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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000142_pilon:541228..560032+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15752.6.p1 ID=MSTRG.15752.6.p1|Name=MSTRG.15752.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18805bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:541228..560032+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATTTTACAGATCGTCCGATCACATATCTGTACAACACTTTGTATTTCTA
CGAGAAGCAACTACGCGATCAAAATCACATCAAAAAGTTATTAGCCTCTG
TCATCATCAATGCTCAATCGGAAAATCAACCTAAAGACTGGTAAGTTGGT
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GTCAATAATAATCAATCTGATTACCCCTTCAATAAAGCCGTTGTTTTTCG
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TTTCGTTTGCTTCAAGTTGAATTCTATCTGCACAATTTAAACGACCATCA
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GGTATACGTCACTTTGTTTTTCGTCTGCATGCCGTTGTTTGTCGGTCTGC
TTGTTGTTGTCTTATGCGATATTCACGGTCTTTTTTCATACCGTTAAGAT
TTCTCTCCCAGCTTGTGAACCATTGAAGTGACTTCCAATTTTCCTGGTCA
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GTGTCTTTGAACGATCTCCCTTTGATTCAGATCAGCCTTTTCTTGTGCAA
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TCGATTTGTTTATCAGATTCCCATGGTCCAATTTCTTCCTCTCTTTTTGC
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AATAATTTCGTTATATCGCTATTTTGGAGCTGTTTCATCTCTTCCTGATC
GAGTTGCAAATCAACCATAATTTTGGtattaattttttcatcagGGCAAG
GCATGTTCTGTAAATTCCAAAATCTGTCCAAGTATTCTGCTAAAAGTTTT
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TATAATGCAAACCACGAAACTTAGAGTGAAACAGATCGTTGAAGAATGTC
AAAAAGCTATTCatacaatctttgaaaaaggaCATCAAGTAGCTACTTCT
TGATTCTCCAAAACGATACCCATCTGGAACTTTCTTGAGCATCGAAAGTG
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TATTCTAAGTTCATTTATTTGTGTTGAATCAGTCAATGAGTTAATGCTCA
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TTGGTCGAAGTCTGGTTGTTCTTCGTTTAACCACATTAAAACAGTTTTAA
TGTGATAACTCTTCAATAGACTTTCTTTGTATGATTGCTGacctttcaat
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TCTGGGTGACTTTTTGGTACCAAAAGTAAtggaatttctaaaaaaatgat
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TAAAACCCCTTATGTTCCGTTTCCACGTAATATAACGCCCTTTTAACAGT
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gttaatttcatctaaataaaactaaaagaataaaatattggaagagaaaa
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tgaaaattttgattccccCGGTTGAAATCAAGGAAAGCTTGGGTTACCCC
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aaaaaatgtaaacaaactatgtAACTGAGCTACCATCTTGCGTGTATTTA
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TGATTGCGTGCAGTTCGCGCGGCAATGGAATATTCTTACAGGCAAgctca
aataaaaaagaataacaaaactcaaaactctctcaacaaaaatattctta
cacaGGAAAAGTGTATTATGTTCCCGAGCATATTACACATTGGAttctaa
aaaaaggtttttgctctctctcttcAatGTTTACTttaaacatcatgaat
aatttaGTAGTACCTTCCATTATttagaaaaagcgcgggaaattttcatt
ctattttttctgtctgtttttctctctcttttatttttattagaactttt
tgatgggtttttgattgagttattctttttcttttttttactatctcgta
ttttcttataataaaacatTAGTAACTTCAGATGGCTAAAAGCGATGCCG
GCGGTTGTTTCAGTGTGAtttccacactgtgacctagtatatatatatac
