|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000136_pilon:220015..229232- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15420.1.p1 ID=MSTRG.15420.1.p1|Name=MSTRG.15420.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9218bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000136_pilon:220015..229232- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATCATCTCAGATCTTAAGTAATCTCCGAAGAACAAACAAACATGAAGGTC
ATCATTTTCACCGCTTTCTTAGCTGGTAAGTACTTCTTGCAGCCCTTTTT
AAGAAAATAATGTCGTTGTGTAAAAGTATTGATTTTCAGAAGCATCCCTA
TACGAATAAATTTTTTCACAGCTTACTATTCAAGGTTTAATAATTTATCA
AAATTTAATGGTATTAAATGTATCTAAACGTTCAATTATCTAAATCTTTC
AGTTGCCGCAGCCCTCGAGGTTGGAACCCAAACTGGTACCACACCACCAG
CTGTCCCATGCCCAGACTCCCTATGTAAAGGAAGAGCTGATGGAAACTAC
GAATACTACTACTACAGCCGATACAACCCACACTACTTCCTCCAATGCTC
CAACGGATTAGCTTACTGTCAAGCTTGCTGGCCATTGTCCTTGGAATTCA
GCGAACCATGCAACCAATGTTTGTACAACCGAAAAGACGAATGTGTCACC
ACACAGCCATGGGAACCAGCAACCACCTTCGAATGTCCAGACAAATGCCC
AGCCCGTGGACCACACTTCAGTGGAAACATTAAAGACGACCACAACCCAC
ATCAATACGTTGCTTGCTTCCACGGACAAACTGTTGGATGCATCGCTTGC
CCAAAAGGATTACAATTCAACGAGAAATGGAACGCCTGTCTGTACCAAGG
AAAATACAAGACCGAACCAGAATCCCCACCAAAACACTAAATTGTTTTCA
GTTTTTTTAAGTAAAAGCGAAAATCCTTCTTTTTTTGTCTTTTTTCCATC
CTTTTATCCACATTTCTAACTTCTGCAACAATTTTCCTAAACTTCTTACT
TTCTTTATATGTCTAAATTTTGTAATTTTTATAAATTATTTATATTTTAC
GAAATAAATGCCTTTAATAATACATTAACTTGAATACGGCTGTTCATTTT
CTGCTTCTAGATTTACATAGAACTAAAACCTTCTTTTTTTAATCGTAAGT
ACAAAAATTTAGTTTGTTTTTTTAGAGTTTAAACATTCGAGCTTCGAGTC
GAACCCGATATAACTTTAATTTATAAAAATCGATCACATTATTCACTATA
AGATTACTTTATGCTGCCCCTTGATTTAATTCGATCTAAATAATAAGTCT
ACTTGCTTTAGGTGTAGTGGAGTGGTGGTCATCGTTCTTGACATTCGTCT
CGGAGGTTCGAGTTCGATTCCCACTGTAGGGCTACGCTAAACGTTCACTT
GGCAAGTAAGCATACCTTCACCCGGGGGTCAACTCATACCATGTGAGGGA
AATCGGGTAACACTTCTCCGATACAAGAGTATGGGTGATATTTCAGACAT
TGTGGTGTGTGGTGTCACTCATCCCGTTCTGCAGCTGTGTCGAGCTATAT
GCTCTTCCTCGTAATTCGAGTGTCGTCACTATGCCTTATGGTAATCTGTT
TGTCACGTTCACAGAACAAGCAGTGTCTGGACAGTGCTAAGCGTTCCGAC
TTGAAAAAGGAGGAATTCCTACTTTGCAAGGAGTAGGACCTATTCCCCAA
