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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000137_pilon:515331..523392+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15503.2.p1 ID=MSTRG.15503.2.p1|Name=MSTRG.15503.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8062bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000137_pilon:515331..523392+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGTTTTGGCGCCAAAGGAtacgaaaatttgaatttcaagaTGGACGCACT
TTTTTAACATGAAATTATACTTTTGCAGAAGTTCTATTCTAGGCAGCCAG
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TATGAGGTGACAACTggtttgattttgtttgttattgcgagctgtttaca
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TCTgataaggtaagtaaaaaacaacttagtacaTGGTACTAAGTTGTTGt
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ATTTTTAATCGAAGGATCTAGGAAGGTTTCTGAAGCAATAACAATGTCTG
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TTAACGGATTGTTGGAACGTATGGTTGCACAATTAAAGCCATTGCCATTC
AAAATCACAGTCTTCTGCGTGTAGTGTAAATATGTTATCTGACATGTAGA
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CACGTtaagaagaaaattgataaatggATAACAATGGAAGAAAAATGTAT
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TCATATAATGCTTTCAATTTAGGATAATCCGGGAATGATCATTTCTTTTC
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CCCAACGCCCAATTTTTCGATCTGACAATCGATCTGCAAGCCCACCACCT
AATTGTTTATAGCAGTGGGCTTGTCAAGAAGGAACCGCTCCTTCACTCGT
TCAACGAAGAAGTGATCCACCTTCTTCTCCTTCTTGCTCTTTATGTAAAT
GCATTGACCCATGAGCCAATGATGCTTTCCCTGGTGTTTGACGGTTGCTG
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ATTTCCGTGGCTGATCCATGGCCTATAGAAAAAAGAGGCAGGACCAGTTA
AAAGTGAAATCTTGGCTGTTAAAAAGCCGGTATTTTACCGCTTTTTAGAC
AATTGGTCTTGATTGGCCTTTTCAAGTGCTAAAAATTGCTTGGTGAGTCA
CCTTTCAACATATAATATTTACACAAATCAACTCTGATGTGCTATTTGAA
AGAATATATGTATTTACATTATATATTTGCTTCCCCCTCCCTCATATAAG
TATAAAGAATATCTTCTCTTCTCCCATTTTGTATAGTTTGTATTGTTCAG
AGGTGATTTCCCAAATTATTTCTATTCATtcagaaaatattcttttgtat
ttaGAGAAAATTCAGTTCCTGatcctgtatttttgaaggatagggtagtt
aaatactaaaatgggtgctatctatgtgttaaatgttgaaaaaatgttac
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ttctcgaaattttttgtcaatataaaaaagacttgaattataagggcaaa
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CTCTTCCAAGAATCcaggtggtggtatgtaaaaattggtaaaaatccttt
tactactcatatatgtctgagattttactaccaaCCTcccccccTGGTAG
AAACTGTCttagaaagaaaaaaggttaaatttaatTAGTTagtaggaaaa
ttttttttttggaattcttACAAGCACCTTTTCATTGTCTCGTTAGCTTA
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TACTTTGATTAAGTACATATCCCTGTCTCTTGTAAGAACCAAAATCATTC
TTGACAATGGTAGGAAAGCTCTatattcaaaagttatagctatatttaaa
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TCAGAATCATTCAGGGGAAAGCCTAAcataaaatttggtgtattactttt
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GTGATTTATTAGAGAGTATGAAACAGGCACAAATATGcaaaaaacatcga
tttttatttatttttattttttaatctctggaaatatttttgaacttctt
tttctaaaattgttGTCCTACCTTTTGAGCTGCTGAGTTTCAAGTCTTTT
TCTTGGCTATATCAAAAGATATGATCTGACCTTACTGACATGAAAACAGC
TTTTCCAGTACAATCAATGTTACCTGGACCCATTAGGACCCTCTACTCCA
GACCCTCTGAAATCAAAAAGCCCCTTAAAACGCTATTTTTACTTGTCTTC
ATTCCGTAAACTAGAGAAGAGATGTTGAGGAACAAAAAAGTTGTATAGAA
AACTACCAACCCTCTAGGCTGCTCTAAGTGGTGCTACCCGTACTCAGGAT
CTGGtatatttgaacattttttgttaGTAGAATATTGGTTTTAATCTGAC
ACAGAGATGATGTACCCTAAGTAACAATGAGTGACACTAAATCAAAAAAG
TACATTCAAGTTGAAGATGTATTTCCAGAGGAAACAGCTCTCCTAGTGCG
GGAGATTGGACAAAATGCAGTTTGGTCCTTGTCATCTTGCAAAGTTGGAT
CAGGCGTCAACCAGCTTCGTGATAATGACTTGACGACATACTGGCAATCA
GATGGGCCGCAGCCACACCTCATCAATATACAATTTCCAAAGAGAACAAT
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CACCAAACAAAATCTCCATCCGGGTTGGCAACGATCCCCATGATCTTCAA
CAGTTCGAGTTATTGGAACTGGATGAGCCAAGTGGCTGGATCAATACAGA
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TGTTAGGTAATCACCAAAATGGACGCGATACACACTTACggcaaatcaaa
atatttggtcCAAAACACAATACTGTTGACGTGAAGGTTCCTTCCATAGA
ACAATTTGTTTCTGTTGACATGGCACAGTTCTCATGTATTAGGTGACGTA
AATGTTTACCGAAATCAATTATTGTACTGAATGTTGTTTTTATCATTAGA
TTAACATCGtcttctttttttgtaaaatattgtaaaGTAACAACCTCCGT
ATTATTCTTTCTCGACCTTTTCACTTCAATCAGttctcttgggtacctaa
tttATTGAGTGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000137_pilon:515331..523392+ >MSTRG.15503.2.p1 ID=MSTRG.15503.2.p1|Name=MSTRG.15503.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=570bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000137_pilon:515331..523392+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTGACACTAAATCAAAAAAGTACATTCAAGTTGAAGATGTATTTCC
AGAGGAAACAGCTCTCCTAGTGCGGGAGATTGGACAAAATGCAGTTTGGT
CCTTGTCATCTTGCAAAGTTGGATCAGGCGTCAACCAGCTTCGTGATAAT
GACTTGACGACATACTGGCAATCAGATGGGCCGCAGCCACACCTCATCAA
TATACAATTTCCAAAGAGAACAATTATCAGTTACATAAGTATTTATACTG
AGTATAAACAGGATGAAAGTTACACACCAAACAAAATCTCCATCCGGGTT
GGCAACGATCCCCATGATCTTCAACAGTTCGAGTTATTGGAACTGGATGA
GCCAAGTGGCTGGATCAATACAGAACTGTGTAAAgacaatcaaaatatca
aaactttcATGATACAAATTGCTGTGTTAGGTAATCACCAAAATGGACGC
GATACACACTTACggcaaatcaaaatatttggtcCAAAACACAATACTGT
TGACGTGAAGGTTCCTTCCATAGAACAATTTGTTTCTGTTGACATGGCAC
AGTTCTCATGTATTAGGTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000137_pilon | genome | sc0000137_pilon:515331..523392 + |
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