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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000140_pilon:675226..687034+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15652.3.p3 ID=MSTRG.15652.3.p3|Name=MSTRG.15652.3.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11809bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:675226..687034+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACCAACGACTGGATGAAGGTCAAACGTGTTATTGTTCTCATGTTCAGAT
GGAGGAACAAGGAACCAAAAAGAGCATTGTTTTCAACAAAGGAGTTGGAG
ACAGCCGGCAAAAAGGTCATCAAAGCTGTTCAAGGTCTCACATTCGATCT
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TCAAGTCTTCAGATCGAATTGAAGCATCCAATCATTCTCCCCAAAGCTCA
TCCACTTTCAAAGATGATACTGCGTTGGTGCCACATCAAAGCAGCGCACA
GCGGCAGAGGTTTGACAATCAACGAAGTAAGAACCTCTGGCTATTGGATC
ATCGGAATCAGCTCGTTAACCAGAAGTTTCATCACAAGCTGTGTCCTCTG
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AGACAGACTGGAACCAGAACCTCCATTCACCTACGCTGCAGTCGACATGT
TTGGACCCTTTGCAATCAAAGTGCGAAGGGCAACTGTGAAGAACTACGTC
GGTTTGTTCACCTGCATGTCTTCAAGAGCTGTCCATCTGGAGAGTACAAC
ATCCATGAATACTGACGCGTTCATTCTGATGCTGAGACGTGTCATCGCCA
GACGAGGCAACATTCGATCACTGAGGTCAGACAATGGCACCAATTTCGTC
GGTGCTGACAATGAGATGAAGAAAGCCATCCATGAACTCGATCACGAACG
GCCGATCGAATCAACGATTTCCTTCAAGGCAACGGAGGAGAATGGCTACA
TTGGAAGAAGAATCCACCAAAGGCCAGCCACATGGGTGGCGTCTGGGAAC
GACAAATCAGGTCAGTACGTTCCATTCTTTCTTCCCTTCTTCACACTCAT
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GGCAATCTTAAATTCGAAACCCCTGACTGTTGAAAGCTTGAATGACCCAA
ACAGTCCATTGCCTCTTTCCCCTGCAAATCTGCTTAccatgaaatcgaaa
gtaatcatGCCACCTCCTGGAGTTTTCCAGAAGGCTGATTTATATTGTAG
GAAGCACTGGAGAAGAGTTCAACACATTGCCAACGAGTTTTGGACCCGCT
GGAGGAAGGAATATCTCTCAACCCTACAATCCAGATCAAAATGGAATCAA
CTACAAAGAAACATCAAAGTCGACGACATCGTCATCATCAACGATGAGAG
CAGTCATCGAAACGACTGGAAACTTGGACGAGTTATTGATGTCAATCGAA
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TGAGCTATCGAAACAGCGTCTACAAATACGTGTAGTGTATTATATGTTAT
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TGAAGTCATTCTATATTTCGTCGTCAAAAGAATGAATTGAAGTCATTCTA
TGtgaaatgttattttttcgatttgatTGGTTTACTTGGATGATTTGCTA
ATTACGACAACATGCTTACCAGATTGATAATGATTGATTTCAGGACATAA
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GATTCCCCATCGAGGGAGCCTTAtgaacattgaatttcaagatATGATTG
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CTAATTAATAATAATTAGCTCTCTAATTTGTTCTCCAGCGTAGCGTCTCA
ACTCATTAGTGTTTCGCGTAGTCCCTTGAGACTTTTGATACTGTTTTTCT
ATTGTAGAATTTATTCTAGCCTTTTATATTATAATTAGGCAATTATGACG
