctctctaattcgatctttttttttgt
ctcaagaaattggaaaaagtGGCTTTTGACCAATTTCCATCCTAATTTTC
CGTACAGacaattcaaaaaagatttgcaataaaaaggttaaattttttgt
aaaaaaggaagtataaagGCCCCATTACACCTAAGAATAAGGGGGAAGAA
TATATCTCTGCAGCTGTTACGATTCGTAAATTCTTGTTCTAGATACacgt
aaaaatattcaaaaatggaaaatctcagagtttttccaaatttgccatct
gttaatttttgtaaattctgcCGTAAAATTACACGAAagaatgtaaaaat
tttatcagatTAATTTTATTGCAAAAGGCAAAACGGAAGTTCTTTAATTC
gatatttttcccttttttcgaaAcccccccAACTTTCGAGAGGGAAAATC
CTTTGTAAAGTTTGTTTGCACAGTCTACACAATAGCCAAAATTCCACACT
AATCCCCACTTTCAATAGGCTGCTATTGTTGAATATTCTTCATAATTTTC
CATTCCTTTGGACACCTCCAAAGGaatagaaaattatgaaattaattaaa
caatagaaactgagatTAGGGAGATAATTTTTCAGCGAATTCTTTATACT
ATTCTTTCAACTGATTACACAggagaatttaataaaattgcTCACAAGTG
TCAGGTGTGCAGTAAATTTCACATTATTCTTCCTTTATATTCTTAGGTGT
AATGGGGCCTTAACATTTTATTAAAGGAATGGTTCggtaaaaaattcatt
tttttatattatctGTCCTATCGGATTCTCCTTTTAAAAAGACACACATA
GATATAAACTTTTAAACTAATTGATTATTCGTTTCCTTTAAAACGCCACT
CACTTTTGTATGCCTTTTAAACAAGACCTTTTGCTTACGTCACAGAGGCT
GTTAAAAGCTGTAGCTGTGTTTACTGAAGTGAATTAAGGCCCCATTACAC
CTAAGAATATAAAGGAAGAATAATGTGAAATTTACTGCACACCTGACACT
TGTGAgcaattttattaaattctccTGTGTAATCAGTTGAAAGAATAGTA
TAAAGAATTCGCTGAAAAATTATCTCCCTAatctcagtttctattgttta
attaatttcataattttctattCCTTTGGAGGTGTCCAAAGGAATGGAAA
ATTATGAAGAATATTCAACAATAGCAGCCTATTGAAAGTGGGGATTAGTG
TGGAATTTTGGCTATTGTGTAGACTGTGCAAACAAACTTTACAAAGGATT
TTCCCTCTCGAAAGTTgggggggTttcgaaaaaagggaaaaatatcGAAT
TAAAGAACTTCCGTTTTGCCTTTTGCAATAAAATTAatctgataaaattt
ttacattctTTCGTGTAATTTTACGgcagaatttacaaaaattaacagat
ggcaaatttggaaaaactctgagattttccatttttgaatatttttacgt
GTATCTAGAACAAGAATTTACGAATCGTAACAGCTGCAGAGATATATTCT
TCCCCCTTATTCTTAGGTGTAATGGGgcctttataaatatttttctgggA
AGAAAAGTGGTTATTTCTGCTAGAAACTGAAGTAAAGAGGGGTTAATTAT
GATAAATTTGTActataatatttttgaatactttGGTAAATGTATTCTGA
CTCGAAAAGCGATATATTCAAGCTAAGAAGAATATGATATCAATGGAAAT
AAAGCAGATTCTGAGTgagagagagagaATGGAGTAAGCAAGAGAGATAT
GGACCCCTCATTAACAAGCTGAAGATATTTAATCCCTGTCTCTATGAGCC
TGAACGAGAATTATTGAGTACAAGCGAGAGTGACACTTCTTCATCCGAAG
ACAAAGGTGACTATGAAACTTGTTCTAAAGGTAGAAGTGGGAGTTTAGAT
TGGTGCGAGTCTGAGTGCTGCCAAATCGAGACAAGAGAAATTGAttgttt
caatgaaaaatttgatcagGGAGATTTTCAGTGTATTATTGATAGGCAAC
AATTCCCAAAAATGTGCCTTGATGAGGACATTTTGAGGAGAATGTGCTGA
CTGGCCTTCACGAGACAAAAGGAGATCATTTGGAAGAGATACCGTCGAAT
AGATCCCTAAGATACGCCGCAGCGTACAGGCAGTGTTCATGGTGGGTTTT