TGGGGAGAGCTCATATCATCATATCACTTGCTTTAAGCGTAATGTTACTA
ATATTTGTTCACGATGCTCATCTCTCATATACAGTGAATTTTCTATAAGT
CGAACACACATAGAGCACGCAAATTCAGTCAGGATTCAAAGGATTTGATG
ACTGAAGGAACCATATAACTTTCAGCTAAGAAGACATTTGAGTTATATAG
GCTCAAAAGACTCATAAGACGCTGTAATTCCTTAAAAAGTATAATTTTCT
CTATAAAGAAATTTTATAGGTCTTGGTGTCTTTGTTTCTGTTAACAGAAA
TCAGTGGTCTCCCCATAGCTATCTGGTACTTTGAAGAGTGGTATAGAATT
TCCTGAACTTATGGAGCTTTCGACTTTTCACCAATGATTTAGATATTCAC
TATCTGAAACATAACCAGAGAGGTTCAAATATTCTAAAAAGATTATACAC
GCTTTTTTAAAAGGTGGTCGTTAACACTTCTGAGATAGGATCATCTTTTT
CGGGTCGATTTTTTAATTTTTGGTTTAAATTAAAGTTTGAACCTTACTTA
ACAATATCCTGAAGTTTTATTTCATATAAAGAAGTAGACAGGAACCCGTC
TGCGTATTTTTTTTAATCTGATGAATACTTGACGGGTCAGAGCTGTGGGT
CCGATTTTGGCCTCAAAAAAGTTACAGTGGGAAATTCGAATTTAGCGCTG
TCCTCGCTTACTAAAATAAAAATCAAATTTCGGAACTTGCGCTTTCTTTA
AGAAAGTGTGACCAGTGAAACAATAACAGAATTTGATTGGCTGTGTTTTC
AACCGTTATTAGGATATGGGAAATTCAAACTGTCAGCCCATACCATGCTA
TATATTTCGCCATCAGTATATAGAATAAGAAATCATAGCATGGATCTCCA
GGCTAATAAAGAAGAGGAAAGTAGAAAACTTTAGGTCTTTAGACACGTAC
CTGAGCAGATCTTGCGGCCCGCCCCTAAACGCCCACCCCGCCGCCGATCA
CGAAAACCGGAATATTCGCTCTTCTGGTCTGGAGCGACTCCAAATTTTTA
CTGTCGCTACTTGGAGCCACAAAGAACATTTCCGGAAAGTTTTACACCGG
TACTGTTAACAGTTCCGGATTTATGACGACCAAAACAAACCCGCCTGAAT
CTCGTCCAATTTCAAATGTGGTTTTTTGCTGGTTTTTGGTAAAGGGAATG
ACTGTTTCATGGCTTATTTTCTTGTAGTAAGTGATGGTTTATTGCTTCCA
TTTTATATAAAGAGCTTCTCAAAACTCCAAGGAACATTTTTACTTGATAA
TCTTTCAAATTTCCTTCCCATTGGGATCAAATTTCAGCGCCACAAATGTG
TGACAGGTACGTGAAACGTTTCTTCTGTTTTCTCTCTCTTTTTAAGTTAT
TCAAATGATAATTTATTGTTATAAACGTCCATAACTTCTTCTTGGAACTA
TCCATATACCTTTAGTTGGGTTTTAATAGTGATATAGTTGATTTTGGTGC
ATTTCGGGGTTTTCTCAAAAGTGAAAGTGAAAGTGCTCTTTACTAGACTT
AAGCGCAGCTTATATTTCAAGTAATGGGGATATAGAAATGTTCTTTTCTA
CAGTGAAATGGGTTACTTTAACCAATTAAAAGGTTAGGCAATACTATTTC
ATGAATTTTCACCAAATTTTAGCTTTTTCGCAGGCAAAAGTAAGGTTTAC
GCAACTTTTTTGTATGTTTGCGGTAATCTCAGGGTTCTATGCGAAGCCAT
GATTTTGCTGACACAAGCAAAAAAAATGGCTTTACTTTCTTTCTTAAATT
GAAAATTGGATTAGTGCATCAAGTTCAACTGAAATCTGTCAAAAATCCCA
TATTTCCTCTTTTTACAGCAATAAATAGTTTTAAGGCCAGTTTACGCAAA