TAGCATTTTGAAGGCGTTTGACAGTGTTGCCTTTCGTGTCTTTTTTGTGT
TCAAACTCTCGTACTGTAGAGAGGGGAGAGAAGAGaattttgacgtattt
taagaAGAGATTTTCGTGCTCGAAACTAAAAGCAATTTCTTGTTTGGAAA
GAATTTTGTTACATTGAGGTGAAGTTTTTACCACTGTCACTCCAAAGTGT
TTTTAGTAAGTATATTTTTTCACCTAGGCTTAGCTTTGTTATTGGACTTT
AGCCTAGATTTCTTGATGTCTTGTAAGCAAATTTTTAGGCCTTGTCAAAC
ATTTTTCTAAGCAAAACTTTTGTACTTATTTTTAGCCTGCATATCGAATG
AATATATGCTGAGTCAAAACTTCAAACGTGAATCGTTTACATATATTTTA
TATTGTAATgttctttttggttttttgaaaacacccctgtgtcccagacc
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tggggaatttactttgatttcatccccactcgaaattcaatgtctaaaaa
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ttttgtatccgctgcatacagtttgtttacaaatttcgcaagtactgtta
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ACAAGGGTGTTTGAAATTACCAAATCTGCTCTAAATCGGAGTTGAGAAGT
TGAAAGTTTCACTCTAAGTGCTCTTATAAATCGGGTTCTTATAAATGAGG
GTGGTTCTTGAAAATGAGTCAgattattttttgataagcaaTTACTAAGA
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ctcagtaaaaaataggaagtagaaaacttgacaggagcatcaatatagtt
tattttaaccatatctcgacataaaaatttcccgctttcaacaaaaatgt
tataaacgactggattcccagtctaggggatttgtgaatattttataatt
ttatgttgtgaactttaaagccttgaaatgaacaacaaaaacatctaata
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CTGGTCtataaaacaaaactgaaaGCAAATCTGATTTCGATATTATGTGC
TGTTGGAGAAAAGTCACGAATCATAAGGGACGGAggatttgaataaattt
tttttgtaaaagaaaattATCGGTAAAAAATTCGTCACTATTTCTTTGAT
AACATTTACAATATAAGTAAGGTGAAGATTAGATACTTTgatggattaat
tttcgcgggtattaaatttcgcggttgagctcatccgtgaaattttaaga
ttttgcggGTACTTAACTTCGCGAATGGCAGCTttgggagacaatatttt
cacgattttgcaCTTTTTCTGCTTGTCGAGCCGTTTGAAGTGAGGGGACC
AAAATTGTAGACCCATGTAGTAATTAAAATGTCATATCGTAGGCTGCCGT
TACCTTATCGCTGAAAGACTCGTCGGCAAAAAATAACGATAAATGGCTTG
ATGACGCTTTTATTCCTTGGTATTCAATTCAGTCTTTTACAGTTTTTACG
CtgttttatgttttgaaaagattgCTCAACTTTCGGAtcaatttgattgg
tcaaatTTTAGAAGTATAATGTAATTAAGTTAAATCAACCAACAAGTGCT
GTTcgaaaaacttgaaagtttaGACAGAGTCTTTGaaataaagttaaaat
aaaaagctTTATGCTTTTTAAGTCTCTATGACTTTTTTCttagaccacgt
tcacacgctactgttccgtttcgcttcGAGACAAAaagaagccattctat
tggttgcattcaagtgttacgtcacttctaaccaatatataatggcttca
tttcgtttcggagcgaaacggaaccgtcacgtgcgaacatggtcttagtt
CTTTAAATTGCATGCTCGATAAGTTTAGTGCAATCTGTTGTTTCGTTAGA
AGAGGGGCAACTTCCATAATCTGAAGGTTCACACCCTTACGGAAACTAAA
TGCTcgtattccattgaaaacgaatatagaatgcattaaaaatagaataa
aaatctaggttcaaaactttgatgaatttctaatTCATTGGGTATCAAAA
TGTATTTAAATTCTAGACTTTAAATTACATATAAATGTATAATAAATGAT
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ATTCATTTTCCATTAACTTTTTCAAACGtagtaaaattatatttttaatg