CAAAAGATTGAGAAAAAACAATCGCTGAGTTCTCCTATCATGACATCATG
TGTGCTTTCAAAGACGCGAAGTACGTCGTGCAGTGACCCTGAAGGATAAA
GGAAGGTGaaaaaaaaCTAGGGCGAATCAtttttttGATTGATGGGTCTG
TCAATTCATTCGTTAGTGCAGTGCATTAATAAGTTCATTTTCCAGTTTGC
ATTGgattacacgttgttttttttattagaacccagtttgtaagaacatt
taggctgaaatttggcaaaaatttaagaacattataagaacatgTCCAGC
CTGAGAATCGAATAGTTTGGCGAAATTCGCttaaaaatctttagatttct
tAAGGAATTTTGTGCAATTATTACCGTAATTATTCCTCTCATCTAAAAAT
AATAGCAAATTTACTCGATTTTTAACCCAATATCGACATTCAAAGgtttt
attagattttaagCAAATCGATTTCAAGAACGtcaataagaacatttcag
gctgaaaattgatgagaaaataGGCACATCCAGCCTCAGCTAAAATTAag
acgttctaataaaaaaaaaacgtgtaacatcCCAAGTTTCCGTATCATCG
ATTCCGTTTGGGTTTACTATCTATTGAATTGACACTAAAAGCTTTGTACT
AATTGATGATGTTGGATGGGTCCTTCAGGGACCTGACACGTTTAGCCTTT
TATTGTGCCCTCCTTTCATTCGACTTTCTTTTAGTTGGTTGTTTGTCTTT
AATCGAACAAGTTTGGGATAGCGTCTTCCTTCAGTAGTCTATGCGATGAA
AGTCCTAGGATGAGTTTGtgctaaaaaaaaacaacttttggtgttttttt
tttcgctttgtATTTTGCAACCACCTTCTCTTGAGTGTTTCGTCCTTAGG
TAGCTTGTATAAAGATACTTTCACTCTTTGGCACGTGAGTTGTTAGTACA
GTTCACTGCTCCAAGGCATggtgacacccccttctcacacgATGGGATTT
TTCaaccagtggggatggaaaaataacTGACTTAAACTCGAtgaggattg
atatttccatagtttttatggctggggattttaattcttttgttttcaag
tcagaaaattcagtgggaattgGAAAAATACCATAACATTGTGCCGCAGG
ATTGAtatggtttatttgattatctcAAAGAATTCTTTATGATTATCTTC
AGTGTGGACAAAAATTGAGAGatgattttccactggggacgatattctGG
CCAATTTtaccagtgggaaggggtcccaatgggtctgtgagaagggggtg
tatggTGGGAAGAAAAGTAAATACATACATCAACTTCACTTGGAAAACAG
TCCAAACTAACTATAAAATTGAGATAAAACTAACTCAATCTCGTATGAAA
AATGTACACTTTTgcgtttctcttttttctcaattttctctGAACAGCCT
CCGTGACGTCACATAcacaaaattgctttttaaaaaggggctttctgtaa
acaaaagaatttaactCCATTAAATAAAAATCATTCTTCTAGTCAAATCA
AGTATCCCTGATTCattaaaaccaataaaattaaaaaatgaggAGTCAAA
tttttaccgaaccattcctttaacgtctttttaaggttctttttcttttt
aagcccTTAACCATTGATTGTTTGGACGCTTCAGTTAAATGTTTGCTTTA
TTTTCCACCAGGTTCTGATGGTCGATGGGTGTTGGATGGAGTTGCAAGTT
ATGTGTACACTTATTGTAAATATTACACAGCGTATACACCCTTCAACAAA
TATTTACCGTGGGTTAGACAATACGTCAGTGGTGTTTAGAAGAACGATAT
GGAAATCATTAAAAGAACTTATAATGTAAAGATACGTGCAAATCGGAATA
AAATTTACTTATCAATCCAGTATAGATTCTTAGTGGGGAAAACATCCTCC
ACCTTGCTCGATAGCCATGGTGGATAAACAATCTCTCGAAAACGTAACCG
AACtttaaatctcgtgatccaaacTCCCAATGTTTACTAAAAAACCTTTg
acaaaaac
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000156_pilon | genome | sc0000156_pilon:448931..459238 + |
|