ACAGCAAAACCGGGGTTTTTTTATCTCTTGGCGGAAAAATCTCAGGATTG
GATGGTTTGATTGACTTGAAATTTTCAACACAGCTTCCCCTCATAGAAAG
GTGTGATCAAGGACACTTGTATAGCGTAGCTACGCTATACAAGTGTCCTT
GGTGTGATCGGAATGAAACAGATTTTTGAAAAAATGTTTTGTTGATTTTT
ATAATTATAAAAAACAGTTTTTTTGGGTTTTTACCCCCTGATTTTATATT
TTTCAAATTTTTTTTTCACTCAGATCACAGAAGGTCACTAGGGTAACATA
ACTGCCAAATATCAAAAGCTAACTCCTTCTGGTTGCTGAGATTTTTCTGC
CAAGAGATTTTCGAATCTATTTTTAGAAGTGACGTCATGACCCCCGTCTT
TGATATTTCAAATTATTTTTTCTATTTTTAGAACGACATAATAATGAAGT
ATCATCATGCTTACCATCAAGTTTCAACAATATATATCAAAAAGTTTTTG
AGATATTCCATTTTGAAATTTTTTGGACTTTTTAAAAAAGTTTGTTAACG
ACCACCTTCTTAATCATAAGAACAATCAGATTTAGGCCCTCAGAACAATA
GCTCTTTTGTTTGGAAGGATAAAATTTAATCTCGGCCAAAATTTACTGTA
GAAATGAATCTTCTTAATTTTTCAATTTTTCTAAAATCTTATCATTTAGA
TTACGATCCCCGAAAATATCTTTCTAACGCAACGGTATACAACTTTTCAA
CATAGCATAACGTGGCTTTTGAGAAATGATTAGAGAAAGAAAAAAGCCCA
CATAATTTTTAGACAGACTGTATGACTATGAGTGTAAGATAATGTTACTG
TATATATCGGGAGGTACAAAGAAGCTAAATATTTTTACTTTCGAATTATC
TGATTCATGGTTGAGTTGAATTGATTGATTTGCATGGTTGAATTGCAAAT
CCTATTTGCTCGCCACAGTTATAGAACCGAAATATGAAAAACAAGCAAAA
ATCAATAAATATCATATTAAGGTAATGTTAATATTAACCCTTTGTGCGCT
GTCTTTTTAAAAAAAGTTCTAATATTTCTTTTTGAAACTTAAAACTTTAA
AGTGCCATAAAAGTTTGTAGCTTATGATTTAGAAGATGGTTTACTGGTAG
GTACCATTGGAAAGGCTAATTTTATACTCTTTCTAAAAGCATTCGGTTTA
TGTCCATTTAAATCAAGTGGCCAGGAGCTATGGCCTAAGTCTGACACTCA
GTATTTTGGCTTGTTTTGGACGCATATACGCGTCCCTTGTGATCTAAGGG
TCAAGGTATAAGCTCCATCATTCATATAAGACCTACAGGCCAGGCTAACG
AAAGAAATGTAAATCCAGAAACAATAATCAACCAAAATAAAGTTAAGAAG
GTATTACTGGTATTTCGTAAAATATAAACAGTTTGATAATTTATATAAGT
TACAAATTTAAAGAAAGTAAGGAGTTTAGGAAAAATGTTGAAGAAGTCAG
AAGTGAGGATAAAAGGGTGGAAAAAAAGACAGAGAAAGATTTTCGCTTTT
ACTTAAAAAAACTGAAAATAATTTAGTGTTTTGGTGGGGATTCTGGTTCG
GTCTTGTATTTTCCTTGGTACAAACAGGCGTTCCATTTCTCGTTGAATTG
TAATCCTTTTGGGCAAGCGATACATCCAACAGTTTGTCCGTGGAAGCAAG
CAACGTACTGGTGTGGGTTGTGGTCATCTTCAATGTTTCCGCTGAAGTGT
GGTCCACGGGCTGGGCATTTGTCTGGGCACTCGAAGGTGGTTGCTGGTTC
CCATGGTTGTGTGGTGACACATTCGTCTTTTCGGTTGTATAAACATTGGT
TGCATGGTTCGCTGAATTCCAAGGACAATGGCCAGCAAGCTTGACAGTAA
GCTAATCCGTTGGAGCATTGGAGGAAGTAGTGTGGGTTGTATCGGCTGTA