tgAACCACGGATTCACTAAAATAAAATGCAATTCAGATGCTCTCACaaat
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gATATGCTgatgaattgacaaaaaaaatgcagttcaaatattttaaaaaa
taaaatgcactttccattcgattttttaaacgcattgaaactaaattttt
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aaataaaatgcacTTTCCATTCGATATTTAAACGtattgaaactaaattt
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acaaataaaatgcactttccattccatgctgttttaatttttttgctgaa
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AATATATTTTAAGTAAAACTATAGCCAGTCTATTCGATATTCAGAAAAGA
GATAGAATGATTAATGGTACAGGGATTaccaaaaatttccattttcaccT
ATTTGAATTCATTGCAGAATGGAGATTTTTCGcaagctttcaaaaaaaat
gttaccaaaattcttgaaacttaatagacgatatcgcgtttagataaatg
caatgcattctggtttctcggggaccctcaagggaattataatctattcc
AGATCATTATATAATCGacattataattcctttgagagtccccgagaaac
cagaatgcattgcatttatctaaacgcgatatcgtctattgaaatCCCAT
GTTCTTTCTTTCAGTGTAACACTCTATTTCAAGCTAACCTTTTCCGTGGT
GAAGTGAAAGACCCAGCGTTTTTGTAATCTTAAAAGCATATTTACCacaa
aagaatgcggctatcgcgaaatcgcacccttacaatGAAGATCGTAATCG
TCAAAAATAAGGCACGCTGATGACAGTACAGTATTTCGCcatcaatttta
aatctttaatccATGTTTAtcatgttttgttaaatctCCTCCTTGATTAA
CTCTCTTGCAGCTGTTCACAAGCTAGAGGAAACAGCCCCTAGAAACAGAC
TCGGTGGGACCCCTCCTCACTGGAAAAAGCCGCCAAAAAATGGTCCCGGT
GataaaaataccctgaaatttcatccccattgaaaaGCTACAAGAGCTCT
CATTGCCGCTGGGAAAAAGACACTGAGGccatcctcactggatttttGAG
ATGTAAACATTAGAATTTGAGATCCCCACTCATTTAGAAACAAGCGGTTT
TCAACTCCCATTGGCATAGCTCATTTTATCTTCACTGGCTAAATAACTTT
AACAGGGTCACTAATATGCTATTTTTCATGAGTTAAAAATTACAGTTCAT
TGTGGTAAggtttcaaaattaaatgatgTCAGAAAATAGACAAGTACTTT
TCAGGAGTTCTGTCTTTTTGAGAGCACGACCAGTGCAcgagttttaaaaa
aatcaaatacagCTTTTTGTGCACAATGCAGGGCGGATCGggaaatcatt
taaaattttgaatttttagtgACCCAGCCGCCCTCACGATTAATAacgaa
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AAAAGTGAATATTTGTCTAACAACAAATTAtttaaatattcgaaaaaact
tggaaaagcgaGCGCGTAGCAGCCATTTTAGAAGCTCTACGCGCAAGATA
ACAGAATATGTTAGCTTTTAGTTGCAAGTAGCGCATGATCCTATGAAGTA
GGATGAATTCTTCCGCAAATTatgaacaaaagtttttgatgttattatta
tCACATATCATAGTATTTCACAATAATGGCgcaactttttttctgattct
aatcataagttttttgtctgacaaaaaaaatgaaaatctatgGTTTAATT
TTCTGTCTTACTTGTAAAAACGAGACTAGCGCAGTATTTCCATGGATTTG
TAAGTTGAGTTAGTTCACAATAATATAAGgacagaaattttgtttttatc
acaaagaaaatatcgtttttgatgtttgatttattCCTCAATGCAGAAGA
AACTtaatcaaaattgtaaaaatttgtgatattttttttacgCTCAAAAT
TCTTAGATACgtttaaaatacatttatttttttcgaataatTTGGGTAAA
TTGCTCTGCTCCATTGATAATTGTAGCAAATTAGTTAGCTAAATTGTTTT
GTGTATTGGCGGTTTAGTTTGATTAAATTACGAGCAATTAGAACACAAaa