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gtcacttacctggagtgccccccccccccgggaaactTTATGCTGATtta
agattaagaaaaaggtcaatatcatggtttgaaaattttgctatctcgag
ctatgaagcactttcgttttcaaaacttagaaagcgaaagtacttcgtat
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AGACCATGCAATTAATGAGGCCCctccagcggcacccctaatcacgccat
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tcatcaccacgcaaaaaatagcgaaaaatagcccaaatcacgcatcacgc
ctcaaatttttgccctatcacgcatcacgccaaaatcttgaacacgccat
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attatcaaaattatgaatcgGTTAATGGTTAGGGATAATTTGATGTGCTT
TGCTTCTTCCCAAACTCAGAGCTCAAACGACGTTTCTTGAACTAGCTTGG
GAATATATaatgttttaaattcatttttgatggattatATTCCCAAATTC
GGCTATCATCCTGAGCTGACATGCAATGTATGTACGAAGTAAAGATACCA
AGAAACCCAAGCTATGATTTAAAACAATGTGACACTGCCAAGAATTCATT
TGCTTGATACCCTGGTCAGCCCCCCGACCTAATAATTAATACCCTGGGGA
ATGTTAAAtgtttccatcaaaaatgtatatttcttcaaaaaatcaaaatc
aacacGTTGTTTTATTCTCCCCCTTTGTGAGGCTTGGAtggtttcatgtt
tttaaaagaaaaagtgtgGACATTATTATTGTAGTTAGTAAGATGGATGC
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tagcctagaaatctaagctagtttgattcagtcacttggataaatctgat
ggttaagttgtgactgaataactagcttagggacagtaaactcggtagct
tatcaactgacaacaacgacaattcaaattttgcggcgagggataacgta
aactcacataatttgcataattcttcgtcgttgacttaattcgtttcata
tcaaaaatatgaaatcacactagcctagaaatctaagctagtttgattca
gtcacttggataaatctgatggttaagttgtgactgaataactagcttag
ggacagtaaactcggtagcttatcaactgacaacaacgacaattcaaatt
tcgcggcgagggataacgtaaactcacataatttgtataattattcgtcg
ttgacttaattcgtttcatatcaaaaatatgaaatcacaccacacacaga
acataatatcaaaacattatttagaatttttttattttgtctttttttct
atcttctgattggctcttattgtaagattagataaacaaactctccgtct
tacagtttatgcgctccttttgtaaaatattgttcaTttttttcaaaaag
ttatgttttatggaaaagtcaacaagagacaaattcgttccttgagtgat
aattttgtgatttgacataaaagtattttgtatgatttttacaaagctca
tcttaaaaataaccttcaacaaaatactgtaaataaaaattactttagac
tagcaggctaaaataccgtatacaaaacaatgtatgtaatcaatcccccc
cccccaaaaaaacattttcttgagtcttgaattcgtatagctgtcactga
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ctgtaaaatcgagcataaagtctcaaattcataaaacaacaagaaaccac
aaccagtcaaaaaccaagaactgtctatcatctatccattacagtatgat
acaatatcatgtcatgcaatccaatcagaatacagaactacagcatagga
tctgtacaagtactctctcttatatattgccacatacgatagtcaatgtt
caatcacaaatctttactttattatttgccattctggaaacaagcaactt
ttgctgtctttacgacAAAAtagcattatttttttcttcatcagttcaat
tcttcccaaaaacaagaggagcactatcaggtcgggatcaggtcttgaaa
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agatcttgcattcaatgagtcccATCCTCTTCTACttcgttttctgataa
aataattataaaaattctatcgctcacgaaaactcccgattttttaccac
gtgacccactctgaccaatcagaagctcaccgaatcctgcgttcatatta
tgaacgcaccctttccctaagccagtattccaaggcaaacttAaaatccg
taaatataaaaaacgtaataaatataataaaaacgctatattgccataag
ccgtgtgtcctagccttgtgaatacgggcttagttaactaggctaaaaTC
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ttttctatcttctgattggctcttattgtaagattagataaacaaactct
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ttgtaaagtgtgccgatggagagtgaaggaaaaatttgttcacttttttc
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ttcttgagtgataattttgtgatttgacataaaagtattttgtatgattt