GTAGTAGTATTCGTAGTTTCCGTCAGCTCTTCCTTTGCAGAGAGAGTCTG
GGCATGGGACAGCTGGTGGTGTGGTACCAGTTTGGGTTCCAACCTCGAGG
GCGGCGGCAACTGGAAATTAGATGTAAAAAATATTTAGATATACCAAGCT
ATTAGCCTTTTAAGTCAATGAAATCAATCGATTATTGATCAAAGGTCTTA
ATTTTTAAACTTGAGATTTATCTGTTAAAAATAATCTTTAAATTTAGTAC
TTGCTTTATTAAGAAAAGTTTAAACAAAGTACTTACCAGCCAAGAAAGCG
GTGAAAATGATGACCTTCATGTTTGTTTGTTCTTCTGAGATTACTTAAGA
TCTGAGATGATGATTTTCACCACCTTTTCACGTCTATTTATACGAAAATC
TTCGAAACTGTTATGAAATATTCAATTTCCTTTATCAATGAACAAATCTT
AGATACTATGTTTGTCTTCCAATATCGTGGTGTTAAACGGAAGGTGTATA
ATTAAAATTCTTTTGTTTGTCAGTTTAAAGTAAATTTTATATCCATATTA
TATAACTGCCTGAGGAATAAACTTCTTGAACTTGCTACATATGTCTTGCA
TATCTAAACCGTCCATCAATAGGATTTAAAACACCCTTAGAGAGTTTTTT
AAATGTGTAAAAAGGTACTCCTGCCACTCACACATACCCGGTCAGTACTT
TTTTTTTCTAAGTGGCCGCCTACCCAACTGCTTGGAAATTTACATCCCTT
TGAATTTCAACTGTCCATTAAAAAGTAAGTATTTTGTTTCAAAATTTGGA
CTTCAATCTCCAGATTTGCTAGGTTACATCAATTGTAAAATTACGGAAAA
GGTATTGAGTGCCCTTTTGTTGCAAGCGCTCTGAAAATTCTTTCCATTAC
GACTGAATTCCATACCCAATGAAATAATTACTGAAACTTCTACCATTCTC
GCTATATTCGAATATAATCCCGGTTCAAACTGGCGGCTCACTCCATTGTC
ATCTCATGCATTGAAAACTTGCAATGTGTTAAGATTATGTGTAAATATAG
TTTCTGGCAACCTTCCATATTTCTCCTATTCAAAATCTGAATATGTTTAT
GGTTCTTTGAATGTATGAAGCCCATAAAGAATTGTTTTAGATTTTCGTTG
CAAGTTGGTGTATTAAATTTGTATCTCAGCAAAATCATTCTTGAATTGCA
TTGAAATTGCGATCTTTACGATTGTTATTGGTCTTTTTGGGGTGTAGAAA
CAGGATTTTTGGTGATTGGCTGATGTAAGCGAGGTAAGGTGATGTGTTTC
TTGAGGTTTTGACCACTAAACTACGGTAATGAGAATTCCCAGAAAGACTT
TTTTTTTTCCCGCTCATGTCATAAAAATTTTCCCTGAGTCATTTAATGGT
GCATTCAGCCGCTACGGTGCGCATCAAGCTTATAGGTTTAATTTTCGGCC
GATTCGAAATTTCGTACTTAGCACTTAGTAGATATTTAGCAATAAAGTGT
ATTTGATTGATGAATTTAGTTTGCATCCAGGGTAAAACAGCGGTGCACTA
CCCTATCTTTGGGTAGATTGCAATAGCGAAGCCTTCAGATCACCTCCACC
CGCAGTCACATGACGTACCTATTTTTTATGTTGGCTAAAGATTTTTACTT
TTTTAAAGATTTTAATCCCGACCAAAGTAATCAAAATCCTTACTTAGAAA
ATTGGTGAACAGTCTATGTGATTTGATAACTTTGCAATTAGGAGAAATTG
TATATAAACCACAGAATGATAATGAGGCTTATTAGAGTAATTGGGATGTA
ATACAGGATATTATACAAGAATTGGTTCACCTGTATTTTGTTACGAGAAC
AGTTAGATTATCCATAGATAGGAAGTATAATTAATGCGATTACTGTAAAG