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CAGTTGTGTCAGTCACATGTCCGTCAGGCCATGAGCTATGTTTAGAAATG
CTGTTAAGGAAGAGTCTCTTCTTGGCTTAAATTTAACAACTCCAatgtta
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AACCATAATATACCGACGGAATACTGACACACAATTGAAGAATGATTAAA
ATCACGATACAAAACAAAAGACGAAGACGCcatcttatttttcaattttt
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tctgtttattctactaaataaaaaattccatttGCAACTCAAACGGTTAG
ACTTGTATCCTGTATCTCAAAACGCAGTTAATCTGAGTGAATATTAGCCA
ATAACCCATCGAATGCAGCTCAACAATGTATACCCCTTACAAGCATCGAT
AAACCTcggaaaataatcagaaaatccCCCGATAAAATCCCAATAAGGAC
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GCTATTTAAAGTGCATTTTAATTTTGACGCCGttcattaaaaatgtattt
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TCCAGGTTTCACTACATTTAAATTGCAATTAAActcaaatttcaatgaaa
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GGTAGGCAAGTTCGTCTCCTGAAGTGAACACGTCTGTGTTAAGTTCCGTG
TAGCTCATGGTGGCAGTCTTTTGGTGCCctattgtcaaaaaaaattaaat
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ATCTCAAACCTCTAAATGACTTTGTCTAACTATTATCTTAAGATATTCAA
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aaatcaaagagatagaaaatagagGAGGTTGCACGCAACTGCTTTAAAGC
CGGGCGACTCttgttttctattcaatttcctttgttttgcaacaaagaaa
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ACATGGCGGGTCGAAGCGGTGATTTTTCTGCTGTTATTTTTGTTATGTCT
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AACATCTCAAATGCTTTTggatatatttatttcaaccaatcaaatgatTT
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CCTGTCTTGTTTAGTAGCTAACAGCACCTACTGATGGAATTCACTCGAAA
TCGAAAAGatggacaatttttttcaaatagggAACAATTTTCCTTGGTAG
AGGATGCCTTGAGGTATGTATATCTGAAGTTTCTAGTGTGGTCTGGCTCT
TTTCACTGTGGTCTGGCTCTTTGAGTTCAGcccatttttaaatttcatgt
aCTCAACCATCGACTAGGTAGTTCTTTCAGTTCTTGTTGTCTTTCACTTT
GTTTACGTGATCAGCTAAAAGTTGGCGGTTAATTTCGAAAAGTTTGCTTC
TTGGTAATAATGAAGGAAGAGATGGAAGAAGAATTTGAATTTCGTCGCAA
ACAAACAGCTGCCTTAGTAAAGTAGTGTAGATTATTATGCGGTTATGCGT
CCGGTGCGTGATATGATAAGCCGattcatcataaaaagtaagacTGTAGA
AAACTTAAAGAGACAGCTTCTTTTAAAGATGCTTTCAATGCTTTGGGAGT
TGATATTACTAATGATGCTGTTGATGTTCATCCTGAGAGAAAATCTGTGA
AAAGTGTAGAGTTGTTTGTACGAGTTTGAATCAGCATTGAAAGGCACCCA
GAGGCACCCAAGCTGAAAGTAGGAAAAAAGAGAAAGCTAGGCATAAATCA
ACACAGTGTATATAAAACAACAACAGCATCAGCTATTGATACCAGTGGTT
TCGCAGATTGTGTTGATGGGagagaaaatttcagaaattaaagAGACTAT
GGCTTTGTCTAATTATTGATGCTGAAGATTTTATATTTgttattgattgt
ttttttttgaattgggtGAAATAAATGAGGAAATCAATAAGTTGGAAAGG
CAATGCGATGAGGAGGGCCAAAAAGCAAGACAATCAGCCTCGCATGTTTT
AGCTTTCATTGTACGAGCTATCTACACTGgattacttttgtttttgtttt