ttacaaagctcatcataaaaataaccttcaacaaaataaataaaaattac
tttagaatAGCAGGCTaaaataccgtatacaaaacaatgtaatcaatccc
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tacaagtactctctcttatttattgccacatacgatagtcaatgttcaat
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gctatatcgccataagccgtgtgtcctagccttgtgaatacgggcttagt
taactaggctaggaTCTTTTCTTCTTCTATCATAGCTTTTTAGCTTCACA
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aattttaaataaggaaacccatttttttctttttccactctgaaaAGaat
gaaattttgctatATTACGACCaaaaaaaCTGCTGTTTTACTttcaacaa
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aattttcttaaccgtcggcgccaaccatggtggcgcctcctcaCACACTG
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tgagccttaaatgtttcttacatgtttctaaactttttgacataatcagc
cttataaaggctggattggaaggttcttaaaagaaaccgaatttaaaaat
gttattttctcattctcagcctcagtcaaaattactcaaaaatatactaa
agttgttttttttcacataattctctttttgttaaatttggcggggattt
aatttggcgaattgccgaatttggaaattttggcgagggcTTGATTTggc
taattttggcaaaattcgccaaattcgccaaTtttaatccccgccaaaat
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ttacatatattcaataggttttcgtttaACTTTTatctattgaatatctg
cttagttttttaagaaaacctcAAACTAACCCTCGTCTATTTGCGACATT
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TGGGTAAagaaaaacgaggaaaaaaagcctaaaatatGGGAATTCTTGAA
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CGATCATGGCCGGCCTAGGTCTAGTTAGGCCATATATTTTCACGGAAGAA
AAAATCACTGTTTTCGTCGGATATCAGACAAGAAATCTGGCGTAAAGTTC
AGACTGAattatagtctagcaagctagacgactaattcagacatattaga
aataaagcaaaaaagtaaattttagtcgtctagaaacctttgtgcactaa
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tctgcgtagctaggcccggtatctataaggctggaacaccggattcttcc
agtcgtttatacaaactaaatcccgtatcaatatttgtgtttattattag
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TATTAGACGatggaaatatttgaaaaagttccTGCTTTTGAGCCCATCCT
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TTCTTACcttcaaaattctaaaatcctctttaaaaataaaaaaacctacA
CCAAATGCCACAAGAAAGTCTATACATTATACAAAATACTGTCTATATAG
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AGTGGTATTCTTGATATACACCCTAAAAAAGCcaggatttgacctctctc
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ttccgttaaaaaatatgacgtcatcttgacttacgcatatcaagaatagg
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CGAAACTTAGggtttttttcttgcttgagaaagctTGAAGATTCCTCGCT
AGCCCTTCGTGCTTTAAACCCAATATTTATCTCCATCATCACTCAGTATT
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GAAACTGGctcaaaaccttttaaaaaccGCCAGACCTGTGGAGACGCGTA
CGAATGATCAGGGCTTTGAATGAGAATCGTCTTGAACAATGGTTTAATTA
TTCATTACAGTAGACTCGCCGTTATTCTAACCGCCATCTATTCGATGTTT
CTTTCTATTTAAAGTAAAATGGATTTCTTAAAATACCTACTAAATCAGAC
AAAACTTCCCTCAGTTTTCGCGAAGTTCATCTTGATTAGGGACCATTAGG
GGACTAAGCCAAATGGGGGGACTTCAACATTTAATGCGAAATGGGGGAAG
TGGGAAAGAAAGTGCAAATACTGGGTACAATATTTCAAATagtgataaaa
atttctatatttGTATGCTCCCTGCAGTGACATGATAGAGGATGCATTGA
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CCCAGATGAggggggggggACTGAAAACCTGCAGGACATCATATTCCTCC
TTGTATTATCGAAAAAGTTGAGCTCTTATCTACGTTCTTTTCCTAAACAG