GGTGTGTCTAAATCGTATGATTTTTTAAACAGGATTTCGTTTATAATATT
TAAAGGAGTAGGTGAAAAACCTCTTCCCGAATTAACAGCGAGTGCAGGAC
CCACGCCACCCGGACTTTTTTGCAAAGTAAAAATTTTGGTTGCGTCTAAG
GACTAACTCTAAGGACTTAGACTCTATACATTGCCCCCCCCCCCCGCCGA
CTTTCAATTTCATGCCGTGGGTCCAGGAGTTTATGTGTTTTCTGTAACCA
AGGTGGTTATTTTATTTTAATTTACATACCTTATATCGGCCAAAACTTAG
TCGGCCTTAATTTTATTCGGCCTTAATTATTAGTCGGCCCCAATTTTAGT
CACCTCGTCAAAATTTAGTCACTATGGGCCGACTAAAAGTTAAAACCGAT
TAAAGATTTGGGCCATTTCTAAATTTAAAAGCATGCAGATGGAAAATAGG
AGAAAGCTTAAAATACTGGAAAACAAGGACAGATTAATTATAAACTTTAA
ATTTGGATCATATTTTTAGTTGGCCCTAATTTTTGGTCGGCCCTAATTTT
AGTCACCAAGCCTAAGACTAAGACTAAGTTTTGGCCGATAAGTTAGTTTA
AGCCAAACCAATGAACCAAGTTCATTAGCCTCCAAAGACAGGATGTGGCA
GAATCAATATGATATTCACTTTACGCAAACGCAAATTTGCAAGAAAAACT
GAAGCAAATACGTCTCTGTAAGATACAATTGTCACCAAGTTATTCTCTTA
AGAATTCTAAAAAAATCTTCAAAGTGATACTAATCTGTTATAATTCAGAT
TTAAAAAATAGCTAAAAATAAAACTTTCTTGGGATAGTTATATAATATTC
TTTCAATGTAATTTAATTTTGACAAAGGAAATGAATTTATACAATTAGAG
TTCTTCCCATCTAGCGCCAAACAATTGGTTGACAAACAAACTACTCGAGA
TTTGTTAATTGATAAAGGAGATTGAATATTTCATAACACTTTTCAAAGAT
TTTCGTATAAATAGACGTGAAAAAGATGGTGAAAATCATCATCTCAGATC
TTAAGTAATCTCAGAAGAACAAACAAACATGAAGGTCATCATTTTCACCG
CTTTCTTGGCTGGTAAGTACTTCAAACAACTTTAAGAAAATAATGTCGTT
GTATAAAAGTATTGATTTTTAAGAGCAAACATTACTGAATTTATTAACTC
ATTTCGCAGATCACTGAATTTTGAAGGTTTTAATTCATTGCAATAATCTT
CATCTTTCAGTTACCGCCGCCCTCGAGGTTGGAACCCAAACTGGTACCAC
ACCACCAGCTGTCCCATGCCCAGACTCCCTCTGCAAAGGAAGAGCTGACG
GAAACTACGAATACTACTACTACAGCCGATACAACCCACACTACTTCCTC
CAATGCTCCAACGGATTAGCTTACTGTCAAGCTTGCTGGCCATTGTCCTT
GGAGTTCAGCGAACCATGCAACCAATGTTTGTACAACCGAAAAGACGAAT
GTGTCACAACACAACCATGGGAACCAGCAACCACCTTCGAATGCCCAGAC
AAATGCCCAGCCCGTGGACCACACTTCAGCGGAAATATTGAAGACGACCA
CAACCCACATCAATACGTCGCTTGCTTCCACGGACAAACTGTCGGATGTA
TTGCTTGCCCAAAAGGATTACAATTCAACGAGAAATGGAACGCCTGTTTG
TACCAAGGAAAATACAAGACCGAACCAGAATCCCCACCAAAACACTAAAT
TAATTTTAGTTTTATAAAAATCAAAAACGAAAACTTTTTTTTTCAATCCT
TTCCTCTTTCAACTCTTCTTTTTCACCACTTTACCTAAACTTCTTATTTT
TCTTTGAAATTTTGTAATTGTATGAATGATGAAATTGTTTATATTTTACG
AAATACCTTTAATAGAAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000136_pilon:220015..229232- >MSTRG.15420.1.p1 ID=MSTRG.15420.1.p1|Name=MSTRG.15420.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000136_pilon:220015..229232- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTACCGCCGCCCTCGAGGTTGGAACCCAAACTGGTACCACACCACCAGCT
GTCCCATGCCCAGACTCCCTCTGCAAAGGAAGAGCTGACGGAAACTACGA
ATACTACTACTACAGCCGATACAACCCACACTACTTCCTCCAATGCTCCA
ACGGATTAGCTTACTGTCAAGCTTGCTGGCCATTGTCCTTGGAGTTCAGC
GAACCATGCAACCAATGTTTGTACAACCGAAAAGACGAATGTGTCACAAC
ACAACCATGGGAACCAGCAACCACCTTCGAATGCCCAGACAAATGCCCAG
CCCGTGGACCACACTTCAGCGGAAATATTGAAGACGACCACAACCCACAT
CAATACGTCGCTTGCTTCCACGGACAAACTGTCGGATGTATTGCTTGCCC
AAAAGGATTACAATTCAACGAGAAATGGAACGCCTGTTTGTACCAAGGAA
AATACAAGACCGAACCAGAATCCCCACCAAAACACTAAGTCATCATTTTC
ACCGCTTTCTTGGCTGATGAAGTTACCGCCGCCCTCGAGGTTGGAACCCA
AACTGGTACCACACCACCAGCTGTCCCATGCCCAGACTCCCTCTGCAAAG
GAAGAGCTGACGGAAACTACGAATACTACTACTACAGCCGATACAACCCA
CACTACTTCCTCCAATGCTCCAACGGATTAGCTTACTGTCAAGCTTGCTG
GCCATTGTCCTTGGAGTTCAGCGAACCATGCAACCAATGTTTGTACAACC
GAAAAGACGAATGTGTCACAACACAACCATGGGAACCAGCAACCACCTTC
GAATGCCCAGACAAATGCCCAGCCCGTGGACCACACTTCAGCGGAAATAT
TGAAGACGACCACAACCCACATCAATACGTCGCTTGCTTCCACGGACAAA
CTGTCGGATGTATTGCTTGCCCAAAAGGATTACAATTCAACGAGAAATGG
AACGCCTGTTTGTACCAAGGAAAATACAAGACCGAACCAGAATCCCCACC
AAAACACTAAGTCATCATTTTCACCGCTTTCTTGGCTGATGAAGTTACCG
CCGCCCTCGAGGTTGGAACCCAAACTGGTACCACACCACCAGCTGTCCCA
TGCCCAGACTCCCTCTGCAAAGGAAGAGCTGACGGAAACTACGAATACTA
CTACTACAGCCGATACAACCCACACTACTTCCTCCAATGCTCCAACGGAT
TAGCTTACTGTCAAGCTTGCTGGCCATTGTCCTTGGAGTTCAGCGAACCA
TGCAACCAATGTTTGTACAACCGAAAAGACGAATGTGTCACAACACAACC
ATGGGAACCAGCAACCACCTTCGAATGCCCAGACAAATGCCCAGCCCGTG
GACCACACTTCAGCGGAAATATTGAAGACGACCACAACCCACATCAATAC
GTCGCTTGCTTCCACGGACAAACTGTCGGATGTATTGCTTGCCCAAAAGG
ATTACAATTCAACGAGAAATGGAACGCCTGTTTGTACCAAGGAAAATACA
AGACCGAACCAGAATCCCCACCAAAACACTAAGTCATCATTTTCACCGCT
TTCTTGGCTGATGAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000136_pilon | genome | sc0000136_pilon:220015..229232 - |
|