ttccctaCTGCCATCTGCTTCAAGTGATGAGTTATTTCCTGTTGTCTGGG
AGCTGTTGAAGTGTTGgaatatttgagtttgaaagtCAGGTGTTTGGTAT
CTGATGGAGCCTCTACAAACCGTTCATTTTATAAACTCAAAGAATAAGGA
AGATACTGTAATTTCTTCAGCATTAATCTATGTGCTTTGGATAGAAATAA
GCTCTGCATATTTCATTTGTCTATTATTTCCAGAGGAAATACCTTAAATG
ATATCAATGATgatttgtttgaaatatttatcacTACCAGgtgttgaaat
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GAATACTAAAATCCCAGGGCTTTATACATGATCAAATTAACAAGAGAACA
CATTGACTAAATATGATGAACGTTTAAACTTGCAGCTCAGGTAACTTAGA
TGATTACCATATTAACTCaaaaaaaGTGCCTATATGTTATCTAATCAGGC
TAGGTAAAGTCTGAGAATTATATTTGTCTGAAATAAAATGGCCTTTTTAT
GACAATAAAAATCCCATGATATGTATTCAGGTATTCAGTTGTTgtcaatg
acattgaaatgACTATAGCTACAAGTCTGGTCTCaataattttagtttga
tgacTAGCTTGATATAAacagaaattttgaataatttttctggGCTCAAC
ATCAAAACTTCTTGAGTGGCTTTTTCAGCTGTGTAAACACAAATATTGAA
TGTTTGGATGGTGACAAAGACTCTagcttattttcattatttgtcCTGGA
GGattccttttgaaaaagttacttcatttttattttagtgtCTCAGTACT
AGAGCATGCTCTTCAGTATCAAAGGCAAGCCCAAAACTAGAGGTACACAA
AAGTTTGTCAGGATCTgcaacaaaatttttgattgcCTAAATGGACAGTA
TCCTAACCAAGATATGGCAACAAGAAAACCGGCAAAACCTGCTCTCAGAC
AGTACACAGAAACAAAAGACAAATGttttgaggtaatttttatccTATAT
TTTTCGATGGGATTAGTTGTTGTAGGTATTCTCACTAGCTGCTAGTTCCC
TTCAAGGGTTATGTAGGTGTTACTATATCCAGATAATTCTACTCCATACA
ATATgtgaattgaaataaaatacatctcATGATTTTAAAGgagcattttt
atttattagagATGACGTGACGAGATGACATGACGGTTCACTTGTGTGTT
GTGACCAAAttataactttttatcattttagtgGCTGACggatacatttt
tgaaaagtgggaAAACAGAGGCACCTACACCTGGCTTGCAAAGGAGGAAA
GAAAAAAGGAGACTGTACCTGGCTATTCAAATTGTTGAAAGGCTGCATGC
AAACTACAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000140_pilon:675226..687034+ >MSTRG.15652.3.p3 ID=MSTRG.15652.3.p3|Name=MSTRG.15652.3.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=492bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:675226..687034+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGCAACAAAAGATGGCAGACCTACCAGAAGACAGACTGGAACCAGAACC
TCCATTCACCTACGCTGCAGTCGACATGTTTGGACCCTTTGCAATCAAAG
TGCGAAGGGCAACTGTGAAGAACTACGTCGGTTTGTTCACCTGCATGTCT
TCAAGAGCTGTCCATCTGGAGAGTACAACATCCATGAATACTGACGCGTT
CATTCTGATGCTGAGACGTGTCATCGCCAGACGAGGCAACATTCGATCAC
TGAGGTCAGACAATGGCACCAATTTCGTCGGTGCTGACAATGAGATGAAG
AAAGCCATCCATGAACTCGATCACGAACGGCCGATCGAATCAACGATTTC
CTTCAAGGCAACGGAGGAGAATGGCTACATTGGAAGAAGAATCCACCAAA
GGCCAGCCACATGGGTGGCGTCTGGGAACGACAAATCAGGTCAGTACGTT
CCATTCTTTCTTCCCTTCTTCACACTCATGGCGAAAGTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000140_pilon | genome | sc0000140_pilon:675226..687034 + |
|