TTGTATTTTTTACGTTCATTTCAGGGCATCAAGAGAATTTCAAGAGTACG
TCAAAGACACAAACAGTATTTGGTCACCCAACACGCAGTACCTAAGCAAC
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CTCTCTAGTTCAAGGaatcttttattattattacagttgactctctctaa
ttcgatcttcaagtgaccaagaaattttttcgactttgggaaagattcga
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TACacgcttttgtttttataagaatacactttataagaatgtccatgatg
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ttagcaactgaacctagaaatgccatttttaatgcattttaacctgtaga
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attttcgccaaaaagttaagaatatccacgaTGGAATGAaaatacaccat
tcttataaaaaaaaagcgtataTAATGTGAAGTATGTCAttcaaaaaccg
aaaattgAAATGGTACAGGCTATAATGTATCTTTCAGCTATAAAGCCACG
GTCGAATAAAGGATGACGGGTAAAACTTTCAAGGCGTTTTGACTGGCTAT
AATACAATACATCAATACATGATAggtctagactggagtcgtttacaatg
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Gggtttagtttgtataaactaaatttgttccctccattactttttgcttt
gtttGTACTATgactgaattagtcgtctagcttgctaaaCCAACATAGGT
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TTAATTAAGAGATTAATTAGGTCGGAAATTAATTACAGGAAAACACTCAT
TtctttgttatgtttttgtgTGTATTGATTTTCTTCCTGTATATCAAATT
TCCGAACATTTCCTCTTCTCTTTTTGTGGAAACAAGCAAACATCCTAAGC
TATAAGCGTATTGACAAATGAGTATGATTTGTAGGTGTGTAATTTTAAAA
CTTGGGGTTTTCATTTTAATTAAAGTACAGTTGAAGCTCTGTAATTCGAT
TGTCAcgggaatttgaatttgaattttcatcgaataagggagcgtaccga
atagtagaacgtcgaaaaAGATAGTTACAACTGTATTTTATGAAGCAAAT
CTTTGCCGTATGGTCATCGAGATATAGAGATAAAGAAGAGACTTTTATTA
CTGGTAGAGCGTGTCATTCCCACATAAGCTTTGCTGGCAATGATCAACAG
AACTACGGCAGTTCACCATTTGGGACACTCGTACATTTTTTATGTAGCAG
AAGAAATAAACTTGGAATTTCCTCAACGAACATTAAGAGattgattttaa
agaaaaatgcttCTCCAAGGTAAGTTCTTTCAAACTATCTCGATATTATC
ATTGCTGCCTCTTATGCCTAAATCCCCTCGGAGAGGAATGAGTGCTAGTC
GCACTTTGATGCGCCAACAAATCGATAGGCCTTTTCACAAATTATTTTAT
ATGCAACAACTGCCtcattttgaaaccattaccaaggcgATTGAAAAATC
CCTAGAGTCTTTCGTGTTACCTTTTTAAATAGAATAAACTTCTTATGAAC
TTAtttgggaatcaattaccatagcaatattttgaaaacgagttaagcgt
tgctcgtgacgtaatttatgaaaaggtttcgGGCTCatctttatctttta
ttttccaAGACCGAATATTCCTAATTACCAGACCCCCTTACAGCtaattt
cgagttaaaaagtGTTGGAAGGAAATCGGATATCATGTAGATAAgttaac
acccccttctcacagacccactggaaaaatttgctaaaatgtcgtccccg
gtggaaaatcctccaatttttgtccccactgagaATAATTTggccccact
ggctgaaaaatgtTTGTGAGAAAGGAATATGTAAGTTAGAAAGTTTGAAA
GCTAACGTAGAGGACTTTGATATTTTCTATGATGACCCAAAGGGAAAGAG
TGACTTGAGAAGCATGGTTAAAATAAACACGGAGTAAGTAAAACTGTCTC
TGATGTTTACTCATTAAATAGCCTTAAAGACGAGAGAGTTAATCTAACGA
GAACTCATCAATCATAAATGTCTAGCTGCCTAGCAAAATGAGTTTAGAAT
AACTGCTTTCCTTTAGTAACTTTGGAGAGTTGTTTGGGAATTTATTCCGT
AGTTTTGGTCATGATCATATTTTAATGGAATTAAATGAGTTGTTGGTTTC
AAAGTGAGATTTCTTTAATTTGCCAGGGTAGATTCAGAGCAGTTCCAGAG
CATATACCAATACCATACaccctttttcatcttttttttatgagactcgg
ctgttcttattttttttggcactgTACAAGGTTTTTTATACCACAGGCCC
GACGGAAGACTTGGGagacttcagcctccccacttttaagcaaatgagat
ttttttcttaaactcTAGCAAATTTTTATcgcattttgagccttcagcct
cccccaCTTTAACAGTTATTTCGCCGGGCCTGATACGTGGAGGTTTTAAA
ATATGTATACAAGAATTGTTGTTTTTGATTGGATCGATTTCCTCTGACTT
ATATTGTTTCTTATAAGTAAACGagaaaattttgtaattgcatagctttt
aatGTAAAATGTAATAATATGCTTTCTATTGACAAAACTACGCATCGGGG
gtatataaaacaaatcagAAAAATAGAGAGAGGCTTTCGTTTTCTCTTCA
TAAGAAATAATACAGTAGCATAAAAACATCATATCATGTAGCTCATAAAA
AGCATTAAAAAGTCCCTTGTGTGTGAGCTGATTAGATTTAATAATCGAGC
GAGACTGTGTTTTGTATAGGGGTGTAGGAAGGTATTAAAAAAGCGCATTT
CGAATTGATTAAAGATTGTAAATAAATGCTCTGATGATAAAAAAGTATGA
TGTTTTTAGTTTAAGTTAAAGTTTTGTGTATTGTCAAACAGAAAAAGTTG
TTGGCTGGTAAGAAGTAGTTATAATGAAGTGGCAAGGAAATGCAATATAT
CTGCTTGTGTAATATATTTTTACAAACTCTTATCGCAAGTTATATATAAG
CTTGGCCTACATTAATGAAAAACAGAGTAtttctttaaagtattttttaa
agcTCTTCACAATCATCAgttgatttgaaaatatgacAATACGAAACGAA
AATAATCTAcagtttttgaaattcaatataatGTCTTCATATAAAACTGG
ACGTCAGAGTCAATCCTTTGAATCGAAAGTTTGATTTATTAGGCATACCG
GCATTTTGAGATCTCGAGTTCAATAAATTGTTTTTAACTTAGCCTACAGT
ATCATTAAGAATTATAGAAGACAGAGTTTCATTGACGAAGTTATGGTGTA
ATTGAGCGAAATTAACCAATAAGTGGTCAGTAAAGCGATTTGAAAGTTAG
AAAGAATCTTTGAAAGTAGAACGCGGTAGCGGTAGTAGGgttagagtaga
atctctaaaatttcccaggcaagaaaaaatggagccacttatttcccatc
caaaacgcgcctagaacgcgctgtaatcatgacgacggattgtatctagt
ggttcctttgtgtTTGAGGACTGCATCTTTTGAAATCTAGCTTTTAGATA
GATTTTAgattcaatccggcgtttgtgtgaaaacaacgcgcgggcgttct
ggatgggcaataagtggttttatttcccatccaggagtctcgagtctagc
ccttcgggcttggaagccTTGGAAGTCAAAGTACGGTGCCGtggttttgt
ataagattcccattccCGCACTAACTAAGATTCCACTTTTCCatcggaaa
aagaccaggatgAGATTCGGAAAGCTAGGTTAGTTTAACtcaacacaaga
ttttccgtgcttttagaaaaaattctttccaatctcatgccggtCCTTCC
GGGAAAAATCCCGGaaaagtcaggaaaatcttTGTGTGGGAATGGAAATT
TAATGCAAAACGATGGTAGCGGTTCTGCGGTAGTTGATTGATTTCACTcc
caaaagaattttttgttttttattttcactgttTTATCCAAGTAAATTCA
GTCAGATTCAATCTCAAGTAAAGTCATTGACCGTGTTGTGTGCTTGTGTG
CTATGATACTCTGAAGAGCAGGGCGTTTGGAACAACACTAGAAATACTAT
GTGTCTGCGGGTAATCTTTCCATGCTAACTGACACACGGCGCTGTCTTAA
GCTCATCTATTGTTATTTAGATACATTAGAGTCTCTTTAACGTTAAAATA
AGGTTTATCTAACGTTCGTGATGgaatggagtctccataactcaaacact
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atctgaagggacgagaaaacttgatcaagttaaggagacattcgtgttat
aactcaaacaaatttgtgttccccgtgatttttcgagttatggagactcc
actgtatcaaGAACGTTAGGTGAACCTTATTCTGACGCTTTGTGCAAACC
GGATCCCATAATAGATATTTCAATAAAGGCTGGCGTAATAATGcaagttt
ttcatatttttcatgtattttttcTCAGAAGATGGAAGAATAAAACCAAG
ACCACCCGGCAAAACACAAACACACCACCCACAACTTTACTGACCATCAA
CCTgaagaaaagtattttttatacAACAGTACCATCACACGACGTTcttc
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TGATATTCGCTTTCTTGTTTCCTTTTCTCATCATTTTCACCGTCTTACAG
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ctttt Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000142_pilon:541228..560032+ >MSTRG.15752.6.p1 ID=MSTRG.15752.6.p1|Name=MSTRG.15752.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=627bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:541228..560032+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTTCACGTTGGAACATACGAGGTGATTTACCGTGGACAGGTAGTTTT
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GTTGGCGTTTAAAGCGGGCGTTGTACCATCCAAGGCgtatgataaatatt
ttttgatgaggAACCATAAATGCATCTATCACGGAAGAGATGTTTCTATC
GCACAGGAGTGGACCCTCGGTGTATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000142_pilon | genome | sc0000142_pilon:541228..560032 + |
|
